BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT5G47020.1

Length=4894
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg494278 jgi|Araly1|494278|fgenesh2_kg.8__94__AT5G47020.1          7251    0.0  


> Ahg494278 jgi|Araly1|494278|fgenesh2_kg.8__94__AT5G47020.1
Length=4431

 Score = 7251 bits (3926),  Expect = 0.0
 Identities = 4277/4447 (96%), Gaps = 21/4447 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  406   ATGCTTGGACTTGTGTTCTTGTGTGTCCTTTTGGTCTCTACGCCATGTTTTAGCTTATCA  465
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGCTTGGACTTGTGTTCTTGTGTGTTCTTTTGGTGTCCACGCCATGTTTTAGCTTATCA  60

Query  466   CAGTATGGGGTCACTGAATTTGAGAGCTCTGTGAGATTGTTTTCAGATGAAGCTTCTGGA  525
             |||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| 
Sbjct  61    CAGTATGGGGGCACTGACTTTGAGAGCCCTCTGAGATTGTTTTCAGATGAAGATTCTGGG  120

Query  526   AATTCTACTAGTTCT-CCGATTTCTGTGACTTGTCAAGACCTGGATGGTGTTGGATCGTT  584
             ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct  121   AATTCTACTAGTT-TACCGATTTCTGTGACTTGTCAAGACTTGGATGGTGTTGGATCTTT  179

Query  585   GAATACCACTTGTACATTGAACTCGAATTTGCGATTCGATTCCGATGTTTATGTATATGG  644
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  180   GAATACCACTTGTACATTGAACTCGAATTTGCGGTTCGATTCTGATGTTTATGTATATGG  239

Query  645   AACTGGTAATCTGAACATACTTGCACATGTCTTAGTTGATTGCCCTGTTGAAGGATGTAT  704
             ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  240   AACGGGTAATCTGAACATACTTGCCCATGTCTTAGTTGATTGCCCTATTGAAGGATGTAT  299

Query  705   GATCACCTTCAATGTATCTGGAACTATTCATTTGGGTCAATCAGCAAGAATTGTTGCTGG  764
             |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  300   GATCATTTTCAATGTATCTGGAACTATTCATTTGGGTCAATCAGCAAGAATCGTTGCTGG  359

Query  765   TTCTGTGGTTTTTTCTGCTATCAACTTAACAATGGATAGCAATTCGTCTATCTACACGAC  824
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  360   TTCTGTGGTTTTTTCTGCTATCAATTTAACAATGGATAGCAATTCGTCTATCTACACGTC  419

Query  825   AGCATTGGCTGGACCACCACCTTCTCAGACTAGTGGAACACCATATGGTATTGATGGTGC  884
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  420   GGCATTGGCTGGACCACCACCTTCTCAGACTAGTGGAACACCATATGGTAGTGATGGTGC  479

Query  885   CGGTGGAGGCCATGGTGGGAGAGGTGCTTCCTGTGTGAAGAGTAATAAAACGACTTATTG  944
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct  480   GGGTGGAGGCCATGGTGGGAGAGGTGCTTCCTGTGTGAAGAGTAATAAGACGACCTATTG  539

Query  945   GGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCGTCTTTGCATGATCCGTGGAGCTATGGGAGTGAGGG  1004
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct  540   GGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCGTCTTTGCATGACCCGTGGAGCTATGGGAGCGAGGG  599

Query  1005  AGGGGTTAAGTTATCCACAAAGAATATCAGAGGCAAAGGTGGAGGTCGTGTTAAACTCAT  1064
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
Sbjct  600   AGGGGTTAAGTTATCCACAAAGAATATCAGAGGCAAAGGTGGAGGTCGTGTCAGACTCCT  659

Query  1065  ATTGACGGACACAGTACATGTGAATGGAACTGTTTCCGCAGATGGTGGTGATGCTGGAGA  1124
             ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   ATTGAAGGACACGGTACATGTGAATGGAACTGTTTACGCAGATGGTGGTGATGCTGGAGA  719

Query  1125  GGAAGGGGGTGGAGGATCTGGAGGAAGTATCTGTATTCGTGCGGTAAAGCTGAAGGGTTA  1184
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||   ||    ||||||
Sbjct  720   GGAAGGGGGTGGAGGATCTGGAGGAAGTATCTGTA-T--T-C-GT---GC----GGGTTA  767

Query  1185  CGGTAAAATATCTGCATCGGGTGGGAGGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGAGGAAGGATCTC  1244
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  768   CGGTAAAATATCTGCATCGGGTGGGAGGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGAGGGAGGATCTC  827

Query  1245  TCTTGACTGTTACAGCATACAAGAAGATGTCAAAGTTTTTGTTCATGGTGGCGCAAGTAT  1304
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  828   CCTTGACTGTTACAGCATACAAGAAGATGTCAAAGTTTTTGTGCATGGTGGCGCAAGTAT  887

Query  1305  CGGGTGCCCCAAAAATGCAGGAGCAGCTGGAACATACTTTAATGCTGAATTAGTGAGTTT  1364
             |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888   CGGGTGTCCCAATAATGCTGGAGCAGCTGGAACATACTTTAATGCTGAATTAGTGAGTTT  947

Query  1365  AAGGGTTGGAAATGATAACATGACTACAGAGACAGAAACTCCTTTGCTCGATTTTCCTAC  1424
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948   AAGGGTTGGAAATGATAACATGACTACAGAGACAGAAACTCCTTTGCTCGATTTTCCTAC  1007

Query  1425  AAGGCCTCTGTGGTCAAACATCTATGTAGATAATAATGCAAAAGTTTTGGTCCCGCTGCT  1484
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1008  AAGGCCTCTGTGGTCAAACATCTATGTAGATAATAATGCAAAAGTTTTGGTCCCGCTGCT  1067

Query  1485  GTGGACCAGAATGCAGGTCGGAGGTCAAATCAGTCTTTATCGGGGAAGCAGCATTGTTTT  1544
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1068  GTGGACCAGAATGCAGGTCAGAGGTCAAATCAGTCTTTATCGGGGAAGCAGCATTGTTTT  1127

Query  1545  CGGGTTATCAAAATATCCAATTTCAGAATTTGAGCTTGTTGCTGAAGAACTTTTAATGAG  1604
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct  1128  TGGGTTATCAAAATATCCAATTTCAGAATTTGAGCTTGTCGCTGAGGAACTTTTAATGAG  1187

Query  1605  TAACTCCGTTATAAAGGTTTTTGGTGCATTACGACTTGTTACGAAGATGCTGCTCATGTT  1664
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1188  TAACTCCGTTATAAAGGTTTTTGGTGCGTTACGACTTGTTACGAAGATGCTGCTCATGTT  1247

Query  1665  GAATTCTGTGATTCAAATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCAGTGCCTTCCTCTGTTCTTGA  1724
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct  1248  GAATTCTGTGATTCAAATTGATGGTGAAGGAAACCCTGCGGTGCCTTCCTCTGTCCTCGA  1307

Query  1725  AGTTCGCAACCTTGCAGTTCTAAAGGGAAAATCCGTCATTACTTCTAATACGAACTTGGG  1784
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct  1308  AGTTCGCAACCTTGCAGTTCTAAGGGGAAAATCCGTCATTACTTCTAATGCAAACTTGGG  1367

Query  1785  TGTATATGGTCAAGGAATGTTGACGCTATCTGGTCCTGGGGATGCAATTAAAGGCCAAAG  1844
             ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1368  TGTATATGGTCAAGGAATGTTGACGCTCTCCGGTCCTGGGGATGCAATTAAAGGCCAGAG  1427

