BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg313679
Length=4488
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G30410.1 | Symbols: ATMRP13, MRP13, ABCC12 | multidrug resis... 6985 0.0
AT1G30420.1 | Symbols: ATMRP12, MRP12, ABCC11 | multidrug resis... 6325 0.0
> AT1G30410.1 | Symbols: ATMRP13, MRP13, ABCC12 | multidrug resistance-associated
protein 13 | chr1:10738805-10747323 FORWARD
LENGTH=4827
Length=4827
Score = 6985 bits (3782), Expect = 0.0
Identities = 4116/4279 (96%), Gaps = 16/4279 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 223 TGTG-TGCTAGGGATATTGGCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTTCTGAGATTGGTCAT 281
|||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 371 TGTGCTTCTGGGGTTATTGGCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTACTGAGATTGGTCAT 430
Query 282 GGGGATTTCACTCTTTGACTTGGATGAA-AACACTGAACTTCCTCCCTTTGAGGTTTCAT 340
||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||
Sbjct 431 GGGGATTTCACTCTTTGACATGGATGAAGAA-ACTGATTTTCCTCCTTTTGAGGTTGCAT 489
Query 341 CTTTAATGGTTGAGGCATTCGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAGCCA 400
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 490 CTTTGATGGTTGAGGCATTCGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAACCA 549
Query 401 AACAATATGTCAAAGAGTTCAGATGGTATGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTG 460
|||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 AACAATATGTCAAAGAGTTCCGGTGGTACGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTG 609
Query 461 CTGATGCTGTGCTGCTGGATCTTGTGTTGCCTTTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCC 520
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CTGATGCTGTGCTGCTGGATCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCC 669
Query 521 TATATCTCTTTATCAGTTCAAGATGTTCCCAGGCTCTTTTTGGAATTCTTCTTCTTATTT 580
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 670 TATATCTCTTTATCAGTTCAAGATGTTCCCAGGCTCTTTTCGGAATTCTTCTTCTTATTT 729
Query 581 ACATTCCGGAACTGGACCCTTATCCGGGTTACCATATTGTAAACGATGAACCGTCAGACA 640
|||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 730 ACATACCGGAACTGGATCCTTATCCAGGTTACCATATTGTAAACAATGAACCGTTAGACA 789
Query 641 ATGTTGAATATGATGCACTTCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 ATGTTGAATATGATGCACTTCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCA 849
Query 701 TATTTTCCAGAATATACTTTGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAAC 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 TATTTTCCAGAATATACTTTGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAAC 909
Query 761 CCATAACAGAGAAGGATGTTTGGCAATTAGACAAATGGGACCAGACAGAAACTCTAATCA 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 910 CCATAACAGAGAAGGATGTTTGGCAATTAGACAAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATCA 969
Query 821 AAAGATTCCAAAGATGTTGGACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCGTGGCTTCTCCGAG 880
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 970 AAAGATTCCAAAGGTGCTGGACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCATGGCTTCTCCGAG 1029
Query 881 CACTAAATAATAGCCTTGGTCGAAGATTCTGGTTGGGTGGTATTTTC-----AA---G-A 931
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |
Sbjct 1030 CACTAAATAATAGCCTTGGTGGAAGATTCTGGTTGGCTGGTATTTTCAAGGTAACTCGTA 1089
Query 932 TTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGGACCGGTTATACTGAGCCATCTATTGCGGTCAA 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 1090 TTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGGACCGGTTATACTGAGCCATTTATTACGGTCAA 1149
Query 992 TGCAAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTGGCTATGTCTATGCTTTCATTATATTCGTTGGGG 1051
