BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G06600.1 Length=3898 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg487470 jgi|Araly1|487470|fgenesh2_kg.6__604__AT5G06600.1 6312 0.0 Ahg317971 jgi|Araly1|317971|fgenesh1_pm.C_scaffold_3000987 3731 0.0 > Ahg487470 jgi|Araly1|487470|fgenesh2_kg.6__604__AT5G06600.1 Length=3842 Score = 6312 bits (3418), Expect = 0.0 Identities = 3743/3892 (96%), Gaps = 53/3892 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GATTGTATTTCTCCCTAAGAGTCACTTTGCCTTTGTCTTTGATTTTTCTCTGTATCGTCG 60 |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1 GATTGTATTTCTCCCT-AGAGTCACTTTGCCTCT-TCTTTGATTTTTCTCTGCATCGTCG 58 Query 61 GTCTCTCTTTTGCGTTTCTCGATCCCACCGTCTAATCCTTCTCCGGCCAATGACTATGAT 120 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 59 GTCTCTCTTTTGCCTTTCTCGATCCCACCGTCAAATCCTTCTCCGGCCAATGACTATGAT 118 Query 121 GACTCCGCCTCCCGTTGATCAGCCAGAAGATGAGGAGATGCTTGTGCCGAATTCAGATTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 119 GACTCCGCCTCCCGTTGATCAGCCAGAAGATGAGGAGATGCTTGTGCCGAATTCAGATTT 178 Query 181 GGTCGACGGTCCTGCTCAGCCCATGGAAGTTACCCAACCCGAGACTGCTGCGAGTACTGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 179 GGTCGACGGTCCTGCTCAGCCCATGGAAGTTACCCAACCCGAGACTGCTGCGAGTACTGT 238 Query 241 GGAGAACCAGCCAGCTGAGGATCCTCCTACTCTGAAATTCACGTGGACTATCCCTAATTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 GGAGAACCAGCCAGCTGAGGATCCTCCTACTCTGAAATTCACGTGGACTATCCCTAATTT 298 Query 301 CTCTAGGCAAAACACCAGGAAGCATTACTCCGATGTATTTGTCGTTGGAGGTTACAAATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 CTCTAGGCAAAACACCAGGAAGCATTACTCCGATGTATTTGTCGTTGGAGGTTACAAATG 358 Query 361 GCGCATATTAATTTTCCCGAAAGGGAACAATGTTGATCATTTGTCCATGTACTTGGATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 359 GCGCATATTAATTTTCCCGAAAGGGAACAATGTTGATCATTTGTCCATGTACTTGGATGT 418 Query 421 TTCTGATGCTGCGAGTTTGCCGTACGGTTGGAGCAGATATGCTCAGTTCAGTCTGGCTGT 480 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 TTCTGATGCTGCGAGTTTGCCGTACGGATGGAGCAGATATGCTCAGTTCAGTCTGGCTGT 478 Query 481 AGTCAATCAAATCCACACCAGATATACCGTTAGAAAAGAGACGCAACATCAATTCAATGC 540 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 AGTCAATCAAATCCACTCCAGATATACCATTAGAAAGGAGACGCAACATCAATTCAATGC 538 Query 541 TAGAGAAAGCGATTGGGGATTTACATCATTCATGCCACTTAGCGAACTTTATGATCCTAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct 539 TAGAGAAAGCGATTGGGGATTTACATCATTCATGCCTCTAAGTGAACTTTATGATCCTAG 598 Query 601 TAGAGGATATTTAGTGAATGATACTGTTTTGGTTGAAGCTGAAGTCGCTGTACGTAAGGT 660 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 TAGAGGATATTTAGCGAATGATACTGTTTTGGTTGAAGCTGAAGTCGCTGTACGTAAGGT 658 Query 661 TCTTGATTACTGGTCATATGACTCTAAAAAAGAGACTGGTTTTGTTGGACTCAAGAACCA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 TCTTGATTACTGGTCATATGACTCTAAAAAAGAGACTGGTTTTGTTGGACTCAAGAACCA 718 Query 721 AGGTGCAACATGCTACATGAATTCTCTCCTACAGACACTATACCACATACCTTACTTCAG 780 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 AGGTGCAACTTGTTACATGAATTCTCTCCTACAGACACTATACCACATACCTTACTTCAG 778 Query 781 AAAGGCTGTATACCACATGCCAACAACTGAGAATGATGCACCCACAGCAAGTATACCGTT 840 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || Sbjct 779 AAAGGCTGTATACCACATGCCGACAACTGAGAACGATTTACCCACAGCAAGTATACCTTT 838 Query 841 