BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G53440.1
Length=3546
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg916985 jgi|Araly1|916985|Al_scaffold_0008_1736 4785 0.0
Ahg908255 jgi|Araly1|908255|Al_scaffold_0002_1336 224 3e-57
> Ahg916985 jgi|Araly1|916985|Al_scaffold_0008_1736
Length=3513
Score = 4785 bits (2591), Expect = 0.0
Identities = 2992/3183 (94%), Gaps = 37/3183 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCCAAGGAGTACGAGGCATAAATCGAGTAAGCATAAAGATGCGACGAAGGAGTATTCC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1 ATGCCAAGGAGTACGAGGCATAAATCGAGTAAGCATAAAGATGCGACGAAGGATTACTCT 60
Query 61 GATTCGGAGAAAGAGACGAGTTTGAAGGAGAAGAAGAGTAAAGAGGAGAGTAGTACTACT 120
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
Sbjct 61 GATTCGGAGAAAGAGACGAGTGTGAAGGAGAAGAAGAGTAAAGAAGAGAGTAGTGCTAGT 120
Query 121 GTTAGGGTTTCGAAGGAATCTGGTTCTGGTGATAAGA-GAAAAGAGTATTATGATTCTGT 179
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTAGGGTTTCGAAGGAGTCTGGTTCTGGTGATAA-ACGAAAAGAGTATTATGATTCTGT 179
Query 180 TAATGGTGAGTATTATGAGGAGTATACTTCTTCTTCGTCGAAGCGTAGGAAAGGGAAGAG 239
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TAATGGTGAGTATTATGAAGAGTATACTTCTTCTTCGTCGAAGCGTAGGAAAGGGAAGAG 239
Query 240 TGGTGAGAGTGGTAGTGATAGGTGGAATGGTAAAGATGATGATAAAGGTGAGAGTTCGAA 299
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 240 TGGTGAGAGTGGTAGTGATAGGTGGAATGGTAAGGATGATGAGAAAGGCGAGAGTTCGAA 299
Query 300 GAAGACGAAGGTTTCgagtgagaagagtaggaagagagatgagggagatggtgaggagac 359
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GAAGACGAAGGTGTCGAGTGAGAAGAGTAGGAAGAGAGATGAGGGAGATGGTGAGGAGAC 359
Query 360 gaagaagagTAGTGGTAAAAGTGATGGGAAGCATAGAGAGTCTAGTAGAAGGGAGAGTAA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GAAGAAGAGTAGTGGTAAAAGTGATGGGAAGCATAGAGAGTCTAGTAGAAGGGAGAGTAA 419
Query 420 AGATG-TTGATAAGGAGAAAGATAGGAAGTATAAAGAAGGGAAAAGTGACAAGTTTTATG 478
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 AGA-GATTGATAAGGAGAAAGATAGGAAGTATAAAGATGGGAAAAGTGACAAGTTTTATG 478
Query 479 ATGGTGATGATCATCATAAGTC--CAAAG-CTGGTTCTGATAAAACTGAATCAAAAGCTC 535
|||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 ATGGTGATGATCATCATAAGTCTGCTAAGGCTGGTTCTGATAAAACTGAATCAAAAGCTC 538
Query 536 AGGATCATGCAAGGAGTCCAGGTACAGAAAATTATACTGAGAAGCGATCAAGGCGTAAGA 595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 539 AGGATCATGCAAGGAGTCCAGGTACAGAAAATTATACTGAGAAGAGATCAAGGCGTAAGA 598
Query 596 GGGATGATCATGGTACTGGAGACAAGCATCACGATAACAGTGATGACGTTGGTGACAGGG 655
|||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 599 GGGAGGATCATGGTACTGGAGACAAGCACCAAGATAACAGTGATGATGTTGGCGACAGGC 658
Query 656 TTCTCACTTCTGGAGATGACTACATTAAAGATGG-AAAGCATAAGGGGGAGAAAAGCAGA 714
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TTCTCACTTCTGGAGATGACTACATTAAAGATGGGAAA-CATAAGGGGGAGAAAAGCAGA 717
Query 715 GATAAATATCGGGAAGACAAAGAAGAAGAAGACATCAAACAGAAAGGTGACAAGCAGAGA 774
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 718 GATAAATATCGGGAAGACAAAGAAGAAGA---CATCAAACAGAAAGGTGACAAGCAGAAA 774
Query 775 GATGACCGACCTACTAAAGAACATCTGAGGTCTGATGAAAAGCTCACTC-GAGATGAGAG 833
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||
Sbjct 775 GATGACCGACCAACTAAAGAACATCCGAGGTCTGATGAAAAGCTCA-TCCGAGATGAAAG 833
Query 834 TAAAAAGAAATCTAAATTTCAGGATAATGACCATGGTCATGAGCCTGACAGTGAACTTGA 893
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 TAAAAAGAAATCTAAATTCCAGGATAATGACCATGGTCATGAGCCTGACAGTGAACTTGA 893
Query 894 TGGATATCATGAACGTGAACGCAATCGGGACTATGATAGAGAAAGTGACCGAAATGAACG 953
|||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 TGGATACCATGATCGTGAACGCAATCGAGATTATGATAGAGAAAGTGACCGAAATGAACG 953
Query 954 GGACCGCGAAAGAACTAGGGATCGTGATCGTGATTATGAGCGAGATAGGGACCGTGATCG 1013
|||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 GGACCGCGAACGAGTTCGGGATCGGGATCGTGATTATGAGCGAGATAGGGACCGTGATCG 1013
Query 1014 AGATAGGGATCGGGAACGTGATCGCGATCGACGGGATTATGAGCATGATCGTTACCATGA 1073
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 AGATAGGGATCGAGAACGTGATCGCGATCGACGAGATTATGAGCATGATCGTTACCATGA 1073
Query 1074 CCGGGATTGGGACCGTGATAGGAGTAGAGATCGTGACCGGGATCATGAGAGGGACAGGAC 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1074 ACGGGATTGGGACCGTGATAGGAGTAGAGATCGTGACCGGGATCATGATAGGGACAGGAC 1133
Query 1134 TCATGACAGAGAAAAAGATCGTAGTCGTGACTATTATCATGATGGGAAACGGAGTAAAAG 1193
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1134 ACATGACAGAGAAAAAGACCGTAGTCGTGACTATTATCATGATGGGAAACGAAGTAAAAG 1193
Query 1194 CGACCGTGAAAGGGATAATGATCGTGATGTGTCGCGTCTAGATGATCAAAGTGGTCGGTA 1253
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 TGACCGAGAAAGGGATAATGATCGTGATGTGTCGCGTCTAGATGATCAAAGTGGTCGGTA 1253
Query 1254 TAAGGATAGGAGGGACGGTAGGAGGTCTCCAGATTATCAGGATTATCAGGACGTAATCAC 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1254 TAAGGATAGGAGGGACGGTAGGAGGTCTCCAGATTATCAGGATTATCAGGAGGTAACCAT 1313
Query 1314 GGGCTCAAGGAGTAGCAGAGTAGAGCCTGATGGTGATATGACAAGACCAGAGCGTCAACT 1373
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1314 GGGCTCTAGGAGTAGCAGAGCAGAGCCTGATGGTGATATGACAAGATCAGAGCGTCAACT 1373
Query 1374 TTCCAGTTCAGTGGTTCAAGAAGAAAATGGGAATGC-CTCAGATCAGATAACTAAAGGGG 1432
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||
Sbjct 1374 TTCCAGTTCGGTGGTTCAAGAAGAAAATGGGAATGTGC-CAGACCAGATAACGAAAGGGG 1432
Query 1433 CTTCTTCAAGGGAGGTGGCTGAGTTGTCTGGAGGATCAGAGAGAGGA-ACAAGACAAAAA 1491
||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||
Sbjct 1433 CTTCTTCTAGGGAGGCGGCTGAGCTGTCTGGAGGATCGGAGAGAG-ATACAAGACATAAA 1491
Query 1492 GTTTCTGAGAAAACAGCAAATATGGAAGATGGTGTTTTGGGCGAGTTTCCGGCTGAAAGG 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 GTTTCTGAGAAAACAGCAAATATGGAAGATGGTGTTTTGGGCGAGTTTCCGGCTGAAAGG 1551
Query 1552 TCTTTTGCCGCAAAAGCTTCACCCCGACCAATGGTTGAAAGATCTCCCTCTTCAACTAGT 1611
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1552 TCTTCTGCCGCAAAAGCTTCACCCCGGCCAATGGTTGAAAGATCTCCCTCTTCGACTAGT 1611
Query 1612 CTTGAGCGGAGGTACAACAATCGTGGTGGTGCAAGACGGAGTATTGAGGTTGAAGAAACA 1671
||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||
Sbjct 1612 CTTGACCGGAGATACAACAATCGCGGTGGTCCAAGACGAAGTCTCGAGGTTGAAGAAACA 1671
Query 1672 GGTCATAGGAACAACGCTAGGGATTATTCAGCAACGGAGGAGGAAAGGCATCTGGTAGAT 1731
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1672 GGTCATAGGAACAATGCTAGGGATTATTCAGCAACTGAGGAGGAAAGGCTTCTGGTAGAT 1731
Query 1732 GAGACGTCCCAGGCAGAATTATCCTTTAACAATAAAGCCAACCAGAACAATTCTTCTTTC 1791
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1732 GAGACATCCCAGGCAGAATTATCCTTTAACAATAAAGCCAACCAAAACAATTCTTCTTTC 1791
Query 1792 CCTCCACGACCTGAATCTAGGAGTGGCGTTAGTAGCCCTAGAGTGGGCCCTCGAGAAGAG 1851
|||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1792 CCTCCACGACCTGAATCTAGGAGT------AGT--CC-TAGAGTTGGCCCTCGAGAAGAA 1842
Query 1852 GATAACAGGGTCAATACTGGTGGACGCTATAAGAGAGGCGGTGTTGATGCGATGATGGGA 1911
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1843 GATAACAGGGTCAATACTGGTGGACGTTATAAGAGAGGCGGCGTTGATGCGATGATGGCA 1902
Query 1912 AGAGGGCAAAGTAATATGTGGAGAGGTGTCCCAAGCTGGCCATCTCCACTCTCCAATGGA 1971
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1903 AGAGGGCAAGGTAATATGTGGAGAGGTGTCCCAAGCTGGCCATCTCCACTTTCAAATGGA 1962
Query 1972 TATTTTCCATTTCAACACGTTCCACCTCATGGAGCTTTCCAAACTATGATGCCACAATTC 2031
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 TATATTCCATTTCAACACGTTCCACCTCATGGAGCTTTCCAAACTATGATGCCACAATTC 2022
Query 2032 CCATCTCCAGCTCTCTTTGGGGTGAGACCTTCAATGGAAATGAACCATCAGGGAATCTCT 2091
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2023 CCATCTCCATCTCTCTTTGGGGTGAGGCCTTCAATGGAAATGAACCATCAGGGAATCCCT 2082
Query 2092 TACCATATACCCGATGCTGAGAGGTTCTCTGGTCACATGCGTCCACTTGGGTGGCAGAAT 2151
||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 TACCATATACCTGACGCTGAGAGGTTCTCTGGGCACATGCGTCCACTTGGGTGGCAGAAT 2142
Query 2152 ATGATGGACAGTTCAGGCGCTTCTCACATGCATGGtttttttGGGGATATGAGTAATAGT 2211
|| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2143 ATTATGGATGGCTCAGGCGCTTCTCACATGCATGGTTTTTTCGGGGATATGAGTAATAGT 2202
Query 2212 GTT---AGGGATGAATCAAACATGTATGGGGGATCTGAATGGGACCAAAACAGGCGGATG 2268
||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||
Sbjct 2203 GTTTTCAGGGATGAATCAAACATGTATGGGGGCTCCGAGTGGGATCATAACAGGCGGATG 2262
Query 2269 AATGGCCGGGGCTGGGAATCTGGTGCAGATGAATGGAAAAGTCGAAATGGAGATGCGAGC 2328
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2263 AATGGCAGGGGCTGGGAATCTGGTGCAGATGAATGGAAAAATCGAAATGGAGATGCGAGC 2322
Query 2329 ATGGAAGTCTCATCAATGTCTGTTAAAGATGATAACTCAGCTCAGGTTGCTGATGATGAG 2388
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 ATGGAAGTCTCATCAATGTCTGTCAAAGACGATAACTCAGCTCAGGTTGCTGATGATGAG 2382
Query 2389 TCTCTTGGCGGCCAAACAAGCCACTCTGATAATAACAGGGCAAAAAGCGTTGAAGCTGGG 2448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2383 TCTCTTGGCGGCCAAACAAGCCACTCTGATAATAACAGGGCAAAAAGTGTTGAAGCTGGG 2442
Query 2449 TCGAATCTAACATCTCCAGCAAAAGAACTGCATGCAAGTTCTCCTAAA-ACGATGGAGGA 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||
Sbjct 2443 TCGAATCTAACATCTCCAGCAAAAGAACTGCATGCAAATTCTCCTAAAGA-GATGGCGGA 2501
Query 2508 AGTTGCAGCTGACGATCCTGTTTCAGAAACAATTGATAACACTGAACGTTACTGCCGGCA 2567
|||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 AGTTGCAGCTGAAGATCATGTTACAGAAACAATTGATAACACTGAACGTTACTGCCGGCA 2561
Query 2568 TTATCTCTCAAAGCTTGATGTATCGGCAGGACTTGCTGATGCCGAGCTGCGTAAATGCAT 2627
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TTATCTCTCAAAGCTTGATGTATCGACAGGACTTACTGATCCCGAGCTGCGTAAATGCAT 2621
Query 2628 TAGTTTATTGATAGGCGAAGAGCATCTAGCAATGGATGACGGGACTGCTGTGTTTGTAAA 2687
||| |||||||| || ||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2622 TAGCTTATTGATGGGTGAAGAACATATAACAATTGATGACGGTACTGCTGTGTTTGTAAA 2681
Query 2688 TCTCAAGGAAGGTGGAAAGAGAGTGACCAAAAGCAACAGTAATTCCTTGAAGGCTCTTTC 2747
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2682 TCTCAAGGAAGGTGGGAAGAGAGTGCCCAAAAGCAACAGTACTTCCTTGATGGCTCTTTC 2741
Query 2748 AT-TGTTTCCATCTCAAAACAGTTCAGTGTTTCAGATTGCTATGGATTTCTACAAGGAGC 2806
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2742 -TCTGTTTCCATCTCAAAACAGTTCAGTGTTTCAGATAGCTATGGACTTCTACAAGGAGC 2800
Query 2807 AAAGATTTGAAATAAAGGGTCTTCCAAATGTCAAAAATCACGAGGCTCCTCAAGTGCCTC 2866
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2801 AAAGATTTGAAATAAAGGGTCTTCCAAATGTCAAAAATCACGAGCCTCTTCAAGTGCCTC 2860
Query 2867 CTTCCAACTTGGTTAAAGTTGAAAACAATGATGATCTGAATGATGCAAGGAATGGAAATA 2926
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2861 CTTCCAACTTGGTTAAAGTCGAAAACAATGATGATCTGAATGATGCAATGAAAAGAAATA 2920
Query 2927 GTTCAATTGAGGCAACAGATATGAAA-A--TTGCGGATGTATCAGATTCAGACACATCCC 2983
|||| |||||| || |||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2921 GTTCCATTGAGACATCAGAAATTAAAGAAGTTGCGGATGTATCAGATACAGACACATCCC 2980
Query 2984 AAAAGGAACTGCAAAAAGTGTCGTCAAATGCTGGTGCCAAAATGGAGACAGAAACACGAG 3043
||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2981 AAAAGGAACCGCAGAAGGTGTCGTCCAATGCTGGTGCCGAAATGGAGACAGAAACACAAG 3040
Query 3044 ATGAAGGATCTTCGTCTCCCAATCCAGACAATTCACCTGAGGCTCTAAATGCTGTGTCGT 3103
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 3041 ATGAAGGACCTTCGTCTCCCAATCCAGACAATTCACCTGAGGCTCTAAAAGCTGTGGCGT 3100
Query 3104 CAGATCACATTGAAGGTTCTGAGGAAGCTATGGCTTCAGATCACATTGAAGGTTCTGAGG 3163
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 3101 CAGATCACATTGAAGGTTATGAGGAAGCTGTGGCTTCAGACCACATTGAAGGTGATGAGC 3160
Query 3164 AAG 3166
|||
Sbjct 3161 AAG 3163
Score = 636 bits (344), Expect = 0.0
Identities = 399/425 (94%), Gaps = 6/425 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3128 AAGCTATGGCTTCAGATCACATTGAAGGTTCTGAGGAAGCTGTGGCTTTAGACCACATTG 3187
||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3089 AAGCTGTGGCGTCAGATCACATTGAAGGTTATGAGGAAGCTGTGGCTTCAGACCACATTG 3148
Query 3188 AAGGTGATGAGCAAGAGGCTAAGCTAGATGATGGAGCTGGTGTAGACCAAACAATGGAGA 3247
||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3149 AAGGTGATGAGCAAGAGGCAAAGCCAGATGATGAAGCTGGTGTAGACCAAACAATGGAGA 3208
Query 3248 CAGCTCCTGAGCATGATGGTGTTCCAGAAGGTGATGCAGTTACCTTGACAGTAGCACCAC 3307
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3209 CAGCTCCTGAGCATGATGGTGTTCCAGAAGGTGATCCAGTTACCTTAACAGTAGCTTCAC 3268
Query 3308 CGACTCTCGAGGCTATGGATGTTGATGAGCGGAAAGATTTATCTGAAGATGAGAACATGG 3367
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3269 CGGCTCTCGTGGCTATGGATGTTGATGAGCGGAAAGATTTGTCTGAAGACAAGAACATGG 3328
Query 3368 AAGAAGCAGAAGAGAAGAAGGGAGCTAATGATGGTGAGGAAGCTGAAGCTGATGATGGTG 3427
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3329 AAGAAGCAGAAGAGAAGAAGGAAGCTAATGATGGTGAGGACGCTGAAGCTGATGATGGTG 3388
Query 3428 ATGGAGATGGA-A-G----TGTAGTTGTTGGGGATGTATCTCCGAAGGTAACCGAACCAT 3481
||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3389 ATGGAGATGGAGATGGAAGTGTAGTTGTTGGGGATGTATCTCCGAAGGTAACAGAACCAT 3448
Query 3482 TAGTTCATGAATCTGATGAGTCAGTAATAAGTCGGATACATCATTCACCCCAAAGTACAC 3541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3449 TAGTTCATGAATCTGATGAGTCAGTAATAAGTCGGATACATCATTCACCTCAAAGTACAC 3508
Query 3542 ATTAA 3546
|||||
Sbjct 3509 ATTAA 3513
> Ahg908255 jgi|Araly1|908255|Al_scaffold_0002_1336
Length=342
Score = 224 bits (121), Expect = 3e-57
Identities = 148/160 (93%), Gaps = 5/160 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 602 ATCATGGTACTGGAGACAAGCATCACGATAACAGTGATGACGTTGGTGACAGGGTTCTCA 661
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 70 ATCATGGTACTGGAGACAAGCATCAAGATAACAGTGATGATGTTGGCGACAGGCTTCTCA 129
Query 662 CTTCTGGAGATGACTACATTAAAGATGGAAAGCATAAGGGGGAGAAAAGCAGAGATAAAT 721
|||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 CTTCTGGAGATGACTACACTAAAGATGAAAA--ATAAGGGGGAGAAAAGCAGAGATAAAT 187
Query 722 ATCGGGAAGACAAAGAAGAAGAAGACATCAAACAGAAAGG 761
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 188 ATCGGGAAGACAAAGAAGAAGA---CATCAAACATAAAGG 224
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133924599387
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5