BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G24710.1 Length=4688 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg489332 jgi|Araly1|489332|fgenesh2_kg.6__2466__AT5G24710.1 7022 0.0 > Ahg489332 jgi|Araly1|489332|fgenesh2_kg.6__2466__AT5G24710.1 Length=4518 Score = 7022 bits (3802), Expect = 0.0 Identities = 4114/4265 (96%), Gaps = 19/4265 (0%) Strand=Plus/Plus Query 166 AATCGTCTATGCGGATGCAGTTGTGCTCAGATTTTTGAGTTGTCTAATTGATCTTGAAGA 225 |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| Sbjct 97 AATCGTCTTTGCGGATGCAATTGTGCTCAGA-TTTTGAGTTGTTTCATTGATCTTGGAGA 155 Query 226 ACTG---T-gagagagagagagagagaTCGAAATGTTGCGGGCGAGAGCATTTCGGCAGA 281 |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 156 ACTGATATAGAGAGCGAGAGAGAGAGATCGAAATGTTGCGGGCGAGAGCATTTCGGCAGA 215 Query 282 CCAATGGTAAGATTGTGAAGATACAGGTACATCCTACGCATCCATGGCTTGTTACGGCTG 341 | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || | Sbjct 216 CAAATGGTAAGATTGTGAAGATACAGGTGCATCCCACGCATCCATGGCTTGTCACAGCCG 275 Query 342 ATGATTCAGATCACGTCTCCGTCTGGAATTGGGAGCATCGTCAGGTAATTTATGAATTGA 401 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 276 ATGATTCAGATCACGTTTCCGTCTGGAATTGGGAGCATCGTCAGGTAATTTATGAATTGA 335 Query 402 AAGCCGGCGGAGTTGACGAGCGCCGTTTAGTTGGTGCCAAGTTAGAGAAGCTCGCCGAAG 461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 336 AAGCCGGCGGAGTTGACGAGCGCCGTTTAGTTGGTGCTAAGTTAGAGAAGCTCGCCGAAG 395 Query 462 GAGAATCCGACTATAAAGCTAAGCCTACTGAAGCCATTCGAGGAGGAAGCGTTAAGCAGG 521 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 396 GAGAATCCGACTATAAAGCCAAGCCCACTGAAGCCATTAGAGGAGGAAGTGTTAAGCAGG 455 Query 522 TGAAGTTTTATGACGATGATGTGCGTTATTGGCAACTGTGGCGCAACCGCTCCGCAGCTG 581 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| Sbjct 456 TGAAGTTTTATGACGATGATGTGCGTTATTGGCAACTGTGGCGTAATCGCTCTGCAGCTG 515 Query 582 CTGAATCTCCATCAGCTGTCAATCATCTGACATCTGCTTTCACTTCCCCTGCTCCATCGA 641 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 516 CTGAATCTCCATCAGCTGTCAATCATCTCACATCTGCTTTCACTTCCCCTGCTCCATCGA 575 Query 642 CTAAAGGCCGTCATTTTCTGGTCATTTGTTGTGAGAATAAAGCTATTTTCTTGGATTTGG 701 |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 576 CTAAAGGCCGGCATTTTCTGGTCATCTGTTGTGAGAATAAAGCCATTTTCTTGGACTTGG 635 Query 702 TGACAATGCGTGGTCGTGATGTGCCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCACTTCTCTGCA 761 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 636 TGACAATGCGTGGTCGTGATGTGCCAAAGCAAGAGCTTGATAACAAGTCACTTCTCTGCA 695 Query 762 TGGAGTTTCTTTCGAGATCATCTGGTGGTGATGGCCCTTTAGTTGCATTTGGTTCAACTG 821 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 696 TGGAGTTTCTTACCAGATCATCTGGTGGTGATGGCCCTTTAGTTGCATTTGGTTCAACTG 