GGCTCTCCAAAGTTTGTTTTACAAGCTCCAATACAATGACACTAGTGTTGCAACAAAAGA 900 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 839 GGCTCTCCAAAGTTTGTTTTACAAGCTCCAATATAATGACACTAGTGTTGCAACAAAGGA 898 Query 901 GCTGACAAAGTCGTTTGGTTGGGATACATATGATTCCTTCATGCAGCATGATGTGCAAGA 960 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 899 GCTGACAAAGTCTTTTGGTTGGGATACATATGATTCCTTTATGCAACATGATGTGCAAGA 958 Query 961 ACTCAATCGGGTTCTCTGCGAAAAGCTTGAGGACAAAATGAAGGGAACTGTTGTGGAGGG 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 ACTCAATCGGGTTCTCTGCGAAAAGCTTGAGGACAAAATGAAGGGAACTGTTGTGGAGGG 1018 Query 1021 AACAATACAACAACTTTTTGAGGGCCACCATATGAATTACATTGAGTGCATAAATGTAGA 1080 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1019 AACAATACAACAACTATTTGAGGGCCACCATATGAATTATATTGAGTGCATAAATGTAGA 1078 Query 1081 TTTTAAATCTACACGGAAAGAATCATTTTACGACCTTCAGCTGGATGTTAAAGGCTGCAA 1140 ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1079 TTTCAAATCGACACGGAAAGAATCATTTTACGACCTTCAGCTGGATGTGAAAGGCTGCAA 1138 Query 1141 GGATGTTTATGCTTCTTTTGACAAGTATGTTGAAGTTGAACGTCTTGAAGGAGACAACAA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1139 GGATGTTTATGCTTCTTTTGACAAGTATGTTGAAGTTGAACGTCTTGAAGGAGATAACAA 1198 Query 1201 ATATCATGCAGAAGGACATGGTTTACAGGATGCaaaaaaaGGTGTTCTTTTCATTGACTT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 ATATCATGCAGAAGGACATGGTTTACAGGATGCAAAAAAAGGTGTTCTTTTCATTGACTT 1258 Query 1261 TCCACCGGTTCTTCAACTCCAGCTCAAGAGGTTTGAATATGACTTTATGAGGGACACCAT 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1259 TCCACCGGTTCTTCAACTCCAGCTCAAGAGGTTTGAATATGACTTTATGAGGGACACCAT 1318 Query 1321 GGTGAAGATAAATGATCGGTATGAGTTTCCGCTTGAACTGGATCTTGATAGAGAAGATGG 1380 ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1319 GGTAAAGATAAACGATCGGTATGAGTTTCCTCTTGAACTGGATCTTGATAGAGAAAATGG 1378 Query 1381 AAAGTATCTGTCGCCTGATGCTGACAGGAGTGTCCGCAACCTTTATACTCTTCACAGTGT 1440 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 AAAGTATCTGTCTCCTGATGCTGACAGGAGTGTCCGCAACCTTTATACTCTTCACAGTGT 1438 Query 1441 TTTAGTTCATAGTGGAGGAGTACATGGTGGGCACTATTATGCTTTTATAAGGCCTACGCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1439 CTTAGTTCATAGTGGAGGAGTACATGGTGGGCACTATTACGCTTTTATAAGACCTACGCT 1498 Query 1501 CTCAGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGAGTAACCAAGGAAGATTTGAAAAGGGC 1560 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1499 CTCAGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGCGTAACAAAGGAAGATTTGAAAAGGGC 1558 Query 1561 TTTGGAGGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGCTACCACAGACTAATCCTGGTTTCAATAA 1620 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 ATTGGAGGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGCTACCACAGACTAATCCTGGTTTCAATAA 1618 Query 1621 TAACCCTCCTTTCAAATTCACAAAGTACTCGAATGCTTACATGCTTGTATATATCCGAGA 1680 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 1619 ---CCCTCCTTTCAAATTCACAAAGTACTCGAATGCTTACATGCTTGTTTATATCCGGGA 1675 Query 1681 AAGTGACAAAGATAAAATAATCTGCAACGTTGATGAGAAAGACATAGCAGAACATTTAAG 1740 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1676 AAGTGACAAGGATAAAATAATCTGCAACGTTGATGAGAAAGACATAGCAGAACATTTAAG 1735 Query 1741 GGTGAGGCTaaagaaagagcaagaagaaaaggaagataaaagaagaTACAAGGCACAAGC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 GGTGAGGCTAAAGAAAGAGCAAGAAGAAAAGGAAGATAAAAGAAGATACAAGGCACAAGC 