BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= ATCG01180.1
Length=2810
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg497139 jgi|Araly1|497139|fgenesh2_kg.9__104__ATCG00950.1 5131 0.0
Ahg952676 jgi|Araly1|952676|scaffold_900027.1 3509 0.0
Ahg921182 jgi|Araly1|921182|scaffold_102463.1 257 3e-67
Ahg319356 jgi|Araly1|319356|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002372 111 2e-23
> Ahg497139 jgi|Araly1|497139|fgenesh2_kg.9__104__ATCG00950.1
Length=2807
Score = 5131 bits (2778), Expect = 0.0
Identities = 2803/2813 (99%), Gaps = 9/2813 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
Query 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
Query 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
Query 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
Query 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCaaaaaaaGCGTCGTGCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCAATAAAAGCGTCGTGCT 300
Query 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
Query 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
Query 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
Query 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
Query 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
Query 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
Query 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
Query 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
Query 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
Query 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
Query 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
Query 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
Query 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
Query 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
Query 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
Query 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
Query 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
Query 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
Query 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
Query 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
Query 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
Query 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
Query 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
Query 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
Query 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
Query 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
Query 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCGAAGCCCCGGTGAACGGC 1920
Query 1921 GGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCC-TTGTCGGGTAAGTTCCGACCCG 1979
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GGCCGTAACTATAACGGTCCTA-G----CGAAATTCCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCG 1975
Query 1980 CACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGT 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 CACGAAAGGCGTAACGATCTGGGCACTGTCTCGGAGAGAGGCTCGGTGAAATAGACATGT 2035
Query 2040 CTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCC 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 CTGTGAAGATGCGGACTACCTGCACCTGGACAGAAAGACCCTATGAAGCTTCACTGTTCC 2095
Query 2100 CTGGGATTGGCTTTGGGCTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCTT 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 CTGGGATTGGCTTTGGGCTTTTCCTGCGCAGCTTAGGTGGAAGGCGAAGAAGGCCCCCTT 2155
Query 2160 CCgggggggCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTG 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 CCGGGGGGGCCCGAGCCATCAGTGAGATACCACTCTGGAAGAGCTAGAATTCTAACCTTG 2215
Query 2220 TGTCAGGACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCC 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TGTCAGGACCTACGGGCCAAGGGACAGTCTCAGGTAGACAGTTTCTATGGGGCGTAGGCC 2275
Query 2280 TCCCAAAAGGTAACGGAGGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCG 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 TCCCAAAAGGTAACGGAGGCGTGCAAAGGTTTCCTCGGGCCGGACGGAGATTGGCCCTCG 2335
Query 2340 AGTGCAAAGGCAGAAGGGAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTC 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 AGTGCAAAGGCAGAAGGGAGCTTGACTGCAAGACCCACCCGTCGAGCAGGGACGAAAGTC 2395
Query 2400 GGCCTTAGTGATCCGACGGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACT 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 GGCCTTAGTGATCCGACGGTGCCGAGTGGAAGGGCCGTCGCTCAACGGATAAAAGTTACT 2455
Query 2460 CTAGGGATAACAGGCTGATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTC 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 CTAGGGATAACAGGCTGATCTTCCCCAAGAGCTCACATCGACGGGAAGGTTTGGCACCTC 2515
Query 2520 GATGTCGGCTCTTCGCCACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCA 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 GATGTCGGCTCTTCGCCACCTGGGGCTGTAGTATGTTCCAAGGGTTGGGCTGTTCGCCCA 2575
Query 2580 TTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCC-ATATCCGG- 2637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 2576 TTAAAGCGGTACGTGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGT-CGGTCCCATATCCGGG 2634
Query 2638 TGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 TGTGGGCGTTAGAGCATTGAGAGGACCTTTCCCTAGTACGAGAGGACCGGGAAGGACGCA 2694
Query 2698 CCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAAACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGA 2757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 CCTCTGGTGTACCAGTTATCGTGCCCACGGTAAACGCTGGGTAGCCAAGTGCGGAGCGGA 2754
Query 2758 TAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCT 2810
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 TAACTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGCCCACCCCAAGATGAGTGCTCTCCT 2807
> Ahg952676 jgi|Araly1|952676|scaffold_900027.1
Length=10497
Score = 3509 bits (1900), Expect = 0.0
Identities = 1902/1903 (99%), Gaps = 0/1903 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7962 TTCAAACGAGGAAAGGCTTACGGTGGATACCTAGGCACCCAGAGACGAGGAAGGGCGTAG 7903
Query 61 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7902 TAAGCGACGAAATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAG 7843
Query 121 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7842 GTTAACCTTTTGAACTGCTGCTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGAACTGA 7783
Query 181 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7782 AACATCTTAGTAGCCAGAGGAAAAGAAAGCAAAAGCGATTCCCGTAGTAGCGGCGAGCGA 7723
Query 241 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCaaaaaaaGCGTCGTGCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 7722 AATGGGAGCAGCCTAAACCGTGAAAACGGGGTTGTGGGAGAGCAATAAAAGCGTCGTGCT 7663
Query 301 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7662 GCTAGGCGAAGCGGTGGAGTGCCGCACCCTAGATGGCGAGAGTCCAGTAGCCGAAAGCAT 7603
Query 361 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7602 CACTAGCTTATGCTCTGACCCGAGTAGCATGGGGCACGTGGAATCCCGTGTGAATCAGCA 7543
Query 421 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7542 AGGACCACCTTGCAAGGCTAAATACTCCTGGGTGACCGATAGCGAAGTAGTACCGTGAGG 7483
Query 481 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7482 GAAGGGTGAAAAGAACCCCCATCGGGGAGTGAAATAGAACATGAAACCGTAAGCTCCCAA 7423
Query 541 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7422 GCAGTGGGAGGAGCCCTGGGCTCTGACCGCGTGCCTGTTGAAGAATGAGCCGGCGACTCA 7363
Query 601 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7362 TAGGCAGTGGCTTGGTTAAGGGAACCCACCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTTCATAGG 7303
Query 661 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7302 GCAATTGTCACTGCTTATGGACCCGAACCTGGGTGATCTATCTATGACCAGGATGAAGCT 7243
Query 721 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7242 TGGGTGAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGACTGATGTTGAAAAATCAGCGGATGAGTTGT 7183
Query 781 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7182 GGTTAGGGGTGAAATGCCACTCGAACCCAGAGCTAGCTGGTTCTCCCCGAAATGCGTTGA 7123
Query 841 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7122 GGCGCAGCAGTTGACTGGACATCTAGGGGTAAAGCACTGTTTCGGTGCGGGCCGCGAGAG 7063
Query 901 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7062 CGGTACCAAATCGAGGCAAACTCTGAATACTAGATATGACCTCAAAATAACTGGGGTCAA 7003
Query 961 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7002 GGTCGGCCAGTGAGACGGTGGGGGATAAGCTTCATCGTCGAGAGGGAAACAGCCCGGATC 6943
Query 1021 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6942 ACCAGCTAAGGCCCCTAAATGACCGCTCAGTGATAAAGGAGGTAGGGGTGCAGAGACAGC 6883
Query 1081 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6882 CAGGAGGTTTGCCTAGAAGCAGCCACCCTTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGATCGAG 6823
Query 1141 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6822 CGCTCTTGCGCCGAAGATGAACGGGGCTAAGCGATCTGCCGAAGCTGTGGGATGTCAAAA 6763
Query 1201 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6762 TGCATCGGTAGGGGAGCGTTCCGCCTTAGGGGGAAGCAACCGCGCGAGCGGCGGTGGACG 6703
Query 1261 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6702 AAGCGGAAGCGAGAATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCG 6643
Query 1321 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6642 AAAACCCAAGGGTTCCTCCGCAAGGTTCGTCCACGGAGGGTGAGTCAGGGCCTAAGATCA 6583
Query 1381 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6582 GGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGACAACAGGTGAATATTCCTGTACTACCCCTTGTTGGTC 6523
Query 1441 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6522 CCGAGGGACGGAGGAGGCTAGGTTAGCCGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGT 6463
Query 1501 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6462 GTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGGGTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTA 6403
Query 1561 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6402 CCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCCATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAACGACCT 6343
Query 1621 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6342 TCAACAAAAGGGTACCTGTACCCGAAACCGACACAGGTGGGTAGGTAGAGAATACCTAGG 6283
Query 1681 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6282 GGCGCGAGACAACTCTCTCTAAGGAACTCGGCAAAATAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGG 6223
Query 1741 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6222 GGTGCCTCCTCACAAAGGGGGTCGCAGTGACCAGGCCCGGGCGACTGTTTACCAAAAACA 6163
Query 1801 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6162 CAGGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATGTATGGGGGCTGACGCCTGCCCAGTGCCGGAAG 6103
Query 1861 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCG 1903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6102 GTTAAGGAAGTTGGTGACCTGATGACAGGGGAGCCGGCGACCG 6060
> Ahg921182 jgi|Araly1|921182|scaffold_102463.1
Length=715
Score = 257 bits (139), Expect = 3e-67
Identities = 145/148 (98%), Gaps = 0/148 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1468 CGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGTGTCCCTGTTTTTTCAGGGTAAGAAGGG 1527
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 148 CGAAAGATGGTTATCGGTTCAAGGACGCAAGGTGTCCCTGTTTTATCAGGGTAAGAAGGG 89
Query 1528 GTAGAGAAAATGCCCCGAGCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTGAAGTAACCC 1587
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 88 GTAGAGAAAATGCCCCGACCCAATGTTCGAGTACCAGGCGCTACGGCGCTAAAGTAACCC 29
Query 1588 ATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAAC 1615
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 ATGCTATACTCCCAGGAAAAGCTCGAAC 1
> Ahg319356 jgi|Araly1|319356|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002372
Length=1524
Score = 111 bits (60), Expect = 2e-23
Identities = 60/60 (100%), Gaps = 0/60 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1274 AATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGT 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 AATGTCGGCTTGAGTAACGCAAACATTGGTGAGAATCCAATGCCCCGAAAACCCAAGGGT 1509
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 106043242080
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5