BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G35980.1
Length=3778
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg493647 jgi|Araly1|493647|fgenesh2_kg.7__3080__AT5G35980.1 5646 0.0
> Ahg493647 jgi|Araly1|493647|fgenesh2_kg.7__3080__AT5G35980.1
Length=3667
Score = 5646 bits (3057), Expect = 0.0
Identities = 3528/3740 (94%), Gaps = 93/3740 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 GGGAAGCAGAAGAAGAAAGAACAAAAATCAGGAGTTGGCATTTTGAAGACGAAACTCATC 61
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GGGAAGCAGAAGAAGAAAGAACAAAAATCAGGAGTTGGCATTTTGAAGACGAAACTCATC 60
Query 62 ATCATCTTCTTCCTCAG------ACAACaaaaaaaGCTTTTCACTTtctctccacccttc 115
||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 61 ATCTTCTTCTTCCTCAGACAACAACAACAAAAAAAGC--TTCACTTTCTCTCGACCCTTC 118
Query 116 tctctctcct-tctgaaagtctctctctTTGCCGTCGTTAGCCT--C--TTC-CTACACT 169
||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||
Sbjct 119 TCTCTCT-CTCTCTCAAAGTCTCTCTCTTTGCCGTCGTT-GCCTCGCAATCCTCTACACT 176
Query 170 TGGGGCTGCGATTCTTCCAATCCTCCGATTTCAATTTCATCCTCTCAATCATAGTTTGAA 229
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||
Sbjct 177 TGGGGCTGCGATTCTTCCAATCCTCCGATTTCAA-TT--T--T-GAAATCATAGTTTGAA 230
Query 230 ATCATCGAGCTTTTACGGTGCTGTTGGTGTTTGACGCCGTAAAATTCGATCCttttttat 289
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |
Sbjct 231 ATCATCGAGC-TTTACGCTGCTGTTGGTGTTTGACGCCATAAAAATCGA--------T-T 280
Query 290 acatttgatgttgattttatcgatagttttgtgagatcgattttttagggtttCGAGTTT 349
| | | || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 281 -C---T--T-TT--TTTTATCGATTGTTCTGTGAGATCGA--TTTTAGGGTTTCGAG-TT 328
Query 350 GGCGCTGACTTGAGGGTTTGATTGGATGAGAATAAG-GGGTTATGGGACTTGAGTCAATT 408
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 329 GGCGCTGACTTGA-GGTTTGATTGGATGAGAA-AAGAGGGGTATGGGACTTGAGTCAATT 386
Query 409 GGGTTTGTCTCCCTAATCATCGCAAATTCCTGATTTCTCAGCTCTTTGGAAGGAATTAGG 468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 387 GGGTTTGTCTCCCTAATCATCGCAAATTCCTGATTTCTGAGCTCTTTCGAAGGAATTAGG 446
Query 469 ATTCGTTGATTTCGAGTTTTGTGTTGTGTTGGTTGATGAGAGAGTTGGGTTTGGTCAATT 528
||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 ATTCGTTGATTTCGAGTTT-GTGTTG-GTTG----ATGAGAGAGTTGGGTTTGGTCAATT 500
Query 529 GAGGGGTTTAGGTGTTGTTTTACTGTTTTGATTCTGATCATGGATGACATTGATTCAAGC 588
|||| || || | | || ||| || ||| ||| || |||||
Sbjct 501 GAGG--TTC---TGATC----A-TG----GAT---GA-CAT---TGA--TT----CAAGC 533
Query 589 GATGGTGCTGCGGCTGCACGAGCTGGTGAGATTGGCTCTATTGGGGTATCCACACCGTGG 648
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 534 GATGGCGCTGCGGCACCACGAGCTGGTGAGATTGGCTCTATTGGGGTATCAACACCGTGG 593
Query 649 AAGCCAATTCAGCTGGTTTTTAAGCGTTATTTGCCACA-AAATGGGTCTGCTAGCAAAGT 707
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||
Sbjct 594 AAGCCAATTCAGCTGGTTTTTAAGCGTTATTTGCCACAGAAA-GGTTCCGATAGCAAAGT 652
Query 708 TCATGTTGCCGTGAAGAAGCCGGTGGTGGTGAGACTAACTAGGGACTTGGTTGAGACGTA 767
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 TCGTGTTGCGGTGAAGAAGCCGGTGGTGGTGAGACTAACTAGGGACTTGGTTGAGACGTA 712
Query 768 CAAAATATGTGACCCACAGTTCAAATATAGAGGAGAGTTGAATCCCAAGCGGTACTTGAC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 713 CAAAATATGTGACCCACAGTTCAAATATAGAGGAGAGTTGAATCCCAAGCGATACTTAAC 772
Query 828 TACTCCATCAGTTGGTGTGAACAATGATGGCTTTGATAATGTCAACTACGATCTAATTCT 887
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 773 TACTCCATCAGTTGGTGTGCACAATGACGGCTTTGATAATGTCAACTTCGATCTAATTCT 832
Query 888 GGCTGTAAATGATGATTTTTGCAGTTCAGATTCACGGCAGAGATACATTGTCAAAGATCT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 GGCTGTAAATGATGATTTTTGCAGTTCAGATTCACGGCAGAGATACATTGTCAAAGATCT 892
Query 948 TCTTGGCCATGGGACTTTTGGTCAGGTTGCTAAATGCTGGGTTCCTGAGACAAACAGCTT 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 TCTTGGCCATGGGACTTTTGGTCAGGTTGCTAAATGCTGGGTTCCTGAGACAAACAGCTT 952
Query 1008 TGTTGCTGTAAAAGTAATAAAAAACCAGCTTGCATACTATCAGCAGGCATTGGTTGAAGT 1067
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 953 TGTTGCTGTAAAAGTAATTAAAAACCAGCTTGCATACTATCAGCAGGCACTGGTTGAAGT 1012
Query 1068 ATCTATTTTGACAACGCTAAACAAGAAGTATGATCCTGAGGATAAGAACCATATCGTTCG 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 ATCTATTTTGACAACGCTAAACAAGAAGTATGATCCTGAGGATAAGAACCATATCGTTCG 1072
Query 1128 CATATACGACTACTTCTTACATCAAAGTCATTTGTGCATATGCTTTGAACTTCTAGACAT 1187
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1073 CATATACGACTACTTCTTATATCATGGTCATTTGTGCATATGCTTTGAACTTCTCGACAT 1132
Query 1188 GAATCTGTATGAGCTCATAAAGATAAATCAATTCAGAGGCCTATCATTAAGCATAGTCAA 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 GAATCTGTATGAGCTCATAAAGATAAATCAATTTAGAGGCCTATCATTAAGCATAGTCAA 1192
Query 1248 GCTCTTCTCTAAGCAGATCTTACTTGGTTTGGCTCTTTTGAAAGATGCTGGCATAATCCA 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1193 GCTCTTCTCTAAGCAGATCTTACTTGGTTTGGCTCTTTTGAAAGATGCTGGTATAATTCA 1252
Query 1308 TTGTGATCTGAAGCCAGAGAATATTCTTCTGTGCGCCAGTGTGAAGCCAACTGAAATTAA 1367
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1253 TTGTGATCTGAAGCCTGAGAATATTCTTCTGTGTGCCAGTGCGAAGCCAACTGAAATTAA 1312
Query 1368 GATAATTGACTTTGGATCAGCGTGCATGGAAGATAAAACTGTTTATTCATATATTCAGAG 1427
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GATAATTGACTTTGGATCAGCGTGTACAGAAGATAAAACTGTTTATTCATATATTCAGAG 1372
Query 1428 TCGTTACTACAGATCGCCGGAAGTCTTACTTGGTTACCAATACACTACAGCTATTGACAT 1487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 TCGTTACTACAGATCGCCGGAAGTCTTACTTGGTTACCAATACACTACAGCTATTGACAT 1432
Query 1488 GTGGTCTTTTGGCTGCATTGTTGCCGAGCTGTTTCTTGGATTGCCACTATTTCCAGGAGG 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 GTGGTCTTTTGGCTGCATTGTTGCCGAGCTGTTTCTTGGATTGCCACTATTTCCAGGAGG 1492
Query 1548 TTCAGAATTTGATATCTTGAGGCGTATGATTGAAATACTAGGCAAACAACCACCTGATTA 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 TTCAGAATTTGATATCTTGAGGCGTATGATTGAAATACTAGGCAAACAACCACCTGATTA 1552
Query 1608 TGTGCTCAAGGAAGCAAAAAATACGAATAAGTTCTTTAAATGTGTTGGGAGTGTCCACAA 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 TGTGCTCAAGGAAGCAAAAAATACGAATAAGTTCTTTAAATGTGTTGGGAGTGTCCACAA 1612
Query 1668 TTTAGGGAATGGTGGAACTTATGGTGGCCTCAAAAGTGCTTATATGGCTTTGACTGGAGA 1727
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1613 TTTAGGGAATGGTGGAACTTATGGTGGCTTCAAAAGTGCTTATATGGCACTGACTGAAGA 1672
Query 1728 AGAGTTTGAAGCTAGAGAAAAGAAAAAGCCAGAAATTGGGAAAGAGTACTTCAACCATAA 1787
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 AGAGTTTGAAGCCAGAGAAAAGAAAAAACCAGAAATTGGGAAAGAGTACTTCAACCATAA 1732
Query 1788 GAACCTTGAAGAAATTGTTAAAAGCTATCCGTACAAGATAAATCTACCTGAGGACGATGT 1847
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1733 GAACCTTGAAGAAATTGTTAAAGGCTATCCTTACAAGATAAATTTGCCTGAGGACGATGT 1792
Query 1848 AGTCAAAGAAACTCAAATCCGGTTAGCTCTTATTGATTTTCTGAAAGGACTTATGGAATT 1907
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||
Sbjct 1793 AGTCAAAGAAACTCAAATCCGGTTAGCTCTTATTGATTTTCTGAGAGGACTTGTTGAATT 1852
Query 1908 TGATCCAGCAAAACGTTGGTCACCTTTTCAGGCAGCAAAGCACCCTTTCATTACTGGAGA 1967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1853 TGATCCAGCAAAACGTTGGTCACCTTTTCAGGCAGCCAAGCACCCTTTCATTACTGGGGA 1912
Query 1968 ACCTTTTACGTGCCCATACAACCCTCCGCCAGAAACACCTCGTGTGCATGTTACCCAAAA 2027
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 ACCTTTTACCTGCCCATACAACCCTGCGCCAGAAACTCCTCGTGTGCATGTTACCCAAAA 1972
Query 2028 CATCAAAGTTGACCATCATCCAGGTGAAGGGCACTGGTTTGCCGCTGGTCTCTCTCCTCA 2087
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1973 CATCAAAGTGGACCATCATCCAGGTGGAGGGCACTGGTTTGCTGCTGGTCTCTCTCCTAA 2032
Query 2088 TGTATCAGGGAGAACCAGAATCCCGATGCACAATAGTCCCCATTTTCAGATGATGCCTTA 2147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2033 TGTATCAGGGAGAACCAGAATCCCGATGCACAATAGTCCCCATTTTCAGATGATACCTTA 2092
Query 2148 TTCACATGCAAATAGTTATGGGAGCATTGGAAGCTATGGTAGCTACAATGATGGTACTAT 2207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2093 CTCACATGCAAATAGTTATGGGAGCATTGGAAGCTATGGTAGCTACAATGATGGTAATAT 2152
