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ID : Virus1926

     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


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DescriptionThysanoplusia_orichalcea_nucleopolyhedrovirus|invertebrates|dsDNA
Sequence
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TAACCTCGGT CGTACACATG CTCTGAAAAC ATTTCAAGAA ATAAAATGAC TTAATATTTA AAAAAATTTA TTTTCGTTTT TTATACAAAC TAAATTTATA CGTGTTATTA GAACATTGAG TGTTGTTTTC GCTGTCCGAA GTATCACAAT TGTCTTCAAT TACGTCATCG TCGTCGTCGT CGTTGTCGCG TTTGCGTTTA ACGCCACACT TTTTAGAATT AATTTTAACT AACATGGGTT CTTTTTGGTC GTACAATTGA TTTTGCATGT ACTTTTTCAT AATACATTCA AAACATTTTG CAATTTTATC TTTATATTCA TCGCCATAAA TTTCAAGTAA TTCGTTCATA AACGTGCACA AAATGCCCAT TATTTTTATC CAGCTAATTC GCATTTTAGC GGGATCAAAT AAGCGCAAAG GGTACGCTTT TTCCGTCATT TTCCCTTCGA TGTCAATTAA AACGTAGGGA ATACGATCGC CGTTACCCGG CACGAAATCT GTACCTTTGT TGATTAAGAT TTCCCTACAG CGCCTAGCTA CCGTGATTAC GCGCCTTTTA GGCGGCGCCG GACCTTCGTC GTCGTTATTA GATTTGCGCT TTTTGCCCGG ATTATCGTTA TAGGTCATGC TAAAACTGTA ATCGGTCAAC GATTTAGATT TACCAAACTC GTCATAGTAT TCAAAAAAAC TATCTTGCAA AGTTTGCAAA CATTTATCTA TATCTAAATG TCGCAAAATT TGTTCTACCG CTTTTCTAAA AGCGATTCTC ATAAAAACCG GCATGTCTTT TTTGACCAAC CAACCTTTAT ATACAATTTT ATTTTCACTA TTTAAATAAC AATATTTTTT CTTTTTGAGC AATATTAAAA CTTTCATTAA ATTTTCAAAT GCCATTTTGT AGCCGTCCGT 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ACAAACAACT TTATCGGCAA CATGCAATCT TGCACGTTGT ACTGAGCGAT CAAGCCCAGC TGCCGAGCGT TATACATTTT TACCATTTCG GTCCACGGTA AATCGATTTT CTGTTCGCCC AAATAGAAAC TACTGATCGT GTTCAATTGA AAATTTTCGA CTTTATGTTG ATTCGAATCG CTACTAAAAA ATTTATACAA ATCAATGTGA ACGTAATAAT CAAAATAATA TGTGTCCACT TTGTTGCCCA ACTTGTTTAT GAACAGTTTT GTCGTTGGCG CTGCAGCGGG CAAATCGTAA CGTTTCAGCA GTATTTTGGT ATTTTTTAAC CGAGCAATTA TATACGGCAT ATCGAACACG TCTCCGTTAA AATTCAAAAT CACGTCGGGG TTTGTTAATT TTATCATGTC AAAAAATGCG GTAATCATAT CAACTTCGTT TTTAAACATG ACCACAAACG TGTTGTCGTT TTTGTCTGTT TCCAAAATTT CGGTCGGGTT TTTGTGGTAC ATAAAACAAA AATTTGTAAA CTTGTCGTCC TTGTACACTG TAAACCCTAT ACACATGATG CAGTCGGCCG AAGGTTTCGA