BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT5G03730.2

Length=2974
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg487152 jgi|Araly1|487152|fgenesh2_kg.6__286__AT5G03730.1         4388    0.0  
  Ahg939916 jgi|Araly1|939916|scaffold_600460.1                        292    8e-78
  Ahg939909 jgi|Araly1|939909|scaffold_600453.1                        291    3e-77


> Ahg487152 jgi|Araly1|487152|fgenesh2_kg.6__286__AT5G03730.1
Length=2958

 Score = 4388 bits (2376),  Expect = 0.0
 Identities = 2540/2619 (97%), Gaps = 11/2619 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  48    ACaaaaaaaaaatgaaaaaCTAGAGAGAGAAACAAGTGGCTAGCTAGCTCGCCAAACTTC  107
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1     ACAAAAAGAAAATGAAAAACTAGAGAGAGAAACAAGTGGCTAGCTAGCTCGCCGAACTTC  60

Query  108   TTCAACAATGGCGGTTTCCTAGGGTTTGATG----T--TTATATGATCGGGAAACTCTCT  161
             |||||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||||| 
Sbjct  61    TTCAACAATGGCGGTTTCCTAGGGTTTGATGCTTATAGTTATATGATCGGGAAACTCTCA  120

Query  162   CATCTAGATCGCGATAACTCTCTTTTCCATGGAAATGCCCGGTAGAAGATCTAATTACAC  221
             |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CATCTAGATCGCGAAAACTCTCTCTTCCATGGAAATGCCCGGTAGAAGATCTAATTACAC  180

Query  222   TTTGCTTAGTCAATTTTCTGACGATCAGGTGTCAGTTTCCGTCACCGGAGCTCCTCCGCC  281
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TTTGCTTAGTCAATTCTCTGACGATCAGGTGTCGGTTTCCGTCACCGGAGCTCCTCCGCC  240

Query  282   TCACTATGATTCCTTGTCGAGCGAAAACAGGAGCAACCATAACAGCGGGAACACCGGGAA  341
              ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct  241   GCACTATGATTCCTTGTCAAGCGAAAACAGGAGCAACAATAACAGCGGGAACAACGGGAA  300

Query  342   AGCTAAGGCGGAGAGAGGCGGATTTGATTGGGATCCTAGCGGTGGTGGTGGTGGTGATCA  401
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   AACTAAGGCGGAGAGAGGCGGATTTGATTGGGATCCTAGCGGTGGTGGTGGTGGTGATCA  360

Query  402   TAGGTTGAATAATCAACCGAATCGGGTTGGGAATAATATGTATGCTTCGTCTCTAGGGTT  461
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  361   TAGGTTGAGTAATCAACCGAATCGGGTTGGGAATAATATGTATGCTTCGTCTCTTGGCTT  420

Query  462   GCAAAGGCAATCCAGTGGGAGTAGTTTCGGTGAGAGCTCTTTGTCTGGGGATTATTACAT  521
             ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  421   GCAGAGGCAATCGAGTGGGAGTAGTTTCGGTGAGAGCTCTTTGTCTGGGGATTATTATAT  480

Query  522   GCCTACGCTTTCTGCGGCGGCTAACGAGATCGAATCTGTTGGATTTCCTCAAGATGATGG  581
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  481   GCCTACGCTTTCTGCGGCGGCTAACGAGATCGAATCTGTTGGATTTCCTCAAGACGATGG  540

Query  582   GTTTAGGCTTGGATTTGGTGGTGGTGGAGGAGATTTGAGGATACAGATGGCGGCGGACTC  641
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct  541   GTTTAGGCTTGGATTTGGTGGTGGTGGAGGAGATTTGAGGATACAGATGGCGGGGGAATC  600

Query  642   CGCTGGAGGGTCTTCATCTGGGAAGAGCTGGGCGCAGCAGACGGAGGAGAGTTATCAGCT  701
              ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601   GGCTGGAGGGTCTTCATCCGGGAAGAGCTGGGCGCAGCAGACGGAGGAGAGTTATCAGCT  660

Query  702   GCAGCTTGCATTGGCGTTAAGGCTTTCGTCGGAGGCTACTTGTGCCGACGATCCGAACTT  761
              |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661   CCAGCTTGCATTGGCGTTACGGCTTTCGTCCGAGGCTACTTGTGCCGACGATCCGAACTT  720

Query  762   TCTGGATCCTGTACCGGACGAGTCTGCTTTACGGACTTCGCCAAGTTCAGCCGAAACCGT  821
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   TCTGGATCCTGTACCGGACGAGTCTGCTTTGCGGACTTCGCCAAGTTCAGCCGAAACCGT  780

Query  822   TTCACATCGTTTCTGGGTTAATGGCTGCTTATCGTACTATGATAAAGTTCCTGATGGGTT  881
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  781   TTCACATCGTTTCTGGGTTAATGGCTGCTTATCGTATTATGATAAAGTTCCTGATGGGTT  840

Query  882   TTATATGATGAATGGTCTGGATCCCTATATTTGGACCTTATGCATCGACCTGCATGAAAG  941
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  841   TTATATGATGAATGGTCTGGATCCATATATTTGGACCTTATGCATCGATCTGCATGAAAG  900

Query  942   TGGTCGCATCCCTTCAATTGAATCATTAAGAGCTGTTGATTCTGGTGTTGATTCTTCGCT  1001
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901   TGGCCGCATCCCTTCAATTGAATCATTAAGAGCTGTTGATTCTGGTGTTGATTCTTCGCT  960

Query  1002  TGAAGCGATCATAGTTGATAGGCGTAGTGATCCAGCCTTCAAGGAACTTCACAATAGAGT  1061
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961   TGAAGCGATCATAGTTGATAGGCGTAGTGATCCAGCCTTCAAGGAACTTCACAATAGAGT  1020

Query  1062  CCACGACATATCTTGTAGCTGCATTACCACAAAAGAGGTTGTTGATCAGCTGGCAAAGCT  1121
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  CCACGACATATCTTGTAGCTGCATTACCACAAAAGAGGTTGTTGATCAGCTGGCAAAGCT  1080

Query  1122  TATCTGCAATCGTATGGGGGGTCCAGTTATCATGGGGGAAGATGAGTTGGTTCCCATGTG  1181
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1081  TATCTGCAATCGTATGGGGGGTCCAGTTATCATGGGGGAAGATGAGTTGGTTCCCATGTG  1140

Query  1182  GAAGGAGTGCATTGATGGTCTAAAAGAAATCTTTAAAGTGGTGGTTCCCATAGGTAGCCT  1241
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  GAAGGAGTGTATTGATGGTCTAAAAGAAATCTTCAAAGTGGTGGTTCCCATAGGTAGCCT  1200

Query  1242  CTCTGTTGGACTCTGCAGACATCGAGCTTTACTCTTCAAAGTACTGGCTGACATAATTGA  1301
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  CTCTGTTGGACTCTGCAGACATCGAGCTTTACTCTTCAAAGTACTGGCTGACATAATTGA  1260

Query  1302  TTTACCCTGTCGAATTGCCAAAGG-ATGTAAATATTGTAATAGAGACGATGCCGCTTCGT  1360
             |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1261  TTTACCGTGTCGAATTGC-AAAGGGATGCAAATATTGTAATAGAGACGATGCCGCATCGT  1319

Query  1361  GCCTTGTCAGGTTTGGGCTTGATAGGGAGTACCTGGTTGATTTAGTAGGAAAGCCAGGTC  1420
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1320  GCCTTGTCAGGTTTGGGCTTGATAGGGAGTACCTGGTTGATTTAGTAGGGAAGCCAGGTC  1379

Query  1421  ACTTATGGGAGCCTGATTCCTTGCTAAATGGTCCTTCATCTATCTCAATTTCTTCTCCTC  1480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| 
Sbjct  1380  ACTTATGGGAGCCTGATTCCTTGCTAAATGGTCCTTCATCTATCTCAATTTCTTCACCTT  1439

Query  1481  TGCGGTTTCCACGACCAAAGCCAGTTGAACCCGCAGTCGATTTTAGGTTACTAGCCAAAC  1540
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1440  TGCGGTTTCCACGACCCAAGCCAGTTGAACCCGCAGTCGATTTTAGGTTACTAGCCAAAC  1499

Query  1541  AATATTTCTCCGATAGCCAGTCTCTTAATCTTGTTTTCGATCCTGCATCAGATGATATGG  1600
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1500  AATATTTCTCCGACAGCCAGTCTCTTAATCTTGTTTTCGATCCTGCATCAGATGATATGG  1559

Query  1601  GATTCTCAATGTTTCATAGGCAATATGATAATCCGGGTGGAGAGAATGACGCATTGGCAG  1660
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1560  GATTCTCAATGTTTCATAGGCAATATGATAATCCGGGTGGAAAGAATGACGCATTGGCAG  1619

Query  1661  AAAATGGTGGTGGGTCTTTGCCACCCAGTGCTAATATGCCTCCACAGAACATGATGCGTG  1720
             |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1620  AAAATGGTGG-G--TCTTTGCCACCCAGTGCTAATATGCCTCCACAGAACATGATGCGTG  1676

