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ID : Virus2957

     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


Annotation
DescriptionBeet_soil-borne_mosaic_virus|plants|ssRNA
Sequence
AAATTCTTCC CATTCGCCAT CATTGAATCG TTATTCGTAT ACTGGAACGC AGTTAGGAGT GGCTCCAAAG CGTCTCGTTT AAAAATAGAT TGCGAAGTGA GTTCACCTAA GACGACGTCG GTGTTTTACG AATTTTTATA TAATCAAGAT GGCAGATTCG TTTGGTTTTT CTCCAATGGA GGTTTTGCTG TTTCGTGGTG AGTCATTAGA TCAGCTGACA TCTGACATGC CTTTGGATGT TCAGTGGGAT GTTGTCTACT CAGCTAGATG CTATGCCATT TGGAAGCATG ATCTTACTCA TCTCAATCCG TTGCTTAAGA ATTCGCAACG TTTGGCAAAA CGCTGGGACA AGTTGATTTC GGGCTTTGGT GGTCCTGTAC CTTTAGACAA GTTATTGACT GCTTTACTTG CTCTTATGAG GTATTGTATC ACCATGGGGG TGTCTGTACA GGATATCTAT TTATCTGATG TTGGTACAAC TTCAGATAAT TTGTTACATG TGTCTAGGGT TCATGGGTTG TGTTACTTTA AAGTGGTTGT ATGCCAAATT GTCTTTGTTT GGAAGGCATG GAAGGTTTTG GGTTGGATCT TCTTAGTCAT ACTGCTGCAA CTATTATTGA AGGGTCCTCG TGCTGTTAAT GGTCCTGATG TGGCTATTTC TGAAATGGTA GAAGCTTTTC ATTTGAAGGT TAAGTCCTTC ACTCGGTGGT CACCGTTTCT CAAACTCCCT AGAGAGAAGA AGATACTAGA GAGAGAATTG GGTTTTGTCC CATTATATAA GCAGAAGACT CGTGCTCCAC GTAATCATCC TGTGTTGGCT GCGTTGCGTG AGGTTATGAG GCAGGAGTAT GCGGCTAGTA GCAACATTTT AAATACAAAG TTGAAGACTT TGGTGATTGG TGCGGCCAGT 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CTAGGTTGAG TGTGTTTGTT GCTGATAATA GTATATTATC GCAGCGCCCT TGCGTTGATC TTTGATCCGC CCTATCTTTA ACTTTATTTG TATTAGTTTC TGTTGTCGTT GGTATTTAAC GTCATGGATT TGAATACTAT GATGCCAGCC TTTAATGTTG CTTATTGGGA CGGCGTTCAT GCTCCTTATG TTGTCAAGCG TATGATGCAT GAGGTGGTTA TGAATGTGGG ACCAGCTGGT TTTATATGTT ATCCGCTTCC TGTCGATTTT GATCTCAACG ACACTGGTGT GATTCATAAT TTTGCTTACC ATAATCGTGT TAAAACCATG AGATTATTTG TGGGCATTCA GAATAATTGT AGTGAGTGGG TTTATGGCCG TGCACGGTTT GTTGTGTTTT CAACCTCCGC TATCTCGCCT TGGGTGAATA ATGGTTGTAT GAGTCTATTC TCGCCTTTTG TTGGCGTTAA TAGTCCTATT GATCGTAATC TTTTGAGGAG AGATAGTCGT GGTGTTAGTG TGTTGTGGGA TCGTGTTTAT CGTGTTAATC GTGGCACACA GCTTTTTGTT GATGAGACGT TTAACTTCAT CGGGCCTGGA AATTATCCCG CCCAAGTTGG TGAAAATTAT CCGTCTGCCA CTACGTATGA TTCTATCTAC GTTGCTTGTG TGACCGATTG GATTGATAAC AATGTTTTTA GACTAACATC TGACAGCGTT GGTTGGTTTC ATTCTGGTTT AGACGACGGT CCTCGACTTG CTTTTGGGCA AGGTTTGAAT GCTCCCGATG ATGATGGTGA TGGTGTTGTT GGTGATGACG ATGTCGATGT TGATGGTGAA AACATTGACG AAGATGCCGA TGTCATGGAC GACGCTAACA CAGATGATGG TGATTAAAAT TTTTCGTCTC 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TGTGGCTCAA CTTATCTGAC CCTGCTTTCG CTATTCTTAT GACGAAAGTT TTTACGTTGA CTAATGCCGG TGGAGCCGAC AATGCCTCCG CCAGTTCACG TCGTGAAGTT GTGGCTGGGA GCCGACCCGA AACTTCTGGT AAGTCTGTAG GTACCGATGA GAGTGGCAGT TATACTTTGA CCACCACTTT ACAAGCTTTT AATCAAGCTA TCCGCTTACC TGAGGTTCTG TGGACTCGTG ATAAGTTTGA ACGGGAGTGG AATCTGCCAT GGACCCCTAC TAGGGGTGTT ACTCCTGCCG TTCCACGCAC CAATTAGCAA TTAAATGCTG CTCGAACTAT GGCACATATT CGAGCAGCAT TAAAGGCGCG TCTGTATCCT GGTGACAGTA TTGAGTGGGT TGGATGGGTG CATAGTTACC CCCCTCCACC ATATGATGGG TACGATGTTC CGTCTTTAGA TATTATTAAT GAGAAACTTG CTGCTGATGA TGTTGGTGGT TTGGTGTTAC CTACACCTGA TATTCCTGGT GGTCCCAATT TTGAGGTCTC CGAGGATATT GAGCAAACTG GTCGGAATGG TTTGTGGTTG ATGGTCGGGT TGCTATTAGC TGCCTTGGCT GTTGGTGTTG GGACTGCTGC CTACCATCGT CGCAAGTTGC GTAGTAGGTT AGTTGAACTA AAGAGTCTAT GGTTTTCTAG GGGTTCTGGT GGCGGCGGTG ATTTCACTGT TGAGTTACCA ACTAGAACTA CTGATGCCTT TAGTTTAGGT ACCACTATTT CTGAACATGC TCCACCTCCT GTAGGTACTA TGCGTCATCG TTCGACTACG GCGACTGATA GTCATGAGGC CCTTCCTTTT GAAACATGGG TTTATTTAAA TCTCTCTCGT GTGTATTTTA GTATCGGGTG TTCTGATCTC TTTTATGCGA CTAGAGAATT TGTTACTGTG TTTAATGGGG AGTTTGAGGG TCTTATCGAA CTACTTGAGG CGTCTGATGA GGATGATGGT GTTTATACTG ATGCTGAGAG TGCTGTCATT GTGGGTACTA GTGCTATTGT TAATGACCAC GATCAATTTG ATCTCAATAC TGTGATTCTT GAAAAGCGCA TAAAGTTTAA ACGGCTTTCT TTAGAGGAGG CGGAACTTAA TCGTCAGGAG TCTGTGACCA TCGAGTTTGC CGATGAGGAA CGTCGTACGC TCATGCATAA GTTAGAAAGC GATAGACTTG AGGCGACGCA TAAGGTGAAT AAGGCTGCTG CTGATGCTGA GGCAGCTCTA TCAGTTGCTG TTCTGGCTGC TAAAGAGGCT CGTACTTATG ATGATAAATT GGCTTTTGAT AGAGCTTGTA AGGAAAAGGA GCTAAGGCTA AGAGAGCTTG AGGTTGAGCG TATGCCCGGG AAGACTGAAA GATATATTCA CACAGGTATA CAAGGTGGTG CTCAACTCGC TGGTGCTTTA GCTGTCGGTA GTATGTTACG AACACGTGGT GTTAGTAATA TAACTCCGAG TAATGCTAGT GGTAGTCCTA CCGGTATTGG TCGTGTTCGT AGTGCTTCTC AGCCCGTACC CACTAGTTTG TCTGGTGGTT CTGTTCTGGG GGCTAATAAT AATAATAGTG TTGGCAGTGT TAGTTCAGGA AGTAGGGTAG AGTCGTTAGG GTATAATTCG GCTATTCGCA ATCATAACAC CTTTTGGTCC AAACTTCGTA TTGGAAGTGA ATGGCGCCAG AACAGCATAA GCAGAATGCA AGCGAGACCG CTAGCGGGCG GCGGAATTCC TCCGTCCGCT CCCGCGGTAT GAGTAAGGAT GACTGGTCTG TCACCCACCC AGATGATGTT TTCTCTATTA TTGAGAAAAC ATTGGTGGAG GATGGGTACA AATGGCATGG GGTAAAACCC GGTCATTGCG ATTGGGATAA GCTAGAGCAG TCTGGTGCTA TTAAGAATTT TAAAGGTACT TTAGAAGGCG AGGTCGATAG TAGTTGTTCA TTAACATGTA ACGCCGCGGC AATTAAGTTG GATATAGTAG AAAGATTAGA CGTGTCTTCT GACTGGTCCG CTCGGGTAGG CATTGTGTTA GGTGCGCCTG GTGTTGGGAA ATCGACTTCA ATTAAGCACA TCTTGGACAC TTATGGTTCT CGTTATAAAA TGGTGTTATG TTTACCAGTC AAACAGTTAC TCGACGGGGT GTTTTCGGGT AGAATGGACA CTTTTCTGAT TGATGACATA TTTAGTCGCT CTGTAGACTA TGGTAAGTAC CACACTATGT TAGTAGACGA GATCACTCGC GTTCATATGT GTGAGGTCCT GGTGTTGGCT GGTTATTTAG GCATTAAAAA TGTTATATGT TTCGGCGACC CTGCACAAGG TATTAACTTT AAGGCAGGGT CTGCTGTTAA CTATAACTTT CCTGTTATTG CTGAGTGCTA CTCTAGTCGT AGGTTCGGGG TTGCCACGGC TGATCTCATA AACTCCTGCA ATGGTGGTGG GAAATCAGTT GTTGGTAATA ACGATGTTAA AGACAACTGG ACATTTGAAG AATTGTGCGG TAAAATCGAG GAAATGTCCA CTGTGCTTGT TGCAACACAC GCCACAAAGG AGTTCTTAGC TGATGATGGC ATTGAAGCTG TATATTACGA AGATGCACAA GGTATGACTT ATGATGTGGT TACCATTGTG CTTAAGGATG AGTTTGACGA CGATGCCATC TGTGATAGCA ATGTGAGAGC 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Length14222
Protein Sequence
Protein Residue
A.thaliana
AGI-code
Description
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
1 Ahg922751
1.41421 Virus3591
2 Ahg887930 Plant protein of unknown function (DUF247)
2.23607 Ahg939327
2.64575 Ahg941972 transposable element gene
3 Ahg359263
3.4641 Ahg942605
4.58258 Ahg895617 SAUR-like auxin-responsive protein family
4.89898 Ahg952321 PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein
5.09902 Ahg916927 Protein of unknown function (DUF1278)
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression