BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg311847
Length=2856
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2281 0.0
AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2270 0.0
AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2248 0.0
AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2012 0.0
AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domai... 425 9e-118
AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832 RE... 228 3e-58
> AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2454846-2457321 FORWARD LENGTH=1783
Length=1783
Score = 2281 bits (1235), Expect = 0.0
Identities = 1316/1356 (97%), Gaps = 2/1356 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1502 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 1561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 168
Query 1562 GTAAA-TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 1620
| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 169 G-AAAGTCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTC 227
Query 1621 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGG 1680
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 228 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 287
Query 1681 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 1740
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 347
Query 1741 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 407
Query 1801 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 1860
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 467
Query 1861 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 468 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTA 527
Query 1921 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 1980
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 587
Query 1981 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 647
Query 2041 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 648 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 707
Query 2101 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 767
Query 2161 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 827
Query 2221 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 887
Query 2281 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 2340
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 888 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 947
Query 2341 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 948 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1007
Query 2401 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 2460
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1008 AATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAG 1067
Query 2461 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 2520
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1127
Query 2521 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 2580
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1187
Query 2581 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1247
Query 2641 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 2700
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 CCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1307
Query 2701 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGG 2760
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1308 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGG 1367
Query 2761 CAGACTGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 2820
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1368 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1427
Query 2821 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1463
Score = 2257 bits (1222), Expect = 0.0
Identities = 1303/1343 (97%), Gaps = 2/1343 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 114 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGG-AAA 172
Query 61 -TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 GTCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 232
Query 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 233 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 292
Query 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 352
Query 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 412
Query 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 472
Query 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 473 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 532
Query 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 533 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 592
Query 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 652
Query 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 653 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 712
Query 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 772
Query 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 832
Query 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 892
Query 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 952
Query 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 953 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1012
Query 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1013 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1072
Query 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1132
Query 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTT 1079
||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1133 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1192
Query 1080 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1252
Query 1140 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1312
Query 1200 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGAC 1259
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGAC 1372
Query 1260 TGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTAC 1319
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 TGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTAC 1432
Query 1320 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1455
Score = 182 bits (98), Expect = 2e-44
Identities = 115/123 (93%), Gaps = 2/123 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1339 GGTGAATCAAAGGACAATGTTAGtttttttACAATAGTTTGGTATCTGGTCGCTTGTCTG 1398
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1491 GGTGAATCAAAGGACAGTGTTAGTTTTATTACAATAGTTTGGTATTTGGTCGCGTGTCTG 1550
Query 1399 TGTTCCTGTTTCGTTATT-TCCCCATCAGAGCGTTGTTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCG 1457
||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TGTTCTTGTTTCGTT-TTCTCCCCGTCAGAGCGTTGTTCTCGTAATTGGGTTCTTGATCG 1609
Query 1458 GAG 1460
|||
Sbjct 1610 GAG 1612
> AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2462953-2465504 REVERSE LENGTH=1864
Length=1864
Score = 2270 bits (1229), Expect = 0.0
Identities = 1314/1356 (97%), Gaps = 2/1356 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1502 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 1561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 172
Query 1562 GTAAA-TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 1620
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 173 G-AAAGTCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTC 231
Query 1621 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGG 1680
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 232 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 291
Query 1681 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 1740
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 351
Query 1741 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 411
Query 1801 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 1860
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 471
Query 1861 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 472 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTA 531
Query 1921 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 1980
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 591
Query 1981 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 651
Query 2041 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 652 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 711
Query 2101 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 771
Query 2161 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 831
Query 2221 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 891
Query 2281 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 2340
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 892 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 951
Query 2341 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 952 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1011
Query 2401 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 2460
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1012 AATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAG 1071
Query 2461 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 2520
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1131
Query 2521 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 2580
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1191
Query 2581 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1251
Query 2641 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 2700
|| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 CCTAAATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1311
Query 2701 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGG 2760
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1312 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGG 1371
Query 2761 CAGACTGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 2820
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 1431
Query 2821 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1432 GTTACCAAGGCTGCAGTCAAGAAGGGTGCCAAGTGA 1467
Score = 2252 bits (1219), Expect = 0.0
Identities = 1302/1343 (97%), Gaps = 2/1343 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 118 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGG-AAA 176
Query 61 -TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 GTCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 236
Query 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 237 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 296
Query 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 356
Query 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 416
Query 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 476
Query 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 477 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 536
Query 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 537 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 596
Query 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 656
Query 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 657 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 716
Query 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 776
Query 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 836
Query 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 896
Query 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 956
Query 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 957 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1016
Query 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1017 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1076
Query 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1136
Query 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTT 1079
||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1137 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1196
Query 1080 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1197 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCTAA 1256
Query 1140 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1316
Query 1200 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGAC 1259
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGAC 1376
Query 1260 TGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTAC 1319
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1377 TGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTTAC 1436
Query 1320 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1437 CAAGGCTGCAGTCAAGAAGGGTG 1459
> AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2458244-2460790 FORWARD LENGTH=1807
Length=1807
Score = 2248 bits (1217), Expect = 0.0
Identities = 1310/1356 (97%), Gaps = 2/1356 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1502 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 1561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 180
Query 1562 GTAAA-TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 1620
| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 181 G-AAAGTCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTG 239
Query 1621 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGG 1680
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 240 ATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 299
Query 1681 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 1740
|| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GTGTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 359
Query 1741 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 360 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 419
Query 1801 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 1860
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 479
Query 1861 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 480 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTC 539
Query 1921 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 1980
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 599
Query 1981 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 659
Query 2041 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 660 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 719
Query 2101 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 779
Query 2161 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 839
Query 2221 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 899
Query 2281 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 2340
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 900 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 959
Query 2341 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 960 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1019
Query 2401 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 2460
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1020 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAG 1079
Query 2461 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 2520
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1139
Query 2521 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 2580
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1199
Query 2581 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1259
Query 2641 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 2700
||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CCCAAATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1319
Query 2701 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGG 2760
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1320 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGG 1379
Query 2761 CAGACTGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 2820
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1380 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1439
Query 2821 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
|||||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct 1440 GTTACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGCAAAGTGA 1475
Score = 2241 bits (1213), Expect = 0.0
Identities = 1301/1344 (97%), Gaps = 4/1344 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 126 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGG-AAA 184
Query 61 -TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||
Sbjct 185 GTCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTGATCGA 244
Query 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 245 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 304
Query 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 364
Query 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 365 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 424
Query 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 484
Query 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 485 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTCCTTGC 544
Query 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 545 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 604
Query 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 664
Query 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 665 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 724
Query 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 784
Query 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 844
Query 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 904
Query 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 905 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 964
Query 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 965 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1024
Query 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1025 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAGGATGA 1084
Query 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1144
Query 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTC-TCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGT 1078
||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1145 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAG-TCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1203
Query 1079 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1263
Query 1139 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1323
Query 1199 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGA 1258
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 1324 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1383
Query 1259 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1318
|||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1443
Query 1319 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
|||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1444 CCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTG 1467
> AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr5:24288658-24291020 FORWARD LENGTH=1764
Length=1764
Score = 2012 bits (1089), Expect = 0.0
Identities = 1264/1351 (94%), Gaps = 2/1351 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1507 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 1566
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129
Query 1567 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 1625
|||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
Query 1626 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 1685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
Query 1686 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 1745
||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308
Query 1746 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 1805
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368
Query 1806 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 1865
||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
Query 1866 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 1925
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
Query 1926 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 1985
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548
Query 1986 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 2045
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
Query 2046 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 2105
||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668
Query 2106 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 2165
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728
Query 2166 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 2225
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788
Query 2226 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 2285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848
Query 2286 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 2345
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
Query 2346 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 2405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
Query 2406 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 2465
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
Query 2466 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 2525
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
Query 2526 GATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 2585
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
Query 2586 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 2645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
Query 2646 GTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 2705
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
Query 2706 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGAC 2765
||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGAC 1328
Query 2766 TGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTTAC 2825
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1329 CGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCAC 1388
Query 2826 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
||||||||| || ||||||||||| || |||
Sbjct 1389 CAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGA 1419
Score = 1986 bits (1075), Expect = 0.0
Identities = 1255/1344 (93%), Gaps = 4/1344 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129
Query 61 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
|||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
Query 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
Query 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308
Query 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368
Query 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
Query 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
Query 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548
Query 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
Query 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668
Query 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728
Query 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788
Query 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848
Query 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
Query 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
Query 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
Query 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
Query 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTT 1079
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
Query 1080 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
Query 1140 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1199
|| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
Query 1200 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGG-ACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGA 1258
||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCT-TTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
Query 1259 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1318
| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
Query 1319 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
|||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1388 CCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTG 1411
> AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domain-containing
protein | chr1:13112506-13113136 FORWARD LENGTH=631
Length=631
Score = 425 bits (230), Expect = 9e-118
Identities = 342/397 (86%), Gaps = 3/397 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2424 GGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCAGC 2483
||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||
Sbjct 133 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 191
Query 2484 CAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGC 2543
| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |
Sbjct 192 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 251
Query 2544 CCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 2603
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 311
Query 2604 GATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGA 2663
||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||
Sbjct 312 GATTGACTGGCGTACTGGTCATGAGATTGAGAAGGAGCCAAAGTTTTTAAAGAACAGTGA 371
Query 2664 TGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTGGAGACCTT-CTCTGAGT 2722
|||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||
Sbjct 372 GGCCGCTATTATTAATATGACTCCCACCAAGCCTATGGTGGTTGAGGC-TTACTCTGCGT 430
Query 2723 ACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCTGTTGGTGTTA 2782
||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||| ||||
Sbjct 431 ACCCACCCCTGGGACGTTTTGCTATTAGGGACATGAGGCAAACCGTTGGTGTTGGAGTTA 490
Query 2783 TCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAA 2819
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 491 TCAAGAGTGTTGTCAAGAAGGACCCAAGTGGAGCCAA 527
Score = 381 bits (206), Expect = 2e-104
Identities = 335/398 (84%), Gaps = 5/398 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 918 GGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCAGC 977
||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||
Sbjct 133 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 191
Query 978 CAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGTTACGC 1037
| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |
Sbjct 192 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 251
Query 1038 CCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1097
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 311
Query 1098 GATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAAA-TTCTTGAAGAATGGTG 1156
||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||
Sbjct 312 GATTGACTGGCGTACTGGTCATGAGATTGAGAAGGAGCC-AAAGTTTTTAAAGAACAGTG 370
Query 1157 ATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTGGAGACCTT-CTCTGAG 1215
| || | ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||||| |
Sbjct 371 AGGCCGCTATTATTAATATGACTCCCACCAAGCCTATGGTGGTTGAGGC-TTACTCTGCG 429
Query 1216 TACCCACCCCTTGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGTC 1275
||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||| || || ||
Sbjct 430 TACCCACCCCTGGGACGTTTTGCTATTAGGGACATGAGGCAAACCGTTGGTGTTGGAGTT 489
Query 1276 ATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAA 1313
|||||||| || | |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 490 ATCAAGAGTGTTGTCAAGAAGGACCCAAGTGGAGCCAA 527
> AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832
REVERSE LENGTH=814
Length=814
Score = 228 bits (123), Expect = 3e-58
Identities = 170/193 (88%), Gaps = 1/193 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 2424 GGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCAGC 2483
||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||
Sbjct 195 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 137
Query 2484 CAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGC 2543
| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |
Sbjct 136 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 77
Query 2544 CCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 2603
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 17
Query 2604 GATTGACAGGCGT 2616
||||||| |||||
Sbjct 16 GATTGACTGGCGT 4
Score = 228 bits (123), Expect = 3e-58
Identities = 170/193 (88%), Gaps = 1/193 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 918 GGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCAGC 977
||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||
Sbjct 195 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 137
Query 978 CAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATCGGTAACGGTTACGC 1037
| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |
Sbjct 136 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 77
Query 1038 CCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1097
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 17
Query 1098 GATTGACAGGCGT 1110
||||||| |||||
Sbjct 16 GATTGACTGGCGT 4
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 141922281747
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5