Query  1721  CGTCAAATCAAATTGAAGCAGCACCTATGAATGCCCCACCAATCAGTCAGCCAGTTCCAA  1780
             ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct  1677  CGTCAAATCAAGTAGAAGCAGTACCTATGAATGCCCCACCAATCACTCAGCCAGTTCCGA  1736

Query  1781  ACAGGGCAAATAGGGAACTTGGACTTGATGGTGATGATATGGACATCCCGTGGTGTGATC  1840
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1737  ACAGGGCAAATAGGGAGCTTGGACTTGATGGTGATGATATGGACATCCCGTGGTGTCATC  1796

Query  1841  TTAATATAAAAGAAAAGATTGGAGCAGGTTCCTTTGGCACTGTCCACCGTGCTGAGTGGC  1900
             ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1797  TTAATATAAAAGAGAAGATTGGAGCAGGCTCCTTTGGCACTGTCCACCGTGCTGAGTGGC  1856

Query  1901  ATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGTGTTA  1960
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  1857  ATGGCTCGGATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGCGTAA  1916

Query  1961  ATGAGTTCTTAAGAGAGGTTGCGATAATGAAACGCCTTCGCCACCCTAACATTGTTCTCT  2020
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1917  ATGAGTTCTTAAGAGAGGTTGCAATAATGAAACGCATTCGCCATCCTAACATTGTTCTCT  1976

Query  2021  TCATGGGTGCGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAG  2080
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1977  TCATGGGTGCGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGAG  2036

Query  2081  GTAGTTTATACAGACTTTTGCATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAATTAGATGAGAGACGTC  2140
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2037  GTAGTTTATACAGACTTTTGCATAAAAGTGGAGCAAGGGAGCAATTAGATGAGAGACGTC  2096

Query  2141  GCCTGAGTATGGCTTATGATGTGGCTAAGGGAATGAATTATCTTCACAATCGCAATCCTC  2200
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2097  GTCTGAGTATGGCTTATGATGTGGCTAAGGGAATGAATTATCTTCACAATCGCAATCCTC  2156

Query  2201  CAATTGTGCATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTTATTGGTTGACAAAAAATATACAGTCA  2260
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2157  CAATTGTGCATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTTGTTGGTTGACAAAAAATATACAGTCA  2216

Query  2261  AGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGATTGAAGGCCAGCACGTTTCTTTCCTCGAAGTCAG  2320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2217  AGGTTTGTGATTTTGGTCTCTCGCGATTGAAGGCCAGCACGTTTCTTTCATCGAAGTCAG  2276

Query  2321  CAGCTGGAACCCCCGAGTGGATGGCACCAGAAGTCCTGCGAGATGAGCCGTCTAATGAAA  2380
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2277  CAGCTGGAACCCCCGAGTGGATGGCACCAGAAGTCCTGCGAGATGAGCCATCTAATGAAA  2336

Query  2381  AGTCAGATGTGTACAGCTTCGGGGTCATCTTGTGGGAGCTTGCTACATTGCAACAACCAT  2440
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2337  AGTCAGATGTGTACAGCTTCGGGGTCATCTTGTGGGAGCTTGCTACATTGCAACAACCAT  2396

Query  2441  GGGGTAACTTAAATCCGGCTCAGGTTGTAGCTGCGGTTGGTTTCAAGTGTAAACGGCTGG  2500
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2397  GGGGTAACTTAAATCCGGCTCAGGTTGTAGCTGCGGTTGGTTTCAAGTGTAAACGGCTTG  2456

Query  2501  AGATCCCGCGTAATCTGAATCCTCAGGTTGCAGCCATAATCGAGGGTTGTTGGACCAATG  2560
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2457  AGATCCCGCGGAATCTGAATCCTCAGGTTGCAGCCATAATCGAGAGTTGTTGGACCAATG  2516

Query  2561  AGCCATGGAAGCGTCCATCATTTGCAACTATAATGGACTTGCTAAGACCATTGATCAAAT  2620
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct  2517  AGCCATGGAAGCGTCCATCATTTGCAACTATAATGGACTTGTTAATACCATTGATCAAAT  2576

Query  2621  CAGCGGTTCCTCCGCCCAACCGCTCGGATTTGTAAAATA  2659
             | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2577  CGGCAGTTCCTCCACCCAACCGCTCGGATTTGTAAAATA  2615