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1150 TGCAAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTGGCTATGTCTATGCTTTCATTATATTCGTTGGTG 1209
Query 1052 TGACACTTGGAGTGCTTTGCGAAGCCCAGTACTTTCAGAATGTTTGGCGGGTGGGATTTC 1111
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 TGACACTTGGAGTGCTTTGTGAAGCCCAGTATTTTCAGAATGTTTGGCGGGTGGGATTTC 1269
Query 1112 GGTTGAGATCAACTTTGGTTTCAGCTATATTCCACAAATCGCTAAGACTAACTCATGAAG 1171
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1270 GGTTGAGATCAACTTTGGTTGCAGCTATATTCCACAAATCTTTAAGACTAACTCATGAAG 1329
Query 1172 CTCGCAAGAATTTTGCATCTGGGAAA-GTAACAAACATGATAACTACAGATGCTAATGCA 1230
|||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 CTCGCAAGAATTTTGCATCT-GGAAAGGTCACAAACATGATAACTACAGATGCTAATGCA 1388
Query 1231 CTTCAGCAAATATCACAACAGCTCCATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTG 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 CTTCAGCAAATATCACAACAGCTCCATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTG 1448
Query 1291 TCTATGATTCTTCTCTATCAACAACTAGGAGTTGCTTCGCTTTTCGGTTCATTGATTCTG 1350
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1449 TCTATGATTCTGCTCTATCAGCAACTAGGAGTTGCTTCGCTTTTTGGTTCATTGATTCTG 1508
Query 1351 TTTCTACTAATTCCTCTCCAGACTCTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAAGAA 1410
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 TTTCTCCTAATTCCTCTCCAGACTCTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAAGAA 1568
Query 1411 GGACTCCAGTGGACTGACAAAAGAGTCGGTATCACGAATGAGATATTGTCATCCATGGAT 1470
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1569 GGACTCCAGTGGACTGACAAAAGAGTCGGTATTACGAATGAGATTTTGTCATCCATGGAT 1628
Query 1471 ACTGTAAAATGCTATGCACGGGAGAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAAT 1530
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACTGTGAAATGCTATGCATGGGAGAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAAC 1688
Query 1531 GAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAAAGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTG 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689 GAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAAAGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTG 1748
Query 1591 AATAGCATCCCGGTAGTTGTGACTGTGGTTTCTTTTGGCGTTTTCGTTCTGCTCGGAGGA 1650
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1749 AATAGCATCCCGGTAGTTGTGACTGTGGTTTCATTTGGGGTTTTCGTTCTGCTTGGAGGA 1808
Query 1651 GATTTGACACCAGCAAGAGCATTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTACTTAGATTTCCT 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1809 GATTTGACACCAGCAAGAGCATTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTTCTAAGATTTCCT 1868
Query 1711 CTCAATATGCTACCAAATCTTCTAAGTCAGGTTGTCAATGCAAATGTTTCACTACAACGC 1770
|| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1869 CTTAACATGCTACCAAATCTACTAAGCCAGGTTGTCAACGCAAATGTTTCACTACAACGC 1928
Query 1771 ATTGAGGAACTACTTCTAAGTGAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTTCAACCA 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929 ATTGAGGAACTACTTCTAAGTGAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTTCAACCA 1988
Query 1831 GGAACTCCAGCCATATCAATTAAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGACAACCAAG 1890
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1989 GGAACTCCAGCCATTTCAATTAAGAATGGATACTTTTCATGGGATTCAAAGACTACCAAG 2048
Query 1891 CCCACATTATCCGATATCAATTTGGAGATACCGGTGGGCAGCTTAGTTGCCATTGTAGGT 1950
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2049 CCCACATTATCCGATATCAATTTGGAGATACCCGTGGGCACCTTGGTTGCCATTGTAGGT 2108
Query 1951 GGAACTGGAGAAGGTAAGACTTCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCT 2010
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2109 GGAACTGGAGAAGGTAAGACGTCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCT 2168
