BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G49030.1 Length=3600 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg494966 jgi|Araly1|494966|fgenesh2_kg.8__782__AT5G49030.1 5445 0.0 > Ahg494966 jgi|Araly1|494966|fgenesh2_kg.8__782__AT5G49030.1 Length=3740 Score = 5445 bits (2948), Expect = 0.0 Identities = 3287/3448 (95%), Gaps = 33/3448 (1%) Strand=Plus/Plus Query 5 AGTTCTGAGGTTTGGTTTTAGTTTCAACTTTTCAGTTAT-C-CACACACATA-CACACAT 61 ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| || Sbjct 3 AGTTCTGAGGTTTGGTTCTAGTTTCAAC-TTTCAGTTATCCACACACACATATTACATAT 61 Query 62 --AC---G-CTTCCCTGAATTTGGTGACGTTAG------T-CTTC-TTCCTTCCTTCTCA 107 || | ||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| Sbjct 62 ACACAAAGCCTTCCCTGAGTTTGGCGACGTTAGTCTTCTTCCTTCTTTCCTTCCTTCTCA 121 Query 108 CTCTTTGTTTCG-C-----CGTGAAAATGAGCTCTGATAGATAGAAGCGACAGAGAGAAA 161 ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 122 ATCTTTGTTTCGCCGATAGCGTGGAAATGAGCTCTGAGAGATAGAAGCGTTAGAGAGAAA 181 Query 162 CTTGAAGCAGATGTCGTCTTTCTTCAAATCCTTCGCGGGAAATCCCAGGGAAGCTGCTGC 221 |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 182 ATTGAAGAAGATGTCTTCTTTCTTCAAATCCTTTGCGGGTAATCCCAGGGAAGCTGCTGC 241 Query 222 AATGGCGATGGTTCAATCTTCATCTTACAGAGTTTTGTCAGGTAAAAGTTGTTCAAATTT 281 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 242 AATGGCGATGGTTCAATCCTCATCTTACAGAGTATTGTCAGGTAGAAGTTGTTCAAATTT 301 Query 282 AAGGAGAAACACGCCGTTGGATTCTTTTCTTGCCAAGGGAAGGTCTTCC-GTCAAGGCTT 340 |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 302 AAGGAGGAATACGCCGTTGGATTCATTTCTTGCCAAGGGAAGGTC-TCCTGTCAAGGCTT 360 Query 341 TTTCATTCTTATATGTCTCACGGTTTTCAACTGAACCAAACAATGAGTTTGGTCATTCAT 400 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTTCATTCTTATATGTCTCAGGGTATTCAACTGAGCCAAACAATGAGTTTGGTCATTCAT 420 Query 401 CAAAACGAAGGTCTCGTGGGCCTGTTATGGCAGCCAAGAAAGCATCTGAAGGGGAAAAGC 460 |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 421 CAAAGCGAAGGTCTCGTGGGCCTGTTATGGCGGCAAAGAAAGCATCCGAAGGGGAAAAGC 480 Query 461 AAGAAGATGGAAAGTACAAGCAAACGGTTGATTTGCCAAAGACTGGTTTTGGTATGAGAG 520 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 481 AAGAAGATGGGAAGTACAAGCAAACGGTTGATTTGCCAAAGACAGGTTTTGGTATGAGAG 540 Query 521 CGAATTCTTTGACAAGGGAACCTGAACTCCAGAAGTTGTGGGAAGAGAACCAGGTCTTCA 580 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 541 CGAATTCTTTGACAAGGGAACCTGAACTCCAGAAGTTGTGGGACGAGAACCAGGTCTTCA 600 Query 581 AGAGAGTTTCTGATAATAACAATGGAGGGAGTTTCATTCTTCATGATGGTCCTCCTTATG 640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AGAGAGTTTCTGATAATAACAATGGAGGGAGTTTCATTCTTCATGATGGTCCTCCTTATG 660 Query 641 CCAATGGTGATCTGCATATGGGTCATGCTCTTAACAAGATACTGAAGGATATCATTAATC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CCAATGGTGATCTGCATATGGGTCATGCTCTTAACAAGATACTGAAGGATATCATTAATC 