 Score =  145 bits (78),  Expect = 2e-33
 Identities = 91/97 (94%), Gaps = 2/97 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2762  AGGGAGGaaaaaaaaaTGTAGTAATGGAAACAATGTGAGGGATATAATCTATCTATCTAG  2821
             ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||
Sbjct  2820  AGGAAGGAAAAAAAAATGTAGTAATGGAAACAGTGTG-GG-AGATAATCTATCTATCTAG  2877

Query  2822  TCCCAAAGGGTAAGCAATATTTTGTTGTTATGTCTTT  2858
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2878  TCCCAAAGGGTAAGCAATATTTTGTTGTTATATCTTT  2914


 Score =  111 bits (60),  Expect = 2e-23
 Identities = 60/60 (100%), Gaps = 0/60 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2693  ATATGCACATATACTCTCAGCATTCTTTTGCTGCCCAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATA  2752
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2613  ATATGCACATATACTCTCAGCATTCTTTTGCTGCCCAGGAGGGAGACACTAGTTAAGATA  2672


 Score = 69.4 bits (37),  Expect = 1e-10
 Identities = 43/46 (93%), Gaps = 0/46 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2887  TTACATTGCTGTACATTTATACCGCTAAATTAGTTACTAAGCGAAG  2932
             |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2913  TTACCTTGTTGTACATTTATACCGCTAAATTAGTTACTAAGCAAAG  2958


> Ahg939916 jgi|Araly1|939916|scaffold_600460.1
Length=435

 Score =  292 bits (158),  Expect = 8e-78
 Identities = 166/170 (98%), Gaps = 0/170 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1910  ATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGTGTTAATGAGTTCT  1969
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct  1     ATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGCGTCAATGAGTTCT  60

Query  1970  TAAGAGAGGTTGCGATAATGAAACGCCTTCGCCACCCTAACATTGTTCTCTTCATGGGTG  2029
             | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TGAGAGAGGTTGCGATAATGAAGCGCCTTCGCCACCCTAACATTGTTCTCTTCATGGGTG  120

Query  2030  CGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGA  2079
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAGA  170


 Score =  226 bits (122),  Expect = 8e-58
 Identities = 136/142 (96%), Gaps = 3/142 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2123  AATTAGATGAGAGACGTCGCCTGAGTATGGCTTATGATGTGGCTAAGGGAATGAATTATC  2182
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  175   AATTAGATGAGAGACGTCGCCTGAGTATGGCTCATGATGTGGCTAAGGCAATGAATTATC  234

Query  2183  TTCACAATC-GCAATCCTCCAATTGTGCATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTTATTGGTT  2241
             ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  235   TTCACAA-CTGCAATCCTCCAATTGTGCATAGAGATCTAAAATCTCCAAACTTGTTGGTT  293

Query  2242  GACAAAAAA-TATACAGTCAAG  2262
             ||||||||| ||||||||||||
Sbjct  294   GACAAAAAAATATACAGTCAAG  315


 Score =  174 bits (94),  Expect = 3e-42
 Identities = 117/127 (92%), Gaps = 5/127 (4%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2556  CAA-TGAGCCATGGAAGCGTCCATCA-TTTGCAACTATAATGGACTTGCTAAGACCATTG  2613
             ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312   CAAGTGAGCCATGGAAGCGTCCATAATTTTGCAACTATAATGGACTTGCTAAGACCATTG  371

Query  2614  ATCAAATCAGCGGTTCCTCCGCCCAACCGCTCGGATTTGTAAAATACCCCCGGTCCATTC  2673
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| 
Sbjct  372   ATAAAATCAGCGGTTCCTCCGCCCAACCGCTCGGATTTGTAAGAT-CCCC-G-TCCATTT  428

Query  2674  AAAAGTT  2680
              ||||||
Sbjct  429   GAAAGTT  435


> Ahg939909 jgi|Araly1|939909|scaffold_600453.1
Length=205

 Score =  291 bits (157),  Expect = 3e-77
 Identities = 165/169 (98%), Gaps = 0/169 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1910  ATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGTGTTAATGAGTTCT  1969
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct  1     ATGTTGCTGTGAAAATTCTCATGGAGCAAGACTTCCATGCTGAGCGCGTCAATGAGTTCT  60

Query  1970  TAAGAGAGGTTGCGATAATGAAACGCCTTCGCCACCCTAACATTGTTCTCTTCATGGGTG  2029
             | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  61    TGAGAGAGGTTGCGATAATGAAGCGCCTTCGCCACCCTAACATTGTTCTCTTCATGGGTG  120

Query  2030  CGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAG  2078
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   CGGTCACTCAACCTCCAAATTTGTCAATAGTGACAGAATATTTGTCAAG  169



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 112290042260


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5