BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G37510.2
Length=2527
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg947400 jgi|Araly1|947400|scaffold_703629.1 3698 0.0
Ahg912745 jgi|Araly1|912745|Al_scaffold_0001_2999 2837 0.0
> Ahg947400 jgi|Araly1|947400|scaffold_703629.1
Length=2466
Score = 3698 bits (2002), Expect = 0.0
Identities = 2170/2253 (96%), Gaps = 4/2253 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 61 CGATACAGATCCACAACGCCATGGGTTTAGGCATCTTAGCTTCTCGAACAATTCGACCAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGATACAGATCCACAACGCCATGGGTTTAGGCATCTTAGCTTCTCGAACAATTCGACCAG 60
Query 121 CTTCACGTCTTCTTCAATCTCA-AACCTCCAATTTCTTCCTCCGCACAATCGTCTCAAAA 179
|||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 61 CTTCTCGTCTTCTTCAATCACACAA-CTCCAATTTCTTCCTCCGCACCATCGTCTCCAAA 119
Query 180 CCAGAGCTCCAATCTCCTGAATCCGCTGCTGTCTCTGAGCCTGAGCCGCCGACACAGATT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 120 CCAGAGCTCCAATCTCCTGAATCCGCTGCTGTCTCTGAGCCTGAGCCACCGACACAGATT 179
Query 240 CTCCCTCCTAGAAACCCTGTAGGTGGAGCACGCGTCCACTTCTCGAATCCTGAAGATGCG 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 180 CTCCCTCCTAGAAACCCTGTAGGTGGAGCACGCGTCCATTTCTCGAATCCTGAAGATGCG 239
Query 300 ATCGAGGTCTTT-GTCGATGGTTACGCGGTCAAAGTCCCTAAAGGATTCACTGTTCTTCA 358
|||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 ATCGAGGT-TTTCGTTGATGGTTACGCGGTCAAAGTTCCTAAAGGATTCACTGTTCTTCA 298
Query 359 GGCTTGTGAGGTCGCTGGAGTTGATATCCCGAGGTTTTGTTATCATTCTCGTTTATCTAT 418
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 299 GGCTTGTGAGGTCGCTGGAGTTGATATTCCAAGGTTTTGTTATCATTCTCGTTTGTCTAT 358
Query 419 TGCTGGAAATTGCAGGATGTGTCTTGTTGAGGTTGAGAAATCTCCTAAGCCTGTAGCTTC 478
|||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 359 TGCTGGAAATTGTAGGATGTGTCTTGTTGAAGTCGAGAAATCTCCTAAGCCTGTAGCGTC 418
Query 479 ATGTGCCATGCCTGCGCTTCCTGGGATGAAGATTAAGACTGATACACCGATAGCTAAGAA 538
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 419 TTGTGCCATGCCTGCACTTCCAGGGATGAAGATTAAGACTGACACACCGATAGCGAAGAA 478
Query 539 GGCGAGGGAGGGAGTGATGGAGTTTTTGTTGATGAATCACCCTTTGGATTGTCCTATTTG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 479 GGCGAGGGAGGGAGTGATGGAGTTTTTGTTGATGAATCATCCTTTAGATTGCCCTATTTG 538
Query 599 TGACCAAGGAGGAGAGTGTGATCTTCAGGATCAGTCTATGGCTTTTGGATCTGATAGAGG 658
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 539 TGATCAAGGAGGAGAGTGTGATCTTCAGGATCAGTCTATGGCTTTTGGATCTGACAGAGG 598
Query 659 ACGTTTTACTGAGATGAAAAGATCTGTTGTTGATAAGAATCTTGGTCCTCTTGTGAAGAC 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TCGTTTTACTGAGATGAAAAGATCTGTTGTTGATAAGAACCTTGGTCCTCTTGTGAAGAC 658
Query 719 TGTTATGACTCGGTGTATCCAGTGTACAAGGTGTGTACGATTTGCTTCTGAAGTTGCTGG 778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 659 TGTTATGACTCGGTGTATCCAGTGTACAAGGTGTGTACGATTTGCTTCAGAAGTTGCTGG 718
