Detail



ID : Virus3474

     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


Annotation
DescriptionMud_crab_dicistrovirus|invertebrates|ssRNA
Sequence
GAGCTCGGTA CCCGGTTTTC ACTCCGTGCA CGATTCCATT CACTATCTAT TGAGCTTCGA TATCACTCTG TTTTGACTCT AGTTATACTA CACTCAAGCA CACTGATATT ATCGTTCTGA TAGTTTGTGG TTTCATTAAA AGTGTATACA TTTATTTATA TTAAATACTG ACACTTTGCG GGTTAAAATG TTTAATACTA TTTTTCAATT TGAGGTTGTA TGAGATAATT TTGATTTCTA TGTTATCATT GAATAAGGGA GTCTGGCCCT AATTGATGTA CGACTCTTCT TTGGTTGCGA CCCGAGTCCC TTCTACATCA AGATGATTAT CAATTCTGTT TATGTATTGT GGACAAGTTC GACAGACCAC TTTATATATT CTGAATTGGT GAAGGTAAGT TATGATGTGA TACATAGTCT TTTGATGGTC CCCCTCATAT ATTTTTCAAG TTGCTTGGTA GTATTTTTCT TTTTGACTTT ACAAGCACCA CACTTATATA TTTACTTTAA GGTTATTTTC GTTATGGAAT TTACAACTTA TGATCAAACC TCTGTCGAAT CCCAAGTTTC CCTCCCCCAT GGTTGCCAGT TCGTGTATCC TGATCGACTC ATCCGAACAA CCCCACCGAT GCTGCTTAAC ACTTGGACTA AGACCCCTAA GTATTCCTCT GTTACACTTG CTCCTGCCTA CAAAGTTGGA CGTCGTCGGT TACCTTCTCA TAAACCTGTA TATCGCCATG CTACTATTGT TAACCTTGAG CACCAGGTGT TTGACCGTGA ATTGCCGTTC AGTGCTTCTC CTCCAGCTAA ACATTTCCTT AAAAAAGATG TTTATGACCC CTATCATTTG GATTCGGTTG ACCATGTTCC TTCTGTTTCA ATGCTTAAGA ATGAACATTG TGAACCGAGT GCTGATGATA TTGTAGGTTT GGAACAGTAT ATGAAGTGCC CCTTTTCATA CCTACTGGAC ACCTGGTGTG GAACGTGTTG CAAATATGCT AATTGTTTTA AATCAAAGAT AGCTGATGGT CCAGGACAGT GTAGTGATTG TCTTGCCTCT TTTCCCTTGG TAACTAATTG CCCACTACCA TTCCCCAAGA CTGAGTTTGG CTGTGTAACT GGGACCCAAT TGCACTATAC TGGCTTTGCT GATGTATTTA GGTGTAAGGA ATGCAATGTT TTGTTGGGCA TGTGGGCCCA AGATGATGAT CCTGTGTGTG AACATTCCCG GTTTTCTCCT GCTTGCTCTG GGAGTGCGAC TTGTGATGAC TCTTTTTGTT GTGATAGGCG TTGCTTTGCT GTTCCTTTGG ATCAAACTCC CTTCTGTTAT TGTTGTGGTA ATACTGGTTA CTGTAAGGCT GCATGTAAGA AATTCCAGGA ACATAAGAGG TGGGTGTATT CACAATCACC TCTTAAGTTT CTGCAACAAT GTGTGTCTGA CAAGATTTTG CCTAATTTTA AGTTTGCAGA ACTGAATGAT GATGATGGTG TTGTGTATTC AACTATCACT TGTGGAGATA AAACTGTTGT TGCTGCCGGT TTAACCAAAC GCTCTGCTCG TCGTGAAGCT GCGTGGCGAT ATCTTCTCTT TCATCCTATT TATCCCGAGG TTCATATGTT TGCACTGGGT ACTCTTCCTG CTCAAGCTAG TGAAACACTT GCCATGGCTG ATGCCACACT TGGACATGTT AACACTTTTC TAGATAAACA TGATACAGCA TTAACACACC TTACTGAAAA TGTCAATGTT AAATTAACAG ATGCTTCTCG AGATTTTGGA GGCCTTCTCC CCAAAATGAA GGATACTATG GATGATGTTT CTTCAACTCT GTCTTCTTTT AAAGCTCTTC TGGACAAGAT TTCAAGCTGG CTCCCCGCAG CCAACTGTGA TGTAATTTCT TTAGTTAAGG ATGTTTTTGT TTCTCTTTTC TTTGCTATGA CTACTAAATC TATAACACCT CTTATTCATG GCCTTGTCAG TTATTCTTTA CGCACCTCCT TCTTCTCTGT TCATTTATCC GCTTTGACCG AATGGCTGTC TACTTGTTCA TTTGGTGAGC CTTTGCCTGA TGAGCCTGAA GCTCATGGCT TCTTTGAGGA TATGATGGAG CGCGCTCCAA CATTAGATGG AGTTCGCAAA TCTGCTGCTT CTGTATATGA TTCTGTTGGA ACTGGTATGT GTATTGCTTT ATCTGGTATT TTGTCATTTG TTGCTATAGT ATGTTTAGGT ATTACAGATT TGTCAACTGC TTCTTTCAAT AAGTTGCTCA CTCAATCTTC CCTGGTGGGT AGGGCTTTGG TAGGTGTCCG GAGCTTTAAG GATGTGTTCT TTGGCATTTG GGATTGGGTC GATAATCAGG TATGTAAAGT GCTTTATGGC TCTGACAGGA AGACTTTGGA CATAACAAAG AATTATCCAC TTCTCACACC TCTTTTGACT ACTTTTTCTT ATTTTCATGA AAGTCAGGAT GCCAATGAAC TATTGGGTTG TAATTCAAGT GTATGTGAAC TATTGGTTAA GGCAGACAAT CTTTATGCTA ATTATGTGGA TAAGGCATTA ACTTTGAGGC ACCATGACAT AGTTGCTAGG CTTAAGGAGA GTAGATTGTT AGTTAAGACT AAAATAGAAA AAGCTAATTT ATATCTATCA TGTGGTGACG GCGCTCGTAT TCCTCCTACT ATCATCTATC TTATGGGTGG TGCTGGATGT GGCAAAACTG AGTTGTCTAG TTTACTTCAA AAATATCTCT CTAATAAATA TTATCCTGAT CTTAACCAGA AGGATGCTGT GTATTCAAGG AAGTCTGAAA ATGAGTTCTG GGATGGCGTG CGCCATTCCC ATGGGATTGT AGTATATGAT GACATTCTTC AGGTAGTTGA TTCAGCGCAG AAACCAAATA CTGAGATTTT TGAAATTATT AGGTTAGGTA ATAGTGATTC ATTTCAAGTT CATATTGCTG ATGTCAAAGG CAAGAGTGAC ACATATATTG CACCTTCATT TGTCATTGCT ACTTCTAATG TTGACCCTTT CACTTTTGAG CCTAAGTCTA TTCATTCTGT TGATGCCTTT GTGCGTAGAT TAAATATAGT AGTGGAAGTA GATATAGATG ATAATTTTGC TAAGTATGTT CAGGGTGCTC ATGGTAGGCG GAAGATCGCT TCGGAAGCAA AGATTTGGCA CTATCAAAAT CCAGGTAAGA CGAATCGCGA CTTGCGCGAG GCTGTTGAGA ATGGGACTTA TGCTTTGAAA ACTGAGACTG CTGTTTATAA ATTACATGTT ACTACTACTC TTGCTGGACG TACACAACGT GACACTTACA CATATGAGGA ATTTCTTCGG TTGATAGACC AATGCCGCAC TTTGTGCGTC GGGGCTCACT CTGACAAAAC CCCTTCTGCT ATGCCTGCTA TGCCTGATAA ACTTCAAGAA CTTGATGCTG AGCTAACGCC AGAGACTCAT GGAAAGAATG ATCCAACGTA CCGGGTATTC TCTACAACCT GGCTTGGTCC TTATGATAAC CCTATTGCTG CTTGTGCTTA TTTAAATGCT ACATTGCCTG CCCGCTTTTG TACTTATAAT GCTCAATTTG CTGATTGTTA TGTGTCTGAT GCTATTATTG ATGATTGCCT ACACCGTTAT TATTCTGAAG AGGATTTTGA TGTTACATCT TTCCTCGAAG ATATTATTGG TGTGCCTTGG CCTAGTGAAG AATTTGTGCA ACAGTTGCGT GAATGTCATT ATGTTAACAA GAGTTTATGG AGTAAGTGCG GTGAGCGTGT GGGTAAGGTA GTCTCCTCAC TCAAAGGTGC TTGGACAAAT GTGTGTGAAT TTCTTAAAGC TAACTGGTTA CCTATTTCAT CTTTGATTGG CGCTGGTCTT CTCATTGGCG GTGCCACCTC TATTTATATG TGTGCTAAGA ATTGTAATGT AATGTCTCTT CTATCTGAGG GTGGCTCTCT TCTTCAACTT GTAGGTACTC GTGCTTGTTA TTTATCATGT GATTTGTGCA ATAGAATTAG GAAAGCTGAT CTGACATTGC GGATCCGCAA TCGGTCAGAT GGGACTATTA TTCTGTGTCC GGATGATGTC CGGCGTGTGG CTAGGCACAT TGTTTCTTCT GCTGAAGTGT GTAAAATCCC AGTTCATCCT ACATTTATTT TGTCATTGTG TGAAGAGAAA TATGTGGTGC AAGATGAAGG CAATGATGTT GTGACTATGT TAGAATCCCA TCAGGATTAT GCCATTAAGA AGCCTTTAGT GGAATCTCAT CAAGATGCTA AATTAATTAA ACCTATCGTA GAGTCACACC AGGAGGTTAA ATTAATTAAG CCACTTGTCG AGTCCCACCA GGATGTGAAG TTGGTTAGAC CTGTCATTGA GTCCCACCAA GACGGTAAAA TTGTGAAGCC CCTTGTTGAA TCCCATCAGG ATGTTAAAAT TAAGAACCCA ATTGTTGAAA TTTGTGAGGT TGAAAGTCAT CAAGATCTCA GGGCAAAGCA AATACATGTT GAAGGTAATT TTCAGTCAGG TTATAGTATA GATTGGACAG ATATCATTGC TGAGTCATCA AATGATCATA ATGCCCAGGA TATTAGTAAG TCAATTTTGT CTAAAAATTT AGTTAGGATT ATGAAGCCTG ATTCTTCTTA CTACACACAT GGATTGTTTG TTAAAGGACG AATGTTGTTG ATGCCTAAGC ACATGTATGA TGTTTTGGAT GGTTATGTAG ATATAGTTAG TATTGCTGAT GTGAATTGTA CTCGTGTGCC TGTGCCTATA GTTTCTAGTA CTCCCCTCTA TCGTGGTGGA GTTGAGATCG ATGTCGTGAT TTGCGAAATG GGTCCATCTA CCCAGGCGCG TCGCGACATC ACTTCTTATT TTCCGCGTAA GAGTGAACTC TCTTCTCTCT CTGGTCTTCT GGATCACGGT GACTTGCGCT CTTTTACTAC TGAATTTTAC ACTTTCAAGA AGAAAGCACC TTTGTTGATA CCTAAGAATT CTTCTGTTCG TTACGTGAAG TCTATTGATA AAATAGTTTC TCGCAACGAA CAGCAGGATG CTTATCATAT CCGTGAAGGC TTTGAGTGCA TGGGTCATAC TTCGCGTGGT GATTGTTGTT CCCCTTACAT TCTCTTCAAC CCTTCTTCGC GTGCTAAGAT TATGGGATTG CACTGTGCCG GCTTTGCTGG TACAACCCGG ATTTTTGCCC AGATTGTTAC TCAAGAAGAC ATTGCCACTG CATCTCCTCA GACTCACGCT GGTATGGTAT CCACTGAGTA CCCTTTAACT TCAACTGTCA TTTCTCCATT ACCCAACACT CTTGTTGTTG GCTCTGTTCG TGCCGCTCCT CCTCCTACTA AATCTGATAT CATTGAGAGT CCTATTCATG GTTGCTTCCC AGTTTTGACT GCTCCTGCCA AATTGTATGT ACCTGGAGAA AATCTTATGA TCTTCAATGC TCTAAAGGTA ACTAAGAACG TTGTGTGTTT GCGCGAGGAT TTGATTGATC TGTGTGTTCA TGATGTCAAA CGTGTGTTGA ATACTCCTGG TGTTTCGGAT GCTGTACCCC GGATACTGTC CCACGAAGAA TCTATCACTG GAATTGAAGG TCGTCAATAT ATGAATGCTC TGAACCGGAG TACGTCTGCC GGATTTCCTT ATAGTCTGCG TAAGGCTAAA GGGAAACCCG GGAAGCAGAC GTGGTTGGGT TCAGATGAAT TTATTGTCGA TCATCCTGAG TTGAAGGAAC ACGTCGAGCT CATTATCAGC AAAGCTCGTA AGGGCATTGT TGATACTGAG CTCGGGGTGT TCACGGCGAC CCTGAAGGAT GAGCGGAGAC CTTTGGCTAA AGTGGAGGCG AACAAAACGC GAGTGTTCGC TGCTACCAAT CAGGCTTTAG CATTAGCTCA GCGTAGGTAT TTTCTTAGTT ATCTTGAACA TGTAATGCTT AATCGCGTAG ACAATGAGAT AGGTTTGGGT GTGAATGTGT ATTCGTATGA TTGGTCTAGA ATAGTCAATA AATTGCATCA TGTAGGTTCT AAGGTTATTG CTGGGGATTT TTCCAATTTT GATGGTTCAC TCAACTCCCA ACTTCTTGCT AGGGTTGCTG AAATTGTTAC TGATTGGTAT GATGATGATG AGGAGAATGG TTTGCTCCGT CACACTCTAA CGGAGTATCT TTTCAATGCT TGCCTTCTTA TAGATAACAC TGTTGTTCAA CTTAACCATT CTCAGCCTTC TGGTAATCCT CTTACCACTT TGATAAATTG CATGTATAAT ATGTTAATAT TTAGATATGT TTATCTTCTT GCTCACGAGG AAAATGGCTT TCCCTTGTCT CTTGCTAATT TTAGTGGGAA TCTCGCTGCT GTCTTCTATG GCGATGATTC TCTTTGTTGT GTCTCCGATA AAGTGTGTGA GTGGTTTAAT CAGCACTCGA TAACACGGCT TATGGCTGTC ACCGGCCATG TATATACTGA TGAAACCAAG AGTGGTTCAC CACCACCGTA TCGCGATATT TCTGAGGTGA CATTCCTTAA GAGAGAATTC GTGAAACGCG ACTCATTATG GATCGCTCCA CTATCTAAAA ACACAATAGA AGATATGTGT ATGTGGAGTA AGAAAAATAT AGAGTCACAA GAAGCCCTCA GACAAACCAC GCGGGTGGCT AGTTTTGAGG CATCGCTACA TGGGAGAAAG TACCATGAGC AATTTTGTGG AGTAATTCGC AAAGCCAGTC GCAAGGCTGG GTATAGTGAA TCCTGTTTGC ACTTTGCCGA GTGCAATGGA TTCCTTCTTG CTCAACAGGA ACGCGGAGGA GCTCATGATT CCGAGCTTCT AAGCTTACTT CTTTCAGAGT AGTTAGGGAC CGTTGACGAC AGCTCCACGT ATATGCTCAT TACGCCCACT GCGGAAACAA TGTGATGCTG TGGTGTATAC GTGGTCAAGC TAGCGGCGTG TCCCGCTTAT TTTAGTTTTA GTCTATCTTA GGTTAGGTTA ATTTAGTTTG TAGTTTTCTT TTCTCCATGT CTGGTTACCT ATCTATCTTA ACTACGCTCC AGACGACTAA ATTTAGTATG GCTTTCATGG AGAGGTTTGC TATTCAGCGT GCGTGTACCA TCGGCAGCCC CAAAAACACG CGTCAGGAGA TCTCCCCAGC CACCATGGGC TAGGTTGGCA GCCAGGTTTT AACTTGGTGG GGAGTAAAAT AGCCTGCTCC AATTCAAAAT TCTGATACTT CTATAATGGA TTCTTCCGTT ACTAACACTG GTGGTTTGAT GCCCTCGGCT ACTATTTCCA ATTCAGAGGG CGCTACAATG CTTCTAAATG ATATTCCTGA TCCCACTCAG AATGTTTTTC TTTCTCGCAA CGTTACTGAT AATTTGTTTG AAGTTCAAGA TCAGAATCTG ATTGAATCTT TATCTCGCGA AGTTCTTTTA GGCACTGGTA CTTGGCAATC CGGTCAAGCT GAAATTTCTA CTACCCTTAC AGAACAACAA CTTATCACAA ATTATGAACA GCCATCAATT AGACAAATTT CTTTACCTGA TGACATAGTT AAAGGTTCCT CTTTTATTGC CTCCAAATTA GCTAATATTG CTTATATGCG TTGCGATTAT GAGTTGTATC TTCGGGTCCA GGGTTCTCCA TTTCTTCAGG GTCTTCTCTT GCTTTGGAAT AAGATGAATG CGGATCAAAC TTCTAAGATT CGTTCCTCAA TTACTGAACA CCTTCGCTCT ATTACTTCTT TTCCTGGTGT CACACTTAAT ATGCAATCCG ACTCAAGATC TGTTAAGCTA GTAATTCCTT ATACTAGTGA ATTTCAAGTT TTTAATCCTC GTAATGAAAA TAAGTTAAAT TCCGTTCGGC TTTCAATTCT TTCAGCTTTG CGAGGACCTT CTACTTCTGA GAAAGCTACT TATTCTATTA TGGGACGTAT GACCAATATA AAGCTGTATG GTCATGCACC TTCTATTGTC TCACTTTCTT ATCCCCAAAC TGAAGGTGGT GATGACGCCA CAGCTTCTCA ACGTGGTATA GTCACACAGG TTGCCGATAC TGTCTCTTCT ATTTCTAATG TGGTGGATGG TCTTGGTGTG CCTCTTCTTT CCTCCATTTC CAAACCTATT GGGTGGGTGT CTAATGTGGT GAGCAATGTT GCGTCAATTT TTGGTTTTTC TAAGGATCGT GATCTTTCTA AAGTTTCTCC CTATGAGAAT ATTCCTGCTA AGGGTTTCAC ACATGGTGTT GGTTTTGATT ATGGTGTATC CACTTTCGCT TTTCCTGATA ACGCTATTGA TCCTACTATT GCTAATCCTG AGTCCATTGA TGAGATGTCT ATTCAATATT TGGCTTCTCG GCCGTATATG TTGGATAGGT ATACCATCAA AGGTGGAAAT ACTCCCTCGC CGTCAGGTAC TGTTGTTGCT GATATCCCTA TTAGTCCTGT CAATTACTCT CTCTATGGTA GTATTATCCG TGATTATAGA ACCATTTTTG GTGCTCCTGT CAGTCTAGCT GTTGCGATGG CTTCATGGTG GCGAGCTAAA ATTCACCTTA ATCTTCAGTT CGCAAAGACA CAATACCACC AGTGTCGTTT ACTTGTTCAG TATCTTCCCT ATGGTTCTGA TGTTCAATCT CTTGAAAATG TTCTTTCCCA AATTATTGAT ATATCCCATG TTGATGAGAG TGGTATTGAT TTATGCTTTC CTTCTATTTT CACAAATAAA TGGATGCGTT CTTATGATCC TGCCACTGAA GGCTACACTG CTGGGTGCGC GCCTGGAAGA ATTCTTATTT CTGTGCTTAA TCCTCTAATT TCTGCTAGTA CTGTTAATGA TGACATTGTT ATGATGCCAT GGCTTACTTG GGAAAATCTT GAACTTGCTG AGCCTGGCTC TCTTGCTAAG GCTGCTATTG GTTTTGACTA TCCTGCTGAT GCTGTTGACG AGAAATGGAC ATCTCGTGAG TTGCCTGTCA CCGGTTCTTC TTTTAATCTT TTTCGTGATA CCACTATTGT TCTTGGTGCC TCTACTAATA TTTCTAATCT TGTTCTTACT AATGATGACA CTGGGGGTGA TTACCAGATA GTTTCTACTA CTCCTACTGG CTCTTATGTT TCTGCTGTCA CATGTCCTCA AGGAACTTAT ACCATCACTC ATGATGGTGT GGGTGCTACT ATTATTAGCA ATTTTCCTAT TCTTGGTGCT GGTGAGGGTC CTTCTTTTCA GATTTCCGCT TTGCGTCATG GTGATAAGGT CACGATAACA GAGGATCCTA CTAAGATAAA TGTTAGTGGT GTTAGTTTTC TCACTGGCAC CAATTCTTGG AAAGCTAGTT TGAAGGATAG TTCTGGAACT TTGTTAGGAC GCTTAGAGTA TGATGGTACT TCTTTTTCTA GTGATTCACC TGCTAGCTTA ATTCCTGGTA AGTATAATGT GGAGCTTGAT CCTGCTGATA ATTCTGCCGT AGTCACCATT GTTGCTAACA ATTCATTTGG AACTGCTTCT CTTGATACAC ATGGTGGTGG GATGGATTAT GCTAAATCAG ATTCTTCTTC TTTAGTTACA ACAATGGGTG AGCAATTTCG TTCTCTTCGT ATGCTCACTC GTCGCTCTAG TCCTACTGAT GTTCTTACTG GTACCTCTGT CACTCTACCT GGTATTACTA TTGGTACTGA TAGTTCTTTG CGTCAGAGTG TTTTAAATAT TATTTCTTAT ATGTATCGCT TTACTAAGGG TAGTATTTCA TATAAAATTA TTCCTAAAAT TAAGGGTGAT CTTTATATAA CCACTTCTAG TGCTGACAAT ATTGAATTAA ATTCTAATGC TTATTCCTTT GATGTAAATC GTGCTCTACA CTATCAAAAT ACAGCCTTAA ATCCTGTGGT TCAAGTTAGT CTACCATATT ACTGTCCTTC TGAAAATCTC GTAATTGATT CTACTTCTTT TCCTAATCTC AGTAATTTAG TTTTAACTAA CCTCGAGCGT TCTAGTAATA CATATACTGT TCTGGTCAGT GCAGGTGATG ACCATACTTT TTCTCAACTT GCTGGGTGTC CCGCCTTTAC TATTGGCCCC AGCAGGTCTG CTGCTTAAAT CTCTTACCTT AAGAGTCCAC TCTCTGAGTG GTTAACCCGT CGCGAGACGC GTGGGTTGAG TTGTCATGAC ATTTGTCAGT TGTGACGAGT GTAACTCAAC AGTTTTTCCT AACCACGCGT CGCGTGGCAG GTTTTTTAAT CTGAGAGTTA CATTCCTACC CACTAAGGTT CCTGACAATA GCTTTATCCG GCTATCTAGT TACCTAGGTT TACTTTTATT AGTTGACCTT AGGAGTGTAA CCAGTGTACA CTTGCTTACC TTAATTGGTT GGCTAACTAG TCGCTATGCA TTTTCGTGCA TATCGGCGGA TTCCTAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAA 
Length10436
Protein Sequence
Protein Residue
A.thaliana
AGI-code
Description
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
0 Virus0316
1.41421 Ahg948552 phloem protein 2-A8
1.73205 Ahg916535 Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein
2.44949 Ahg928172
2.82843 Ahg907099 Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein
2.82843 Ahg497388
3.16228 Virus1402
3.16228 Ahg915561 Leucine-rich repeat (LRR) family protein
3.74166 Ahg471479 Leucine-rich repeat (LRR) family protein
5 Ahg328172 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression