BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg312653
Length=6390
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G16800.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 6835 0.0
> AT1G16800.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr1:5745523-5755263
REVERSE LENGTH=6384
Length=6384
Score = 6835 bits (3701), Expect = 0.0
Identities = 4005/4155 (96%), Gaps = 8/4155 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1830 TTTGCC-TATGACATGTGTACGTTTGCTTGAGATTCTTCCTGTCGTTCTGGGAAAACTTA 1888
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 TTTGCCAGATGACATGTGTACGTTTGCTTGAGATTCTTCCTGTCGTTCTGGGAAAACTTA 2170
Query 1889 GAGTAAGCCGTGAAGAGTCCTTTGATACTAGAGGAACTTTGAAAGATGTGTCTGGTCTTA 1948
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2171 GAGTAAGCCGTGAAGAGTCCTGTGATACTAGAGGAACTTTGAAAGATGCGTCTGATCTTA 2230
Query 1949 AATGGCTTCCTGATCTCATTGATTGGGGAAGGTCACAACTTAAGGTTGTTGTTGCGTATT 2008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 AATGGCTTCCTGATCTCATTGATTGGGGAAGGTCACAACTTAAGGTTGTTGTTGCGTATT 2290
Query 2009 GGAAACGAGCATTAGTGGCTTTGCTAGACATCTTACAAGGATCAAACAGTGACGCTTGTT 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 GGAAACGAGCATTAGTGGCTTTGCTAGACATCTTACAAGGATCAAACAGTGACGCTTGTT 2350
Query 2069 CTTCGGCAGTCCAAGCTATCAGACATGTTCTAGCCTCTGGTGATACAAGTCATAATGCTC 2128
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 2351 CTTCGGCAGTCCAAGCTATCAGACATGTTCTATCCTCTGGTGATACAATTGACAATGCTC 2410
Query 2129 TGACTCTTCTTAATTCAGATGATGTTGACATCGAGCAATTAGTAGAACAAATCTCACGCC 2188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2411 TGACTCTTCTTAATTCAGATGATGTTGACATCGAGCAATTAGCAGAACAAATCTCACGCC 2470
Query 2189 TTGTTCCCAAGGCAAATGAGTACCAGATTCTCAAACCTGTTGATGTTGTTGGCAAAGTAC 2248
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2471 TTGTTCCCAAGGCAAATGAGTACCAGATTCTCAAACCTGTTGATGTTGTTGGCAAATTAC 2530
Query 2249 AAGATAATATGATGGATCTAACAGTGGATGAGACAGAAAAGGAATCATTGAAGAATTTAC 2308
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2531 AAGATAATATGATGGATCTAACAGTGGATGAGACAGAAAAGGAATCGTTGAAAAATTTAC 2590
Query 2309 CTAGTCTGCATAAGTCTCATCAACCTGACATCAATAAAACTCTTCCACCTATCACAAGCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 2591 CTAGTCTGCATAAGTCTCATCAACCTGACATCAATAAAACTCTTCTACCTATCAAAAACA 2650
Query 2369 TCTCACAGGTCTCTTCTCTGAAGAAGAGTACTTCTAGTATTGATGCTTCAAAGCTTTTAG 2428
|||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2651 TCTCCCAGATCTCCTCTCTGAAGAAGAGTACTTCTAGTATTGATGCTTCAAAGCTTTCAG 2710
Query 2429 CGCCAGTTCTCTCAGAGAGAGATGTTACAGTTAGCTCCACG-AATATTGTTAGGGATCTT 2487
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2711 CGTTAGTTCTTTCAGAGAGAGATGTTACAGTTAGCTCCA-GCAATATTGTTAGGGATCTT 2769
Query 2488 CCCACGACAAACGCTGAACCAAGCAAGGCTGCTGGTATGAGTAGGGAAGCGGAAAAAAGA 2547
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2770 CCCACAACAAACGCTGAACCAAGCAAGGCTGCTGGTATGAGTAGGGAAGCGGAAAAAAGA 2829
Query 2548 CAGAATGTGGAAGATCCTGTTTCATCTGGAAACAGACCCAACTT--A-AAGGCTACTGAT 2604
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2830 CAGAATGTGGAAGATCCTGTTTCATCTGGAATCAGACCCAACTTAAAGAAGGCTACTGAT 2889
Query 2605 GAACTCGGCCCTCGTGGAACTTCAAAAGAGGCTCAGAAATCTGCGATTTGCAACACAAAA 2664
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||
Sbjct 2890 GAACTCGGCCCTCGTGGTACTTCAAAAGAGGCTCAGAAATCTGCGATTTCCAACGCCAAA 2949
Query 2665 GGCATGGATTTGAGAAAGGTGGTAAATGAGACGGAGGCTGATCCACTGGACATGGCCCTT 2724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||
Sbjct 2950 GGCATGGATTTGAGAAAGGTGGTAAATGAGACGGAGGTTGATCCACTTGACTTGGCTCTT 3009
Query 2725 AAATCTCTGAAACCGCAGTCATTACCCCTGGCAAAACCAGGGCCCATTGTTCCCAAAAGA 2784
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 AAATCTCTGAAACGGCAGTCATTACCCCTGGCAAAATCAGGGCCCATTGTTCCCAAAAGA 3069
Query 2785 CAAGTCATTCAACTTTGTGCACCTGTCAATAAGAAATCCGATCGTTGGCAGAGGCAAGAA 2844
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3070 CAAGTCATTCAACTTTGTGCACCTGTCAACAAGAAATCCGATCGTTGGCAGAGACAAGAA 3129
Query 2845 GCCGGATTTAAAAGATTCAGACCACCAAAGCTTGAAGATTGGTTTAGAAAGATTTTGCAA 2904
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3130 GCTGGATTCAAAAGATTCAGACCACCAAAGCTTGAAGATTGGTTTAGAAAGATTTTGCAA 3189
Query 2905 ATGGACTACTATGCGATAGTGGGATTGGCGTCAACAAATAAAGATGAAAATCAGAATGTT 2964
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||
Sbjct 3190 ATGGACTACTATGCGATAGTGGGATTGGCATCAACAAAGAAAGATGAGAGTCAGAATGTT 3249
Query 2965 GGAAAATTTAGGGAAGTTCCTGTGCGCTTTGGTTCACCTGAGCAATATATTCAGATTTTT 3024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3250 GGAAAATTTAGGGAAGTTCCTGTGCGCTTTGGTTCACCTGAGCAATATATTCAGATTTTT 3309
Query 3025 CAGCCCTTGGTTTTGGAGGAGTTTAAAGCACAGCTGCAAAGTTCCTTCCAGGAGATATCA 3084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3310 CAGCCCTTGGTTTTGGAGGAGTTTAAAGCACAGCTGCAAAGTTCCTTCCAGGAGATATCA 3369
Query 3085 TCACTGGAGGAGATATATTATGGTGTTCTTTCAGTGTTATCGATTGAAAGGGTTGACGAT 3144
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3370 TCACTGGAGGAGATATATTATGGTGTTATTTCAGTGTTATCGATTGAAAGGGTTGACGAT 3429
Query 3145 TTTCATTTTGTTCGTTTTATGCAAGACGAAAATGATGGATCCAACTCGAAAAGTTTCTCT 3204
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3430 TTTCATTTTGTTCGTTTTATGCAAGACGAAAATGATGGGTCCAACTCGAAAAGTTTCTCT 3489
Query 3205 GAGAATGACTTGGTTTTGTTCACGAAAGAGCATCCAGAAAACAGCAATGTCGGTGTTAAT 3264
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3490 GAGAATGACTTGGTTTTGTTCACGAAAGAGCATCCAGAAAACAGCAATGTCGGTGTAAAT 3549
Query 3265 ATGATGGGAAAGGTAGAAGGACGGGAATGGGATGACAAAAAACGGTCCAGCATTTTGAAT 3324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3550 ATGATGGGAAAGGTAGAAGGACGGGAATGGGATGACAAAAAACGGACCAGCATTTTGAAT 3609
Query 3325 GTACGGTTGTATCTTCAGAATGCATCTTCACGTCTGAATCAAGCTAGAAGAAATCTCTTG 3384
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3610 GTACGGTTGTATCTTCAGAATGCATCTTCACGGCTGAATCAAGCTAGAAGGAATCTCTTG 3669
Query 3385 GAACGTAGCCAGTGGCATGCAAGTCGCATTCTCAACATTACATCCCAAATTCGCGAGTTT 3444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3670 GAACGTAGCCAGTGGCATGCAAGTCGCATTCTCAACATTACATCCCAAATTCGCGAGTTT 3729