Query 2208 ACAGGACAA-TAGCTATGGGAGCTATGGAGGGACTGGCAATATGTTTGCATACTATTCTC 2266
|||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2153 ACAGGA-AAGTAGTTATGGAAGCTATGGAGGGACTGGCAATATGTTTGCATACTACTCTC 2211
Query 2267 CTGTGAATCATCCAGGCCTATACATGCAAAACCA-AGGTGGGGTCTCAATGCTTGGAACT 2325
||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 CTGTGAATCATCCGGGCCTATACATGCAAAACAACAG-TGGGGTCTCAATGCTTGGAACT 2270
Query 2326 AGTCCTGATGCCAGACGTCGGGTTATGCAGTACCCACATGGAAATGGGCCAAATGGCCTT 2385
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2271 AGCCCTGATGCCAGACGTCGGGTTATGCAGTACCAACATGGATATGGGCCAAATGGCCTT 2330
Query 2386 GGTACAAGTCCATCTGCTGGAAATTTTGCACCACTACCCCTTGGCACTAGTCCGTCACAA 2445
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2331 GGTACAAGTCCATCTGCTGGAAATTTTGCACCACTACCCCTTGGCACTAGTCCGTCGCAA 2390
Query 2446 TTTACTCCAAATACAAACAATCAATTTTTAGCTGGGTCTCCTGGACACCATGGCCCGACA 2505
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TTTACTCCGAATACAAACAATCAATTTTTAGCTGGGTCTCCTGGACACCATGGCCCGACA 2450
Query 2506 TCTCCAGTAAGAAACAGCTGCCATGGGTCTCCTTTGGGAAAGATGGCTGCATTTAGTCAA 2565
||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 TCTCCGGTAAGAAACAGCAGTCATGGATCTCCTCTAGGAAAGATGGCTGCATTTAGTCAA 2510
Query 2566 ATTAATAGAAGAATGAGCGCTGGATATTCTGGAGGTTCTCAGTCGCAAGATTCTTCCTTG 2625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2511 ATTAATAGAAGAATGAGCGCTGGATATTCTGGAGGTTCTCAGTCGCAAGATCCTTCCTTG 2570
Query 2626 TCACAAGCCCAAGGGCATGGGATGGATAACTTTTATCAAAATGAGGGGTATTCTGGACAA 2685
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2571 TCACAAGCGCAAGGGCATGGGATGGATAATTTTTATCAAAATGAGGGATATTCTGGACAA 2630
Query 2686 TTCTCTGGTTCACCTTCACGCCGGCAACTGGATTCTGGTGTCAAAAATCGTAAACAGACA 2745
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2631 TTCTCTGGTTCACCTTCACGCCGGCAATTGGATTCTTGTGGCAAAAATCGTAAACAGACA 2690
Query 2746 CAAGGAGGCACTACATTAAGTACTGGGTACTCTACTCATAACAATGCCAACTCATCACTT 2805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2691 CAAGGAGGCACTACATTAAGTACTGGGTACTCTACTCATAACAATTCCAACTCATCACTT 2750
Query 2806 CGGTCCAATATGTATAACCCTTCCAGTACTGCACACCATCTTGAAAATCCGGATACTGCC 2865
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 CGGTCCAATATGTCTAACCCTTCCAGTACTGCACACCATCTTGAAAATCCGGATACTGCC 2810
Query 2866 TTATCAGTACCTGATCCAGGAGACTGGGACCCAAATTACAGTGATGACTTGCTTCTAGAA 2925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 TTATCAGTACCTGATCCAGGAGACTGGGACCCAAATTACAGTGATGACTTGCTTCTAGAA 2870
Query 2926 GAAGATAGTGCAGATGAGAGTTCTCTTGCTAATGCATTCAGCAGAGGTATGCAACTTGGT 2985
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 GAAGATAGTGCGGATGAGAGTTCTCTTGCTAATGCATTCAGCAGAGGTATGCAACTTGGT 2930
Query 2986 TCAACAGATGCCTCCAGTTATTCCAGAAGGTTCAACAGTAATGCCTCGACCTCATCCTCA 3045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 TCAACAGATGCCTCCAGTTATTCCAGAAGGTTCAACAGTAATGCCTCGACCTCATCCTCA 2990
Query 3046 AATCCGACTACCCAAAGGAGATATGCTCCCAATCAAGCCTTTTCACAAGTAGAGACTGGC 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2991 AATCCGACTACCCAAAGGAGATATGCTCCCAATCAAGGCTATTCACAAGTAGAGACTGGC 3050
Query 3106 AGCCCTCCAAGTAATGATCCTCATGCCAGATTTGGCCAACATATACCAGGATCACAATAT 3165
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3051 AGCCCTCCAAGTAATGATCCTCATGCCAGATTTGGCCAACATATACCAGGATCACAATTT 3110
Query 3166 ATTCCTCATGTCTCCCAGAACTCTCCAAGTCGCTTAGGGCAGCAACCTCCTCAACGGTAT 3225
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3111 ATTCCTCACGTCTCCCAGAACTCTCCAAGTCGCTTAGGGCAGCAACCTCCTCAACGGT-T 3169
Query 3226 -AATCATGGGAGACCAAATGCTGGAAGAACTATGGATCGGAATCACATGAACGCTCAGCT 3284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3170 CAATCATGGGAGACCAAATGCTGGAAGAACTATGGATCGGAATCACATCAACGCTCAGCT 3229
Query 3285 TCCTCCTTCCAATACAAATTCTGGGGGTCAACAACGTTCACCCAGAAGTAGCTCATATAC 3344
||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3230 TCCCCCTTCCAACACGAATTCTGGGGGTCAACAACGCTCACCCAGAAGTAGCTCATATAC 3289
Query 3345 AAATGGTGTCCCTTGGGGTCGTAGGACTAACAATCATGTCCCGAATGTTCCATCGACGTC 3404
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 CAATGGTGTCCCTTGGGGACGTAGGACTAACAATCATGTCCCGAATGTTCCATCGACGTC 3349
Query 3405 CCATGGAAGGGTAGACTACGGAAGTATTGCTTAATTCTGCA-GTCTT-TCTTCTCATTTA 3462
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||
Sbjct 3350 CCATGGAAAGGTAGACTACGGAAGTATTGCTTAATTCC-CAAGTTTTATCT-CTCATTTA 3407
Query 3463 TTTTGTTCTTTCCCTTGGTGTGCAATCTTCTTGTTAGAAGTGTGGGAACAAAGTTGTACT 3522
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 TTTTGTTCTTTCCCTTGGTGTGCAATCTTCTTGTTGGAAGTGTGGGAACAAAGTTGTACT 3467
Query 3523 GAGACAAGAAACAAACTTAGTTCATGGCTTGTGGGCTTCTGATCAGAACGTGCTTATTCA 3582
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3468 GAGACAAAAAACAAACTTAGTTCATGGCTTGTGGGCTTCTGATCAGAACGTGCTTATTCA 3527
Query 3583 TTGTGCTTTTTGCACAAATAAAC-aaaaaaaaaaaGTATGTTATAATTGATATTGTTATC 3641
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3528 TTGTGCTTTTTGCACAAATAAACCAAAAAAAAAAAGTATGTTATCATTGATATTGTTATC 3587
Query 3642 TTTCTGGCATCTATCTCTCTGAATTTCTTTTTGGTATTCTCTGATGAATGTATCTTTTGG 3701
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3588 TTTCTGGCATCTATCTCTCGGAATTTCTTATTGGTATTCTCTGTTGAATGTATCTTTTGG 3647
Query 3702 GAAAGTTGTTCAAGTGTTTA 3721
||||||||| |||||||||
Sbjct 3648 CAAAGTTGTTGAAGTGTTTA 3667
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 142753956323
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5