BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G06970.1 Length=3781 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg487516 jgi|Araly1|487516|fgenesh2_kg.6__650__AT5G06970.1 5930 0.0 Ahg892385 jgi|Araly1|892385|Al_scaffold_0006_381 568 1e-160 > Ahg487516 jgi|Araly1|487516|fgenesh2_kg.6__650__AT5G06970.1 Length=3714 Score = 5930 bits (3211), Expect = 0.0 Identities = 3592/3768 (95%), Gaps = 58/3768 (2%) Strand=Plus/Plus Query 18 ATATACAGATAGATCTTTCGGCCCCGGCGCATTCTCTAGATTTGCTCATCACCACCTCGA 77 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 1 ATACACAGATAGATCTTTCGGCCCCGGCGCGTTCTCTAGATTTGCTCA-CACGACCTCGA 59 Query 78 AATTTCTGCTCGAAGTTCTCCAAAACAGTTCATTCATCTACATTTACCAGATCATATTCG 137 || || | || | |||| | ||||| || | | | | ||| || |||| Sbjct 60 AA-TT-T-CT----G--CTCC---A-AGTTC--TC--C-A-A---AACAGTTC--ATTCC 95 Query 138 TATTCAGTCGTCTCTAAATTCTCACTAAATCAATCCTTCCTTTGGA-TAATTCCGGTGTT 196 | | | | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| Sbjct 96 T-CT-A--CAT-T-TAAATTCTCACTAAATCAATCCTTCCGTTGGATTAATTGCTGTGTT 149 Query 197 TGCGAGGAATCTGATA-AAATGATTGGTCAATTGGAAATCTGAGAATCCGTGTGACTATT 255 ||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 150 CGCGAGGAATCTGA-AGAAATGGTTGGTTAATTTGAAATCTGAGAATCCGTGTGACTATT 208 Query 256 ATTGCAGCTGGATCGAGATGGAAGAAGAAAATGCTGTCGAGATTCTTCAGAGATATCGCC 315 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 209 ATTGCAGCTGGATCGACATGGAAGAAGAAAATGCTGTTGAGATTCTTCAGAGATATCGCC 268 Query 316 GGGATAGGCGGAAGCTATTGGATTTTATGTTGGCTGGTAGCTTAATCAAGAAAGTTATAA 375 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 269 GGGATAGGCGGAAACTCTTGGATTTTATGTTGGCTGGTAGCTTGATCAAGAAAGTTATAA 328 Query 376 TGCCTCCTGGTGCTGTGACTCTTGACGATGTTGATTTAGATCAAGTTAGTGTTGATTATG 435 |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 329 TGCCTCCTGGGGCTGTTACTCTGGATGATGTTGATTTGGATCAAGTTAGTGTTGATTATG 388 Query 436 TCATTAACTGTGCTAAGAAAGGTGGAATGCTCGAACTCGCTGAAGCGATTCGGGACTATC 495 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 389 TCATTAACTGTGCTAAGAAAGGTGGAATGCTTGAACTTGCTGAAGCGATTCGGGACTATC 448 Query 496 ATGATCACATTGGATTGCCTTATATGAACAGCGTGGGTACTGCTGATGAATTCTTTTTGG 555 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 449 ATGATCACATTGGATTGCCTTATATGAATAGCGTCGGTACTGCTGATGAATTCTTTTTGG 508 Query 556 CTACAATTCCTGAATCTTCTGGCTCACCTCCAAAAAGGGCCCCACCGCCTATTCCTGTAT 615 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 509 CTACAAATCCTGAATCTTCCGGCTCACCTCCAAAAAGGGCCCCACCACCTATTCCTGTAT 568 Query 616 TAATTTCCTCATCTTCTCCCATGGTTACAAATCCCGAGTGGTGTGAGTCACCATCTGCGC 675 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || Sbjct 569 TAATTTCCTCATCCTCTCCCATGGTTACAAATCCGGAGTGGTGTGAGTCACCAACTGTGC 