720 Query 701 GCTATAAGCTGCTCCAAAACTATAAAGTTCAGTACGTTCCTGGGTGGGATTGCCATGGCC 760 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GCTATAAGCTGCTCCAAAACTATAAAGTTCAGTACGTTCCTGGGTGGGATTGCCATGGCC 780 Query 761 TTCCAATTGAGTTGAAAGTTCTGCAGTCCCTGGATCAGGAAGTAAGAAAGGAACTTACAC 820 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTCCAATTGAGTTGAAAGTTCTGCAGTCCCTGGATCAGGAAGTAAGAAAGGAACTTACAC 840 Query 821 CATTAAAATTAAGGGCAAAGGCGGCGAAATTTGCAAAAGCAACAGTCAAAACACAAATGG 880 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CATTAAAATTAAGGGCAAAGGCGGCGAAATTTGCAAAAGCAACAGTCAAAACACAAATGG 900 Query 881 AATCATTTAAGCGATTTGGAGTATGGGCAGACTGGAACAATCCTTATCTAACTCTTGATC 940 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AATCATTTAAGCGGTTTGGTGTATGGGCAGACTGGAACAATCCTTATCTAACTCTTGATC 960 Query 941 CGGAATATGAAGCAGCTCAGATTGAAGTATTTGGCCAGATGGCCTTGAAAGGGTACATTT 1000 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 961 CGGAATATGAAGCAGCCCAGATTGAAGTATTTGGCCAGATGGCCTTGAAAGGGTACATCT 1020 Query 1001 ATAGAGGTAGGAAACCAGTTCACTGGAGCCCTTCATCTCGGACTGCTCTTGCAGAAGCTG 1060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 ATAGAGGTAGGAAACCAGTTCACTGGAGCCCTTCATCTCGGACTGCTCTTGCAGAAGCTG 1080 Query 1061 AACTAGAGTATCCGGAGGGTCATATTTCCAAAAGCATATATGCTATTTTTAAATTGGTTG 1120 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 1081 AATTAGAGTATCCGGAGGGTCATATTTCCAAAAGCATATATGCTATTTTCAAAGTGGTTG 1140 Query 1121 GTGGAGCGAAAACAAGCCTTTTAGATGAGTTTATCCCTAATATATACTTGGCAGTATGGA 1180 | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1141 GCGGAGCGAAAACAAGCCTTTTAGATGAGTTTGTCCCTAATATATGCTTGGCAGTATGGA 1200 Query 1181 CAACTACACCTTGGACTATGCCAGCCAATGCTGCTGTCGCGGTGAATGCAAAGCTTCAGT 1240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 CAACTACACCTTGGACTATGCCAGCCAATGCTGCTGTCGCGGTGAATGCAAAGCTTCAGT 1260 Query 1241 ACTCTGTTGTGGAAGTGCAGTCATTCTCAGAAGATGAATCAACAGTGACAAGCAATAAAA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| Sbjct 1261 ACTCTGTTGTGGAAGTGCAGTCATTCTCAGAAGATGAATCTGCTGTGACAGGCAATAAAA 1320 Query 1301 AGAAAATTCCCGGGAAGGTTCTAAAGAATCAACAAAAGCTTTTCGTGATTGTAGCGACCG 1360 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 AGAAAATGCCTGGGAAGGTTCTAAAGAATCAACAAAAGCTTTTCGTGATTGTAGCGACCG 1380 Query 1361 ACCTTGTGCCAGCATTAGAAGCGAAATGGGGTGTGAAGCTTAGCATAAGTAAAACATTCC 1420 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1381 ACCTTGTGCCAGCATTAGAAGCGAAATGGGGTGTCAAGCTTATCATAAGTAAAACATTCC 1440 Query 1421 TTGGTTCAGATCTTGAAAACTGCAGGTACACTCATCCCATTGACAACAGAGACTGTCCAG 1480 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 1441 TTGGTTCAGATCTTGAAAACTGCAGGTACACACATCCAATTGACAACAGGGACTGTCCAG 1500 Query 1481 TCGTTATAGGGGGTGATTACATAACTACAGAATCTGGAACAGGGTTGGTCCACACTGCCC 1540 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 TCGTTATAGGGGGTGATTACATAACTACGGAATCTGGAACAGGGTTGGTCCACACTGCCC 1560 Query 1541 CTGGTCATGGTCAGGAGGATTATGCAACTGGCCTGAAGTACGGGCTGCCTCTTGTCTCTC 1600 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct 1561 CTGGTCATGGTCAGGAGGATTATGCAACCGGCCTGAAGTATGGGCTGCCTCTTATCTCTC 1620 Query 1601 CGGTGGATGATGAAGGAAAGTTCACTGAAGAAGCTGGACAG-TTTAGAGGGCTCTCTGTC 1659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| Sbjct 1621 CGGTGGATGATGAAGGAAAGTTCACTGAAGAAGCTGGA-AGGTTTAGAGGGCTCTCCGTC 1679 Query 1660 CTTGGAGAAGGGAATACCGCTGTTGTCAGTTACCTGGATGAAAATATGTCTCTGGTCATG 1719 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 CTTGGAGAAGGGAATAGTGCTGTTGTCAGTTACCTGGATGAAAATATGTCTCTGGTCATG 1739 Query 1720 GAAGAATCTTATGCTCATAAATACCCATATGATTGGCGAACTAAGAAACCGACGATATTT 1779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1740 GAAGAATCTTATGCTCATAAATACCCATATGATTGGCGAACTAAGAAACCTACGATATTT 1799 Query 1780 AGAGCGACTGAGCAGTGGTTTGCATCGGTTGAAGGGTTTCGCACAGCCACAATGGATGCA 1839 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1800 AGAGCGACTGAGCAGTGGTTTGCATCAGTTGAAGGGTTTCGCACGGCCACAATGGATGCA 1859 Query 1840 ATCAACAATGTAAAATGGGTACCACATCAGGCAGTAAACAGAATATCTGCCATGACTTCC 1899 |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1860 ATCAACAATGTAAAATGGGTACCAGATCAGGCGGTAAACAGAATATCTGCCATGACTTCC 1919 Query 1900 AGTCGATCTGATTGGTGCATCTCAAGACAAAGGACATGGGGTGTCCCTATTCCTGCTTTT 1959 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 1920 AGTCGATCTGATTGGTGCATCTCGAGACAAAGGACATGGGGGGTCCCTATTCCTGCCTTT 1979 Query 1960 TATCATGTTAAGACAAAAGAACCACTCATGAATGAAGAGACAATCAACCATGTTAAATCT 2019 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1980 TATCATGTTAAGACAAAAGAACCCCTCATGAATGAAGAGACAATTAACCATGTTAAATCT 2039 Query 2020 ATAATTTCCCAAAAGGGTAGTGATGCGTGGTGGTATATGTCAGTGGAAGACCTACTTCCT 2079 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2040 GTAATTTCCCAAAAGGGTAGTGATGCGTGGTGGTATATGTCAGTGGAAGACCTACTTCCT 2099 Query 2080 GAGAAATATCGTGATAAAGCAGCTGATTATGAAAAGGGGACTGATACGATGGACGTCTGG 2139 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2100 GAGAAATATCGTGATAAAGCAGCTGATTATGAAAAAGGGACTGATACAATGGACGTCTGG 2159 Query 2140 TTTGACTCAGGATCTTCTTGGGCTGGTGTATTAGGGAAACGCGAAGGTCTTAGTTTCCCT 2199 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 2160 TTCGACTCAGGATCTTCTTGGGCTGGTGTATTGGGGAAACGTGAGGGTCTTAGTTTCCCT 2219 Query 2200 GCAGACGTGTATCTAGAAGGTACAGATCAGCATCGTGGATGGTTCCAAAGTTCTTTGTTA 2259 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2220 GCAGACGTGTATCTAGAGGGTACAGATCAGCATCGTGGATGGTTCCAGAGTTCTTTGTTA 2279 Query 2260 ACAAGCATCGCAACGCAAGGAAAAGCCCCCTATTCTGCTGTTATAACACATGGATTTGTA 2319 |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2280 ACAAGCATCGCAACACAAGGAAAAGCTCCATATTCTGCTGTTATAACACATGGATTTGTA 2339 Query 2320 TTGGATGAGAAGGGTATGAAAATGAGCAAGTCTCTAGGTAACGTAGTGGACCCACGTTTG 2379 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2340 TTGGATGAGAAGGGTATGAAAATGAGCAAGTCTCTAGGTAATGTAGTGGACCCACGTTTG 2399 Query 2380 GTCATTGAAGGAGGGAAAAATTCAAAGGACGCACCTGCTTACGGAGCTGATGTTATGCGT 2439 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2400 GTCATTGAAGGAGGGAAAAATTCAAAGGACGCACCTGCTTATGGAGCTGATGTTATGCGT 2459 Query 2440 CTTTGGGTTTCTAGTGTAGATTACACAGGGGATGTACTAATAGGTCCCCAGATTCTTCGT 2499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 2460 CTTTGGGTTTCTAGTGTAGATTACACAGGGGATGTACTGATAGGTCCTCAGATTCTTCGG 2519 Query 2500 CAAATGTCTGATATATATAGGAAGTTAAGGGGAACGTTAAGATACCTCTTGGGAAATCTT 2559 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 2520 CAAATGTCTGATATATATAGGAAGTTGAGGGGAACGTTAAGATATCTCTTGGGCAATCTT 2579 Query 2560 CATGATTGGAGAGTTGATAATGCTGTTCCATACCAGGATTTACCTATCATTGATCAGCAT 2619 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2580 CATGATTGGAGAGTTGATAATGATGTTCCATACGAGGATTTACCTATCATTGATCAGCAT 2639 Query 2620 GCTCTCTTTCAGCTTGAGAATGTTGTAAAGAATATACAAGAATGTTACGAGAACTACCAG 2679 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2640 GCTCTCTTTCAGCTTGAGAATGTTGTAAAGAACATACACGAATGTTACGAGAACTACCAG 2699 Query 2680 TTCTTTAAAATATTCCAGATCATACAACGATTCACAATTGTTGATCTGTCAAATTTCTAC 2739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2700 TTCTTTAAAATATTCCAGATCATACAACGATTCACAATTGTTGATCTGTCAAATTTCTAC 2759 Query 2740 TTCGATATAGCTAAAGATAGACTGTATACTGGGGGTACTTCAAGTTTTACCAGAAGAAGC 2799 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2760 TTCGATATTGCTAAAGATAGACTGTATACTGGGGGCACTTCAAGTTTTACCCGAAGAAGC 2819 Query 2800 TGTCAAACAGTTCTTTCAACACATCTTTTATCCATATTGAGAGTGATTGCTCCAATCGTA 2859 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2820 TGTCAAACAGTTCTTTCAACACATCTTTTATCCATATTGAGAGTGATTGCTCCGATAGTA 2879 Query 2860 CCTCACCTAGCGGAAGATGTCTGGCAGAATCTTCCATTTGAGTACAGAAATGAAGATGGC 2919 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2880 CCTCACCTAGCAGAAGATGTCTGGCAGAATCTTCCATTTGAGTACAGAAATGAAGATGGC 2939 Query 2920 TCTGCAGCAGAATTTGTCTTCGAACTTAAATGGCCTACTTTGAATGAACAATGGCTTTCA 2979 ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| Sbjct 2940 TCTGCAGCAAAATTCGTCTTCGAACTTAAATGGCCTACAGTGAACGAACAATGGCTCTCA 2999 Query 2980 TTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGCAAAGGCTTCTCGAGTTGAGGACTGAGG-TGAA 3038 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||| Sbjct 3000 TTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGCAAAGGCTTCTCC-G--G-GGACCGAGGGTGAA 3055 Query 3039 CAAAGTGCTGGAGCTAGCACGTAATGAGAAAATGATTGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGT 3098 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3056 CAAAGTGCTGGAGCTCGCACGTAATGATAAAATGATTGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGT 3115 Query 3099 GTATTTGCATACTGCAGATGCAGGCATGGCTGCAAAATTACTAGAGATGAGTGAAGCAAA 3158 |||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3116 GTATCTGTACACTGCAGATGCAGGAATGGCTACAAAATTACTAGAGATGAGTGAAGCAAA 3175 Query 3159 GAACGAGGCTGACACTCTGCAACGCATATTCATAACATCACAAGTTGAAGTATTGTCTTC 3218 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3176 GAACGAGGCTGACACTCTGCAACGCATATTCATAACATCACAAGTTGAAGTATTGCCTTC 3235 Query 3219 AATGGAGAAGGAGATGATAAGCAGTGTGCAACACACAGGAGAGTATGTGGAGGGAGAGAA 3278 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 3236 AATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTGCAACACACAGGAGAGTATGTAGAGGGAGATAA 3295 Query 3279 CAAAGTGTGGATTGGGGTGTCACGAGCCGAGGGGTCTAAGTGTGAGAGGTGCTGGAATTA 3338 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3296 GAAAGTGTGGATTGGTGTGTCACGAGCTGAGGGGTCCAAGTGTGAGAGGTGCTGGAATTA 3355 Query 3339 CTCGGGCCAGGTCGGATCATTTTCTGACCATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAGTGT 3398 ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3356 CTCGGGCCAGGTCGGGTCATTTTCCAACCATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAATGT 3415 Query 3399 CATTGTTGCTAATCCACCTGAGCCTGCA 3426 ||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 3416 CATTGTTGCTAATCCGCCTGAGCCAGCA 3443 Score = 375 bits (203), Expect = 9e-103 Identities = 244/264 (92%), Gaps = 2/264 (1%) Strand=Plus/Plus Query 3200 AAGTTGAAGTATTGTCTTCAATGGAGAAGGAGATGATAAGCAGTGTGCAACACACAGGAG 3259 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3478 AAGTTGAAGTATTGCCTTCAATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTGCAACACACAGGAG 3537 Query 3260 AGTATGTGGAGGGAGAGAACAAAGTGTGGATTGGGGTGTCACGAGCCGAGGGGTCTAAGT 3319 ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 3538 AGTATGTAGAGGGAGATAAGAAAGTGTGGATTGGTGTGTCACGAGCTGAGGGGTCCAAGT 3597 Query 3320 GTGAGAGGTGCTGGAATTACTCGGGCCAGGTCGGATCATTTTCTGACCATCCTACTCTCT 3379 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3598 GTGAGAGGTGCTGGAATTACTCGGGCCAGGTCGGGTCATTTTCCAACCATCCTACTCTCT 3657 Query 3380 GTGGACGCTGCTTCAGTGTCATTGTTGCTAATCCACCTGAGCCTGCAGTTGCAGC-TGTG 3438 ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | || Sbjct 3658 GTGGACGCTGCTTCAATGTCATTGTAGCTAATCCGCCTGAGCCAGCAGTTGCAGCCT-TG 3716 Query 3439 AACAGCTTAGCCTAAAATTTGCTC 3462 | ||||| ||||| |||||||||| Sbjct 3717 ATCAGCTCAGCCTGAAATTTGCTC 3740 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 135979708329 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5