CATGTTGTGG CCGTCCGAAT GAGTTTCAAT GTCGTAACAC GACAACACCG GCATGATGCC GCTAGTCAAA GTCATTTCGT CGACGACCTC AAAATCTTCG TCAAAATATT CCAGATTAAA CATTCGCGTC GCCGATCCAC CGACGTAGTT GTTTTGGCAG CGTTGCGTTT TTTTAAACCT GACATACGCG CCTTCCACAA AAGGAGTTTG CATATGCACA CGGTTAACGT TGTGTAAAAA CTTGTCCAAA CACGAGGCGT TTTCAGATGC CGTCGCTTCG TTTCGTTTGT ATTTAACCAC GTTAATTTTA TTCAAGTGAA 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TTACTATAAT CAACGTTATA TCGGCCTTGT CGTCCGTTCG CACATTGATC GATTACAATT TTACAGAATT TATTAAATGT GTCTATTTAA AAACTAATAT ACGCTTTGCG ATAGATCAGT ATTTGTGCGC TACCATAGTT ATATTTGTAG AATTCTTCAG CAGAGTATAT ACTTTGATGA CACAGAAAAG CTTCCAATTT GCCACTTTTG AACAGTTGAC CGAAATTTCG ACTCAAGTGT ACACACAGAT CGCAACAATT GTTACGCAAA ACGCAGATTT TACTATGTCG CCGCCAAGCG GTCCTCGGCC CTTCGAGACA ATAAACTACG ATAATATTAT TTTGGATCTA CAAGATCAGT TAAAAAGAGA ACGCGCTTTG CATCAACAGA TCTCTGAACA GCACAAACTT GCAAACGACA GGGTAGAAAT TTTGCAGACG CAATACAACG AATTGGATGC AAAATATAAA GAAATAATTG ATGATAAAAG CGAGTTTGCT CAACAAAAAA ACGAAAACAT TCGAAAAATT AAACAGCTAG AAAAAATTAA CAAAGACCTC GACAACGATA TTCAGGAATT GCGAGATACA AACGCTGAAA ATTTGTCGCA ATTAAAATTG CAAAAAAACG ATATAGAAGA ATACAAAGCC AATATTCTTA AATTAAACGA AGAAATTCAC AAATTAAAAA ATAAATTAGA CACATCTCGT AGTAATACGA CAGATTTAAA TAATAAAATC GAATCGTTAG AGCGGCAAAT AGACGATAAA CAGGGTTTAA ATGAAGAATT GAAGATTAAC ATTGCAAAAA TAAACGAGAC TACGCAAAAG TACAAACTCG ACGCGATAGA TATAATAGAG CTTAAACAAG CAATAACGGT TAAAGATCAA GAACTTGCCG CAAAGTCTAA TCAGTATTTA CAGTTAAATT CTGCATACGA ACAAACTGTT AACGAATTAA ATGCGTTTAA AAATCAATTG TCTCAGACCG CCGTGCAATA TCAAACTTTA CAACAAACAT ATTTAGAATC TCAAACCATT TTAGAAGGCG CATTAGCGTT TATTAATAGT ATATATCAAA TAGTTATGCA GATTGATAAA CCCGATTATG TTACAACATT AAAGCCGCAG TTTACAATTG AAGAAAGTAA ACTGCAAATG GATACTATCG AAAGTTGGAT GTTGAGTTTA AAATCTAAAC TGTCTAACAT TGACACTGCT AATTTGCAAC CGAATGCGGA TTTGATAGAC TTGAAAACTC AAATAGCTTC TAAAGTGCCC AAAAACATTT TAAATCGTAT ATTAAAAAAA CAATACAATA TTAAACCGGA AAATTATAGT ATAGATATGT TGGAACCCAT TACGATCATA AGTGCCGTTA GTGCTTTGGC GGAACAATAC GACGCTTTGC AAAATCAAAA CGTTAAAATG AAACAAGATT TTGAAATAAA ACTAGACGAA TTAGAAAGAA CGTTACAACG