628 Query 676 CACCATTGATGCGATCAGAATCTTTTGATTCACCAAAAGCTCAAGAGCTGACTGTTGATG 735 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 629 CATCATTGATGCGATCAGAATCTATTGATTCACCAAAAGCTCAAGAGCTGACTGTTGATG 688 Query 736 ACATTGATGATTTTGAAGACGATGATGATCTTGATGAAGTTGGTAATTTCAGGATCTCTA 795 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 689 ACATTGAAGATTTTGAAGACGATGATGATCTTGATGAAGTTGGTAATTTCAGAATCTCAA 748 Query 796 GGCGGACTGCAAATGATGCTGCTGATCTTGTGCCAAGACTGCCCTCCTTTGCGACTGGTA 855 |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 749 GGCGAACTGCGAATGATGCGGCTGATTTTGTGCCAAAACTGCCCTCCTTTGCGACTGGTA 808 Query 856 TTACCGATGATGATCTCCGTGAAACTGCATTTGAAATACTTTTGGCTTGCGCTGGAGCTT 915 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 809 TTACAGATGATGATCTCCGTGAAACTGCATTTGAAATCCTTTTGGCTTGCGCTGGAGCTT 868 Query 916 CAGGAGGTCTCATAGTACCATCAAAAGAGAAAAAGAAGGAGAAAAGCAGGTCTAGGCTGA 975 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 869 CAGGAGGTCTCATAGTACCATCAAAAGAGAAAAAGAAGGAGAAAAGCAGGTCTAGGCTGA 928 Query 976 TTAAGAAGCTTGGTCGCAAAAGTGAGAGTGTTTCTCAATCTCAGAGCTCATCAGGATTGG 1035 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 929 TTAAGAAGCTTGGTCGCAAAAGTGAGAGTGTTTCTCAGTCTCAGAGTTCATCAGGATTGG 988 Query 1036 TTTCTCTTTTAGAAATGATGCGGGGCCAAATGGAGATTTCTGAGGCCATGGACATCAGAA 1095 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 989 TTGCTCTTTTAGAAATGATGCGGGGTCAAATGGAGATTTCTGAGGCTATGGACATCAGAA 1048 Query 1096 CAAGACAAGGGTTGCTTAATGCCCTAGCGGGAAAAGTTGGCAAAAGAATGGACAGCCTCC 1155 ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1049 CAAGACAGGGGTTACTTAATGCCCTAGCGGGAAAAGTAGGCAAAAGAATGGACAGCCTCC 1108 Query 1156 TGGTGCCTTTAGAATTGCTATGTTGCGTGTCTCGTACCGAGTTCTCTGACAAGAAAGCAT 1215 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1109 TGGTCCCTTTAGAATTGCTATGTTGCGTGTCTCGTACCGAGTTCTCTGACAAGAAAGCGT 1168 Query 1216 ACTTACGCTGGCAGAAAAGGCAGTTAAACATGTTAGCAGAGGGGCTCATTAACAATCCAG 1275 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1169 ACTTACGTTGGCAGAAAAGGCAGTTAAACATGTTAGCAGAGGGGCTCATTAACAATCCAG 1228 Query 1276 TTGTTGGATTTGGAGAATCAGGTCGTAAGGCAACTGACCTGAAGAGTCTTCTGCTAAGGA 1335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1229 TTGTTGGATTTGGAGAATCAGGTCGTAAGGCAACTGACCTGAAGAGTCTTCTGCTAAGGA 1288 Query 1336 TTGAAGAATCAGAGTCTCTTCCATCCTCAGCTGGAGAAGTGCAAAGAGCAGAATGTTTAA 1395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1289 TTGAAGAATCAGAGTCTCTTCCATCCTCAGCTGGAGAAGTGCAAAGAGCAGAATGTTTAA 1348 Query 1396 AATCTCTTAGAGAAGTTGCTATCTCACTTGCTGAGAGACCGGCTCGTGGTGATTTGACGG 1455 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1349 AATCTCTTAGAGAAGTTGCTATCTCACTTGCCGAGAGACCGGCTCGTGGTGATTTGACGG 1408 Query 1456 GTGAAGTCTGCCATTGGGCTGATGGCTATCATTTGAATGTCAGACTATATGAAAAATTGC 1515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1409 GTGAAGTCTGCCATTGGGCTGATGGCTATCATTTGAATGTCAGACTATATGAGAAATTGC 1468 Query 1516 TTCTCTGTGTCTTTGACATATTGAATGATGGGAAGCTCACAGAGGAAGTTGAAGAAATTC 1575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1469 TTCTCTGTGTCTTTGACATATTGAATGATGGGAAGCTCACAGAGGAAGTTGAAGAAATTC 1528 Query 1576 TTGAGCTTTTGAAGTCAACATGGCGTGTTCTCGGAATTACAGAGACCATCCATTACACAT 1635 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1529 TTGAGCTTTTGAAGTCAACGTGGCGTGTTCTTGGAATTACAGAGACCATCCATTACACAT 1588 Query 1636 GCTATGCTTGGGTTTTGTTTCGACAGTATGTCATTACTAGTGAACGAGGACTTCTGCGAC 1695 ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1589 GCTATGCCTGGGTATTGTTTCGACAGTATGTAATTACTAGTGAACGAGGACTTCTGCGAC 1648 Query 1696 ATGCTATTCAGCAGCTGAAGAAGATCCCACTAAAAGAACAACGAGGGCCTCAAGAGCGTT 1755 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1649 ATGCTATTCAGCAGCTGAAGAAAATCCCTCTAAAAGAACAACGTGGGCCTCAAGAGCGCA 1708 Query 1756 TACACTTGAAAACCTTGAAGTGTAGGGTTGATAATGAAGAGATATCCTTCCTGGAGTCCT 1815 ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1709 TACACTTGAAAACATTGCAGTGTAGGGTTGAAAATGAAGAGATATCCTTCCTAGAGTCCT 1768 Query 1816 TCTTGTCACCTATACGGAGTTGGGCCGATAAGCAGCTGGGCGACTACCATCTGCATTTTG 1875 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 1769 TCTTGTCACCTATACGGAGTTGGGCCGATAAGCAGCTGGGCGATTACCATTTGCATTTTG 1828 Query 1876 CCGAGGGTTCACTTGTCATGGAGGATACAGTCACAGTTGCAATGATAACTTGGAGGCTCT 1935 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1829 CCGAGGGTTCACTTGTCATGGAGGATACAGTCACAGTTGCAATGATAACTTGGAGGCTTT 1888 Query 1936 TGTTGGAGGAATCTGATCGAGCGATGCATTCTAACTCTTCAGATCGAGAGCAAATTGAAT 1995 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 1889 TGTTGGAGGAATCTGATCGAGCGATGCATTCTAACTCTTCAGACCGAGAGCAAATTGAGT 1948 Query 1996 CCTACGTTTTATCTTCCATCAAGAATACGTTCACAAGGATGTCACTTGCCATTGATAGAT 2055 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1949 CATACATTTTATCTTCCATCAAGAATACGTTCACAAGGATGTCACTTGCCATTGATAGAT 2008 Query 2056 CAGACAGAAATAATGAGCACCATTTGGCATTGCTTGCTGAGGAGACTAAGAAACTTATGA 2115 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2009 CAGACAGAAATAATGAGCACCCTTTGGCATTGCTTGCTGAGGAGACTAAGAAACTTATGA 2068 Query 2116 AAAAGGACTCTACCATCTTTATGCCAATTTTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGT 2175 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2069 AAAAAGACTCTACCATCTTTATGCCAATTTTATCTCAGAGGCACCCACAGGCAATTGCGT 2128 Query 2176 TTTCTGCATCCCTTATTCACAAGCTTTATGGGAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTG 2235 |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2129 TTTCTGGATCCCTTGTTCACAAGCTTTATGGGAACAAGTTGAAACCTTTTCTTGATGGTG 2188 Query 2236 CTGAACACTTGACTGAGGACGCTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAAT 2295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2189 CTGAACACTTGACTGAGGACGCTGTCTCTGTTTTTCCTGCGGCTGATAGCCTTGAGCAAT 2248 Query 2296 ATTTACTGGAGTTAATGACTTCTGTCTGCGGAGAGGATACAAGTGGACCTTACTTCAAAA 2355 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2249 ATTTACTGGAGTTAATGACTTCTGTCTGCAGAGAGGATACAAGTGGACCTTACTTCAGAA 2308 Query 2356 AATTAATTCCATATGAGGTCGAATCCCTCTCTGGCACATTGGTTTTGAGATGGATCAATT 2415 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2309 AATTAATTCCATATGAGGTCGAATCACTCTCTGGCACATTGGTTTTGAGATGGATCAATT 2368 Query 2416 CACAACTGGGGAGAATTTTAAGCTGGGTGGAGCGAGCTTATAAACAAGAGCATTGGGACC 2475 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 2369 CACAGCTGGGGAGAATTTTAAGCTGGGTGGAGCGAGCTTTTAAACAAGAGCAATGGGACC 2428 Query 2476 CAATATCACCTCAACAGCGGTATGGGAGCTCAATTGTCGAAGTTTTCAGGATTGTAGAAG 2535 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2429 CAATATCACCTCAACAGCGGCATGGGAGCTCAATTGTCGAAGTTTTCAGGATTGTAGAAG 2488 Query 2536 AGACTGTTGATCAATTTTTTGCGCTGAAAGTTCCAATGAGATCCATTGAACTAAGTGCTT 2595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2489 AGACTGTTGATCAATTTTTTGCGCTGAAAGTTCCAATGAGATCCATTGAACTAAGTGCTT 2548 Query 2596 TATTTCGTGGCATTGACAATGCATTTCAAGTATATACTAACCATGTCATGGAGAAGCTAG 2655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2549 TATTTCGTGGCATTGACAATGCATTTCAAGTATATACTAACCATGTCATGGAGAAGCTAG 2608 Query 2656 CTAGCAAGGATGATTTGGTTCCACCTGTACCTGTTCTTACTCGTTACAAGAAGGAAACAG 2715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2609 CTAGCAAGGATGATTTGGTTCCACCTGTACCTGTTCTTACTCGTTACAAGAAGGAAACCG 2668 Query 2716 CAATCAAGGTTTTTGTTAAGAAGGAACTATTCGACTCAAAACA-CCTTGATGAGAGAAGG 2774 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 2669 CAATCAAGGTTTTTGTTAAGAAGGAACTATTCGAGTCAAAACATCCT-GATGAGAGAAGG 2727 Query 2775 TCGATTAACATTGATGTTCCTGCAACCGCTATGCTTTGCGTTCAGCTCAATACTTTACAT 2834 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2728 TCGATTAACATTAATGTTCCTGCAACCGCTATGCTTTGCGTTCAGCTCAATACTTTACAT 2787 Query 2835 TATGCTGTTAGTCAACTGAGCAAGTTAGAAGACAGCATGTGGCTA-CGCTGGATAGCaaa 2893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || Sbjct 2788 TATGCTGTTAGTCAACTGAGCAAGTTAGAAGACAGCATGTGGG-AGCGCTGGATAGCGAA 2846 Query 2894 aaaaCCTCGTGAAAAGATTGTCATCAGAAAATCTATGGTTGAGAAATCCAAGAGTTTTAA 2953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2847 AAAACCTCGTGAAAAGATTGTCATCAGAAAATCTATGGTTGAGAAATCCAAGAGTTTTAA 2906 Query 2954 CCAGAAGGAATCTTTTGAGGGGAGTAGAAAAGATATCAATGCAGCTCTGGATCGTATTTG 3013 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2907 CCAGAAGGAATCTTTTGAGGGGAGTCGAAAAGATATCAATGCAGCTCTGGATCGTATCTG 2966 Query 3014 CGAGTTTACTGGAACCAAGATTATCTTCTGCGATTTAAGGGAGCCATTTATTGAAAATTT 3073 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2967 CGAGTTTACTGGAACCAAGATTATCTTCTGCGATTTAAGGGAGCCATTTATTGAAAATTT 3026 Query 3074 GTATAAGCCAAATGTTTCTCAATCAAGATTGGAAGGATTAATCGAAGCCCTAGACACGGA 3133 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3027 GTATAAGCCAAGTGTTTCTCAATCAAGATTGGAAGGATTAATCGAAGCCCTAGACACGGA 3086 Query 3134 ACTTGGACAGCTATGTAGTGTCATAATGGAGCCATTGAGGGATCGGATAGTCACCAGCCT 3193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3087 ACTTGGACAGCTATGTAGTGTCATAATGGAGCCATTGAGGGATCGGATAGTCACCAGCCT 3146 Query 3194 GCTCCAAGCATCACTTGATGGGTTGCTTCGTGTACTATTAGATGGAGGCGCGTCTCGTGT 3253 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| Sbjct 3147 GCTTCAAGCATCACTTGATGGGTTGCTTCGTGTACTACTAGATGGAGGCCCGTCACGTGT 3206 Query 3254 ATTTCATCCAAGCGAGTCAAAGCTGTTAGAAGAAGATGTAGAGGTCTTAAAGGAATTCTT 3313 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3207 ATTTCATCCAAGCGAGTCAAAGCTGTTAGAAGAAGATGTAGAGGTCTTAAAGGAATTTTT 3266 Query 3314 TATTTCTGGTGGGGATGGACTTCCGAGAGGAGTGGTTGAAAACCAAGTAGCCAGAGTTCG 3373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3267 TATTTCTGGTGGGGATGGACTTCCGAGAGGAGTGGTTGAAAACCAGGTAGCCAGAGTTCG 3326 Query 3374 TCTTGTTGTAAAGTTGCACGGATATGAGACACGGGAGCTTATTGATGACTTGAGGTCTAG 3433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3327 TCTTGTTGTAAAGTTGCACGGATATGAGACACGGGAGCTTATTGATGACTTGAGGTCTAG 3386 Query 3434 AAGCAGTCTAGAGATGCAGCAAGGAGGAAAAGGCAAACTTGGAGCGGACACCCAAACATT 3493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3387 AAGCAGTCTAGAGATGCAGCAAGGAGGAAAAGGCAAACTTGGAGCGGACACCCAAACATT 3446 Query 3494 GGTACGAGTGCTTTGCCACAGAAACGATTCAGAGGCATCTCAGTTTCTGAAAAAACAGTA 3553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3447 GGTACGAGTGCTTTGCCACAGAAACGATTCAGAGGCGTCTCAGTTTCTGAAAAAACAGTA 3506 Query 3554 CAAAATCCCAAGATCCCACGGGTAATCTATGCGCCGATCTAATCAGATCAGATCATATTT 3613 ||||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||| Sbjct 3507 CAAAATCCCAAAATCCCACGGGTAAT--AT-C-----T-------GATCAGATCATATTT 3551 Query 3614 GCGtctctttctttctttctttctttcggtcttttctttAGTAACAAAATCATTTGTATA 3673 |||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3552 GCGTCT-TTTGATT-T--CTTTCTTTCGGTCTTTTCTTTAGTAACAAAATCATTTGTATA 3607 Query 3674 ATTGATTCTCACAAGTACAGGTTGCAGAGAAATACTACCTGAGGGGTTTTAGGTGTCATT 3733 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 3608 ATTGATTCTCACAAGTACAGGTTGTAGAGAGATATTACCTGAGTT-TTTTAGGTGTCATT 3666 Query 3734 CTTTTGACTTATCTTTGCTTTTTATACAAATGTTTGTAGTTTACGATC 3781 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3667 CTTTTGACTTATCTTTGCTTTTGATACAAATGTTTGTAGTTTGCGATC 3714 > Ahg892385 jgi|Araly1|892385|Al_scaffold_0006_381 Length=1293 Score = 568 bits (307), Expect = 1e-160 Identities = 383/419 (91%), Gaps = 7/419 (2%) Strand=Plus/Plus Query 743 TGATTTTGAAGACGATGATGATCTTGATGAAGTTGGTAATTTCAGGATCTCTAGGCGGAC 802 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 668 TGATTTTGAGGACGATGATGATCTTGAGGAAGTTGGTAATTTCAGGATCTCAAGGCGAAC 727 Query 803 TGCAAATGATGCTGCTGATCTTGTGCC-AAGACTG-CCCTCCTTTGCGACTGGTATTACC 860 ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 728 TGCCGATGATGCGGCTGATCTTGTGCCAAAG-CTGCCCCTCCTTTGCGACTGGTATTACA 786 Query 861 GATGATGATCTCCGTGAAACTGCATTTGAAATACTTTTGGCTTGCGCTGGAGCTTCAGGA 920 |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| | Sbjct 787 GATGATGATCTCTGTGAAACTGCATTTGAAATCCTGTTGGGTGGCGCTGGAGCTTCA-G- 844 Query 921 GGTCTCATAGTACCATCAAAAGAG--AAAAAGAAGGAGAAAAGCAGGTCTAGGCTGATTA 978 |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 845 GGTCTCATAGCACCATCAAAAGAGAAAAAAAAAAGGAGAAGAGCAGGTCTAGGCTGAAGA 904 Query 979 AGAAGCTTGGTCGCAAAAGTGAGAGTGTTTCTCAATCTCAGAGCTCATCAGGATTGGTTT 1038 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 905 GGAAGCTTGGTCGCAAAAGTGAGAGTGTTTCTCAGTCTCGGAGTTCATCAGGATTGGTTG 964 Query 1039 CTCTTTTAGAAATGATGCGGGGCCAAATGGAGATTTCTGAGGCCATGGACATCAGAACAA 1098 | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 965 CCCTTTTAGAAATGATGAGGGGCCGAATGGAGATTTCTGAGGCCATGGACATCAGAACAA 1024 Query 1099 GACAAGGGTTGCTTAATGCCCTAGCGGGAAAAGTTGGCAAAAGAATGGACAGCCTCCTG 1157 |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1025 GACAGGGGTTGCTTGATGCCCTAGCGGGGAAAGTTGGCAAAAGAATGGACAGCCTCCTG 1083 Score = 171 bits (92), Expect = 5e-41 Identities = 102/107 (95%), Gaps = 0/107 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1241 AAACATGTTAGCAGAGGGGCTCATTAACAATCCAGTTGTTGGATTTGGAGAATCAGGTCG 1300 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 1086 AAACATGTTAGCAGAGAGGCTCATTAACAATCCAGTTGTTGGGTGTGGAGAATCAGGTCG 1145 Query 1301 TAAGGCAACTGACCTGAAGAGTCTTCTGCTAAGGATTGAAGAATCAG 1347 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1146 TAGGGCAACTGACCTGAAGAGTCTTCTGCTAAGGATTGAAGGATCAG 1192 Score = 119 bits (64), Expect = 2e-25 Identities = 74/79 (94%), Gaps = 0/79 (0%) Strand=Plus/Plus Query 520 TGAACAGCGTGGGTACTGCTGATGAATTCTTTTTGGCTACAATTCCTGAATCTTCTGGCT 579 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| Sbjct 551 TGAATAGCGTGGGTACTGCTGATGAATTCTTTTTGGCTGCAAATCTTGAATCTTCTGGCT 610 Query 580 CACCTCCAAAAAGGGCCCC 598 |||||||||||||| |||| Sbjct 611 CACCTCCAAAAAGGTCCCC 629 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 142868129042 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5