Detail



ID : Virus3797

     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


Annotation
DescriptionSwine_pasivirus_1|vertebrates|ssRNA
Sequence
GCTTTTGACC AGTGGCTCTG GGTTACTTAG CCAAGTCCCT TTCTCTTATT TTCACTAGTT TATGTTGTGT GTTGTCTGTT TTGTTTTGTT TAAATTGTAT ACAAGATCCT TCCCGCCGAC ACAGACCTCG ACAGTCTGGT GTAGGAGGGT TGGTGATATT AATTTGCCCC AAAAGAGTGA CCGTGATACG TGGAAACCAT GAGTACATGT GTATCCGTGG AGGATCGCCC GGGACTGGAT TCCATATCCC ATTGCCATCC CAACAAACGG AGGGTATACC CACCACGTGC GCGTTTGCAG TGGGAATCTG CAAATTTAGT CATACTGCCT GATAGGGTGT GGGCCTGCAC TTTGGGGTAC TCAGGCTGTT CATATAATAT GGATGTTGTT GTTGATACTT TAACTAAGGA AGTTTCTCAA ACGTTGCTTG GTGATACTGC TGAATCTGGC GGAGGTTTTG GTGGTGTTCT TTCGGGATCA GCCACCACTA ATGCAGCAAA TATTGTCCAG CATAGTGCTG CTCCTACGGC TCCTGCCAAT CCTGTTTTGG ATGCCAATGA CCCTTATGAA GCATGTGCGT ACTCGAAAGA GACCTCACGC GAAACTCCGT CTAAAATGGT TTTGCTTGAC ATTGTGCATT TTGACAACAC CTGGGTATGG GGCGGAAATG ATAAGTTGCA ATTGCCATTA CCCAAATGCT TTTGGAAGAA TCGGTCGTTT CCTGCTTATG GCACATCACG ATATTTTCAG TTCTTTCGTG GTTCGTTCCA TATTAAGATT CAGGTCAATG CTGCTGCAGG TTCTGCCGGT TCTTTTGTCG TTGTCTATGT GCCAAATGAC CATTATCAGA GTTGGAATAA TAAGGATTTG ATACTCCATA CAATGTTTAA TTGGCCACAT GTCATTTTTA ATGTGGCGAC TATGACTGAG GCAGATTTGT ACATTCCTTA CATTAATACC CACAATCTTG CTAACACTGA TTCTTCTGAC TGCGGGTGGG TGGTAGTTAC ACCTTTTACG CACTTGGAAG TAGCTAGCAC CACTACTAAT ACACTGGACA TTGCTGTTTT CGGGTCTTTG GTTGATTTTC AATTCCAAGG CCCAAGGCCA TATACCGATT TACCTAGTGA TTCTCAGGGG CCCAAGCGTG TTGCCCGCAA TAAGAAATAT AAGTACACAC GCAACAAAAT TGATATTGCT GAAGGGCCTG GATCAATGAA CATCGCCAAT GTACTTAGCA CAACAGCCGC CCAATCGATA GCTTTGGTTG GTGAACGTGC TTTTATTGAT CCTAGTGTTG CAGGCACGAG AGTGAGAGTC CGCACGTTTC GTGATGTAAC AAAAATTAAA GCATTACCTT TGCTACCGTT CACAGCTTCA CATAGTGAAT ATTGTATTTT TGATTGGCAG GCTAGCCATG CTCCAACAAC CAAGTCTCCG ATTTTTGGGC GTGGCTATAA GATACGAGAG CTTGGTAATT TGGGTCCATT GTCAACAGCC TATCAGTTTT GGCGTGGTTC TATTATTTTC ACTCTCACCA TTTTTGCTAG CAGTTTTCAC CGTGGCAGGC TTAGAATTGT CTTGTTTCCA AATGGAACCC ACAGTTTTAG TCAGGATGAT GCCAATGCGT TGATATTTAC TGTCTGTGAC ATTGGTGAAC AATCCTCATT TGATATTACT TTGCCATTTA CTCATTACAA TTGGATTAGG GAATGTGATA ATTCTGTAGT TGTCCTGGTC AACGTGTATG TTGAAACCCG ATTGGCTCAC AATAATGCAT CTTCCAACGT TATAAAATGC GCACTTTTTG TGCGTGGCGG CGAGGATTTT GAGTTCTTGG CGCCATGCGG TGACACTGTC AAGTTCCATG GTTGGGGATC GGATATGGAT GAAGCTGATC CTTTGGATGA CATGGAACCA GGACATCCTG ATTGTCTTAC ATTGGAATCT AAAGATGGGA GTAGTGGTAA AGGGCCCCAG TGTGCGCAGA TGGCTGGATT AACAAGTGTG GAGAATGATG GCACAACTGA TAACCAACTT AATTGTGCAG CACCTAAGTT TATCAATATC CATAAGCTGA CTACTTCAAT ATTTGCCAAA GATCATATGC ACCTTGATTA TTTCTTTGGT CGTGGATGGT ATGTCATGAA ACATAACTAT GAGGGCGAGA GCCGTGCCCC TTTTTATATT GATGTGGATG CTCCATCGTC TATGCCAGGC GCTGCAATGA ATTTCTTTTC TTTCTGGGCT GGGGAGGTTA ACTTCCATGT TGTCAACAAT AGTGATGACC CAATGGCTGT CACTCATAGT TATTCGCATG AGGCTAGCAC TGTTGGTCCC GCTGAAGGTC TAGGGTTGAT AATTGTGCCG CCTCGTGAGA TGATATCATT TGCAGCCCCT TTCTATTCCT GGTCGCCATT GCGGACTGTG CTTGCTCACC AAAATAGTGC AGTTAAGCGC ACGTTTGGCA TTTTGAAGTT AGTGCCTGAG GCTCCAAAAG GACAGGTCAT TGTTTATGCA TCACTTAGAA CTCCATGCTT CTTCTTAGTC AAGCCATTTC CTATACAGAC AACTGCAGCT AAGATGGCTG TGTATCCATC AAAGCTGACA TCAGCTGAGG AGGCAGAGGA GCTAAAGTTC AAATTGGTGC ATGAGCCTTA TGAGCAGTTT TTTATCCCCC ATTATGGGGA TATTCCTAGT TTTCAAAGGG ATTTTATTAA TTGGCTAGGC AGTAAAGAAG AATTACAAAA CATGATATTA CAATGTGGAG ATGTGGAACA AAATCCTGGC CCTGTCTTGA TGTATGATGG TAATAAGAAA TTTTGTGTCC CAGTCTGCAA TGGTTATTTG ACTTTTCATG GCAGTCCCGA ACAGTTCTTG GTGAGTGGTA ATGGCACACT CATCATTTAT AAAGAAGTTT ATGGAATGCT TCCTTACGAA GAGGCTTACC CAGAGGATCT GTCTAGCAAT TGGCATATTG AATGGCAGTG TGTCAATGGC AAGGTTGATT CTTTGGTTAA GAGGATGGCT AATTGGATGT TGCTGCGTTA TATTGATCTA GTTATCTTTG GTGGCACTTG GAGAAGGTTG CTCGCCCCCA ACACAGATAT GAAATTTGAC TCCCAGGGAG TTGATGACAT GATGAATTCT TTGACTGGGC TGCTTAATTC TTCTGCTATG GAGTTGCTGG GTAATGATGT TTCAAAATCT ATATTGTGCT GTCTGGTCCG CTTTGTTGCG GTGCTTGTCA TGTTTTTTCG TAATCCTGAC CTTATTAATG GAGTTGCACT GGCATCTTAT TTAGCCTCTG AATTTTCTAG TGTAAGACTT GTGTCGTCTC AAACAGCCGC TTTTGTGGAT GCCCTTTTTA ATGGTGATTT GTATAAACTC TCTGAACAAT TCCTTTCAAT GATGGATATT GGTTCTGATT CTGACTATAA ACAATTAATC AAGGAGACGT TGGGATCGTA CCCTCCTGAA ATGAACCCAT TTGAGTCACA GAGTTTGGCT GCATTTAATG CTTTGTCCTT GAGTGCTCGT AATTGTACAT GGTGGATTGA GCTCTTCCAG AAATTGCACA CGTTCGTGCG TGACTTATTG AAACCAGATA CTTCGGCAAA GTTTCATGAA TGGTGTAGGA AAAATAAGAT GCTCATTTCC AATTTTATGT ATACTCTTAA TGAGCATTTG AAGGATTGTG CCACCACCTG CAATTTGCGT AAGAGGGAAT TTAGAGACAA GCATAAGTGG TTGTTATCTG TTCTTAATCG CCTTACTGAG GGTTTTACCA CGTATGGGGT ACAGAATGAT ATCACACGAG CATTGTTGGA CATGCGTAAG AGCATGTTAG CTGTTAAGCT AGGGCAAGAA TATCAGAATA CGTGTGCTCG TGAGGAGCCC CTTGGTGTGC TGCTACGTGG CGAACCTGGA CAAGGAAAAT CCTTTATGAC ACATCTGCTC GTGCGTAGTG TTTGCAATGC TATGGGCTGG AAGGTTTCTG AGAGTGTGTT TAGCCACCCT ACATCAAGTG AGTTCTTTGA TGGGTATGCT GGGCAACCGA TTCATCTTAT CGATGATTTT GGGCAGAATG TGGAGGAACC TGAATATAAA GTTTTGTGCC AGTGTATGTC TTCCATACCA TTTTCTGTGC CTATGGCTTC GCTTGAGGAA AAGGGTTTGC CTTATACTTC AAAGTTAGTT ATTGCCACGA CAAATAAATC AGATTGGTCA TCTCGTACCT TGTGCGCTCC AGGTGCTTTG AAGCGCCGGT TTCCTATTGT TTATACCGTT CGCGCACGGA GGACTTTAAC CAAGAATGGC CTTCTTGATG TCAACGCACA TATGAGTGCA GTGCGCGATG GAGCAGCATG GGAGTATACT ACCAATGGTT ATGACTGGCA ACCCTTTTCT GTTAATGATC TTGCTGCTGA AATAATTAAA CAGTTAGAGC AGCGTAGGGA ATCTTTTCAA CTCTGGAATT CTTTTATTAG TCAGGCTCCT GAAACTTTTG AGGCTTGGTG TGATGATATG GTGTCCCTTC TTGGCCCTGC TGTTCCAGTT GCTTCAGTGT TCGACTATTG CGCTAGCACT GGTGTTGTAC CCATGTTAAA GCAAGCGTCG GAATCTGTCC TTAAGTGGTT TGATTCGTGT GTTGACAGCA TGGTGTCGTT TGTTACACGT AACAAAAAGT GGATTGCTTT TGGTGCTTTA ACTATGAGTG TGTTAGGTAT TGCTATATCT ATGCTTAAGG AATTGGACAG CCAGCGTCCC TATAATCAGA CCGCCCATAA GATGCCTGTT ACTAAGCTCA CGCGTGGGCG ACGTGTGCTT GTTTCCCAAG GCCCTTATAA TGAATTCCAG CATTATTCTA AATACTGTGT TTTTCTCCAT TCTGGGTCTA TTACACTTCA TGGCCTTGCA TTTGGTGGTA ATTCTTTTTT GTTTTACACA CATGGCCTTG CTACTCTTGA GCGCTATGAT AATTGGGTGC TTGACTATAA TGGGTCCATG TTTGATTTAG ATATTGAAAC TGTGGATGAG TTATACTTGA ATGGAGAGTC CATGGACCTT TGTCTTATCA CCTGCAAGCC TTTACCTGTT ACTTTTGCTA GCATCGTGGG CCATTTGTCT GATGGAGACC TTGGAGATGG TGTCATCTTG TGGCGAGGTC GAGAGGGCCT AACATGTATG CCAATTTATG ACCTTCACCA TTATGGCACT GTCACCACTA ACCAAGGAGA TACATGCACA TCAGCAATAC GCTACCGTGC AAAAACGACA CGCGGTATGT GTGGTGGCCT TGTTTTGTCT AAAATTAGTG GCACTTATAA AGCTGTTGGT TTGCATGTTG CTGGAAATGG TGTTTATGGT GTTGCAGCAA GTCTGAGTGT GTGTAAGCAG CTTGAAAGTC AAGGACTAGT CACCGACACC AAACCATGGC CTGGTGTGCG TGTACATCAA CCTTCAAAGA GTGTTCTAAA GCCCTCTCCA CTTTATGGCT TTGTCGAACA GGAGCTCCAC CCAGCGGTGT TGAGCCCGTT TGACAATCGC CTGAAGTGTG AGGTTGACTC TGTGATTGGC AGACAAGCTT TGAAATACAA TTCAAATGTT TTTAATCCTG GACCTTACTA TGATGAAGTG CTTGAGGCGT TCGCAGTTGA TTTTAATGGC AGGTTTGGTA TTAATGAAAT GATGTCAGCT GAAGAGGTCT TTGCCCTATC TGGTGACGAA GCGATCGAGC TTTCTACCTC ACCTGGTTTA AAGTATACTA GTAAGGGCTT GAGAAAGAGG GATCTCGTGC CTGGTGGCAA GGCATGTGAC CTATTATTGA GTGATGTTGA ACGCCTTATG AATGATCCAA AAGGAACTCC TGTCTACTTC TACTGTCACC TTAAAGATGA GCTTAGGCCC CAAGAGAAGA TTGAACAAGG CCTTACAAGG TGCATTGAAA GTAGCGATTT TGACTATGTT TTTAGTGCCA AAAGAGTCTT TTGCAAGCTG TTCCGGCAAC TTTATGATTC TGACCCTATT GAGACTGGAT TTGCTGTTGG TATCAACTGT ATTGCTGACT GGAAGAATTT GTTGGACGGC ATGTATGATT ACATTTATGA TTTTGATCTG AAAGGATATG ATGGTTCTAT ACCACGTCAG CTCATGATAG ATGCTTGTCG TGTCTTGAGT GAAAGTTGTA GTGATGAAGA GTTAGCCTAC AATTTACTCC ACAAAACTGT GGATTCACAG CATGTGGTAG GTAACCAGCT TTTGACAGTT TCTGGTGGAA TGGCTTCAGG ATCACCTTTT ACAACTATTG TCAATACAGC TTGTAATATC CTTGCAAATA TGACTGTTCT TGAGGAGGAG GGTGTTGAGT ATACGCTAGT GTGTTATGGT GATGATATAC TAGTCTCCAC CTCCGATCCC ATTTCTGTCA ATGACTATGT TGACAAAATG GGGCAATATT TTGGGTTCAC TGTCAAGCTT GATGGTGATT ATCCCAAGAC TAAAAATAAT TTTACTTTTC TAAAACGGAG AACTACTTAC TGGAACGGCA TTCCAGTTGG AGCGATGGAA GTTGGCCTTT TGTTGCAACA TCTTGGGTAT TGTCGGTCAG TGAGTGTTTT CCAGGACCAA TTAAATTCAG CAAGTATAGA GCTTGCTTTG CATGGCCCAG AAACGTATAA TGTGTTGCGT TCGCGCGTCA ATTCATTCCT GAATGGAACC GGGTTTGCTT TGATGAGTTA CCGCAGGGCC GCGGCAGTGG TGGGCTCTAT GCTTTCCTAG ATTTGTGGTC ACAATTGGCT GTTATTCTGA ATTGATTCTA ACCAATTGGG TGTGTTCCAA TTTACTTGAT TGGCTCTGGT TTTAATTTGT TTAATTTGGC TGATTGGATG TATTGCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAA 
Length6916
Protein Sequence
Protein Residue
A.thaliana
AGI-code
Description
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
1 Ahg944235 SEC14-like 12
1.41421 Virus1147
1.73205 Virus0370
2 Ahg931363
2.23607 Virus3608
2.64575 Ahg913543 Pectin lyase-like superfamily protein
3 Ahg937285
3.31662 Ahg947513
3.4641 Virus2592
3.4641 Ahg315601 DegP protease 3
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression