BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G24740.1
Length=10517
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg942029 jgi|Araly1|942029|scaffold_602573.1 1.558e+04 0.0
Ahg925876 jgi|Araly1|925876|scaffold_201437.1 444 7e-123
> Ahg942029 jgi|Araly1|942029|scaffold_602573.1
Length=10078
Score = 1.558e+04 bits (8437), Expect = 0.0
Identities = 9255/9648 (96%), Gaps = 64/9648 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 774 GGTCAATCGATCTGGAGAGCTTTATGACGATCTTCCTCAGTATTCTATCAGCGCTGAGTT 833
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 GGTCAATCGATCTGGAGAGATTTTTGACGATCTTCCTCAGTATTCTATCAGCGCTGAGTT 514
Query 834 GACTGATGTGGTGGTGACTCTGAATGAATTTCAATTGCAGCAGATTCTTATTCTGTTAGA 893
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 GACTGATGTGGTCATGACTCTGAATGAATTTCAATTGCAGCAGATTCTTATTCTGTTAGA 574
Query 894 TTATTTGCAAACCAGCCAGTTGCGTGAGAGGTATGGGCGGTATCGTCCCTGCTCCACTTC 953
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 575 TTACTTGCAAACCAGCCAATTGCGTGAGAGGTATGGGCGGTATCGTCCCTGCTCCACTTC 634
Query 954 TTTATCGAGGAAACCACCTGGATGGCAGAAACTTTGGTGGCACTATGCCCAAAATTCAGT 1013
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |
Sbjct 635 CTTATCGAGGAAACCACCAGGATGGCAGAAACTTTGGTAGCATTATGCCCAAAAATCAAT 694
Query 1014 TTTATCTGATTCAATCGATAAGTCCATCCGTTTGGGTTTGGAAGAATTGGAGAAGAAGTC 1073
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 695 TTTATCTGATTCAATCGATGAGTCTATCCGTTTGGGTTTGGAAGAAGTGGAGAAGAAGTC 754
Query 1074 TGATATTGATGATATCTTAAGTTATAGGTCTGCAGCGGAAGGTGAGATGCAGGAAGCTTG 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 755 TGATATTGATGATATCTTAAGTTATAGGTCTGCAGCGGAAGGTGAGATGCAGGAAGCTTG 814
Query 1134 CTCAGAATTGACAGTAAACATGGGAGCGACTGGTGCCACTAGATCCGAAAAGGAACAGAG 1193
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 815 TTCAGAATTGACAGTGGACATGGGAGCGACTGGTGCCAC----T-------GG--C---- 857
Query 1194 TGCCCCTGAAAAGGAACCGAGTGACGATCCTACATTAAATAAGTCGCGTGGGTGGTTGAA 1253
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 T----CTGAAAAGGAACCGAGTGACGATCCTACATTAAATAAGTCGCGTGGGTGGTTGAA 913
Query 1254 CTGGTTGTCACGGGGAATGCTTGGTGCCGGAGGCACAGAGGATTCAAGTCAGTTTTCTGG 1313
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 914 CTGGTTGTCACGGGGAATGCTTGGTGCCGGAGGCACAGAGGACTCAAGTCAGTTTTCTGG 973
Query 1314 TGTTGTTTCTGATGAAGTTGTCAAGGATATACACAAGGCAACAAAGTTTTACCCTCTTTC 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 974 TGTTGTTTCTGATGAAGTTGTCAAGGATATACACAAGGCAACAAAGTTTCACCCTCTTTC 1033
Query 1374 TTCATCTCCTAGAAATACAAGTGCAACTGGTAAGATCTGTACGTGCTCCATTCGACTCAA 1433
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 GTCATCTCCTAGAAATACAAGTGCAACTGGTAAGATCTGTACGTGCTCCATTCGACTCAA 1093
Query 1434 CGTACGCAAATTTTCTGCTACTTTGCAACATATAAGTGGAAGTTCTTCTCAAGTTATTAC 1493
||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 CGTACCCAAAATTTCTGGTACTTTGCAACATATAACTGGGAGTTCTTCTCAAGTTATTAC 1153
Query 1494 AGAGTTGGACATTTTGGGGGTGATTGTTGAATGCAAGTCTTGGAAAGATTCTACAGCCAT 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 AGAGTTGGACATTTTGGGGGTGATTGTTGAATGCAAGTCTTGGAAAGATTCTACAGCCAT 1213
Query 1554 GATTTTATCTGTTATTTCTGGAAGGCTGGTCTATCCTCACAATGGGAAAGAAATTTTAAC 1613
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 GATTGTATCTGTTATTTCTGGAAGGCTGCTCTATCCTCACAATGGGAAAGAAATTTTAAC 1273
Query 1614 CATGAAAAGGGTCTGTTCTCAGAGTGATACACTAGAAACGAAACCCTCATATGGAGCGCG 1673
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1274 CATGAAAGGGGTCTGTTCTCAGAGTGATACACTAGAAACGAAACCCTCATATGGAGCACG 1333
Query 1674 GTTGGAGTTGTCTAAAGATCATGATGTTGCATTGTCATTAAAGGCCACCCTTCAACCACT 1733
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1334 ATTGAAGTTGTCTAAAGATCATGATGTTGCATTGTCATTAAAGGTCACCCTTCAACCACT 1393
Query 1734 TGAAGCCGCTTATGATGGAGGCTTCATTCTAGCTGTCAGTAATTTTTTC-TCGGGTTCAA 1792
|||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 1394 TGAAGCTGCTTATGATGTAGACTTCTTTCTAGCTGTCAGTAAATTTTTCAT-GGGTTCAA 1452
Query 1793 GATACTTCAAACTCCAACATGAAAGGATTTTATCATCACTCAATGGCCTTGAAAGTGAAA 1852
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 GATACTTCAAACTACAACATGAAAGGATTTTATCATCACTCAATGGCCTTGAAAGTGAAA 1512
Query 1853 CGCGATTGGCAGCGAAAGCTGAATACCTCTTATCAAGCCGAAATAAAGTTAAGTGGGATC 1912
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1513 CGCGATTGGTAGCGAAAGCTGAATACCTCTTATCAAGCCGAAATAAAGTTAAGTGGGACC 1572
Query 1913 TGGACATAAAAGATCTTACCTTAAGTTTCCCTGGACGATTGGTTGAATCAGAAAGCTATA 1972
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1573 TGGACATAATAGATCTTACCTTAAGTTTCCCTGGACGATTGGTTGAATCAGAAAGCTATA 1632
Query 1973 ATCTGGTTCTGGTATTGGAATCTCTTTCTATCACATCTAGTAGCACAGATGCTCTTAGCC 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 ATCTGGTTCTGGTATTGGAATCTCTTTCTATCACATCTAGTAGCACAGATGCTCTTAGCC 1692
Query 2033 AAATTCCAAGATTGCAGTCTGATGTGGACCATGTGGTCAATAGCTTACAAA-----G-TT 2086
|| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1693 CAAGTCCAAGATTGGAGTCTGATGCGGACCATGTGGTCAATAGCTTACAAAGTTCCGTTT 1752
Query 2087 CCGTTGAAGCTTTGGATGCTTTTCAAGTCAAAGATCTCTACGACCATTTTGATATCAAAA 2146
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1753 CCGTTGCAGCCTTGGATGCTTTTCAAGTCAAAGATCTCTATGACCATTTTGATATCAAAA 1812
Query 2147 TCTGTAACCTTGAGATGAAGCTCATGAAGATTCATCCTTTCCAAGAACTTCCCCTTGTGG 2206
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 TCTGTAACCTTGAGATGAAGCTCATGAAGATTTATCCTTTCCAAGAACTTCCCCTTGTGG 1872
Query 2207 AGAAATCATCTTTACTTATCAAGTTTGCGTCTTGTATAATTCCGGAGGAGTCGATTTTGA 2266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 AGAAATCATCTTTACTTATCAAGTTTGCGTCTTGTATAATTCCGGAGGAGTCGATTTTGA 1932
Query 2267 AGCAGTTGGAGGTTGAAGCTACTCTGCCTATGTTCAATGTCCATTTCTCTCCGTCAATAT 2326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 AGCAGTTGGAGGTTGAAGCTACTCTGCCTATGTTCAATGTCCATTTCTCTCCGTCAATAT 1992
Query 2327 TTAAAGGAGTCATGTCTGTGATTGAATATCTTGATATTCAGGATCATGGAACTCGAAATC 2386
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1993 TTAAAGGAGTCATGTCTGTGATTGAATATCTTGATATTCAGGATCATGCAGCTCGAAATG 2052
Query 2387 CTCCACCTTCCCCTGCTCCCATCTTTCACTTCACCATCAAAACCGACTTGGCATTTTTAA 2446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
Sbjct 2053 CTCCACCTTCCCCTGCTCCCATCTTTCACTTCACCATAAAAACCAACTTGGCATTTTTCA 2112
Query 2447 GGTTGCACGTCAATCTCGAAAATAAAGGAGAAAATAGCACAGTGCTTGTTCTTTCTATAC 2506
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 GGTTGCACGTCAATCTCGAAAATGAAGGAGAAAATAGCACAGTGCTTGTTCTTTCTATAC 2172
Query 2507 AGCAGCTTGATCTCTGGTATTCACGTGCTATATTTGAAGAGTGGTCAGTCCGTGCGAAAA 2566
|||| || |||||||||||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 AGCAACTGGATCTCTGGTATTCGCTTACCAAATTTGAAGAGTGGTCAGTCCGTGCGAAAA 2232
Query 2567 CATTGGAAATAACAGCTTGCTCCTCTAAAGATGCAGCTGACAGTCATATTTTATGTTCAT 2626
|| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2233 CACTGGAAATGACAGATTGCTCCTCTAAAGATGCAGCTGACAGTCATATATTATGTTCAT 2292
Query 2627 CTGGAAATCTACTCAAATCGTCTTCCCATGGACATGGGATGGATGCTCATACTAGCGATG 2686
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293 CTGGAAATCTACTCAAATCTTCTTCCCATGGACATGGGATGGATGCTCATACTAGCGATC 2352
Query 2687 AAACCAACATTATTGACTACAGAACAACTCCTGAAGCTGCTATCAGCTTAAATTGCAAGG 2746
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 AAACCAACATTATTGATTACGGAACAACTCCTGAAGCTGCTATCAGCTTAAATTGCAAGG 2412
Query 2747 TTTCTCAAAGTAAAAGTTTTATTTTTCACAAGTATACAGTCTATTGGAGGAGCGCCGAGC 2806
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
Sbjct 2413 TTTCCCAAAGTAAAAGTTTTGTTTTTCACAAGTATACAGTCTATTGGAGGGGCGCTGAAC 2472
Query 2807 TCCATTGCTACCCATACATATTTGGTTTGCTGACAAATTTTTTGGATAAGATAGCTTCCT 2866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2473 TCCATTGCTACCCATACATATTTGGTTTGCTGACAAATTTTTTGGATAAGATAGCCTCCT 2532
Query 2867 ATAAGATCTCGTCTAGCTATACAAATCCATCTAGCCTTGCTACAGATACCATTGCTCCAA 2926
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 2533 ATAAGATCTCGTCTAGCGATACAAATCCATCTAGCCTTACTACAGATACCAGTGCTCCAG 2592
Query 2927 CAGAAATACCTCAGTTTGATTTTGAAAGGTTTGGATTCTCAAACTTCACTGAAAGTAGAT 2986
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2593 CAGAAATTCCTCAGTTTGATTTTGAAAGGTTTGGATTCTCAAACTTCATTGAAAGTAGAT 2652
Query 2987 CTTGTGGCTGCATTCCTCTTGACAAATTTCCATTTGTAACCATTAACAATTCGGGTTCTC 3046
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||
Sbjct 2653 CTTGTGGCTGCATTCCTCTTGAAAAATATCCATTTGTGACCATTTACAATTCGGGTTTTC 2712
Query 3047 TTCATAGCCTAGAAAGTTCTCTGTGTTATTCGACTTCTGACTGGAGGAAGTTATTTATAT 3106
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 TTGATAGCCTAGAAAGTTCTCTGTGTTATTCGACTTCTGACTGGAGGAAGTTATTTATAT 2772
Query 3107 TAAAGAATAGAAAGGATGGGGCACAAATAGGTTTGAACTGCGAATGTAACAGCTGTACTT 3166
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2773 TAAGGAATAAAAAGGATGGGGCACAAATAGGTTTGAACTGCGAATGTAACAGCTGTACTT 2832
Query 3167 TTCAACTTAAACGTGATTGCCCTCTGAATGGGCTTGCGTCCTCCAGGGATCTTGGTCAGA 3226
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2833 TTCAACCAAAACGTGATTGCCCTCTGAATGGGCTTGCGTCCTCCAGTGATCTTGGTCAGA 2892
Query 3227 CCAATCACTTTACAGTTGATATGCATGTCTTCAACACCAATGTACATTTTCATGATTCTT 3286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2893 CCAATCACTTTACAGTTGATATGCATGTCTTCAACACCAATGTGCATTTTCATGATTCTT 2952
Query 3287 CAAGTGTTTTTGGAACTATTATACTGCCAGTATCCAGATACTTTCTTAACATTTCAGATG 3346
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2953 CAAGTGTTTTTGGAACTATTATACTGCCAGTATCCAGATACTTTCTTACCATTTCAGATG 3012
Query 3347 ATCTTCTCGATTTGGTTGCCTCTGCTGAAGACTTGATGCTGGTGTCATCTTTGTTCACCA 3406
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3013 ATCATCTCGATTTGGTTGCCTCTGCTGAAGACTTGATGCTGGAGTCATCTTTGTTCACCA 3072
Query 3407 ACTATTCTGGCGGGTTTCTTTGGAAACAATCATCAACAGATGTCTCACAGGTCTTGAACC 3466
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3073 ACTATTCTGGTGGGTTTCTTTGGAAACATTCATCAACAGATGTCTCGCAGGTCTTGAACC 3132
Query 3467 TACGTGTAAGGAAGAGGGGTTTGGAGCCTTCTGGTTCTCAACTTGAAGTGAGCATAGGTA 3526
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 TACGTGTAAGGAAGAAGGATTTGGAGCCTTCTGGTTCTGAACTTGAAGTGAGCATAGGTA 3192
Query 3527 TTCAACACACATACTGCATTTTACCGCCGGAATATCTAGCCATTATAATTGGCTATTTCT 3586
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3193 TTCAACACACATGCTGCATTTTACCTCCGGAATATCTGGCCATTATAATTGGCTACTTCT 3252
Query 3587 CTCTTTCTGACTGGACTTCAAAGTCTGGCCTGCAGTCATTGCCACAAGCTACTGAGTTGA 3646
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 CTCTTTCTGACTGGACTTCGAAGTCTGGCCTGCAGTCATTGCCACAAGCTACTGAGTTGA 3312
Query 3647 CCAAGGCTCATTCTGAGTTTGCCATTAG-TTATAAAATTGAGATACTGGACTCCTCTATT 3705
||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3313 CCAAGGCTCCTTCTGAGTTTGCCATT-GCTTATAAAATTGAGATACTGGACTCCTCTATA 3371
Query 3706 GTTCTTCCTGTGGAAGGTGATGACCGCCGGCAACTGAAAGTTGACATTCAGCAGTTATAT 3765
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3372 GTTCTTCCTGTGGAAGATGATGACCGCCGGCAACTGAAAGTTGACATTCAGCAGTTATAT 3431
Query 3766 ATTAGCTTTATTCCAGAGTGTGCGTTGAGCAATGTGGTGCAGCACATACCACAGGAATGT 3825
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3432 ATTAGCTTTGTTCCAGAGTGTGCTTTGAGCAATGTGGTGCAGCACATACCACAGGAATGT 3491
Query 3826 GTTATTCCACTTAATCAAGTA-CTAGGGCGAGCCGACTGTTTAAACATATTTGGGCGGGA 3884
|||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3492 GTTATTCCGCTTAATCAAGTAGC-AGAGCGAGCTGACTGTTTAAACATATTTGGGCGGGA 3550
Query 3885 CTTATCAGTATCATTGCTGCTTTCTGAGAGTGACATATCAACATTCAAGAAGAACGCCGT 3944
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 3551 CTTATCGGTATCATTGCTGCTTTCTGAGAGTGGCATATCAACATTCGAGAAGGACGCCAT 3610
Query 3945 GTGCAGAAGTATCACTCTGGCTGCTAGCATTATTGCTGATACTTGGATTAGATTCCCTTG 4004
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 3611 GTGCAGAAGTATCACTCTAGCTGCTAGCATTATTGCTGATGCTTGGATTAGCTTCCCTTG 3670
Query 4005 TGATCACAATCCGTTAACGGAATTGGCATGTGTTATGTCAAGGGTTGACGTTTGTGAAAT 4064
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3671 TGATCGCAATCCGTTAACGGATTTGGCATGTGTTATGTCAAGGGTTGACGTTTGTGAAAT 3730
Query 4065 TGTTGTCGATGATTCAGATGCCTTGGATGGGTTTAAGGCATTTCTTGATGTGGTTGATCA 4124
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3731 TGTTGTGGATGATTCAGATGCCTTGGATGGGTTTAAGGCATTTCTTGATGTGTTTGATCA 3790
Query 4125 GCTTTCTTTAGTCGATGAGGAATCAAAACTTTTCGTGTCTGATGTTCCTCAGTTTCTTCA 4184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3791 GCTTTCTTTAGTCGATGAGGAATCAAAACTTTTCGTGTCTGATGTTCCTCAGTTTCTTCG 3850
Query 4185 TACGAAGATGCGCCTAAAGCAAGAGTTGTCAGTTGCACCCCTGGAACCTTCCACAAGCTT 4244
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3851 TACAAAGATGCGTCTAAAGCAAGAGTTGTCAGTTGCCCCCCTGGGATCTTCCACAAGCTT 3910
Query 4245 TATAAAATTCAGAATTTTTGTCAATCTTTTGACGTCAAAACTGCATCGGTTAAGGAAAGC 4304
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3911 TATAAAATTCAGAATTTTTGTCAATCTTTTGACGGCAAAATTGCATCGGTTAAGGAAAGA 3970
Query 4305 TCCTGGAACACTGCTATCCGAACCAGTGCTCCAAGCTGATATGAAATTTGTTTGCTCTGG 4364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3971 TCCTGGAACACTGCTATCCGAACCAGTGCTCCAAGCTGATATGAAATTTGTTTGCTCTGG 4030
Query 4365 AGAACTTAAAAATAATTTCCCTATGAGCTTGGATGTTCAGTTTTTCAAAATCGGGCTTTA 4424
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||
Sbjct 4031 AGAATTTAAAAATAATTTCCCTATGAGCTTGGATGTTCAATTTTTCGAAATCGGGATTTA 4090
Query 4425 TTCATTACTGAGCTCAGTCATGTTAGCTAGATGCATCAATGCAGATGGGGATCCTTCTGC 4484
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4091 TTCATTGCTGAGCTCAGTCATGTTAGCTAGATGCATCAATGCATATGGGGATCCTCCTGC 4150
Query 4485 ACTGAGAGTCAGATTTACGGAGCAGGCTGAAAATGAATACGATCTCTGTTTTTCTCTTCC 4544
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4151 ACTGAAAGTCAGATTTACGGAACAGGCTGAAAATGAATACGATCTCTGTTTTTCTCTTCC 4210
Query 4545 ATCCCTAGACATCTGGTTACACTTTTTTGATTGGATTGAAGTTATTGAACTTCTGAAATC 4604
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4211 ATCTCTAGACATCTGGTTACACTCTTTTGATTGGATTGAAGTTATTGAACTTCTGAAATC 4270
Query 4605 TTATTCCCAGAAACTGGAAGACAGTAGTGAAGACCGTTTTTTCTCAAAAGGTTCAAAATT 4664
|||||| ||| | | || | | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 4271 TTATTCTCAG--A-T-----AC--T-G-GAAGACCCTTTTTTGTCAAAAGGTTCAAACTT 4318
Query 4665 GGATATGGATGAATCTATTGGAGTGGTAAGGACTATTTGTGACAATACTGATCGGGTTTT 4724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4319 GGATATGGATGAATCTATTGGAGTGGTAAGGACTATTTGTGACAATACTGATCGGGTTTT 4378
Query 4725 GAATGTTCTGCAAACTGAGGTATCAGAGAACTCTAGTGAGGTAATGTCATTTGCCGCAAG 4784
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 4379 GAATGTTCTGCAAACTGAGGTATCAGAGAACTCTAGTGAGGTAATGGCATTTTCCGCAAG 4438
Query 4785 ATCAGAGAATATTGGTGTCAAAATCCATATTCCTCTTTGCACAAGCCATACAGAATTTCC 4844
|||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4439 ATCAGAGACTATTGGGGTCCAAATCCATTTTCCTCTTTGCACAAGCCATACAGAATTTCC 4498
Query 4845 AGGGTTCATGGCAACTGATGTTCATGAGATATCTGAGGAAGAGCACACAAATTGTTTTAA 4904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4499 AGGGTTCATGGCAACTGATGTTCATGAGATATCTGAGGAAGAGCACACAAATTTTTTTAA 4558
Query 4905 AGGGAATTACTGTAAATATGTTTCTGTTACAGCGTGTAGTAGAAGTGGCGAACTCTCTAT 4964
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 4559 AGGGAATTACTGTAAATATGTTTCTGTTACAGCGCGTAGTAGGAGCGGCGAACTCTCTAT 4618
Query 4965 TCTTGGGAGAGATGTCAAACTGAGCTATAAGATTGAAAAGCTCAATGGGATTCTTGCAAT 5024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4619 TCTTGGGAGAGATGTCAAACTGAGCTATAAGATTGAAAAGCTCAATGGGATTCTTGCAAT 4678
Query 5025 ATCTGGGGTTGACACTGTCAGGTCTTGCTCTCTATTTGGGGCGGCACAACTACTTGTAGA 5084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4679 ATCTGGGGTTGACACTGTCAGGTCTTGCTCTCTATTTGGGGCGGCACAACTACTTGTAGA 4738
Query 5085 AACTAGTATTCAGATGGATCAGAACAAAATCATGAGCATAGATGTGGGGATACTGTCTGA 5144
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4739 AACTAGTATTCAGATGGATCAGAACAAAATCATGAGCATAGATGTGGGGATATTGTCTGA 4798
Query 5145 CAAAGTAGAGATGCATGCATCTCATCAAGTATTATCTTTTTGGCATGGAATTACGTTTGA 5204
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4799 CAATGTAGAGATGCATGCATCTCATCAAGTATTATCTTTCTGGCATGGAATTACGTTTGA 4858
Query 5205 TGCACCTGAGACACCATCTTCACAAAATTCGGAAGGAAACATGAGCATAAAAGTCCAGAT 5264
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4859 TGCACCTGAGACACCATCTTCACAAAATTCGCTAGGAAACATGAGTTTAAAAGTCCAGAT 4918
Query 5265 AAGAGATGTGTCTCTTCTTATATCAGATGGAAAGTGGGGATGTAGCGGTATGCTTCTTGA 5324
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4919 AAGAGATGTGTCTCTTCTTATATCTGATGGAAAGTGGGGATGTAGCGGTATGCTTCTTGA 4978
Query 5325 AGTTCTTATGAGAAACTTTCTCCTGCAAGCTAATCTGGCCGaaaaaaaTATGGAGAGTTT 5384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4979 AGTTCTTATGAGAAACTTTCTCCTGCAAGCTAATCTGACCGAAAAGAATATGGAGAGTTT 5038
Query 5385 GGTTTCATGTGATCTTGAAGTGAATTATAATAATATGCACAAGGTCTTGTGGGAGCCTTT 5444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5039 GGTTTCATGTGATCTTGAAGTGAATTATAATAATATGCACAAGGTCTTGTGGGAACCTTT 5098
Query 5445 TATTGAGCCCTGGAATTTTGATATCAAATTATCCCGAAAATTTGATGCAAATTCTTTGCT 5504
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5099 TATTGAGCCCTGGAATTTTGATATCAAATTATCCAGAAAATTTGATGCAAATTCTTTGCT 5158
Query 5505 GAACAATGCTGGGCTCACTGAAGTAATTGTTGCATCATCAAATCAGCTCAATTTGAACTT 5564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 5159 GAACAATGCTGGGCTCACTGAAGTAATTGTTGCATCATCAAATCATCTCAATTTGAACAT 5218
Query 5565 AACAGAATCTCTTTTTGAGTGCATTTTCAGGATAATTGAGATGTTGAACATTTTGGAATT 5624
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 5219 AACAGAATCTCTTTTTGAGTGCATTTTCAGGATAATTGAGATGTCGAACACTTTGGAATT 5278
Query 5625 GATGGAAACAGATGCCATTCCTGATAATAAGGGATTGTCAGTTTACTGCACCAACAGTAC 5684
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5279 GATGGAAACAGATGTCATTCCTGATGATAAGGGATTGTCAGTTTACTGCACCAAAAGTAC 5338
Query 5685 CAGGACAGAACGATATTCCCCATATGTACTTCAAAATTTAACTTCTCTTCCGTTGGGGTA 5744
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5339 CAGGACAGAACGATATTCCCCATATGTATTTCAAAATTTAACTTCTCTTCCTTTGGGGTA 5398
Query 5745 CCAAGTTTTCCAAGGACATGATTCAGATGTGCTAAATATATCAGCTCCAGTGGCTCAGAA 5804
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5399 CCAAGTTTTTCAAGGACATGATTCAGATGTGCTAAATATGTCAGCTCCAGTGGCTCAGAA 5458
Query 5805 CTTTGTGCAACCCGGTTGC-TCTGTTCCCATTTATATCGATAATAGTGACACACTACTTA 5863
||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5459 CTTTGTGCAACCCGGTT-CTTCTGTTCCCATCTATATCGATAATAGTGACACACTACTTA 5517
Query 5864 TTCCTGATAGACGTCGAAGTCAATTTGGTTGTTCCAGCAGTGAATCTGGTGATGCCATAC 5923
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5518 TTCCTGATAGACGTCGAAGTCAATTTGGTTGTTTCAGCAGTGAATCTGGTGATGCCATAC 5577
Query 5924 ATCATTATATGAAGGTCCAACTTGATGGAACATCTTTTGCTTCTCCTCCTCATTCAATGG 5983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5578 ATCATTATATGAAGGTCCAACTTGATGGAACATCTTTTGCTTCTCCTCCTCATTCAATGG 5637
Query 5984 ATCGAATTGGCCTTTCCTATTTTGAGGTTGATTTTTCCAAAACATCAAACTCCAGTGATA 6043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5638 ATCGAATTGGCCTTTCCTATTTTGAGGTTGATTTTTCCAAAACATCGAACTCCAGTGATA 5697
Query 6044 ATGTTGAGAAAGCAAGTAAATCTGGTTATGGAAGCAGCTTTGTTGTTCCTGTTGTGTACG 6103
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5698 ATGTTGAGAAAGCAAGTAAATCTGGTTCTGGAAGCAGCTTTGTTGTTCCTGTTGTGTACG 5757
Query 6104 AGGTTTCATTGCAGCAGCAGAGCAAGTTGATACGAGTATACTCTACTGTTATAATTTTGA 6163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5758 AGGTTTCATTGCAGCAGCAGAGCAAGTTGATACGAGTATACTCTACTGTTATAATTTTGA 5817
Query 6164 ACTCCACATCCATGCCATTGGAACTTCGCTTTGATATTCCGTTTGGCATCTCCCCAAAG- 6222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5818 ACTCCACATCCATGCCATTGGAACTTCGCTTTGATATTCCGTTTGGCATCTCCCCAAAGA 5877
Query 6223 ----TTGCCTTACCTGGTTGATCTTAACACCATCTTTTATTATTCTTATG-CCATTCTAT 6277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||
Sbjct 5878 CACTTTGCCTTACCTGGTTGATCTTAACACCATCTTTTATTCTTCTTATGTCAATTCTAT 5937
Query 6278 TTCAGATCCTAGATCCTATTTTTCCTGGTCAAGAATTTCCACTGCCTCTACACTTGGCTA 6337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5938 TTCAGATCCTAGATCCTATTTTTCCTGGTCAAGAATTTCCACTGCCTCTACACTTGGCTA 5997
Query 6338 AATCTGGCCGGCTACGGTGGCGTCCCCTCGGAGATTCTTATTTGTGGAGTGAAGCTCATA 6397
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5998 AATCTGGCCGGCTTCGGTGGCGTCCCCTCGGAGATTCTTATTTGTGGAGTGAAGCTCATA 6057
Query 6398 GCATCTCCAAAGTTCTTTCTCAAGATAGCGGGATAGGATTTCGCCGATCTTTTGCTTGTT 6457
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6058 GCATCTCCAAAGTTCTTTCTCAAGATAGCAGGATAGGATTTCGCCGATCTTTTGCTTGTT 6117
Query 6458 ATCCATGTCACCCTAGCCATGAACCATTTCGGTGTTGCATATCTGTTCAGAGCACCAGCT 6517
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6118 ATCCTTGTCACCCTAGCCATGAACCATTTCGGTGTTGCATATCTGTTCAGAGCACTAGCT 6177
Query 6518 TGCCGGCATCGTTTCATATTAATGATTTGTCAGCTGGAAATTTTGGTCAGCAGTTGCACA 6577
|||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6178 TGCCGGCATCCTTTCATCTTAATGATTTGCCAGATGGAAATTTTGGTCAGCAGTTGCACG 6237
Query 6578 ATCTTGACCAATCAAGAGAGCAATTCATTCATCAAGTAACTTTAAGCACTCCATTTGTTG 6637
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6238 ATCTTGACCAATCAAGAGAGCAAGTCATTCATCAAGTAACTTTAAGCACTCCATTTGTTG 6297
Query 6638 TGAGCAACTGTCTTCCAGATCCAATATCACTTTCTATCGAAAGTGGTGGCATCACTCAAA 6697
||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
Sbjct 6298 TGAGCAACTGTCTTCCAGAACCAATATCACTTTCGATAGAAAGTGGTGGCATCACTCAGA 6357
Query 6698 CTGCATCCCTTCCT------GAGACGCCATTCCATCATATTGATCCTTCACATGACCTGG 6751
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6358 CTGCATCCCTTCCTGAGGGGGAGACGCCATTCCATCACATTGATCCTTCACATGATCTGG 6417
Query 6752 TCCTTGAGTTCAAATTAAATGGCTGTAGAACATCATCTTTAAAGTTTTCACGCTCAGAAA 6811
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6418 TCCTTGAGTTCAAATTAAATGGCTATAGATCATCATCTTTGAAGTTTTCACGCTCAGAAA 6477
Query 6812 CTTTTAGCACAGAGGCTAAGTTCAGTGGAGGGAAGTTCTCTCAGATTGAAACTATTTCCT 6871
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6478 CTTTTAGCACAGCGGCTAAGTTCAGTGGAGGGAAGTTCTCTCAGATTGAAACTATTTCCT 6537
Query 6872 TTGATTCACACGTTGGTGGTGGTTCTGTTTATGTATCGTGTGAGAAAACAATGGATGCAA 6931
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6538 TTGATTCTTACGTTGGTGGTGGTTCTGTTTATGTATCGTGTGAGAAAACAATGGATGCAA 6597
Query 6932 CATGTGGGGCTCGGGAAGTATTAATCTTTGTCCCATTTTTACTGTATAACTGCACTGGAA 6991
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||
Sbjct 6598 CATGTGGGGCTCGGGAAGTATTCATCTTTGTCCCATTTCTATTGTACAACTGCACTGGAA 6657
Query 6992 CTCCTCTGATTGTTTCGGACTGCACCAATGAAACTAAAGGGATTTACAGCGTAATACCGT 7051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |
Sbjct 6658 CTCCTCTGATTGTTTCGGACTGCACCAATGAAACTAAAGCGATGTACAGCGTAATTCCCT 6717
Query 7052 CTTGCTACAACCTGATTGAGCAGCATTTTGTTCAAAGTCGAAAAGTTGGTCTTGGCATTT 7111
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6718 CCTGCTACAACCTGATTGAGCAGCATTTTGTTCAAAGTCGAAAAGTTGGTCTTGGGATTT 6777
Query 7112 TGACCTCTGAGAAAGATTTGCTAGATAAAGCTGTAATGGAGGACATTCCTTGTAGTCCTT 7171
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||
Sbjct 6778 TGACCTCTGAGAAAGATTTGCTAGATAAAGTTCTAATGGAGGATATCCCTTCTAGTCCTT 6837
Query 7172 CCTCATCGGAGTGCAGCAACACTGCTTCCAGTACTGAGAGATTTATAGATAAGCATGCGA 7231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||
Sbjct 6838 CCTCATCGGAGTGCAGCAACACTGCTTCCAGTACTGAGAGATTTTTGGATAGGCATGCGA 6897
Query 7232 CTCAGTCAACTCGCCAAGTCCCTTTTGCAGCATATCCAAAAGACTCAGCAATTGTTCGCA 7291
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6898 CTCAGTCAACTCGCCAAGTCCCTTTTGTAGCATATCCAAAAGACTCACCAATTGTTCGCA 6957
Query 7292 AGAGGAGCCTTTCTTCAAAAAGTTTAAGAGAGGTGTGCTTCCAAGGTAATGATGAGTCTG 7351
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 6958 AGAGGAGTCTTTCTTCAAAAAGTTTAAGAGAGGTGTGCTTCCAAGGT-A--ATGAGTCTG 7014
Query 7352 GCAAAGTAAAGGCATGCATTTATTCACCTTGCCCTATTTCCAGAGTCAGTGACACCATGA 7411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 7015 GCAAAGTAAAGGCATGCATTTATTCACCTTGCCCTATTTCCAGGGCCAGTGACACCATGA 7074
Query 7412 TCCGAGTCAAAAGGGACCTGCCAGGGTGGGTTAATTCAAGTAGCCCATACCCTCTGTGGT 7471
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 7075 TCCGAGTCAAAAGGGACCTGCCAGAGTGGGATAATTCAAGTAGCCCATACCCCCTGTGGT 7134
Query 7472 CTGCTCCATTTCCTCTCGTTCCACCCAGTGGTTCTACAAATGTAGTTGTCCCACAACCAT 7531
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 7135 CTGCTCCATTTCCTCTTGTTCCACCCAGTGGTTCTACCAATGTAATTGTCCCACAACCAT 7194
Query 7532 CGCCTGGTGAATCATCTTTATTATCTGTTACATGTTCTATTCTTGGTGGTGCATTAGCAG 7591
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7195 CGCCTGGTGAATCATCTTTATTATCTGTTACGTGTTCTATTCTTGGTGGTGCATTAGCAG 7254
Query 7592 GGAGAACGCAAGCAATTACTTTCCAACCTAGATATATCATCTGTAATTCATGCAGCCATA 7651
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7255 GGAGAACGCAAGCAATTACTTTCCAACCTAGATATGTCATCTGTAATTCATGCAGCCATA 7314
