BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg311694
Length=3990
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G06150.1 | Symbols: EMB1444 | basic helix-loop-helix (bHLH) ... 6124 0.0
AT1G06149.1 | Symbols: CPuORF8 | conserved peptide upstream ope... 3437 0.0
AT2G31280.3 | Symbols: CPUORF7 | conserved peptide upstream ope... 981 0.0
> AT1G06150.1 | Symbols: EMB1444 | basic helix-loop-helix (bHLH)
DNA-binding superfamily protein | chr1:1867015-1873718 REVERSE
LENGTH=4607
Length=4607
Score = 6124 bits (3316), Expect = 0.0
Identities = 3776/3997 (94%), Gaps = 35/3997 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTCTACCTTGCAACAGATACTGAGGAGCCTCTGCTCCAACACGGATTGGAACTAT 60
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 ATGGGTTATACCTTGCAACAGATACTGAGGAGCATCTGCTCCAACACGGATTGGAACTAC 584
Query 61 GCCGTGTTCTGGAAACTCAATCACCACTCTCCTATGGTGCTTACTTTGGAGGATGTGTAC 120
||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 585 GCCGTGTTCTGGAAACTTAATCACCACTCGCCAATGGTTCTTACTTTGGAGGATGTGTAC 644
Query 121 TGTGTTAATCATGAGCGCGGTTTGATGCAGAAAAGCTTGCAAGGAGGGTGCCATGCACAT 180
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct 645 TGTGTTAATCATGAGCGCGGTTTGATGCCGGAAAGCTTGCATGGAGGGCGCCATGCTCAT 704
Query 181 GATCCC-CTTGGGTTAGCTGTGGCTAAGATGTCATATCATGTACACTCTCTTGGGGAAGG 239
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 GA-CCCTCTTGGGTTAGCTGTGGCTAAGATGTCATATCATGTACACTCTCTTGGGGAAGG 763
Query 240 GACTGTAGGACAAGTGGCAATCTCTGGACAACATCAATGGATCTTCTCTGAATATTTGAA 299
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 GATTGTAGGACAAGTAGCAATCTCTGGACAACATCAATGGATCTTCTCTGAATATTTGAA 823
Query 300 TGACTCTCCTTCGACACTTCAGGTTCACAACGGCTGGGAGAGTCAAATTTCTGCTGGAAT 359
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 TGACTCTCATTCGACACTTCAGGTTCACAACGGTTGGGAGAGTCAAATTTCTGCTGGAAT 883
Query 360 TAAGACTATTCTTATAGTAGCTGTTGGTTCTTGTGGAGTTGTGCAGCTTGGCTCTTTGTG 419
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TAAGACAATTCTTATAGTAGCTGTTGGTTCTTGCGGAGTTGTGCAGCTTGGCTCTTTGTG 943
Query 420 TAAAGTTGAAGAAGACCCGGCTTTGGTGACTCATATCAGGCATTTGTTTTTGGCACTTAA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 944 TAAAGTTGAAGAAGACCCGGCTTTGGTGACTCATATCAGGCATTTATTTTTGGCACTTAC 1003
Query 480 GGATCCACTGGCAGACCATGCATCAAATTCAGTGCGATGTGATATTAACAGTCCATCGGA 539
||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 GGATCCACTAGCAGACCATGCATCAAATTTAATGCAATGTGATATTAACAGTCCATCGGA 1063
Query 540 TCTGCCAACTATACCTTCCAAATGCTTACACGAGGCATTCCCTGATTTCTCAGGAGAATT 599
|| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 TCGGCCAAAAATACCTTCCAAATGCTTACATGAGGCATCCCCTGATTTCTCAGGAGAATT 1123
Query 600 TGACAAAGCTATGGATATGGGAGGGTTAAATATTGTATCTCAAAACACAAGTAATAGAAG 659
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 TGACAAAGCTATGGATATGGAAGGGTTAAATATTGTATCTCAAAACACAAGTAATAGAAG 1183
Query 660 TGACGACCTTCCATACAATTTCACTCCAACATATGTTCATATGGAGAGGACTGCTCAAGT 719
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TAACGACCTTCCATACAATTTCACTCCAACATATTTTCACATGGAGAGGACTGCTCAAGT 1243
Query 720 AATTGGTGGGCTTGAAGCAGTCCAACCTTCCATGTTTGGAAGCAATTATTGTGTTACAAG 779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1244 AATTGGTGGGCTTGAAGCAGTCCAACCTTCCATGTTTGGAAGCAATGATTGTGTTACAAG 1303
Query 780 TGGTTTTTCAGTTGATGTGGTTGATGCTAAACACGAGAATCAAGTGGGTATAAATGATAT 839
|||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1304 TGGTTTTTCAGTTGGTGTGGTTGATACTAAACACAAGAATCAAGTGGATATAAGTGATAT 1363
Query 840 GAGTAAGGTAATTTATGATGAGGAAACTGGTGGATACCGATACTCAAGAGAATCAGATCC 899
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1364 GAGTAAGGTGATTTATGATGAGGAAACAGGTGGATACCGATACTCAAGAGAATTAGATCC 1423
Query 900 TAATTTCCAACAGTACTCGAGAAATCATCTGCGTAATAGTGCAGGCTCATCTGCTTTAGC 959
||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1424 CAATTTCCAACACTACTCGAGGAATCATGTGCGTAATAGTGGAGGCACATCTGCTTTAGC 1483
Query 960 AATGAAGACTGATAGGCTAAAAGCAGGTCCATCATATCCACAACTTGATTCACCTGTTCT 1019
||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1484 TATGGAGAGTGATAGGCTAAAAGCAGGTTCATCATATCCACAACTTGATTCAACTGTACT 1543
Query 1020 AACTGCGTT-AATAACAGATAAAGATTATTCTCATCGAAATGAGGTTTTCCAACCATCTG 1078
|||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 TACTGCGTTGAA-AACAGATAAAGATTATTCTCGTCGAAATGAGGTTTTCCAACCATCTG 1602
Query 1079 AGAGCCAAGGAAGTATGTATGTGAAAGATACAGAACATAGGCAGGAGaaaaaaaGTGAGT 1138
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1603 AGAGCCAAGGAAGTATATTTGTGAAAGATACAGAACATAGGCAGGAGGAAAAAAGTGAGT 1662
Query 1139 CAAGTCGGTTGGATGCTTTAACTGCATCTTTGTCTTCTTTTTCTGGCAGTGAGCTGCTAG 1198
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1663 CAAGTCAGTTGGATGCTTTAACTGCATCTTTGTGTTCTTTTTCTGGCAGTGAGCTGTTAG 1722
Query 1199 AGGCATTAGGGCCAGCTTTCAGTAAAACGAGCACTGGTTATGAAGAGCTAGCAAAGTTTG 1258
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1723 AGGCATTAGGGCCAGCGTTCAGTAAAACAAGCACTGATTATGGGGAGCTAGCAAAGTTTG 1782
Query 1259 AATCTGCTGCAGCTATAAGACGAACAAATGATATGAGCCATAGTCACCTGACATTTGACT 1318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1783 AATCTGCTGCAGCTATAAGACGAACAAATGATATGAGCCATAGTCACCTGACATTTGAAT 1842
Query 1319 CCAGCCCCGAGAATCTTCTAGATGCCGTTGTTGCTAGTATGAGTAATGGTGATGGTAATG 1378
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 CCAGCTCCGAGAATCTTCTAGATGCCGTTGTTGCTAGTATGAGTAATGGTGATGGTAATG 1902
Query 1379 TCAGGCGTGAAATATCGTCAAGTAGGTCAACTCAGTCATTACTTACAACTGCTCAAATGG 1438
|||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1903 TCAGGCGTGAAATATCTTCAAGCAGGTCAACACAGTCATTGCTTACAACTGCTGAAATGG 1962
Query 1439 CAGAGGCAGAACCTTTTGGTCATAATAAGCAAAGTCTTGTTAGCACAGTTGATAGTGTGA 1498
|| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 CACAGGCAGAACCTTTTGGTCATAATAAGCAAAATATTGTTAGCACAGTTGATAGTGTGA 2022
Query 1499 TTAGCCAGCCGCCTTC-AGCAGAGGGGCGTATCCTACAGAATCCATCAAATATCTGTGGA 1557
||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2023 TTAGCCAGCCGCC-TCTAGCAGATGGGCTTATCCAACAGAATCCATCAAATATCTGCGGA 2081
Query 1558 GCATTTTCTTCCATTGGGTTTTCATCAACATGTCTCAGTTCATCCAGCGACCAGTTTCCG 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 GCATTTTCTTCCATTGGGTTTTCATCAACATGTCTCAGTTCATCCAGCGACCAGTTTCCG 2141
Query 1618 ACGTCCCTGGAAATTCCCAAGAAGAACAAAAAGAGAGCTAAACCTGGTGAAAGTTCTCGG 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 ACGTCCCTGGAAATTCCCAAGAAGAACAAAAAGAGAGCTAAACCTGGTGAAAGTTCTCGG 2201
Query 1678 CCTCGTCCAAGGGACAGGCAACTTATTCAGGATCGTATCAAAGAACTAAGGGAGCTTGTG 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 CCTCGTCCAAGGGACAGGCAACTTATTCAGGATCGTATCAAAGAACTAAGGGAGCTTGTG 2261
Query 1738 CCTAATGGATCTAAGTGCAGTATTGATTCTTTGCTAGAGTGCACGATCAAGCACATGCTC 1797
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 CCTAATGGATCTAAGTGCAGTATTGATTCCTTGCTAGAGTGCACGATCAAGCACATGCTC 2321
Query 1798 TTTCTGCAGAATGTCTCTAAGCATGCCGACAAGCTCACTAAAAGTGCAAGTTCAAAGATG 1857
|| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 TTCCTGCAGAGTGTCTCTCAGCATGCTGACAAGCTCACTAAAAGTGCAAGTTCAAAGATG 2381
Query 1858 CAGCACAAGGATAATGGCACCCTAGGATCATCTAGCACTAGCACTGAACAAGGTTCGAGC 1917
|| |||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 CAACACAAGGATACCGGCACCCTAGGA--ATAT--CA--AGCACTGAACAAGGTTCGAGC 2435
Query 1918 TGGGCAGTGGAGATTGGAGGCCATCTTCAAGTGTGTTCAATCATGGTGGAGAATCTGGAC 1977
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 TGGGCAGTGGAGATTGGAGGCCATCTGCAAGTGTGCTCAATCATGGTGGAGAATCTGGAC 2495
Query 1978 AAAGAAGGAGTGATGCTTATCGAGATGTTATGCGAAGAATGTAGCCACTTTCTCGAGATA 2037
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496 AAAGAAGGAGTGATGCTTATTGAGATGCTATGCGAAGAATGTAGCCACTTTCTCGAGATA 2555
Query 2038 GCAAACGTGATAAGGAGCTTGGAACTTATCATCCTCAGAGGCATCACTGAGAAACAAGGC 2097
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2556 GCGAACGTGATAAGGAGCTTGGAACTCATCATCCTCAGAGGCACCACTGAGAAACAAGGC 2615
Query 2098 GAGAAAACATGGATATGCTTTGTAGTGGAGGGACAAAACAACAAAGTAATGCACAGGATG 2157
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2616 GAGAAAACATGGATATGTTTTGTAGTGGAGGGACAAAACAACAAAGTAATGCACAGGATG 2675
Query 2158 GACATCCTGTGGTCTCTGGTGCAGATATTTCAACCCAAGGCCACAATTAACGGTCTGCAT 2217
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||
Sbjct 2676 GACATCCTGTGGTCTCTTGTGCAAATATTTCAACCCAAGGCTACAA--A-CAGTCTGCAT 2732
Query 2218 CTTTGTCGACAATACTCAAATTCTTCTTACATGAATGCTTTTGTCAACGTGCGTAGTCTT 2277
|||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||| |||||||
Sbjct 2733 CTTTATCGACAAT-CTCAAATTCTT-T-ACATGAATGCTTTCGCCAATGTGCATAGTCTT 2789
Query 2278 CGGGTACCCTCTCACCATCTTCTTCTCCTCCGAGATTGCTCAACTTCACTCTCCCCGTAT 2337
|||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| | | |
Sbjct 2790 CGGGTACCTTCTCACCATCTTC---------GAGATTTCTCAGCGTCACTCTCTCTGGCT 2840
Query 2338 CTTCCAA-TCTTAAAGCAAATCATCAAGCAATGCTCGACCCCCAAGCTTCTGGAGTCTGC 2396
| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2841 CCTCCAAAT-TTAAAGAAAATCATCAAGCAATGCTCGACGCCCAAGCTTCTGGAGTCTGC 2899
Query 2397 TTTAGCCGCCATGATCAAGACGAGCC-AAACCCAAAACTGTTACTTAATGAACCAATTCA 2455
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2900 TTTAGCCGCCATGATCAAGACGAGCCTAAACC-AAGACTGTCGCTTAATGAACCAATTCA 2958
Query 2456 TCACTGCTTGCTCTTCCTTTAATCGTCTTGATCTCGCGGTTTCCTTCATGACCCAGATGC 2515
||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 2959 TCACTGCCTGCACTTCCTTTAAACGTCTTGACCTCGCAGTTTCCACCATGACCCAGATGC 3018
Query 2516 AGAAACCTAATGTTTTCGTCTATAACGCGTTGATTAAAGGCTTCGTTACTTGTTCTCACC 2575
|| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019 AGGAACCTAATGTTTTCGTCTACAACGCGTTGTTTAAAGGCTTCGTTACTTGTTCTCACC 3078
Query 2576 CGATTCGATCTCTGGAATTCTATGTTCGTATGCTCAGGGACTCCGTTTCTCCATCAAGCT 2635
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3079 CGATTCGATCTCTGGAATTGTATGTTCGTATGCTCAGGGACTCGGTTTCTCCATCAAGCT 3138
Query 2636 ACACGTACTCTTCACTAGTACAGGCTTCTGCTTTCGCTTCTGGGTTTGGAGAATCACTTC 2695
|||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |
Sbjct 3139 ACACGTACTCTTCACTAGTAAAGGCGTCTTCTTTCGCTTCTAGGTTTGGGGAATCACTCC 3198
Query 2696 AGGCGCACATCTGGAAATTTGGATTTGGTTTCCATGTTCAAATTCAGACGACTCTTATTG 2755
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3199 AGGCGCACATCTGGAAATTTGGATTTGGTTTCCATGTTAAAATTCAGACGACTCTTATTG 3258
Query 2756 GTTTTTATTCAGCCTCTGGTAGAATCAGAGAAGCCAGGAAAGTGTTTGATGAAATGCCTG 2815
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3259 ATTTTTATTCAGCCACTGGTAGAATCAGGGAAGCCAGGAAAGTGTTTGATGAAATGCCTG 3318
Query 2816 AAAGAGATGATGTTACTTGGACCACAATGGTTTCTGCTTATCGCCAGGTCTTGGATATGG 2875
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||
Sbjct 3319 AAAGAGATGATATTGCTTGGACCACAATGGTTTCTGCTTATCGTCGGGTTTTGGATATGG 3378
Query 2876 ACTCTGCCAATTCTTTAGCTAACCAAATGCCGGAGAAGAATGAGGCTACGTGGAACTGTT 2935
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3379 ACTCTGCGAATTCTTTAGCTAACCAAATGTCGGAGAAGAATGAGGCTACGTCGAACTGTT 3438
Query 2936 TGATTGATGGCTATACGAGATTAGGCAATCTGGAACAAGCAGAGTCATTGTTTAATCAGA 2995
||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3439 TGATTAATGGATATATGGGATTAGGCAATCTGGAACAAGCAGAGTCATTGTTTAATCAGA 3498
Query 2996 TGCCTGTGAAGGACATAATCTCATGGACCACTATGATCAACGGTTACTCGC-GCAATAAA 3054
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||
Sbjct 3499 TGCCTGTGAAGGACATAATCTCATGGACCACTATGATCAAGGGTTACTCGCAG-AATAAA 3557
Query 3055 AGATATAGAGAAGCAATTGCAGTTTTCTACAAAATGATGGAGGAAGGG-ATCATTCCTGA 3113
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 3558 AGATATAGAGAAGCAATTGCAGTGTTCTACAAAATGATGGAGGA-GGGCATCATTCCTGA 3616
Query 3114 TGAGGTTACTATGTCAACTGTTATTTCAGCTTGTGCCCATCTCGGCGTGCTGGAAATAGG 3173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3617 TGAGGTTACTATGTCAACTGTTATTTCAGCTTGTGCCCATCTCGGCGTGCTGGAAATAGG 3676
Query 3174 TAAGGAGGTTCATATGTACACGGTGCAGAACGGGTTTGTCCTTGATGTCTACATTGGTTC 3233
|||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3677 TAAGGAGGTTCATATGTACACGTTACAGAACGGTTTTGTTCTTGATGTCTACATTGGTTC 3736
Query 3234 TGCACTGGTAGATATGCATTCTAAATGCGGTAGCTTAGAGCGGGCGCTTCTGGTTTTCTT 3293
|||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3737 TGCACTGGTAGATATGTATTCCAAATGTGGTAGCTTAGAGCGGGCGCTTCTGGTGTTCTT 3796
Query 3294 CAATTTGCCCAAAAAGAATCTATTTTGTTGGAATTCGATCATTGAAGGACTGGCGGCTCA 3353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3797 CAATTTGCCCAAAAAGAATCTATTTTGTTGGAATTCGATCATTGAAGGACTGGCGGCTCA 3856
Query 3354 TGGTTTTGCACAGGAAGCACTGAAAATGTTCGCCAAGATGGAGATGGAGTCGGTCAAACC 3413
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3857 TGGTTTTGCACAAGAAGCACTGAAAATGTTTGCCAAGATGGAGATGGAGTCGGTGAAACC 3916
Query 3414 TAACGCAGTCACTTTTGTGAGTGTTCTTACTGCGTGTACTCACGCAGGTCTTGTTGAAGA 3473
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3917 TAACGCAGTCACTTTTGTGAGTGTTTTTACTGCGTGTACTCACGCAGGTCTTGTTGACGA 3976
Query 3474 AGGCCGGAGGATATATCGTAACATGATTGATGACTATTCCATTGTCTCTAATGTTGAACA 3533
||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3977 AGGTCGGAGGATATATCGCAGCATGATTGATGACTATTCCATTGTCTCTAATGTTGAACA 4036
Query 3534 TTATGGATGCATGGTTCATCTATTCAGCAAAGCGGGGTTGATCTATGAGGCTCTTGAATT 3593
||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4037 TTACGGAGGCATGGTTCATCTATTCAGCAAAGCTGGGTTGATCTATGAGGCTCTTGAATT 4096
Query 3594 GATCGGAAGTATGGAATTTGAACCAAATGCGGTTATCTGGGGGGCCTTGCTTGATGGATG 3653
||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4097 GATTGGAAATATGGAATTTGAACCAAATGCGGTTATCTGGGGGGCCTTGCTTGATGGGTG 4156
Query 3654 CAGAATTCACAAGAATCTAGAGATAGCTGAGATAGCGTTTAACAAACTGATGGTTTTGGA 3713
|||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4157 CAGAATTCACAAGAATCTCGTGATAGCTGAAATAGCGTTTAACAAACTGATGGTTTTGGA 4216
Query 3714 GCCGATGAATAGTGGGTATTATTTCCTTTTAGTTAGCATGTATGCAGAACAAAACAGGTG 3773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4217 GCCGATGAATAGTGGGTATTATTTCCTTTTAGTTAGCATGTATGCAGAACAAAACAGGTG 4276
Query 3774 GAGAGATGTTGCAGAGATTAGGGGAAGGATGAGAGAGTTGGGTATAGAAAAGATATGTCC 3833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4277 GAGAGATGTTGCAGAGATTAGGGGAAGGATGAGAGAGTTGGGTATAGAAAAGATATGTCC 4336
Query 3834 TGGGACAAGTTCGATCCGGATAGATAAACGAGACCATCTGTTTGCTGCAGCTGATAAGTC 3893
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4337 TGGGACAAGTTCGATTCGGATAGATAAACGAGACCATCTGTTTGCTGCAGCTGATAAGTC 4396
Query 3894 TCACTCAGCTTCAGATGAGGTTTGCTTGCTGCTTGATGAGATTTATGAGCAGATGGGATT 3953
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 4397 TCACTCAGCTTCAGATGAGGTTTGCTTGCTGCTTGATGAGATATATGATCAGATGGGATT 4456
Query 3954 AGCTGGATATGTGCAGGAAACTGATAATGTATATTAA 3990
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4457 AGCTGGATATGTGCAGGAAACTGAGAATGTATATTAA 4493
> AT1G06149.1 | Symbols: CPuORF8 | conserved peptide upstream open
reading frame 8 | chr1:1868989-1873718 REVERSE LENGTH=2968
Length=2968
Score = 3437 bits (1861), Expect = 0.0
Identities = 2093/2206 (95%), Gaps = 12/2206 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTCTACCTTGCAACAGATACTGAGGAGCCTCTGCTCCAACACGGATTGGAACTAT 60
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 ATGGGTTATACCTTGCAACAGATACTGAGGAGCATCTGCTCCAACACGGATTGGAACTAC 584
Query 61 GCCGTGTTCTGGAAACTCAATCACCACTCTCCTATGGTGCTTACTTTGGAGGATGTGTAC 120
||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 585 GCCGTGTTCTGGAAACTTAATCACCACTCGCCAATGGTTCTTACTTTGGAGGATGTGTAC 644
Query 121 TGTGTTAATCATGAGCGCGGTTTGATGCAGAAAAGCTTGCAAGGAGGGTGCCATGCACAT 180
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct 645 TGTGTTAATCATGAGCGCGGTTTGATGCCGGAAAGCTTGCATGGAGGGCGCCATGCTCAT 704
Query 181 GATCCC-CTTGGGTTAGCTGTGGCTAAGATGTCATATCATGTACACTCTCTTGGGGAAGG 239
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 GA-CCCTCTTGGGTTAGCTGTGGCTAAGATGTCATATCATGTACACTCTCTTGGGGAAGG 763
Query 240 GACTGTAGGACAAGTGGCAATCTCTGGACAACATCAATGGATCTTCTCTGAATATTTGAA 299
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 GATTGTAGGACAAGTAGCAATCTCTGGACAACATCAATGGATCTTCTCTGAATATTTGAA 823
Query 300 TGACTCTCCTTCGACACTTCAGGTTCACAACGGCTGGGAGAGTCAAATTTCTGCTGGAAT 359
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 TGACTCTCATTCGACACTTCAGGTTCACAACGGTTGGGAGAGTCAAATTTCTGCTGGAAT 883
Query 360 TAAGACTATTCTTATAGTAGCTGTTGGTTCTTGTGGAGTTGTGCAGCTTGGCTCTTTGTG 419
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TAAGACAATTCTTATAGTAGCTGTTGGTTCTTGCGGAGTTGTGCAGCTTGGCTCTTTGTG 943
Query 420 TAAAGTTGAAGAAGACCCGGCTTTGGTGACTCATATCAGGCATTTGTTTTTGGCACTTAA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 944 TAAAGTTGAAGAAGACCCGGCTTTGGTGACTCATATCAGGCATTTATTTTTGGCACTTAC 1003
Query 480 GGATCCACTGGCAGACCATGCATCAAATTCAGTGCGATGTGATATTAACAGTCCATCGGA 539
||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 GGATCCACTAGCAGACCATGCATCAAATTTAATGCAATGTGATATTAACAGTCCATCGGA 1063
Query 540 TCTGCCAACTATACCTTCCAAATGCTTACACGAGGCATTCCCTGATTTCTCAGGAGAATT 599
|| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 TCGGCCAAAAATACCTTCCAAATGCTTACATGAGGCATCCCCTGATTTCTCAGGAGAATT 1123
Query 600 TGACAAAGCTATGGATATGGGAGGGTTAAATATTGTATCTCAAAACACAAGTAATAGAAG 659
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 TGACAAAGCTATGGATATGGAAGGGTTAAATATTGTATCTCAAAACACAAGTAATAGAAG 1183
Query 660 TGACGACCTTCCATACAATTTCACTCCAACATATGTTCATATGGAGAGGACTGCTCAAGT 719
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TAACGACCTTCCATACAATTTCACTCCAACATATTTTCACATGGAGAGGACTGCTCAAGT 1243
Query 720 AATTGGTGGGCTTGAAGCAGTCCAACCTTCCATGTTTGGAAGCAATTATTGTGTTACAAG 779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1244 AATTGGTGGGCTTGAAGCAGTCCAACCTTCCATGTTTGGAAGCAATGATTGTGTTACAAG 1303
Query 780 TGGTTTTTCAGTTGATGTGGTTGATGCTAAACACGAGAATCAAGTGGGTATAAATGATAT 839
|||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1304 TGGTTTTTCAGTTGGTGTGGTTGATACTAAACACAAGAATCAAGTGGATATAAGTGATAT 1363
Query 840 GAGTAAGGTAATTTATGATGAGGAAACTGGTGGATACCGATACTCAAGAGAATCAGATCC 899
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1364 GAGTAAGGTGATTTATGATGAGGAAACAGGTGGATACCGATACTCAAGAGAATTAGATCC 1423
Query 900 TAATTTCCAACAGTACTCGAGAAATCATCTGCGTAATAGTGCAGGCTCATCTGCTTTAGC 959
||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1424 CAATTTCCAACACTACTCGAGGAATCATGTGCGTAATAGTGGAGGCACATCTGCTTTAGC 1483
Query 960 AATGAAGACTGATAGGCTAAAAGCAGGTCCATCATATCCACAACTTGATTCACCTGTTCT 1019
||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1484 TATGGAGAGTGATAGGCTAAAAGCAGGTTCATCATATCCACAACTTGATTCAACTGTACT 1543
Query 1020 AACTGCGTT-AATAACAGATAAAGATTATTCTCATCGAAATGAGGTTTTCCAACCATCTG 1078
|||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 TACTGCGTTGAA-AACAGATAAAGATTATTCTCGTCGAAATGAGGTTTTCCAACCATCTG 1602
Query 1079 AGAGCCAAGGAAGTATGTATGTGAAAGATACAGAACATAGGCAGGAGaaaaaaaGTGAGT 1138
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1603 AGAGCCAAGGAAGTATATTTGTGAAAGATACAGAACATAGGCAGGAGGAAAAAAGTGAGT 1662
Query 1139 CAAGTCGGTTGGATGCTTTAACTGCATCTTTGTCTTCTTTTTCTGGCAGTGAGCTGCTAG 1198
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1663 CAAGTCAGTTGGATGCTTTAACTGCATCTTTGTGTTCTTTTTCTGGCAGTGAGCTGTTAG 1722
Query 1199 AGGCATTAGGGCCAGCTTTCAGTAAAACGAGCACTGGTTATGAAGAGCTAGCAAAGTTTG 1258
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1723 AGGCATTAGGGCCAGCGTTCAGTAAAACAAGCACTGATTATGGGGAGCTAGCAAAGTTTG 1782
Query 1259 AATCTGCTGCAGCTATAAGACGAACAAATGATATGAGCCATAGTCACCTGACATTTGACT 1318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1783 AATCTGCTGCAGCTATAAGACGAACAAATGATATGAGCCATAGTCACCTGACATTTGAAT 1842
Query 1319 CCAGCCCCGAGAATCTTCTAGATGCCGTTGTTGCTAGTATGAGTAATGGTGATGGTAATG 1378
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 CCAGCTCCGAGAATCTTCTAGATGCCGTTGTTGCTAGTATGAGTAATGGTGATGGTAATG 1902
Query 1379 TCAGGCGTGAAATATCGTCAAGTAGGTCAACTCAGTCATTACTTACAACTGCTCAAATGG 1438
|||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1903 TCAGGCGTGAAATATCTTCAAGCAGGTCAACACAGTCATTGCTTACAACTGCTGAAATGG 1962
Query 1439 CAGAGGCAGAACCTTTTGGTCATAATAAGCAAAGTCTTGTTAGCACAGTTGATAGTGTGA 1498
|| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 CACAGGCAGAACCTTTTGGTCATAATAAGCAAAATATTGTTAGCACAGTTGATAGTGTGA 2022
Query 1499 TTAGCCAGCCGCCTTC-AGCAGAGGGGCGTATCCTACAGAATCCATCAAATATCTGTGGA 1557
||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2023 TTAGCCAGCCGCC-TCTAGCAGATGGGCTTATCCAACAGAATCCATCAAATATCTGCGGA 2081
Query 1558 GCATTTTCTTCCATTGGGTTTTCATCAACATGTCTCAGTTCATCCAGCGACCAGTTTCCG 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 GCATTTTCTTCCATTGGGTTTTCATCAACATGTCTCAGTTCATCCAGCGACCAGTTTCCG 2141
Query 1618 ACGTCCCTGGAAATTCCCAAGAAGAACAAAAAGAGAGCTAAACCTGGTGAAAGTTCTCGG 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 ACGTCCCTGGAAATTCCCAAGAAGAACAAAAAGAGAGCTAAACCTGGTGAAAGTTCTCGG 2201
Query 1678 CCTCGTCCAAGGGACAGGCAACTTATTCAGGATCGTATCAAAGAACTAAGGGAGCTTGTG 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 CCTCGTCCAAGGGACAGGCAACTTATTCAGGATCGTATCAAAGAACTAAGGGAGCTTGTG 2261
Query 1738 CCTAATGGATCTAAGTGCAGTATTGATTCTTTGCTAGAGTGCACGATCAAGCACATGCTC 1797
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 CCTAATGGATCTAAGTGCAGTATTGATTCCTTGCTAGAGTGCACGATCAAGCACATGCTC 2321
Query 1798 TTTCTGCAGAATGTCTCTAAGCATGCCGACAAGCTCACTAAAAGTGCAAGTTCAAAGATG 1857
|| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 TTCCTGCAGAGTGTCTCTCAGCATGCTGACAAGCTCACTAAAAGTGCAAGTTCAAAGATG 2381
Query 1858 CAGCACAAGGATAATGGCACCCTAGGATCATCTAGCACTAGCACTGAACAAGGTTCGAGC 1917
|| |||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 CAACACAAGGATACCGGCACCCTAGGA--ATAT--CA--AGCACTGAACAAGGTTCGAGC 2435
Query 1918 TGGGCAGTGGAGATTGGAGGCCATCTTCAAGTGTGTTCAATCATGGTGGAGAATCTGGAC 1977
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 TGGGCAGTGGAGATTGGAGGCCATCTGCAAGTGTGCTCAATCATGGTGGAGAATCTGGAC 2495
Query 1978 AAAGAAGGAGTGATGCTTATCGAGATGTTATGCGAAGAATGTAGCCACTTTCTCGAGATA 2037
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496 AAAGAAGGAGTGATGCTTATTGAGATGCTATGCGAAGAATGTAGCCACTTTCTCGAGATA 2555
Query 2038 GCAAACGTGATAAGGAGCTTGGAACTTATCATCCTCAGAGGCATCACTGAGAAACAAGGC 2097
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2556 GCGAACGTGATAAGGAGCTTGGAACTCATCATCCTCAGAGGCACCACTGAGAAACAAGGC 2615
Query 2098 GAGAAAACATGGATATGCTTTGTAGTGGAGGGACAAAACAACAAAGTAATGCACAGGATG 2157
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2616 GAGAAAACATGGATATGTTTTGTAGTGGAGGGACAAAACAACAAAGTAATGCACAGGATG 2675
Query 2158 GACATCCTGTGGTCTCTGGTGCAGATATTTCAACCCAAGGCCACAA 2203
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2676 GACATCCTGTGGTCTCTTGTGCAAATATTTCAACCCAAGGCTACAA 2721
> AT2G31280.3 | Symbols: CPUORF7 | conserved peptide upstream open
reading frame 7 | chr2:13339087-13343662 FORWARD LENGTH=3043
Length=3043
Score = 981 bits (531), Expect = 0.0
Identities = 1534/2001 (77%), Gaps = 138/2001 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 175 GCACATGATCCCCTTGGGTTAGCTGTGGCTAAGATGTCATATCATGTAC-ACTCTCTTGG 233
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||| ||
Sbjct 745 GCACATGACCCCCTTGGGTTAGCTGTGGCAAAGATGTCTTATCATGT-CTATTCTCTAGG 803
Query 234 GGAAGGGACTGTAGGACAAGTGGCAATCTCTGGACAACATCAAT-GG-ATCTTCTCTGAA 291
|||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |||| |||| || || ||| | |||
Sbjct 804 GGAAGGGATTGTAGGACAAGTTGCAGTTTCTGGAGAACACCAATGGGTAT-TTC-CCGAA 861
Query 292 TATT-TGAATGACTCT-CCTTCGA-CACTTCAGGTTCACAACGGCTGGGAGAGTCAAATT 348
||| | || ||| | | || | || || || |||| |||| ||||| |||||||||
Sbjct 862 AATTAT-AACAACTGTAAC-TC-AGCATTTGAGTTTCATAACGTTTGGGAAAGTCAAATT 918
Query 349 TCTGCTGGAATTAAGACTATTCTTATAGTAGCTGTTGGTTCTTGTGGAGTTGTGCAGCTT 408
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||
Sbjct 919 TCTGCTGGAATTAAGACCATTCTTGTAGTAGCTGTTGGTCCATGTGGAGTTGTTCAGCTA 978
Query 409 GGCTCTTTGTGTAAAGTTGAA-GAAGACCCGGCTTTGGTGACTCATATCAGGCATTTGTT 467
|||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||| ||||||| | ||||| ||
Sbjct 979 GGCTCTTTGTGTAAAGTT-AATGAAGATGTGAATTTTGTGAATCATATCCGACATTTATT 1037
Query 468 TTTGGCACTTAAGGATCCACTGGCAGACCATGCATCAAA-TTCAGTGCGATGTGATATTA 526
| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || || || |||| |||| |
Sbjct 1038 TCTGGCACTTAGGGATCCATTGGCAGACCATGCAGCAAATTTAAG-GCAATGTAATATGA 1096
Query 527 AC-AGTCCATCGGATCTGCCAACTATACCTTCCAAATGCTTACA--C-GAGGCATTCCCT 582
|| | || | | |||||||| || ||||| || | ||||| | ||||| ||||||
Sbjct 1097 ACAATTCGTTATG-TCTGCCAAAAATGCCTTCTGAAGGTTTACATGCTGAGGCTTTCCCT 1155
Query 583 GATTTCTCAGGAGAATTTGACAAAGCTATGGATATGGGAGGGTTAAATATTGTATCTCAA 642
|||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||| || |||||
Sbjct 1156 GATTGCTCTGGAGAAGTTGACAAAGCTATGGACGTGGAAGAGTCCAATATTCTAACTCAA 1215
Query 643 AACACAAGTA-ATAGAAGTGACGA-CCTTCCATACAATTTCACTCCAACAT-ATGT-TCA 698
||| || || | |||||||| | | | || ||||| | ||||| | | |||| |
Sbjct 1216 TACAAAACTAGA-AGAAGTGA-TAGCATGCCTTACAA--T-ACTCCTTCGTCATGTCTTG 1270
Query 699 T-ATGGAG-AGGACTGCTCAAGTAATTGGTGGGCTTGAAGCAGTCCAACCTTCCATGTT- 755
| |||||| ||| | || ||||| ||||||| | ||||| || ||| || | ||
Sbjct 1271 TCATGGAGAAGG-CAGCCCAAGTTGTTGGTGGTCGTGAAGTTGTGCAAGGATCTA-CTTG 1328
Query 756 TGGAAGCAATTA-TTGTGTTACAAGTGGTTTTTCAGTTGA-TGTGGTTGATGCTAAACAC 813
||| || | || | ||||||| ||| ||| ||||||| | |||||| ||| |||||
Sbjct 1329 TGGGAGTTA-TAGTGGTGTTACGTTTGGCTTTCCAGTTGACT-TGGTTGGTGCCAAACAT 1386
Query 814 GAGAATCAAGTGGGTA-TAAATGAT-ATGAGTAAGGTAATTTATGATGAGGAA--ACTGG 869
||||||||||| |||| | ||| || || || | | | | ||| || |||| ||| |
Sbjct 1387 GAGAATCAAGTAGGTACT-AAT-ATAATCAGGGATGCACCTCATG-TG-GGAATGACTAG 1442
Query 870 TGGATACCGATACTCAAGAGAATCAGATCCTAATTTCCAACAGTACT-CG-AGAAATCAT 927
||| | | | | ||||| || | |||||||||||| || | ||| | | || ||||||
Sbjct 1443 TGGCTGCAAAGATTCAAGGGATTTAGATCCTAATTTACATCTGTA-TATGAAG-AATCAT 1500
Query 928 CTGCGT-AATAG-TGCAGGCTCATCTGCTTTAGCAA-TGAAGACTGATAGGCT-AAAAGC 983
||| | ||| | | || || ||||||||||||||| || || |||| || | | || |
Sbjct 1501 GTGC-TCAAT-GATACAAGCACATCTGCTTTAGCAATTG-AGGCTGAAAGATTGATAA-C 1556
Query 984 AGGTCC-ATCATATCCACAACTTGATTCACCTGTTCTA-ACTGCGTTAATAACAGATAAA 1041
| | || ||||||||||| || || ||| || ||| | || | | | ||||||||||
Sbjct 1557 AAG-CCAATCATATCCACGCCTGGACTCAACTTTTC-AGGCTACCTCGAGAACAGATAAA 1614
Query 1042 GATTA-TTCTCATCGA-AATGAGGTTTTCCAACCATCTGAGAGCCAAGGAAGTATGTATG 1099
|| | |||| | | | ||||| || ||||||| |||||||| |||||||| || ||
Sbjct 1615 GA-AAGTTCTTA-CCATAATGAAGTGTTCCAACTATCTGAGAACCAAGGAAATAAATACA 1672
Query 1100 TGAAAGATACAGAACATAGGCAGGAGaaaaaaaGTGAGTCAAGTCGGTTGGATGCTTT-A 1158
| ||||| || || | || || || || || | ||||| |||| || |||||||| |
Sbjct 1673 TAAAAGAGACTGAGCGTATGCTGGGGAGGAACTGCGAGTCTAGTCAATTTGATGCTTTGA 1732
Query 1159 ACTGCATCTTTGTCTTCTTTTTCTGGCAGTGAGCTGCTAGAGGCATTAGGGC-CAGCTTT 1217
|| ||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| ||| | |||||
Sbjct 1733 TCT-CATCTGGGTATACTTTTGCTGGCAGCGAGCTACTAGAAGCGTTA-GGCTCTGCTTT 1790
Query 1218 C-AGTAAAACGAGCACTGGTTATGAAGAGCTAGC-AAAGTTTGAATC-TGCTGCAGCTAT 1274
| || |||||| ||||||| | || |||||| | |||| |||| | || | || | ||
Sbjct 1791 CAAG-CAAACGAACACTGGTCAGGAGGAGCTA-CTGAAGTCTGAA-CATGGTTCAACAAT 1847
Query 1275 AAGACGAACAAATGATATGAGCCATAGTCACCTGACATTTGACTCC-AGCCCCGAGAATC 1333
|||| |||| | |||||||| ||||| || || || |||||| || |||| |||||||
Sbjct 1848 GAGACCAACAGACGATATGAGTCATAGCCAGCTCACGTTTGAC-CCTGGCCCTGAGAATC 1906
Query 1334 TTCTAGATGCCGTTGTTGCTAGTATGAGT-AATGGTGATGGTAATGTC-AGGCG-TGAAA 1390
|||||||||| || ||||||| | || || || | |||||||||| | ||| | ||| |
Sbjct 1907 TTCTAGATGCTGTGGTTGCTAATGTGTGTCAA-AGAGATGGTAATG-CGAGG-GATGATA 1963
Query 1391 T-ATCGTCAAGTAGGTCAACT-CAGTCATTACTTACAACTGCTCAA-ATGGCAGAGGCAG 1447
| || ||| || || || | || ||||| ||| | || || |||| | |||||
Sbjct 1964 TGAT-GTCGAGCAGATC-GGTACAATCATTGCTT---A---CT-AACATGGAACTGGCAG 2014
Query 1448 AACCTTTTGGTCATAATAAGCA-AAGTCTTGTTAGCACAGTTGATAGTG-TGATTAGCCA 1505
|||| | ||||| || ||||| || | |||||| | || || |||||| | || | ||
Sbjct 2015 AACCCTCAGGTCAGAAGAAGCATAA-TATTGTTAACCCAATTAATAGTGCT-ATGAATCA 2072
Query 1506 GCCGCC-TTCAGCAGAGG-GGCGTATCCTACAGAATCCATCAAATATCTGTGGAGCATTT 1563
||| || | ||||||| || || || ||| ||| ||||| |||| |||||||| |||
Sbjct 2073 GCCACCAAT-GGCAGAGGTGG-ATACCCAACAAAATTCATCAGATATTTGTGGAGCGTTT 2130
Query 1564 TCTTCCATTGGGTTTTCATCAACATGTCTCAGTTCATCCAGCGACCAGTTTCCGACGTCC 1623
||||| ||||| || ||||| || | | ||| || || || || ||||||| ||| |||
Sbjct 2131 TCTTCAATTGGATTCTCATCTACGTACCCCAGCTCCTCTAGTGATCAGTTTCAGACATCC 2190
Query 1624 CTGGAAATTCCCAAGAAGAACAAAAAGAGAGCTAAACCTGGTGAAAGTTCTCGGCCTCGT 1683
||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2191 CTGGACATACCCAAGAAGAACAAAAAGAGGGCCAAACCTGGTGAAAGTTCTCGACCTCGC 2250
Query 1684 CCAAGGGACAGGCAACTTATTCAGGATCGTATCAAAGAACTAAGGGAGCTTGTGCCTAAT 1743
||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||
Sbjct 2251 CCAAGAGACAGGCAACTTATTCAAGATCGAATCAAGGAACTTAGAGAACTTGTGCCTAAT 2310
Query 1744 GGATCTAAGTGCAGTATTGATTCTTTGCTAGAGTGCACGATCAAGCACATGCTCTTTCTG 1803
||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 2311 GGATCTAAGTGCAGTATCGATTCTTTGCTAGAACGAACGATCAAACACATGCTCTTTTTG 2370
Query 1804 CAGAATGTCT-CTAAGCATGCCGACAAGCTCACTAAAAGTGC-AAGTTCAAAGATGCAGC 1861
|||||||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||| |
Sbjct 2371 CAGAATGT-TACTAAGCATGCTGAAAAGCTCAGTAAAAGTGCTAA-TGAAAAGATGCAAC 2428
Query 1862 ACAAGGATAATGGCACCCTAGGATCATCTAGCACTAGCACTGAACAAGGTTCGAGCTGGG 1921
| ||||| || | | || | || ||| || | ||| ||||| |
Sbjct 2429 AAAAGGA-AA---C----T-GG-T-AT---GCA--AG----G-------TTCAAGCTGCG 2461
Query 1922 CAGTGGAGATTGGAGGCCATCTTCAAGTGTGTTCAATCATGGTGGAGAATCTGGACAAAG 1981
|||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||| |
Sbjct 2462 CAGTGGAGGTTGGAGGTCATCTTCAAGTAAGCTCGATCATCGTGGAGAATCTGAACAA-G 2520
Query 1982 AAGGAG-TGATGCTTATCGAGATGTTATGCGAAGAATGTAGCCACTTTCTCGAGATAGCA 2040
||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||
Sbjct 2521 CAGGGGATGGTGCTTATCGAGATGTTATGTGAAGAATGTGGCCATTTTCTTGAGATAGCA 2580
Query 2041 AACGTGATAAGGAGCTTGGAACTTATCATCCTCAGAGGCATCACTGAGAAACAAGGCGAG 2100
||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||| |||| |||| || ||||||
Sbjct 2581 AACGTCATAAGGAGCTTAGACCTCGTCATCCTAAGAGGTTTCACCGAGACTCAGGGCGAG 2640
Query 2101 AAAACATGGATATGCTTTGTA 2121
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 AAAACATGGATATGCTTTGTA 2661
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 198811595109
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5