BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= ATCG00480.1
Length=1497
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg907875 jgi|Araly1|907875|Al_scaffold_0002_956 2682 0.0
Ahg475601 jgi|Araly1|475601|fgenesh2_kg.2__731__ATCG00480.1 2669 0.0
Ahg925505 jgi|Araly1|925505|scaffold_201066.1 2634 0.0
Ahg952437 jgi|Araly1|952437|scaffold_7100007.1 152 7e-36
> Ahg907875 jgi|Araly1|907875|Al_scaffold_0002_956
Length=1497
Score = 2682 bits (1452), Expect = 0.0
Identities = 1482/1497 (99%), Gaps = 0/1497 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGAACAAATCCTACTACTTCAAATCCAGAGGTTTCGATACGTGaaaaaaaaaaCCTG 60
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAACAAATCCTACTACTTCGGATCCAGAGGTTTCGATACGTGAAAAAAAAAACCTG 60
Query 61 GGACGTATCGCCCAAATCATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCCTTCCCCCCGGGCAAAATG 120
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 GGACGTATCGCTCAAATCATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCCTTTCCCCCGGGCAAAATG 120
Query 121 CCTAATATTTACAATGCTCTGGTGGTTAAGGGTCGAGATACTCTTGGTCAAGAAATTAAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTAATATTTACAATGCTCTGGTGGTTAAGGGTCGAGATACTCTTGGTCAAGAAATTAAT 180
Query 181 GTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGT 240
Query 241 GCGACAGAGGGTTTAAAGAGAGGAATGGACGTGGTTGATATGGGAAATCCTCTAAGTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCGACAGAGGGTTTAAAGAGAGGAATGGACGTGGTTGATATGGGAAATCCTCTAAGTGTT 300
Query 301 CCAGTCGGCGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTTGGGGAACCCGTTGATAAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCAGTCGGCGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTTGGGGAACCCGTTGATAAT 360
Query 361 TTAGGTCCTGTCGATACTCGCACAACATCTCCTATCCATAAATCCGCGCCTGCTTTTATA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTAGGTCCTGTCGATACTCGCACAACATCTCCTATCCATAAATCCGCGCCTGCTTTTATA 420
Query 421 GAATTAGATACAAAATTATCGATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTGGCC 480
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAATTAGATACAAAATTATCAATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTGGCC 480
Query 481 CCTTATCGTCGTGGGGGAAAAATTGGACTATTCGGTGGGGCTGGCGTGGGTAAAACAGTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCTTATCGTCGTGGGGGAAAAATTGGACTATTCGGTGGGGCTGGCGTGGGTAAAACAGTA 540
Query 541 CTAATTATGGAATTGATCAACAACATTGCTAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTAATTATGGAATTGATCAACAACATTGCTAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGT 600
Query 601 GGAGTAGGCGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GGAGTAGGCGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGA 660
Query 661 GTCATTAATGAACAAAATCTTGCGGAATCCAAAGTGGCCCTAGTTTATGGTCAGATGAAT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 661 GTCATTAATGAACAAAATCTTGCGGAATCCAAAGTGGCCCTAGTCTATGGTCAGATGAAT 720
Query 721 GAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTC 780
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAACCACCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTC 780
Query 781 CGAGATGTTAATGAGCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTCGTACAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CGAGATGTTAATGAGCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTCGTACAA 840
Query 841 GCAGGATCCGAGGTATCCGCCTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCAGGATCCGAGGTATCCGCCTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCC 900
Query 901 ACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAAGGGGTCC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 901 ACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACAAAAAAGGGGTCC 960
Query 961 ATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGATGATTTGACTGACCCCGCACCTGCC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 961 ATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGATGATTTGACTGACCCCGCTCCTGCC 1020
Query 1021 ACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGGT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGGT 1080
Query 1081 ATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTT 1140
Query 1141 GGCGAGGAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTAAAACAAACTTTACAACGTTACAAGGAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGCGAGGAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTAAAGCAAACTTTACAACGTTACAAGGAG 1200
Query 1201 CTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGATGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACC 1260
Query 1261 GTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCCTTTTTCGTAGCAGAAGTA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 GTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCCTTTTTCGTAGCAGAAGTA 1320
Query 1321 TTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAATTTG 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1321 TTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTG 1380
Query 1381 ATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCCGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATC 1440
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 ATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATC 1440
Query 1441 GATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGA 1497
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GATGAAGCTACTGCGAAGGCTACAAACTTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATGA 1497
> Ahg475601 jgi|Araly1|475601|fgenesh2_kg.2__731__ATCG00480.1
Length=1496