Query 7652 ACCTGTGTTACAAGCAGAAGGGAACCAATTTAGTTTCTCATCTGGCTGTTGGACAGCATT 7711
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7315 ACTTGTGTTACAAGCAGAAGGGAACCAATTTAGTTTCTCATCTGGCTGTTGGACAGCATT 7374
Query 7712 CTCAGCTTCAATGGACAGATACTACTAGGGAGCTGCTAGTTTCAATCCGTTTAAATGAGC 7771
|||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7375 GTCAGCTTCAATGGACAGATACTGCGAGGGAGTTACTAGTTTCAATCCGTTTAAATGAGC 7434
Query 7772 CTGGATGGCAATGGTCAGGCAGCTTCTTGCCAGATCATTTAGGGGATACGCAACTGAAGA 7831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 7435 CTGGATGGCAATGGTCAGGCAGCTTCTTGCCAGATCATTTAGGGGATACTCAATTGAAGA 7494
Query 7832 TTTGGAACTATGTTAACAAAGCTTTCAACATGGTGCGGGTGGAAGTTCAGAATGCCAATA 7891
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7495 TTTGGAACTATGTTAATAAAGCTTTCAACATGGTGCGGGTGGAAGTTCAGAATGCCAATA 7554
Query 7892 TGTCAAGCGGAGATGAAAAGATTGTAGGGAGTGTTCATGGACATGTCGGGACAAACTTTA 7951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7555 TGTCAAGCGGAGATGAAAAGATTGTAGGGAGTGTTCATGGACATGTCGGGACAAACTTTA 7614
Query 7952 TTCTATTATCAGATGACGACATGGGCTATATGCCTTACAGGATTGATAATTTCTCAAATG 8011
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 7615 TTCTATTATCAGATGACGACATGGGTTATATGCCTTACAGGATTGATAATTTCTCGAATG 7674
Query 8012 AGAGACTTAGGGTTTATCAACAAAAATGTGAAACTTTTGATACCATAGTTCATCCTTACA 8071
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7675 AGAGACTGAGGGTTTATCAACAAAAATGTGAAACTTTTGATACCATAGTTCATCCTTACA 7734
Query 8072 CATCTTGCCCTTATGCTTGGGATGAACCCTGTTATCCACATCGTTTGACCATTGAGGTAC 8131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 7735 CATCTTGCCCTTATGCTTGGGATGAACCCTGTTATCCACATCGTTTGACCATTGAGGTGC 7794
Query 8132 CCGGAGATCGTGTTC-TAGGCTCTTATGCATTTGAGATAACAAAACAACCTATTGCAGTG 8190
| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7795 CTGGAGATCGTG-TCATAGGCTCTTATGCATTTGAGATAACAAAACAACCTATTGCAGTG 7853
Query 8191 CACTTGCGCTCCACCTCTGAGAAACCTGAAAGGACATTGTTGCTATCTATCTGTGCTGAA 8250
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 7854 CACTTGCGCTCCACCTCTGAGAAACCTGAAAGGACGCTGTTGCTATCTATCTGTGCTGAA 7913
Query 8251 GGAGCTACAAAGGTTTTCAGTGTTGTAGATTCAGGTTATCACGCCATAAAAGATATAAAG 8310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||
Sbjct 7914 GGAGCTACAAAGGTTTTCAGTGTTGTAGATTCAGGTTATCACACTATGAAAGATATAAAG 7973
Query 8311 GAAACATTTGACTCCAGATTCCATGAGAAGGGAAAGAAAAAGCTTCAAACTGACAATATC 8370
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 7974 GAAACGTTTGACTCCAGATTCCATGTGAAGGGAAAGCAAAAGCTTCAAACTGATAATGTC 8033
Query 8371 ATCCGTTACACAGAAACGTTCTTGCTTGTCCTGCCAAGCATTGGTATATCTTTGGTTAAT 8430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8034 ATCCGTTACACAGAAACGTTCTTGCTTGTCCTGCCAAGCATTGGTATATCTTTGGTTAAT 8093
Query 8431 TCTCATCCACAGGAATTGGTTTATGCTTGTGCATCAAATGTTGTGTTAGAGTTAAGTCAG 8490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8094 TCTCATCCACAGGAATTGGTTTATGCTTGTGCATCAAATGTTGTGTTAGAGTTAAGTCAG 8153
Query 8491 AGTGTAGATCAGCAGAAGCTTTCCTTTCAGATCTCTTCACTACAGATAGACAACCCACTT 8550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8154 AGTGTAGATCAGCAGAAGCTTTCCTTTCAGATCTCTTCACTACAGATAGACAACCCACTT 8213
Query 8551 CAAAATTCTTCGTATCCTGTCATATTGTCATTCAATCATGACCACGAAGTCATTCCTCCT 8610
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 8214 CACAATTCTTCGTATCCTGTCATATTGTCGTTCAATCATGACCACAAAGGCATTCCTCCT 8273
Query 8611 GATTGGGGAATGAAGAACAACAAAGCAATACTTTTAAGTGAAATTGTTCAGCAAGTTAGG 8670
||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 8274 GATTGGGGAGTTAAGAATAAAAAAGCAATACTTTTAAGTGAAACTGTTCAGCAAGTTAGG 8333
Query 8671 GGTAATTCCTGTGATGCTGTAGTCTACGTTGACCTAGCAAAGTGGCGGAAAAAAGATGTT 8730
||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8334 GGTAATTCCCGTGATGCAGTAGTCTATGTTGGCCTAGCAAAGTGGCGGAAAAAAGATGTT 8393
Query 8731 TCACTAGTTTCTTTTGAGTACATAAATATTAGGATTGGTGAATTTGGACTTGAGCTGGAG 8790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 8394 TCACTAGTTTCTTTTGAGTACATAAATATTAGGATTGGTGAATTTGGACTTGAGCTCGAG 8453
Query 8791 CTACAAACACTTTTATCCTTACTGGAGTTCGTAAAAGCAGTGCTTCCCAATTCTCAGGCT 8850
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8454 CTACAAACACTTTTATCCTTACTAGAGTTTGTAAAAGCAGTGCTTCCCAATTCTCAGGCT 8513
Query 8851 AGACTCCTGCCGCTCTCAGATCCAACGCTACGTCCTCTGATTTATGACACTGGTTCCAAG 8910
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 8514 AGACTCCTGCCACTCTCGGATCCAACGCTACGTCCTCTGATTTATGACACAGGTTCCAAG 8573
Query 8911 GATATAAGTTCAGAAGATACTCCACATGCAAGAAACATTCCTGTATTTAACAAAAACCAG 8970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 8574 GATATAAGTTCAGAAGATACTCCACATGCAAGAAACATTCCTGTATTTAACAAAAGCCAG 8633
Query 8971 AGAAGCATTGTAGCTCTGCCTATAGTGGTTCCAATAGGAGCTCCTTGGCAGCATATTCAC 9030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8634 AGAAGCATTGTAGCTCTGCCTATAGTGGTTCCAATAGGAGCTCCTTGGCAGCATATTCAC 8693
Query 9031 TTGTTGGCTCGAAGACGCAGGAAAATTTATGTTGAAACATTTGACTTGGCCCCTATTCAG 9090
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 8694 TTGTTGGCTCGAAGACACAGGAAAATTTATGTTGAATCATTCGACTTGGCCCCTATTCAG 8753
Query 9091 TTTACTTTAAGCTTCTGCAGTGCTCCCTGGATGCTTAGGAACGGCATTCTTACTTCAGGA 9150
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 8754 TTTACGTTAAGCTTCTGCAGTGCTCCCTGGATGCTTAGGAATGGCATTCTTACTTCAGGA 8813
Query 9151 GAGTCCCTTATCCATAGAGGTCTTATGGCTCTTGCCGATGTCGAGGGTGCTCGAATACAT 9210
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8814 GAGTCCCTTATCCATAGAGGTCTAATGGCTCTTGCCGATGTCGAGGGTGCTCGAATACAT 8873
Query 9211 CTCAAACAATTGACAATTGCTCATCAAATTACTAGTTGGGAATCATTTCAGGAGATCCTT 9270
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8874 CTCAAGCAATTGACAATTGCTCATCAAATCACTAGTTGGGAATCATTTCAGGAGATCCTT 8933
Query 9271 GTTGGGCACTATACCCGCCAAATTCTTCATGAGATTTACAAGGTTTTCGGCTCTGCTGGT 9330
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 8934 GTTGGGCACTATACCCGCCAAATTCTTCATGAGATTTACAAGGTCTTCGGCTCTGCTGGT 8993
Query 9331 GTTATTGGAAATCCCATGGGGTTTGCGAGGAATGTTGCATTTGGAATTAAAGATTTCCTG 9390
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8994 GTTATTGGAAATCCCATGGGATTTGCGAGGAATGTTGCATTTGGAATTAAAGATTTCCTG 9053
Query 9391 TCAGCTCCCAGCAGGAGTATCTCAAAGAGCCCAGCAGGAATTATTCAAGGAATGGCTCAC 9450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9054 TCAGCTCCCAGCAGGAGTATCTCAAAGAGCCCAGCAGGAATTATTCAAGGAATGGCTCAC 9113
Query 9451 GGAACCACAAGTCTCTTCAGTAGCACTATTTATGCTTTAAGTGATGCTGCCACTCAATTT 9510
||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9114 GGAACCACAAGCCTCTTTAGTAGCACTGTTTATGCTTTAAGTGATGCTGCCACTCAATTT 9173
Query 9511 AGTAAAGCTGCACACAAGGGTATTGTTGCATTTACATTCAATGACCATGATGTTGCAAGG 9570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9174 AGTAAAGCTGCACACAAGGGTATTGTTGCATTTACATTCAATGACCATGATGTTGCAAGG 9233
Query 9571 ATGGAGAAGCAGCAATTGGGTGAAGGATCGCGTAGCAAAGGAGTTATAGGTGAAGTGTTT 9630
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9234 ATGGAGAAGCAGCAATTGGGCGAAGGATCGCGTAGCAAAGGAGTTATAGGTGAAGTGTTT 9293
Query 9631 GAGGGACTCACTGGTCTCCTTCAATCACCAATAAGAGGAGCTGAGAAACATGGTCTTCCA 9690
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9294 GAGGGACTCACTGGTCTTCTTCAATCACCAATAAGAGGAGCTGAGAAACATGGTCTTCCA 9353
Query 9691 GGCGTTATCTCAGGAGTGGCCATGGGGATTACTGGACTTGTGGCCAGACCAACCGCTAGT 9750
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 9354 GGCGTCATCTCAGGAGTGGCCATGGGGATTACCGGACTTGTGGCCAGACCAACGGCTAGT 9413
Query 9751 ATCCTTGAGGTAACTGGAAAAACCGCACAGAGTATAAGAAACCGAAGCAGGATTCATAAC 9810
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9414 ATCCTTGAGGTAACTGGAAAAACTGCACAGAGTATCAGAAACCGAAGCAGGATTCATAAC 9473
Query 9811 ATAAGATCCCAAAGGCATAGGCTTCGTCTTCCGAGGCCTCTGAGTAGAGAACAACCTCTC 9870
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9474 ATAAGATCCCAAAGGCATAGGCTTCGTCTTCCCAGGCCTCTGAGTAGAGAACAACCTCTC 9533
Query 9871 AGGCCTTACTCATGGGAAGAAGCGGTCGGGACAGCAGTACTTATGGAGGTTGGAGATTCC 9930
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9534 AGGCCTTACTCATGGGAAGAAGCAGTCGGGACAGCAGTACTTATGGAGGTTGGAGATTCC 9593
Query 9931 CTGAAGTTCAAGGGCGAGAAGCTGGTGAAGTGCAAAGCCCTGAAACAAGAAGGAGCTTTC 9990
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 9594 CTGAAGTTCAAGGGCGAGAAGCTGGTGAAGTGCAAAGCCCTGAAGCAAGAAGGAGCTTTC 9653
Query 9991 GTTGTAATCACAGGGAGACTGGTATTGGTTCTAAGCAGCCTGAGCTTGGTAGATTTCAGA 10050
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 9654 GTTGTAATCACAGGGAGACTGGTATTGGTTTTAAGCAGCCCCAGCTTGGTAGATTTCAGA 9713
Query 10051 AAACAGGGATTTCTCGGAGTTCCAATAGATTTGGTATGGAATATCGAAAGAGAAATCGGT 10110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9714 AAACAGGGATTTCTCGGAGTTCCAATAGATTTGGTATGGAATATCGAAAGAGAAATCGGT 9773
Query 10111 TTGGAGAGTGTAATACATACAGATTGCAGCGGTGGAGTAGTCCGCATCATAGGAAGCAAT 10170
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 9774 TTGGAGAGTGTAATACATACAGATTGCAGCGGCGGAGTTGTCCGCATCATAGGAAGCAAT 9833
Query 10171 TCAGATGGTGTATGGAACTGGAGACAGGACCAGCAAAAGAAGAGCAGCCCGACCAAAAAA 10230
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 9834 TCAGATGGTGTATGGAACTGGAGACAGGACCAGCAAAAGAAGAGCAGCCCAACCAAAAAA 9893
Query 10231 CGATGGAACAATCCTTCAGCACAGCCGCTTCTTCAGACTAACTTAGAGTTTCCATCGGAG 10290
|||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 9894 CGATGGAACAATTCTTCAGCTCAACCGCTGCTTCAGACAAACTTAGAGCTTCCATCGGAG 9953
Query 10291 GAAGAAGCAGAGGACTTGTTGAGTGTGTTGTTATCGACTATTGAAACTGGGAAAAGCCGG 10350
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9954 GAAGAAGCAGAGGACTTGTTGAGTGTGTTGCTATCGACTATTGAAACTGGGAAAAGCCGG 10013
Query 10351 AGCTGGCACAGTCGATTTGTTTTAAGTCGAAGTAACATCACTTAAACC 10398
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||
Sbjct 10014 AGCTGGCACAGTCGATTTGTTTTAAGTCGAAGTAACATTAGTTGAACC 10061
Score = 556 bits (301), Expect = 9e-157
Identities = 394/438 (90%), Gaps = 9/438 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCTTGAAGG-ATATGTGCAAGGATTTG-TGAACCTGTTGTTAGGGTACTTAGGTCGTT 58
||| ||||||| || |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 24 ATGTTTGAAGGAAT-TGTGCAAGGAGTTGTTCAA-CTGTTGTTAGGGTACTTAGGTCGCT 81
Query 59 ACATTAAAGACATCCAGAAAGACCAGCTCAAGATCTCACTCTGGAATGGAGAAGTCTTAT 118
|||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 82 ACATCAAAGACATTAAAAAAGACCAGCTCAAGATCACACTCTGGAATGGGGAAGTCTTGT 141
Query 119 TGGAGAACGTGGAATTGAATCCTGAGGCGTTTGAGTATTTGCAGCTTCCAATTGCTCTCA 178
|||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 TGGAGAACGTGGAACTGATTCTTGAGGCGTTTGAGTATTTGCAGCTTCCAATTGCTCTCA 201
Query 179 AGCAAGGCCGTGTTGGGAAATTGAGCATTAAAATTCCATGGAAGAAACTTCATAGGGATC 238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 202 AGCAAGGCCGTGTTGGGAAATTGAGCATTAAAATTCCATGGAAGAAACTTGGTAGGGATC 261
Query 239 CTGTAACCATTATGATTGAAGATGTCTTTATATGTGCATCGCAACGCAATGATCAAGAGT 298
|| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 262 CTATAATCATCATGCTTGAAGATGTCTTTATATGTGCATCACAACGGAATGATCAAGAGT 321
Query 299 GGAGTTCAGATGTCGTTGAGAAAAGAGAGTTTGCTGGTAAGAAAGCTAAACTTGCTTCTG 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||
Sbjct 322 GGAGTTCAGATGTCGTTGAGAAAAGAGAGTTTGCTGGTAAGCAAGCTAAGCTTGCTGCTG 381
Query 359 CAGAACTGGCAAAATTGTCCAGGCGTGTCTTCGACAATCCAG-GCGGAAATTCTTATATG 417
||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||| | ||| | |
Sbjct 382 CAGAACTAGCAAAATTGTCCAGGCGCGTC---GACAGTCCAGCGGGGAAGT-CTTTTTTC 437
Query 418 TCATATATTACTGCCAAG 435
|||| |||| ||||||||
Sbjct 438 TCATTTATTGCTGCCAAG 455
> Ahg925876 jgi|Araly1|925876|scaffold_201437.1
Length=1657
Score = 444 bits (240), Expect = 7e-123
Identities = 354/408 (87%), Gaps = 12/408 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2276 AGGTTGAAGCTACTCTGCCTATGTTCAATGTCCATTTCTCTCCGTCAATATTTAAAGGAG 2335
|||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 901 AGGTGGAAGCTACTCTGTCTGTGATCAATGTGCATTTCTCTCCGTCGATATTTGAAGGAA 960
Query 2336 TCATGTCTGTGATTGAATATCTTGATATTCAGGATCATGGA-ACTCGAAATCCTCCACCT 2394
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |
Sbjct 961 TCATGTCTGTGATTGAATGTCTTGATACTCAGGATCATGGAGA-TCGAAATGCTCCA-AT 1018
Query 2395 T--CCCCTGCTCCCATCTTTCACTTCACCATCAAAACCGACTTGGCATTTTTAAGGTTGC 2452
| |||| | ||||||||||| |||||| || | ||| |||||| | |||| |||||||
Sbjct 1019 TGACCCC-GTTCCCATCTTTCGTTTCACCGTCGATACCAACTTGGTACTTTTCAGGTTGC 1077
Query 2453 ACGTCAATCTCGAAAATAAAGGAGAAAATAGCACAGTGCTTGTTCTTTCTATACAGCAGC 2512
||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1078 ACGTCAACCTTGAAAATGAAGGAGAAAATAGCACAGTGCTTGTTCTTTCTATTCAACAGC 1137
Query 2513 TTGATCTCTGGTATTCACGTGCTATATTTGAAGAGTGGTCAGTCCGTGCGAAAACATTGG 2572
| |||||||||||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1138 TGGATCTCTGGTATTCACTTACCAAAGTTGAAGAGTGGTCGGTCCGTGTGAAAACATTGG 1197
Query 2573 AAATAACAGCTTGCTCCTCTAAAGATGCAGCTGACAGTCATATTTTATGTTCATCTGGAA 2632
|||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1198 AAATAAAAGCTTGCTCCTCTAAAGATGCAG---ACGGTCATATTTTGTGTTCATCTGGGA 1254
Query 2633 ATCTACTCAAATCGT-CT-TCCC-ATGGACATGGGATGGATGCTCATA 2677
||||||| ||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1255 ATCTACTGAAATCGTACTCTGCCTATGGACAGGGGATGGATGCTCATA 1302
Score = 278 bits (150), Expect = 8e-73
Identities = 178/191 (93%), Gaps = 3/191 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 5238 AGGAAACATGAGCATAAAAGTCCAGATAAGAGATGTGTCTCTTCTTATATCAGATGGAAA 5297
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 AGGAAACATGAGTACAAAAGTCCAGATAAGAGATGTGTCTCTTCTTATATCAGATGGAAG 1384
Query 5298 GTGGGGATGTAGCGGTATGCTTCTTGAAGTTCTTATGAGAAACTTTCTCCTGCAAGCTAA 5357
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1385 GTGGGGATGTAGCGGTCTGCTTCTTGAAGTTCTTATGAGAAACTTTCTGCTGCAAGCTAA 1444
Query 5358 TCTGGCCGaaaaaaaT-ATGGAGAGTTTGGTTTCATGTGATCTTGAAGTGAATTATAATA 5416
|||| ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1445 TCTGACCGCGAAGAAGGA-GGAGAGTTTGGTTTCATGTGATCTTGAAGTGAATTATAA-A 1502
Query 5417 ATATGCACAAG 5427
|||||||||||
Sbjct 1503 ATATGCACAAG 1513
Score = 147 bits (79), Expect = 2e-33
Identities = 122/142 (86%), Gaps = 5/142 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 298 TGGAGTTCAGATGTCGTTGAGAAAAGAGAGTTTGCTGGTAAGAAAGCTAAACTTGCTTCT 357
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 762 TGGATTTCAGATGTGGTTGAGAAAAGAGAGTTTGCTGGTAAGAAGGCTAAGCTTGCTGCT 821
Query 358 GCAGAACTGGCAAAATTGTCCAGGCGTGTCTTCGACAATCCAGGC-GGAAATTCTT--A- 413
|||||| |||||||||| ||||||||| |||| || | ||||| | || ||| ||| |
Sbjct 822 GCAGAATTGGCAAAATTATCCAGGCGTATCTTTGATAGTCCAG-CAGGGAATCCTTTTAG 880
Query 414 TATGTCATATATTACTGCCAAG 435
||||||||||||| | ||||||
Sbjct 881 TATGTCATATATTGCAGCCAAG 902
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 398843186589
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5