Query 2011 GAAACCTCGACCGTTGTTATTAGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCGTGGATC 2070
|||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2169 GAAACCACAAGCGTTGTTATTAGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCGTGGATC 2228
Query 2071 TTTAATGCCACTGTGCGTGAAAACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATAT 2130
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229 TTCAATGCCACTGTGCGTGAAAACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATAT 2288
Query 2131 TGGAGGGCTATTGATGCGACTGCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGTCGTGAT 2190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2289 TGGAGGGCTATTGATGCGACTGCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGCCGTGAT 2348
Query 2191 CTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCA 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2349 CTTACTGAGATTGGAGAACGTGGGGTGAATATTAGCGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTCTCA 2408
Query 2251 ATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTTTGAGTTCA 2310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2409 ATGGCTAGGGCAGTCTACTCAAATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTTTGAGTGCA 2468
Query 2311 TTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGCTAAGGGGG 2370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469 TTAGATGCTCATGTTGCTCACCAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGCTAAGGGGG 2528
Query 2371 AAAACAAGAGTTCTTGTCACAAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATT 2430
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2529 AAAACAAGGGTTCTTGTAACAAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAAAATAATT 2588
Query 2431 TTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAGAGGAGGGAACCTTTACAGAGCTGTCAAAAAGTGGG 2490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2589 TTAGTCTCCGAAGGAATGATTAAAGAGGAGGGAACCTTTGTAGAGCTGTCAAAAAGTGGG 2648
Query 2491 AGTTTGTTCAAGAAACTAATGGAGAATGCTGGAAAAATGGACGCAACCCAAGAGGTCAAT 2550
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2649 ATTTTGTTCAAGAAACTAATGGAGAATGCTGGAAAAATGGATGCAACCCAAGAGGTCAAT 2708
Query 2551 ACAAATGACGAGGACATTTTGAAACTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGA 2610
|||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2709 ACAAATGATGAGAACATTTTGAAGCTGGGTCCTACTGTCACGGTTGATGTGAGTGAAAGA 2768
Query 2611 AATCTTGGCAGTACCAAGCAAGGGAAACGGAGAAGATCTGTGCTTGTAAAGCAAGAAGAA 2670
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2769 AATCTTGGCAGTACCAAGCAAGGGAAACGGAGAAGATCAGTGCTCATAAAGCAAGAAGAA 2828
Query 2671 CGGGAAACTGGCATCATTAGTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAAAGAAGCAGTAGGCGGC 2730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 CGGGAAACTGGCATCATTAGTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAAAGAAGCAGTAGGCGGC 2888
Query 2731 TTATGGGTAGTTATGATTCTATTAGCATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTACGAGTTTCA 2790
||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2889 TTATGGGTAGTTATGATTCTACTGGCATGCTATTTAGCAACTGAAGTTCTCCGAGTTTCA 2948
Query 2791 AGTAGCACATGGTTAAGTATTTGGACTGATCAAAGCACGTCAAAGAGTTATAGCCCCGGT 2850
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2949 AGTAGCACATGGTTAAGTATTTGGACTGATCAAAGTACGTCAAAGAATTATAGTCCCGGT 3008
Query 2851 TTTTACATTGTTGTATATGCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTCACCAAC 2910
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 TTCTACATTGTTGTATATGCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTCACCAAC 3068
Query 2911 TCCTTTTGGCTGATCACATCAAGTTTACATGCCGCCAAAAGACTCCATGACGGGATGCTG 2970
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||