1795 Query 1801 TCACTTATATACCATAATTAAGGTTGCAAGAGATGAAGACCTTAAGGAACAAATTGGGAA 1860 |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1796 TCACCTATATACAATAATTAAGGTTGCAAGAGATGAAGATCTTAAGGAACAAATCGGGAA 1855 Query 1861 GGATATATATTTTGATCTTGTGGATCATGACAAAGTTCGCAGTTTCCGTATCCAGAAACA 1920 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1856 GGATATATATTTTGATCTTGTGGACCATGACAAAGTTCGCAGTTTCCGTATCCAGAAACA 1915 Query 1921 GACACCATTTCAACAGTTTAAGGAGGAGGTAGCAAAAGAATTTGGTGTACCTGTTCAGTT 1980 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1916 GACACCATTTCAACAGTTTAAGGAGGAGGTAGCCAAAGAATTTGGTGTACCTGTTCAGTT 1975 Query 1981 ACAGAGGTTCTGGATTTGGGCAAAGAGACAAAACCATACCTATCGTCCCAATCGCCCCCT 2040 ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1976 ACAGAGGTTCTGGATTTGGGCTAAGCGACAAAACCATACCTATCGTCCCAATCGCCCCCT 2035 Query 2041 TACGCCTCAAGAGGAATTACAACCGGTTGGACAAATAAGGGAAGCATCTAATAAGGCAAA 2100 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 2036 TACGCCTCAAGAGGAATTACAACAGGTTGGACAAATAAGAGAAGCATCTAACAAGGCAAA 2095 Query 2101 CACTGCAGAACTCAAGCtttttttGGAAGTAGAGCACCTGGATTTACGTCCTATTCCTCC 2160 |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2096 CACTGCAGAACTAAAGCTTTTCCTGGAAGTAGAGCACCTGGATTTACGTCCTATTCCTCC 2155 Query 2161 TCCTGAAAAATCAAAAGAAGATATTCTTCTTTTCTTCAAGCTTTATGACCCCGAGAAGGC 2220 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2156 TCCTGAAAAATCAAAAGAAGATATTCTGCTTTTCTTTAAGCTTTATGACCCCGAGAAGGC 2215 Query 2221 AGTATTAAGCTATGCTGGCAGGCTGATGGTGAAAAGTTCCAGTAAGCCTATGGATATAAC 2280 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2216 AGTATTAAGCTATGCAGGCAGGCTGATGGTGAAAAGTTCCAGTAAGCCTATGGATATAAC 2275 Query 2281 TGGAAAACTGAATGAAATGGTTGGCTTTGCTCCTGATGAAGAAATAGAACTTTTTGAGGA 2340 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2276 TGGAAAACTTAATGAAATGGTTGGCTTTGCTCCTGATGAAGAAATAGAACTTTTTGAGGA 2335 Query 2341 AATCAAGTTTGAACCTTGTGTTATGTGCGAACACTTGGATAAGAAAACTTCATTCAGATT 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2336 AATCAAGTTTGAACCTTGTGTTATGTGCGAACACTTGGATAAGAAAACTTCATTCAGATT 2395 Query 2401 GTGTCAAATTGAAGATGGAGATATCATTTGCTTTCAGAAACCTCTTGTTAACAAGGAGAT 2460 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2396 GTGTCAAATTGAAGATGGAGACATCATTTGCTTTCAGAAACCTCTAGTTAACAAGGAGAT 2455 Query 2461 TGAATGCCTCTACCCAGCTGTGCCTTCGTTTCTTGAATATGTCCAGAATAGACAGCTGGT 2520 ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2456 TGAGTGCCGCTACCCAGCTGTGCCTTCGTTTCTTGAATATGTCCAGAACAGACAGCTGGT 2515 Query 2521 CCGGTTTCGTGCTCTGGAAAAACCTAAAGAAGATGAGTTTGTTCTGGAGTTGTCGAAGCA 2580 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2516 CCGGTTTCGTGCTCTGGAAAAACCTAAAGAAGATGAGTTTGTTCTGGAGTTGTCGAAGCT 2575 Query 2581 GCACACTTATGACGATGTTGTGGAGAAAGTGGCTGAGAAGCTTGGTCTTGACGATCCATC 2640 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2576 GCACACTTATGACGATGTTGTGGAAAAAGTGGCTGAGAAGCTTGGTCTTGACGATCCATC 2635 Query 2641 CAAACTTAGGCTTACATCTCACAATTGCTATTCCCAGCAACCCAAGCCTCAGCCTATCAA 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2636 CAAACTTAGGCTTACATCTCACAATTGCTATTCCCAGCAACCTAAGCCTCAGCCTATCAA 2695 Query 2701 GTACCGTGGAGTAGACCATTTGTCAGATATGTTAGTTCATTACAATCAGACGTCTGACAT 2760 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2696 ATACCGTGGAGTAGACCATTTGTCAGATATGTTAGTTCACTACAATCAGACGTCTGACAT 