755 Query 822 ATGGTGTCATTCGGGTTTTATCAATGATAACATGGAAGCTTGCACGTCGATATACAGGTG 881 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 756 ATGGTGTCATTCGGGTTTTATCAATGATAACTTGGAAGCTTGCACGTAGATATACAGGTG 815 Query 882 GCCATAAAGGATCCATTTATTGCTTGATGAATTTCATGGCATCATCTGGCGAAGCACTCC 941 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 816 GCCATAAAGGATCCATATATTGCTTGATGAATTTCATGGCATCGTCTGGCGAAGCACTCC 875 Query 942 TTGTTTCAGGTGGCAGTGATGGCTTACTTGTACTGTGGAGTGCCGATCATGGCGCTGACT 1001 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| Sbjct 876 TTGTTTCAGGTGGCAGTGATGGCTTACTTGTACTGTGGAGTGCTGATAATGGCACTGACT 935 Query 1002 CAAGGGAACTTGTACCCAAGCTTAGCTTAAAGGCACATGATGGTGGGGTGGTGGCTGTTG 1061 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 936 CAAGGGAACTTGTACCCAAGCTTAGCTTAAAGGCACATGATGGTGGGGTGGTGGCTGTTG 995 Query 1062 AGCTGTCAAGGGTAAGTGGGAGTGCTCCACAATTGATTACAATTGGGGCTGACAAGACAT 1121 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 996 AGTTGTCAAGGGTAAGTGGGAGTGCTCCACAATTGATTACAATTGGGGCTGACAAGACAT 1055 Query 1122 TGGCCATATGGGATACAATGACATTTAAGGAGCTACGTAGAATTAAACCTGTCCCGAAAC 1181 | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1056 TAGCCATATGGGACACAATGACATTTAAGGAGCTGCGTAGAATTAAACCTGTCCCGAAGC 1115 Query 1182 TAGCTTGCCACAGTGTTGCATCTTGGTGTCACCCTCGAGCGCCAAACCTTGATATTTTGA 1241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1116 TAGCTTGCCACAGTGTTGCATCTTGGTGTCACCCTCGAGCGCCAAACCTTGATATTTTGA 1175 Query 1242 CTTGCGTTAAAGATTCACACATATGGTCTATTGAGCATCCAACTTATTCGGCCCTGACAA 1301 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1176 CTTGCGTTAAAGATTCGCACATATGGTCTATTGAGCATCCAACTTATTCGGCCCTAACAA 1235 Query 1302 GGCCGTTATGTGAACTTTCTTCCTTGGTTCCGCCTCAAGTACTTGCAACCCACAGAAAAC 1361 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1236 GGCCATTATGTGAACTTTCTTCCTTGGTTCCGCCTCAAGTACTTGCAACCCACAGAAAAC 1295 Query 1362 TTAGGGTCTATTGTATGGTTGCACATCCTCTACAACCACATCTCGTCGCAACTGGTACCA 1421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1296 TTAGGGTCTATTGTATGGTTGCACATCCTCTACAACCACATCTCGTCGCAACTGGTACCA 1355 Query 1422 ATGTTGGTATTATAGTTAGTGAATTTGATCCTCGTGCTATCCCGTCTGCAGCTCCTCTAC 1481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1356 ATGTTGGTATTATAGTTAGTGAATTTGATCCTCGTGCCATCCCGTCTGCAGCTCCTCTAC 1415 Query 1482 CAGCACTGCCTGGAAGTCGGGAGAATTCAGCTATATATATCCTTGGAAGAGAATTAAAGC 1541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1416 CAGCACTGCCTGGAAGTCGGGAGAATTCAGCTATATATATCCTTGGAAGAGAATTAAAGC 1475 Query 1542 TCTTGAACTTTCAACTATCCAACACAGCCAACCCATCCCTTGGCAATAATAGTGCCTTGT 1601 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1476 TCTTGAACTTTCAACTATCCAACTCAGCCAACCCATCCCTTGGAAATAATAGTGCCTTGT 1535 Query 1602 CCGAATCAGGGCTTTCTAAGGGAGACCCAGGTGAACAGTTAACTGTAAAGCAAACCAAAA 1661 ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 1536 CCGAATCAGGGCTGTCTAAGGGAGACCCAAGTGAGCAGTTGACTGTAAAGCAGACCAAAA 1595 Query 1662 AGCAGATCGTGGCACCAGTTCCACATGATTCATACTCAGTTCTTTCTGTGAGCAGTTCAG 1721 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1596 AGCAGATCGTGGCACCTGTTCCACATGATTCATACTCAGTTCTTTCTGTGAGCAGTTCAG 1655 Query 1722 GGAAGTATGTGGCAGTTGTATGGCCGGATATTCTATACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTG 1781 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1656 GGAAGTATGTGGCAGTTGTATGGCCTGATATTCTGTACTTCTCTATCTACAAGGTTAGTG 1715 Query 1782 ACTGGTCCATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGACTGTTGGCGTGGGATACATGTCGAGACA 1841 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1716 ACTGGTCGATTGTTGACTCTGGAAGTGCAAGACTGTTGGCTTGGGATACATGTCGAGACA 1775 Query 1842 GATTTGCGATTCTAGAATCTGTGTTACCTCATAGAATGCCTATAATCCCTAAGGGTGGTT 1901 ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1776 GATTTGCCATTCTAGAATCTGTGTTACCTCAAAGGATGCCTATAATCCCTAAGGGTGGTT 1835 Query 1902 CATCGAGAAAGGCAAAAGAAGCCgctgcagctgcagctcaagctgctgctgctgccagtg 1961 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1836 TATCGAGAAAGGCAAAAGAAGCCGCTGCAGCTGCAGCTCAAGCTGCTGCTGCTGCCAGTG 1895 Query 1962 cagctTCATCGGCTAGTGTCCAAGTTCGTATTCTCTTGGATGATGGTACCTCAAACATAC 2021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1896 CAGCTTCATCGGCTAGTGTCCAAGTTCGTATTCTCTTGGATGATGGTACCTCAAACATAC 1955 Query 2022 TCATGAGATCCGTAGGAGGTCGCTCTGAACCGGTCATTGGTCTGCATGGTGGTGCTCTAC 2081 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1956 TCATGAGATCTGTAGGAGGTCGCTCTGAACCGGTCATTGGTCTGCATGGTGGTGCTCTAC 2015 Query 2082 TTGGTATAGGTTATCGCACATCCCGAAGGATTAGTCCTGTTGCTGCAACAGCTATTTCAA 2141 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2016 TTGGTATAGGCTATCGCACATCCCGAAGGATTAGTCCTGTTGCTGCAACAGCTATTTCAA 2075 Query 2142 CCATTCAGTCGATGCCACTCTCGGGATTTGGAAACAGCAATGTTTCTTCGTTTTCTAGCT 2201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2076 CCATTCAGTCGATGCCACTCTCGGGATTTGGAAACAGCAATGTTTCTTCGTTTTCTAGCT 2135 Query 2202 ATGATGATGGGTTTTCTTCGCAGAAGTCTGCTGAGTCTGCACCCCTAAACTACCAGCTCT 2261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2136 ATGATGATGGGTTTTCTTCGCAGAAGTCTGCTGAGTCTGCACCCCTAAACTACCAGCTCT 2195 Query 2262 ACAGTTGGGAAAATTTTGAGCCAGTAGGTGGTATGCTACCTCAGCCAGAATGGACGGCAT 2321 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2196 ACAGTTGGGAAAATTTTGAGCCAGTTGGTGGTATGCTACCTCAGCCAGAATGGACGGCGT 2255 Query 2322 GGGACCAAACAGTTGAATACTGTGCTTTTGCTTATCAACAATACATGGTCATATCGTCCT 2381 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2256 GGGACCAAACAGTTGAGTACTGTGCTTTTGCTTATCAACAATACATGGTCATATCGTCCT 2315 Query 2382 TGCGCCCTCAGTATAGATATCTTGGTGATGTTGCCATTGCACATGCTACTGGAGCTGTTT 2441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2316 TGCGCCCTCAGTATAGATATCTTGGTGATGTTGCCATTGCACATGCTACTGGAGCTGTTT 2375 Query 2442 GGCATCGCAGACAGCTGTTTGTGGCTACACCAACCACGATTGAATGTGTTTTTGTGGATG 2501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2376 GGCATCGCAGACAGCTGTTTGTGGCTACACCAACCACGATTGAATGTGTTTTTGTGGACG 2435 Query 2502 CGGGAGTTTCCGAAATTGATATAGAGACTAGGAAGATGAAGGAAGAAATGAAACTTAAGG 2561 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2436 CGGGAGTTTCTGAAATTGATATAGAGACTAGGAAGATGAAGGAAGAAATGAAACTTAAGG 2495 Query 2562 AGGCGCAGGCTAGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGAGTTGGCCTTAATCACAGTAGAAGGTT 2621 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2496 AGGCGCAGGCTAGAGCAGTTGCAGAGCATGGAGAGTTAGCCTTAATCACAGTAGAAGGTT 2555 Query 2622 CCCAGGCTGCAAAGCAAGAAAGGATATCTTTAAGGCCCCCCATGCTGCAGGTGGTGCGTT 2681 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2556 CCCAGGCTGCAAAGCAAGAAAGGATATCTTTAAGGCCCCCCATGCTGCAGGTTGTGCGTT 2615 Query 2682 TAGCTTCTTTCCAAAATGCTCCATCTGTTCCACCATTCTTATCATTGCCAAGACAATCTA 2741 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2616 TAGCTTCTTTCCAAAATGCTCCATCTGTTCCACCATTCTTATCATTGCCAAGACAATCTA 2675 Query 2742 GAGGTGATAGCGATGACATAATGGATGAAAGAAGGGTCAATGAGGTAGCTGTGGGTGGTG 2801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2676 GAGGTGATAGCGATGACATAATGGATGAAAGAAGGGTCAATGAGGTAGCTGTGGGTGGTG 2735 Query 2802 GAGGAGTCTCAGTTGCTGTTACTCGTTTCCCAGTGGAGCAAAAACGACCAGTGGGGCCTC 2861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2736 GAGGAGTCTCAGTTGCTGTTACTCGTTTCCCAGTGGAGCAAAAACGACCAGTGGGGCCTC 2795 Query 2862 TTGTTGTTGCCGGTGTGCGGGATGGAGTTCTTTGGCTCATTGACAGGTACATGTGTGCCC 2921 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2796 TTGTTGTTGCCGGTGTACGTGATGGAGTTCTTTGGCTCATTGACAGGTACATGTGTGCCC 2855 Query 2922 ATGCCATATCCCTTAATCATCCTGGTATCCGCTGTCGCTGTCTTGCTGCTTACGGGGATG 2981 ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2856 ATGCCATTTCACTGAATCATCCTGGTATCCGTTGCCGCTGTCTTGCTGCTTACGGGGATG 2915 Query 2982 CTGTTAGTGCAGTTAAATGGGCAAGTAGGCTTGGGAGAGAACATCATGACGATCTGGCAC 3041 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2916 CTGTTAGTGCAGTCAAATGGGCAAGTAGGCTTGGCAGGGAACATCATGACGATCTGGCAC 2975 Query 3042 AGTTTATGCTAGGGATGGGATACGCAACAGAAGCTCTTCATTTGCCTGGAATATCTAAGA 3101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2976 AGTTTATGCTAGGGATGGGATACGCAACAGAAGCTCTTCATTTGCCTGGAATATCTAAGA 3035 Query 3102 GGCTGGAGTTTGACCTAGCAATGCAGAGCAATGATCTTAAGAGGGCACTTCATTGTCTTC 3161 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3036 GGCTGGAGTTTGATCTAGCAATGCAGAGCAATGATCTTAAGAGGGCTCTTCATTGTCTTC 3095 Query 3162 TCACAATGAGTAATAGCAAGGACATTGGACAGGACGGTGTAGGCCTTGATTTGAGTGACA 3221 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3096 TCACAATGAGTAATAGTAAGGACATTGGACAGGACGGTGTAGGCCTTGATTTGAGTGACA 3155 Query 3222 TTCTCTCTTTGACAGCTACTAAAAAAGAAGATGTTGTTGAAGCTGTGGAAGGAATAGTGA 3281 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3156 TTCTCTCTTTGACAGCTACTAAAAAAGAAGATGTTGTTGAAGCTGTGGAGGGAATAGTGA 3215 Query 3282 AATTTGCAAAGGAGTTTCTTGACCTTATAGATGCTGCAGATGCCACAGGGCACGCCGACA 3341 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 3216 AATTTGCAAAGGAGTTTCTTGACCTTATAGATGCTGCTGATGCCACAGGGCACGCTGACA 3275 Query 3342 TTGCTCGCGAAGCTCTCAAAAGACTGGCAACTGCAGGTTCGGTCAAAGGCGCTTTACAGG 3401 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 3276 TTGCTCGCGAAGCTCTCAAAAGACTGGCAACTGCAGGTTCAGTCAAAGGCGCCTTACAGG 3335 Query 3402 GTCATGAGTTGCGAGGCCTTTCATTACGCCTAGCAAACCATGGAGAATTGACACGCCTAA 3461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3336 GTCATGAGTTGCGAGGCCTTTCATTACGCCTAGCAAACCATGGAGAATTGACACGCCTAA 3395 Query 3462 GTGGACTTGTAAACAATCTGATCTCCATAGGCCTTGGACGAGAATCAGCATTTTCTGCTG 3521 | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 3396 GCGGACTTATAAACAATCTGATCTCCATAGGCCTCGGGCGAGAATCAGCATTTTCTGCTG 3455 Query 3522 CAGTTCTGGGAGACAATGCGCTCATGGAGAAGGCATGGCAAGACACGGGAATGCTCGCAG 3581 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3456 CAGTTCTGGGAGACAATGCGCTCATGGAGAAGGCATGGCAAGACACGGGAATGCTTGCAG 3515 Query 3582 AAGCCGTGCTTCATGCCCATGCACATGGTCGCCCAACTCTAAAGAACTTGGTCCAGGCTT 3641 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3516 AAGCCGTGCTTCATGCCCATGCACATGGTCGTCCAACTCTAAAGAACTTGGTCCAGGCTT 3575 Query 3642 GGAATAAAACGCTGCAGAAGGAAGTTGAGAAAGCTCCGTCTTCTAAAACCGATGCTGCAA 3701 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 3576 GGAATAAAACGCTGCAGAAGGAAGTTGAGCAAGCTCCATCTTCTAAAACTGATGCTGCAA 3635 Query 3702 GTGCGTTTCTGGCTTCTCTCGAGGATCCAAAGCTCACTAGTTTATCTGATGCATCTAGAA 3761 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 3636 GTGCGTTTCTGGCTTCTCTCGAGGATCCAAAGCTCACGAGTTTATCTGATGCATCCAGAA 3695 Query 3762 AACCTCCTATCGAGATTCTACCTCCTGGAATGTCTTCAATCTTTGCTTCCATTACGGCTC 3821 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3696 AACCTCCTATCGAGATTCTACCTCCTGGAATGTCTTCAATCTTTGCTTCCATTACTGCTC 3755 Query 3822 CCAAAAAACCTCTACTCACGCAGAAGACTGCACAGCCAGAAGTAGCTAAGCCATTGGCGC 3881 ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3756 CCAAAAAACCTTTACTCACACAGAAGACTGCACAGCCAGAAGTAGCTAAGCCATTGGCGC 3815 Query 3882 TCGAAGAACCTACGAAACCATTGGCTATTGAAGCTCCTCCATCTTCCGAGGCACCACAGA 3941 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 3816 TCGAAGAACCTGCAAAACCATTGGCTATTGAAGCTCCTCCATCTTCTGAGGCACCTCAGA 3875 Query 3942 CCGAATCAGCGCCTGAAACCGCAGCCGCTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGCAGCCG 4001 | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3876 CTGAATCAGCGCCTGAAACTGCAGCTACTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGTAGCCG 3935 Query 4002 TTGCTGAGTCACCAGCACCTGGAACCGCAGCCGTTGCTGAGGCACCAGCATCTGAGACTG 4061 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 3936 TTGCTGAGTCACCAGCACCTGAAACCGTAGCCGTTGCTGAGTCACCAGCATCTGAAACTG 3995 Query 4062 CAGCAGCACCTGTGGATGGACCAGTGACGGAGACTGTGTCTGAGCCTCCTCCCGTAGAGA 4121 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3996 CAGCAGCACCTGTGGATGGACCCGTGACGGAGACAGTGTCTGAGCCTCCTCCCGTAGAG- 4054 Query 4122 AGGAGGAAACTTCTTTGGAAGAAAAAAGCGATCCGTCTTCAACTCCAAACACAGAAACAG 4181 | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4055 -G-AGGAAACTTCTTTGGAATACAAAAGTGATCCGTCTTCAACTCCAAACACAGAAACAG 4112 Query 4182 CT--ACGTCCACAGAAAATACTAGCCAAACAACAACAACGCCTGAAAGTGTTACAACAGC 4239 || | | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| Sbjct 4113 CTGTA-G-CCACAGAAGATACTAGCCAAACAACAACGACGCCTGAAACTGTTACAAGAGC 4170 Query 4240 GCCACCTGAACCTATTACAACAGCGCC---GCCTGAAACTGTTACGACAACAGCAGTGAA 4296 |||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 4171 GCCACCAGAAACTGTTACAACAGCCCCTCCGCCTGAAACTGCTACGACAACAG---TGAA 4227 Query 4297 ACCAACAGAGAATGCAGCAACCGAGAGACGAGTAACCAATTACCCTCCAATAAGAAGCCA 4356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4228 ACCAACAGAGAATGCAGCAACCGAGAGACGAGTAACCAATTATCCTCCAATAAGAAGCCA 4287 Query 4357 GCCAATAGATTTTGATTTCTTGAATGGCTAAA-CCAAGTTTTCACAGAAGATCCCAAAAC 4415 |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 4288 GCCAATTGATTTTGACTTCTTGAATGGCTAAAACCAAGTTTGCACAGAAGATCCCAAAAC 4347 Query 4416 GAAGA 4420 ||||| Sbjct 4348 GAAGA 4352 Score = 145 bits (78), Expect = 4e-33 Identities = 92/98 (94%), Gaps = 3/98 (3%) Strand=Plus/Plus Query 3 ACACTACCGGAGTTTTTGTTCGGCGATTGTAGTTAGTGGTGGTGGATCCGGGCA-TTTCA 61 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| Sbjct 1 ACACTACCGGAGTTTTTGTTCGGCGATTGTAG-TGGTGGTGGTGGATCCGGCCATTTTC- 58 Query 62 TTTGATAACCGCGGTGGATCTAATTGATCTGGATCTGA 99 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 59 TTTGATAACCGCGGTGGATCTAATCGATCTGGATCTGA 96 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 177386347753 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5