Score = 2669 bits (1445), Expect = 0.0
Identities = 1479/1496 (99%), Gaps = 0/1496 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGAACAAATCCTACTACTTCAAATCCAGAGGTTTCGATACGTGaaaaaaaaaaCCTG 60
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAACAAATCCTACTACTTCGGATCCAGAGGTTTCGATACGTGAAAAAAAAAACCTG 60
Query 61 GGACGTATCGCCCAAATCATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCCTTCCCCCCGGGCAAAATG 120
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 GGACGTATCGCTCAAATCATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCCTTTCCCCCGGGCAAAATG 120
Query 121 CCTAATATTTACAATGCTCTGGTGGTTAAGGGTCGAGATACTCTTGGTCAAGAAATTAAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTAATATTTACAATGCTCTGGTGGTTAAGGGTCGAGATACTCTTGGTCAAGAAATTAAT 180
Query 181 GTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGT 240
Query 241 GCGACAGAGGGTTTAAAGAGAGGAATGGACGTGGTTGATATGGGAAATCCTCTAAGTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCGACAGAGGGTTTAAAGAGAGGAATGGACGTGGTTGATATGGGAAATCCTCTAAGTGTT 300
Query 301 CCAGTCGGCGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTTGGGGAACCCGTTGATAAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCAGTCGGCGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTTGGGGAACCCGTTGATAAT 360
Query 361 TTAGGTCCTGTCGATACTCGCACAACATCTCCTATCCATAAATCCGCGCCTGCTTTTATA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTAGGTCCTGTCGATACTCGCACAACATCTCCTATCCATAAATCCGCGCCTGCTTTTATA 420
Query 421 GAATTAGATACAAAATTATCGATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTGGCC 480
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAATTAGATACAAAATTATCAATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTGGCC 480
Query 481 CCTTATCGTCGTGGGGGAAAAATTGGACTATTCGGTGGGGCTGGCGTGGGTAAAACAGTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCTTATCGTCGTGGGGGAAAAATTGGACTATTCGGTGGGGCTGGCGTGGGTAAAACAGTA 540
Query 541 CTAATTATGGAATTGATCAACAACATTGCTAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTAATTATGGAATTGATCAACAACATTGCTAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGT 600
Query 601 GGAGTAGGCGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GGAGTAGGCGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGA 660
Query 661 GTCATTAATGAACAAAATCTTGCGGAATCCAAAGTGGCCCTAGTTTATGGTCAGATGAAT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 661 GTCATTAATGAACAAAATCTTGCGGAATCCAAAGTGGCCCTAGTCTATGGTCAGATGAAT 720
Query 721 GAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTC 780
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAACCACCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTC 780
Query 781 CGAGATGTTAATGAGCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTCGTACAA 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CGAGATGTTAATGAGCAAGACGTACTTCTATTTATCAACAATATCTTCCGTTTCGTACAA 840
Query 841 GCAGGATCCGAGGTATCCGCCTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCC 900
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCAGGATCTGAGGTATCCGCCTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCC 900
Query 901 ACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAAGGGGTCC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 901 ACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACAAAAAAGGGGTCC 960
Query 961 ATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGATGATTTGACTGACCCCGCACCTGCC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 961 ATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGATGATTTGACTGACCCCGCTCCTGCC 1020
Query 1021 ACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGGT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGGT 1080
Query 1081 ATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTT 1140
Query 1141 GGCGAGGAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTAAAACAAACTTTACAACGTTACAAGGAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGCGAGGAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTAAAGCAAACTTTACAACGTTACAAGGAG 1200
Query 1201 CTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGATGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACC 1260
Query 1261 GTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCCTTTTTCGTAGCAGAAGTA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 GTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCCTTTTTCGTAGCAGAAGTA 1320
Query 1321 TTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAATTTG 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1321 TTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTG 1380
Query 1381 ATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCCGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATC 1440
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 ATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATC 1440
Query 1441 GATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATG 1496
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GATGAAGCTACTGCGAAGGCTACAAACTTAGAAATGGAGAGTAAATTGAAGAAATG 1496
> Ahg925505 jgi|Araly1|925505|scaffold_201066.1
Length=1867
Score = 2634 bits (1426), Expect = 0.0
Identities = 1462/1480 (99%), Gaps = 0/1480 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGAACAAATCCTACTACTTCAAATCCAGAGGTTTCGATACGTGaaaaaaaaaaCCTG 60
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGAGAACAAATCCTACTACTTCGGATCCAGAGGTTTCGATACGTGAAAAAAAAAACCTG 80
Query 61 GGACGTATCGCCCAAATCATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCCTTCCCCCCGGGCAAAATG 120
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 81 GGACGTATCGCTCAAATCATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCCTTTCCCCCGGGCAAAATG 140
Query 121 CCTAATATTTACAATGCTCTGGTGGTTAAGGGTCGAGATACTCTTGGTCAAGAAATTAAT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 CCTAATATTTACAATGCTCTGGTGGTTAAGGGTCGAGATACTCTTGGTCAAGAAATTAAT 200
Query 181 GTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 201 GTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGATGTAGCTATGAGT 260
Query 241 GCGACAGAGGGTTTAAAGAGAGGAATGGACGTGGTTGATATGGGAAATCCTCTAAGTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GCGACAGAGGGTTTAAAGAGAGGAATGGACGTGGTTGATATGGGAAATCCTCTAAGTGTT 320
Query 301 CCAGTCGGCGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTTGGGGAACCCGTTGATAAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 CCAGTCGGCGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTTGGGGAACCCGTTGATAAT 380
Query 361 TTAGGTCCTGTCGATACTCGCACAACATCTCCTATCCATAAATCCGCGCCTGCTTTTATA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 TTAGGTCCTGTCGATACTCGCACAACATCTCCTATCCATAAATCCGCGCCTGCTTTTATA 440
Query 421 GAATTAGATACAAAATTATCGATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTGGCC 480
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 CAATTAGATACAAAATTATCAATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTGGCC 500
Query 481 CCTTATCGTCGTGGGGGAAAAATTGGACTATTCGGTGGGGCTGGCGTGGGTAAAACAGTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 CCTTATCGTCGTGGGGGAAAAATTGGACTATTCGGTGGGGCTGGCGTGGGTAAAACAGTA 560
Query 541 CTAATTATGGAATTGATCAACAACATTGCTAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 CTAATTATGGAATTGATCAACAACATTGCTAAAGCTCATGGTGGTGTATCCGTATTTGGT 620
Query 601 GGAGTAGGCGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 GGAGTAGGCGAACGGACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGA 680
Query 661 GTCATTAATGAACAAAATCTTGCGGAATCCAAAGTGGCCCTAGTTTATGGTCAGATGAAT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 681 GTCATTAATGAACAAAATCTTGCGGAATCCAAAGTGGCCCTAGTCTATGGTCAGATGAAT 740
Query 721 GAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTC 780
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAACCACCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTCTGACTGCCTTAACTATGGCAGAATATTTC 800
Query 781 CGAGATGTTAATGAGCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTCGTACAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 CGAGATGTTAATGAGCAAGACGTACTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTCGTACAA 860
Query 841 GCAGGATCCGAGGTATCCGCCTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 GCAGGATCCGAGGTATCCGCCTTATTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCC 920
Query 901 ACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACGAAAAAGGGGTCC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 921 ACCCTTAGTACCGAAATGGGTACTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACAAAAAAGGGGTCC 980
Query 961 ATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGATGATTTGACTGACCCCGCACCTGCC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 981 ATAACCTCTATTCAAGCAGTTTATGTACCTGCAGATGATTTGACTGACCCCGCTCCTGCC 1040
Query 1021 ACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGGT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 ACCACATTTGCACATTTAGATGCGACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGGT 1100
Query 1081 ATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 ATCTATCCAGCGGTAGATCCTTTAGATTCAACGTCAACTATGCTACAACCTCGAATCGTT 1160
Query 1141 GGCGAGGAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTAAAACAAACTTTACAACGTTACAAGGAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 GGCGAGGAACATTATGAAACTGCGCAACAAGTAAAGCAAACTTTACAACGTTACAAGGAG 1220
Query 1201 CTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGATGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 CTTCAGGACATTATAGCTATCCTGGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAACC 1280
Query 1261 GTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCCTTTTTCGTAGCAGAAGTA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 GTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCCTTTTTCGTAGCAGAAGTA 1340
Query 1321 TTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAATTTG 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1341 TTTACAGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTAGCGGAAACAATTAGAGGGTTTAAATTG 1400
Query 1381 ATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCCGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATC 1440
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 ATCCTTTCCGGAGAATTTGATTCTCTTCCTGAACAGGCCTTTTACTTAGTGGGTAACATC 1460
Query 1441 GATGAAGCTACTGCGAAGGCTACGAACTTAGAAATGGAGA 1480
|| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1461 GACGAAGCTACTGTGAAGGCTACAAACTTAGAAATGGAGA 1500
> Ahg952437 jgi|Araly1|952437|scaffold_7100007.1
Length=361
Score = 152 bits (82), Expect = 7e-36
Identities = 86/88 (98%), Gaps = 0/88 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 26 ATCCAGAGGTTTCGATACGTGaaaaaaaaaaCCTGGGACGTATCGCCCAAATCATTGGTC 85
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 40 ATCCAGAGGTTTCGATACGTGAAAAAAAAAACCTGGGACGTATCGCTCAAATCATTGGTC 99
Query 86 CGGTACTGGATGTAGCCTTCCCCCCGGG 113
||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 100 CGGTACTGGATGTAGCCTTTCCCCCGGG 127
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 56030750395
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5