2755 Query 2761 TTTGTATTATGAAGTTCTGGACATCCCTCTTCCAGAATTACAAGGTCTTAAAACCTTAAA 2820 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2756 TTTGTATTATGAAGTTCTGGACATTCCTCTTCCAGAATTGCAAGGTCTTAAAACCTTAAA 2815 Query 2821 AGTTGCTTTCCATCATGCCACGAAGGAAGAAGTGGTAATCCACAATATCAGACTACCTAA 2880 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2816 AGTTGCTTTCCATCATGCCACGAAGGAAGAAGTGGTAATCCACAATATCAGACTACCTAA 2875 Query 2881 ACAAAGCACGGTCGGAGATGTTATTAATGAACTTAAAACAAAGGTGGAGCTTTCGCATCC 2940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2876 ACAAAGCACGGTCGGAGATGTTATTAATGAACTTAAAACAAAGGTGGAGCTTTCGCATCC 2935 Query 2941 AGATGCAGAACTGAGATTGCTCGAGGTGTTTTACCACAAGATCTACAAGATTTTCCCATC 3000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2936 AGATGCAGAACTGAGATTGCTCGAGGTGTTTTACCACAAGATCTACAAGATTTTCCCATC 2995 Query 3001 AACTGAAAGAATTGAGAATATAAATGACCAGTACTGGACTTTACGAGCTGAGGAGATTCC 3060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2996 AACTGAAAGAATTGAGAATATAAATGACCAGTACTGGACTTTACGAGCTGAGGAGATTCC 3055 Query 3061 GGAAGAAGAGAAGAATATTGGTCCAAATGATCGCTTAATTCTTGTGTACCATTTTGCCAA 3120 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3056 GGAAGAAGAGAAGAATATCGGTCCAAATGATCGCTTAATTCTTGTGTACCATTTTGCTAA 3115 Query 3121 GGAGACTGGACAAAACCAGCAAGTGCAAAACTTTGGCGAGCCCTTCTTCTTGGTAATCCA 3180 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3116 GGAGACTGGACAAAATCAGCAAGTGCAAAACTTTGGCGAGCCCTTCTTCTTGGTAATCCA 3175 Query 3181 TGAAGGTGAAACTCTTGAAGAAATCAAGAACCGTATCCAAAAGAAGCTTCATGTATCTGA 3240 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3176 TGAAGGTGAAACTCTTGAAGAAATAAAGAACCGTATCCAAAAGAAGCTTCATGTATCCGA 3235 Query 3241 TGAAGATTTTGCCAAGTGGAAGTTTGCGTTCATGTCAATGGGGCGTCCAGAGTACTTGCA 3300 ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3236 TGAGGACTTTGCCAAGTGGAAGTTTGCGTTTATGTCAATGGGGCGTCCAGAGTACTTACA 3295 Query 3301 GGACACAGATGTTGTTTATAATCGCTTCCAGAGAAGAGATGTCTATGGTGCTTTTGAGCA 3360 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3296 GGACACAGATGTTGTTTATAATCGCTTTCAGAGAAGAGATGTCTATGGTGCTTTTGAGCA 3355 Query 3361 GTACCTCGGGTTGGAGCATGCTGACACTACTCCTAAGAGGGCTTATGCTGCAAACCAGAA 3420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3356 GTACCTCGGGTTGGAGCATGCTGACACTACTCCTAAGAGGGCTTATGCTGCAAACCAGAA 3415 Query 3421 CCGCCATGCTTACGAGAAGCCGGTAAAAATATACAATTAGCCCCAAAACATGAACACAAA 3480 |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 3416 CCGCCACGCTTACGAGAAGCCGGTGAAAATATACAATTAGCCCCA------GA------- 3462 Query 3481 TGTCAGGAGACATTGTGGCAGCAACGTTGGACCAAGGCATTGATTGGACCAATGCATCGA 3540 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3463 -G--A-----CATTGTGGCAGCAACGTTGGACCAAGGCATTGATTGGACCAATGCATCGA 3514 Query 3541 ATAAGAAGGGAAAGGGCGAGTGTGAGGGTGTGATGATGACCGTAGGATGTTGTAGAGAAT 3600 ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3515 ATAAGGAGGGAAAGAGAGAGTGTGAGGGTGTGATGATGACCGTAGGATGTTGTAGAGAAT 3574 Query 3601 CTGGTCTGATAGGGTTTTGGGTTGCGCATTGATAGTGGTGTGTTTTCTAtttttttCTTT 3660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3575 CTGGTCTGATAGGGTTTTGGGTTGCGCATTGATAGTGGTGTGTTTTCTATTTTT--CTTT 3632 Query 3661 TCAAT-CTATCCTTATTTTATTTCGTGCTTCAATACTTTGTGTTAATATCTGGAATGTGT 3719 | | || || || | | | || | ||||||||||||||||||||| Sbjct 3633 -CG-TGCT-TCA--AT---A---C-T--TT---T-----GTGTTAATATCTGGAATGTGT 3670 Query 3720 GAAGACCATTG-CACATGCAATTTTTATTTTCCaaaaaaaGA-ATATGGAAGCCCTTCGC 3777 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 3671 GAAGACCATTGGCACATGCAATTTTTATTTTCCAAAAAAAAATATATGGAAGCCCTTCGC 3730 Query 3778 TTGGATTCGGGAGCGCGGTTTGGCTTTCAGAGTTTATAGAATACCGAAACATTTGTAATT 3837 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3731 TTGGATTCGGGAGCGCGGTTTGGCTTTCAGAGTTAATAGAATACCGAAACATTTGTAATT 3790 Query 3838 TTAGAGATTGTGGTTTAAGAAGATTTTTGACTGAGGAGATTTGTATTCTTTT 3889 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 3791 TTAGAGATTGGGGTTTAAGAAGATTTTTGACTGAGGAAATTTGCATTCTTTT 3842 > Ahg317971 jgi|Araly1|317971|fgenesh1_pm.C_scaffold_3000987 Length=3348 Score = 3731 bits (2020), Expect = 0.0 Identities = 2940/3383 (87%), Gaps = 67/3383 (2%) Strand=Plus/Plus Query 110 ATGACTATGATGACTCCGCCTCCCG-TTGATCAGCCA-GAAGATGAGGAGATGCTTGTGC 167 |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| | Sbjct 1 ATGACTATGATGACTCCGCC-GCCGCTTGATCAG-CAGGAAGACGAGGAGATGCTTGTTC 58 Query 168 CGAATTCAGATTTGGTCGACGGTCCTGCTCAGCCCATGGAAGTTACCCAACCCGAGACTG 227 ||||| | ||||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||| Sbjct 59 CGAATCCGGATTTGGTCGA-GGGAC--CTCAGCCTATGGAAGTTGCCCAAACTGAGCCTG 115 Query 228 CTGCGAGTACTGTGGAGAA-CCAGCCAGCTGAGGATCCTCCTACTCTGAAATTCACGTGG 286 |||| | | |||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 116 CTGCTACCGCCGTGGAGAATCC-GCCACCCGAGGATCCTCCAACTCTGAAATTCACGTGG 174 Query 287 ACTATCCCTAA-TTTCTCTAGGCAAAACACCAGGAAGCATTACTCCGATGTATTTGTCGT 345 || ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 175 ACCATCCC-AATTTTCACTAGGCTCAATACCAGGAAGCATTACTCTGATGTATTTGTTGT 233 Query 346 TGGAGGTTACAAATGGCGCATATT-AATTTTCCCGAAAGGGAACAATGTTGATCATTTGT 404 ||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| || ||||||| Sbjct 234 TGGCGGTTATAAATGGCGTATATTGATTTTTCCC-AAAGGAAACAATGTCGACCATTTGT 292 Query 405 CCATGTACTTGGATGTTTCTGATGCTGCGAGTTTGCCGTACGGTTGGAGCAGATATGCTC 464 | ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| | | Sbjct 293 CAATGTACTTGGATGTTGCTGACGCCGCGAATTTGCCGTATGGGTGGAGCAGATATTCAC 352 Query 465 AGTTCAGTCTGGCTGTAGTCAATCAAATCCAC-ACCAGATATACCGTTAGAAAAGAGACG 523 ||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||| || | ||||| |||||| Sbjct 353 AGTTCAGTCTGGCTGTAGTGAATCAAGTCAACAACC-GATATTCCATCAGAAAGGAGACG 411 Query 524 CAACATCAATTCAATGCTAGAGAAAGCGATTGGGGATTTACATCATTCATGCCACTTAGC 583 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| Sbjct 412 CAACATCAATTCAATGCAAGAGAAAGCGATTGGGGGTTTACATCATTCATGCCTCTCAGC 471 Query 584 GAACTTTATGATCCTAGTAGAGGATATTTAGTGAATGATACTGTTTTGGTTGAAGCTGAA 643 || || |||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| Sbjct 472 GAGCTCTATGATCCCACTCGAGGATATTTAGTGAATGACATTGTTCTGATTGAAGCTGAA 531 Query 644 GTCGCTGTACGTAAGGTTCTTGATTACTGGTCATATGACTCTAAAAAAGAGACTGGTTTT 703 || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 532 GTTGCTGTGCGTAAAGTTCTTGATTACTGGTCATATGACTCAAAAAAAGAGACTGGTTTT 591 Query 704 GTTGGACTCAAGAACCAAGGTGCAACATGCTACATGAATTCTCTCCTACAGACACTATAC 763 |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 592 GTTGGACTAAAAAACCAAGGTGCTACCTGTTACATGAATTCTCTCCTGCAGACTTTATAC 651 Query 764 CACATACCTTACTTCAGAAAGGCTGTATACCACATGCCAACAACTGAGAATGATGCACCC 823 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 652 CACATACCTTACTTCAGAAAGGCTGTGTACCACATGCCAACGACTGAAAATGATGCACCT 711 Query 824 ACAGCAAGTATACCGTTGGCTCTCCAAAGTTTGTTTTACAAGCTCCAATACAATGACACT 883 || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || Sbjct 712 ACTGCTAGTATCCCATTGGCGCTCCAGAGTTTGTTTTACAAGCTTCAGTATAATGATACC 771 Query 884 AGTGTTGCAACAAAAGAGCTGACAAAGTCGTTTGGTTGGGATACATATGATTCCTTCATG 943 ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 772 AGTGTAGCGACAAAGGAGCTGACAAAGTCGTTTGGTTGGGATACATATGATTCTTTCATG 831 Query 944 CAGCATGATGTGCAAGAACTCAATCGGGTTCTCTGCGAAAAGCTTGAGGACAAAATGAAG 1003 || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 832 CAACATGATGTCCAAGAACTCAACCGAGTTCTCTGTGAAAAGCTTGAGGACAAGATGAAG 891 Query 1004 GGAACTGTTGTGGAGGGAACAATACAACAA-CTTTTTGAGGGCCACCATATGAATTACAT 1062 ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 892 GGAACTGTTGTGGAGGGAACAATACAA-AAGCTATTTGAGGGTCACCACATGAATTACAT 950 Query 1063 TGAGTGCATAAATGTAGATTTTAAATCTACACGGAAAGAATCATTTTACGACCTTCAGCT 1122 ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| Sbjct 951 TGAGTGCATTAATGTAGATTACAAATCTACACGAAAAGAATCATTCTATGACCTCCAGCT 1010 Query 1123 GGATGTTAAAGGCTGCAAGGATGTTTATGCTTCTTTTGACAAGTATGTTGAAGTTGAACG 1182 ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1011 TGATGTCAAAGGCTGCAAAGATGTATATGCTTCTTTTGACAAGTATGTTGAAGTTGAACG 1070 Query 1183 TCTTGAAGGAGACAACAAATATCATGCAGAAGGACATGGTTTACAGGATGCaaaaaaaGG 1242 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 1071 CCTTGAAGGAGACAACAAATACCATGCAGAAGGACATGATTTGCAGGATGCAAAAAAAGG 1130 Query 1243 TGTTCTTTTCATTGACTTTCCACCGGTTCTTCAACTCCAGCTCAAGAGGTTTGAATATGA 1302 |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 1131 TGTTCTATTCATAGACTTTCCACCAGTTCTTCAACTTCAGCTCAAGAGGTTTGAATACGA 1190 Query 1303 CTTTATGAGGGACACCATGGTGAAGATAAATGATCGGTATGAGTTTCCGCTTGAACTGGA 1362 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 1191 TTTTATGAGGGACACAATGGTGAAGATCAATGATCGGTATGAGTTTCCTCTTCAACTGGA 1250 Query 1363 TCTTGATAGAGAAG-ATGGAAAGTATCTGTCGCCTGATGCTGACAGGAGTGTCCGCAACC 1421 ||| || |||| || ||||||| ||| | || |||||||| |||| |||||| ||||| | Sbjct 1251 TCTCGACAGAG-AGAATGGAAAATATTTATCCCCTGATGCAGACAAGAGTGTTCGCAATC 1309 Query 1422 TTTATACTCTTCACAGTGTTTTAGTTCATAGTGGAGGAGTACATGGTGGGCACTATTATG 1481 | || || || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| Sbjct 1310 TCTACACCCTCCACAGTGTCTTGGTTCACAGTGGAGGAGTGCATGGAGGGCATTATTATG 1369 Query 1482 CTTTTATAAGGCCTACGCTCTCAGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGAGTAACCA 1541 ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 1370 CTTTTATTAGGCCAACACTTTCAGATCAGTGGTATAAATTTGATGATGAACGGGTAACGA 1429 Query 1542 AGGAAGATTTGAAAAGGGCTTTGGAGGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGCTACCACAGA 1601 |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 1430 AGGAAGATGTGAAAAGGGCACTGGAAGAGCAATATGGTGGTGAAGAAGAGTTACCGCAGA 1489 Query 1602 CTAATCCTGGTTTCAATAATAACCCTCCTTTCAAATTCACAAAGTACTCGAATGCTTACA 1661 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 1490 ATAATCCTGGTTTCAATAAT---CCACCTTTCAAATTCACAAAATACTCGAATGCATACA 1546 Query 1662 TGCTTGTATATATCCGAGAAAGTGACAAAGATAAAATAATCTGCAACGTTGATGAGAAAG 1721 ||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1547 TGCTTGTTTATATTCGGGAAAGTGACAAGGACAAGATAATCTGCAACGTTGATGAGAAAG 1606 Query 1722 ACATAGCAGAACATTTAAGGGTGAGGCT-aaagaaagagcaagaagaaaaggaagataaa 1780 |||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1607 ACATTGCGGAACATTTGCGGGTGAGGCTGAAA-AAAGAACAAGAAGAAAAGGAAGATAAA 1665 Query 1781 agaagaTACAAGGCACAAGCTCA-CTTATAT-ACCATAATTAAGGTTGCAAGAGATGAAG 1838 |||| ||||||||| |||||||| ||| | | || | ||| ||||| ||||| ||||| | Sbjct 1666 AGAAAATACAAGGCTCAAGCTCACCTT-T-TCACGACAATCAAGGTCGCAAGGGATGATG 1723 Query 1839 ACCTTAAGGAACAAATTGGGAAGGATATATATTTTGATCTTGTGGATCATGACAAAGTTC 1898 || | | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 1724 ACATCACTGAGCAAATTGGAAAGAATATATATTTTGATCTTGTTGATCATGAAAAAGTTC 1783 Query 1899 GCAGTTTCCGTATCCAGAAACAGACACCATTTCAACAGTTTAAGGAGGAGGTAGCAAAAG 1958 | ||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||| Sbjct 1784 GGAGTTTTCGAATCCAGAAACAGACCCCCTTTCAACAATTTAAGGAAGAGGTAGCCAAAG 1843 Query 1959 AATTTGGTGTACCTGTTCAGTTACAGAGGTTCTGGATTTGGGCAAAGAGACAAAACCATA 2018 | |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| Sbjct 1844 AGTTTGGTGTCCCGGTTCAACTACAGCGGTTCTGGATCTGGGCAAAGCGTCAAAACCATA 1903 Query 2019 CCTATCGTCCCAATCG-CCCC-CTTACGCCTCAA-GAGGAATTACA-ACCGGTTGGACAA 2074 | ||||| |||||||| |||| ||| ||| || || |||||||| | ||||||||||| Sbjct 1904 CTTATCGCCCCAATCGTCCCCTATTA--CCT-AATGAAGAATTACAGA-CGGTTGGACAA 1959 Query 2075 ATAAGGGAAGCATCTAATAAGGCAAACACTGCAGAACTCAAGCtttttttGGAAGTAGAG 2134 ||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| Sbjct 1960 ATAAGAGAGGCATCTAACAAGGCAAACAATGCTGAACTAAAGCTGTTTTTGGAAATAGAG 2019 Query 2135 C----ACCTGGATTTA-CGTCCTATTCCTCCTCCTGAAAAATCAAAAGAAGATATTCTTC 2189 | ||| ||| | | | |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| Sbjct 2020 CGTGGACC-GGA-TGATCTTCCTATTCCTCCCCCAGAAAAATCTTCTGAAGATATCCTTC 2077 Query 2190 TTTTCTTCAAGCTTTATGACCCCGAGAAGGCAGTATTAAGCTATGCTGGCAGGCTGATGG 2249 ||||||| || || |||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| Sbjct 2078 TTTTCTTTAAACTCTATGACCCTGAGAATGCAGTACTAAGATATGTTGGCAGGCTAATGG 2137 Query 2250 TGAAAAGTTCCAGTAAGCCTATGGATATAACT-GGAAAACTGAATGAAATGGTTGGCTTT 2308 ||||||||||||||||||| |||||||| | | || |||||||| |||||| ||| ||| Sbjct 2138 TGAAAAGTTCCAGTAAGCCCATGGATAT-AGTAGGGCAACTGAATAAAATGGCTGGTTTT 2196 Query 2309 GCTCCTGATGAAGAAATAGAACTTTTTGAGGAAATCAAGTTTGAACCTTGTGTTATGTGC 2368 ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2197 GCTCCTGATGAGGAAATTGACCTTTTTGAGGAAATTAAGTTTGAACCTTGTGTAATGTGT 2256 Query 2369 GAAC-ACTTGGATAAGAAAACTTCATTCAGATTGTGTCAAATTGAAGATGGAGATATCAT 2427 |||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2257 GAACAAC-TGGATAAGAAGACTTCTTTCAGGCTGTGTCAAATTGAAGATGGAGATATCAT 2315 Query 2428 TTGCTT-TCAGAAACCTCTTGT-TAACAAGGAGATTGAATGCCTCTACCCAGCTGTGCCT 2485 ||| || ||||||||||| | | || | |||||| |||||| | |||||||| |||||| Sbjct 2316 TTG-TTATCAGAAACCTC-TATCTATCCAGGAGAGTGAATGTCGCTACCCAGATGTGCCA 2373 Query 2486 TCGTTTCTT-GAATATGTCCAGAATAGACAGCTGGTCCGGTTTCGTGCTCTGGAAAAACC 2544 || ||| || || ||||| |||||| || ||||||| || |||||| | ||||||||||| Sbjct 2374 TCATTT-TTGGAGTATGTACAGAATCGAGAGCTGGTGCGTTTTCGTACACTGGAAAAACC 2432 Query 2545 TAAAGAAGATGAGTTTGTTCTGGAGTTGTCGAAGCAGCACACTTATGACGATGTTGTGGA 2604 |||||||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2433 AAAAGAAGACGAATTTACTATGGAGCTGTCAAAGCAGCACACTTATGATGATGTTGTGGA 2492 Query 2605 