BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G47020.1 Length=4894 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg494278 jgi|Araly1|494278|fgenesh2_kg.8__94__AT5G47020.1 7251 0.0 > Ahg494278 jgi|Araly1|494278|fgenesh2_kg.8__94__AT5G47020.1 Length=4431 Score = 7251 bits (3926), Expect = 0.0 Identities = 4277/4447 (96%), Gaps = 21/4447 (0%) Strand=Plus/Plus Query 406 ATGCTTGGACTTGTGTTCTTGTGTGTCCTTTTGGTCTCTACGCCATGTTTTAGCTTATCA 465 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCTTGGACTTGTGTTCTTGTGTGTTCTTTTGGTGTCCACGCCATGTTTTAGCTTATCA 60 Query 466 CAGTATGGGGTCACTGAATTTGAGAGCTCTGTGAGATTGTTTTCAGATGAAGCTTCTGGA 525 |||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 61 CAGTATGGGGGCACTGACTTTGAGAGCCCTCTGAGATTGTTTTCAGATGAAGATTCTGGG 120 Query 526 AATTCTACTAGTTCT-CCGATTTCTGTGACTTGTCAAGACCTGGATGGTGTTGGATCGTT 584 ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct 121 AATTCTACTAGTT-TACCGATTTCTGTGACTTGTCAAGACTTGGATGGTGTTGGATCTTT 179 Query 585 GAATACCACTTGTACATTGAACTCGAATTTGCGATTCGATTCCGATGTTTATGTATATGG 644 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 180 GAATACCACTTGTACATTGAACTCGAATTTGCGGTTCGATTCTGATGTTTATGTATATGG 239 Query 645 AACTGGTAATCTGAACATACTTGCACATGTCTTAGTTGATTGCCCTGTTGAAGGATGTAT 704 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 240 AACGGGTAATCTGAACATACTTGCCCATGTCTTAGTTGATTGCCCTATTGAAGGATGTAT 299 Query 705 GATCACCTTCAATGTATCTGGAACTATTCATTTGGGTCAATCAGCAAGAATTGTTGCTGG 764 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 300 GATCATTTTCAATGTATCTGGAACTATTCATTTGGGTCAATCAGCAAGAATCGTTGCTGG 359 Query 765 TTCTGTGGTTTTTTCTGCTATCAACTTAACAATGGATAGCAATTCGTCTATCTACACGAC 824 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 360 TTCTGTGGTTTTTTCTGCTATCAATTTAACAATGGATAGCAATTCGTCTATCTACACGTC 419 Query 825 AGCATTGGCTGGACCACCACCTTCTCAGACTAGTGGAACACCATATGGTATTGATGGTGC 884 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 420 GGCATTGGCTGGACCACCACCTTCTCAGACTAGTGGAACACCATATGGTAGTGATGGTGC 479 Query 885 CGGTGGAGGCCATGGTGGGAGAGGTGCTTCCTGTGTGAAGAGTAATAAAACGACTTATTG 944 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 480 GGGTGGAGGCCATGGTGGGAGAGGTGCTTCCTGTGTGAAGAGTAATAAGACGACCTATTG 539 Query 945 GGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCGTCTTTGCATGATCCGTGGAGCTATGGGAGTGAGGG 1004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 540 GGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCGTCTTTGCATGACCCGTGGAGCTATGGGAGCGAGGG 599 Query 1005 AGGGGTTAAGTTATCCACAAAGAATATCAGAGGCAAAGGTGGAGGTCGTGTTAAACTCAT 1064 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | Sbjct 600 AGGGGTTAAGTTATCCACAAAGAATATCAGAGGCAAAGGTGGAGGTCGTGTCAGACTCCT 659 Query 1065 ATTGACGGACACAGTACATGTGAATGGAACTGTTTCCGCAGATGGTGGTGATGCTGGAGA 1124 ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 ATTGAAGGACACGGTACATGTGAATGGAACTGTTTACGCAGATGGTGGTGATGCTGGAGA 719 Query 1125 GGAAGGGGGTGGAGGATCTGGAGGAAGTATCTGTATTCGTGCGGTAAAGCTGAAGGGTTA 1184 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || || |||||| Sbjct 720 GGAAGGGGGTGGAGGATCTGGAGGAAGTATCTGTA-T--T-C-GT---GC----GGGTTA 767 Query 1185 CGGTAAAATATCTGCATCGGGTGGGAGGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGAGGAAGGATCTC 1244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 768 CGGTAAAATATCTGCATCGGGTGGGAGGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGAGGGAGGATCTC 827 Query 1245 TCTTGACTGTTACAGCATACAAGAAGATGTCAAAGTTTTTGTTCATGGTGGCGCAAGTAT 1304 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 828 CCTTGACTGTTACAGCATACAAGAAGATGTCAAAGTTTTTGTGCATGGTGGCGCAAGTAT 887 Query 1305 CGGGTGCCCCAAAAATGCAGGAGCAGCTGGAACATACTTTAATGCTGAATTAGTGAGTTT 1364 |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 888 CGGGTGTCCCAATAATGCTGGAGCAGCTGGAACATACTTTAATGCTGAATTAGTGAGTTT 947 Query 1365 AAGGGTTGGAAATGATAACATGACTACAGAGACAGAAACTCCTTTGCTCGATTTTCCTAC 1424 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 948 AAGGGTTGGAAATGATAACATGACTACAGAGACAGAAACTCCTTTGCTCGATTTTCCTAC 1007 Query 1425 AAGGCCTCTGTGGTCAAACATCTATGTAGATAATAATGCAAAAGTTTTGGTCCCGCTGCT 1484 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1008 AAGGCCTCTGTGGTCAAACATCTATGTAGATAATAATGCAAAAGTTTTGGTCCCGCTGCT 1067 Query 1485 GTGGACCAGAATGCAGGTCGGAGGTCAAATCAGTCTTTATCGGGGAAGCAGCATTGTTTT 1544 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1068 GTGGACCAGAATGCAGGTCAGAGGTCAAATCAGTCTTTATCGGGGAAGCAGCATTGTTTT 1127 Query 1545 CGGGTTATCAAAATATCCAATTTCAGAATTTGAGCTTGTTGCTGAAGAACTTTTAATGAG 1604 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1128 TGGGTTATCAAAATATCCAATTTCAGAATTTGAGCTTGTCGCTGAGGAACTTTTAATGAG 1187 Query 1605 TAACTCCGTTATAAAGGTTTTTGGTGCATTACGACTTGTTACGAAGATGCTGCTCATGTT 1664 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1188 TAACTCCGTTATAAAGGTTTTTGGTGCGTTACGACTTGTTACGAAGATGCTGCTCATGTT 1247 Query 1665 GAATTCTGTGATTCAAATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCAGTGCCTTCCTCTGTTCTTGA 1724 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || Sbjct 1248 GAATTCTGTGATTCAAATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCGGTGCCTTCCTCTGTCCTCGA 1307 Query 1725 AGTTCGCAACCTTGCAGTTCTAAAGGGAAAATCCGTCATTACTTCTAATACGAACTTGGG 1784 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 1308 AGTTCGCAACCTTGCAGTTCTAAGGGGAAAATCCGTCATTACTTCTAATGCAAACTTGGG 1367 Query 1785 TGTATATGGTCAAGGAATGTTGACGCTATCTGGTCCTGGGGATGCAATTAAAGGCCAAAG 1844 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1368 TGTATATGGTCAAGGAATGTTGACGCTCTCCGGTCCTGGGGATGCAATTAAAGGCCAGAG 1427 Query 1845 ACTTTCCTTATCTCAATTTTACAACATAACTGTTGGACCAGGCTCTATACTTCAAGCACC 1904 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 1428 ACTTTCCTTATCTCAATTTTACAACATAACTATTGGGCCAGGTTCTTTACTTCAAGCACC 1487 Query 1905 ACTTGATGATTATGAAAGCAAAAACGCGGTTACTCAGACCCTTTGTGAGAGCAAAACATG 1964 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1488 ACTTGATGATTACGAAAGCAAAAACGCGGTTACTCAGACCCTTTGTGAGAGCAAAACATG 1547 Query 1965 CCCAATAGATTTAATCAGTCCGCCGGATGATTGCCATGTCAATTATACACTATCCTTTTC 2024 ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1548 CCCAATAGACTTGATCAGTCCGCCGGATGATTGTCATGTCAATTATACACTATCCTTTTC 1607 Query 2025 CCTTCAGATATGTCGAGTTGAGGACATTCTTGTGAGAGGACTTGTGAAAGGAAGCATAAT 2084 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct 1608 CCTTCAGATATGTCGAGTTGAAGACATTCTTGTGATTGGACATGTGAAAGGAAGCATAAT 1667 Query 2085 TCAAATCCACAGGGCGAGAACGGTAGTAGTTACTGATGATGGCTTGATAACTGCATCTGG 2144 ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 1668 TCAAATCCACAGGGCGAGAACAGTGGTGGTTACTGATGATGGCTTGATTACTGCAACTGG 1727 Query 2145 ATTTGGTTGCAGTGCTGGGTTGGGGAAGGGACTTTATTCAAATGGGGCTGGTAGTGGTGC 2204 |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1728 ATTTGGTTGCAGTGGTGGCTTGGGGAAGGGGCTTTATTCAAATGGGGCTGGTAGTGGTGC 1787 Query 2205 TGGGCATGGAGGACGAGGGGGATCAGGCATTTTCAATGGGAGAGTATGCAACGGAGGACA 2264 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1788 TGGGCATGGAGGAAGAGGGGGATCAGGCATTTTCAATGGGAGAGTATGCAACGGAGGTCA 1847 Query 2265 TACCTATGGTGATCCTGATTTTCCCTGTGAGTTAGGAAGCGGAGCAGAGAGTCCAGATAA 2324 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1848 TACCTATGGTGATCCTGATTTTCCCTGTGAGCTAGGAAGCGGAGCAGAAAGTCCAGATAA 1907 Query 2325 ATCATATGGGAATGTGACTGGTGGAGGGATGATAGTAATTGGCTCCATCCAGTTTCCTCT 2384 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1908 ATCATATGGGAATGTGACTGGTGGAGGGATGATAGTAATTGGCTCCATCCAGTTTCCTCT 1967 Query 2385 TTTGACTCTTAATCTGCGGGGATCTCTGAGCTCTGATGGTCAAAGCCTTTGGAAGCCAAC 2444 |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1968 TTTGACACTTAATCTGCGTGGATCTCTGAGCTCTGATGGCCAAAGCCTTTGGAAGCCAAC 2027 Query 2445 AGCGAATGGTAACAGATCTTTGGTCGGTGGAGTTGGTGGGGGATCTGGTGGGACGATTCT 2504 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2028 AGCGAATGGTAACAGATCTTTGGTCGGCGGAGTTGGTGGGGGATCTGGTGGGACGATTCT 2087 Query 2505 TCTTTTCCTTCAGATGCTTGAACTCTCAAAGAATTCATCTCTATCAGTTCGAGGGGGCCG 2564 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2088 TCTTTTCCTCCAGATGCTTGAGCTCTCAAAGAATTCATCTCTATCAGTTCGAGGGGGCCG 2147 Query 2565 GGGTGGGCCTCTTGGGGGTGGTGGAGGTGGAGGAGGGA-GACTTCACTTTCACTGGGACA 2623 |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2148 GGGTGGCCCTCTTGGGGGTGGTGGGGGTGGAGG-GGGAAGACTTCACTTTCACTGGGACA 2206 Query 2624 TGTTACATACTGGGGACGAGTATTCTCCTGTTGCAATTGTCAAGGGGTCCATTAGTAATA 2683 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2207 TGTTACACACTGGGGACGAGTATTCTCCTGTTGCAGTTGTCAAGGGGTCCATTAGTAATA 2266 Query 2684 GAGGAGGTGCAGGGGACAATGGAGGTCGATTCGGGGAAGAGGGAACAATGACTGGGAAAA 2743 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2267 GAGGAGGTGCAGGGGACAATGGAGGTCGATTCGGGGAAGAGGGAACAATGACTGGGAAAA 2326 Query 2744 AGTGTCCAAAGGGACTCTACGGTACATTCTGCTTGGAATGCCCCATTGGCACTTACAAGA 2803 ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2327 AGTGTCCGAAGGGACTCTATGGTACATTTTGCTTGGAATGCCCCATTGGCACTTACAAGA 2386 Query 2804 ACGTCGAAGGCTCTGACAAACGTCTTTGTACTCCCTGCCCGCCTGAGCATCTTCCAAGTC 2863 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2387 ATGTTGAAGGCTCTGACAAACGTCTTTGTACTCCCTGCCCGCCTGAGCATCTTCCAAGTC 2446 Query 2864 GTGCAAAATTTGTATACGTACGAGGAGGAGTTAGCGAACCTGTTTGTCCCTATAAATGTG 2923 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2447 GTGCAAAATTTGTATACGTACGAGGAGGAGTTAGTGAACCTGTTTGTCCCTATAAATGTG 2506 Query 2924 TATCAGAAAAATACAGATTGCCAAACTGCTATACACCTCTGGAAGAGCTTGTCTATACAT 2983 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2507 TATCTGACAAATACAGATTGCCAAACTGCTATACACCTCTGGAAGAGCTTGTCTATACAT 2566 Query 2984 TTGGAGGGCCATTGCCCTTTACTCTTCTTCTATCTTGTGTGGTGGTAGTTTTGGGTCTGT 3043 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2567 TTGGAGGGCCATTGCCCTTTACCCTTCTTCTATCTTGTGTGGTGGTAGTTTTGGGTCTGT 2626 Query 3044 TGCTAAGCACATTAAGTATCAAATTGCTCAGGTTGAGTTTCTATGGTGCTAATTCCATTG 3103 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 2627 TGCTAAGCACATTAAGTATCAAATTGCTCAGATTGAGTTTCTATGGTGCCAATTCCATCG 2686 Query 3104 AACACCAGAGTGCACATTGTTTACCCCATCTTCTGTCACTCTCTGAGGTTCGAGGCGCAA 3163 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2687 AACACCAGAGTGCTCATTGTTTACCCCATCTTCTGTCACTCTCTGAGGTTCGAGGCGCAA 2746 Query 3164 AATCTGAGGACACGCAAACCCATGCTTACCGTATGTACTTCATGGGTCCAAACAATTTCA 3223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2747 AATCTGAGGACACGCAAACCCATGCTTACCGTATGTACTTCATGGGTCCAAACACTTTCA 2806 Query 3224 GGGAACCTTGGCATCTGCCCTACTCTCCTCCTGGTGCAATCATAGAGATAGTGTACGAAG 3283 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2807 GGGAACCTTGGCATCTGCCCTACTCTCCTCCTGATGCAATCATAGAGATAGTGTACGAAG 2866 Query 3284 ATGCTTTTAACAGCTTTATTAATGAAATAAACTCTACCGCAGCATATGATTGGTGGGAAG 3343 ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2867 ATGCTTTTAACAGATTTATTGATGAAATAAACTCTACCGCAGCATATGATTGGTGGGAAG 2926 Query 3344 GGTCTGTGCACAGCATTCTTTCAGTTCTTGCAAATCCTTGTGCCTGGTCGTGGAAACAAT 3403 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2927 GGTCTGTGCACAGCATTCTATCAGTTCTTGCAAATCCTTGTGCCTGGTCGTGGAAACAAT 2986 Query 3404 GGCGTCGCAGGAGAAAAATTCATCGCCTTCAAGAATATGTCAAATCTCAATATGACCATT 3463 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2987 GGCGTCGCAGGAGAAAAATTCACCGCCTTCAAGAATATGTCAAATCTCAATATGACCACT 3046 Query 3464 CTTGCCTCCGCTCATGCAGATCTAGAGCTCTCTACAAAGGGATGAAGGTTGGAGCCACTC 3523 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3047 CTTGCCTCCGCTCATGCAGATCTAGAGCTCTCTACAAAGGGATGAAGGTTGGAGCCACTC 3106 Query 3524 CGGATCTGATGGTTGCATACATAGATTTCTTCCTTGGCGGTGACGAGAAGCGTGTAGATA 3583 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3107 CGGATCTGATGATTGCATACATAGATTTCTTTCTTGGCGGTGACGAGAAGCGTGTAGATA 3166 Query 3584 TGGTCTCTATTATACAGAAAAGATTCCCAATGTGCATACTTTTTGGAGGAGATGGAAGTT 3643 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3167 TGGTCTCCATTATACAGAAAAGATTCCCAATGTGCATACTTTTTGGTGGAGATGGAAGTT 3226 Query 3644 ATATGTCACCCTATAGTCTCCATAGTGATACACTGTTAACAAATCTTCTTGGCCAGCACA 3703 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3227 ATATGTCACCTTATAGTCTCCATAGTGATACACTATTAACAAATCTTCTTGGCCAGCACA 3286 Query 3704 TCCCACCGAGTGTTTGGCACCGGTTTGTTGCTGGTTTAAATGCTCAGCTTAGGACTGTGA 3763 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3287 TCCCACCAAGTGTTTGGCACCGGTTTGTTGCTGGTTTAAATGCTCAGCTTAGGACTGTGA 3346 Query 3764 GGCACGGATCAATTCGGTCAGCATTACTTCCTGTCATTAGGTGGATAAACAGCCATGGAA 3823 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3347 GGCACGGATCAATTCGTTCAGCATTACTTCCTGTCATTAGGTGGATAAACAGTCATGGAA 3406 Query 3824 ATCCTCAACTCGAATTCCATGGAGTAAGAATTGAACTTGGATGGTTTCAAGCTACAGCTT 3883 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3407 ATCCTCAGCTAGAATTCCATGGAGTAAGAATTGAACTTGGATGGTTTCAAGCTACAGCTT 3466 Query 3884 CTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTTCCTCTGAACACTGTAA 3943 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3467 CTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTTCCTCTGAGCACTGTAA 3526 Query 3944 ACAGATCACTGTCGTTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCCCCTGGGAACAACTCTGCATGTC 4003 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| Sbjct 3527 CCCGATCACTTTCGTTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCACCTCGGAACAGCTCTGCATGTC 3586 Query 4004 CAAGCAAATCTCTTATCGAGTTGCAGCAAAACTTGATCCAACCAGGACATGGATTATCTC 4063 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3587 CCAGCAAATCTCTTATCGAGTTGCAGCAAAACTTGATCCAACCAGGACATGGATTATCTC 3646 Query 4064 GGAAGAGGATCAATGGTGGAATCAATGGAGGCCTCATCAATGAGATTTCACTAGAATCTT 4123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3647 GGAAGAGGATCAATGGTGGAATCAATGGAGGCCTCATCAATGAGATTTCACTAGAATCTT 3706 Query 4124 TGGAGTATCGAAGGGATTTACTTTTTCCATTTTCTCTCTTATTGAACAACACTCGACCTG 4183 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3707 TGGAGTACCGAAGGGATTTACTTTTTCCATTTTCTCTCTTATTGAACAACACTCGACCTG 3766 Query 4184 TTGGGCGTCAGGATACTCTTCTCCGTTTTATTTCCATCCTTCTCCTTGCTGATCTTTCAG 4243 |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3767 TTGGGCGTCAGGATACTCTTCTCCGTTTGATCTCCATCCTTCTCCTTGCTGATCTTTCAG 3826 Query 4244 TTACGCTACTTGCATTACTTCAGTTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTTGCTATCC 4303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| Sbjct 3827 TTACGCTACTTGCATTACTTCAGTTCTATTGGCTTGCCATTGCAGCCTTTCTCGCTATCC 3886 Query 4304 TCCTGATTCTCCCTCTCTCCCTTCTTTGCCCATTCCCTGCCGGCCTTAACGCTTTATTAA 4363 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3887 TCCTGATTCTCCCTCTCTCCCTGCTTTGCCCATTCCCTGCCGGCCTTAACGCTTTATTAA 3946 Query 4364 GTAAAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATCTACGGCCTGTGGAATGCTACATCTC 4423 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 3947 GTAAAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATCTATGGCCTTTGGAATGCTACATCTC 4006 Query 4424 TAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCCGGGTTTTTCACTGACG 4483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4007 TAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCCGGGTTTTTCACTGACG 4066 Query 4484 AGCTACCAAACATCTGGAACGCCATAAGGGATGATGATAAATGGTGGGTATTACCAACA- 4542 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 4067 AGCTACCAAACATCTGGAACGCCATAAGGGATGATGATAGATGGTGGGTGTTACCAACAG 4126 Query 4543 TTCCTCTTGTTACTCAAGTCAATACAAGCTCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTA 4602 ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4127 TTC-TCCTGTTACTCAAGTCAATACAAGCCCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTA 4185 Query 4603 GAAGTACCAGACTTTTCTCTTCTTTGTCCAGATCCAGATACCTTCTGGGCATATGAATCT 4662 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4186 GAAGTACCGGACTTTTCTCTTCTTTGTCCAGATCCAGATACCTTCTGGGCTTATGAATCT 4245 Query 4663 GGAGCTTGACCATCAACATGATTATAAAGAAAGACCAGCAAAAGATATATCTTATTTTTC 4722 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| Sbjct 4246 GGAGCTTGACCATCAACATGATTATAAAGAAAGACAAGCAAAAGGTATATCATATTTTTC 4305 Query 4723 ATGTAAATCTTTTAAAA-GTACAAAGTTCTTCTCGGTGATAGTTGTTAAAAACAGTTCTC 4781 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4306 ATGTAAATCTTTTAAAAAGTACAAAGCTCTTCTCAGTGATAGTTGTTAAAAACAGTTCTC 4365 Query 4782 TAGAACATCTGGTTATATATCTGGTGCTGAATTAGGAGTTC-GCCAGATCAATGGTAGTT 4840 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 4366 TAGAACATCTGGTTATATTTCTGGTGCCGAATTAGG-GTTTTGCCAGATCAATGGTAGTT 4424 Query 4841 GTAGAAA 4847 ||||||| Sbjct 4425 GTAGAAA 4431 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 185226207791 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5