BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT5G24710.1

Length=4688
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg489332 jgi|Araly1|489332|fgenesh2_kg.6__2466__AT5G24710.1        7022    0.0  


> Ahg489332 jgi|Araly1|489332|fgenesh2_kg.6__2466__AT5G24710.1
Length=4518

 Score = 7022 bits (3802),  Expect = 0.0
 Identities = 4114/4265 (96%), Gaps = 19/4265 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  166   AATCGTCTATGCGGATGCAGTTGTGCTCAGATTTTTGAGTTGTCTAATTGATCTTGAAGA  225
             |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||
Sbjct  97    AATCGTCTTTGCGGATGCAATTGTGCTCAGA-TTTTGAGTTGTTTCATTGATCTTGGAGA  155

Query  226   ACTG---T-gagagagagagagagagaTCGAAATGTTGCGGGCGAGAGCATTTCGGCAGA  281
             ||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  156   ACTGATATAGAGAGCGAGAGAGAGAGATCGAAATGTTGCGGGCGAGAGCATTTCGGCAGA  215

Query  282   CCAATGGTAAGATTGTGAAGATACAGGTACATCCTACGCATCCATGGCTTGTTACGGCTG  341
             | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |
Sbjct  216   CAAATGGTAAGATTGTGAAGATACAGGTGCATCCCACGCATCCATGGCTTGTCACAGCCG  275

Query  342   ATGATTCAGATCACGTCTCCGTCTGGAATTGGGAGCATCGTCAGGTAATTTATGAATTGA  401
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276   ATGATTCAGATCACGTTTCCGTCTGGAATTGGGAGCATCGTCAGGTAATTTATGAATTGA  335

Query  402   AAGCCGGCGGAGTTGACGAGCGCCGTTTAGTTGGTGCCAAGTTAGAGAAGCTCGCCGAAG  461
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  336   AAGCCGGCGGAGTTGACGAGCGCCGTTTAGTTGGTGCTAAGTTAGAGAAGCTCGCCGAAG  395

Query  462   GAGAATCCGACTATAAAGCTAAGCCTACTGAAGCCATTCGAGGAGGAAGCGTTAAGCAGG  521
             ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct  396   GAGAATCCGACTATAAAGCCAAGCCCACTGAAGCCATTAGAGGAGGAAGTGTTAAGCAGG  455

Query  522   TGAAGTTTTATGACGATGATGTGCGTTATTGGCAACTGTGGCGCAACCGCTCCGCAGCTG  581
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||
Sbjct  456   TGAAGTTTTATGACGATGATGTGCGTTATTGGCAACTGTGGCGTAATCGCTCTGCAGCTG  515

Query  582   CTGAATCTCCATCAGCTGTCAATCATCTGACATCTGCTTTCACTTCCCCTGCTCCATCGA  641
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516   CTGAATCTCCATCAGCTGTCAATCATCTCACATCTGCTTTCACTTCCCCTGCTCCATCGA  575

Query  642   CTAAAGGCCGTCATTTTCTGGTCATTTGTTGTGAGAATAAAGCTATTTTCTTGGATTTGG  701
             |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct  576   CTAAAGGCCGGCATTTTCTGGTCATCTGTTGTGAGAATAAAGCCATTTTCTTGGACTTGG  635

Query  702   TGACAATGCGTGGTCGTGATGTGCCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCACTTCTCTGCA  761
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636   TGACAATGCGTGGTCGTGATGTGCCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCACTTCTCTGCA  695

Query  762   TGGAGTTTCTTTCGAGATCATCTGGTGGTGATGGCCCTTTAGTTGCATTTGGTTCAACTG  821
             ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696   TGGAGTTTCTTACCAGATCATCTGGTGGTGATGGCCCTTTAGTTGCATTTGGTTCAACTG  755

Query  822   ATGGTGTCATTCGGGTTTTATCAATGATAACATGGAAGCTTGCACGTCGATATACAGGTG  881
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  756   ATGGTGTCATTCGGGTTTTATCAATGATAACTTGGAAGCTTGCACGTAGATATACAGGTG  815

Query  882   GCCATAAAGGATCCATTTATTGCTTGATGAATTTCATGGCATCATCTGGCGAAGCACTCC  941
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  816   GCCATAAAGGATCCATATATTGCTTGATGAATTTCATGGCATCGTCTGGCGAAGCACTCC  875

Query  942   TTGTTTCAGGTGGCAGTGATGGCTTACTTGTACTGTGGAGTGCCGATCATGGCGCTGACT  1001
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct  876   TTGTTTCAGGTGGCAGTGATGGCTTACTTGTACTGTGGAGTGCTGATAATGGCACTGACT  935

Query  1002  CAAGGGAACTTGTACCCAAGCTTAGCTTAAAGGCACATGATGGTGGGGTGGTGGCTGTTG  1061
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936   CAAGGGAACTTGTACCCAAGCTTAGCTTAAAGGCACATGATGGTGGGGTGGTGGCTGTTG  995

Query  1062  AGCTGTCAAGGGTAAGTGGGAGTGCTCCACAATTGATTACAATTGGGGCTGACAAGACAT  1121
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996   AGTTGTCAAGGGTAAGTGGGAGTGCTCCACAATTGATTACAATTGGGGCTGACAAGACAT  1055

Query  1122  TGGCCATATGGGATACAATGACATTTAAGGAGCTACGTAGAATTAAACCTGTCCCGAAAC  1181
             | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1056  TAGCCATATGGGACACAATGACATTTAAGGAGCTGCGTAGAATTAAACCTGTCCCGAAGC  1115

Query  1182  TAGCTTGCCACAGTGTTGCATCTTGGTGTCACCCTCGAGCGCCAAACCTTGATATTTTGA  1241
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1116  TAGCTTGCCACAGTGTTGCATCTTGGTGTCACCCTCGAGCGCCAAACCTTGATATTTTGA  1175

Query  1242  CTTGCGTTAAAGATTCACACATATGGTCTATTGAGCATCCAACTTATTCGGCCCTGACAA  1301
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1176  CTTGCGTTAAAGATTCGCACATATGGTCTATTGAGCATCCAACTTATTCGGCCCTAACAA  1235

Query  1302  GGCCGTTATGTGAACTTTCTTCCTTGGTTCCGCCTCAAGTACTTGCAACCCACAGAAAAC  1361
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1236  GGCCATTATGTGAACTTTCTTCCTTGGTTCCGCCTCAAGTACTTGCAACCCACAGAAAAC  1295

Query  1362  TTAGGGTCTATTGTATGGTTGCACATCCTCTACAACCACATCTCGTCGCAACTGGTACCA  1421
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1296  TTAGGGTCTATTGTATGGTTGCACATCCTCTACAACCACATCTCGTCGCAACTGGTACCA  1355

Query  1422  ATGTTGGTATTATAGTTAGTGAATTTGATCCTCGTGCTATCCCGTCTGCAGCTCCTCTAC  1481
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1356  ATGTTGGTATTATAGTTAGTGAATTTGATCCTCGTGCCATCCCGTCTGCAGCTCCTCTAC  1415

Query  1482  CAGCACTGCCTGGAAGTCGGGAGAATTCAGCTATATATATCCTTGGAAGAGAATTAAAGC  1541
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1416  CAGCACTGCCTGGAAGTCGGGAGAATTCAGCTATATATATCCTTGGAAGAGAATTAAAGC  1475

Query  1542  TCTTGAACTTTCAACTATCCAACACAGCCAACCCATCCCTTGGCAATAATAGTGCCTTGT  1601
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1476  TCTTGAACTTTCAACTATCCAACTCAGCCAACCCATCCCTTGGAAATAATAGTGCCTTGT  1535

Query  1602  CCGAATCAGGGCTTTCTAAGGGAGACCCAGGTGAACAGTTAACTGTAAAGCAAACCAAAA  1661
             ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct  1536  CCGAATCAGGGCTGTCTAAGGGAGACCCAAGTGAGCAGTTGACTGTAAAGCAGACCAAAA  1595

Query  1662  AGCAGATCGTGGCACCAGTTCCACATGATTCATACTCAGTTCTTTCTGTGAGCAGTTCAG  1721
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1596  AGCAGATCGTGGCACCTGTTCCACATGATTCATACTCAGTTCTTTCTGTGAGCAGTTCAG  1655

Query  1722  GGAAGTATGTGGCAGTTGTATGGCCGGATATTCTATACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTG  1781
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1656  GGAAGTATGTGGCAGTTGTATGGCCTGATATTCTGTACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTG  1715

Query  1782  ACTGGTCCATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGACTGTTGGCGTGGGATACATGTCGAGACA  1841
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1716  ACTGGTCGATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGACTGTTGGCTTGGGATACATGTCGAGACA  1775

Query  1842  GATTTGCGATTCTAGAATCTGTGTTACCTCATAGAATGCCTATAATCCCTAAGGGTGGTT  1901
             ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1776  GATTTGCCATTCTAGAATCTGTGTTACCTCAAAGGATGCCTATAATCCCTAAGGGTGGTT  1835

Query  1902  CATCGAGAAAGGCAAAAGAAGCCgctgcagctgcagctcaagctgctgctgctgccagtg  1961
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1836  TATCGAGAAAGGCAAAAGAAGCCGCTGCAGCTGCAGCTCAAGCTGCTGCTGCTGCCAGTG  1895

Query  1962  cagctTCATCGGCTAGTGTCCAAGTTCGTATTCTCTTGGATGATGGTACCTCAAACATAC  2021
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1896  CAGCTTCATCGGCTAGTGTCCAAGTTCGTATTCTCTTGGATGATGGTACCTCAAACATAC  1955

Query  2022  TCATGAGATCCGTAGGAGGTCGCTCTGAACCGGTCATTGGTCTGCATGGTGGTGCTCTAC  2081
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1956  TCATGAGATCTGTAGGAGGTCGCTCTGAACCGGTCATTGGTCTGCATGGTGGTGCTCTAC  2015

Query  2082  TTGGTATAGGTTATCGCACATCCCGAAGGATTAGTCCTGTTGCTGCAACAGCTATTTCAA  2141
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2016  TTGGTATAGGCTATCGCACATCCCGAAGGATTAGTCCTGTTGCTGCAACAGCTATTTCAA  2075

Query  2142  CCATTCAGTCGATGCCACTCTCGGGATTTGGAAACAGCAATGTTTCTTCGTTTTCTAGCT  2201
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2076  CCATTCAGTCGATGCCACTCTCGGGATTTGGAAACAGCAATGTTTCTTCGTTTTCTAGCT  2135

Query  2202  ATGATGATGGGTTTTCTTCGCAGAAGTCTGCTGAGTCTGCACCCCTAAACTACCAGCTCT  2261
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2136  ATGATGATGGGTTTTCTTCGCAGAAGTCTGCTGAGTCTGCACCCCTAAACTACCAGCTCT  2195

Query  2262  ACAGTTGGGAAAATTTTGAGCCAGTAGGTGGTATGCTACCTCAGCCAGAATGGACGGCAT  2321
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2196  ACAGTTGGGAAAATTTTGAGCCAGTTGGTGGTATGCTACCTCAGCCAGAATGGACGGCGT  2255

Query  2322  GGGACCAAACAGTTGAATACTGTGCTTTTGCTTATCAACAATACATGGTCATATCGTCCT  2381
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2256  GGGACCAAACAGTTGAGTACTGTGCTTTTGCTTATCAACAATACATGGTCATATCGTCCT  2315

Query  2382  TGCGCCCTCAGTATAGATATCTTGGTGATGTTGCCATTGCACATGCTACTGGAGCTGTTT  2441
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2316  TGCGCCCTCAGTATAGATATCTTGGTGATGTTGCCATTGCACATGCTACTGGAGCTGTTT  2375

Query  2442  GGCATCGCAGACAGCTGTTTGTGGCTACACCAACCACGATTGAATGTGTTTTTGTGGATG  2501
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2376  GGCATCGCAGACAGCTGTTTGTGGCTACACCAACCACGATTGAATGTGTTTTTGTGGACG  2435

Query  2502  CGGGAGTTTCCGAAATTGATATAGAGACTAGGAAGATGAAGGAAGAAATGAAACTTAAGG  2561
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2436  CGGGAGTTTCTGAAATTGATATAGAGACTAGGAAGATGAAGGAAGAAATGAAACTTAAGG  2495

Query  2562  AGGCGCAGGCTAGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGAGTTGGCCTTAATCACAGTAGAAGGTT  2621
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2496  AGGCGCAGGCTAGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGAGTTAGCCTTAATCACAGTAGAAGGTT  2555

Query  2622  CCCAGGCTGCAAAGCAAGAAAGGATATCTTTAAGGCCCCCCATGCTGCAGGTGGTGCGTT  2681
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2556  CCCAGGCTGCAAAGCAAGAAAGGATATCTTTAAGGCCCCCCATGCTGCAGGTTGTGCGTT  2615

Query  2682  TAGCTTCTTTCCAAAATGCTCCATCTGTTCCACCATTCTTATCATTGCCAAGACAATCTA  2741
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2616  TAGCTTCTTTCCAAAATGCTCCATCTGTTCCACCATTCTTATCATTGCCAAGACAATCTA  2675

Query  2742  GAGGTGATAGCGATGACATAATGGATGAAAGAAGGGTCAATGAGGTAGCTGTGGGTGGTG  2801
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2676  GAGGTGATAGCGATGACATAATGGATGAAAGAAGGGTCAATGAGGTAGCTGTGGGTGGTG  2735

Query  2802  GAGGAGTCTCAGTTGCTGTTACTCGTTTCCCAGTGGAGCAAAAACGACCAGTGGGGCCTC  2861
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2736  GAGGAGTCTCAGTTGCTGTTACTCGTTTCCCAGTGGAGCAAAAACGACCAGTGGGGCCTC  2795

Query  2862  TTGTTGTTGCCGGTGTGCGGGATGGAGTTCTTTGGCTCATTGACAGGTACATGTGTGCCC  2921
             |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2796  TTGTTGTTGCCGGTGTACGTGATGGAGTTCTTTGGCTCATTGACAGGTACATGTGTGCCC  2855

Query  2922  ATGCCATATCCCTTAATCATCCTGGTATCCGCTGTCGCTGTCTTGCTGCTTACGGGGATG  2981
             ||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2856  ATGCCATTTCACTGAATCATCCTGGTATCCGTTGCCGCTGTCTTGCTGCTTACGGGGATG  2915

Query  2982  CTGTTAGTGCAGTTAAATGGGCAAGTAGGCTTGGGAGAGAACATCATGACGATCTGGCAC  3041
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2916  CTGTTAGTGCAGTCAAATGGGCAAGTAGGCTTGGCAGGGAACATCATGACGATCTGGCAC  2975

Query  3042  AGTTTATGCTAGGGATGGGATACGCAACAGAAGCTCTTCATTTGCCTGGAATATCTAAGA  3101
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2976  AGTTTATGCTAGGGATGGGATACGCAACAGAAGCTCTTCATTTGCCTGGAATATCTAAGA  3035

Query  3102  GGCTGGAGTTTGACCTAGCAATGCAGAGCAATGATCTTAAGAGGGCACTTCATTGTCTTC  3161
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3036  GGCTGGAGTTTGATCTAGCAATGCAGAGCAATGATCTTAAGAGGGCTCTTCATTGTCTTC  3095

Query  3162  TCACAATGAGTAATAGCAAGGACATTGGACAGGACGGTGTAGGCCTTGATTTGAGTGACA  3221
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3096  TCACAATGAGTAATAGTAAGGACATTGGACAGGACGGTGTAGGCCTTGATTTGAGTGACA  3155

Query  3222  TTCTCTCTTTGACAGCTACTAAAAAAGAAGATGTTGTTGAAGCTGTGGAAGGAATAGTGA  3281
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3156  TTCTCTCTTTGACAGCTACTAAAAAAGAAGATGTTGTTGAAGCTGTGGAGGGAATAGTGA  3215

Query  3282  AATTTGCAAAGGAGTTTCTTGACCTTATAGATGCTGCAGATGCCACAGGGCACGCCGACA  3341
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3216  AATTTGCAAAGGAGTTTCTTGACCTTATAGATGCTGCTGATGCCACAGGGCACGCTGACA  3275

Query  3342  TTGCTCGCGAAGCTCTCAAAAGACTGGCAACTGCAGGTTCGGTCAAAGGCGCTTTACAGG  3401
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct  3276  TTGCTCGCGAAGCTCTCAAAAGACTGGCAACTGCAGGTTCAGTCAAAGGCGCCTTACAGG  3335

Query  3402  GTCATGAGTTGCGAGGCCTTTCATTACGCCTAGCAAACCATGGAGAATTGACACGCCTAA  3461
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3336  GTCATGAGTTGCGAGGCCTTTCATTACGCCTAGCAAACCATGGAGAATTGACACGCCTAA  3395

Query  3462  GTGGACTTGTAAACAATCTGATCTCCATAGGCCTTGGACGAGAATCAGCATTTTCTGCTG  3521
             | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3396  GCGGACTTATAAACAATCTGATCTCCATAGGCCTCGGGCGAGAATCAGCATTTTCTGCTG  3455

Query  3522  CAGTTCTGGGAGACAATGCGCTCATGGAGAAGGCATGGCAAGACACGGGAATGCTCGCAG  3581
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3456  CAGTTCTGGGAGACAATGCGCTCATGGAGAAGGCATGGCAAGACACGGGAATGCTTGCAG  3515

Query  3582  AAGCCGTGCTTCATGCCCATGCACATGGTCGCCCAACTCTAAAGAACTTGGTCCAGGCTT  3641
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3516  AAGCCGTGCTTCATGCCCATGCACATGGTCGTCCAACTCTAAAGAACTTGGTCCAGGCTT  3575

Query  3642  GGAATAAAACGCTGCAGAAGGAAGTTGAGAAAGCTCCGTCTTCTAAAACCGATGCTGCAA  3701
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3576  GGAATAAAACGCTGCAGAAGGAAGTTGAGCAAGCTCCATCTTCTAAAACTGATGCTGCAA  3635

Query  3702  GTGCGTTTCTGGCTTCTCTCGAGGATCCAAAGCTCACTAGTTTATCTGATGCATCTAGAA  3761
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3636  GTGCGTTTCTGGCTTCTCTCGAGGATCCAAAGCTCACGAGTTTATCTGATGCATCCAGAA  3695

Query  3762  AACCTCCTATCGAGATTCTACCTCCTGGAATGTCTTCAATCTTTGCTTCCATTACGGCTC  3821
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3696  AACCTCCTATCGAGATTCTACCTCCTGGAATGTCTTCAATCTTTGCTTCCATTACTGCTC  3755

Query  3822  CCAAAAAACCTCTACTCACGCAGAAGACTGCACAGCCAGAAGTAGCTAAGCCATTGGCGC  3881
             ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3756  CCAAAAAACCTTTACTCACACAGAAGACTGCACAGCCAGAAGTAGCTAAGCCATTGGCGC  3815

Query  3882  TCGAAGAACCTACGAAACCATTGGCTATTGAAGCTCCTCCATCTTCCGAGGCACCACAGA  3941
             ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct  3816  TCGAAGAACCTGCAAAACCATTGGCTATTGAAGCTCCTCCATCTTCTGAGGCACCTCAGA  3875

Query  3942  CCGAATCAGCGCCTGAAACCGCAGCCGCTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGCAGCCG  4001
             | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  3876  CTGAATCAGCGCCTGAAACTGCAGCTACTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGTAGCCG  3935

Query  4002  TTGCTGAGTCACCAGCACCTGGAACCGCAGCCGTTGCTGAGGCACCAGCATCTGAGACTG  4061
             ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct  3936  TTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGTAGCCGTTGCTGAGTCACCAGCATCTGAAACTG  3995

Query  4062  CAGCAGCACCTGTGGATGGACCAGTGACGGAGACTGTGTCTGAGCCTCCTCCCGTAGAGA  4121
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3996  CAGCAGCACCTGTGGATGGACCCGTGACGGAGACAGTGTCTGAGCCTCCTCCCGTAGAG-  4054

Query  4122  AGGAGGAAACTTCTTTGGAAGAAAAAAGCGATCCGTCTTCAACTCCAAACACAGAAACAG  4181
              | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4055  -G-AGGAAACTTCTTTGGAATACAAAAGTGATCCGTCTTCAACTCCAAACACAGAAACAG  4112

Query  4182  CT--ACGTCCACAGAAAATACTAGCCAAACAACAACAACGCCTGAAAGTGTTACAACAGC  4239
             ||  | | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||
Sbjct  4113  CTGTA-G-CCACAGAAGATACTAGCCAAACAACAACGACGCCTGAAACTGTTACAAGAGC  4170

Query  4240  GCCACCTGAACCTATTACAACAGCGCC---GCCTGAAACTGTTACGACAACAGCAGTGAA  4296
             |||||| ||| || |||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||   ||||
Sbjct  4171  GCCACCAGAAACTGTTACAACAGCCCCTCCGCCTGAAACTGCTACGACAACAG---TGAA  4227

Query  4297  ACCAACAGAGAATGCAGCAACCGAGAGACGAGTAACCAATTACCCTCCAATAAGAAGCCA  4356
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  4228  ACCAACAGAGAATGCAGCAACCGAGAGACGAGTAACCAATTATCCTCCAATAAGAAGCCA  4287

Query  4357  GCCAATAGATTTTGATTTCTTGAATGGCTAAA-CCAAGTTTTCACAGAAGATCCCAAAAC  4415
             |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  4288  GCCAATTGATTTTGACTTCTTGAATGGCTAAAACCAAGTTTGCACAGAAGATCCCAAAAC  4347

Query  4416  GAAGA  4420
             |||||
Sbjct  4348  GAAGA  4352


 Score =  145 bits (78),  Expect = 4e-33
 Identities = 92/98 (94%), Gaps = 3/98 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3   ACACTACCGGAGTTTTTGTTCGGCGATTGTAGTTAGTGGTGGTGGATCCGGGCA-TTTCA  61
           |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| 
Sbjct  1   ACACTACCGGAGTTTTTGTTCGGCGATTGTAG-TGGTGGTGGTGGATCCGGCCATTTTC-  58

Query  62  TTTGATAACCGCGGTGGATCTAATTGATCTGGATCTGA  99
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  59  TTTGATAACCGCGGTGGATCTAATCGATCTGGATCTGA  96



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 177386347753


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5