BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G11700.2 Length=5223 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg940649 jgi|Araly1|940649|scaffold_601193.1 6244 0.0 > Ahg940649 jgi|Araly1|940649|scaffold_601193.1 Length=4325 Score = 6244 bits (3381), Expect = 0.0 Identities = 3591/3691 (97%), Gaps = 19/3691 (1%) Strand=Plus/Plus Query 270 TGTGATGACTCTTGATACTAGTGGATGGCTCGATTTCAATTTTGCTGCGTCTTCGTCTTG 329 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 1 TGTGATGACTCTTGATACTAGTGGATGGCTCGATTTCAATTTTGCTGCGTCTTCATCGTG 60 Query 330 GTCGCTCTTGCGGTTTTGGCCGTAAACCCTAGTTCAAGCTATCGATTTACCATTGTGGAA 389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTCGCTCTTGCGGTTTTGGCCGTAAACCCTAGTTCAAGCTATCGATTTACCATTGTGGAA 120 Query 390 CCGAAATCGGGTTCTGATTCCGATTTGGACTCAGATTCAGAGTCGTTACTTTTCCATCAG 449 ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CCGAATTCGGGTTTTGATTCGGATTTGGACTCAGATTCAGAGTCGTTACTTTTCCATCAG 180 Query 450 GACTACTCTCCGCCTGCTCCGCCACCGCCACCACCGCATGGACCGTCGGTATCTTGTAGC 509 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GATTACTCTCCGCCTGCTCCGCCACCGCCACCACCGCATGGACCGTCGGTATCTTGTAGC 240 Query 510 GAGGATCTCGGCGGCGTTGGGTTTTTGGATACTACTTGTAAGATTGTCGCCGATTTGAAC 569 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GAGGATCTCGGTGGCGTTGGGTTTTTGGATACTACTTGTAAGATTGTCGCCGATTTGAAT 300 Query 570 CTTACGCACGATGTGTATATAGCTGGGAAGGGGAATTTTATCATCCTGCCTGGTGTTAGG 629 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTTACGCATGATGTGTATATAGCTGGGAAGGGGAATTTTATCATCCTGCCTGGTGTTAGG 360 Query 630 TTTCACTGCCCGATCCCTGGTTGTTCTATAGCTATCAATGTTTCTGGAAACTTCTCTTTG 689 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTTCACTGCCCGATCCCTGGTTGCTCTATAGCTATCAATGTTTCTGGAAACTTCTCTTTG 420 Query 690 GGAGCGGAATCTACAATTGTCGCTGGGACATTGGAGCTTACAGCTGGTAATGCTAGCTTT 749 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct 421 GGAGCGGAATCTACAATTGTCGCTGGGACATTGGAGCTTTCAGCTGGTAATGCTAGTTTT 480 Query 750 GCTAATGGGTCGGCGGTGAACACGACGGGGTTAGCTGGGAGCCCTCCGCCACAGACCAGT 809 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 481 GCCAATGGGTCGGCGGTGAACACGACGGGATTAGCTGGGAATCCTCCGCCACAGACCAGT 540 Query 810 GGGACACCGCAGGGGATTGATGGTGCTGGTGGTGGACATGGTGGTAGAGGCGCTTGTTGT 869 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 541 GGGACACCGCAGGGGATTGATGGTGCTGGTGGTGGACATGGTGGTAGAGGCGCTTGCTGT 600 Query 870 TTGACTGACACTAAGAAGCTACCTGAAGATGTGTGGGGAGGTGATGCATACTCTTGGTCG 929 ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 601 TTGACTGACACTAGGAAGCTTCCTGAAGATGTGTGGGGAGGTGATGCATACTCGTGGTCG 660 Query 930 ACTCTGCAGAAGCCGTGGAGCTATGGTAGTAAAGGAGGGTCAACTAGTAGAGAGATTGAT 989 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 661 ACTCTGCAGAGGCCGTGGAGCTATGGTAGTAAAGGAGGGTCAACGAGTAGAGAGATTGAT 720 Query 990 TATGGAGGAGGAGGAGGTGGGAAAGTGAAGATGGATATTCTGCAGCTTCTGGATGTTAAC 1049 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TATGGAGGAGGAGGAGGTGGCAAAGTGAAAATGGATATTCTGCAGCTTCTGGATGTTAAT 780 Query 1050 GGAAGCCTTTTGGCAAACGGAGGCT-ATGGAGGAGCCAAAGGCGGTGGTGGATCTGGTGG 1108 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 781 GGAAGCCTTTTGGCAAACGGAGG-TAATGGAGGAGCCAAAGGTGGTGGTGGCGCTGGTGG 839 Query 1109 CAGCATCTACATCAAGGCATACAAGATGACTGGAATTGGAAAGATCAGTGCATgtggtgg 1168 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 CAGCATCTACATCAAAGCATACAAGATGACTGGAATTGGAAAGATCAGTGCATGTGGTGG 899 Query 1169 gagtggttatggtggtgggggtggtggAAGAGTATCTGTCGATATTTTTAGTAGGCATGA 1228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GAGTGGTTATGGTGGTGGGGGTGGTGGAAGAGTATCTGTCGATATTTTTAGTAGGCATGA 959 Query 1229 TGACCCGAAGATTTTTGTGCATGGCGGATACAGTATCGGATGTCCAGATAACTCGGGTGC 1288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 960 TGACCCGAAGATTTTTGTGCATGGCGGATACAGTATCGGATGTCCAGACAACTCAGGTGC 1019 Query 1289 TGCTGGAACTCTATATGATGCTGTTCCCCGAAGCCTTTTCGTTAGCAACTACAATCA-GA 1347 |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || Sbjct 1020 TGCTGGGACACTCTATGATGCTGTTCCCCGAAGCCTTTTCGTTAGCAACTACAAT-ATGA 1078 Query 1348 CAACAGACACGTATACGCTTCTCTTAGAATTTCCATTCCAGCCACTTTGGACCAATGTTT 1407 | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 CGACAGACACGTATACACTTCTCTTAGAATTTCCCTTCCAGCCACTTTGGACCAATGTTT 1138 Query 1408 ATATTCAGGATAAAGCACGCGCAACTTGTCCTCTGTTATGGAGTCGTGTCCAGGTTCAAG 1467 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 ATATTCAGGATAAAGCGCGAGCAACTTGTCCTCTGTTATGGAGTCGTGTCCAGGTTCAAG 1198 Query 1468 GACAAATTAGTTTGTTGTGCGGTGGTGTTTTGAGCTTCGGATTAGCTCATTATGGTACAT 1527 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| Sbjct 1199 GACAAATTAGTTTGTTGTGCGGTGGTGTTTTGAGCTTTGGATTAGCTCATTTTGGCACAT 1258 Query 1528 CAGTATTTGAGTTGTTGGCAGAAGAACTCTTAATGAGTGATTCTACCATCAAGGTTTACG 1587 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 1259 CAGTATTTGAGTTGTTTGCAGAAGAACTCTTAATGAGTGATTCTACTATCAAGGTTTATG 1318 Query 1588 GGGCATTACGCATGACTGTCAAGATGTTCTTGATGTGGAACTCAGAATTGCATTTAGATG 1647 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct 1319 GGGCATTACGCATGACTGTCAAAATGTTCTTGATGTGGAATTCAGAATTGCATATAGATG 1378 Query 1648 GAGGAGGAGGAGATACAACTGTTTCAACTTCCATGCTTGAGGCTAGCAATTTATTCGTTC 1707 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 GAGGAGGAGGAGATACAACTGTTTCAACTTCCATGCTTGAGGCTAGCAATTTATTCGTTC 1438 Query 1708 TTAGGGGATCATCTGTCATTCGGTCAAATGCAAATCTTGGAGTCCATGGACAAGGTTTCT 1767 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 TTAGGGGATCATCTGTCATTCGGTCAAATGCAAATCTTGGAGTCCATGGACAAGGTTTCT 1498 Query 1768 TGAATCTAACTGGACCAGGGGATTCAATTGAAGCACAACGGCTTGTTTTGTCACTGTTTT 1827 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1499 TGAATCTAACTGGACCAGGGGATTCGATTGAAGCACAACGGCTTGTTTTGTCACTATTTT 1558 Query 1828 ACCGGATTTATGTTGGGCCTGGGTCTATCTTGCGTGCTCCTCTACTGAATGCGTCCAGAG 1887 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 ACCGGATTTATGTTGGGCCTGGGTCTCTTTTGCGTGCTCCTCTACTGAATGCGTCCAGAG 1618 Query 1888 ATGCTGTTACACCAAAGCTCTATTGTGAACGACAAGATTGCCCTTATGAACTACTGAATC 1947 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1619 ATGCTGTTACACCAAAGCTCTATTGTGAACGGCAAGATTGCCCTTATGAACTACTGAATC 1678 Query 1948 CTCCAGAGGATTGCAATGTGAATGCATCTCTGTCCTTTACTCTACAGATATGCCGAGTTG 2007 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || | Sbjct 1679 CTCCAGAGGATTGCAATGTCAATTCATCTCTGTCCTTTAC-C--C---TA---C------ 1723 Query 2008 AGGATATTCTCGTCGAAGGTTTCATTAAAGGATCAGTAGTTCATTTCCACCGGGCAAAAA 2067 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1724 AGGATATTCTCGTCGAAGGTTTCATTAAAGGATCAGTAGTTCATTTCCACCGAGCAAAAA 1783 Query 2068 CTGTAACCCTTGAACCCTCTGGAGAGATTAGTGCCAGTGGAATGGGTTGTAGAGGTGGCG 2127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1784 CTGTAACCCTTGAACCCTCTGGAGAGATTAGTGCCAGTGGAATGGGTTGTAGAGGTGGCG 1843 Query 2128 TAGGTGAAGGTAAATTGCTTGGAAATGGCTTTGGCAGTGGTGGTGGACATGGTGGTAAAG 2187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1844 TAGGTGAAGGTAAATTGCTTGGAAATGGCTTTGGCAGTGGTGGTGGACATGGTGGTAAAG 1903 Query 2188 GGGGGCGTGTTTGTTACAATAACAGCTGTGTTGAAGGTGGAATTACATATGGAAATGCAA 2247 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1904 GGGGGCGTGTATGTTACAATAACAGCTGTGTTGAAGGTGGAATTACATATGGAAATGCAA 1963 Query 2248 ATCTCCCTTGTGAGCTTGGCAGTGGAAGTGGCGATTTTAGCCCTGGTTATTCATCTGCTG 2307 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1964 ATCTCCCTTGTGAGCTTGGCAGTGGAAGTGGCGATTTTAGCCCTGGTTATTCATCTGCTG 2023 Query 2308 GTGGTGGTATTGTAGTGATTGGTTCAATGGAGCAGCCTCTATCTGGTTTATCGCTTGAAG 2367 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2024 GTGGTGGTATTGTAGTGATTGGTTCAATGGAGCAGCCTCTATCTGGTTTATCACTTGAAG 2083 Query 2368 GCTCAATTAGGGTTGATGGAGAAAGTGTCAAACGTTTGAGTAGAGATGAAAACGGTTCTA 2427 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2084 GCTCAATTAGGGTTGATGGAGAAAGTGTCAAACGTTTGAGTAGAGATGAAAATGGTTCTA 2143 Query 2428 TTGTAGCTCCTGGGGGTGGTTCTGGGGGAACAGTCCTTTTGTTCCTGCGTTATCTTATTT 2487 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2144 TTGTAGCTCCTGGGGGTGGTTCTGGGGGAACAGTCCTTTTGTTCCTGCGTTATCTTATTT 2203 Query 2488 TAGGAGAGTCATCTCTTCTCTCAAgtggtggtgggtctggcagtcctggtggtggtggtg 2547 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2204 TAGGAGAGTCGTCCCTTCTCTCAAGTGGTGGTGGGTCTGGCAGTCCTGGTGGTGGTGGTG 2263 Query 2548 gtggcggaggtggGAGGATTCATTTTCATTGGTCAAACATTCCTACTGGGGACATATACC 2607 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2264 GTGGCGGAGGTGGGAGGATTCATTTTCATTGGTCAAACATTCCGACTGGGGACATATACC 2323 Query 2608 AGCCAATTGCTAGTGTAAAAGGAATAATTCATGCACGAGGGGGAGCAGCAGCGGATGATG 2667 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2324 AGCCCATTGCTAGTGTAAAAGGAATAATTCATGCACGAGGGGGAGCAGCAGCGGATGATG 2383 Query 2668 GTTTTTATGGCAAAAATGGTACAATAACTGGGACGGCTTGTCCGAAGGGACTCCACGGTA 2727 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2384 GTTTTTATGGCAAAAATGGTACAATAACTGGGACGGCTTGTCCGAAGGGACTCCACGGTA 2443 Query 2728 TATTTTGCAAGGAATGCCCATCTGGTACATTCAAGAATGTTACTGGATCCGACCCTTCTC 2787 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2444 TATTTTGCAAGGAATGTCCATCTGGTACATTCAAGAATGTTACTGGATCCGACCCTTCTC 2503 Query 2788 TTTGTCGTCCTTGTCCGGTTGATGAGCTTCCAACTCGTGCTGTCTATGTCACAGTTCGAG 2847 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2504 TTTGTCGCCCTTGTCCCGTTGATGAGCTTCCAACTCGTGCTGTCTATGTCACAGTTCGAG 2563 Query 2848 GTGGTGTTTCTGAGACACCATGTCCATATCGATGCATATCGGAAAGGTATCACATGCCAC 2907 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2564 GTGGCGTTTCTGAGACACCATGTCCATATCGATGCATATCGGAAAGGTATCACATGCCAC 2623 Query 2908 ACTGTTACACCGCACTCGAGGAGTTAATTTACACATTTGGTGGGCCTTGGTTGTTTGGTC 2967 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2624 ACTGTTACACCGCACTCGAGGAGTTAATTTACACATTTGGTGGGCCTTGGTTGTTTGGTC 2683 Query 2968 TTCTTCTGATGGGTCTCCTCATCCTCTTAGCACTTGTACTTAGTGTTGCACGAATGAAAT 3027 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2684 TTCTTCTGATGGGTCTCCTCATCCTCTTAGCACTTGTACTTAGTGTTGCACGAATGAAAT 2743 Query 3028 TTGTTGGAGTTGATGATTTACCTGGCCCAGCTCCCACACAGCATGGCTCTCAAATAGATC 3087 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2744 TTGTTGGAGTTGATGATTTGCCTGGCCCAGCTCCCACACAGCATGGCTCTCAAATAGATC 2803 Query 3088 ATTCGTTCCCTTTCCTGGAATCACTTAATGAGGTGTTGGAAACAAATAGAGCTGAGCAAT 3147 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2804 ATTCCTTCCCTTTCCTGGAATCACTTAATGAGGTGTTGGAAACAAATAGAGCTGAGCAAT 2863 Query 3148 CTCAGAGTCATGTGCATAGAATGTATTTTATGGGTCCTAATACATTCAGTGAACCGTGGC 3207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2864 CTCAGAGTCATGTGCATAGAATGTATTTTATGGGTCCTAATACATTCAGTGAGCCGTGGC 2923 Query 3208 ATCTCTCACACATTCCCCCGGAGGAGATTAAAGAGATAGTATATGAGGCTGCATTTAACA 3267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2924 ATCTCTCACACATTCCCCCGGAGGAGATTAAAGAGATAGTATATGAGGCTGCATTTAACA 2983 Query 3268 CATTTGTCGACGAAATCAACTCTATAGCTGCATATCAATGGTGGGAAGGTGCTATATATA 3327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2984 CATTTGTCGACGAAATCAACTCTATAGCTGCATATCAATGGTGGGAAGGTGCCATATATA 3043 Query 3328 GTATTCTTTCAGTAGTTGCGTATCCGCTCGCATGGTCATGGCAGCAATGGCGGCGGAAGA 3387 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3044 GTATTCTTTCAGTAGTTGCATATCCGCTCGCATGGTCATGGCAGCAATGGCGGCGGAAGA 3103 Query 3388 TGAAGTTGCAAAAATTGCGTGAGTTTGTACGTTCAGAATATGATCACTCCTGTTTACGCT 3447 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3104 TGAAGTTGCAAAAACTGCGTGAGTTTGTACGTTCAGAATATGATCACTCCTGTTTACGCT 3163 Query 3448 CCTGTCGCTCCCGAGCTTTATACGAGGGTCTGAAGGTCGCTGCAACCTCCGATTTGATGC 3507 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3164 CCTGTCGCTCCCGAGCTTTATACGAGGGTCTGAAGGTCGCTGCAACCTCCGATTTGATGC 3223 Query 3508 TTGCGTATCTGGATTTCTTCCTTGGTGGGGATGAAAAAAGGACAGACCTTCCACCTCGAC 3567 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3224 TTGCATATCTGGATTTCTTCCTTGGTGGTGATGAAAAAAGGACAGACCTTCCACCTCGAC 3283 Query 3568 TTCACCAAAGGTTTCCAATGCCCATATTGTTTGGTGGTGATGGCAGTTACATGGCTCCTT 3627 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3284 TTCACCAAAGGTTACCAATGCCCATATTGTTTGGTGGTGATGGCAGTTACATGGCTCCTT 3343 Query 3628 TCTCACTTCAAAATGACAACATTCTTACCAGTCTGATGAGTCAGCTTGGTTCGCCTACTA 3687 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3344 TCTCACTTCAAAATGACAACATTCTTACCAGTCTGATGAGTCAGCTTGGTTCGCCTACTA 3403 Query 3688 CTTGGTATAGACTGGTGGCTGGTGTAAATGCTCAATTACGTCTTGTTCGCCGTGGGCGTC 3747 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3404 CTTGGTACAGACTGGTGGCTGGTGTTAATGCTCAATTACGTCTTGTTCGCCGTGGGCGTC 3463 Query 3748 TGAGATCAACATTTCATTCTGTTCTGAGATGGTTAGAAACTCATGCTAATCCCGCTCTGG 3807 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3464 TGAGATCAACATTTCATTCTGTTCTGAAATGGTTAGAAACTCATGCTAATCCCGCTCTGG 3523 Query 3808 AAACACATGGCATACGGGTTGATCTGGCCTGGTTCCAGACTACAGCTTGTGGTTACTGCC 3867 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3524 AAACACATGGCATACGGGTTGATCTGGCCTGGTTCCAGACTACAGCTTGTGGTTACTGCC 3583 Query 3868 AATATGGTCTCTTGATTCATACTGTTGAGGATTGTGAACCAACATCACCTCAGTGTGTCA 3927 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3584 AATATGGTCTCTTGATTCATACTGTTGAGGATTGTGAACCAACATCACCTCAGTGTGTCA 3643 Query 3928 GTGAAACAACATGGACTGAAATCCAGCCACG 3958 ||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3644 ATGAAACAGCATGGACTGAAATCCAGCCACG 3674 Score = 1160 bits (628), Expect = 0.0 Identities = 644/652 (99%), Gaps = 0/652 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4129 GAAAGAACTATGGAGGGATAATCGACCTTGACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAG 4188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3674 GAAAGAACTATGGAGGGATAATCGACCTTGACAGCTTACCGAGTCTGAAAGAGAAGAGAG 3733 Query 4189 ATATGTTTTTCCTTCTCTCTTTCTTAGTTCACAACACAAAACCTGTGGGCCACCAGGATA 4248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3734 ATATGTTTTTCCTTCTCTCTTTCTTAGTTCACAACACAAAACCTGTGGGCCACCAGGATA 3793 Query 4249 TGGTTGGCTTAGTTATCTCGATGTTACTTTTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACAC 4308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3794 TGGTTGGCTTAGTTATCTCGATGTTACTTTTAGGAGATTTTAGTCTAGTCTTGCTCACAC 3853 Query 4309 TCCTCCAGCTGTATTCGATTTCTTTGCTGGATGTACTTTTGGCTTTGTTTATATTACCTC 4368 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3854 TGCTCCAGCTGTATTCAATTTCTTTGCTGGATGTACTTTTGGCTTTGTTCATATTACCTC 3913 Query 4369 TCGGCTTGCTTCTGCCATTCCCCGCTGGGATTAATGCCTTATTCAGTCATGGACCCAGAC 4428 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3914 TCGGCTTGCTTCTGCCATTCCCCGCCGGGATTAATGCCTTATTCAGTCATGGACCCAGAC 3973 Query 4429 GCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCATTGTGGAACTTCATGTCCTTAGTCAATGTGT 4488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3974 GCTCTGCTGGCTTAGCACGTGTTTACGCATTGTGGAACTTCATGTCCTTAGTCAATGTGT 4033 Query 4489 TTGTGGCTTTTCTCTGCGGATATGTTCATTATCATAGTGAATCATCAGCTAGCAAGAAAA 4548 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4034 TTGTTGCTTTTCTCTGCGGATATGTTCATTATCACAGTGAATCATCAGCTAGCAAGAAAA 4093 Query 4549 TCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATGGGTGAAAGTGAATGGTGGATATTCCCAGCAG 4608 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4094 TCCCATTTCAGCCGTGGAATATAAACATGGGTGAAAGTGAATGGTGGATATTCCCAGCAG 4153 Query 4609 GACTGGTCGTGTGTAAGATAATGCAATCGCAGCTCATAAATCGACATGTAGCAAACCTGG 4668 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4154 GATTGGTCGTGTGTAAGATAATGCAATCGCAGCTCATAAATCGACATGTAGCAAACCTGG 4213 Query 4669 AGATACAAGACCGCTCGTTGTATAGTAAGGATTATGAGCTGTTTTGGCAGTCGTGACAAA 4728 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4214 AGATACAAGACCGCTCGTTGTATAGTAAGGATTATGAGCTGTTTTGGCAGTCGTGACAAA 4273 Query 4729 GTCTTGTCAGGTAATTTTTCTCAGAACAACTAAAAACAGTCCTGCCCCAAGT 4780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4274 GTCTTGTCAGGTAATTTTTCTCAGAACAACTAAAAACAGTCCCGCCCCAAGT 4325 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 197747149308 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5