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ID : Virus1080

     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


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DescriptionLactococcus_phage_phiL47|bacteria|dsDNA
Sequence
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GATAATGTGA AGGTTATATT AGCTAGTCTA TGATATAACT CAAAAAACTA CTCGCACGGT ACTCGATTTG TAGTTTGCCA ATACACAATT TGGTTTCCCA TTTCGTTTAA ACATTGGAAT AAGACTGCCT ATTCGAGAAC AGGCAACCTC GGTTCGATTC CGAGGGTGGG AATTTAATTT GAAATATTAT TACTTATCTC TTGACAAACT CATTTGATTA TGGTATAATA GTATATGTAA GTTAAAAAAA ACGTAAGGAG AACATAATAT GGGGTGCATA ATTCCAATTG TATTAATTTT ATTATTTATA GCAAATCCAG TTCTGGGTTT AGTCGCAACG GTTATTGTAT TAGCAATAGC AAGTCTTAAA AAATAAGGAG AATAAACACA ATGACACAAA ACAAAACACT CTCAGTACAA GAAGCACTCA ATGAACTTAA AGTCCTCGAC AAACGCATTG AACGTAAACT TGGAGACACT AAATATGTAG GTGTTGTTCA AGAAGACAAA CTTGTTTATC CTGCATCATC AAAAGGTGAT AAAGATAAAT TCATTTCAGA TGCAAAATCT AGTATTGATT CATTGCTTGA CTTGATTGCT TATCGTCATG CTTTGAAAGC TGGTGTATTA CGTTCTAATG CGTTAACAGA AATTGTAATT GGAGACAAAA AAATGACAGT TGCGGAAGCA ATTGACTACA AAACTTCAAT CCAAAGTGAA AAAGATTTGG TTCAAACTCT TGTTAATGAT TTGACTCAGG CAACAACTAA GATGACACGT ATTAACAGTG ACATTGATAT GGCTCTCGAA AAGAAACAAA ATAGTTTATT GAGTTCAGAA AAAGATGATA AAAGCTCTGA GTTTATTAAA TTCTTGAAAG AACAAGCTGA GAGAGAAAAA GCAACAGTTC 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GACATGGTTC ACACTTGCAA CACCTAACGT TGCTATGGGT GTTCTATATC TAATCTTCCT TGTAAACTCA ATCTTTGGTT ACATTGTTTG GAACGCATCT AAAAAAGAAA GCCTTTAATG GGCTTTTTTA TTATGTCACT TGACAAACCA TGAAAAATAT GGTATAATAT AACTTGAATA GAAATTGGAG GAAATAGATG GATAATTTAT TTGTTGTTAA GAAAAGAACA GATGATAAAC AAGAAAGGGT GACAGAAGAA TGGAACTTCG ATAAGATAGT TTCTGCCTGT CAAAAGTCAG CCCAACACAT AGACAAACCT CTAAAGAAGG AACAAATCAC TGAGATTAAA TCCTTAGTGG AACTTGCTAT CGCTAAGCGT AGAGATAATA TTTTAGCTGA TACAAATACC CAGCATGAAG ATAAACTTCA TTACATTAAT GTTCGTGAAA TTCATGATAT TGTTTTGTCA GCTCTAAAAC AAGTTGATAC TGATATCTAT GATTCATACC ATGAATATCG AAATTATAAA ATATCGCAAG ATAAGCATTA TCGTGAACTA TACAAAGATT TAGATAGTCT TAAAAATGGA GTCTATAATG AGAATGCAAA CAAAGACAGT TCTATTAATT CAACTAAGCG TTCTCTTCTT GCCGAAATGA CTCAGAAGAA AATTGTGACT GACTTTATTC TTCAAAAGAA CTGGGTTAAG GCTCATGAAG AAGGGTGGAT TTATATTCAT GACTTAGGAG ATTTATACTG GCGAACTTTT AATTGTGACA ACGTTGATTT AGCAAATCTC ATTAAGACTA AAAAGCAAAA AGATGGAGAG TATGCTTTTA CTTTAAATGG TATTAAATAT CCTGAACCTA AATCAATTAG TTCAGCATTT AATTTAGTAG CAGATTTGAT 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TTAAATAATG GGTATAAAGT TGATAACTTA CCAAACTACA AGAGTGGTGA ACAGCGTCAA CAAGACCAAA TAAAATTCAT GGAAGTTCTT AATTCAATTA