Sbjct 3069 TCTTTTTGGCTGATCACATCAAGTTTGCATGCCGCCAGAAGACTCCATGATGCGATGCTG 3128
Query 2971 AGTTCTATTCTTCGAGCTCCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTGGACGTGTAATA 3030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3129 AGTTCTATTCTTCGAGCTCCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTGGACGTGTAATA 3188
Query 3031 AACAGATTTTCTAAGGATATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACCTAATGAATATG 3090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3189 AACAGATTTTCTAAGGATATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACCTAATGAATATG 3248
Query 3091 TTCATGAACCAGCTATGGCAACTCCTCTCGACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACA 3150
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3249 TTCATGAACCAGCTATGGCAACTCCTCTCAACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACA 3308
Query 3151 ATTTCATTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATTCAGCATATCTCTACTAT 3210
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3309 ATTTCGTTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAGCATATCTCTACTAT 3368
Query 3211 CAGAGCACATCCCGTGAAGTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCACCTATTTATGCT 3270
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3369 CAGAGCACATCTCGTGAAGTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCGCCTATTTATGCT 3428
Query 3271 CAGTTTGGAGAAGCTTTGAATGGTTTGTCAAGTATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGG 3330
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3429 CAGTTTGGAGAAGCTTTAAATGGTTTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGG 3488
Query 3331 ATGGCCAAGATTAATGGAAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTCACTCTTGCAAATACT 3390
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3489 ATGGCCAAGATTAATGGAAAATCCATGGACAATAACATAAGGTTCACTCTTGCAAATACT 3548
Query 3391 AGCTCAAATCGTTGGCTCACTATAAGATTGGAGACTCTTGGGGGTGTGATGATTTGGTTA 3450
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3549 AGTTCCAATCGTTGGCTCACTATAAGATTGGAGACTCTTGGGGGTGTCATGATTTGGTTA 3608
Query 3451 ACTGCAACTTTTGCGGTTCTGCAAAATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGCTTTTGCATCA 3510
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||
Sbjct 3609 ACTGCAACGTTTGCGGTTCTGCAAAATGGTAATACAAATAACCAAGCTGGTTTTGCATCT 3668
Query 3511 ACGATGGGTCTCCTTCTTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTATTAAGTGGTGTTCTA 3570
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3669 ACGATGGGTCTCCTTCTTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTGTTAAGTGGTGTTCTA 3728
Query 3571 AGGCAAGCTAGCAGAGCGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTTGGTAACTACATT 3630
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3729 AGGCAAGCTAGCAGAGCGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTTGGTAACTATATT 3788
Query 3631 GATCTTCCTTCTGAGGCTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCAGTA-GCTGGCTGGCC 3689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||
Sbjct 3789 GATCTTCCTTCTGAGGCTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCTGTATG-TGGCTGGCC 3847
Query 3690 TTCAAGAGGATCAATTAAGTTCGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCCGGGCTTCCTCC 3749
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3848 TTCAGGAGGATCAATTAAGTTTGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCCGGGCTTCCTCC 3907
Query 3750 AGTATTGCATGGGCTGACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGAGTTGTGGGAAG 3809
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3908 AGTGTTGCATGGACTGACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGAGTTGTGGGAAG 3967
Query 3810 AACTGGGGCAGGAAAATCTTCCATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTGGAAGTGGAAAA 3869
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3968 AACTGGGGCAGGAAAATCTTCAATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTGGAAGTGGAAAA 4027
Query 3870 GGGAAGAATTATGATTGATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTAACAGATTTACGCAG 3929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 4028 GGGAAGAATTATGATTGATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTGACAGATGTACGCAG 4087
Query 3930 GGTTCTAAGTATCATACCACAATCTCCTGTTCTTTTCTCAGGGACGGTGAGATTCAATAT 3989
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4088 GGTTCTAAGTATCATACCACAATCTCCAGTTCTTTTCTCAGGGACGGTGAGATTCAACAT 4147
Query 3990 CGATCCATTTAGTGAACATAATGATGCTGACCTCTGGGAAGCTCTACAAAGGGCGCATAT 4049
|||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||
Sbjct 4148 TGATCCATTTAGTGAGCACAATGATGCTGGCCTCTGGGAGGCTCTTCACAGAGCGCATAT 4207
Query 4050 AAAAGATGTCATCAGCAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGA 4109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4208 AAAAGATGTCATCAGCAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTGTGAGGGAGGTGA 4267
Query 4110 GAATTTCAGCGTGGGGCAAAGGCAACTGCTGAGTCTTGCGCGTGCGTTGCTAAGAAGATC 4169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4268 GAATTTCAGCGTGGGGCAAAGGCAACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATTGCTAAGAAGATC 4327
Query 4170 TAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGCAACAGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGAT 4229
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4328 TAAGATCCTTGTTCTCGATGAAGCAACGGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGAT 4387
Query 4230 ACAGAGGACCATTCGGGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTATTGCTCACAGGTT 4289
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4388 ACAGAGGACCATTCGCGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTATTGCTCACAGGTT 4447
Query 4290 GAATACCATCATCGACTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTA 4349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4448 GAATACCATCATCGACTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTA 4507
Query 4350 TGATAGTCCTCAAGAATTGCTATCAAGAGACACAAGCGCCTTCTTTAGTATGGTTCATAG 4409
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4508 TGATAGTCCACAAGAATTGCTATCAAGAGATACAAGCGCCTTCTTTAGGATGGTTCATAG 4567
Query 4410 CACCGGACCAGCAAATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAGGCGAGAGAATGG 4469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4568 CACCGGACCAGCAAATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAGGAGAGAGAATGG 4627
Query 4470 TATGAGTTTGGGTGGATAA 4488
|||||| |||||||||||
Sbjct 4628 AATGAGTGTGGGTGGATAA 4646
Score = 215 bits (116), Expect = 3e-54
Identities = 134/143 (94%), Gaps = 0/143 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTTTGAAGCTTTGAATTGGTATTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 240 ATGGGTTTTGAAGCCTTGAATTGGTACTGCAAGCCAGTTGCAGACGGATTTTGGGAAAAG 299
Query 61 TCAGTGGATGGTGCGTTTGGAGCCTATACGCCGTGTGCCATTGACTCACTTGTGATGCTT 120
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 300 GCAGTGGATGGTGCGTTTGGAGCCTACACGCCTTGTGCCATTGACTCACTAGTGATGCTT 359
Query 121 GTTTCTCACTTTGTGCTTCTGGG 143
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GTTTCTCACTTTGTGCTTCTGGG 382
> AT1G30420.1 | Symbols: ATMRP12, MRP12, ABCC11 | multidrug resistance-associated
protein 12 | chr1:10748816-10756316 FORWARD
LENGTH=4488
Length=4488
Score = 6325 bits (3425), Expect = 0.0
Identities = 4150/4504 (92%), Gaps = 34/4504 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTTTGAAGCTTTGAATTGGTATTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTTTTGAGGCATTGAATTGGTACTGCAAGCCAATTGCAGAAGGATTTTGGGAAAAA 60
Query 61 TCAGTGGATGGTGCGTTTGGAGCCTATACGCCGTGTGCCATTGACTCACTTGTGATGCTT 120
|| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 61 ACACCGGATGGTGCGTTTGGTGCCTACACGCCGTGTGCCATTGACTCACTAGTGATGATT 120
Query 121 GTTTCTCACTTTGTGCTTCTGGGTTTGTGTTTCTACCGGATATGGATCATCTTCCACAAT 180
|||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 121 GTTTCTAACTCTGTACTTCTGGGTTTGTGTTTCTACCGGATATGGATCACCTTGTACAAT 180
Query 181 ACCAAAGCTCAGATTTATGTTTTGAGGAAGAAGTATTATAACTGTGTGCTAGGGATATTG 240
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 181 GCCAAAGCTCAGATTTATGTTTTGAGGAAGATGTACTATCACTGTGTGCTATGGATATTG 240
Query 241 GCTTGTTACTGTGTTGTTGAGCCTGTTCTGAGATTGGTCATGGGGATTTCACTCTTTGAC 300
||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||
Sbjct 241 GCTTGTTGCTGTGTTGTTGAGCCTGTACTGAGATTAGTTATGGGGATTTCGCTTTTTGAC 300
Query 301 TTGGATGA-AAACACTGAACTTCCTCCCTTTGAGGTTTCATCTTTAATGGTTGAGGCATT 359
||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 301 ATGGGTGATGAA-ACTGATCTTCCTCCCTTTGAGGTTGCATCCTTAATGGTTGAGGCATT 359
Query 360 CGCTTGGTTCTCCATGCTTGTTTTGATCGGACTCGAAGCCAAACAATATGTCAAAGAGTT 419
||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TGCTTGGTTCGCCATGCTTGTTTTGATTGGACTTGAAACCAAACAATATGTCAAAGAGTT 419
Query 420 CAGATGGTATGTGAGATTTGGTGTTTTATATGTTTTGGTTGCTGATGCTGTGCTGCTGGA 479
| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 CCGATGGTACGTGAGATTTGGTGTTGTATATGTTTTGGTTGCTGATGCGGTGCTGCTGGA 479
Query 480 TCTTGTGTTGCCTTTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCCTATATCTCTTTATCAGTTC 539
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 480 CCTTGTGTTGCCTCTCAAGAACTCAATCAATAGAACTGCCCTATATCTCTGTATCAGTTC 539
Query 540 AAGATGTTCCCAGGCTCTTTTTGGAATTCTTCTTCTTATTTACATTCCGGAACTGGACCC 599
|||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |
Sbjct 540 AAGATGTTGCCAGGCTCTTTTTGGAATCCTTCTACTTGTTTACATTCCTGAACTGGATCT 599
Query 600 TTATCCGGGTTACCATATTGTAAACGATGAACCGTCAGACAATGTTGAATATGATGCACT 659
|||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TTATCCAGATTACCATATTCTAAACAATGAATCGTTAGACAATGTTGAATATGATGCACT 659
Query 660 TCGAGGGGGAGAGCACATATGTCCCGAGCGACATGCCAGCATATTTTCCAGAATATACTT 719
| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 660 GCCTGGGGGAGTGAACATATGTCCCGAGCGATATGCCAGCATATTTTCTGGAATATACTT 719
Query 720 TGGTTGGATCACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAACCCATAACAGAGAAGGATGT 779
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||
Sbjct 720 TAGTTGGATGACGCCGCTTATGCAGTTAGGCTACAGAAAGCCTATTACTGAGAGGGATGT 779
Query 780 TTGGCAATTAGACAAATGGGACCAGACAGAAACTCTAATCAAAAGATTCCAAAGATGTTG 839
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||
Sbjct 780 TTGGCAATTAGACCAATGGGACCAAACAGAAACTCTGATAAAAAGATTCCAAAGGTGCTG 839
Query 840 GACTGAAGAATCACGGAGACCTAAGCCGTGGCTTCTCCGAGCACTAAATAATAGCCTTGG 899
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GACTGAAGAATCACGGAGGCCTAAGCCATGGCTACTCCGAGCACTAAATAATAGCCTTGG 899
Query 900 TCGAAGATTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAAGATTGGAAATGATCTTTCTCAATTTGTTGG 959
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 900 TCGAAGGTTCTGGTTGGGTGGTATTTTCAAGGTTGGGCATGATCTATCTCAATTTGTTGG 959
Query 960 ACCGGTTATACTGAGCCATCTATTGCGGTCAATGCA-AGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTG 1018
||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACCAGTTATACTGAGCCATATCCTGCAGTCAATG-ATAGAAGGTGATCCAGCTTGGGTTG 1018
Query 1019 GCTATGTCTATGCTTTCATT-ATATTCGTTGGGGTGACACTTGGAGTGCTTTG-CGAAGC 1076
||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||| | || |
Sbjct 1019 GCTATGTCTATGCTTTC-TTAATTTTCTTTGGGGTGACATTTGGAGTGCTTTGTC-AATC 1076
Query 1077 CCAGTACTTTCAGA-ATGTTTGGCGGGTGGGATTTCGGTTGAGATCAACTTTGGTTTCAG 1135
||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1077 TCAGTACTTTCA-ACATGTTGGGCGAGTGGGATTTCGGTTGAGGTCAACTTTGGTTGCAG 1135