Query 779 GGTTCAGGATCTTGGTATACTAGGTCGTGGTAGTGGAGAGGAAATTGGAACTTATGTTGA 838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 719 AGTTCAGGATCTTGGTATACTAGGTCGTGGTAGTGGAGAAGAAATTGGAACTTATGTTGA 778
Query 839 AAAGCTTATGACCAGTGAACTCTCTGGAAATGTTATTGATATCTGTCCTGTTGGAGCCTT 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AAAGCTTATGACCAGTGAACTCTCTGGAAATGTTATAGACATCTGTCCTGTTGGAGCCTT 838
Query 899 GACCTCAAAGCCTTTTGCCTTTAAAGCCAGAAACTGGGAGTTGAAAGCAACAGAAACTAT 958
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 839 GACCTCAAAGCCCTTTGCCTTTAAAGCGAGAAACTGGGAGTTGAAAGCAACAGAAACCAT 898
Query 959 TGATGTTAGTGATGCTGTTGGGTCCAACATCCGTGTTGATAGTAGAGGACCAGAAGTAAT 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 899 TGATGTTAGTGATGCTGTTGGGTCCAACATCCGCGTTGATAGTAGAGGACCAGAAGTGAT 958
Query 1019 GCGTATCATTCCACGCCTGAATGAGGATATAAACGAAGAATGGATATCTGACAAAACCCG 1078
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCGTATCATTCCACGCCTTAATGAGGATATAAACGAAGAATGGATATCTGACAAAACCCG 1018
Query 1079 ATTCTGTTATGACGGCCTGAAAAGACAAAGGCTGAGCGACCCTATGATCCGAGATTCCGA 1138
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1019 ATTCTGTTATGACGGTTTGAAAAGACAAAGGTTGAGCGACCCTATGATCAGAGATTCCGA 1078
Query 1139 TGGACGATTCAAGGCAGTGAGCTGGCGTGATGCCTTGGCTGTTGTGGGTGATATCATTCA 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TGGACGATTCAAGGCAGTGAGCTGGCGTGATGCCTTGGCTGTTGTGGGTGATATCATTCA 1138
Query 1199 TCAGGTGAAGCCAGATGAGATTGTTGGAGTAGCAGGTCAGCTATCTGATGCGGAATCCAT 1258
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 TCAGGTGAAACCAGATGAGATTGTTGGCGTAGCAGGTCAGCTATCTGATGCGGAATCCAT 1198
Query 1259 GATGGTACTGAAGGACTTCGTTAACAGAATGGGCTCAGACAATGTATGGTGTGAAGGAAC 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1199 GATGGTACTGAAGGACTTCGTTAACAGAATGGGTTCAGACAATGTCTGGTGTGAAGGAAC 1258
Query 1319 AGCTGCTGGTGTTGATGCTGATCTTAGATACAGTTATCTGATGAACACTAGCATCAGTGG 1378
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1259 AGCTGCTGGTGTTGATGCTGATCTTAGGTATAGTTATCTGATGAACACTAGTATCAGTGG 1318
Query 1379 ACTTGAAAACGCCGATCTCTTCCTTCTCATCGGTACCCAGCCTAGGGTGGAAGCTGCAAT 1438
|||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1319 ACTTGAGAACGCCGATCTCTTCCTTCTAATTGGTACCCAGCCTAGGGTTGAAGCTGCAAT 1378
Query 1439 GGTGAATGCTAGGATCTGCAAGACAGTCCGTGCATCAAATGCCAAGGTTGGATATGTTGG 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 GGTGAATGCTAGGATCTGCAAGACAGTCCGTGCATCAAATGCCAAGGTTGGATATGTTGG 1438
Query 1499 TCCACCTGCAGAGTTCAATTACGACTGCAAACACCTCGGGACTGGGCCTGATACTCTCAA 1558
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1439 TCCACCTGCAGAGTTCAACTACGACTGCAAACACCTCGGGACTGGGCCTGATACCCTCAA 1498
Query 1559 GGAAATTGCTGAGGGACGGCATCCATTCTGTACGGCTCTCAAGAACGCCAAAAACCCTGC 1618
|||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GGAAATCGCTGAGGGACGACACCCATTCTGTGCGGCTCTCAAGAACGCCAAAAACCCTGC 1558
Query 1619 AATCATTGTTGGTGCTGGGCTCTTCAACAGAACTGATAAAAATGCTATCCTCTCTTCTGT 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 AATCATTGTTGGTGCTGGGCTCTTCAACAGAACTGATAAAAATGCTATCCTCTCTTCTGT 1618
Query 1679 GGAGTCCATTGCACAAGCCAACAATGTTGTCCGACCAGACTGGAACGGTCTCAACTTTCT 1738
||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 GGAATCCATCGCACAAGCCAACAATGTCGTCCGACCAGACTGGAACGGTCTCAACTTTCT 1678
Query 1739 CCTTCAGTATGCTGCCCAAGCGGCTGCTCTTGATCTTGGTCTCATTCAACAGTCCGCCAA 1798
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 CCTTCAGTATGCTGCTCAAGCGGCTGCTCTTGATCTCGGTCTCATTCAACAGTCCGCCAA 1738
Query 1799 AGCCCTCGAGTCTGCAAAATTCGTCTACTTGATGGGAGCAGACGATGTAAATGTTGACAA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1739 AGCCCTCGAGTCTGCAAAATTCGTCTACTTGATGGGAGCAGACGATGTAGATGTTGAGAA 1798
Query 1859 GATTCCTAAAGACGCCTTTGTGGTTTACCAAGGACACCATGGAGACAAAGCGGTTTACCG 1918
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GATTCCTAAAGACGCCTTCGTGGTTTACCAAGGACACCATGGAGACAAAGCGGTTTACCG 1858
Query 1919 TGCAAACGTAATTCTCCCTGCATCGGCCTTCACTGAGAAAGAAGGAACCTATGAAAATAC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 TGCAAACGTAATTCTCCCTGCATCGGCCTTCACCGAGAAAGAAGGAACCTATGAAAATAC 1918
Query 1979 TGAAGGATTTACCCAACAGACTGTTCCAGCTGTTCCAACAGTTGGTGATGCAAGAGATGA 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TGAAGGATTTACCCAACAGACTGTTCCAGCTGTTCCAACAGTTGGTGATGCAAGAGATGA 1978
Query 2039 CTGGAAGATTGTGAGAGCCTTATCCGAGGTCTCGGGTGTGAAGCTTCCATACAACTCAAT 2098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TTGGAAGATTGTGAGAGCCTTATCCGAGGTCTCGGGTGTGAAGCTTCCATACAACTCAAT 2038
Query 2099 CGAAGGTGTTAGATCAAGAATAAAGAGCGTTGCACCAAATCTAGTCCACACAGATGAGCG 2158
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2039 CGAAGGTGTTAGATCAAGAATCAAGAGTGTTGCACCAAATCTAGTCCACACAGATGAACG 2098
Query 2159 AGAGCCAGCTGCTTTTGGGCCTTCATTGAAGCCTGAGTGCAAGGAGGCAATGAGCACAAC 2218
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2099 AGAGCCAGCTGCTTTTGGGCCTTCATTGAAACCCGAGTGCAAGGAGACAATGAGCGCAAC 2158
Query 2219 ACCGTTCCAAACCGTGGTTGAGAACTTTTACATGACAAACTCGATCACAAGAGCATCAAA 2278
||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 ACCATTCCAACCCGTGGTTGAGAATTTTTACATGACAAACTCGATCACAAGAGCATCAAA 2218
Query 2279 GATCATGGCGCAGTGCAGTGCCGTGCTCTTGAA 2311
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 GATCATGGCGCAGTGCAGTGCCGTGCTCTTGAA 2251
Score = 211 bits (114), Expect = 2e-53
Identities = 119/121 (98%), Gaps = 1/121 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2315 ACCTTTTGTTTAAGCCTGAGTATCACTGTATCTCGGGTTTAGCTTGCGGTGAAATCTATA 2374
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347 ACCTTTTGTGTAAGCC-GAGTATCACTGTATCTCGGGTTTAGCTTGCGGTGAAATCTATA 2405
Query 2375 AGCAATTTGCAATAAGCACATTGTTAGATTCAAAACTTTGCAGTGTTAATTGGATGCTTT 2434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2406 AGCAATTTGCAATAAGCACATTGTTAGATTCAAAACTTTGCAGTGTTAATTGGATGCTTT 2465
Query 2435 G 2435
|
Sbjct 2466 G 2466
> Ahg912745 jgi|Araly1|912745|Al_scaffold_0001_2999
Length=2235
Score = 2837 bits (1536), Expect = 0.0
Identities = 2009/2236 (90%), Gaps = 37/2236 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 81 ATGGGTTTAGGCATCTTAGCTTCTCGAACAATTCGACCAGCTTCACGTCTTCTTCAATC- 139
||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGGATTAAGCAGCTTAGCTTCTAGAACAATTCGACCAGTTTCTCGTCTTCTTC-ATCA 59
Query 140 TCA-AACCTCCAATTTCTTCCTCCGCACAATCGTCTCAAAACCAGAGCTCCAATCTCCTG 198
|| || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 60 CCAGAA-CACTAGTTTCTTCCTCCGCACAATCGTCTCAAAACCAGAGCTTCAATCTCCGG 118
Query 199 AATCCGCTGCTGTCTCTGAGCCTGAGCCGCCGACACAGATTCTCCCTCCTA-GAAACCCT 257
|| |||| ||||| ||| || |||||||| || | | |||||| ||||||| |||| |||
Sbjct 119 AAACCGCCGCTGTATCTCAGTCTGAGCCGACG-C-C-GATTCTTCCTCCTAGGAAA-CCT 174
Query 258 GTAGGTGGAGCACGCGTCCACTTCTCGAATCCTGAAGATGCGATCGAGGTCTTTGTCGAT 317
|| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||
Sbjct 175 GTTGGTGGGGCACGTGTCCATTTCTCAAATCCTGATGAGGCGATTGAGGTGTTCGTTGAT 234
Query 318 -GGTTACGCGGTCAAAGTCCCTAAA-GGATTCACTGTTCTTCAGGCTTGTGAGGTCGCTG 375
|||| |||||| ||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 235 GGGTT-CGCGGTGAAAATCCC-AAAGGGTTTCACGGTTCTTCAGGCGTGTGAGGTCGCCG 292
Query 376 GAGTTGATATCCCGAGGTTTTGTTATCATTCTCGTTTATCTATTGCTGGAAATTG-CAGG 434
|||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || | ||
Sbjct 293 GAGTTGATATTCCGAGGTTTTGTTATCATTCACGGTTGTCTATTGCTGGAAACTGTC-GG 351
Query 435 ATGTGTCTTGTTGAGGTTGAGAAATCTCCTAAGCCTGTAGCTTCATGTGCCATGCCTGCG 494
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 352 ATGTGTCTTGTTGAGGTTGAGAAGTCTCCTAAACCTGTGGCTTCGTGTGCCATGCCTGCA 411
Query 495 CTTCCTGGGATGAAGATTAAGACTGATACACCGATAGCTAAGAAGGCGAGGGAGGGAGTG 554
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 412 CTTCCTGGGATGAAGATTAAGACTGACACACCAATAGCAAAGAAAGCGAGGGAGGGAGTG 471
Query 555 ATGGAGTTTTTGTTGATGAATCACCCTTTGGATTGTCCTATTTGTGACCAAGGAGGAGAG 614
||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 472 ATGGAATTTCTGTTGATGAACCATCCTTTGGATTGCCCAATATGTGACCAAGGAGGAGAA 531
Query 615 TGTGATCTTCAGGATCAGTCTATGGCTTTTGGATCTGATAGAGGACGTTTTACTGAGATG 674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 532 TGTGATCTTCAGGATCAGTCTATGGCTTTTGGATCTGACAGAGGCCGTTTCACTGAGATG 591
Query 675 AAAAGATCTGTTGTTGATAAGAATCTTGGTCCTCTTGTGAAGACTGTTATGACTCGGTGT 734
||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 592 AAAAGATCTGTCGTTGATAAAAATCTCGGTCCTCTTGTGAAGACCGTTATGACTCGGTGT 651
Query 735 ATCCAGTGTACAAGGTGTGTACGATTTGCTTCTGAAGTTGCTGGGGTTCAGGATCTTGGT 794
|| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 ATACAATGTACAAGGTGTGTACGATTTGCCACAGAAGTTGCTGGGGTTCAGGATCTTGGC 711
Query 795 ATACTAGGTCGTGGTAGTGGAGAGGAAATTGGAACTTATGTTGA-AAAGCTTATGACCAG 853
|| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||
Sbjct 712 ATTCTTGGTCGTGGTAGTGGAGAAGAAATCGGAACTTATGTCGAGAAA-CTTATGACCAG 770
Query 854 TGAACTCTCTGGAAATGTTATTGATATCTGTCCTGTTGGAGCCT-TGACCTCAAAGCCTT 912
|||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| || |||| |||||||| |
Sbjct 771 TGAACTCTCTGGAAATGTCATAGACATCTGTCCTGTGGGAG-CTCTGACGTCAAAGCCCT 829
Query 913 TTGCCTTTAAAGCCAGAAACTGGGAGTTGAAAGCAACAGAAACTATTGATGTTAGTGATG 972
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 830 TTGCCTTCAAAGCCAGAAACTGGGAGTTGAAAGGAACAGAAACCATTGATGTTACTGATG 889
Query 973 CTGTTGGGTCCAACATCCGTGTTGATAGTAGAGGACCAGAAGTAATGCGTATCATTCCAC 1032
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 890 CTGTTGGGTCCAACATCCGTGTTGATAGTAGAGGACCAGAGGTGATGCGTATCCTTCCAC 949
Query 1033 GCCTGAATGAGGATATAAACGAAGAATGGATATCTGACAAAACCCGATTCTGTTATGACG 1092
|||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |
Sbjct 950 GCCTTAATGAGGATATAAATGAAGAATGGATTTCTGACAAAACTCGATTCAGCTATGATG 1009
Query 1093 GCCTGAAAAGACAAAGGCTGAGCGACCCTATGATCCGAGATTCCGATGGACGATTCAAGG 1152
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 1010 GCCTGAAAAGACAAAGGCTGAGCGACCCTATGATTCGAGATGCGGATGGACGATTCAAGG 1069
Query 1153 CAGTGAGCTGGCGTGATGCCTTGGCTGTTGTGGGTGATATCATTCATCAGGTGAAGCCAG 1212
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1070 CAGTGAGCTGGCGTGATGCTTTGGCTGTTGTGGGTGATATTATTCATCAGGTGAAGCCAA 1129
Query 1213 ATGAGATTGTTGGAGTAGCAGGTCAGCTATCTGATGCGGAATCCATGATGGTACTGAAGG 1272
|||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1130 ATGAGATTGTTGGAATTGCAGGTCAACTATCTGATGCCGAATCCATGATGGTATTGAAGG 1189
Query 1273 ACTTCGTTAACAGAATGGGCTCAGACAATGTATGGTGTGAAGGAACAGCTGCT-GGTGTT 1331
|||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||
Sbjct 1190 ACTTTGTGAACAGAATGGGTTCAGACAATGTCTGGTGTGAAGGAACAGCTG-TGGGCGTT 1248
Query 1332 GATGCTGATCTTAGATACAGTTATCTGATGAACACTAGCATCAG-TGGACTTGAAAACGC 1390
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||
Sbjct 1249 GATGCTGATCTTAGATACAGTTATCTTATGAACACTAGCATC-GCTGGACTTGAGAATGC 1307
Query 1391 CGATCTCTTCCTTCTCATCGGTACCCAGCCTAGGGTGGAAGCTGCAATGGTGAATGCTAG 1450
|||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1308 AGATCTCTTCCTTCTTATTGGTACCCAGCCTAGGGTTGAAGCTGCAATGGTGAACGCTAG 1367
Query 1451 GATCTGCAAGACAGTCCGTGCATCAAATGCCAAGGTTGGATATGTTGGTCCACCTGCAGA 1510
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1368 GATCTGCAAGACAGTCCGTGCATCAAATGCCAAGGTTGCATACATTGGTCCACCTTCAGA 1427
Query 1511 GTTCAATTACGACTGCAAACACCTCGGGACTGGGCCTGATACTCTCAAGGAAATTGCTGA 1570
||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1428 TTTCAACTACGATTGCAAACACCTCGGAACTGGTCCTGATACCCTCAAGGAAATTGCTGA 1487
Query 1571 GGGACGGCATCCATTCTG-TACGGCTCTCAAGAACGCCAAAAACCCTGCAATCATTGTTG 1629
|||| | || |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 GGGAAGTCACCCATTCTGCT-CAGCTCTCAAGAACGCCAAAAACCCTGCAATCATTGTTG 1546
Query 1630 GTGCTGGGCTCTTCAACAGAACTGATAAAAATGCTATCCTCTCTTCTGTGGAGTCCATTG 1689
||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| | |||| || |||||||
Sbjct 1547 GTGCTGGGCTCTTTAACAGAACCGATAAAGATGCAATCCTCTGTGCTGTTGAATCCATTG 1606
Query 1690 CACAAGCCAACAATGTTGTCCGACCAGACTGGAACGGTCTCAACTTTCTCCTTCAGTATG 1749
|||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1607 CACAAGTCAACAATGTTATCCGACCAGACTGGAATGGTCTCAACTTTCTCCTTCTGTATG 1666
Query 1750 CTGCCCAAGCGGCTGCTCTTGATCTTGGTCTCATTCAACAGTC-CGCCAAAGCCCTCGAG 1808
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1667 CTGCACAAGCGGCTGCTCTTGATCTTGGCCTCATTCAACAGTCTC-CCAAAGCCCTCGAG 1725
Query 1809 TCTGCAAAATTCGTCTACTTGATGGGAGCAGACGATGTAAATGTTGACAAGATTCCTAAA 1868
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||
Sbjct 1726 TATGCAAAATTCGTCTACTTGATGGGATCAGACGATGTAGATGTTGACAAGATCCCAAAA 1785
Query 1869 GACGCCTTTGTGGTTTACCAAGGACACCATGGAGACAAAGCGGTTTACCGTGCAAACGTA 1928
||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1786 GACGCGTTTGTTGTCTACCAAGGACACCATGGAGACAAAGCGGTTTATCGTGCAAACGTG 1845
Query 1929 ATTCTCCCTGC-ATCGGCCTTCACTGAGAAAGAAGGAACCTATGAAAATACTGAAGGATT 1987
||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 1846 ATTCTCCCTGCGA-CAGCCTTCACCGAGAAAGAAGGAACTTATGAAAACACCGAAGGATA 1904
Query 1988 TACCCAACAGACTGTTCCAGCTGTTCCAACAGTTGGTGATGCAAGAGATGACTGGAAGAT 2047
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1905 TACCCAACAGACGGTTCCTGCTGTTCCAACAGTTGGCGATGCAAGAGACGACTGGAAGAT 1964
Query 2048 TGTGAGAGCCTTATCCGAGGTCTCGGGTGTGAAGCTTCCATACAACTCAATCGAAGGTGT 2107
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 TGTAAGAGCTTTATCCGAGGTCTCGGGTGTGAAGCTTCCATACAACTCAATCGAAGGTGT 2024
Query 2108 TAGATCAAGAATAAAGAGCG-TTGCACCAAATCTAGTCCACACAGATGAGCGAGAGCCAG 2166
||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2025 CAGAACAAGAATCAAGA-CGGTTGCACCAAACCTAGTCCACACAGACGAGCGAGAGGCAG 2083
Query 2167 CTGCTTTTGGGCCTTCATTGAAGCCTGAGTGCAA-GGAGGCAAT-GAGCACAACACCGTT 2224
|||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| |||| || ||||| || ||
Sbjct 2084 CTGCTTTTGGCCCTACCTTGAAGCCTGAGT-CAAAGGAGACAATAGA-CACAATGCCTTT 2141
Query 2225 CCAAACC-GTGGTTGAGAACTTTTACATGACAAACTCGATCACAAGAGCATCAAAGATCA 2283
| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2142 C-AAACCCGTGGTCGAAAATTTTTATATGACAAACTCAATCACAAGAGCCTCAAAGATCA 2200
Query 2284 TGGCGCAGTGCAGTGC 2299
|||| |||||||||||
Sbjct 2201 TGGCTCAGTGCAGTGC 2216
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 95263702745
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5