BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G67320.1 Length=2101 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg951489 jgi|Araly1|951489|scaffold_803376.1 3072 0.0 > Ahg951489 jgi|Araly1|951489|scaffold_803376.1 Length=1895 Score = 3072 bits (1663), Expect = 0.0 Identities = 1816/1889 (96%), Gaps = 14/1889 (1%) Strand=Plus/Plus Query 97 TAGGATTTGGCTGTGGAGATGTCTTCACTTACCTCCGTCGAATTGAATTTTCTGGTTTTC 156 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3 TAGGAATTGGCTGTGGAGATGTCTTCACTCACCTCCGTCGAATTGAATTTTCTGGTTTTC 62 Query 157 CGATATCTTCAGGAATCAGGGTTTACACACGCTGCATTCACTCTAGGTTATGAGGCAGGG 216 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 63 CGATATCTTCAGGAATCAGGGTTTACACACTCTGCATTCACTCTAGGTTATGAGGCAGGG 122 Query 217 ATTAATAAATCCAACATTGATGGGAATATGGTTCCACCTGGTGCTCTTATCAAATTTGTT 276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 123 ATTAATAAATCCAACATTGATGGGAATATGGTTCCACCTGGTGCTCTTATCAAATTTGTT 182 Query 277 CAGAAAGGTCTTCAGTACATGGAGATGGAAGCTAATTTGAGCAATAGTGAAGTGGACATT 336 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 183 CAGAAAGGACTCCAGTACATGGAGATGGAAGCTAATTTGAGCAATAGTGAAGTGGACATT 242 Query 337 GATGAGGATTTCTCATTCTTTCAACCCTTGGATCTGATTTCAAAGGATGTAAAGGAACTG 396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 243 GATGAGGATTTCTCATTCTTTCAACCCTTGGATCTGATTTCAAAGGATGTTAAGGAACTG 302 Query 397 CAGGATATGCTgagggaaaagaagaggaaagagagggatatggagaaggaaagagacaga 456 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 303 CAGGATATGCTGAGGGAAAAGAAGAGGAAAGAGAGGGATAGGGAGAAGGAAAGAGACAGG 362 Query 457 tctaaagaaaacgataaagGGGTTGAACGAGAACATGAAGGAGATCGCAACCGAGCTAAG 516 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 363 TCTAAAGAAAACGATAAAGAGGTTGAACGAGAACATGAAGGTGATCGCAACCGAGCTAAG 422 Query 517 GAAAAGGATAGGCACgagaagcagaaggaacgagagagggaaagggaaaaattggaacgt 576 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 423 GAAAAGGATAGGCACGAGAAACAGAAGGAACGAGAGAGGGAAAGGGAAAAATTGGAACGT 482 Query 577 gaaaaggagagggaaagagagaagatagaacgagaaaaggaacgggaaagggagaagatg 636 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 483 GAAAAGGAGAGGGAAAGAGAGAAGATAGAACGAGAAAAGGAACGAGAAAGGGAGAAGATG 542 Query 637 gaacgggaaaTATTTgagagggagaaggatagattgaaattagagaaagaaagagaaata 696 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 543 GAACGGGAAATATTCGAGAGGGAGAAGGAAAGATTGAAATTAGAGAAAGAAAGAGAAATG 602 Query 697 gaacgggagagggaaagagagaagatagagagggaaaagagCCATGAAAAACAGCTTGGA 756 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 603 GAACGGGAGAGGGAAAGAGAGAAGATAGAGAGGGAAAAGGGCCATGAAAAACAGCTTGGA 662 Query 757 GATGCTGATAGGGAAATGGTTATTGACCAAACTGACAAAGAAATTGCT--GG-----G-G 808 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | Sbjct 663 GATGCTGATAGGGAAATGGTTATTGACCAAACTGACAAAGAAAATGCTGGGGATCTTGAG 722 Query 809 -AT--G-GTTCTACAGGCGCAGAACCTATGGATATTGTTATGACTCCCACATCTCAGACA 864 || | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| Sbjct 723 CATGGGCGTTCTACAGGCGCAGAACCTATGGATATCGTGATGACTCCTACATCTCTGACA 782 Query 865 AGTCACATTCCTAATTCTGATGTGAGGATTTTGGAAGGGCATACTTCTGAGGTTTGTGCT 924 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 783 AGTCACATTCCTAGTTCTGATGTGAGGATTTTGGAAGGGCATACTTCCGAGGTTTGTGCT 842 Query 925 TGCGCATGGAGTCCCTCAGCTTCACTTCTTGCGTCAGGGTCTGGTGATGCAACAGCGCGA 984 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 843 TGCGCATGGAGTCCCTCGGCTTCACTTCTTGCGTCAGGGTCTGGTGATGCAACAGCGCGT 902 Query 985 ATCTGGAGTATTCCGGAAGGATCATTCAAAGCTGTGCATACTGGTCGTAATATCAACGCT 1044 