Query 3445 CAAGCTCTGTCGTCCATAAAGGATATTCCTATACTACCTCTGATCTTAAGTCCTAAGAGT 3504
|||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3730 CAAGCTTTGTCGTGCATAAAGGATATTCCCGTACTTCCTCTGATCTTAAGTCCTATGAAT 3789
Query 3505 GATTCTAATTATGATTCCGAAGTTAAAAGATCAGATCTGCGTTCACTACCACATTCTCTA 3564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3790 GATTCTAATTATGATTCCGAAGTTAAAAGATCAGATCTGCGTTCACTACCACATTCTCTA 3849
Query 3565 CAGCAAATACTTAAATCATCTTTCAATGAGAGTCAACTTCAGGCTATTAGTGTTGCTATT 3624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3850 CAGCAAATACTTAAATCATCTTTCAATGAGAGTCAACTTCAGGCTATTAGTGTTGCTATT 3909
Query 3625 GGCTCATCCAATTTGATGAAAGCTTTTGACATTTCACTTATCCAGGGTCCACCAGGGACT 3684
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3910 GGCTCATCCAATTTGATGAAAGCTTTTGACATTTCACTTATCCAGGGTCCTCCAGGGACT 3969
Query 3685 GGCAAGACGCGCACTATTGTTGCCATTATTAGTGGCTTTCTTGCATCCGCTTTACATAAA 3744
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||
Sbjct 3970 GGCAAGACGCGCACTATTGTTGCCATTATTAGTGGCTTGCTTGCATCCGCCTCACATAAA 4029
Query 3745 GCAAGTGACAGGGGAAATTCTGAACCAGATCATAGTTCTTCAACCTCTAGGCAGAGAATG 3804
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4030 ACTAGTGACAGGGGAAATTCTGAACCAGGTCATAGTTCTTCAACCTCTAGGCAGGGAATG 4089
Query 3805 AATCCGAGTGTCGCTATTGCAAGGGCATGGCAAGATGCAGCTCTGGCTAAACAGCTAAAT 3864
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4090 AATCCGAGTGTCGCTGTTGCAAGGGCATGGCAAGATGCAGCTCTGGCTAAACAGCTAAAT 4149
Query 3865 GATGACGAG-GAAACAAATAAAAAGATAGCAGAAAAGAATGTTAGAGGAAGGGTGCTGAT 3923
||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 4150 GATAAC-AGCGAAACGAATAGAAAGATAGCAGAAAAGAATGGTAGAGGAAGGGTTCTGAT 4208
Query 3924 CTGTGCTCAGTCAAATGCTGCAGTTGATGAATTAGTTTCAAGAATATCCAGTTTAGGCAT 3983
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4209 CTGTGCTCAATCAAATGCTGCAGTTGATGAATTAGTTTCAAGAATATCCAGTTTAGGTAT 4268
Query 3984 ATATGGCAGGGATGGGAAGATGTTCAAACCTTATCTTGTGAGAGTTGGAAATGCAAAAAC 4043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4269 ATATGGCAGGGATGGGAAGATGTTCAAACCTTATCTTGTGAGGGTTGGAAATGCAAAAAC 4328
Query 4044 TGTTCATCCAAATTCAATGCCCTTCTTTCTTGATACCCTTGTTGATCAGCGTTTGGCAGA 4103
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4329 TGTTCATTCAAATTCAATGCCCTTCTTTCTTGATACCCTTGTTGATCAGCGGTTGGCAGA 4388
Query 4104 GGAGAGAATGAGGATAAACGAATCTAAGAGTAATAAAGGTGCAGATTCCTCTGGATTACT 4163
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 4389 GGAGAGAATGCGGATAAACGAATCTAAGAGTAATAAGGGTGCAGATTCTTCTGCATTACT 4448
Query 4164 GCGCTCTAATCTAGAAAAAATAGTTGATCAGATCACGCATTTTGAAGCTAAGCGTGCAAA 4223
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4449 GCGCTCTAATCTAGAAAAAGTCGTTGATCAGATCACGCACTTTGAAGCTAAGCGTGCAAA 4508
Query 4224 CATAAATCAGGAAAGTTTAGACGCCAAAGATAAGCCGGAGAATGAACACCACAATAAAGA 4283
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4509 CATAAACCAGGAAAGTTTAGACGCCAAAGATAAGCCGGAGAATGAACACCACAACAAAGA 4568
Query 4284 TGATGATGGCAAGCCAATGTCCGACGCGGAGCTAGGAATAAGATTGCGAAGGTTATATGA 4343
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4569 TGATGATGGCAAGCTAATGTCCGATGCGGAGCTAGGAATAAGATTGCGAAGGTTATATGA 4628
Query 4344 GCAGAAGAGAAAAATTTACAAAGATCTTAGTGCTGTTCAGGCTCAAGAGAGAAAAGCTAA 4403
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4629 GCAAAAGAGAAAAATTTACAAAGATCTTAGTGCTGTTCAGGCTCAAGAGAGAAAAGCGAA 4688
Query 4404 CTATGAAATGAGAGCATTGAAACATAAGTTGCGGAAGTCCATTCTTAAAGAAGCTCAAAT 4463
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4689 CTATGAAATGAGAACATTGAAACAAAAGTTGCGGAAGTCCATTCTTAAAGAAGCTCAAAT 4748
Query 4464 AGTCGTTACAACTTTAAGTGGTTGTGGAGGAGACCTGTACAGTGTGTGTGCTGAATCTTT 4523
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4749 AGTTGTTACAACTTTAAGTGGTTGTGGAGGAGACCTGTACAGTGTGTGTGCTGAATCTTT 4808
Query 4524 ATCAGCCCATAAATTTGGTAGTCCATCTGAAGATAATTTATTTGATGCGGTAGTGATTGA 4583
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4809 AGCAGCACATAAATTTGGTAGTCCATCTGAAGATAATTTATTTGATGCGGTGGTGATTGA 4868
Query 4584 TGAAGCAGCTCAGGCCCTGGAGCCTGCTACGTTGATTCCTCTACAACTGTTAAAGTCAAG 4643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4869 CGAAGCAGCTCAGGCCCTGGAGCCTGCTACGTTGATTCCTCTACAACTGTTAAAGTCAAG 4928
Query 4644 AGGAACAAAATGTATAATGGTTGGAGACCCAAAGCAGCTTCCAGCAACTGTGCTCTCTAA 4703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4929 AGGAACAAAATGTATAATGGTTGGAGACCCAAAGCAGCTTCCAGCAACTGTGCTCTCTAA 4988
Query 4704 CGTTGCAAGTAAATTTTTGTATGAATGCAGCATGTTTGAACGTCTGCAAAGGGCTGGGTA 4763
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4989 CGTTGCAAGTAAATTTTTGTACGAATGTAGCATGTTTGAACGTCTGCAAAGGGCTGGGTA 5048
Query 4764 CCCTATCCTTATGCTTACCCAGCAGTATAGGATGCATCCAGAAATTTGTCGATTCCCGTC 4823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5049 CCCTATCCTTATGCTTACCCAGCAGTATAGGATGCATCCAGAAATTTGTCGATTCCCGTC 5108
Query 4824 TATGCATTTCTACGACTATAAGTTACTAAATGGTGTTGACATGTCAAGTAAATCAGCACC 4883
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5109 TATGCATTTCTACGACAATAAGTTACTAAATGGTGTTGACATGTCAAGTAAATCAGCACC 5168
Query 4884 GTTTCACGAGAGCCATCATCTTGGACCATATGTTTTGTATGATATTGTTGATGGCCAAGA 4943
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5169 ATTCCACGAGAACCATCATCTTGGACCATATGTTTTCTATGATATTGTTGATGGCCAAGA 5228
Query 4944 GCATCGAAGTGGCGATTCTAGTTCTGTATGCAATGAACAAGAAGCTGAAGCTGCTGTTCA 5003
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5229 GCATCGAAGTGGCGATTCTAGCTCCGTATGCAATGAACAAGAAGCTGAAGCTGCTGTTCA 5288
Query 5004 ACTGCTTAGATTTTTCAAGAAGAGGTACCCCTCCGAATTTGTTGCTGGAAGAATTGGCAT 5063
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5289 ACTGCTTAGATTTTTCAAGAAGAGGTACCCCTCAGAATTTGTTGCTGGAAGGATTGGCAT 5348
Query 5064 TATAACCCCTTATAAACGTCAGCTTGCCGTTTTGCGTTCACGTTTCACTGGTGCATTTGG 5123
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5349 TATAACCCCTTACAAGCGTCAGCTTGCCGTTTTGCGTTCGCGTTTCACTGGTGCATTTGG 5408
Query 5124 GGCTCAAGTAACAGCAGATATGGAAATGAATACTGTGGATGGCTTTCAAGGCAGAGAAGT 5183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5409 GGCTCAAGTAACAGCAGATATGGAAATGAATACTGTGGATGGCTTTCAAGGCAAAGAAGT 5468
Query 5184 GGACATATTAGTGTTATCCACTGTAAGAGCTACACATTCTGATCCTGATGGGGTCAATCA 5243
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 5469 TGACATATTAGTATTATCCACTGTAAGAGCTACACATTCGGCTCCTGATGGGGTCAATCA 5528
Query 5244 AAGTCGGATTGGTTTTGTTGCAGATGTTAGACGCATGAATGTTGCTCTCACTAGAGCCAA 5303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5529 AAGTCGGATTGGTTTTGTTGCAGATGTTAGACGCATGAATGTTGCTCTCACTAGAGCCAA 5588
Query 5304 ACTCTCCCTTTGGGTTTTGGGTAACACACGAACCTTGCAAAGAGACCATAACTGGGGTGC 5363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5589 ACTCTCCCTTTGGGTTTTGGGTAACACACGAACCTTGCAAAGAGACCATAACTGGGGTGC 5648
Query 5364 TCTTGTGAAAGATGCAAAAGAAAGAGAAGTCATCATACCAGTTAAGCGACCATACAACAA 5423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 5649 TCTTGTGAAAGATGCAAAAGAAAGAGAAGTCATCATACCAGTTAAGCGACCGTACAACTA 5708
Query 5424 CATGTTTGGTGAAAATGTGATGGAACAAAACCATTCTGAGAATCTTCCAAAGAATTTTCC 5483
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5709 CATGTTTGGTGAGAATGTGATGGAACAAAACCATTCTGAGAATCTTCCAAAGAATTTTCC 5768
Query 5484 TAAGCCTGAGAAACAGCATTCACGCCGCAAAGAACAGAGAGCAGAGACATCTTCTGATAG 5543
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5769 TAAGCCTGATAAACAGCATTCACGCCGCAAAGAACAGAGAGCAGAGACATCTTCTGATAG 5828
Query 5544 AAAAATGAGGAAATCTGATGGAGATGTTGTGCCTATCTCATCAAAAGGATCAGAGAGAAA 5603
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5829 AAAACTGAGGAAAACTGATGGAGATGTTGTGCCTATCTCATCAAAAGGATCAGAGAGTAA 5888
Query 5604 GCACAGCAGACGAAACGCCAAAGAAGAAGCTTCTTCTCAAAGGGAAAAACTTGTTGCAAG 5663
||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5889 GCACACCAGACGAAATGCGAAAGAAGAAGCTTCATCTCAAAGGGAAAAACTAGTTGCAAG 5948
Query 5664 CTGTGAGAAGGTAGCATCCAAAGAGACTCTGAAACGGAGCTATGAAAAGAAAGAGAAAAT 5723
||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 5949 CTGTGAGAAAGTAACATCCGAAGAGACTCTGAGACGGAGCCATGAAAAGAAAGAAAAAAT 6008
Query 5724 GAAAGGCAGAGAGAAAAGCAGTAATCCAGAGAATACAGATACAAATAGTTCAAAGAACGA 5783
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 6009 GAAAGGCAGAGAGAAAAGCAGTAATCCAGAGATTACAGATGCAAATAGTTCGAAGAACGA 6068
Query 5784 AAATTCTAATGAGTGGAAGAAATCTAAGAAGGCTTCATCAAAGGTTGACAGTAGCAAGAG 5843
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6069 AAATTCAAATGAATGGAAGAAATCTAAGAAGGCTTCATCAAAGCTTGACAGTAGCAAGAG 6128
Query 5844 GGCAAATCCCACAGATGAAATTGGACAGAAAGATAGACAAATAAACAAAGGCAATGCTTC 5903
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6129 GGCAAATCCCACAGATAAAATTGGACAGCAAGATAGGCAAATAAACAAGGGCAATGCTTC 6188
Query 5904 TAATCAAGGAGGTGTTGAAGATATGATATCCAAACGAAAGCAACAGCGTGAAGCTGTTGC 5963
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6189 TAATCAAGGAGGTGTTGAAGATATGATATCCAAACGAAAGCAGCAGCGTGAAGCTGTTGC 6248
Query 5964 TGCCATTCTCAATTC 5978
|||||||||||||||
Sbjct 6249 TGCCATTCTCAATTC 6263
Score = 1038 bits (562), Expect = 0.0
Identities = 608/631 (96%), Gaps = 0/631 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTTGAGTAAAGTCTCCCCAAGTGGAGAGCTCTTGAGCCGGTGGAGGAGAATCGAGGAA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGAGTAAAGTCTCCCCAAGTGGAGAGCTCTTGAACCGGTGGAGGAGAATCGAGGAA 60
Query 61 GACGAAGAGGAGAATGACGATTCTGATCCTTCCTCAGTTCGGCGTCTTAATCAGCGCAAA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GACGAAGAGGAGAATGACGATTCTGATCCTTCAGCAGTTCGGCGTCTTAATCAGCGCAAA 120
Query 121 GAACAATGGTTTACGGATGCATTCACTTTATTGATATCTTTGCCCAAGGATACTCATATA 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 121 GAACAATGGTTTACGGATGCATTCACTTTATTGATATCGTTGCCGAAAGATACTCATATT 180
Query 181 TGGTGTGGGCATGGGGATGTAATGGGACCTCTTATAGAGACATTCTACAATTACTTCAAA 240
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 TGGTGTGGGCACGGGGATATAATGGGACCTCTTATAGAGACTTTCTACAATTACTTCAAA 240
Query 241 GATGATAGAGTTGATTCACCTCTCAAGGTCTTGTGGAAGAGAATCTCTGAAGAAATGCGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 241 GATGATAGAGTTGATTCACCTCTCAAGGTCTTGTGGAAGAGAATCTCTGAAGAGATGCGG 300
Query 301 CTTTGTGCCCAATGCATTTGTCAGCACCATCAGACTCAAGAGATGTATGAAAAAGAGTAT 360
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTTTGTGCGCAATGCATTTGTCAGCACCATCAGACTCAAGAGATGTATGAAAAAGAGTAT 360
Query 361 GAGTGCTTTTCTGTTGGTCCATTACTTGATGTGTTGCGGAAACTTGATGAGGAAAGGGTC 420
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGTGCTCTTCTGTTGGTCCATTACTTGTTGTGTTGCGGAAACTTGATGAGGAAAGGGTG 420
Query 421 ACGAGGCACTTGCAAGAGATCAATTTCAAAGTTGAAAATGGAACCTATGATCCAGATCAT 480
|||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 421 ACGAGGCACTTGCAAGAGATCAATTTGAAAATAGAAAAAGGAACATATGATCCAGATCAT 480
Query 481 CATCATGCGGAAGTTGTTAGTGTTATGTACGAGGTTTTGATGTTTCCGTTCTTCTTTGAT 540
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 481 CATCATGCTGAAGTTGTTAGTGTTATGTACGAGGTTTTGATGTTTCCATTCTTCTTTGAT 540
Query 541 GATATGTCCTTATGCGCTGAGTTTGAGAAATTTATTGAGTCAATCGACAACATACACGAG 600
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GATATGTCCTTATGCACTGAGTTTGAGAAATTTATTGAGTCAATCGACAACATACACGAG 600
Query 601 CTTGCGTTTGCTGAGAATCAAGAATTTCCGG 631
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CTTGCGTTTGCTGAGAATCAAGAATTTCCGG 631
Score = 752 bits (407), Expect = 0.0
Identities = 427/437 (98%), Gaps = 0/437 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1310 TGGAATCTGAAAAGAATGATGAAATGACAGTTGATATAGAAACTTGGCTTTCATCTTCTG 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388 TGGAATCTGAAAAGAATGATGAAATGACAGTTGATATAGAAACTTGGCTTTCATCTTCTG 1447
Query 1370 CTGTTGAAATCAAAGGCACGCTTGGATGGAAGGTAGCAACAGGATCTGATGACGGGGGGC 1429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448 CTGTTGAAATCAAAGGCACGCTTGGATGGAAGGTAGCAACAGGATCTGATGACGGGGGGC 1507
Query 1430 CAGGAAAGGAGTCCAAAAACTCAGTGACAGTATCAAAGATGTGTCTTACATTGATACGAA 1489
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 CAGGAAAGGAGTCTAAAAACTCAGTGACAGTATCAAAGATGTGTCTTACATTGATACGAA 1567
Query 1490 CATTGAAGAGATTGACCACTTGTTATCTGGTCCAAATGGGTGAAGAATGTCGAAAACAGT 1549
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1568 CATTAAAGAGATTGACCACTTGTTATCTGGTACAAATTGGTGACGAGTGTCGAAAACAGT 1627
Query 1550 GGACCTGGGTACCAGGGATGGGAGAAACGTTCATCCTTTCTCTTTCAGACCCAGATGACA 1609
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GGACCTGGGTACCAGAGATGGGCGAAACGTTCATCCTTTCTCTTTCAGACCCAGATGACA 1687
Query 1610 ATGTAAGGCAGTTTGGAAAGTCTATGCTGGAACATGTTTCAAATACCAGAGGTCTGTCTT 1669
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 ATGTAAGGCAGTTTGGAAAGTCTATGCTGGAACACGTTTCAAATACCAGAGGTCTGTCTT 1747
Query 1670 GTGGGTTGAAGTTTCTCTGCTCTCAAACTTCTCACCTCCTATTTGTTTCTTCCGGCGTTA 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1748 GTGGGTTGAAGTTTCTCTGCTCTCAAACTTCTCACCTCCTATTTGTTTCTTCCGGAGTTA 1807
Query 1730 GACATGTTTTACAGCAG 1746
|||||||||||||||||
Sbjct 1808 GACATGTTTTACAGCAG 1824
Score = 518 bits (280), Expect = 3e-145
Identities = 310/324 (96%), Gaps = 4/324 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 630 GGTCAGCAACCCAGTTAGAGCGCCTCCAACCATTGCTCAAGAAATTCATTGGAATTCTGG 689
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 GGTCAGCAACCCAGTTAGAGCGCCTCCAGCCATTGCTCAAGAAATTCATTGGAATTCTGG 769
Query 690 AGATGGAGGGACTGCCTTCTGCGTCTCAGGAACCGAGGCCGAGGATTTATCTAGACCGCT 749
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 770 AGATGGAGGGACTGCCTTCCGCGTCTCAGGAACCGAGACCAAGGATATATCTAGACCGCT 829
Query 750 CATCTATATGGCTTGGGATGACATCATTG--TAAG-AGTTA-AAGGCCCTGCTTTTGAAG 805
|||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 830 CATCTATATGGCTTGGGATGACATCACTGCTTGAGTTCTTAGAAGGCCCTGCTTTTGAAG 889
Query 806 AGGGGATATTAGAGCCTTATCCCATTTTTGTCGATACAGTGTTGAATCACATAAGTGGTG 865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 AGGGGATATTAGAGCCTTATCCCATTTTTGTCGATACAGTGTTGAATCACATAAGTGGTG 949
Query 866 ATTCACCTGAATTTTCGCTGGCTGTTAATTGTCTAAAAGAGCTATTTAAGACACTTGGTA 925
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 ATTCACCTGAATTTTCGCTGGCTGTTAATTGCCTAAAAGAGCTATTTAAGACACTTGGTA 1009
Query 926 TGTCCCTTGAGGCTTTGCGAGATG 949
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 TGTCCCTTGAGGCTTTGCGAGATG 1033
Score = 237 bits (128), Expect = 1e-60
Identities = 149/159 (94%), Gaps = 1/159 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 949 GATTCTTCACTTCATATTTCATTGCGACAACCTGCTATTGATCTTGTCCAAGCTATCCTG 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 GATTCTTCACTTCATATTTCATTGCGACAACCTGCCATTGATCTTGTCCAAGCTATCCTG 1296
Query 1009 GTATCTGATGCAACAGCCTTACTAGCTTCGCTGCTACGTAATAAGACTGGTAAATATATG 1068
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 1297 GTATCTGATGCAACAGCCTTACTAGCTTCGTTGCTACGTAATAATACTGGTAAATTTATG 1356
Query 1069 GGCGATGAGATGCAATCTGACGATGATGACA-GTAATCT 1106
||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||
Sbjct 1357 GGCTATGAGATTCAATATGACGACGATGACATGGAATCT 1395
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 318948315442
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5