BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G08500.1
Length=2022
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg487688 jgi|Araly1|487688|fgenesh2_kg.6__822__AT5G08500.1 3066 0.0
Ahg940337 jgi|Araly1|940337|scaffold_600881.1 3009 0.0
Ahg489219 jgi|Araly1|489219|fgenesh2_kg.6__2353__AT5G23575.1 1877 0.0
Ahg892784 jgi|Araly1|892784|Al_scaffold_0006_780 822 0.0
Ahg940340 jgi|Araly1|940340|scaffold_600884.1 610 1e-173
> Ahg487688 jgi|Araly1|487688|fgenesh2_kg.6__822__AT5G08500.1
Length=1855
Score = 3066 bits (1660), Expect = 0.0
Identities = 1793/1858 (97%), Gaps = 5/1858 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 TCTCACACGGTAAAGTTACAATAATCTCAGCTTGAATC-ACACTGACGAAGGCATCTTCC 61
||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |
Sbjct 1 TCTCACACGGTAAAGTTAC-ATAGT-TCAGCTTGAATCGGCACTGACGAAAGCATCTTTC 58
Query 62 TGCGATTATGGCGTCGCCGGCAGGTGAAACAGCAGCGGTTGTTGAGGGCGGAGATGGGCA 121
||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 59 TGCGAATATGACGCCGCCGGCAAGTGAAACAGCTGCGGTGGTTGACGGCGGTGATGGGCA 118
Query 122 GCAGCAACGACAAGCTGGTGGGTTTGGGCAGACAATTACCGGAATCATAAGAATCGCCGT 181
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 119 GCAGCAACGACAAGCTGGTGGGTTTGGGCAGGCAATTACCGGAATCATTAGAATCGCCGT 178
Query 182 CTTCTGTTACTTTGCTTCTAAGTTCTTTTCTCCCAAACAAAAACC-TGCGGATCCTTCCA 240
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |
Sbjct 179 CTTCTGCTACTTTGCTTCTAAGTTCTTTTCTCCGAAACAAAAACCAT-CGGATCCTTCTA 237
Query 241 AGCCTACTCATCTCATGTCCAATCTATTTCAGAGGGGCGAGCCCATAGATATGTGGTTTT 300
||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 238 AGCCTTCTCATCTTATGTCCAATCTCTTTCAGAGGGGAGAGCCCATGGATATGTGGTTTT 297
Query 301 ATCTTTCGGAGCATGAGAAATTCAATGACTTCGGCAATGAAGGTGCGCTTATTTGGCATG 360
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 298 ATCTTTCGGAGCATGAGAAATTCAATGACTTTGGCAATGAAGGTGCGCTTATTTGGCACG 357
Query 361 AGACAAACATACCTTATGCTGTGTGGAAACCAGAGAGCACTAGGACCTTGTCAATGACGT 420
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 358 AGACAAACATACCTTATGCTGTGTGGAAGCCAGAGAGCACTAGGACCTTGTCAATGACAT 417
Query 421 ACTATCCTTCCGAGGCACTGAAGAATAATGGAAGTCTGTATGCTCATGTCTTCTTTGCTC 480
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 ATTATCCATCCGAGGCACTGAAGAATAATGGAAGTCTGTATGCTCATGTCTTCTTTGCTC 477
Query 481 TATCTGGTTATCCTATAGATCTTAGTGATCCTGAATACCAGCCTCTCAACTGCTTTGGCA 540
|||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 478 GATCTGGCTATCCTATAGACCCCACTGATCCTGAATACCAACCTCTTAACTGCTTTGGCA 537
Query 541 GGACTCACCCTGTTGCAACTTACTTACCAAAGCGAAAAGCAGATAAGAAGAAGAGTCTGT 600
||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 AGACACACCGTGTTGCAACTTACTTGCCAAAGCGAAAAGCAGATAAGAAGAAGAGTCTGT 597
Query 601 TGGGAAATCCCAAAGACTCTGATGAATCCCATGTGGAAGTTGAGGAGGTTGATGGTAAGG 660
||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 TGGGAAATCCCAAAGACGATGATGAATCCAATGTTGAAGTTGAGGAGGTTGATGGTAAGG 657
Query 661 ACTCGGATCTCAAGGATGAGGGCCCTGTGGAATGGGTATCCTACTGGAAACCAAATGTCA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ACTCGGATCTCAAGGATGAGGGCCCTGTGGAATGGGTTTCCTACTGGAAACCAAATGTCA 717
Query 721 CAATTAACCTAGTCGATGACTTTACTCGCTATCCACAGCATGGTGTACCACCAAACATTT 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CAATTAACCTAGTCGATGACTTTACTCGCTATCCACAGCATGGTGTACCACCAAACATTG 777
Query 781 ATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAGTACAATAAACTACTACCCTACAGTTTTCTTCAATG 840
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 778 ATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAGTACAGTAAACTACTACCCTACAGTTTTCTTTAATG 837
Query 841 AGTTTTGGTTGCTAAGGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGACGGTCTCAGAGCTGCCAC 900
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 AGTTTTGGCTGCTAAGGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGACGGTCTCAGAGCTGCCAC 897
Query 901 TTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGCTGTTTCAGCAGATTGATC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 TTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGCTGTTTCAGCAGATTGATC 957
Query 961 AGTCTTTCCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 AGTCTTTCCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAA 1017
Query 1021 AGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCACTATGTTTGTTTCGATGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1018 AGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCACAATGTTTGTTTCGATGC 1077
Query 1081 TTCATTCTGTATTCGACTTCCTTGCATTCAAAAATGATATCCAGTTTTGGAACAAGAACA 1140
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 TTCATTCTGTATTTGACTTCCTTGCATTCAAAAATGATATCCAGTTTTGGAACAAGAACA 1137
Query 1141 AATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAAGTCTGTCGTACTAAACTTTATCTGTCAGTTTATCA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1138 AATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAAGTCTGTCGTACTGAACTTTATGTGTCAGTTTATCA 1197
Query 1201 TCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCATGGATGATACTGGCTAGCTCTGGAGTTG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCGTGGATGATACTGGCTAGCTCTGGAGTTG 1257
Query 1261 GTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAATTGGGAAAGCCATGCGCATTGAGGTTGATCGAAGTG 1320
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAATAGGGAAAGCCATGCGGATTGAGGTTGATCGAAGTG 1317
Query 1321 GGATGATTCCAAGATTGAGGTTCCACGACCGTGAATCCTATGCAAGCAACAAGACCAAGG 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GGATGATTCCAAGATTGAGGTTCCACGACCGTGAATCCTATGCAAGCAACAAGACCAAGG 1377
Query 1381 AGTATGACGACATTGCCATCAAATTCTTATCCTATGTGCTCCTCCTTCTTGTTGTGGGTT 1440
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1378 AGTATGACGACATCGCCATTAAATTCTTATCCTATGTGCTCCTCCTCCTTGTTGTGGGTT 1437
Query 1441 TCTCCATATATTCACTTGCCTATGAACGCCACAAGAGCTGGTACTCATGGATCCTATCTT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 TCTCCATATATTCACTTGCCTATGAACGCCACAAGAGCTGGTACTCATGGATCCTATCTT 1497
Query 1501 CACTAACGAGCTGCGTCTACATGTTTGGTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 CACTAACGAGCTGCGTCTACATGTTTGGTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCA 1557
Query 1561 ACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCACATTTACCATGGAGGCAAATGACATATAAGTTCCTCA 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 ACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCACATTTACCATGGAGGCAAATGACATATAAGTTCCTCA 1617
Query 1621 ACACAATCATCGACGATCTCTTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAATGTTGCATCGCCTTT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1618 ACACAATCATCGACGATCTCTTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAATGCTGCATCGCCTTT 1677
Query 1681 CTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCTTAATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 CTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCTTAATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTG 1737
Query 1741 TGGACAAAACACGTGTCAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTGGATACAA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 TGGACAAAACACGTGTCAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTGGATACAA 1797
Query 1801 AGAAGATCTCTGACCAAGAAGATGACAAGAAAACAAACTAATTAGCTTTGTGCTTTTG 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 AGAAGATCTCTGACCAAGAAGATGACAAGAAAACAAACTAATTAGCTTTGTGCTTTTG 1855
> Ahg940337 jgi|Araly1|940337|scaffold_600881.1
Length=1813
Score = 3009 bits (1629), Expect = 0.0
Identities = 1752/1813 (97%), Gaps = 2/1813 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 49 GAAGGCATCTTCCTGCGATTATGGCGTCGCCGGCAGGTGAAACAGCAGCGGTTGTTGAGG 108
||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1 GAAAGCATCTTTCTGCGAATATGGCGCCTCCGGCAAGTGAAACAGCTGCGGTGGTTGACG 60
Query 109 GCGGAGATGGGCAGCAGCAACGACAAGCTGGTGGGTTTGGGCAGACAATTACCGGAATCA 168
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 GCGGTGATGGGCAGCAGCAACGACAAGCTGGTGGGTTTGGGCAGGCAATTACCGGAATCA 120
Query 169 TAAGAATCGCCGTCTTCTGTTACTTTGCTTCTAAGTTCTTTTCTCCCAAACAAAAACC-T 227
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 121 TTAGAATCGCCGTCTTCTGCTACTTTGCTTCTAAGTTCTTTTCTCCGAAACAAAAACCAT 180
Query 228 GCGGATCCTTCCAAGCCTACTCATCTCATGTCCAATCTATTTCAGAGGGGCGAGCCCATA 287
|||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 181 -CGGATCCTTCTAAGCCTTCTCATCTTATGTCCAATCTCTTTCAGAGGGGAGAGCCCATG 239
Query 288 GATATGTGGTTTTATCTTTCGGAGCATGAGAAATTCAATGACTTCGGCAATGAAGGTGCG 347
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 240 GATATGTGGTTTTATCTTTCGGAGCATGAGAAATTCAATGACTTTGGCAATGAAGGTGCG 299
Query 348 CTTATTTGGCATGAGACAAACATACCTTATGCTGTGTGGAAACCAGAGAGCACTAGGACC 407
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 300 CTTATTTGGCACGAGACAAACATACCTTATGCTGTGTGGAAGCCAGAGAGCACTAGGACC 359
Query 408 TTGTCAATGACGTACTATCCTTCCGAGGCACTGAAGAATAATGGAAGTCTGTATGCTCAT 467
||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TTGTCAATGACATATTATCCATCCGAGGCACTGAAGAATAATGGAAGTCTGTATGCTCAT 419
Query 468 GTCTTCTTTGCTCTATCTGGTTATCCTATAGATCTTAGTGATCCTGAATACCAGCCTCTC 527
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GTCTTCTTTGCTCGATCTGGTTATCCTATAGATCCTAGTGATCCTGAATACCAGCCTCTT 479
Query 528 AACTGCTTTGGCAGGACTCACCCTGTTGCAACTTACTTACCAAAGCGAAAAGCAGATAAG 587
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 AACTGCTTTGGCAGGACACACCCCATTGCAACTTACTTACCAAAGCGAAAAGCAGATAAG 539
Query 588 AAGAAGAGTCTGTTGGGAAATCCCAAAGACTCTGATGAATCCCATGTGGAAGTTGAGGAG 647
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 540 AAGAAGAGTCTGTTGGGAAATCCCAAAGACGATGATGAATCCAATGTTGAAGTTGAGGAG 599
Query 648 GTTGATGGTAAGGACTCGGATCTCAAGGATGAGGGCCCTGTGGAATGGGTATCCTACTGG 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 600 GTTGATGGTAAGGACTCGGATCTCAAGGATGAGGGACCTGTGGAATGGGTTTCCTACTGG 659
Query 708 AAACCAAATGTCACAATTAACCTAGTCGATGACTTTACTCGCTATCCACAGCATGGTGTA 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AAACCAAATGTCACAATTAACCTAGTCGATGACTTTACTCGCTATCCACAGCATGGTGTA 719
Query 768 CCACCAAACATTTATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAGTACAATAAACTACTACCCTACA 827
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 720 CCACCAAACATTGATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAGTACAGTAAACTACTACCCTACA 779
Query 828 GTTTTCTTCAATGAGTTTTGGTTGCTAAGGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGACGGTC 887
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTTTCTTTAATGAGTTTTGGCTGCTAAGGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGACGGTC 839
Query 888 TCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGCTGTTT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGCTGTTT 899
Query 948 CAGCAGATTGATCAGTCTTTCCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATGGTGAA 1007
