BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg313049
Length=6399
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G21580.1 | Symbols: | Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type fam... 4844 0.0
> AT1G21580.1 | Symbols: | Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family
protein | chr1:7557262-7565803 REVERSE LENGTH=7209
Length=7209
Score = 4844 bits (2623), Expect = 0.0
Identities = 2968/3131 (95%), Gaps = 37/3131 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2163 TGCCTCTCTGGACATTGCTAATGTTTCATCGGATCTTGCTAATGCAAATAATAGTGCCTC 2222
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2320 TGCCTCTCTGGACATTGCTAATGTTTCATTGGATCTTGCTAATTCAAATAATAGTGCGTC 2379
Query 2223 AGGGGATCTTGCTAATGCTAACAGTTTTACCGTTGGGACATATATTAATACTATGGTCAC 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2380 AGGGGATCTTGCTAATGCTAACAGTTTTACCGTTGGGACATATATGAATCCTATGGTCAC 2439
Query 2283 GTCACCTGGTAAGAGTGTAGTTTTCCAGATGGAAAGTAAAAATCTTCCTCACTGCAAAAA 2342
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 GTCACCTGATAAGAGTGTAGTTTTCCAGATGGAAAGTAAAAATCTTCCTCACTGCAAAAA 2499
Query 2343 CACAGTCAATGCAGCTGTTGAGAATGTTAGCGGAAAAGAATACATGGAAACTACGCCTCT 2402
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2500 CACAGTCAATGCACCGGTTGAGAATGTTAGCGGAAAAGGATACATGGAAACTACGCCTCT 2559
Query 2403 TAATGTTGCTGCAGAAATGGCTGACAATATGGATAGTGATGAAGGTAAACAGACTTTTGT 2462
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 2560 TAATGTTGCTGCAGAAACGGCTGACAATATGGACAGTGAAGAAGGTAAACAGACTTGTGT 2619
Query 2463 AAACGACACTTCTTCATCTCTAACAAAGGTTGGAGTAAAGGGATCATCAAATGTGCTGTC 2522
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2620 AAACGACACTTCTTCATCTCTGACAAAGGTTGGAGTAAAGGGATCATCAAATGTGCTGTC 2679
Query 2523 TGTGGAGAGGACTGATGGCTGTTCGCACAGTGATGAATCTGATTTAGCTATGGCAGTACC 2582
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2680 TGTGGAGAGGACTGGTGGCTGTTCGCATAGTGATGAATCTGATTTAGCTATGGCAGTGCC 2739
Query 2583 ATCTGAGGTGTGTATGGAAAATGTAAGCGCCGAGAGACTTGTCCCTGAT---GAG--G-T 2636
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |
Sbjct 2740 ATCTGAGGGGTGTATGGAAAATGTAAGCACCGAGAGACTTGTCCCTGATGAGGAGCTGAT 2799
Query 2637 TTTGAAATCTTATCATCCTGCAGAAATTCCTTCTGTAGATCAGTTTAGTGGTTCTGATCG 2696
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || ||||||||||||| |
Sbjct 2800 TTTGAAATCTTATCATCCTGCAGAAATTCC-T-TGT-G-T-AG-ATAGTGGTTCTGATAG 2853
Query 2697 TAGAGGTTTGAAAGCTTATTTATTGGAGCCAAATGTTTCTCTTAGCAAAGATCTTACTGA 2756
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 TAGAGGTTTGAAAACTTGTTTATTGGAGCCAAATGTTTCTCTTAGCAAAGATCTTACTGA 2913
Query 2757 TTGTGCGAGAGAGAGTCTTGTTGAGCGAGATGTTAGCCAAAGATCTGCCACATTTTGTGA 2816
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2914 TTGTGCGAGAGAGAGTCTTGTTGAGCAAGATGTTAGCCAAAGATCTGCCATATTTTGTGA 2973
Query 2817 TAAATTACCTAGCTTGTCTGCGCTCGTAACTGAAACAAATCTTGCAATTGGAATTAATGG 2876
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2974 TAAATTACCTAGCTTGTCTGCGTTCGTAACTGAAACAACTCTTGCAATTGGAATTAATGG 3033
Query 2877 CATGTCTGGTAATGAAACGGTTACTGATACTGTATCTGGTCTCCACGAAATTCAACCATG 2936
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 CATGTCTGGTAATGAAACAGTTACTGATACTGAATCTGGTCTCCACGAAATTCAACCATG 3093
Query 2937 TAAAACAGTATGCAAGTTGTCTCCTGAAGATCGTTTTGGATATGGATCATCTGGTGTCAT 2996
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3094 TACAACAGTATGTAAGTTGTCTCCTGAAGATCGTTTTGGATATGGATCATCTGGTGCCAT 3153
Query 2997 TGGTTCTGTCCGGAGTCTCTTTATAGATAAAAATCTTGAAAAGGATCCTTCAAAGGTCAG 3056
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3154 TGGTTCTGTCCGGAGTCTCTCTATAGATAAAAATCTTGAAAAGGATTCTTCAAAGGTCAG 3213
Query 3057 TTCTTGCTTAGTATCTGATAGTTCTGTTGGTCCTTGTCATATTTCTCCCTTGGTGGCAGT 3116
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3214 TTCTTGCTTAGTATCTGATAATTCTGTTAGTCCTTGTCATATTTCGCCATTGGTGGCAGT 3273
Query 3117 GAATGAGGAGATACAAAACAAAATATGTATCCAAGCTAACTGCAGTAATTCTCAAGATGG 3176
|||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3274 GAATGAGGAGATACAAAACAAAATATCTGTTAAAGCTAACTACAGTAATTCTCAAGATGG 3333
Query 3177 CATCAAGCATACGGAAAATAATTGTACTGAAAGCGTTGAGGTAGATACTCAAGAAGAGAA 3236
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3334 CATCAAGCATAAGGAAGATAATTGTACTGAAAGCGTTGAGGTAGAAACTCATGAAGAGAA 3393
Query 3237 AGCAAAGCTTCCTGGAGGAACTTCTAAGTCA-AGAACTCGGGGAACTAATATTATTGCTG 3295
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||
Sbjct 3394 AGCAAAGCTTCCTGGAGGAACTTCTAAGT-ACAGAACTCCGGTAACTAATATTACTGCTG 3452
Query 3296 GTAGT---GGGGACTCTGTGTTATTATGTGATTCTTTATCCAGCTCAGGAAGGCGGAACT 3352
||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 3453 GTAGTGGGGGGGACTCTCTGTTTTTATGTGATTCTTTATCCAGCTCACGAA---GG---- 3505
Query 3353 TCAGGCAGCTACGGAGTGAAGTTCATGTTGCTGCTATGGTTGATGAAACTAGCAAAGGTG 3412
| || | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3506 -C-GG-A--TACGGAGTGAAGTTCATGTTTCGGCTGTGGTTGATGAAACTAGCAAAGGTG 3560
Query 3413 AAGAGAAATCCAAGCCTTCTGGTGGTATTGTTGCTGTTAGGAAAGATTCAGTGTTTCCAT 3472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3561 AAGAGAAATCCAAGCCTTCTGGTGGTATTGTTGCTGTTAGGAGGGATTCAGTGTTTCCAT 3620
Query 3473 GTGATTCTCTATCCAGCTCGCCAAGGCTGTACAGACCGTTACGGAGTGAAATTCACGTTG 3532
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3621 GTGATTCTCTATCCAGCTCGCCTAGGCTGTCCAGACCGTTACGGAGTGAAATTCATGTTG 3680
Query 3533 CTTCTATGGTTGATGAAACTAGCAAATCTAAAGAGAAAACAGAGTCTTCTGGTGGAACTT 3592
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3681 CTTCTATGGTTGATGAAACTAGCAAATCTATAGAGAAAATAGAGTCTTCTGGTGGAACTT 3740
Query 3593 CTAAGCACAGAACTCCGGAAACTGATATTGTTGCTGGTAGTGGGGATTCAGTGTTTCCAT 3652
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3741 CTGAGCACAGAACTCCGGAAACTGATATTGTTGCTGGTAGTAGGGATTCAGTGTTTCCAT 3800
Query 3653 GTAATTCTTTATCAAGCTCACCAAGGCTGAGCTTCAGGCAGTTACGGAGTGAAATTCATG 3712
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801 GTAATTCTTTATCAAACTCACAAAGGCTGAGCTTCAGGCAGTTACGGAGTGAAATTCATG 3860
Query 3713 TTGCTGCTATGGTTGATGAAACCAACAGAGTTAAAGTGAGTCAAAATGGAGATAGTCTTT 3772
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3861 TTGCTAATATGGTTGATGAAACCAACAGAGTTAAAGAGAGTCAAAATGGAGATAGTCTTT 3920
Query 3773 TAGATACTTTACAAGAGCAAATTATGAGCTCCCATGAGTTAACCCAGCCAGATAGCTCTT 3832
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3921 TAGATACTTTACAAGAGCAAATTATGACCTCCCATGAGTTAACCCAGCCAG---GTTCTT 3977
Query 3833 TGGCGCATTGTGATTTAGTTATGAAGCCAATTGGTGATCCAATCGTGAAACTGACTGATA 3892
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3978 CGGCGCATTGTGATTTAGTTATGAAGCCAATGGGTGATCCAATAGCGAAACTGACTGATA 4037
Query 3893 TAACTTCTGATGTGGGCTCTCAAGAAAAAGACTTACGCAATAGTGCTAAGACTGATATAT 3952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||
Sbjct 4038 TAACTTCTGATGTGGGCTCTCAAGAAAAAGACTTACGGAACATTGCTAAGACTGATACAT 4097
Query 3953 TTGATGGCGAAGCATTGTCATCTGATGGAAAAGTTTCTGGAACTGAAATTCCTGGTGATT 4012
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4098 TTGATGGCGAAGCAGTGTCATCTGATGGACAAGTTTCTGGAACTGAAATTCCTGGTGGTT 4157
Query 4013 CAGGTGTTCTTGTGTCCAGATCATACTCACATGCAGATGTTAAATTTGCATCGACCCATG 4072
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 4158 CAGGTGTTCGTGTGTCCAGATCATACTCACATGCAGATGTTAAATTTGCTTTGACCCATG 4217
Query 4073 TTAAAGAACATGTAGTCTCTGTGCCACACCGGGATCTTCAAAGTAAGACATCTATGAATT 4132
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4218 TTAAAGAGCATGTAGTCTCTGTACCACACCGGGATCCCCAAAGTAAGACATCTATGAATT 4277
Query 4133 CTAAGTATGAAATAGAAAAGAGGAAAAAGAAACCCAGTTACTCTACTCAGAAAAATTATC 4192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4278 CTAAGTATGAAATAGAAAAGAGGAAAAAGAAACCCAATTACTCTACTCAGAAAAGTTATC 4337
Query 4193 CCAGTTCCCTGCTTTTTGTGTCTGACACGAAGAAAGATGCTAACCCTCCAATTCATATCA 4252
|||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4338 CCAGTTCCCTGCCTTATGTGTCTGACACTAAGAAAGATGCTAACCCTCCAATTCATATCA 4397
Query 4253 CAAAGCGTCACACTTGGCATCGAAAGTCCGATACTTCTCCCTCTTCTTTTGTAGCTGCCA 4312
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4398 CAAAGCGTCACACTTGGCATCGAAAGTCCGATGCTTCTCCCTCTTCTTTTGTAGCTGCCA 4457
Query 4313 AGCCTTTGTCTTCGACGTTGTCTACACAACAGAAGTTTCCCAAAGTGACTGCCCAATCTA 4372
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4458 AGCCTTTGTCGTCTACGTTGTCTACACAACAGAAGTTTCCCAAAGTGACTGCCCAATCTA 4517
Query 4373 GTAATAGTTACGTACGTAAAGGGAATAGTCTTCTTCGAAAACCCTCACA---TTCTCCTG 4429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4518 ATAATAGTTACGTACGTAAAGGGAATAGTCTTCTTCGAAAACCCTCACATGGTTCTCCTG 4577
Query 4430 GTACTGCCCTGGGAATGCCTCCATCTGCTATCCAGTTGAACCATTTCACTGTGGAAGACA 4489
|| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4578 GTGCTGCCCTTGGAATACCTCCATCTGCTATCCAGTTGAACCATTTCACTGTGGAAGACA 4637
Query 4490 AAAGCACGGGACCTTCCAATATGGTTGATGTAGATAATGCTTCTTCACTTGTTAAAACAG 4549
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4638 AAAGCACGGGATCTTCCAATATGGTTGATGTAGATAATGCTTCTTCACTTGTTAAAACAG 4697
Query 4550 GGGAAATACCTACTCTTGAGAGGCAGTCAAAGCCTCCCTCAGACAGCAGCACTTCCAAAG 4609
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4698 GGGAAATAGCTACTCTTGAGAGGCAGTCAAAGCCTCCCTCAGACAGCAGCACTTCCAAAC 4757
Query 4610 TATCAAATGCCATCGCTACTTCTTCAGGAAAATGTG-TGTTATCTTACAGCACGGATCAT 4668
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 4758 TATCAAATGCCATCGCTACTTCATCAGGAAAATGTGCT-TTATCTTACAGCACGGATCAT 4816
Query 4669 CTCACCCCCGGTTTACCTGAGTCTATCATGGATTCTGCTACATCTGGAGAAGCTAATTTT 4728
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4817 CTCACCACTGGTTTACCTGAGTCTATCATGGATTCTGCTACATCTGGAGAAGCTAATTTT 4876
Query 4729 CCACATTCTGGTGGGGATACATTGAAGACATTTGATACACTAATTCAGACGGGTTACGCT 4788
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 4877 CCACATTCTGGTGGGGACACATTGAAGACATCTGATACACTGATTCAGACGGGTTATGCT 4936
Query 4789 TCAGATTGCCAGCAGAAGAGAAATCCGTCTGACTTGGATTCTGCGAATTTGAAGAGAATG 4848
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 4937 TCAGATTGCCAGCAGAAGAGAAATCCGTCTGACTTGGATTCTTCAAATTTGAAGAGAATG 4996
Query 4849 GTATATGTCAAGAGAAAGGCAAATCAGATGGTTGCAGCTTCAGATATTCATGGTGTAAGT 4908
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4997 GTATATGTCAAGAGAAAGGCAAATCAGTTGGTTGCAGCTTCAGATATTCATGATGTAAGT 5056
Query 4909 CAGAACCAGATTCCTTCCTCTGATGGGTACTTTAAGCGAAGTAAAAATCAGCTAGTAAGG 4968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5057 CAGAACCAGATTCCTTCCTCTGATGGGTACTTTAAGCGAAGTAAAAATCAGCTAGTAAGG 5116
Query 4969 AATTCAGAGAGCCGTTGCAATCAGTCAATTTCCTTACCTGATGATGCATTAGATACACGA 5028
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5117 AATTCAGAGAGCCGTTGCAATCAGTCAATTTCCTTGCCTGATGATGCATTAGATACACGA 5176
Query 5029 TCAGCTGCAAACATAGTTTCGGAAAGATCATCTAGCTCAGCATTCTCTGACTCTGCTGTC 5088
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5177 TCAGCTGCAAACATGGTTTCGGAAAGACCATCTAGCTCAGCATTCTCTGACTCTGCTGTC 5236
Query 5089 ATGCGACCATTTAAGCAATCAAAGTTTTCTCTGGTATGGACGCAAAATGATCCGCAGCCA 5148
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5237 ATGCGACCATTTAAGCAATCAAAGTTTTCTCTGGTTTGGACGCAAAATGATCCGCAGCCA 5296
Query 5149 AGAATGCCCATAGCTCACATGCGATATCAGAATATTTTGCCGCAACTTGTTCCCTGGAAA 5208
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5297 AGAATGCCCATAGCTCACATGCGAAATCAGAATATTGTGCCGCAACTTGTTCCCTGGAAA 5356
Query 5209 AGAGTGACATACTGGAGAAGATTAATGAATTCAGTGTCTGCTTTCCGAAATGGTTCTTTT 5268
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5357 AGAGTGACGTACTGGAGAAGATTAATGAACTCAGTGTCTGCTTTCCGAAATGGTTCTTCT 5416
Query 5269 CCCAACATTAG 5279
| |||||||||
Sbjct 5417 CTCAACATTAG 5427
Score = 2039 bits (1104), Expect = 0.0
Identities = 1437/1582 (91%), Gaps = 86/1582 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATTCTTCTCATTACAATCCTACCTACGATCCATGGAATTCTCCTTACTctcctcat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGGATTCTTCTCATTACAATCCTACCTACGATCCATGGAATTCTCCTTACTCTCCTCAT 208
Query 61 cttcatcctccttctgctcctctccttccgccgccaccgccgtta---cctcctcctcct 117
||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 209 CTTCATCCTCCCTCTGCT-C-CT-CTTCCGCCGCCACCGCCGTTACCGCCTCCTCCTCCT 265
Query 118 cctcGTCAATCTCATCCCGAGAGCCCTAATTTATATGGTCGATCAACCCAGAGCAATGGT 177
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 266 CCTCGTCAATCTCATCCCGAAAGCCCTAATTTATATGGTCGATCAACTCAGAGCAATGGT 325
Query 178 CAACGTCAAGATTACCACCATCAATACTCTCATCATCGCCAAGATCTTCCGCCTAATCCG 237
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 326 CAACGTCAAGATTACCTCCATCAATACTCTCATCATCGCCAAGATCTTCCGCCCAATACG 385
Query 238 GCGGTTAATCAGCCTTCTTCAAACTACTACCAGCATCATCCGTCACCGCTCCAGCAACAG 297
| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 386 GTGGTTAATCAGCCGACTTCAAACTACTACCAG---CATCCGCCACCGCTCCAGCAACAG 442
Query 298 CATCAGCCACCACCG-TT--GCAGCAGCAGCAGCATCCTCAATACATTCCTCAGCAAGTT 354
|||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 443 CATCAGCCACTATCGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCATCCTCAATACATTCCTCAGCAGGTT 502
Query 355 AGTTACGAGCCTCAAAGAATATCGCAGCCGTTGTCATCGAGTATTCAATGTAAAGAATCC 414
||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |
Sbjct 503 AGTTATGAGCCTCAAAGAATATCACAGCCGTTGACATCGAGTATTCAATGT-----A--C 555
Query 415 AGAGTTATAGCTCAATCTGATTGGGTTGGGTTCAATGAAAAGCGACTTGATTCATGGACA 474
| | | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 556 -G-G--A-ATCTCAGTCTGATTGGGTTGGGTTCAATGAAAAGCGGCTTGATTCATGGACA 610
Query 475 GGGGATGCTGCTCCGGGTCG-A--C---TTGATTCTGGTCCAAGCCGTAACTATCAGTAT 528
| |||| | | ||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 GTGGATTCAGGTCCGGGTCGAAGCCGAGTGGATGATGGTCCAAGCCGTAACTATCAGTAT 670
Query 529 GACTACAGCCGTAACTTGTCGAGGGAGTCTTCGGGTGTTAATCGTGGTTTAGATGGTAGT 588
||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 GACTACAGCCGTAAC---TC------G---TCGGGTGTTAATCGTGGTTTAGATGGTAGT 718
Query 589 TCTAGGTCTAGAGATGAGTTTCGTAATCTTGGATATGCTAGAAAAGAATCTGGAGCCACT 648
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 719 TCTAGGTCTAGAGATGAGTTTCGTAGTCTTGGATATGCTAGAAAAGAATCTGGAGTCACT 778
Query 649 AGGACAGAGGGGAATTATCAAGCCCGTGGTCAGTTAAAATCAGAATCCGATAGATTTGTT 708
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 779 AGAACAGAGGGGAATTATCAAGCCCGTGGTCAGTTAAAATCAGAATCCGATAGATATGTT 838
Query 709 AGGGGTTTAGATGAGGGAAATAGGGTTTTATCTTCTAGTGTTGGTTATGGCAGTGACAGA 768
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AGGGGTTTAGGTGATGGAAATAGGGTTTTATCCTCTAGTGTTGGTTATGGCAGTGACAGA 898
Query 769 TATGGTCTTACAGTAAGTCGAGATGTGACTAGGTCATCAGCAAGCCGTGAAGGGGCTAGA 828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TATGGTCTTACAGTAAGTCGAGATGTGACTAGGTCATCAGCAAGCCGTGAAGGGGCT--- 955
Query 829 AACCAGAGGTGGGATGAAGCACGTAATGAAGGGAGGACTCTCCATCCCCAGAAAAAAGAT 888
||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||
Sbjct 956 ----AGA-----GA--AA-CACGTAATGAAGGGAGGACTCTCTATCCCGAGAAAAAGGAT 1003
Query 889 GATTACTATCATTCTGAGATTGAACAATATTTTGATCGTGGAAGGAGAGAGGAGATCAGT 948
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
Sbjct 1004 GATTACTATCATTCTGAGATTGAACAATATTTTGATCGTGGAAGGAGAGAGGCGAGCAAT 1063
Query 949 CAGTTGAATCGAACACCTAGGAAACAAATCCAGAAGAAGAGTGCTCTGCTAAGGCTTGAA 1008
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 GAGTTGAATCGAACACCTAGGAAACAAGTTCAGAAGAAGAGTGCTCTGCTAAGGCTTGAA 1123
Query 1009 ACTCCAAGATCCTATCAAAACAGTAGAGAGAATGATTGGTCTCGGCAACATAATCATC-- 1066
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 ACTCCAAGATCCTATAAAAACAGTAGAGAGAATGAATGGTCTCGGCAACATAATCATCAT 1183
Query 1067 -A---CAATGGGAAAAGG-TTATACTCTAACTCATACAGGGGTAAGGAACACTTGGGTCA 1121
| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 AATGGTAATGGGAAAAGGTTTA-ACTCTAACTCATATAGGGGTAAGGAACACTTGGGTCA 1242
Query 1122 TTCTGATCGTGGACTGGTGGAGAAGCAAAGGGGGAGAAGTCCAGTGGATCTTGATATATC 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 TTCTGATCGTGGACTGGTGGAGAAGCAAAGGGGGAGAAGTCCAGTGGATCTTGATATATC 1302
Query 1182 ATTTAAATCGAATGCTCTGGTAGCTAAGCCCGTAGCATCACCTACAAGTGCAGGTATCCG 1241
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1303 ATTTAAATCGAATGTTCTGGTAGCTAAGCCCGTAGCATCACCTACAAGTGCAGGCATCCG 1362
Query 1242 TTCGGGCGCGTCTGTGACACCTAGGTCTATTAAAGCTAGAAGAGCATTGCTTTCTGATAA 1301
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1363 TTCGGGTGCGTCTGTGACACCTAGGTCTATTAAAGCTAGAAGAGCTTTGCTTTCTGATAA 1422
Query 1302 AAATGAGAAAGCTTCAGTAACTGAAAGAAATGGAAAGCTGGGAACCCAGTTGTCATTTGA 1361
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1423 AAATGAGAAAGTTTCAGTAACTGAAAGAAATGGAAAGCTGGGAACCCATTTGTCAGATGA 1482
Query 1362 GGAGGTTTCGGTTTCTGAGGGCTTCAGACGGTCTACAAGGCAAACTACTGCATCT----- 1416
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 G-A--TTTCGGTTTCTGAGGGCTTCAGACGGTCTACAAGGCAAACTACTGCATCTAAAAA 1539
Query 1417 -GAAAAACAACCTGACAGTCACTCAACCCCGTCTTCCAGTGATTCCGGTGGCAAGCTAAA 1475
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1540 TGAAAAAGAACCTGACAGTCACTCAACCCCGTCTTCCAGTGATTCTGGTGGTAAGCTAAA 1599
Query 1476 CAAGGT-C-A---G--A-T--T-T-GTTCAGGACAGCAAAGTCAAACTTACTGATACAGG 1523
|||||| | | | | | | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1600 CAAGGTACGATTTGTTAATGGTGTCGTTCAGGACAGCAAAGTCAAACTTACCGATTCAGG 1659
Query 1524 TCCTGAAGCTTCAACTCATGAT 1545
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 TCCTGAAGCTTCAACTCATGAT 1681
Score = 1530 bits (828), Expect = 0.0
Identities = 876/900 (97%), Gaps = 0/900 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5500 GATGTTGATCCACCGTGCTCTGGACCTTCTGAAAATGGGAAGGGTGTGAAAATACCGATT 5559
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||
Sbjct 5750 GATGTTGATTCACCGTGCTCTGGACCTTCTGAAAATGGAAAGGGTGTGAAAAGACCGTTT 5809
Query 5560 ATCCCAAAGAGATTGGTGATCGGCAATGAAGAATATGTTCGGTTCGGAAATGGTAACCAG 5619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5810 ATCCCAAAGAGATTGGTGATCGGCAATGAAGAATATGTTCGGTTCGGGAATGGTAACCAG 5869
Query 5620 CTTGTCAGAGATCCAAAGAAACGAACTCGTGTGTTGGCAAATGAGAAAGTGAGATGGAGC 5679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5870 CTTGTCAGAGATCCAAAGAAACGAACTCGTGTGTTGGCAAATGAGAAAGTCAGATGGAGC 5929
Query 5680 CTGCACAATGTCCGGTTGCGGTTGGCTAAAAAGAAGAAGTACTGCCAGTTTTTCACAAGA 5739
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5930 CTGCACAATGCCCGGTTGCGGTTGGCTAAAAAGAAGAAGTACTGCCAGTTTTTCACAAGA 5989
Query 5740 TTTGGGAAATGCAACAAAGATGACGGAAAATGTCCCTATGTTCATGACCCCTCGAAAATT 5799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5990 TTTGGGAAATGCAACAAAGATGACGGAAAATGTCCCTATGTTCATGATCCCTCGAAAATT 6049
Query 5800 GCTGTTTGCACCAAATTTTTGAATGGATTGTGTGCCAATGCAAATTGCAAATTGACTCAC 5859
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6050 GCTGTTTGCACCAAATTTTTGAATGGATTGTGTGCAAATGCAAATTGCAAATTGACTCAC 6109
Query 5860 AAGGTCATTCCAGAAAGGATGCCTGATTGTTCTTATTATCTGCAAGGCCTATGCAACAAT 5919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6110 AAGGTCATTCCAGAAAGGATGCCTGATTGTTCTTATTATCTGCAAGGCCTATGCAACAAT 6169
Query 5920 GAGGCATGTCCATATAGGCATGTGCATGTCAATCCGAGCGCCCCTATATGTGATGGGTTT 5979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6170 GAGGCATGTCCATATAGGCATGTGCATGTCAATCCGATCGCCCCTATATGTGATGGGTTT 6229
Query 5980 TTAAAGGGATACTGTTCCGACGGAGACGAGTGTCGGAAGAAGCATTCCTACAACTGCCCG 6039
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6230 TTAAAGGGATACTGTTCCGAAGGAGACGAGTGTCGGAAGAAGCATTCCTACAACTGCCCG 6289
Query 6040 GTTTTCGAAGCCACTGGATCATGCTCTCAAGGATCAAAATGCAAGCTCCACCACCCCAAG 6099
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6290 GTTTTCGAAGCCACTGGATCATGCTCTCAAGGATTGAAATGCAAGCTCCACCACCCCAAG 6349
Query 6100 AACCAAAGCAAAGGAAGAAAGAGAAAAAGACCAAGCGAACCATCACAGAAAAATGCCCGT 6159
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6350 AACCAAAGCAAAGGAAGAAAGAGAAAAAGAACAAACGAACCATCACAGAAAAATGCCCGT 6409
Query 6160 GGGCGTTACTTTAGTTCACTTCACAACATCCTTTCCGAGTCTGAGCCAATGGTATTCAAT 6219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6410 AGGCGTTACTTTAGTTCACTTCACAACATCCTTTCCGAGTCTGAGCCAATGGTATTCAAT 6469
Query 6220 AGGCGTTCTACTGACAGTGAAGTTTTTGGAATGGAAGGCCTCGATTTTATAACCCTTGGC 6279
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6470 AGGCGTTCTACTGACAGTGAAGTTTTTGGAATGGAAAGCCTCGATTTTATAACCCTTGGC 6529
Query 6280 ACTACTGAGTATGAAGCCAGTGATGACAATGATCCAGCCACCGTGCAATCTATCTCCAGT 6339
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6530 ACTGCTGAGTATGAAGCCGGTGATGACAATGATCCAGCCACCGTGCAATCTATCTCCAGT 6589
Query 6340 GACAGCGAATCACCGATTTCAATATACAATCTAATCACACCAGTAGCTCTAATGCAGTAA 6399
||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6590 GACAGTGAATCACTAATCTCAATATACAATCTAATCACACCAGTAGCTCTGATGCAGTAA 6649
Score = 878 bits (475), Expect = 0.0
Identities = 571/615 (93%), Gaps = 16/615 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1573 CATGCTGCAGAAAAGATCTCTAGTTTTTGTGAGACTTTGAAAGAGGCCAAGGATGACATT 1632
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1676 CATGATACAGAAAAGATCTCTAGTTTTTGTGAGACTTTGATAGAGGCCAAGGATGACATT 1735
Query 1633 AATGTCAAACATGGTAGCAATATGGAGGCTTGCTCCACTGAGGAAGGTGTTATTGATGGA 1692
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 AATGTCAAACATGGTATCAATACGGAGGCTTGCTCCACTGAGGAAGGTGTTATTGATGGA 1795
Query 1693 AACCAAAGTACACTGAAGTCTCATGAAGATGTGTTGGACAGAACGAGCACTGATTGTAAT 1752
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 AATCAAAGTACACTGAAGTCTCATGAAGATGTGTTGGACAGAACGAGCACTGATTGTAAT 1855
Query 1753 GCGGGCGAAGCGCTTATGCCGAAGGTCATGGAGATGGATGAAATCGTGAAGACAAAGGCA 1812
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1856 GCAGGCGAAGCGCTTTTGCCGAAGGTCATGGAGATGGATGAAATCCTGAAGACAAAGACA 1915
Query 1813 AAAATCAATATATCTCCTGGTAAATTACCTGTATCATGGCCAACAGCCGATGATCTTTCT 1872
| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||
Sbjct 1916 ACAATCAATACGTCTCCTGGTAAGTTACCTGTATCATGGCCAACCGTCGCTGATCTTTCT 1975
Query 1873 GGGTGTTCTGAGGACATGGATTGTGA--AG-AT--G-AC-G--A------CATGGATTGT 1917
|||||||||||||||||||||||||| || || | | | | ||||||||||
Sbjct 1976 GGGTGTTCTGAGGACATGGATTGTGATGAGGATATGGATTGTGATGAGGACATGGATTGT 2035
Query 1918 ATACCATCAAGGAATATACCAATGATGGAAGTAAGTACTGGGTTTGAAGAAAGAAAATTC 1977
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2036 ATACCATCAAGGAATATACCAATGATGGAAGTAAATACTGGGTTTGAAGAAAGAAAATCC 2095
Query 1978 ATTAATTCATCTGATGGATCTTTGGGTTACGGAGGAAAGGATTTTCAGAAGTTATGTCTA 2037
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2096 ATTAATTCATCTGATGGATCTTTGGGTTATGGAGGAAAGGATTTTCAGAAGCCATATCTA 2155
Query 2038 GATGCATCCATCTATTTTAATAGAGAAGACCCTGGTGATAAGGTGTTGGCGAAGTCAGAT 2097
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 GATGCTTCCATCTATTTTAATAGAGAAGACCCTGGTGATAAGGTGTTGGCGAAGTCAGAT 2215
Query 2098 ATCGGTGGTATTGAAGATGACAACAAGAGGATTAATAAGAATCTAGATTCCTTGTCTCCT 2157
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2216 ATCGGTGGTATTGAAGATGACAACAAGAGGATTGATAAGAATGTAGATTCCTTGTCTCCT 2275
Query 2158 GAAAATGCCTC-TCT 2171
||||||| ||| |||
Sbjct 2276 GAAAATGACTCCTCT 2290
Score = 300 bits (162), Expect = 1e-79
Identities = 170/174 (98%), Gaps = 0/174 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5278 AGGAGGCCACATTGGCTGTGGCTGCATTCTCAAAGAAAGAAAGTGAAAAGCATTCTGGAC 5337
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5577 AGGAGGCCACATTGGCTGTGGCTGCATACTCAAAGAAAGAAAGTGAAAAGCAATCTGGAC 5636
Query 5338 AAAATAATAATAGTATGGCGAGCAGAAACCATCTGGCACGGGAGCGCGTTTTCAGGTTTG 5397
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5637 AAAATAATACTAGTACGGCGAGCAGAAACCATCTGGCACGGGAGCGCGTTTTCAGGTTTG 5696
Query 5398 GTTCCCTTCGTTATAAAATGGACTCTTCAAGACGAACTCTTCAGAGAATATCTG 5451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5697 GTTCCCTTCGTTATAAAATGGACTCTTCAAGACGAACTCTTCAGAGAATATCTG 5750
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 319399515511
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5