BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= ATCG00280.1
Length=1422
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg315545 jgi|Araly1|315545|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000578 2593 0.0
Ahg475572 jgi|Araly1|475572|fgenesh2_kg.2__702__ATCG00280.1 2590 0.0
Ahg925953 jgi|Araly1|925953|scaffold_201514.1 1356 0.0
Ahg946907 jgi|Araly1|946907|scaffold_703136.1 259 4e-68
Ahg315523 jgi|Araly1|315523|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000556 99.0 8e-20
Ahg475593 jgi|Araly1|475593|fgenesh2_kg.2__723__ATCG00270.1 95.3 1e-18
> Ahg315545 jgi|Araly1|315545|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000578
Length=1422
Score = 2593 bits (1404), Expect = 0.0
Identities = 1416/1422 (99%), Gaps = 0/1422 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACT 60
Query 61 TTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACCGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACCGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC 120
Query 121 CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTTTTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC 180
Query 181 GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCCCATTTTGTACCTGAAAAGCCC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCCCATTTTGTACCCGAAAAGCCC 240
Query 241 ATGTATGAACAAGGATTAATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGATGGGGGGTAGGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATGTATGAACAAGGATTAATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGATGGGGGGTAGGT 300
Query 301 CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCGTACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCGTACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT 360
Query 361 TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT 420
Query 421 GAAGAATCTTTTCCCTTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAAGAATCTTTTCCCTTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT 480
Query 481 TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCCTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCCTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC 540
Query 541 TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCGGGAgggggggATGTAAGAAAAATTACA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCGGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACA 600
Query 601 AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA 660
Query 661 GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAAGATATAATTGGAGGACATGTATGGTTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 661 GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAAGATATAATTGGAGGGCATGTATGGTTA 720
Query 721 GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAAGCCTTTTGCATGGGCT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAAGCCTTTTGCATGGGCT 780
Query 781 CGCCGCGCACTTGTATGGTCTGGGGAGGCTTACTTGTCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CGCCGCGCACTTGTATGGTCTGGGGAGGCTTACTTGTCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCT 840
Query 841 GTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTTTTGTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTTTTGTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAG 900
Query 901 TTTTACGGACCTACGGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTTTACGGACCTACGGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGA 960
Query 961 GACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATAC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATAC 1020
Query 1021 TTAATGCGTTCTCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGAT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1021 TTAATGCGTTCTCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGCTTTTGGGAT 1080
Query 1081 CTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCTAACGGTTTGGACTTGAGTAGGTTG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCTAACGGTTTGGACTTGAGTAGGTTG 1140
Query 1141 AAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCGGCAGAATATATGACTCATGCTCCT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 AAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCGGCAGAATATATGACTCATGCTCCT 1200
Query 1201 TTAGGTTCGTTAAATTCTGTAGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTATGTC 1260
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTAGGTTCCTTAAATTCTGTAGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTATGTC 1260
Query 1261 TCTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTTTTCCTATTCGTGGGT 1320
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TCCCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTTTTCCTATTCGTGGGT 1320
Query 1321 CATTTATGGCACGCGGGAAGGGCTCGGGCAGCGGCAGCGGGATTTGAAAAAGGAATTGAT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CATTTATGGCACGCGGGAAGGGCTCGGGCAGCGGCAGCGGGATTTGAAAAAGGAATTGAT 1380
Query 1381 CGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCCATGACTCCTCTTAACTAA 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCCATGACTCCTCTTAACTAA 1422
> Ahg475572 jgi|Araly1|475572|fgenesh2_kg.2__702__ATCG00280.1
Length=1420
Score = 2590 bits (1402), Expect = 0.0
Identities = 1414/1420 (99%), Gaps = 0/1420 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACT 60
Query 61 TTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACCGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACCGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC 120
Query 121 CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTTTTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC 180
Query 181 GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCCCATTTTGTACCTGAAAAGCCC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCCCATTTTGTACCCGAAAAGCCC 240
Query 241 ATGTATGAACAAGGATTAATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGATGGGGGGTAGGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATGTATGAACAAGGATTAATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGATGGGGGGTAGGT 300
Query 301 CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCGTACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCGTACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT 360
Query 361 TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT 420
Query 421 GAAGAATCTTTTCCCTTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAAGAATCTTTTCCCTTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT 480
Query 481 TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCCTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCCTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC 540
Query 541 TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCGGGAgggggggATGTAAGAAAAATTACA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCGGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACA 600
Query 601 AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA 660
Query 661 GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAAGATATAATTGGAGGACATGTATGGTTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 661 GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAAGATATAATTGGAGGGCATGTATGGTTA 720
Query 721 GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAAGCCTTTTGCATGGGCT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAAGCCTTTTGCATGGGCT 780
Query 781 CGCCGCGCACTTGTATGGTCTGGGGAGGCTTACTTGTCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CGCCGCGCACTTGTATGGTCTGGGGAGGCTTACTTGTCTTATAGTTTAGCTGCTTTATCT 840
Query 841 GTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTTTTGTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTTTGTGGTTTCATTGCTTGTTGTTTTGTCTGGTTTAATAATACCGCTTACCCTAGTGAG 900
Query 901 TTTTACGGACCTACGGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTTTACGGACCTACGGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTACTTTTCTAGTTAGA 960
Query 961 GACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATAC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAGGTTTAGGTAAATAC 1020
Query 1021 TTAATGCGTTCTCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGTTTTTGGGAT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1021 TTAATGCGTTCTCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAATGCGCTTTTGGGAT 1080
Query 1081 CTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCTAACGGTTTGGACTTGAGTAGGTTG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCTAACGGTTTGGACTTGAGTAGGTTG 1140
Query 1141 AAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCGGCAGAATATATGACTCATGCTCCT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 AAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCGGCAGAATATATGACTCATGCTCCT 1200
Query 1201 TTAGGTTCGTTAAATTCTGTAGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTATGTC 1260
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTAGGTTCCTTAAATTCTGTAGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTATGTC 1260
Query 1261 TCTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTTTTCCTATTCGTGGGT 1320
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TCCCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTTTTCCTATTCGTGGGT 1320
Query 1321 CATTTATGGCACGCGGGAAGGGCTCGGGCAGCGGCAGCGGGATTTGAAAAAGGAATTGAT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CATTTATGGCACGCGGGAAGGGCTCGGGCAGCGGCAGCGGGATTTGAAAAAGGAATTGAT 1380
Query 1381 CGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCCATGACTCCTCTTAACT 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCCATGACTCCTCTTAACT 1420
> Ahg925953 jgi|Araly1|925953|scaffold_201514.1
Length=1276
Score = 1356 bits (734), Expect = 0.0
Identities = 754/764 (99%), Gaps = 0/764 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAATGGAACT 80
Query 61 TTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACCGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 TTAGCTTTAGCTGGTCGTGACCAAGAAACCACCGGTTTCGCTTGGTGGGCCGGGAATGCC 140
Query 121 CGACTTATCAATTTATCTGGTAAACTTTTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC 180
|||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 CGACTTATTAATTTATCTAGTAAACTATTGGGAGCTCATGTAGCCCATGCCGGATTAATC 200
Query 181 GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCCCATTTTGTACCTGAAAAGCCC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 201 GTATTCTGGGCCGGAGCAATGAACTTATTTGAAGTGGCCCATTTTGTACCCGAAAAGCCC 260
Query 241 ATGTATGAACAAGGATTAATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGATGGGGGGTAGGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 ATGTATGAACAAGGATTAATTTTACTTCCCCACCTAGCCACTTTAGGATGGGGGGTAGGT 320
Query 301 CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCGTACTTTGTATCTGGAGTACTTCACTTAATT 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 321 CCTGGGGGAGAAGTTATAGACACCTTTCCGTACTTTGTATCTAGAGTACTTCACTTAATT 380
Query 361 TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTGGGACCCGAAACTCTT 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 381 TCTTCTGCAGTTTTGGGCTTTGGCGGTATTTATCATGCACTTCTTGGACCCAAAACTCTT 440
Query 421 GAAGAATCTTTTCCCTTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 GAAGAATCTTTTCCCTTTTTCGGTTATGTATGGAAAGATAGAAATAAAATGACCACCATT 500
Query 481 TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCCTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 TTGGGTATTCACTTAATTTTGTTAGGTGTAGGTGCCTTTCTTCTAGTATTCAAGGCTCTC 560
Query 541 TATTTTGGGGGCGTATATGATACCTGGGCTCCGGGAgggggggATGTAAGAAAAATTACA 600
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 TATTTTGGGGGCGTATATGATACATGGGCTCCGGGAGGGGGGGATGTAAGAAAAATTACA 620
Query 601 AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 AACTTGACTCTTAGCCCAAGTGTTATATTTGGTTATTTACTAAAATCTCCCTTTGGGGGA 680
Query 661 GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAAGATATAATTGGAGGACATGTATGGTTA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 681 GAAGGATGGATTGTTAGTGTGGACGATTTGGAACATATAATTGGAGGGCATGTATGGTTA 740
Query 721 GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTTCCATTTGTATATTTGGTGGAATCTGGCATATCTTAACCAA 784
Score = 496 bits (268), Expect = 3e-139
Identities = 280/286 (98%), Gaps = 0/286 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1137 GTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCGGCAGAATATATGACTCATGC 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 971 GTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCGGCAAAATATATGACTCATGC 1030
Query 1197 TCCTTTAGGTTCGTTAAATTCTGTAGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTA 1256
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 TCCTTTAGGTTCCTTAAATTCTGTGGGGGGCGTAGCTACTGAGATCAATGCAGTCAATTA 1090
Query 1257 TGTCTCTCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCATTTTGTTCTAGGATTTTTCCTATTCGT 1316
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1091 TGTCTCCCCGAGAAGTTGGTTATCTACCTCTCATTTTTTTCTAGGACTTTTCCTATTCGT 1150
Query 1317 GGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGGGCTCGGGCAGCGGCAGCGGGATTTGAAAAAGGAAT 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 GGGTCATTTATGGCACGCGGGAAGGGCTCGGGCAGCGGCAGCGGGATTTGAAAAAGGAAT 1210
Query 1377 TGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCCATGACTCCTCTTAACTAA 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 TGATCGTGATTTTGAACCTGTTCTTTCCATGACTCCTCTTAACTAA 1256
Score = 324 bits (175), Expect = 1e-87
Identities = 188/194 (97%), Gaps = 1/194 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 887 CTTACCCTAGTGAGTTTTACGGACCTACGGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTA 946
|||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 CTTAACC-AATGAGTTTTACGGACCTACGGGGCCAGAAGCTTCTCAAGCTCAAGCATTTA 834
Query 947 CTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAG 1006
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 CTTTTCTAGTTAGAGACCAACGTCTTGGAGCTAACGTGGGGTCTGCTCAAGGACCTACAT 894
Query 1007 GTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCTCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGAGAAACAA 1066
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 895 GTTTAGGTAAATACTTAATGCGTTCTCCGACTGGAGAAGTTATTTTTGGAGGCGAAACAA 954
Query 1067 TGCGTTTTTGGGAT 1080
|||| |||||||||
Sbjct 955 TGCGCTTTTGGGAT 968
> Ahg946907 jgi|Araly1|946907|scaffold_703136.1
Length=213
Score = 259 bits (140), Expect = 4e-68
Identities = 144/146 (99%), Gaps = 0/146 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1057 GGAGAAACAATGCGTTTTTGGGATCTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCT 1116
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 GGAGAAACAATGCGCTTTTGGGATCTGCGTGCTCCCTGGTTAGAACCTTTAAGGGGTCCT 72
Query 1117 AACGGTTTGGACTTGAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCG 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 AACGGTTTGGACTTGAGTAGGTTGAAAAAAGACATACAACCTTGGCAAGAACGACGTTCG 132
Query 1177 GCAGAATATATGACTCATGCTCCTTT 1202
|||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 133 GCAGAATATATGACTCATGCTCTTTT 158
> Ahg315523 jgi|Araly1|315523|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000556
Length=1062
Score = 99.0 bits (53), Expect = 8e-20
Identities = 53/53 (100%), Gaps = 0/53 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAA 53
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTTAA 1062
> Ahg475593 jgi|Araly1|475593|fgenesh2_kg.2__723__ATCG00270.1
Length=1060
Score = 95.3 bits (51), Expect = 1e-18
Identities = 51/51 (100%), Gaps = 0/51 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTT 51
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 ATGAAAACCTTATATTCCCTGAGGAGGTTCTACCACGTGGAAACGCTCTTT 1060
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 53173982020
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5