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CAGCAGATTGATCAGTCTTTTCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATGGTGAA 959
Query 1008 TCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCACTATG 1067
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 960 TCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTATCTCTTGGGTGTCACAATG 1019
Query 1068 TTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTATTCGACTTCCTTGCATTCAAAAATGATATCCAGTTT 1127
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTATTTGACTTCCTTGCATTCAAAAATGATATCCAGTTT 1079
Query 1128 TGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAAGTCTGTCGTACTAAACTTTATC 1187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAAGTCTGTCGTACTAAACTTTATC 1139
Query 1188 TGTCAGTTTATCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCATGGATGATACTGGCT 1247
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1140 TGTCAGTTTATCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCTTGGATGATACTGGCT 1199
Query 1248 AGCTCTGGAGTTGGTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAATTGGGAAAGCCATGCGCATTGAG 1307
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1200 AGCTCCGGAGTTGGTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAATAGGGAAAGCCATGCGGATTGAG 1259
Query 1308 GTTGATCGAAGTGGGATGATTCCAAGATTGAGGTTCCACGACCGTGAATCCTATGCAAGC 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GTTGATCGAAGTGGGATGATTCCAAGATTGAGGTTCCACGACCGTGAATCCTATGCAAGC 1319
Query 1368 AACAAGACCAAGGAGTATGACGACATTGCCATCAAATTCTTATCCTATGTGCTCCTCCTT 1427
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 AACAAGACCAAGGAGTATGACGACATCGCCATTAAATTCTTATCCTATGTGCTCCTCCTC 1379
Query 1428 CTTGTTGTGGGTTTCTCCATATATTCACTTGCCTATGAACGCCACAAGAGCTGGTACTCA 1487
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CATGTTGTGGGTTTCTCCATATATTCACTTGCCTATGAACGCCACAAGAGCTGGTACTCA 1439
Query 1488 TGGATCCTATCTTCACTAACGAGCTGCGTCTACATGTTTGGTTTCATAATGATGTGTCCT 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TGGATCCTATCTTCACTAACGAGCTGCGTCTACATGTTTGGTTTCATAATGATGTGTCCT 1499
Query 1548 CAATTGTTCATCAACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCACATTTACCATGGAGGCAAATGACA 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CAATTGTTCATCAACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCACATTTACCATGGAGGCAAATGACA 1559
Query 1608 TATAAGTTCCTCAACACAATCATCGACGATCTCTTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAATG 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TATAAGTTCCTCAACACAATCATCGACGATCTCTTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAATG 1619
Query 1668 TTGCATCGCCTTTCTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCTTAATATACTTGTACCAGAGA 1727
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CTGCATCGCATTTCTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCTTAATATACTTGTACCAGAGA 1679
Query 1728 TGGGTTTATCCTGTGGACAAAACACGTGTCAACGAGTTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAG 1787
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TGGGTTTATCCTGTGGACAGAACACGTGTCAACGAATTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAG 1739
Query 1788 TCTGTGGATACAAAGAAGATCTCTGACCAAGAAGATGACAAGAAAACAAACTAATTAGCT 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TCTGTGGATACAAAGAAGATCTCTGACCAAGAAGATGACAAGAAAACAAACTAATTAGCT 1799
Query 1848 TTGTGCTTTTGTT 1860
|||||||||||||
Sbjct 1800 TTGTGCTTTTGTT 1812
> Ahg489219 jgi|Araly1|489219|fgenesh2_kg.6__2353__AT5G23575.1
Length=2207
Score = 1877 bits (1016), Expect = 0.0
Identities = 1479/1703 (87%), Gaps = 29/1703 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 156 ATTACCGGAATCATAAGAATCGCCGTCTTCTGTTACTTTGCTTCTAAGTTCTTTTCTCCC 215
||| |||||||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 316 ATTTCCGGAATCGTTAGAATCGCCGTCTTTTGGTATTTTGCTTCCAAGTTCTTTTCACCT 375
Query 216 AAACAAAAACCTGCGGATCCTTCCAAGCC-TACTCATCTCATGTCCAATCTATTTCAGAG 274
||||| |||||| |||||| || || | |||| |||||| ||||||| || || |
Sbjct 376 AAACAGAAACCTATGGATCCCTCTGCTCCGT-CTCAGCTCATGACCAATCTCTTCCACAA 434
Query 275 GGGCGAGCCCA-TAGATATGTGGTTTTATCTTTCGGAGCATGAGAAATTCAATGACTTCG 333
|||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 435 GGGCGA-ATCATTGGATATGTGGTTTTATCTCTCAGAGCATGAGAAGTTCAATGACTTTG 493
Query 334 GCAATGAAGGTGCGC-TTATTTGGCATGAGACAAACATACCTTATGCTGTGTGGAAACCA 392
||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 494 GCAATGATCGTGCGCTTTA-TTGGCATGAGACCAATATACCTTATGCTGTATGGACACCA 552
Query 393 GAGAGCACTAGGACCTTGTCAATGACGTACTATCCTTCCGAGGCACTGA-AGAATAATGG 451
||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||| |||| | ||||||||||
Sbjct 553 GAGAGTATTAGGACCAAGTCACTGACGTATTATCCATCTGAGACACT-ACAGAATAATGG 611
Query 452 AAGTCTGTATGCTCATGTCTTCTTTGCTCTATCTGG-TTATCCTATAGATCTTAGTGATC 510
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||| | || |||||
Sbjct 612 AAGTCTGTATGCTCATGTCTTTTTTGCTCGGTCTGGATT-TCCCATAGACCCTAATGATC 670
Query 511 CTGAATACCAGCCTCTCAACT-GCTTTGGCAGGACTCACCCTGTTGCAACTTACTTACCA 569
|||||||||| ||||| || | | ||| ||||||| || |||| || |||||||| |||
Sbjct 671 CTGAATACCAACCTCTTAA-TAGTTTTAGCAGGACACATGCTGTGGCGACTTACTTTCCA 729
Query 570 AAGCGAAAAG-CAGATAAGAAGAAGAGTCTGTTGGGAAATCCCAAAGACTCTGATGAATC 628
|||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 730 AAGC-AAAAGAAAAATAAGAAGAAGAGTCTCTTGGGAAGTCCCAAAGACTCTGATGAATC 788
Query 629 CCATGTG-GAAGTTGAGGAGGTT-GATGGTAAGGACTCGGATCTCAAGGATGAGGGCCCT 686
| | | | ||||||||| | ||| || | |||| | || |||| |||||| |||| ||||
Sbjct 789 CGA-GCGTGAAGTTGAGAAAGTTGGA-GATAAGAAATCCGATCCCAAGGAAGAGGTCCCT 846
Query 687 GTGGAATGGGTAT-CCTACTGGAAACCAAATGTCACAATTAACCTAGTCGATGACTTTAC 745
||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||
Sbjct 847 GTGGAATGGATATCCCT-CTGGAAACCTAATGTCACGATTAACCTGGTTGATGATTTTAC 905
Query 746 TCGCTATCCACAGCATGGTGTACCACCAAACATTTATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAG 805
||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||
Sbjct 906 TCGCTATTCACAAAATGGTGTACCACCAAATATTGCTCCTCACTTACTGGTAGAACCTAC 965
Query 806 TACAATAAACTACTACCCTACAGTTTTCTTCAATGAGTTTTGGTTGCTAAGGGACAAGTT 865
||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 966 CACAGGAAATTACTATCCTACAATTTACTTCAATGAGTTTTGGCTGCTAAGGGACAAATT 1025
Query 866 GATTTTAATCAATGAGACGGTCTCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAG 925
||| | |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1026 CATTCCAGTCAATGAGACAGTCTCAGAACTACCACTCAATCTGGAAATAAGCCCCATAAG 1085
Query 926 CATGACAAAGTGGCAGCTGTTTCAGC-AGATTGATCAGTCTTTCCAGATTCACCGTAGCT 984
||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1086 CATGATGAAGTGGCAACTGTTTCAGCAAG-TCGATCAGTCTTTCCAGATGCAGCGTAGCT 1144
Query 985 ATGGAAGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATC 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 ATGGAAGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATC 1204
Query 1045 CCTATCTGTTGGGCGTCACTATGTTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTATTCGACTTCCTTG 1104
||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 1205 CCTATCTCTTGGGTATCACGATGTTTGTTTCGATGCTTCATTCAGTGTTCGACTTCCTGG 1264
Query 1105 CATTCAAAAATGATATCCAGTTTTGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGA 1164
||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1265 CATTCAAAAATGATATCCAATTCTGGAACAAAAACAAATCAATGGAAGGACTGTCTGCAA 1324
Query 1165 AGTCTGTCGTACTAAACTTTATCTGTCAGTTTATCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACG 1224
||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 AGTCTGTTGTACTGAACTTTATCTGTCAGTTTGTCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACG 1384
Query 1225 ACACTTCATGGATGATACTGGCTAGCTCTGGAGTTGGTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAA 1284
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1385 ACACTTCATGGATGATACTGGCTAGTTCTGGAGTCGGTGTCTGCATTGAGTTCTGGAAAA 1444
Query 1285 TTGGGAAAGCCATGCGCATTGAGGTTGATCGAAGTGGGATGATTCCAAGATTGAGGTTCC 1344
| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1445 TAGGGAAAGCCATGCGTATAGAGGTTGATCGAAGTGGAATGATTCCAAGGTTGAGGTTCC 1504
Query 1345 ACGACCGTGAATCCTATGCAAGCAACAAGACCAAGGAGTATGACGACATTGCCATCAAAT 1404
|||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1505 ACGATCGTGAATCCTATGCAAGCAATAAAACCAAGGAGTATGATGACATTGCCATCAAAT 1564
Query 1405 TCTTATCCTATGTGCTCCTCCTTCTTGTTGTGGGTTTCTCCATATATTCACTTGCCTATG 1464
|||||||||||||||||||||| ||||| | || || || |||||||| || |||||||
Sbjct 1565 TCTTATCCTATGTGCTCCTCCTCCTTGTCATTGGCTTATCTATATATTCTCTCGCCTATG 1624
Query 1465 AACGCCACAAGAGCTGGTACTCATGGATCCTATCTTCACTAACGAGCTGCGTCTACATGT 1524
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1625 AACGCCACAAGAGCTGGTATTCTTGGATCCTGTCTTCACTAACAAGCTGTGTCTACATGT 1684
Query 1525 TTGGTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCAACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCAC 1584
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||
Sbjct 1685 TTGGTTTCATCATGATGTGTCCTCAGCTATTCATCAACTATAAGCTAAAATCAGTGGCAC 1744
Query 1585 ATTTACCATGGAGGCAAATGACATATAAGTTCCTCAACACAATCATCGACGATCTCTTTG 1644
||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 1745 ATTTACCATGGAGACAGATGACTTACAAGTTCCTCAACACCATTATCGACGATCTTTTTG 1804
Query 1645 CTTTTGTCATCAAAATGCCAATGT-TGCATCGCCTTTCTGTCTTCCGAGATGATGTGATA 1703
| ||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1805 CCTTTGTCATCAAAATGCCGAT-TCTACATCGACTTTCTGTATTCCGAGATGATGTGATA 1863
Query 1704 TTCTTAATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTGTGGACAAAACACGTGTCAACGAG 1763
||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1864 TTCTTGATATACTTATACCAAAGGTGGGTTTACCCTGTGGACAAGACACGTGTTAACGAG 1923
Query 1764 TTTGGTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTGGATACA-AAGAAGATCTCTGACCAAGAAGA 1822
|| |||||||||||||||||||| ||| || | | ||| |||| |||| |||||||
Sbjct 1924 TTCGGTTTTGGAGGTGAGGATGAAACTGCAGAGA-AGAAGTTGATCACTGAGAAAGAAGA 1982
Query 1823 TGA---CAAGAAAACAAACTAAT 1842
|| |||||||||||||||||
Sbjct 1983 AGAAGACAAGAAAACAAACTAAT 2005
> Ahg892784 jgi|Araly1|892784|Al_scaffold_0006_780
Length=2427
Score = 822 bits (445), Expect = 0.0
Identities = 468/479 (98%), Gaps = 2/479 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 643 AGGAGGTTGATGGTAAGGACTCGGATCTCAAGGATGAGGGCCCTGTGGAATGGGTATCCT 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 AGGAGGTTGATGGTAAGGACTCGGATCTCAAGGATGAGGGCCCTGTGGAATGGGTATCCT 859
Query 703 ACTGGAAACCAAATGTCACAATTAACCTAGTCGATGACTTTACTCGCTATCCACAGCATG 762
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 ACTGGAAACCAAATGTCACAAATAACCTAGTCGATGACTTTACTCGCTATCCACAGCATG 919
Query 763 GTGTACCACCAAACATTTATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAGTACAATAAACTACTACC 822
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 920 GTGTACCACCAAACATTGATCCTTACTTACTGGTGGAACCTAGTACAGTAAACTACTACC 979
Query 823 CTACAGTTTTCTTCAATGAGTTTTGGTTGCTAAGGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGA 882
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 CTACAGTTTTTTTCAATGAGTTTTGGCTGCTAAGGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGA 1039
Query 883 CGGTCTCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGC 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 CGGTCTCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAAGCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGC 1099
Query 943 TGTTTCAGCAGATTGATCAGTCTTTCCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATG 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 TGTTTCAGCAGATTGATCAGTCTTTCCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATG 1159
Query 1003 GTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCA 1062
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 TTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGGAAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCA 1219
Query 1063 CTATGTTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTATTCGACTTCCTTGCATTCAAAAA-TGATAT 1120
| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1220 CAATGTT-GTTTCGATGCTTCATTCTGTATTTGACTTCCTTGCATTCAAAAAATGCTAT 1277
Score = 93.5 bits (50), Expect = 6e-18
Identities = 50/50 (100%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1116 GATATCCAGTTTTGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAA 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GATATCCAGTTTTGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAA 1352
> Ahg940340 jgi|Araly1|940340|scaffold_600884.1
Length=1933
Score = 610 bits (330), Expect = 1e-173
Identities = 332/333 (99%), Gaps = 0/333 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1528 GTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCAACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCACATT 1587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600 GTTTCATAATGATGTGTCCTCAATTGTTCATCAACTATAAGCTGAAGTCAGTAGCACATT 1659
Query 1588 TACCATGGAGGCAAATGACATATAAGTTCCTCAACACAATCATCGACGATCTCTTTGCTT 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 TACCATGGAGGCAAATGACATATAAGTTCCTCAACACAATCATCGACGATCTCTTTGCTT 1719
Query 1648 TTGTCATCAAAATGCCAATGTTGCATCGCCTTTCTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCT 1707
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1720 TTGTCATCAAAATGCCAATGCTGCATCGCCTTTCTGTCTTCCGAGATGATGTGATATTCT 1779
Query 1708 TAATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTGTGGACAAAACACGTGTCAACGAGTTTG 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780 TAATATACTTGTACCAGAGATGGGTTTATCCTGTGGACAAAACACGTGTCAACGAGTTTG 1839
Query 1768 GTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTGGATACAAAGAAGATCTCTGACCAAGAAGATGACA 1827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 GTTTTGGAGGTGAGGATGAGTCTGTGGATACAAAGAAGATCTCTGACCAAGAAGATGACA 1899
Query 1828 AGAAAACAAACTAATTAGCTTTGTGCTTTTGTT 1860
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1900 AGAAAACAAACTAATTAGCTTTGTGCTTTTGTT 1932
Score = 599 bits (324), Expect = 3e-170
Identities = 436/483 (90%), Gaps = 35/483 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 856 GGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGACGGTCTCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAA 915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GGGACAAGTTGATTTTAATCAATGAGACGGTCTCAGAGCTGCCACTTAATCTGGAAGTAA 1077
Query 916 GCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGCTGTTTCAGCAGATTGATCAGTCTTTCCAGATTC 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GCCCCATAAGCATGACAAAGTGGCAGCTGTTTCAGCAGATTGATCAGTCTTTCCAGATTC 1137
Query 976 ACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACTAAAGAGGGTGTTTTTGG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1138 ACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGATGGTGAATCTGACGAACT-AA-AGGGTGTTTTTGG 1195
Query 1036 AAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCAC--T-ATG-TT---TG--T--TTC-G-A--TG- 1079
|||||||||||||||||||||||||||| | || || || | ||| | | ||
Sbjct 1196 AAGGAAATCCCTATCTGTTGGGCGTCACAATGTTGTTTCGATGCTTCATTCTGTATTTGA 1255
Query 1080 ----CTT-CATTC-----TG-TATTCGACTT--CCTTG-CATT-CAAAAATGATATCCAG 1124
||| ||||| || |||| || || || || |||| | | |||||||||
Sbjct 1256 CTTCCTTGCATTCAAAAATGCTATT-GAATTACCCGTGACATTCCCTGCA-GATATCCAG 1313
Query 1125 TTTTGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAAGTCTGTCGTACTAAACTTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1314 TTTTGGAACAAGAACAAATCTATGGAAGGACTGTCTGCGAAGTCTGTCGTACTGAATTTT 1373
Query 1185 ATCTGTCAGTTTATCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCATGGATGATACTG 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1374 ATCTGTCAGTTTATCATCTTCCTCTACCTGCTTGACAACGACACTTCGTGGATGATACTG 1433
Query 1245 GCTAGCTCTGGAGTTGGTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAATTGGGAAAGCCATGCGCATT 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1434 GCTAGCTCTGGAGTTGGTGTCTGCATCGAGTTCTGGAAAATAGGGAAAGCCATGCGGATT 1493
Query 1305 GAG 1307
|||
Sbjct 1494 GAG 1496
Score = 326 bits (176), Expect = 5e-88
Identities = 195/204 (96%), Gaps = 1/204 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 545 TCACCCTGTTGCAACTTACTTACCAAAGCGAAAAGCAGATAAGAAGAAGAGTCTGTTGGG 604
||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 816 TCAGCC-GTTGCAACTTACTTGCCAAAGCGAAAAGCAGATAAGAAGAAGAGTTTGTTGGG 874
Query 605 AAATCCCAAAGACTCTGATGAATCCCATGTGGAAGTTGAGGAGGTTGATGGTAAGGACTC 664
||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 AAATCCCAAAGACTCTGATGAATCCAAAGTTGAAGTTGAGGAGGTTGATGGTAAGGACTC 934
Query 665 GGATCTCAAGGATGAGGGCCCTGTGGAATGGGTATCCTACTGGAAACCAAATGTCACAAT 724
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 GGATCTCAAGGATGAGGGCCATGTGGAATGGGTATCCTACTGGAAACCAAATGTCACAAA 994
Query 725 TAACCTAGTCGATGACTTTACTCG 748
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 TAACCTAGTCGATGACTTTACTCG 1018
Score = 174 bits (94), Expect = 2e-42
Identities = 102/106 (96%), Gaps = 0/106 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1372 AGACCAAGGAGTATGACGACATTGCCATCAAATTCTTATCCTATGTGCTCCTCCTTCTTG 1431
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1495 AGACCAAGGAGTATGACGACATCGCCATTAAATTCTTATCCTATGCGCTCCTCCTCCTTG 1554
Query 1432 TTGTGGGTTTCTCCATATATTCACTTGCCTATGAACGCCACAAGAG 1477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTGTGGGTTTCTCCATATATTCACTTGCCTATGAACGCCACAAGAG 1600
Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-14
Identities = 48/50 (96%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 685 CTGTGGAATGGGTATCCTACTGGAAACCAAATGTCACAATTAACCTAGTC 734
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 CTGTGGAATGGGTATCAAACTGGAAACCAAATGTCACAATTAACCTAGTC 791
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 76028129020
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5