BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg312521
Length=4869
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G15290.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 5463 0.0
> AT1G15290.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr1:5257046-5264942 REVERSE LENGTH=5145
Length=5145
Score = 5463 bits (2958), Expect = 0.0
Identities = 3353/3545 (95%), Gaps = 21/3545 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1332 TGTCCAGGATACTCCGGCTTTAGGCACAGTTATCGTAAGACACTGTGGATATACTGCGGT 1391
||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1330 TGTTCATGATACTCCGGCTTTAGGCAAAGTTATTGTAAGACAGTGTGGATATACTGCGGT 1389
Query 1392 GGTAAATGTCAAGGGTAAAACTCAGAAGGCAATATCTGATTTCCGTGATATTTTGATCGA 1451
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1390 GGTAAATGTCAAGGGTCAAACTCAGAAGGCAATGTCTGATTTCCGTGATATTTTAATCGA 1449
Query 1452 TGACCTGCCGGATGGAGGAGCTAATGCTCTTAACCTTAACAGCTTAAGGGTTCAGCTTCG 1511
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||
Sbjct 1450 TGACCTGCCGGATGGAGGAGCTAATGCTCTTAACCTTAACAGCTTACGGGTAGAGTTTCA 1509
Query 1512 CAGGTCCCATAGTGTTAGAATATCTGGAGAGAACCAGCCCACACTGCTTGATTCGGATGA 1571
|||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1510 CAGGCCCCATAGTGTTGGAACATCTGTAGAGAACCAGCCCACACAGCTTGATTGGGATGA 1569
Query 1572 TTTAGAGTCTTATAGATGTATTGTACAGGATTTAGTAAAAGTTAACTTAACAAAGTTAGA 1631
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1570 TTTAGAATCTTATAGATGTATTATACAGGAGTTAGTAAAAATTAACTTAACAAAGTTAGA 1629
Query 1632 AGAAAAAAGGGTATCTTCTGTAAGACCCATCAGATGGGAGCTCGGTTCTTGCTGGGTTCA 1691
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 1630 AGAAACAAGGGTATCTTCTGTAAGACCCATCAGATGGGAACTCGGTTCTACCTGGGTTCA 1689
Query 1692 GCATCTACAAAAGAAAGAAACAGACGTCTGTGGAAAGCCTGCAACTAATGATGAGACTGA 1751
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1690 GCATCTACAGAAGAAAGAAACAGACGTCTGTGGAAAGCCTGCAACTAATGATGAAACTGA 1749
Query 1752 ACTTTCAATTAAAGGCTTGGGAAAACAATTTAAAGTTCTAAAGAGCAAAAGTAAGAAATC 1811
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 ACTTTCAGTTAAAGGCTTGGGAAAACAATTTAAAGATCTAAAGAGCAAAAGTAAGAAATC 1809
Query 1812 AGAATCTATAAGTACCGTGAAGGAAAAGGAAAAAGATATCAGACTACGCGAGTTAAATGG 1871
|||| ||||||| |||| | || |||||||||| |||||| | |||||||||||
Sbjct 1810 AGAAAATATAAGTGCCGT----G--AATGAAAAAGATACCAGACTGCACGAGTTAAATGA 1863
Query 1872 GGAGGCTGATCTAGGGCAGAAAAGCATTGATGGACACTTTACTGAACTGAAGGAGCTGCT 1931
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1864 GGAGGATGATCTAGGGCAGAAAAGCATTGATGGACTCTTTACTGAACTGAAGGAACTGCT 1923
Query 1932 TTCTGAAGAAGCTTTCTCTCGTCTACAAGAAACTGGAACTGGTCTCCATTTAAAGTCAAA 1991
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 TTCTGAAGAAGCTTTCTCTCGCCTAAAAGAAACTGGAACTGGTCTCCATTTAAAGTCAAA 1983
Query 1992 AGAAGAGCTTACCAAGATGGCATATGGTTACTATGATGAAATTGCTTTGCCAAGGCTGGT 2051
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 AGAAGAGCTTACCAATATGGCATATGGTTACTATGATGAAATTGCTTTGCCAAGGCTGGT 2043
Query 2052 AGCAGATTTCGGGTCACTGGAGCTTTCTCCAGTTGATGGTCGCACAATGACTGACTTCAT 2111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 2044 AGCAGATTTCGGGTCACTGGAGCTTTCTCCAGTTGATGGTCGCACTTTGACTGATTTCAT 2103
Query 2112 GCATATAAGAGGACTCCAAATGCGTTCTCTAGGACATGTGGCTAAAATTGCTGAGAAACT 2171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2104 GCATATAAGAGGACTCCAAATGCGTTCTCTAGGACATGTGGCTAAACTTGCTGAGAAACT 2163
Query 2172 TCCTCATATACAGTCCCTCTGTATTCATGAGATGATTACAAGAGCTTTCAAGCATCTTTT 2231
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2164 TCCTCATATACAGTCCCTCTGTATTCATGAGATGATTACAAGAGCTTTCAAGCATCTTCT 2223
Query 2232 TAGGGCGGTTATTGCATCTGTCAATAATATGGCTGAGATACCTGTGGCAGTAGCTGCTTC 2291
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 2224 TAGGGCGGTTATTGCATCTGTTAATAATATGGCAGAGCTACCTGTGGCGGTAGCTGCTTC 2283
Query 2292 ATTAAATTTCATGTTTGGCCACCGTGAATTGGAAGGGT-CTGATAGGATCCCCAGTGAAG 2350
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||
Sbjct 2284 ATTAAATTTTATGCTTGGCCGCCGTGAATTGGAAGGGTGC-GATAGAATCCCCGGTGAAG 2342
Query 2351 AGTATTGTCTCAGATTACGGTGGCTACAGAAATTTCTCTCCAGAAAATTTGGTTGGATAC 2410
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343 AGTACTGTCTCAGATTACAGTGGCTACAGAAATTTCTCTCCAGAAAATTTGGTTGGATAC 2402
Query 2411 AGAAAGATGAGTTCAATCATTTGAAAAAGTTTTCTATCCTCCGAGGACTCTGCCAGAAGG 2470
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2403 AGAAAGATGAGTTCCATCATTTAAAAAAGTTTTCTATCCTCCGAGGACTCTGCCAGAAGG 2462
Query 2471 TTGGGTTAGAACTAGTTGCAAGAGATTATGACTTCGATTCTCCAAATCCCTTCACGAGCT 2530
|||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 2463 TTGGTTTAGAACTAGTTTCAAGAGATTTTGACTTCGATTCTCCAAATCCTTTCATGAGCT 2522
Query 2531 CTGACATTTTTGGCTTGGTACCTGTGTGCAAGCATGTGCTGTGTATTTCATCTGACGGAA 2590
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2523 CTGACATTATTGGATTGGTACCTGTGTGCAAGCATGTGCTGTGTATTTCATCTGACGGAA 2582
Query 2591 GGACACTCTTGGAGTCATCAAAACTTGCCCTTGACAAAGGAAAACTTGATGATGCTGTGA 2650
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2583 GGACACTCTTGGAGTCATCAAAACTTGCTCTTGACAAAGGAAAACTAGATGATGCTGTGA 2642
Query 2651 ACTATGGAACAAAGGCATTAGTCAAGATGATTGCTGTCTGTGGGCCTTATCACAGAAATA 2710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2643 GCTATGGAACAAAGGCATTAGTCAAGATGATTGCTGTCTGTGGGCCTTATCATAGAAATA 2702
Query 2711 CTGCTTGTGCGTACAGCCTTCTCGCAGTTGTACTATACCACACTGGCGATTTTAACCAGG 2770
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2703 CTGCATGTGCGTACAGTCTTCTCGCAGTTGTACTATACCACACTGGCGATTTTAACCAGG 2762
Query 2771 CAACAATATATCAGCAGAAGGCTCTAGATATAAATGAGAGAGAACTTGGTCTCGACCATC 2830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2763 CAACAATATATCAGCAGAAGGCTCTAGATATAAATGAGAGAGAACTTGGTCTCGACCATC 2822
Query 2831 CCGACACTATGAAAAGCTATGGGGATCTTTCTGTATTTTACTATCGTCTTCAACACTTTG 2890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2823 CCGACACTATGAAAAGCTATGGGGATCTTTCTGTATTTTACTATCGTCTTCAACATTTTG 2882
Query 2891 AATTGGCACTAAAATATGTGAACCGTGCGTTATTTCTCCTTCACTTCACTTGTGGGCTAT 2950
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883 AATTGGCACTAAAATATGTGAACCGGGCGTTGTTTCTTCTTCACTTCACTTGTGGGCTAT 2942
Query 2951 CTCACCCAAATACTGCTGCCACATATATCAATGTGGCTATGATGGAAAAAGAAGTAGGGA 3010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2943 CTCACCCAAATACTGCTGCCACATATATCAATGTGGCTATGATGGAAAAAGAAGTAGGGA 3002
Query 3011 ATGATCATCTAGCTCTAAGATACCTGCATGAAGCGCTAAAGTGCAATAAAAGATTGCTAG 3070
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3003 ATGATCATCTAGCTCTAAGGTACCTGCATGAAGCTCTAAAGAGCAATAAAAGATTGCTAG 3062
Query 3071 GAGCTGACCATATTCAGACTGCGGCAAGCTATCATGCAATAGCGGTGGCTCTCTCTTCCA 3130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 3063 GAGCTGACCATATTCAGACTGCGGCAAGCTATCATGCAATAGCAGTGGCTCTCTCTTTCA 3122
Query 3131 TGGAAGCACATTCATTGAGTGTGCAACACGAACAAACTACACTTCAGATACTTACAGCAA 3190
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3123 TGGAAGCACATTCATTGAGTGTGCAACATGAACAAACTACACTTCAGATACTTACTGCAA 3182
Query 3191 AACTTGGATCAGATGACCTTCGTACACAGGATGCTGCTGCATGGCTCGAATATTTTGAAT 3250
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AACTTGGAGCAGATGACCTTCGTACACAGGATGCTGCTGCATGGCTCGAATATTTTGAAT 3242
Query 3251 CAAGAGCCATAGAGCAGCAGGAAGCAG-CACGAAATGGAATCCCAAAGCATGATGCTTCC 3309
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3243 CAAGAGCCATAGAGCAGCAGGAAGCAGGC-CGAAATGGAATCCCAAAGCCTGATGCTTCC 3301
Query 3310 ATCGCAAGCAAAGGCCACCTTAGTGTATCAGATCTCCTGGACTATATAAGTTCTGATCCA 3369
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302 ATCGCGAGCAAAGGCCACCTTAGTGTATCAGATCTCCTGGACTATATAAGTTCTGATCCA 3361
Query 3370 GACACCAAAGGAAGTGTTGCTCACAGGAAACATCGGCGTGCCAGGGCATTACAGGTCAAT 3429
||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3362 GACACTAAGGGAAATGTTGCTCACAGGAAACATCGGCGTGCCAGGATATTACAGGTCAAT 3421
Query 3430 GATA-GTGTTGCATCAGCTGATGATGACGCCCATAGAGTTGATTCTCAGATTGGCATTGT 3488
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||
Sbjct 3422 GATAAG-GTTGCATCAGCTGATGATGACGCCCATAGAGTTGCTTCACAGATTGACATTGT 3480
Query 3489 TGCATGGAACGACGTGGCAGAAGCGGATGCCATTAAGAGTAGGA-CTGAAGTAAATGATC 3547
| |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3481 TACATGGAACAATGTGGCAGAAGCGGATGTCACTAAGAGTAGGAGC-GAAGTAAATGATC 3539
Query 3548 CTAATGCAGTTGTTGATGAGATCAAAATTGAGACAGGTGATATTGTAGTACACAGGCTAA 3607
|| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 CTGATACAGTTGTTGATAAGACCAATATTGAGACAGGTGATATTGTAGTACACAGGCTAA 3599
Query 3608 ATGTAGACAGCCAAACTGTGGAAGAGTCAACTTTAGATGATGGCTGGCAAGAGGCATACT 3667
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 3600 ATGTAGACAGGCAAACTGTGGAAGAGTCAACTTTAGACGAGGGCTGGCAAGAGGCATACT 3659
Query 3668 CAAAGGGGAGATCCGGAAATGGTGCTGGAAGGAAATTCAGACAAAGGCAGCCTGATCTTA 3727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 CAAAGGGGAGATCCGGAAATGGTGCTGGAAGGAAATCCAGACAAAGGCAGCCTGATCTTA 3719
Query 3728 TGAAAAAGAGAATGTCGCTTAATAAACATTTCAACAGGAGA-CAGGATGTTCAGCAACAG 3786
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3720 TGAAAAAGAGAATGTTGCTTAATAAACATCACAACAGGA-ATCAGGATGTTCAGCAACAG 3778
Query 3787 AATATATCTTC-C--TTGCAGAAAACAAGCAAAAGACCCTCCCTCTCTAAGTCATCATCC 3843
||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3779 AATATATATTCTCCCTTGCAGAAAACAAGCAAAGGACCCTCCCTCTCTAAGTCATCACCC 3838
Query 3844 CATAGGGCTATGAAGAATGCAGAGATAGATGTCAGTACAAATACAACTAAACCACAGTTA 3903
| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3839 CGTAGGGCTCTAAAGAATGCAGAGATAGATGTCAGTACAAATACAACTAAACCACAGTTA 3898
Query 3904 ATGGCTTCTGGTTCTGCTGCTGTGACCAGTACTACTTTGGCTTCAAAGTCTCTCTCATAC 3963
| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3899 AAGGCTTCTGGTGCTGCTGCTGTGACCAGTACTACTTTGGCCTCAAAGTCTCTCTCATAC 3958
Query 3964 AAAGAGGTTGCTTTGGCACCACCAGGTACAGTTCTGAGGCCAATGTTAGAAAAATTAGAA 4023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 AAAGAGGTTGCTTTGGCACCACCAGGTACAGTTCTGAAGCCAATGTTAGAAAAATTAGAA 4018
Query 4024 CTGAATTTGGAGAGAACTGAAACTCAGATATACAGGACTTCAAGTGCGTCAACTGGAGAA 4083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4019 CTGAATTTGGAGAGAACTGAAACTCAGATATACAGGACTTCAAGTGCGTCATCTGGAGAA 4078
Query 4084 GAAAGCAAGTCTGACACTGTAATGTTGGATTTGCCAATCGAAGGCACAGAGCTTCCCTGT 4143
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4079 GAAAGCAAGTCCGACACTGTAATGTTGGATTTGCCAATCGAAGGCACAGAGCTTCACTGT 4138
Query 4144 GAAAAACAAGAATCACAAGAAAGTGCTGAGTCAGTGGAAAATTTAACGTCAGAGTCTGAA 4203
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4139 GAGAAACAAGAATCACAAGAAAGTGCTGAGTCAGTGGAAAACTTAACGTCAGAGTCTGAA 4198
Query 4204 GGGGATCTGGGGTCCTATTGTGGGCAAAAGGCTTCTGATATAAGCCAGACAAAGCTATCA 4263
|||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4199 GGGGATCTGGGGTCCTATCGTGGGAAAAAAACTTCTGATATAAGCCGGACAAAGCTATCA 4258
Query 4264 GCCGCTGCAGAGCCTTACAACCCTGGAGGTTTCTTGTTTATTGATCTGCAAAGCTCAGCA 4323
||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 GCCTCCGCAGAGCCTTACAACCCTGGAGGTTTCTTGGTTATTGATCTGCAAAGCTCAGCA 4318
Query 4324 GCAACAACAGGCAACTACCCGATTATGGTTGCAGACCCTATTTCCTGGGCTGGAGTTCCA 4383
||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 4319 GCAACAATAGGCAGCTACCCAATTATGGTTGCAGACCCTATTTCCTGGGCTGTAGTTTCA 4378
Query 4384 TGTGGGATTCACTCACCACCATATTATAGTGCTAATCACTCCCATGGAGTTGGGATGCCA 4443
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 4379 TGTGGGATTCACTCACCACCATATTATAGTGCTATTCACTCAAATGGAGTTGGGACGCCA 4438
Query 4444 AGAAGCATGAATCCAGATGCACCAGAGTTTGTTCCAATGA-GATCCGTGCAGAATAGCTC 4502
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||
Sbjct 4439 AGAAGCATGAATCCAGATGCACCAGAGTTTGTTCCGA-GAAGATCCTTGCAGAATAGCTC 4497
Query 4503 ACAACATGCAGGTGGAGATGCAAGTGTATCCGTCGACTCCAGCAGTTTCCTAAAGGCTGA 4562
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4498 TCAACATGCAGGTGAAGATGCAAGTGTATCCGTCGACTCCAGCAGTTGCCTAAAGGCTGA 4557
Query 4563 GAAAGAAGCAGTTGCTTTGAAGAAGCGAGAGCTAGCCAGCTTCATAGTAAAGTCATCCCA 4622
|||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4558 GAAAGATGCAGTTGATTTGAAGAAGCGAGAGCTTGCCAGCTTCATAGTAAAGTCATCACA 4617
Query 4623 GAAGGAGGTTCCGGCTGCTCTGAGGAAAACGAGCCCAAAAGCTGAGTCAGGAGATACCTC 4682
||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4618 GAAAGAGGTTCCGGCTGCTCTTAGCAAAACGAGCCCCGAAGCTGAGTCAGGAGGTACCTC 4677
Query 4683 CGCAAAGGATAGTGCATTAACCGAGGTAGTTTATAGTAGAGAAGAGGAGAGTGGAGCGAA 4742
|| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4678 CGAAAAGGATAGTGCAGTAACCGAGATAGTTTATAGTAGAGAAGAGGAGAATGGAGCGAA 4737
Query 4743 TGCAAATGAGACAAATGGAGGTGAAGGGTTTGTGATTGTGGCAAAGAAGAGGAGGAGGAA 4802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4738 TGCAAATGAGACAAATGGAGGTGAAGGGTTTGTGATTGTGGCAAAGAAAAGGAGAAGGAA 4797
Query 4803 GAACAAGCTGCGGCTTACAAATGTTGGGGCTGGGCTGTACCATCAACCGTCGTCAGTTTG 4862
||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4798 GAACAAGGTGCGACTTACAAATGTTGCGGCTGGGCTGTACCATCAACCGTCGTCAGTTTG 4857
Query 4863 TGCAT 4867
|||||
Sbjct 4858 TGCAT 4862
Score = 1995 bits (1080), Expect = 0.0
Identities = 1234/1308 (94%), Gaps = 11/1308 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCACCGAGGTCAAGCAAAGGGAAATCAAACAACAGAGGGAAAGGAGGAGATAAGAAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 38 ATGGCACCGAGGTCAAGCAAAGGGAAATCAAACAACAAAGGGAAAGGAGGAGATAAGAAG 97
Query 61 AAGAGAGAAGACAAACTGTTGGCACCGAGTCTTGTTGAAATCACAGTCACCACTCCGTAC 120
|||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 AAGAGAGACGATAAACTGTTGGCTCCGAGTCTGGTTGAAATCACAGTCACCACTCCGTAC 157
Query 121 GAAACTCAAGTGATACTCAAGGGAGTTTCTACTGACAAAATCATTGATGTGAGAAGGCTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 158 GAAACTCAAGTGATACTCAAGGGAGTTTCTACTGACAAAATCATTGACGTGAGAAGGCTT 217
Query 181 TTGGCATCTCACGTTGAGACTTGCCATTTCACCAACTATTCTCTCTCCCATAAGGTGAAA 240
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 TTAGCATCTCACGTTGAGACTTGCCATTTCACCAACTATTCTCTCTCCCATAAGGTGAAG 277
Query 241 GGGCATAAATTGAATGACAACATCCAAGTGCTTTCCCTCAAGCCTTGTTTCCTCCGCATG 300
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 278 GGGCATAAATTGAATGACAACATCCAAGTACTTTCCCTCAAGCCTTGTTTTCTCCGCATG 337
Query 301 ATTCCAGAGGAGTATCTAGAGGAAAGCCAGGCGTTGACTCAGGTACGGAGAGTCATAGAC 360
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 338 ATTCCAGAGGAGTATCTAGAGGAAAGTCAGGCGTTGACTCAGGTACGGAGAGTCATCGAC 397
Query 361 ATCGTAGCATGCACCACCAGGTTCTTCTCCGCTTCCCCCAAATCCCCCAACAAATCCATA 420
|| ||||||||||||||||||||| | | | | ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 398 ATTGTAGCATGCACCACCAGGTTC-T-T---C-T---CCAAATCTCCCAACAAATCCATC 448
Query 421 GCCGCCGGCAATGCCACTCAGACGCCGGAGCCGGACGGCCTCGACATGGTCGCCATCCAC 480
| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 449 GTTGCCGGCAATGCCAATCCGACACCGGCGCCGGACGGCCTCGACATGGTCGCTATCCAC 508
Query 481 CCCACTCCCAAACTTTCTCAGTTCTACGAGTTTTTCTCCATTC-CTCACCTCTCTCCTCC 539
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||
Sbjct 509 ACCACACCCAAACTTTCTCAGTTCTACGAGTTCTTCTCCATTCAC-CACCTATCTCCTCC 567
Query 540 GATTCTTCACTTGAAGAAAGTTGATGGTGAAGACGCTGGAGAGAAGCGTGATGGTGACTA 599
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 GATTCTTCATTTGAAGAAAGTTGATGGTGAAGAAGCTGGAGAGAAGCGTGATGGTGACTA 627
Query 600 TTTTGGACTCAAGGTTAAGATTTGCAATGGGAAGGTTATACATGTGATTGCTTCGGTGAA 659
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 628 TTTTGGACTTAAGGTTAAGATTTGCAATGGCAAGGTTATACATGTGATTGCTTCTGTAAA 687
Query 660 AGGGTTCTTCGCCGTTGGAAAGCAGCTCACACATTGCCACTCCATTGTTGATTTGCTTCA 719
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 688 AGGGTTCTTCGCCGTTGGAAAACAGCTCTCACATTGTCATTCCATTGTTGATTTGCTCCA 747
Query 720 GAATGTCAGCAATGCTTTTGCCAAGGCATATGAATCTCTAATGAAAACTTTCACTGACCG 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||
Sbjct 748 GAATGTCAGCAATGCTTTTGCCAAGGCATATGAATCTTTAATGAAAGCTTTCACTGATCG 807
Query 780 GAATAAGTTTGGCAACCTCCCGTGTGGATTACGCTCAAATACATGGCTTGTACCTTCTCC 839
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GAATAAGTTTGGCAACCTCCCGTTTGGATTACGCTCAAACACATGGCTTGTACCTTCTCC 867
Query 840 TGTTTCTGAGTCTGCTTCTCCTTTACCAGTAGAGGATGAACATTGGGGCGGGAATGGTGG 899
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 TGTTTCTGAGTCTGCTTCTCCTTTACCAACAGAGGATGAACATTGGGGCGGGAATGGTGG 927
Query 900 AGGTCAGGGGAGAAATGGTGAATATGATCATCGACCTTGGGCGGCACAGTTTTCTGTATT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 928 AGGTCAGGGGAGAAATGGTGAATATGATCATCGACCTTGGGCGGCTGAGTTTTCTGTATT 987
Query 960 AGCTACGCTTCCTTGCAAGACGGAGGAGGAGAGAGTTATTCGAGATAAGAAAGCTTTTTT 1019
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 AGCTACGCTTCCTTGCAAGACTGAGGAGGAGAGAGTTATTCGAGATAAGAAAGCTTTTTT 1047
Query 1020 GCTTCATAGCCAGTTTATCGACACCTCGGTGCAAAGAGCTGTTAGAGCCATTTGCAATTT 1079
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1048 GCTTCATAGCCAGTTTATTGATACCTCAGTGCAAAGAGCTGTTAGAGCCATTTGCAACGT 1107
Query 1080 GATGGATACTAATCAACACACAAGTGGGACTACTGACTTACCTGCTGGCTCGATCCTTCT 1139
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GATGGATACTAATCAACAAACAAGTGGGACTACTGACTTACCTGCTGGCTCGATCCTTCT 1167
Query 1140 TGAGGATCATGTTGGGGATTTGTCTATTATTGTAAAACGCGATATAGCCACCCTTGACCC 1199
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |
Sbjct 1168 TGAGGATCATGTTGGAGATTTGTCTATTGTTGTAAAACGTGATATAGCCAGCCTTGACTC 1227
Query 1200 AAAGCCTGAAGCTACATTTCAAAATGAAGCATTTGTTCTATCATCCCAGGAACTTGCCGA 1259
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1228 AAAGCCTGAAGCTACATTTCAAAATGATGCATTTGTTCTATCATCCGAGGAACTTGCTGA 1287
Query 1260 AAAGAATTTGCTAAAAGGGATAACAGCTGATGAGAGTGTGATTGTTCA 1307
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 AAGGAATTTGCTAAAAGGGATTACAGCTGATGAGAGTGTGATTGTTCA 1335
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 242908338006
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5