BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G60390.1 Length=1764 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1 2682 0.0 Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627 2012 0.0 Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1 1984 0.0 > Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1 Length=1599 Score = 2682 bits (1452), Expect = 0.0 Identities = 1553/1602 (97%), Gaps = 6/1602 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACATTTTCGTAGCCGCAAGACTCCTTTCAGATTCTTA 60 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACACTTTCGTAGCCGCAAGCCTCCTCTCAGATTCTTA 60 Query 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGAC 120 Query 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180 Query 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCA 240 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCA 240 Query 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTA 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTC 300 Query 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGAT 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGAT 360 Query 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420 Query 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480 Query 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCC 540 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCC 540 Query 541 ACCACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ACTACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600 Query 601 CTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAG 660 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| Sbjct 601 CTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAG 660 Query 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTT 720 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTT 720 Query 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCA 780 Query 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACT 840 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACC 840 Query 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900 Query 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960 Query 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCC 1020 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCC 1020 Query 1021 AAGGATGATCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCAC 1080 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1021 AAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCAC 1080 Query 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140 Query 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200 Query 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCC 1260 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCC 1260 Query 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATG 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCATTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATG 1320 Query 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380 Query 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTTCGTTATGATCGA 1440 |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGATGAGACTTTCGTTATGATGGA 1440 Query 1441 CTCTCTTATGGttttctttggttcttaaaactttgatggcgtttgagcctttttcttttt 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1441 CTCTCTTATGGTTTTCTTTGGTTCTTAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTTT-TTTT- 1498 Query 1501 tctctttatttctgtgactttct-ctctc--cctcctttttggatatctctgagactttt 1557 |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 -CTCTTTATTTCTATGACTTTCTTCTCTCTTCCTCCTTTTTGGATATCTCTGAGACTTTT 1557 Query 1558 tATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 TATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599 > Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627 Length=2856 Score = 2012 bits (1089), Expect = 0.0 Identities = 1264/1351 (94%), Gaps = 2/1351 (0%) Strand=Plus/Plus Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| Sbjct 1507 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 1566 Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188 |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || Sbjct 1567 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 1625 Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 1626 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 1685 Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308 ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| Sbjct 1686 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 1745 Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct 1746 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 1805 Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428 ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1806 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 1865 Query 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1866 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 1925 Query 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1926 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 1985 Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 1986 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 2045 Query 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668 ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2046 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 2105 Query 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2106 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 2165 Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2166 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 2225 Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2226 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 2285 Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2286 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 2345 Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2346 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 2405 Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028 ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct 2406 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 2465 Query 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088 || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2466 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 2525 Query 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2526 GATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 2585 Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2586 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 2645 Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268 ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2646 GTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 2705 Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGAC 1328 ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct 2706 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGAC 2765 Query 1329 CGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCAC 1388 ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2766 TGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTTAC 2825 Query 1389 CAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGA 1419 ||||||||| || ||||||||||| || ||| Sbjct 2826 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856 Score = 1986 bits (1075), Expect = 0.0 Identities = 1255/1344 (93%), Gaps = 4/1344 (0%) Strand=Plus/Plus Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| Sbjct 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60 Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188 |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || Sbjct 61 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119 Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179 Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308 ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| Sbjct 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239 Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299 Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428 ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359 Query 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419 Query 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479 Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539 Query 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668 ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599 Query 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659 Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719 Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779 Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839 Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899 Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028 ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959 Query 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088 || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019 Query 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTT 1079 Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1139 Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268 || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1140 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1199 Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCT-TTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327 ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||| Sbjct 1200 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGG-ACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGA 1258 Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387 | ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 1259 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1318 Query 1388 CCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTG 1411 |||||||||| || |||||||||| Sbjct 1319 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342 > Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1 Length=1522 Score = 1984 bits (1074), Expect = 0.0 Identities = 1260/1352 (93%), Gaps = 4/1352 (0%) Strand=Plus/Plus Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| Sbjct 6 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 65 Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188 || ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || Sbjct 66 TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 124 Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 125 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 184 Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308 ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| Sbjct 185 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 244 Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| Sbjct 245 TGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 304 Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 305 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 364 Query 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 365 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 424 Query 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 425 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 484 Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 485 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 544 Query 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668 ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 545 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 604 Query 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 605 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 664 Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 665 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 724 Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 725 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 784 Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 785 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 844 Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 845 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 904 Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028 ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct 905 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 964 Query 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088 || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 965 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1024 Query 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1025 GATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1084 Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1085 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1144 Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268 ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 1145 GTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGT 1204 Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCT-TTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327 ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||| Sbjct 1205 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGG-ACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGGCAGA 1263 Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387 | ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 1264 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1323 Query 1388 CCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGA 1419 |||||||||| || ||||||||||| || ||| Sbjct 1324 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1355 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 66200845810 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5