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 903 ATCTGGAGTATTCCGGAAGGATCATTCAAATCTGTGCATACTGGTCGGAATATCAACGCT 962 Query 1045 TTAATCCTGAAGCATGCAAAAGGCAAGTCAAACGAGAAGAGCAAGGATGTGACCACTCTT 1104 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 963 TTAATCCTGAAGCATGCAAAAGGCAAGTCAAACGAGAAGAGCAAGGATGTGACCACTCTT 1022 Query 1105 GACTGGAATGGTGAAGGGACTTTACTTGCAACTGGTTCATGTGATGGCCAAGCAAGAATC 1164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1023 GACTGGAATGGTGAAGGGACTTTACTTGCAACTGGTTCATGTGATGGCCAAGCAAGAATC 1082 Query 1165 TGGACTTTAAATGGTGAACTGATAAGTACTCTTAGCAAACACAAGGGACCTATTTTTTCC 1224 |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1083 TGGAATTTAAATGGTGACCTGATAAGTACTCTGAGCAAACACAAGGGACCTATTTTTTCC 1142 Query 1225 CTTAAGTGGAACAAGAAGGGGGACTATCTTCTAACCGGTAGTGTTGATAGAACTGCTGTT 1284 |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 1143 CTTAAGTGGAACAAGAAGGGTGACTATCTTTTAACTGGCAGTGTTGATAGAACTGCTGTT 1202 Query 1285 GTTTGGGACGTAAAGGCAGAGGAGTGGAAGCAACAATTTGAATTTCATTCAGGTCCAACA 1344 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1203 GTTTGGGACGTAAAGGCAGAGGAGTGGAAGCAGCAATTTGAATTTCATTCAGGTCCAACA 1262 Query 1345 CTTGATGTTGATTGGCGCAACAATGTATCTTTTGCAACGAGTTCCACGGACAGCATGATC 1404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1263 CTTGATGTTGATTGGCGCAACAATGTATCTTTTGCAACGAGTTCCACGGACAGCATGATC 1322 Query 1405 TACTTATGTAAGATTGGAGAAACTAGGCCTGCCAAAACCTTTACTGGGCATCAGGGTGAG 1464 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 1323 TACTTATGTAAGATTGGAGAAACTAGGCCGGCCAAAATCTTTGCTGGGCATCAGGGTGAG 1382 Query 1465 GTCAACTGTGTGAAATGGGATCCTACTGGTTCATTATTGGCCTCATGCTCAGATGATAGT 1524 || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1383 GTTAATTGCGTGAAATGGGATCCTACTGGCTCATTATTGGCCTCATGCTCAGATGACAGC 1442 Query 1525 ACTGCTAAGATATGGAATATAAAACA-AAGCACCTTTGTTCATGACCTCCGAGAGCATAC 1583 ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1443 ACTGCTAAGATATGGAATATAAAGCAGAA-CACCTTTGTTCATGACCTCCGAGAGCATAC 1501 Query 1584 TAAGGAAATTTATACAATCAGATGGAGCCCTACAGGACCAGGAACTAACAATCCTAACAA 1643 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1502 TAAGGAAATTTATACAATCAGATGGAGCCCGACAGGACCAGGAACTAACAATCCTAACAA 1561 Query 1644 ACAGCTAACTCTTGCAAGTGCATCATTTGACTCAACAGTAAAGCTATGGGATGCAGAACT 1703 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1562 ACAGCTAACTCTTGCGAGTGCATCATTTGACTCATCAGTAAAGCTATGGGATGCAGAACT 1621 Query 1704 CGGGAAGATGCTCTGTAGTTTCAATGGACACAGGGAACCGGTTTACTCACTGGCGTTTAG 1763 ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 1622 CGGAAAGATGCTATGTAGTTTCAACGGACACAGGGAACCGGTATACTCACTGGCATTTAG 1681 Query 1764 TCCAAACGGGGAGTACATAGCGAGTGGGTCTTTGGACAAATCGATACACATATGGTCGAT 1823 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1682 TCCAAACGGGGAGTACATAGCGAGTGGGTCTTTGGACAGATCGATACACATATGGTCGAT 1741 Query 1824 TAAAGAAGGTAAAATCGTAAAGACATACACAGGAAATGGAGGGATATTCGAAGTGTGTTG 1883 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1742 AAAAGAAGGTAAAATCGTAAAGACATACACAGGAAATGGAGGGATATTCGAAGTGTGTTG 1801 Query 1884 GAACAAAGAAGGTAACAAAATCGCAGCTTGCTTCGCTGATAACTCAGTTTGCGTTCTTGA 1943 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1802 GAATAAAGAAGGTAACAAAATCGCAGCTTGCTTTGCTGATAACTCAGTCTGCGTTCTTGA 1861 Query 1944 TTTCAGAATGTAGTTTTCTTAATTGTAGT 1972 |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1862 TTTCAGAATGTAGTTTTCTTAACTGTAGT 1890 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 79037258375 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5