AAACAAAAGT GATGTTGAAT CGATATCAGA GTTCATTTCG AGAGACCCAG CTCTCAATAG AAATTTAAAC GACGAACGAT TTCAAAATTT AAAGCAGCAA TACGATGAAA TGTCCAGTAA ATATTTGGCT ATGGAAACTA CTAAAATTAA AGAAATGGAA TTGCTTGCAG ACCAGGCTGT AAAGATGGAA TTGGGTAAAT TAAATGCACA GGTTGATGAG TTAAATTCTT TATTCATTAA ATACAATAGT AAAGCTCAAG AAATATTTGA ATGGAAGAGC GACATGCTTA AACGCTATGA AACATTAGCT CGAACAACGG TGACCAGCTT ACAAGAAGGC 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CTCATAGCAT TTGCCTTCTT CCATGTCTTT AAACGATTGC GAGTCGCCAT AATATTCTTG AATCTTGTTG TCGGACATTA TACGAAACGT GTAGTAGTAT TCGTTGTCAA TGCTCAATCT CATTTTGCTC ATCAATTTAC CAGAAATTTG TTTGTAGTTT TCTTTAATCT TTTTGGGACT AGCAGCCGTG CGTTTTATAA GCGGTTCATC GCTGCTACCT TCCCCCGAAA AAGATCTTTT GGTTGCCATT ATTATGTGGG AATCTATACG ATGGCAGATA TTAAACGGCG ACGAAATCGA AGTGTCGCCC GAGCACCGTT CTCTGGCGTG GCGCGAGTTG ATTATTAACG TTGCAAACAA CACGCCGCTC GACAACACGT TCAGAACAAT GTTTCAAAAA GCAGATTTTA AAAATTTTGA CTACAATACC CCAATCGTGT ACAATTTAAA AACTAAAACG CTGACAATGT ACAACGAAAG AATAAGAGCG GCTCTAAACC GACCCGTCCG GGCTAATGAT CAAACTATCA ATGTGAATAT AGTGCACGTC GTTTTATTAT TTATTTGTAT TATTTTGCTC ATCGTGTTGG CCGTCTTTTC AAACACAAAC GGCGCAATCA ACGCGAAAAA CAAAAATGCT CCAACAAAAA TTAAATGAGC TAAAGGACGG ACTGAACACG TTCAAAAACA AGTCGATAGT TTGCGCCCGA ACAAAATTAT TCGACAAACG CCGAACGCGC AGACCTAGGT GTTGGCAAAA ATTATCAGAA ATTGATAAAA AGTTTCGTGT GTGCCGACGT ATCGACACGT TTTTAGACTT GTGCGGCGGC CCGGGCGAGT TCGCCAACTA TACCATGTCG TTGAACCCGT TTTGTAACGC GTACGGTGTC ACGTTGACTG ACAATTTCGT GTGCGCGTAC AAAAAAGAAT TGATAAAACG CAAAAATTTT ACGCCCATCG TGGGGCCCGA CGTGTCGGGC AACGTTTTTG ATAAAAATGT TGTGTTCGAG GTCAGCGTTA AATGCGGCAA CGTGTGCGAT TTAGTGTTGG CGGACGGTTC GATCGATGTT AATAAACGCG AAAACGAACA AGAGCGGCTT AATTATGATC TCATCAGATG CGAAACTCAA ATAATTCTAA TCTGTTTGCG TCCGGGTGGC AACAGCGTTT TAAAAGTTTT TGATGCATTT GAACGCGAAA CTCTACAAAT GCTCAACAAG TTTATAAACC ATTTTGAAAA ATGGGTTTTG TACAAACCGC CTTCTTCGCG ACCCGCCAAC TCGGAGCGAT ATTTAATTTG CTTAAATAAA TTAATAGTTC CTAAAAGCGT TGATTACACA AACGAGTTGA AAAGACGGTT TAGAAAATTT TATTACATTC AATTAAAAAG TTTAAACGCG TTGGTAAACT TGTTAGAAGT ATAAACCGAT GGCGCTCGGC GTATAAAAGC AAACGGGTCC GTTTATTTTA CATCATTCAA TTATGGATTC GCTTTTGAAT TTGTGTTTGA AAATCCTCCC TAGCAAGGTT GAATTGCCAC GGGTGTTAAG CTCACAAATA AAGCAATGCA ATGGGTGCCA TCAATGGTTT TTACCAAAAT TTATTGGCGA CAAATGTTGC GGTAGATGCA CATGCGACAT TTGCCACGAA TATAAAATTA ACGACTGCTT ACAATTGGGT GTAAGCACAA TAAAGCCGCA ATCTTCGAAC AAAGAAATAT ATATTTTTAC AAACAGGACA TTTAAAACGT GCAAAAATGA ATGTCGACAC AAATCAAAAC GCAAATGTTT AGTTACATAT TTTAATAAAA ATGAAAAATG TTTTAATTCT TGTTGTGTTA ATAAAAGGTG TTACATGTGT TTGGAGTATA AACAGACTTT ACATAGTGTA AATTTGTATG TGCGTAATGG CAAATATACT TCGTATGCGG CTTTTTGTTT TTCGTGCATA AAAAATCGCA TTAAAGTGTG TCAAATGTGC GATCAGCCTT TGTTAAAAAT GTACAAACAA AAGCAAGAAG AACGTCTGAA AACCCAATCG TTGTACAAAA CTATGGCGGA CCAAGATTTA AAAGTGTTTG ATTTGTACGA TACCAATAAT TATACCGGAA TTATGGTGTT ATGCGCCCAA TGTCATATAT TTTCATATTG TGTATGTACT TTTACTATAC AGTGTTATTG TCCCAGACTT AATTACGAAT GTGAATGTTT TTGTAGACAA TCTAAATACT TTAAAAATAA CGTACTTTGT ATTAAAAGTA AACAGGCCTG TTTTAACAAA TTTAAAATAC GACGCATTCC GAAAATTTAC AAAGAAGAAT ATAAATTTAA ACGCATGTAT AAATTGATTA ATATATATTA GTTTTAAGAA TTATATTATG ATGCATGTAT AAATTGATTA ATATATATTA GTTTTAAGGG TTATATTATG GAATAAACTA TGAATTTGAT GCAATTTAAT TTTTTAATAC TTTCCACTGA CGGCAGGTTT AAAACTATGA CTAATATGGC GTTGGAAAAC GAATACAAGC TTGAACTGGC CAAAACGGGC TTGTTTTTTC ACAACAATTT GATAAAATGT ATAGGTTGTC GCATTATTAT GGACAAAATT AATGCCAAAA AAGTTAAACG TCATACTTAT TCAAATTATT GCATTTCGTC TACGAACGCG TTAATGTTTA ACGAAGCCAT GAGAAAAAAA TCGTTTACTA GTTTTAAAAG TTGCCGACGC 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TATTCGGGCG TTTCGCTGTT CAAATATTGG TCCACCTCGC GTACAATATC CAATACATTC TTTTGCAAGC TAATAAGCTG CGTCACCACG TCCACTGACG CGGTCATGTT TGTTTTTTGA ATATTAAATT GCAACAATTG TACGTGTCTA CAATACAATT CGGCTTAATA TATTCGTCGA CGCAATCGTG TTGGCAGTTT AATTGCGTAT TCAACAGATC CGTGACAATA TTTTTAAACG TGCAAGTTTT CAATCTGCTC TTGTCGTTCA ACGCCGCCCT TAATTCGCTC TGTAAATTAT CTAGAATTTT ATCTTTATTC TCGTCAAAAT CGTGCGCGTT ACGTTCCAGC CACAATTTGA ACGGCTCGTC CACAAAAATG CTGCGCAGTA CTTCGTACAA CTGTCGGCCC AACGTGTACA CTTGTTCGTA CTCTTTCATG CTCACTTCCT TGCTAACATA CATGACCAGA AAATCTACGA GTATTTTTAA ACATTTGTAA TACGCTACAT ATTTTTGTTT AAGTTTTAAC CCATCCACCG TGTACTCTTG CACGTCGGCA TCGATCACTT TTTCATTGTT ATCGCTCGAA GCGTTTGTTT GTTCCGTTTT AATTATATCC GGTTCGATGT GTAAAGTTTC AAAAGATTTA ATTGCTTCTA TAAAATCGTT ATTTTGCTGA ACGGTATTTA GGGGAAAATC TATTAAAGAG TCATCCGCGT CTGTCTGTTC TTCGGGCACG TTGTTTAAAC GCACCGTAAT TTTTTTAGGA TCGTTTTCAT CGAGTATGAG GCTGGCTTTG ATTTTATTTG AATTCAACAA CGACATGGTA GTCGCTTGTA GATTCAACAA ATTAATCAAA GACTGAAATT GTATATTACA CAGATTTATT TTCATTTTTA TTGATCTTAT AATTAATACG CCGGCAATTG GTACGCTTCA TCCATTTTCG TGACTAGAAA ATTCGCCATA AAACTAAGCT CGTCTTGCGT TAGCACGTTG TCTTCAACAA ACCTATGAAG CGTAAATGTT ACAGAAACGT TGTTTAATAA CGCGTTTATT AAAAAATCCA CTTGACGCGC GCTAAGCTTT TTTTGAGAGT CTACCGTATC TACCAATTTG TATATTTTGA CATTTTCAAT TTCGTTGTTT AAAAACATGC CAACTACTCG TCTGAGTTTA AGCGAAAAAT CCTTGTCCGG GTAGACTTGT TCGCATAACC AATTGTTTAA AGTGGTCTTC ACCACGGACA CTTTGGTCGT GAACGTTGTC GATTTAACTA GCTCTGTGAA AAAGTTTTTC ATTAAATTGG ACATTTTGCT TATCAGTCTA ACGAGCTGGT ATTTTTATTT AGGATCGCAT CAAGCGCTTG CTCGATTTCC AATTTTTTTC GGACGCTCTT AGCTTTATGG CTCGGTATAT TGTCCACGGC GGATTCAGTG TTCTTACTTA TTATGGCGGG ACTCACGATA ATAAAAACCA AAAACAATAT GAGTAGATAC AAAAAAATGC TGCTTTCCTT TTTGTCGTAC ACCAGACTGA ATACGGCCAG CGCGCCCAAC AACAAATACA AATTCATTTT TATTCCCTTA CTCTATTCGT TGCGATAATA CAACAACGAT TCTCCCGATG AACCTGAAGA ATTTCGATTG TGCTGCGCGT CGTCGCCGTC GTTGTTGTTG TTGTTACGAT TGTTGTTGGC GTTTTCGTCT TCGCTGCTCG TGTCGTCGTT GTCCAAACCG ATATTGTATT TGTTTAGATA GTGTTTGGTG CTCGCGGACG ACTCGTGGTT CATCAACTTG GCCACTTTTT GCAGAGGCAC ACCGCTGTTG TATAGGTTGC TACTTAAATA GTGTCTTATC ATGTTACTGC GCGGCCGCTC CATTTCAACG CCGGACTCTT CGAGGAGCCG CCTGAAATCT TTGAATGGCG TAGACGTGTT TTTGCTTATT TGCAAAATGG TGGGATTGCG CGAATAAATC TCGCGCGCCA ACTCGAGCGG TTTCATTTTT ATGTTATTGA GCGTGTTGTT ACGGCTTCGT TTTCGCTTCA AATTGATCGT GTCGCTGTGC AACTTTCCTC TTTTAATGAG CACATTGAGA TCGTCCACGC TGAGTTGGCG CGCTTCGTTG ATTCTCATGC CCGTGCCTAA CATGATACAA AACACTATCG CTCCTCTAAT CAAACCGCGA TCGTGAACAT AATCGCTGTT GAGCATTTTG ATTTTATTGT TAATAAAATG TAGTATGGTG TCTATGACAT TTTTGAGCAT CAAATTTTTT TCGTTTTCTT TAATATTTTT AAGTTCCTTG TCCCGCGGTA GCATAACCAT GCGGGGTATT TTGTATTCGG GCAAATTCAT CATGTTGGTG TAAAAATTGA TGGTCAACTG TAGCGTTTCT TTGGTGACAG AACGAAGCTC TAGCATGCGT CTGCACAGTT CTTGGGGATC GATGAGCAAC GATTGATTTT CTATCGAGTC AAACTCTTTG TCCAACGAGT ACGATATGTC TTCTAAATGA ACATCGTCCA CCGAGCAGTA TACAATTTTG ATGAATCGAG ATTTGTAGCT TTTTAAAGTG GTGGGCGCAA ACGGTTTGGG GAACATGTAC TTGCTCCACA AGCTGTTGTT TTTTACTTCG TCGGGCGTGC AGCGCTGCCG GTCCGTGGCC AAATCGAACA CGGCCTCAAA CCGGGGCGCG GACTGAATTT TTATTTTCCA TGAATTGAAA 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GTAGCGTTTT GGAACATGCT AGGCTGCTTG CCGGCTCGCG TCGCCAGCTC GGCCATGTAA TTGAATATGT TGGCCGACGC GGACAGCGGT GCCAAAAACG CGACGTTCTC TTTCAAACTC ATGACTCGGG CCCTGTTTTT TTCGTTCAGC ACATAATGGT AGTAATCGCC GCCGCCGGCA AACAGGTCTT CTATAACGGA ATTGACCAGA TCGTTGATCA TGTTGATATG CGGAAAACGG CGCGACTCGA CGGCGCTCTG TATGTTCGGC GGCAGGGTGG CGTGTTTGAG CAGCAGAGTC ATATAGTTGT TGGCCAACTG CTGGTTAAAC GGAAGCGGAA TGGGAATGTT GCACGTCACC GCCTCCGCCA CCATGTATTG AACGGCCACG CTGAGCTGTT TGGCGGCTTC GTTCAAAGCG TCTTTGCCCA ACATGTCGGC GCCGCCGTTG TAAAACTTTT GAGCGTACGC CGGTAGCGAG TTGAGCACAA ACGACGGCTG AAATATGTTG GAATCGCTCG ACAGCGATTC GGCAGCGCTG TTTTGTCCAA GTTCTTTTTG CAGGCGAATC AAATGGCGTA TCATGGTTTC TTCGGACTCG AACCGCTTTA CTACGTTTAC GCTAATCGGG TTTGTGTCAA TGCACATGTC TCGTATAGTG TTTATGAACA AAATCATTAG CGGGCTCAAT TCGGCCATGT CGTTGCAACG ATAGTATCTA ATAATTTTTT GAACAAAATC TACACATTTG TTATACCAAA TAGATTCGCC CGTATCAAGT GCCGACTCTT TAGCCTTGTT GTACGGAACA ACCGAATTCG CACTATTGCT GCGACTTGCA TAATCCATCC TGTTATCTCT TGTAACGGTG CTGGTATTGG TGGTAATGGT GGCCACCGTT GGCGGTGACG CGTAGCCAGG CGCGC 
Length65535
Protein Sequence
Protein Residue
A.thaliana
AGI-code
Description
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
1 Ahg357347
1.41421 Ahg928422
1.73205 Ahg321026 Domain of unknown function (DUF313)
2 Ahg919984 F-box associated ubiquitination effector family protein
2.44949 Ahg904936 F-box family protein
2.64575 Ahg891082
2.82843 Ahg495523 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein
3 Ahg899966 Putative membrane lipoprotein
3.16228 Ahg924761
3.4641 Ahg938044 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression