BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg313056
Length=4740
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G21650.3 | Symbols: SECA2 | Preprotein translocase SecA fami... 4294 0.0
AT1G21651.1 | Symbols: | zinc ion binding | chr1:7600805-76042... 2416 0.0
> AT1G21650.3 | Symbols: SECA2 | Preprotein translocase SecA family
protein | chr1:7592854-7604229 REVERSE LENGTH=5532
Length=5532
Score = 4294 bits (2325), Expect = 0.0
Identities = 2543/2643 (96%), Gaps = 35/2643 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2129 AGGGGAATTTGGGTCGTTTAAAGAGGAATATACAGGATTTTACGAGCATGAATTATTGGG 2188
||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 AGGGGAATTTGGGTCGTTTGAAGAGGAATGTACAAGATTTTACGAGCATGAATTATTGGG 2550
Query 2189 TTGTGCGGGACTACTATCGTCTTGTGGAATCCGTCAATTCCCTTGAGCCACAGATGCAAA 2248
|||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2551 TTGTCCGGGACTACTACCGTCTGGTGGAATCTGTCAATTCCCTTGAACCACAGATTCAAA 2610
Query 2249 GCCTTTCCGATG---A-G-----C--AG-CTGAAAGCTAAAACTGCAGAATTTCGAGAAA 2296
|||||||||||| | | | || ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2611 GCCTTTCCGATGAACAGGTTAAACTTAGTCTGAAAGCTAAAACTGCTGAATTTCGAGAAA 2670
Query 2297 GATTAGCACGAGGGGAGTCCCTAGCAGATATGCAAGCTGAGGCATTTGCTGTTGTCCGTG 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 GATTAGCACGAGGGGAGTCCCTAGCAGATATGCAAGCTGAGGCATTTGCTGTTGTCCGTG 2730
Query 2357 AAGCTGCTAAGAGAACAATTGGAATGCGTCATTTTGACGTGCAGATAATTGGTGGAGGAG 2416
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2731 AAGCTGCAAAGAGAACAATTGGAATGCGTCATTTTGACGTGCAGATAATTGGTGGAGGAG 2790
Query 2417 TGCTTCACGATGGATCCATTGCGGAGATGAAGACTGGTGAAGGGAAGACGCTAGTCTCCA 2476
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |
Sbjct 2791 TGCTTCATGATGGATCCATTGCGGAGATGAAGACAGGTGAAGGGAAAACACTAGTTTCTA 2850
Query 2477 CCTTAGCTGCATATCTTAATGCATTAACTGGTGAAGGCGTTCATGTGGTTACCGTGAATG 2536
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2851 CCTTAGCTGCATATCTTAATGCATTAACTGGTGAGGGCGTTCATGTGGTTACTGTGAATG 2910
Query 2537 ATTACCTGGCCCAGCGTGATGCTGAATGGATGGGTCGTGTTCACCGCTTCTTAGGCCTTT 2596
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2911 ATTACCTGGCACAGCGTGATGCTGAATGGATGGGTCGTGTTCACCGCTTCTTAGGCCTTT 2970
Query 2597 CAGTTGGTCTCATTCAGAGAGGGATGAAAGCTGAAGAGAGAAAATTCAACTATAGCTCTG 2656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2971 CAGTTGGTCTCATTCAGAGAGGGATGAAAGCTGAAGAGAGAAAATTCAACTATAGCTGTG 3030
Query 2657 ATATAACATACACCAATAACTCGGAGCTTGGATTTGATTATCTACGAGATAACCTTACTT 2716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 ATATAACATACACCAATAACTCGGAGCTTGGATTTGATTATCTACGAGATAACCTTACTT 3090
Query 2717 CAAACCGTGAACAACTTGTTATGAGATGGCCAAAACCATTTCACTTTGCAATAGTTGATG 2776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3091 CAAACCGTGAACAACTTGTTATGAGATGGCCAAAACCATTTCACTTTGCAATAGTTGATG 3150
Query 2777 AAGTGGATTCAGTCCTCATTGATGAAGGCAGAAATCCTTTGCTAATAAGTGGTGAGGCTA 2836
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3151 AAGTGGACTCAGTCCTCATTGATGAAGGCAGAAATCCTTTGCTAATTAGTGGTGAGGCTA 3210
Query 2837 ACGAAAATGCCGCACGATATCCAGTTGCTGCTAAAGTGGCGGAACTTCTCGTAAAGGATA 2896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3211 ACGAAAATGCCGCACGATATCCAGTTGCTGCTAAAGTGGCTGAACTTCTCGTAAAGGATA 3270
Query 2897 GTCATTACAAAGTTGAACTGAAAGAAAACTCAGTGGAACTCACAGAAGAAGGCATATCTC 2956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3271 GTCATTACAAAGTTGAACTGAAAGAAAACTCAGTGGAACTCACAGAAGAAGGCATATCTC 3330
Query 2957 TTGCTGAAATGGCTCTTGAGACGAGTGATTTATGGGATGAAAATGATCCATGGACAAGGT 3016
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3331 TTGCTGAAATGGCTCTTGAGACGGGTGATTTATGGGACGAAAATGATCCATGGGCAAGGT 3390
Query 3017 TTGTTATGAATGCTTTAAAAGCTAAAGAATTTTACAAGCGGGATGTCCAATATATTGTGA 3076
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3391 TTGTTATGAATGCTTTGAAAGCTAAAGAATTTTACAAGCGGGATGTCCAATATATTGTGA 3450
Query 3077 GAGATGGGAAAGCACTTATAATCAATGAGTTGACTGGAAGAGTTGAAGACAAAAGGAGAT 3136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451 GAGATGGGAAAGCACTTATAATCAATGAGTTGACTGGAAGAGTTGAAGACAAAAGGAGAT 3510
Query 3137 GGTCTGAAGGAGTTCACCAGGCTGTGGAGGCTAAAGAAGGTCTAGAAATTCAGGCTGATT 3196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3511 GGTCTGAAGGAGTTCACCAGGCTGTGGAGGCTAAAGAAGGTCTAGAAATTCAGGCTGATT 3570
Query 3197 CAATTGTTGTGGCTCAAATCACCTATCAATCACTCTTTAAACTCTACCCAAAGCTCTCCG 3256
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3571 CAATTGTTGTGGCTCAAATCACCTATCAGTCGCTCTTTAAACTCTATCCAAAGCTCTCCG 3630
Query 3257 GGATGACTGGGACAGCCAAAACAGAAGAAAAAGAATTTTTGAAGATGTTTCAGATACCTG 3316
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3631 GGATGACTGGGACAGCAAAAACAGAAGAAAAAGAATTTTTGAAAATGTTTCAGATACCTG 3690
Query 3317 TTATTGAAGTTCCTACAAATTTGTCAAATATTCGAATCGATCTACCAATACAAGCTTTCG 3376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3691 TTATTGAAGTTCCTACAAATTTGTCAAATATTCGAATCGATCTACCAATACAAGCTTTCG 3750
Query 3377 CTACTGCTCGGGGTAAATGGGAACATGTTCGTCGAGAAGTTGAAGATATGTTTGGACAAG 3436
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3751 CGACTGCTCGGGGTAAATGGGAACATGTTCGTCGAGAAGTTGAAGATATGTTTGGACAAG 3810
Query 3437 GTCGACCTGTTTTAGTAGGAACAACAAGTGTAGAGAATTCTGAATATTTATCAGAACTGC 3496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3811 GTCGACCTGTTTTAGTAGGAACAACAAGTGTAGAGAATTCTGAATATTTATCAGAACTGC 3870
Query 3497 TGAAAGAATGGGGTATACCTCACAATGTCCTGAATGCACGACCCAAGTATGCTGCCAGGG 3556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3871 TGAAAGAATGGGGTATACCTCACAATGTCCTGAATGCACGACCCAAGTATGCTGCCAGGG 3930
Query 3557 AAGCTGATTTTATAGCCCAAGCAGGAAGAAAATATGCCATCACCATTTCTACAAATATGG 3616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3931 AAGCTGATTTTATAGCCCAAGCAGGAAGAAAATATGCCATCACCATTTCCACAAATATGG 3990
Query 3617 CTGGTAGGGGTACTGACATTATTCTGGGAGGAAATCCGAAGATGCTTGCAAGGGAAATCA 3676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3991 CTGGTAGGGGTACTGACATTATTCTGGGAGGAAATCCGAAGATGCTTGCAAGGGAAATCA 4050
Query 3677 TAGAAGATAGCATCCTTTCATATCTAACGAGTGAAGTTTTGGCTGATAATATTGACGACA 3736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4051 TAGAAGATAGCATCCTTTCATATCTAACGAGTGAAGTTTTGGCTGATAATATTGACGATG 4110
Query 3737 ATGAGTTATCACAGAAGGTGTTGTCAAAAATAAAAGTGGGACCATCGTCCTTAGCTTTGC 3796
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4111 ATGAGTTATCACAGAAGGTATTGTCAAAAATAAAAGTAGGACCATCGTCATTAGCTTTGC 4170
Query 3797 TAGCCAGAGCTTCTCTTATGGCAAAATATGTTGGCAAAAGTGAAAGTAAGAGCTGGACAA 3856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4171 TAGCCAGAGCTTCTCTTATGGCAAAATATGTTGGCAAAAGTGAAAGTAAGAGCTGGACAA 4230
Query 3857 GGAAAAAAGCAAAGTCCGTGGTCACAGAATCTTTGGAGAAAAGCCAGACCATGGATCCTA 3916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4231 GGAAAAAAGCAAAGTCCGTGGTCACAGAATCTTTGGAGAAAAGCCAGACCATGGATCCTA 4290
Query 3917 TGAAACTGCAGAATCTTGTCAATGAGCAGTCAGAAATGTACCCATTAGGCCCTGCTATTG 3976
|| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4291 TGGAACTGCAGAATCTTATCAATGAGCAGTCAGAGATGTACCCATTAGGCCCTGCTATTG 4350
Query 3977 CTCTGGCTTATCTGTCCGTCTTAAAGGACTGTGAGGCCCATTGTCTGCATGAAGGATCTG 4036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4351 CTCTGGCTTATCTGTCCGTCTTAAAGGACTGTGAGGCCCATTGTCTGCATGAAGGGTCTG 4410
Query 4037 AAGTGAAGAGGCTTGGAGGCCTTCATGTAATTGGGACTTCTTTGCATGAGTCTCGGAGGA 4096
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 4411 AAGTGAAGAGGCTTGGAGGCCTTCATGTGATTGGGACTTCATTGCATGAGTCTCGGAGAA 4470
Query 4097 TTGATAACCAGCTTCGTGGCAGAGCTGGAAGGCAAGGAGATCCTGGATCCACGCGGTTTA 4156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4471 TTGATAACCAGCTTCGTGGCAGAGCTGGAAGGCAAGGAGATCCTGGATCCACGCGGTTTA 4530
Query 4157 TGATAAGCTTGCAAGATGAGATGTTTCAGAAGTTTAATTTTGACACTGAGTGGGCTGTGA 4216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4531 TGATAAGCTTGCAAGATGAGATGTTTCAGAAGTTTAATTTTGATACTGAGTGGGCTGTGA 4590
Query 4217 GACTTATATCAAAGATTACAAACGATGAAGACTTACCAATTGAAGGTGACACAATAGTAA 4276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4591 GACTTATATCAAAGATTACAAACGATGAAGACTTACCAATTGAAGGTGACACAATAGTAA 4650
Query 4277 AACAGCTTCTAGCTCTCCAGATCAACGCAGAGAAATACTTCTTTGGAATAAGAAAAAGCC 4336
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4651 AACAGCTTCTAGCTCTCCAGATCAACGCAGAGAAATACTTCTTTGGCATAAGAAAAAGCC 4710
Query 4337 TGGTCGAGTTTGACGAAGTGCTAGAGGTTCAAAGGAAGCATGTCTATGACCTAAGGCAAC 4396
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4711 TGGTCGAGTTTGACGAAGTGCTAGAGGTTCAAAGGAAGCATGTCTATGACTTAAGGCAAC 4770
Query 4397 TGCTTTTGACGGGTGAAAACGAAAGTTGCTCTCAGCATATATTCCAGTACATGCAAGCTG 4456
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4771 TGCTGTTGACGGGTGAAAACGAAAGTTGCTCTCAGCATATATTCCAGTACATGCAAGCTG 4830
Query 4457 TTGTAGATGAAATCGTCGTTGGAAATGCTAATCCACAGAAGCATCCAAGATACTGGAGCT 4516
|||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4831 TTGTAGATGAAATCGTTGTTGGGAATTCTAATCCGCAGAAGCATCCAAGATACTGGAGCT 4890
Query 4517 TGGCCAAGCTATTGAAAGAGTTTATGGCTATTTCGGGAAACCTACTGGATGA---A---- 4569
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4891 TGGCCAAGTTATTGAAAGAGTTCATGGCTATTTCGGGAAACCTACTGGATGAGTCATTTT 4950
Query 4570 --G--A--A-A-------CCATGTTACAGTCCCTTGAAAACCTGCATGAGAGGAT-TTCA 4614
| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 4951 CTGGGATCACAGAAGAGACCATGTTACAGTCCCTTGAAAACCTGCATGAG-GGAAGTTCA 5009
Query 4615 ATAGATATGGAAGACTTGTACCTTCCGCACCTGCCAAAACCTCCTAACGCTTTCAGGGGA 4674
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 5010 ATAGAAATGGAAGACTTGTCCCTTCCGCACCTGCCAAAACCTCCAAACGCTTTCAGAGGA 5069
Query 4675 ATCCGCAGAAAGAATTCTTCACTAAGACGTTGGCTTGATATCTGCTCAGATAATTTGACG 4734
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5070 ATTCGCAGGAAGAATTCTTCACTAAGACGTTGGCTTGATATCTGCTCCGATAATTTGACG 5129
Query 4735 GGG 4737
|||
Sbjct 5130 GGG 5132
Score = 2416 bits (1308), Expect = 0.0
Identities = 1509/1607 (94%), Gaps = 10/1607 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGCACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTTCGACGGCGAGTCTACAGTCCCG 60
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 78 ATGGAGGAACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTACGACGGCGAGTCTACTGTCCCG 137
Query 61 CGTGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACGAATCTACCCAAGAAG 120
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 138 CGCGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACAAATCTACCCAAGAAG 197
Query 121 TTTCCGAACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCTCCTCAAGGA 180
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 198 TTTCCGGACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCACCTCAAGGA 257
Query 181 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATCGATCTTCTCAGATTTTTCCCTTCTATTTCGAAGATT 240
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||
Sbjct 258 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATTGATCTTCTCAGATTGTTCCCTTCGATTTCGAAGCTT 317
Query 241 AAGCTGGAACCTGGTCGGAATTGTAAAAAAGCCGTTGAATTTGTCATTCGATCATGGTCC 300
|||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 318 AAGCTGGAACCTGGCCGGAATTTTGAAAAAGTCGTTGAATTTGTCACTCGATCATGGTCC 377
Query 301 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATCCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 360
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATTCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 437
Query 361 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGCTTCAGCTTCGCTTTTATGTGGAAGTCTGAGG 420
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 438 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGATTCATCTTCGCGTTTATGTGGAAGTCTGAGG 497
Query 421 GATGATTTGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGATGATTGTGATTCT 480
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 498 GATGATTCGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGGTGATTGTGATTCT 557
Query 481 GTTCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGGATGAGAGAGGAG 540
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 558 GTCCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGTATGCGAGAGGAG 617
Query 541 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAAAGAGGTGTTTCTATAGTTTTT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 618 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAGAGAGGTGTTTCTAAAGTTTTT 677
Query 601 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAGAAGCTCACTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 678 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAAAAGCTCATTGGA 737
Query 661 CTTTT-GTT---GGAGTTTGATAGCCTCACTGAAGATTATACTTCGCGTTTAGCAATAAT 716
|||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||| ||||||
Sbjct 738 -TTTTCGTTGGAGGAGTTTGATAGCCT--C-GAAGATGAGACTTTACGTTTAGGAATAAT 793
Query 717 TGGCATGCAAATATGTGAGGCACTACTCAATTTGCACAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 776
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 TGGTATGCAAATATGTGAGGCACTACTTAATTTGCATAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 853
Query 777 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 913
Query 837 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCAAATTATCGCCGAAGAAACTAGCTCTTTTAG 896
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 914 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCGAATTATCGCTGAAGAAACTAGCTCTTTGAG 973
Query 897 CAAACCAGTTGGGGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTGGTTGGATTACTACAAAAGGGGAt 956
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||
Sbjct 974 AAAACCAGTTGGTGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTTGTTGGGTTACAACAGAAGGGGAT 1033
Query 957 tttt-ttGAGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTGTTGAAAGAACGGAATATGTTGATAAAAG 1015
|||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1034 TTTTATT-AGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTTTTGAAAGAACAGAATATGTTAATAAAAA 1092
Query 1016 ATTCCGGCTCAAAGTCGTTGGTTTCATATAACTCTGATGTTTGGCCAGTTTGTTTTCTTG 1075
|| || ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1093 ATACCAGCTCAAAATCTTTTGTTTCACATAACTCTGATGTTTGGCCAGTGTGTTTTCTTC 1152
Query 1076 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTTTATGGAGGAGCTTATTGAAAGTGTAAATTGTG 1135
||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1153 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTGTACCGAGGAGTTTATTGAAAGTGTGAATTGTG 1212
Query 1136 TGGATGCAAAAGGATGTGAAGAGGGTATTGAGGATCTCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1195
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 TGGATGGAAAAGGCTGTGAAGAGGGTATTGAGGATATCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1272
Query 1196 CGGAGAAAGTAAGTCTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAAACGATGGTTGAAATTC 1255
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1273 CGGAGAAACTAAGTTTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAATCGATGGTTGAAATTC 1332
Query 1256 TTCGCCAATGTTGCTGTCTTAATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1315
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTCGTCAATGTTGCTGTCTTGATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1392
Query 1316 GCATCAGGGAGCTGGTGGTGAAACCTAGGTTTAATTCTATGAGTGGATTGCATAAGACGA 1375
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1393 GCATCAGGGAGCTGGTCATGAAACCTAGGTTCAATTCTATGAGTAGATTGCATAAGACGA 1452
Query 1376 TTTCTGGGAAAAGGAAAGAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGTCGGGTAGAAG 1435
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1453 TTTATGGGAAAAGGAAACAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGCCTGGTAGAAG 1512
Query 1436 TGGAATCCAAAGAACTGGACGAAGAGTTGCCTGGAATGAAAACTGGCGATGAAGCAGAGG 1495
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1513 TGGAATCCAAAGAAGTGGACAAAGAGTTGCCTGGAATGAAAATTGGCGATGAAGCAGAGG 1572
Query 1496 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTGCTAGGAGACTCTCAGAAGGAAAGGTGAAATCTAAAG 1555
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1573 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTCCGGGGAGAGTCTCAGAAGGAAAGGTGAGATCTAAAG 1632
Query 1556 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCGGTTGGAGGT 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1633 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCCGTTGGAGGT 1679
Score = 701 bits (379), Expect = 0.0
Identities = 401/412 (97%), Gaps = 0/412 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1599 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1819
Query 1659 CAGTGGCGACGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTCCCTCTGAAAGAACA 1718
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1820 TAGTGGCGATGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTTCCTCTGGAAGAACA 1879
Query 1719 GCCACTAAGAAAGTGGTACGAGCCAAAAGACTGGCGTTATACTGGCATTCATGCATTGGC 1778
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880 GCCGCTAAGAAAGTGGTATGAGCCAAAAGACTGGCGATATACTGGCATTCATGCATTGGC 1939
Query 1779 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1999
Query 1839 ACTGCAAGATGGAAGCCTGGTTTGCACTATGAGTGGCCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 1898
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 ACTGCAAGATGGAAGCCTGCTTTGCACTATGAGTGGTCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 2059
Query 1899 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 1958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 2119
Query 1959 TCTAAGTGACCACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGTGAAGAGACTCCAGGTATT 2010
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2120 TCTAAGTGACAACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGGGAAGAGACTCCAGGTATT 2171
Score = 191 bits (103), Expect = 6e-47
Identities = 115/121 (95%), Gaps = 0/121 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2011 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGCAGATACAGAGTGGCGCAATCCTCACC 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2244 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGAAAATACAGAATGGCGCAATCCTCAGC 2303
Query 2071 ATTACCGTGAACGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2130
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304 ATTGCCGTGAATGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2363
Query 2131 G 2131
|
Sbjct 2364 G 2364
> AT1G21651.1 | Symbols: | zinc ion binding | chr1:7600805-7604215
REVERSE LENGTH=2755
Length=2755
Score = 2416 bits (1308), Expect = 0.0
Identities = 1509/1607 (94%), Gaps = 10/1607 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGCACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTTCGACGGCGAGTCTACAGTCCCG 60
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 64 ATGGAGGAACCGGAGTGTCCGGTGTGTCTACAGTCTTACGACGGCGAGTCTACTGTCCCG 123
Query 61 CGTGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACGAATCTACCCAAGAAG 120
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 124 CGCGTACTCGCCTGCGGACACACGGCGTGCGAAGAATGCTTAACAAATCTACCCAAGAAG 183
Query 121 TTTCCGAACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCTCCTCAAGGA 180
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 184 TTTCCGGACACAATCCGATGTCCTGCTTGCACCGTTCTCGTCAAGTTTCCACCTCAAGGA 243
Query 181 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATCGATCTTCTCAGATTTTTCCCTTCTATTTCGAAGATT 240
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||
Sbjct 244 CCATCAGCTCTCCCCAAAAACATTGATCTTCTCAGATTGTTCCCTTCGATTTCGAAGCTT 303
Query 241 AAGCTGGAACCTGGTCGGAATTGTAAAAAAGCCGTTGAATTTGTCATTCGATCATGGTCC 300
|||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 304 AAGCTGGAACCTGGCCGGAATTTTGAAAAAGTCGTTGAATTTGTCACTCGATCATGGTCC 363
Query 301 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATCCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 360
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GACGACTTTTACGCCACTTGGAAGGATCGGATTCTAGTGCACGACGCCGTTTCCGTGGAA 423
Query 361 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGCTTCAGCTTCGCTTTTATGTGGAAGTCTGAGG 420
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 424 ATTAGGGAGAGTGAAAGTAGTGATTTTGATTCATCTTCGCGTTTATGTGGAAGTCTGAGG 483
Query 421 GATGATTTGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGATGATTGTGATTCT 480
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 484 GATGATTCGAAGGTGAGTCTTTTACGGGTTGCTTCGTTCGAGCATGGTGATTGTGATTCT 543
Query 481 GTTCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGGATGAGAGAGGAG 540
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 544 GTCCTCAAGTATAGTTATGTCCAGAGGATGATGAGTTGTCTGTGGGGTATGCGAGAGGAG 603
Query 541 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAAAGAGGTGTTTCTATAGTTTTT 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 604 GAAAGAGATGAGCTTGATGCGATCATCTCTGTTAAACAGAGAGGTGTTTCTAAAGTTTTT 663
Query 601 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAGAAGCTCACTGGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 664 GGCTTGTGGGGTGATTTGAAGAATGGTGTTTTGTATTTAGTGGGTGAAAAGCTCATTGGA 723
Query 661 CTTTT-GTT---GGAGTTTGATAGCCTCACTGAAGATTATACTTCGCGTTTAGCAATAAT 716
|||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||| ||||||
Sbjct 724 -TTTTCGTTGGAGGAGTTTGATAGCCT--C-GAAGATGAGACTTTACGTTTAGGAATAAT 779
Query 717 TGGCATGCAAATATGTGAGGCACTACTCAATTTGCACAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 776
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TGGTATGCAAATATGTGAGGCACTACTTAATTTGCATAAGGAAGGGTTGATCACAGGCTG 839
Query 777 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TTTGAGTGTTTCTTGTGTGAAGTTTGACGAATATGAGAATGCTTATGTTGATTTGATTGA 899
Query 837 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCAAATTATCGCCGAAGAAACTAGCTCTTTTAG 896
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 900 GTTGATTGAAACTGGAAGGAATGTGTATCGAATTATCGCTGAAGAAACTAGCTCTTTGAG 959
Query 897 CAAACCAGTTGGGGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTGGTTGGATTACTACAAAAGGGGAt 956
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||
Sbjct 960 AAAACCAGTTGGTGCTTCGGAAATGGGTTTGATTTTTGTTGGGTTACAACAGAAGGGGAT 1019
Query 957 tttt-ttGAGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTGTTGAAAGAACGGAATATGTTGATAAAAG 1015
|||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1020 TTTTATT-AGCTCAGAGGTGTTGTTTGAATTTTTGAAAGAACAGAATATGTTAATAAAAA 1078
Query 1016 ATTCCGGCTCAAAGTCGTTGGTTTCATATAACTCTGATGTTTGGCCAGTTTGTTTTCTTG 1075
|| || ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1079 ATACCAGCTCAAAATCTTTTGTTTCACATAACTCTGATGTTTGGCCAGTGTGTTTTCTTC 1138
Query 1076 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTTTATGGAGGAGCTTATTGAAAGTGTAAATTGTG 1135
||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1139 TCCTCAAGCTTCGTCTTGGAAAACGGTGTACCGAGGAGTTTATTGAAAGTGTGAATTGTG 1198
Query 1136 TGGATGCAAAAGGATGTGAAGAGGGTATTGAGGATCTCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1195
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TGGATGGAAAAGGCTGTGAAGAGGGTATTGAGGATATCTTGGTGCTATACACAGGTATTA 1258
Query 1196 CGGAGAAAGTAAGTCTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAAACGATGGTTGAAATTC 1255
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGAGAAACTAAGTTTGGAATCTGAACTCCAAGGGAAGTTTAAATCGATGGTTGAAATTC 1318
Query 1256 TTCGCCAATGTTGCTGTCTTAATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1315
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TTCGTCAATGTTGCTGTCTTGATCCTCAGGCACGTCCCGTTTTGACTGATCTATGGAAAT 1378
Query 1316 GCATCAGGGAGCTGGTGGTGAAACCTAGGTTTAATTCTATGAGTGGATTGCATAAGACGA 1375
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1379 GCATCAGGGAGCTGGTCATGAAACCTAGGTTCAATTCTATGAGTAGATTGCATAAGACGA 1438
Query 1376 TTTCTGGGAAAAGGAAAGAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGTCGGGTAGAAG 1435
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1439 TTTATGGGAAAAGGAAACAGTTCTGTTTGGCTCAAAGTGAATTATGTCGCCTGGTAGAAG 1498
Query 1436 TGGAATCCAAAGAACTGGACGAAGAGTTGCCTGGAATGAAAACTGGCGATGAAGCAGAGG 1495
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1499 TGGAATCCAAAGAAGTGGACAAAGAGTTGCCTGGAATGAAAATTGGCGATGAAGCAGAGG 1558
Query 1496 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTGCTAGGAGACTCTCAGAAGGAAAGGTGAAATCTAAAG 1555
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1559 AGGGTAAGGTTGACATAGATTTTCCGGGGAGAGTCTCAGAAGGAAAGGTGAGATCTAAAG 1618
Query 1556 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCGGTTGGAGGT 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1619 ACATGCGGGGACACCAAGACTCTGTCACAGGTTTAGCCGTTGGAGGT 1665
Score = 701 bits (379), Expect = 0.0
Identities = 401/412 (97%), Gaps = 0/412 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1599 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 AGGTCATCAGGATAAAGTAATGGCCTTGATACACATCGAGGGAACAGAACCAGTATGTGT 1805
Query 1659 CAGTGGCGACGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTCCCTCTGAAAGAACA 1718
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1806 TAGTGGCGATGGTGGAGGAGGTATCTTTGTATGGAGCACTACTTTTCCTCTGGAAGAACA 1865
Query 1719 GCCACTAAGAAAGTGGTACGAGCCAAAAGACTGGCGTTATACTGGCATTCATGCATTGGC 1778
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866 GCCGCTAAGAAAGTGGTATGAGCCAAAAGACTGGCGATATACTGGCATTCATGCATTGGC 1925
Query 1779 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 ATACTCAGAATATGGGCATGTGTACACTGGCAGTGGAGATAACACTATCAAAGCTTGGTC 1985
Query 1839 ACTGCAAGATGGAAGCCTGGTTTGCACTATGAGTGGCCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 1898
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 ACTGCAAGATGGAAGCCTGCTTTGCACTATGAGTGGTCATAAATCTGTAGTCTCAACGCT 2045
Query 1899 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 1958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 TGTTGTGGTAAATGGAGTACTATACAGTGGAAGTTGGGATGGAACCGTTCGTTTGTGGAG 2105
Query 1959 TCTAAGTGACCACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGTGAAGAGACTCCAGGTATT 2010
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2106 TCTAAGTGACAACAGTTTGTTGACAGTGTTGGGGGAAGAGACTCCAGGTATT 2157
Score = 191 bits (103), Expect = 6e-47
Identities = 115/121 (95%), Gaps = 0/121 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2011 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGCAGATACAGAGTGGCGCAATCCTCACC 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2230 ATATGGAGGGATGATACATTGATGAAGTCAATGAAAATACAGAATGGCGCAATCCTCAGC 2289
Query 2071 ATTACCGTGAACGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2130
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 ATTGCCGTGAATGGTAAATGGCTATTCACTGGAGGTTGGGACAAAACCATCAATGTACAG 2349
Query 2131 G 2131
|
Sbjct 2350 G 2350
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 236436802359
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5