AAGACTTTAG AAATATCCAT GACGCTGTTC GTATTGATGA AGAAGGGATT CAAACTCGTG TTTGGGATGA TGAAGGAAAC TTTATTAATC CAAACCCAGA CAAGAAATAC CTTGAAGTTT ATGATGGGTT AGACACAATG TGCAAAACAA CTGTCATACC TCGTATGTAT TCTATTTATG GAACACCTGC CGAATCTGTT GTATATAAAA TGATGAAACA ATTACAAGAA CAATATGGAT TCATTAACGG TGTTACAGCT CAAGAAGACG GAAAAGGACG TAATTATATT ACTAACTCAT TCCACCAGCC AGTGTGGATA GAATCAAATG TGTTTGATAA GATTGATTTT GAAGCACCTT TCCATTTAGA TAAAATGGCA AGTGGTGGAC ATATCAGTCA AAATGAATTT GCATATGGTA CAGCTGTAAC AGTTCTTGAA CAAGCTGTTA AATATGCTAT GGGAAGAGGC ATGTATTACG GAATTAATAT TGCATCTAGC CATTGCTTTG ATTGTGGTTG GAATGGTGAA ACAGCAGATG TTTGTCCCGA ATGTAATTCA GAGAACGTTG TAACAATACA AAGAGTATGC GGATATCTCT CTATCACATC ACGCAATGGA CATAGTGTTG TCAATGCTGG TAAGACTGAG GAATTACTTG AACGTGTTAA TCATGTTGGA AATACTAAGA AAGAATATAC GAAGAACTTT GAGAAGAATC ATGACATACA AAGAGATATT GTATCGAAAG AGTTCTCAAT GTTTGAATCA GGAGAATAAT GGCTTATATA CATCAATTAA ATGCTATGGA 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GATTATTCAA ATGCTTCCAC TAAAATGTTA ATAAAGCACA ATATTTGTGA GAATGAATAT AAAGTAACAT GGAGTGACTT CAAACAAGAA AAGAGATGTC CTAAATGTAG TAGTACTGCA AAGCTAAATA ATCAAGAAAT TGATAAAAGA ATGAGAGAAT TAACAGGGAA TGAATATTTT CGATTAGGAG ATTATAAAGG TGCTCAAATT AAGATGTTGG TTCAACATAC TACTTGCAGA ACAGTATATG AGGTAAGATG GAGTCACTTT CAGGAAGGTA AGAGATGTCC CAAGTGCAAC GAATCTAAAG GTGAGAAAGA AATCTCAAAT ATTTTAAATT CTTTAAATAT TAAATATACT CCACAAAAAC GATTTAAAGA TTGTAAACAT AAAAATCCGT TACCTTTCGA TTTTTATATA CATAATAAAA AATCTAAACT TTTAATTGAA TTTGATGGAG AACAACATTT TAAATCTGTA AAGATTTTTG GTGGAGAAGA AGCTCTTAGA AAAACTCAAC TTCGTGATAA AATCAAAAAT GATTTTGTTC TGTCAAATAA CATTCCTCTG CTAAGAATCC CCTACACAGA ACAAGATAAT ATCAAACAAA TCCTAACAAA CAAACTCAAA GAATTAAATT TCATTTAACT ACTACTTGAC AAACTCAAAT AAATATGTTA TAATATTATA TAGAGAACAT AAAGGAGACA ACACTTATGA AAATCAAAGG TTTAAACAAT GATGTAGAGG TATTACTCGA CCCTGAGAAT GTTGACCAAG CAACTCTTAC GCAAATTAAA GAACTTGCAG ATTCAGAACG GTATGTTGAT AACAAAATTG TTATGATGCC TGACACTCAC GCTGGTATAC CAGCACCAAT TGGGTTAACA ATGAAAATTA ATAATCCTCT TGAAAAGTTC CCTTT 
Length65535
Protein Sequence
Protein Residue
A.thaliana
AGI-code
Description
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
1 Ahg922977 Coiled-coil domain-containing protein 55 (DUF2040)
2.23607 Ahg906699 LOV KELCH protein 2
3.74166 Ahg887541 1-amino-cyclopropane-1-carboxylate synthase 12
4.47214 Ahg931456
5.47723 Ahg913646
10.6771 Ahg895098
17.0294 Ahg918984
19.2873 Ahg922043
19.6214 Ahg497282 tubulin folding cofactor A (KIESEL)
19.7484 Ahg497382 actin-related protein C1A
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression