BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg311741 Length=2967 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G06710.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 4868 0.0 > AT1G06710.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | chr1:2056575-2060242 REVERSE LENGTH=3418 Length=3418 Score = 4868 bits (2636), Expect = 0.0 Identities = 2852/2957 (96%), Gaps = 11/2957 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAACAAAACAGTCGTAAGATGTCTTCTTTCTCGTTCACACCATCCTTTGATTCCTTTC 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1 ATGAACAAAACAGTCGTAAGATGTCTTCTTTCTCGTTCACACCATCCTTTGATTCATTTC 60 Query 61 TCCACCAATTTATCTCTTCTCCACAGAGTTTTCACCTGTAGCCGTTATCTCAC-GACTAG 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 61 TCCACCAATTTATCTCTTCTCCACAGAGTTTTCACCTGTAGCCGTTATCTCACTG-CTAG 119 Query 120 GTTTATGTCCACTCCTCCGCCCGATGAAATGTTTGGTTTCGACGATCCCTTCTCCCCCAT 179 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 120 GTTTATGTCCACTCCTCCGCCGGATGACATGTTTGGTTTCGACGATCCTTTCTCCCCCAG 179 Query 180 TGAGTCGCGGGAAGTTGTGGATTTGACTAAAGAGTACTCCTTTTTGCACGATTCTCTTTT 239 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 180 TGATTCGCGGGAAGTTGTGGATTTGACTAAAGAGTACTCCTTTTTGCACGATTCTCTTGT 239 Query 240 GGACTCTGGAAATGTTGATCTTCACCAATTAGTGCCCGTTATTACTCAATCCTCTATTGA 299 |||| |||||| ||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 240 CGACTATGGAAACGTTAATGTTCATCAAGTAGTGCCCATTATTACTCAATCCTCTATTGA 299 Query 300 TGCTAGAGCCATTGCAGATGCTGTTTCTGGTGGCGATGATGTGTTTGGGAGCAAATCCCA 359 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 300 CGCTAGAGCCATTGCAGATGCTGTTTCTGGTGTCGACGATGTGTTTGGGAGAAAATCCCA 359 Query 360 GAAGTTTCTTAGGCAATTTAGAGAGAAGTTGAGTGAGAGTTTAGTGATTGAGGTGTTGCG 419 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 GAAGTTTCTTAGGCAATTTAGAGAGAAATTGAGTGAGAGTTTAGTGATTGAGGTGTTGCG 419 Query 420 TTTGATAGAAAGACCTTCTGCTGTTATCAGTTTCTTCGTTTGGGCAGGTAGGCAGATAGG 479 |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 TTTGATAGCAAGACCATCTGCTGTTATCAGTTTCTTCGTTTGGGCAGGTAGGCAGATAGG 479 Query 480 TTATAAGCATACAT-CACCTGTGTATAACGCTTTGGTAGACCTTATTGTACGCGATGATG 538 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 480 TTATAAGCATAC-TGCACCTGTGTATAACGCTTTGGTTGACCTTATTGTACGTGATGATG 538 Query 539 ACGAAAAAGTTCCCGAAGAACTCCTGCAGCAGATTAGAGATGATGATAAGGAAGTGTTTG 598 |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 ACGAAAAAGTTCCCGAAGAATTCCTGCAACAGATTAGAGATGATGATAAGGAAGTGTTTG 598 Query 599 GGGAATTTCTCAATGTGTTGGTAAGGAAATATTGCAGGAGTGGGTCATTTAGCATTGCAC 658 | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | Sbjct 599 GCGAATTTCTCAATGTGTTGGTAAGGAAACATTGCAGGAATGGGTCATTTAGTATTGCGC 658 Query 659 TTGAGGAGTTAGGGAGGCTCAAGGATTTTAGGTTTAGACCTTCAAGATCTACTTATAATT 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 659 TTGAGGAGTTAGGGAGGCTCAAGGATTTTAGGTTCAGACCTTCAAGATCGACTTATAATT 718 Query 719 GTTTGATTCAGGCATTTCTCAAGGCTGATTGTTTGGACTCTGCTTCGTTGGTCCATCGAG 778 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||| | | Sbjct 719 GTTTGATTCAGGCATTTCTCAAGGCTGATCGTTTGGACTCTGCATCTTTGATTCATAGGG 778 Query 779 AAATGTCCCTTGCAAATCTTAGGATGGATGGTTTTACGCTTAGATGCTATGCTTACTCTC 838 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| Sbjct 779 AAATGTCTCTTGCAAATCTTAGGATGGATGGGTTTACACTTAGATGCTTTGCTTATTCTC 838 Query 839 TCTGTAGAGTAGGAAAGTGGAGGGAAGCTCTAACATTGATGGAAACGGAAAATTTTGTGC 898 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 839 TCTGTAAAGTAGGAAAGTGGAGGGAAGCTCTAACATTGGTGGAAACGGAAAATTTTGTGC 898 Query 899 CTGATACTGTCTTTTATACAAAACTGATATCTGGTCTGTGTGAAGCATCGCTTTTTGAAG 958 |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 899 CTGATACTGTGTTTTATACAAAATTGATATCTGGTCTGTGTGAAGCTTCGCTTTTTGAAG 958 Query 959 AGGCTATGGATTTCCTGAATAGGATGCGAGCTACTTCCTGCCTTCCAAATGTTGTAACAT 1018 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 959 AGGCTATGGATTTCCTGAATAGGATGCGTGCTACTTCCTGCCTTCCAAATGTTGTTACAT 1018 Query 1019 ATTCAACTTTGCTGTGTGGATGCTTGAACAAAAAACAGCTGGGTAGGTGTAAAAGGGTGC 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 ATTCAACTTTGCTGTGTGGATGCTTGAACAAAAAACAGCTGGGTAGGTGTAAAAGGGTGC 1078 Query 1079 TTAATATGATGATGATGGAAGGTTGTTATCCAAGTCCCAAGATTTTTAATTCTCTTGTAC 1138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 TTAATATGATGATGATGGAAGGTTGTTATCCAAGTCCCAAGATTTTTAATTCTCTTGTAC 1138 Query 1139 ATGCTTATTGCACATCAGGAGATCATTCATATGCATACAAATTGCT-AAAGAAAATGGTT 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 1139 ATGCTTATTGCACATCAGGAGATCATTCATATGCATACAAATTGCTCAAA-AAAATGGTT 1197 Query 1198 AAATGTGGTCACACGCCAGGATATGTTGTCTACAATATATTGATTGGGAGTATTTGTGGT 1257 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 AAATGTGGTCACATGCCAGGATATGTTGTCTACAATATATTGATTGGGAGTATTTGTGGT 1257 Query 1258 GACAAAGACTCCCTTAGTTGTGATCTGTTGGAATTAGCTGAGAAAGCTTATAGTGAAATG 1317 |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 GACAAAGACTCCCTTAATTGTGATCTGTTGGACTTAGCTGAGAAAGCTTATAGTGAAATG 1317 Query 1318 CTTGCTACAGGGGTTGTTCTGAATAAGATTAATGTCAGCAGCTTCACACGGTGTCTTTGT 1377 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 CTTGCTGCAGGGGTTGTTCTGAATAAGATTAATGTCAGTAGCTTCACACGGTGTCTTTGT 1377 Query 1378 AGTGCTGGGAAATATGAAAAGGCATTTAGTGTTATCCGTGAAATGATTGGTCAGGGTTTT 1437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1378 AGTGCTGGGAAATATGAAAAGGCATTTAGTGTTATCCGTGAAATGATTGGTCAGGGATTT 1437 Query 1438 ATACCAGATACCAGTACCTATTCCAAAGTCCTTGGTTATTTATGTAATGCTTCGAAAATG 1497 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1438 ATACCAGATACCAGTACCTATTCCAAAGTCCTTAATTATTTATGTAATGCTTCGAAAATG 1497 Query 1498 GAGTTGGCGTTTCTGTTATTTGAAGAAATGAAAAGGGGTGGCCTTGTTGCTGATGTCTAC 1557 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 GAGTTGGCGTTTTTGTTATTTGAAGAAATGAAAAGGGGTGGCCTTGTTGCTGATGTCTAC 1557 Query 1558 ACGTATACTATTATGGTAGATAGTTTCTGTAAAGCTGGTCTAATTGAACAGGCTCGTAAG 1617 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 ACGTATACTATTATGGTAGATAGTTTCTGTAAAGCTGGTCTAATTGAACAGGCTCGTAAG 1617 Query 1618 TGGTTCAATGAAATGATAGAGGTTGGTTGTACACCTAACGTCGTCACATATACCGCTCTT 1677 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1618 TGGTTCAATGAAATGAGAGAGGTTGGTTGTACACCTAACGTCGTCACATATACCGCTCTT 1677 Query 1678 ATCCATGCTTATCTTAAGACTAAGAAGGTCAGTTATGCAAATGAGCTGTTTGAAACGATG 1737 |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1678 ATCCATGCTTATCTTAAGGCTAAGAAGGTCAGCTATGCAAATGAGCTGTTTGAAACGATG 1737 Query 1738 CTGTCTGAAGGTTGTCTCCCTAATATTGTTACATATTCTGCCTTAATTGATGGCCATTGC 1797 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1738 CTGTCTGAAGGGTGTCTCCCTAATATTGTTACATATTCTGCCTTAATTGATGGCCATTGC 1797 Query 1798 AAAGCTGGACAAATGGAGAAAGCTTGCCAGATTTTTGAAAGAATGTGTGGCAGTAAAGAT 1857 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1798 AAAGCTGGACAAGTGGAGAAAGCCTGCCAGATTTTTGAAAGAATGTGTGGCAGCAAAGAT 1857 Query 1858 GTCCCAGATGTAGATATGTACTTCAAGCAGTATGTTGATGACAACAGCGAGAGGCCAAAT 1917 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1858 GTCCCAGATGTAGATATGTACTTCAAGCAGTA---TGATGACAACAGCGAGAGGCCAAAT 1914 Query 1918 GTAGTTATATATGGAGCTTTACTGGATGGTTTCTGCAAGTTGCATAGGGTCGAAGAAGCT 1977 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1915 GTAGTTACATATGGAGCTTTACTGGATGGTTTCTGCAAGTCGCATAGGGTCGAAGAAGCT 1974 Query 1978 CGTAAGTTGTTGGATGCTATGTCTATGGAAGGTTGTGAACCAAATCAGATTGTATATGAT 2037 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1975 CGTAAGTTGTTGGATGCTATGTCTATGGAAGGTTGTGAACCGAATCAGATTGTATATGAT 2034 Query 2038 GCTCTCATCGATGGACTCTGTAAGGTTGGGAAACTAGACGAAGCACAAGAAGTGAAAGCT 2097 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2035 GCTCTCATTGATGGACTCTGTAAGGTTGGGAAACTAGACGAAGCACAAGAAGTGAAAACT 2094 Query 2098 GAGATGTCTGAGCATGGATTCCCCGCAACCTTATATACTTACAGTTCTCTAATTGATCGT 2157 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2095 GAGATGTCTGAGCATGGATTCCCTGCAACCTTATATACTTACAGTTCTCTAATTGATCGT 2154 Query 2158 TATTTCAAAGTCAAGCGCCAAGATTTAGCCTCAAAAGTATTGTCTAAGATGCTTGAGAAT 2217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2155 TATTTCAAAGTCAAGCGCCAAGATTTAGCCTCAAAAGTATTATCTAAGATGCTTGAGAAT 2214 Query 2218 TCCTGTGCGCCCAATGTGGTTATATACACTGAGATGATTGATGGCTTATGCAAGGTTGGT 2277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 TCCTGTGCGCCCAATGTGGTTATATACACTGAGATGATTGATGGCTTATGCAAGGTTGGT 2274 Query 2278 AAAACTGATGAAGCTTATAAGCTTATGCAAATGATGGAAGAAAAAGGGTGTCAGCCCAAT 2337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2275 AAAACTGATGAAGCTTATAAGCTTATGCAAATGATGGAAGAAAAAGGGTGTCAGCCCAAT 2334 Query 2338 GTTGTGACATATACAGCGATGATTGATGGATTTGGAAGGATTGGTAAAATAGAAACATGC 2397 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2335 GTTGTGACATATACAGCGATGATTGATGGATTTGGAATGATTGGTAAAATAGAAACATGC 2394 Query 2398 CTTGAGCTCTTAGAGCGAATGGGTTCCAAAGGTGTTGCTCCAAATTATGTTACTTATAGG 2457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2395 CTTGAGCTCTTAGAGCGAATGGGTTCCAAAGGTGTTGCTCCAAATTATGTTACTTACAGG 2454 Query 2458 GTCTTGATAGATCATTGTTGCAAAAATGGTGCACTGGATGTGGCCCACAATCTTCTAGAA 2517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2455 GTCTTGATAGATCATTGTTGCAAAAATGGTGCACTGGATGTGGCCCACAATCTTCTCGAA 2514 Query 2518 GAAATGAAACAGACACATTGGCCTACACACGCAGCCGGATATCGCAAAGTCATTGAAGGA 2577 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2515 GAAATGAAACAGACACATTGGCCTACACACACAGCAGGATATCGCAAAGTCATTGAAGGA 2574 Query 2578 TTCAATAAAGAGTTCATAGAGTCTCTAGGTCTTCTTGATGAGATAGGCCAGGATGATACT 2637 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2575 TTCAATAAAGAGTTCATAGAGTCTCTAGGGCTTCTCGATGAGATAGGCCAGGATGATACT 2634 Query 2638 GCCCCTTTTCTTTCTTTATATAGGCTTTTGGTTGATAATCTTATTAAAGCTCAAAGGCTG 2697 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2635 GCCCCTTTTCTTTCTGTATATAGGCTTTTGATTGATAATCTTATTAAAGCTCAAAGACTG 2694 Query 2698 GAAATGGCTCTTAGGCTTCTTGAAGAGGTTGCAACATTTTCAGCCACGTTGGTTGACTAC 2757 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2695 GAAATGGCTCTTAGGCTTCTTGAAGAGGTTGCAACATTTTCAGCCACGTTGGTTGACTAC 2754 Query 2758 AGTAGCACATATAATTCATTAATTGAAAGCCTTTGCCTTGCTAATAAAGTGGACAA-GGC 2816 |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2755 AGTAGCACATATAACTCACTGATTGAAAGCCTTTGCCTTGCTAATAAAGTGGA-AACGGC 2813 Query 2817 TTTTCGGTTGTTCTCAGAAATGTCAAAGAAAGGTGTCATTCCGGAGATGCAAACATTTTG 2876 ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || Sbjct 2814 TTTTCAGTTGTTCTCAGAAATGACAAAGAAAGGTGTCATTCCGGAGATGCAATCATTCTG 2873 Query 2877 TAGTCTCATCAAGGGACTTTTCCGAAACAGCAAGATCAGTGAAGCACTCTTGCTTCTAGA 2936 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2874 TAGTCTAATCAAGGGACTTTTCCGAAACAGCAAGATCAGTGAAGCACTATTGCTTCTAGA 2933 Query 2937 TTTCATATCTCATATGG 2953 ||||||||||||||||| Sbjct 2934 TTTCATATCTCATATGG 2950 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 147490812420 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5