Query  1845  ACTTTCCTTATCTCAATTTTACAACATAACTGTTGGACCAGGCTCTATACTTCAAGCACC  1904
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||
Sbjct  1428  ACTTTCCTTATCTCAATTTTACAACATAACTATTGGGCCAGGTTCTTTACTTCAAGCACC  1487

Query  1905  ACTTGATGATTATGAAAGCAAAAACGCGGTTACTCAGACCCTTTGTGAGAGCAAAACATG  1964
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1488  ACTTGATGATTACGAAAGCAAAAACGCGGTTACTCAGACCCTTTGTGAGAGCAAAACATG  1547

Query  1965  CCCAATAGATTTAATCAGTCCGCCGGATGATTGCCATGTCAATTATACACTATCCTTTTC  2024
             ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1548  CCCAATAGACTTGATCAGTCCGCCGGATGATTGTCATGTCAATTATACACTATCCTTTTC  1607

Query  2025  CCTTCAGATATGTCGAGTTGAGGACATTCTTGTGAGAGGACTTGTGAAAGGAAGCATAAT  2084
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1608  CCTTCAGATATGTCGAGTTGAAGACATTCTTGTGATTGGACATGTGAAAGGAAGCATAAT  1667

Query  2085  TCAAATCCACAGGGCGAGAACGGTAGTAGTTACTGATGATGGCTTGATAACTGCATCTGG  2144
             ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct  1668  TCAAATCCACAGGGCGAGAACAGTGGTGGTTACTGATGATGGCTTGATTACTGCAACTGG  1727

Query  2145  ATTTGGTTGCAGTGCTGGGTTGGGGAAGGGACTTTATTCAAATGGGGCTGGTAGTGGTGC  2204
             |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1728  ATTTGGTTGCAGTGGTGGCTTGGGGAAGGGGCTTTATTCAAATGGGGCTGGTAGTGGTGC  1787

Query  2205  TGGGCATGGAGGACGAGGGGGATCAGGCATTTTCAATGGGAGAGTATGCAACGGAGGACA  2264
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1788  TGGGCATGGAGGAAGAGGGGGATCAGGCATTTTCAATGGGAGAGTATGCAACGGAGGTCA  1847

Query  2265  TACCTATGGTGATCCTGATTTTCCCTGTGAGTTAGGAAGCGGAGCAGAGAGTCCAGATAA  2324
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1848  TACCTATGGTGATCCTGATTTTCCCTGTGAGCTAGGAAGCGGAGCAGAAAGTCCAGATAA  1907

Query  2325  ATCATATGGGAATGTGACTGGTGGAGGGATGATAGTAATTGGCTCCATCCAGTTTCCTCT  2384
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1908  ATCATATGGGAATGTGACTGGTGGAGGGATGATAGTAATTGGCTCCATCCAGTTTCCTCT  1967

Query  2385  TTTGACTCTTAATCTGCGGGGATCTCTGAGCTCTGATGGTCAAAGCCTTTGGAAGCCAAC  2444
             |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1968  TTTGACACTTAATCTGCGTGGATCTCTGAGCTCTGATGGCCAAAGCCTTTGGAAGCCAAC  2027

Query  2445  AGCGAATGGTAACAGATCTTTGGTCGGTGGAGTTGGTGGGGGATCTGGTGGGACGATTCT  2504
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2028  AGCGAATGGTAACAGATCTTTGGTCGGCGGAGTTGGTGGGGGATCTGGTGGGACGATTCT  2087

Query  2505  TCTTTTCCTTCAGATGCTTGAACTCTCAAAGAATTCATCTCTATCAGTTCGAGGGGGCCG  2564
             ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2088  TCTTTTCCTCCAGATGCTTGAGCTCTCAAAGAATTCATCTCTATCAGTTCGAGGGGGCCG  2147

Query  2565  GGGTGGGCCTCTTGGGGGTGGTGGAGGTGGAGGAGGGA-GACTTCACTTTCACTGGGACA  2623
             |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2148  GGGTGGCCCTCTTGGGGGTGGTGGGGGTGGAGG-GGGAAGACTTCACTTTCACTGGGACA  2206

Query  2624  TGTTACATACTGGGGACGAGTATTCTCCTGTTGCAATTGTCAAGGGGTCCATTAGTAATA  2683
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2207  TGTTACACACTGGGGACGAGTATTCTCCTGTTGCAGTTGTCAAGGGGTCCATTAGTAATA  2266

Query  2684  GAGGAGGTGCAGGGGACAATGGAGGTCGATTCGGGGAAGAGGGAACAATGACTGGGAAAA  2743
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2267  GAGGAGGTGCAGGGGACAATGGAGGTCGATTCGGGGAAGAGGGAACAATGACTGGGAAAA  2326

Query  2744  AGTGTCCAAAGGGACTCTACGGTACATTCTGCTTGGAATGCCCCATTGGCACTTACAAGA  2803
             ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2327  AGTGTCCGAAGGGACTCTATGGTACATTTTGCTTGGAATGCCCCATTGGCACTTACAAGA  2386

Query  2804  ACGTCGAAGGCTCTGACAAACGTCTTTGTACTCCCTGCCCGCCTGAGCATCTTCCAAGTC  2863
             | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2387  ATGTTGAAGGCTCTGACAAACGTCTTTGTACTCCCTGCCCGCCTGAGCATCTTCCAAGTC  2446

Query  2864  GTGCAAAATTTGTATACGTACGAGGAGGAGTTAGCGAACCTGTTTGTCCCTATAAATGTG  2923
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2447  GTGCAAAATTTGTATACGTACGAGGAGGAGTTAGTGAACCTGTTTGTCCCTATAAATGTG  2506

Query  2924  TATCAGAAAAATACAGATTGCCAAACTGCTATACACCTCTGGAAGAGCTTGTCTATACAT  2983
             |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2507  TATCTGACAAATACAGATTGCCAAACTGCTATACACCTCTGGAAGAGCTTGTCTATACAT  2566

Query  2984  TTGGAGGGCCATTGCCCTTTACTCTTCTTCTATCTTGTGTGGTGGTAGTTTTGGGTCTGT  3043
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2567  TTGGAGGGCCATTGCCCTTTACCCTTCTTCTATCTTGTGTGGTGGTAGTTTTGGGTCTGT  2626

Query  3044  TGCTAAGCACATTAAGTATCAAATTGCTCAGGTTGAGTTTCTATGGTGCTAATTCCATTG  3103
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct  2627  TGCTAAGCACATTAAGTATCAAATTGCTCAGATTGAGTTTCTATGGTGCCAATTCCATCG  2686

Query  3104  AACACCAGAGTGCACATTGTTTACCCCATCTTCTGTCACTCTCTGAGGTTCGAGGCGCAA  3163
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2687  AACACCAGAGTGCTCATTGTTTACCCCATCTTCTGTCACTCTCTGAGGTTCGAGGCGCAA  2746

Query  3164  AATCTGAGGACACGCAAACCCATGCTTACCGTATGTACTTCATGGGTCCAAACAATTTCA  3223
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2747  AATCTGAGGACACGCAAACCCATGCTTACCGTATGTACTTCATGGGTCCAAACACTTTCA  2806

Query  3224  GGGAACCTTGGCATCTGCCCTACTCTCCTCCTGGTGCAATCATAGAGATAGTGTACGAAG  3283
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2807  GGGAACCTTGGCATCTGCCCTACTCTCCTCCTGATGCAATCATAGAGATAGTGTACGAAG  2866

Query  3284  ATGCTTTTAACAGCTTTATTAATGAAATAAACTCTACCGCAGCATATGATTGGTGGGAAG  3343
             ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2867  ATGCTTTTAACAGATTTATTGATGAAATAAACTCTACCGCAGCATATGATTGGTGGGAAG  2926

Query  3344  GGTCTGTGCACAGCATTCTTTCAGTTCTTGCAAATCCTTGTGCCTGGTCGTGGAAACAAT  3403
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2927  GGTCTGTGCACAGCATTCTATCAGTTCTTGCAAATCCTTGTGCCTGGTCGTGGAAACAAT  2986

Query  3404  GGCGTCGCAGGAGAAAAATTCATCGCCTTCAAGAATATGTCAAATCTCAATATGACCATT  3463
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2987  GGCGTCGCAGGAGAAAAATTCACCGCCTTCAAGAATATGTCAAATCTCAATATGACCACT  3046

Query  3464  CTTGCCTCCGCTCATGCAGATCTAGAGCTCTCTACAAAGGGATGAAGGTTGGAGCCACTC  3523
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3047  CTTGCCTCCGCTCATGCAGATCTAGAGCTCTCTACAAAGGGATGAAGGTTGGAGCCACTC  3106

Query  3524  CGGATCTGATGGTTGCATACATAGATTTCTTCCTTGGCGGTGACGAGAAGCGTGTAGATA  3583
             ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3107  CGGATCTGATGATTGCATACATAGATTTCTTTCTTGGCGGTGACGAGAAGCGTGTAGATA  3166

Query  3584  TGGTCTCTATTATACAGAAAAGATTCCCAATGTGCATACTTTTTGGAGGAGATGGAAGTT  3643
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3167  TGGTCTCCATTATACAGAAAAGATTCCCAATGTGCATACTTTTTGGTGGAGATGGAAGTT  3226

Query  3644  ATATGTCACCCTATAGTCTCCATAGTGATACACTGTTAACAAATCTTCTTGGCCAGCACA  3703
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3227  ATATGTCACCTTATAGTCTCCATAGTGATACACTATTAACAAATCTTCTTGGCCAGCACA  3286

Query  3704  TCCCACCGAGTGTTTGGCACCGGTTTGTTGCTGGTTTAAATGCTCAGCTTAGGACTGTGA  3763
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3287  TCCCACCAAGTGTTTGGCACCGGTTTGTTGCTGGTTTAAATGCTCAGCTTAGGACTGTGA  3346

Query  3764  GGCACGGATCAATTCGGTCAGCATTACTTCCTGTCATTAGGTGGATAAACAGCCATGGAA  3823
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3347  GGCACGGATCAATTCGTTCAGCATTACTTCCTGTCATTAGGTGGATAAACAGTCATGGAA  3406

Query  3824  ATCCTCAACTCGAATTCCATGGAGTAAGAATTGAACTTGGATGGTTTCAAGCTACAGCTT  3883
             ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3407  ATCCTCAGCTAGAATTCCATGGAGTAAGAATTGAACTTGGATGGTTTCAAGCTACAGCTT  3466

Query  3884  CTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTTCCTCTGAACACTGTAA  3943
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  3467  CTGGATATTACCAACTTGGTATCTTGGTTTTTGTTGGCGATTTTCCTCTGAGCACTGTAA  3526

Query  3944  ACAGATCACTGTCGTTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCCCCTGGGAACAACTCTGCATGTC  4003
              | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||
Sbjct  3527  CCCGATCACTTTCGTTCAGCAGAAGTGACGACGAGTCACCTCGGAACAGCTCTGCATGTC  3586

Query  4004  CAAGCAAATCTCTTATCGAGTTGCAGCAAAACTTGATCCAACCAGGACATGGATTATCTC  4063
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3587  CCAGCAAATCTCTTATCGAGTTGCAGCAAAACTTGATCCAACCAGGACATGGATTATCTC  3646

Query  4064  GGAAGAGGATCAATGGTGGAATCAATGGAGGCCTCATCAATGAGATTTCACTAGAATCTT  4123
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3647  GGAAGAGGATCAATGGTGGAATCAATGGAGGCCTCATCAATGAGATTTCACTAGAATCTT  3706

Query  4124  TGGAGTATCGAAGGGATTTACTTTTTCCATTTTCTCTCTTATTGAACAACACTCGACCTG  4183
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3707  TGGAGTACCGAAGGGATTTACTTTTTCCATTTTCTCTCTTATTGAACAACACTCGACCTG  3766

Query  4184  TTGGGCGTCAGGATACTCTTCTCCGTTTTATTTCCATCCTTCTCCTTGCTGATCTTTCAG  4243
             |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3767  TTGGGCGTCAGGATACTCTTCTCCGTTTGATCTCCATCCTTCTCCTTGCTGATCTTTCAG  3826

Query  4244  TTACGCTACTTGCATTACTTCAGTTCTATTGGCTTGCCCTTGCAGCCTTTCTTGCTATCC  4303
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct  3827  TTACGCTACTTGCATTACTTCAGTTCTATTGGCTTGCCATTGCAGCCTTTCTCGCTATCC  3886

Query  4304  TCCTGATTCTCCCTCTCTCCCTTCTTTGCCCATTCCCTGCCGGCCTTAACGCTTTATTAA  4363
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3887  TCCTGATTCTCCCTCTCTCCCTGCTTTGCCCATTCCCTGCCGGCCTTAACGCTTTATTAA  3946

Query  4364  GTAAAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATCTACGGCCTGTGGAATGCTACATCTC  4423
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3947  GTAAAGAAATGAGAAGAGCCTCACTTACTCGTATCTATGGCCTTTGGAATGCTACATCTC  4006

Query  4424  TAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCCGGGTTTTTCACTGACG  4483
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4007  TAACAAACGTCATTGTGGCTTTCATTTGCGGTGTCATTCATTCCGGGTTTTTCACTGACG  4066

Query  4484  AGCTACCAAACATCTGGAACGCCATAAGGGATGATGATAAATGGTGGGTATTACCAACA-  4542
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| 
Sbjct  4067  AGCTACCAAACATCTGGAACGCCATAAGGGATGATGATAGATGGTGGGTGTTACCAACAG  4126

Query  4543  TTCCTCTTGTTACTCAAGTCAATACAAGCTCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTA  4602
             ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4127  TTC-TCCTGTTACTCAAGTCAATACAAGCCCGGTTCCTTGATTGGCACGTCGCAAATCTA  4185

Query  4603  GAAGTACCAGACTTTTCTCTTCTTTGTCCAGATCCAGATACCTTCTGGGCATATGAATCT  4662
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  4186  GAAGTACCGGACTTTTCTCTTCTTTGTCCAGATCCAGATACCTTCTGGGCTTATGAATCT  4245

Query  4663  GGAGCTTGACCATCAACATGATTATAAAGAAAGACCAGCAAAAGATATATCTTATTTTTC  4722
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||
Sbjct  4246  GGAGCTTGACCATCAACATGATTATAAAGAAAGACAAGCAAAAGGTATATCATATTTTTC  4305

Query  4723  ATGTAAATCTTTTAAAA-GTACAAAGTTCTTCTCGGTGATAGTTGTTAAAAACAGTTCTC  4781
             ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4306  ATGTAAATCTTTTAAAAAGTACAAAGCTCTTCTCAGTGATAGTTGTTAAAAACAGTTCTC  4365

Query  4782  TAGAACATCTGGTTATATATCTGGTGCTGAATTAGGAGTTC-GCCAGATCAATGGTAGTT  4840
             |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||
Sbjct  4366  TAGAACATCTGGTTATATTTCTGGTGCCGAATTAGG-GTTTTGCCAGATCAATGGTAGTT  4424

Query  4841  GTAGAAA  4847
             |||||||
Sbjct  4425  GTAGAAA  4431



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 185226207791


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5