GAA-AGTGGCTGAGAAGCTTGGTCTTGACGATCCATCCAAACTTAGGCTTACATCTCACA 2663 || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 2493 -AAGAGTGGCTGAGAAGCTTGGCCTTGATGATCCATCGAAACTTAGACTTACATCTCACA 2551 Query 2664 ATTGCTATTCCCAGCAACCCAAGCCTCAGCCTATCAAGTACCGTGGAGTAGACCAT-TTG 2722 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || Sbjct 2552 ATTGCTACTCCCAGCAACCCAAGCCTCAGCCAATCAAATACCGTGGAGTAGATCATCTT- 2610 Query 2723 TCAGATATGTTAGTTCATTACAATCAGACGTCTGACATTTTGTATTATGAAGTTCTGGAC 2782 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2611 TCAGATATGTTAGTTCACTACAATCAGACGTCTGACATTTTGTATTATGAAGTTCTGGAT 2670 Query 2783 ATCCCTCTTCCAGAATTACAAGGTCTTAAAAC-CTTAAAAGTTGCTTTCCATCA-TGCCA 2840 || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||| | ||||| Sbjct 2671 ATTCCTCTTCCAGAATTGCAAGGTCTTAAGACTCT-AAAAGTGGCTTTCCAT-AGTGCCA 2728 Query 2841 CGAAGGAAGAAGTGGTAATCCACAATATCAGACTACCTAAACAAAGCACGGTCGGAGATG 2900 | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||| Sbjct 2729 CAAAGGATGAAGTGATAATCCACAATATCAGACTACCTAAGCAGAGTACTGTTGGAGATG 2788 Query 2901 TTATTAATGAACTTAAAACAAAGGTGGAGCTTTCGCATCCAGATGCAGAACTGAGATTGC 2960 ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | Sbjct 2789 TTATTAACGATCTGAAAACAAAGGTGGAGCTTTCGCATCAAGATGCAGAACTGAGGTTAC 2848 Query 2961 TCGAGGTGTTTTACCACAAGATCTACAAGAT-TTTCCCATCAACTGAAAGAATTGAGAAT 3019 | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || Sbjct 2849 TTGAGGTCTTTTTCCACAAGATCTACAAGATCTTTCC-ATCTACTGAAAGAATTGAAAAC 2907 Query 3020 ATAAATGACCAGTACTGGACTTTACGAGCTGAGGAGATTCCGGAAGAAGAGAAGAATATT 3079 || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| Sbjct 2908 ATCAATGACCAGTACTGGACTTTACGAGCAGAAGAGATACCTGACGAAGAGAAGAATATT 2967 Query 3080 GGTCCAAATGATCGCTTAATTCTTGTGTACCATTTTGCCAAGGAGACTGGACAAAACCAG 3139 ||||| |||||||| ||||||| || || |||||| | || ||| | |||||||| ||| Sbjct 2968 GGTCCCAATGATCGGTTAATTCACGTATATCATTTTACTAAAGAGGCCGGACAAAATCAG 3027 Query 3140 CAAGTGCAAAACTTTGGCGAGCCCTTCTTCTTGGTAATCCATGAAGGTGAAACTCTT-GA 3198 ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || Sbjct 3028 CAAGTACAAAATTTTGGGGAACCCTTCTTTTTGGTAATCCACGAAGGTGAAACT-TTAGA 3086 Query 3199 AGAAATCAAGAACCGTATCCAAAAGAAGCTTCATGTATCTGATGAAGATTTTGCCAAGTG 3258 ||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||| || ||||||||||| Sbjct 3087 AGAAATCAAGATCCGTATCCAAAAAAAACTCCATGTCCCTGATGAGGACTTTGCCAAGTG 3146 Query 3259 GAAGTTTGCGTTCATGT-CAATGGGGCGTCCAGAGTACTTGCAGGACACAGATGTTGTTT 3317 ||||||||| | | | | || |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3147 GAAGTTTGCAT-CTTTTTCATTGGGACGTCCTGATTACTTGCAGGACACAGACGTTGTTT 3205 Query 3318 ATAATCGCTTCCAGAGAAGAGATGTCTATGGTGCTTTTGAGCAGTACCTCGGGTTGGAGC 3377 |||||||||| |||||||||||||| || || || | |||||||| || |||||||||| Sbjct 3206 ATAATCGCTTTCAGAGAAGAGATGTATACGGCGCGTGGGAGCAGTATCTTGGGTTGGAGC 3265 Query 3378 ATGCTGACACTACTCCTAAGAGGGCTTATGCTGCAAACCAGAACCGCCATGCTTACGAGA 3437 | ||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| Sbjct 3266 ACATTGACAATGCTCCTAAAAGGGCTTATGCTGCGAATCAGAACCGACATGCATACGAGA 3325 Query 3438 AGCCGGTAAAAATATACAATTAG 3460 ||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3326 AGCCGGTGAAAATATACAATTAG 3348 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147320865083 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5