Query 1136 CTATATTCCACAAATCGCTAAGACTAACTC-ATGAAGCTCGCAAGAATTTTGCATCTGGG 1194
|||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1136 CTATATTCCACAAATCTTTAAGACTAAC-CAATAAAGCTCGCAAAAATTTTGCATCTGGG 1194
Query 1195 AAAGTAACAAACATGATAACTACAGATGCTAATGCACTTCAGCAAATATCACAACAGCTC 1254
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||
Sbjct 1195 AAAGTCACAAACATGATAACTACTGATGCTAATGCACTTCAGCTAATAGCAGAACAGCTC 1254
Query 1255 CATGGCTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTGTCTATGATTCTTCTCTATCAACAA 1314
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1255 CATGGTTTATGGTCAGCTCCCTTTCGCATCATTGTGTCTATGGTTCTTCTCTATCAACAA 1314
Query 1315 CTAGGAGTTGCTTCGCTTTTCGGTTCATTGATTCTGTTTCTACTAATTCCTCTCCAGACT 1374
|||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| ||||||||
Sbjct 1315 CTAGGAGTTGCTTCAATTTTCGGTTCACTGATTTTATTTCTCCTTATTCCTTTCCAGACT 1374
Query 1375 CTGATTATAAGCAAAATGCGGAAACTGACTAAAGAAGGACTCCAGTGGACTGACAAAAGA 1434
|||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 CTGATTGTAAGAAAAATGCGGAAACTTACTAAAGAAGGACTCCAGTGGACTGACAAAAGA 1434
Query 1435 GTCGGTATCACGA-ATGAGATATTGTCATCCATGGATACTGTAAAATGCTATGCACGGGA 1493
|||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1435 GTCGGTATCA-TATATGAGATTTTGGCATCCATGGATATTGTAAAATGCTATGCATGGGA 1493
Query 1494 GAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAATGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAA 1553
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 GAAGAGCTTCGAGTCCCGGATTCAAGGAATTAGAAACGAAGAGCTCTCATGGTTTCGTAA 1553
Query 1554 AGCACAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTGAATAGCATCCCGGTAGTTGTGA- 1612
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||
Sbjct 1554 AGCGCAGTTACTATCAGCTTTTAATAGTTTTATACTGAACAGCACCCCAGTTGTTGTGAC 1613
Query 1613 CTGTGGTTTCTTTTGGCGTTT-TCGTTCTGCTCGGAGGAGATTTGACACCAGCAAGAGCA 1671
|| ||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1614 CT-TGGTTTCATTTGGGGTTTAT-GTTCTGCTTGGAGGAGATTTGACACCAGCAAGGGCA 1671
Query 1672 TTCACATCTCTTTCTCTCTTCGCAGTACTTAGATTTCCTCTCAATATGCTACCAAATCTT 1731
||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1672 TTCACATCTCTTTCTCTATTTGCAGTTCTAAGATCTCCTCTCAGCACGCTACCAAATCTT 1731
Query 1732 CTAAGTCAGGTTGTCAATGCAAATGTTTCACTACAACGCATTGAGGAACTACTTCTAAGT 1791
||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1732 ATAAGTCAGGCTGTCAACGCAAATGTTTCACTGCAACGCATTGAGGAACTACTTTTAAGT 1791
Query 1792 GAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTTCAACCAGGAACTCCAGCCATATCAATT 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||
Sbjct 1792 GAAGAGAGAATTCTAGCACAAAACCCACCTCTCCAACCAGGAGCTCCAGCCATTTCCATT 1851
Query 1852 AAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGACAACCAAGCCCACATTATCCGATATCAAT 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1852 AAGAATGGATATTTTTCATGGGATTCAAAGACATCCAAACCCACATTATCGGATATCAAT 1911
Query 1912 TTGGAGATACCGGTGGGCAGCTTAGTTGCCATTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACT 1971
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 TTGGAGATACCGGTGGGCAGCTTGGTTGCCATTGTAGGTGGAACTGGAGAAGGTAAGACG 1971
Query 1972 TCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCTGAAACCTCGACCGTTGTTATT 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 1972 TCACTTATTTCGGCAATGCTGGGGGAGTTATCTCATGCTGAAACCTCAAGCGTTGATATC 2031
Query 2032 AGAGGCTCTGTAGCTTATGTTCCTCAAGTTTCGTGGATCTTTAATGCCACTGTGCGTGAA 2091
||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2032 AGAGGATCTGTAGCTTATGTACCTCAAGTTTCATGGATCTTTAATGCCACTCTGCGTGAA 2091
Query 2092 AACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATATTGGAGGGCTATTGATGCGACT 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2092 AACATTTTATTTGGGTCAGATTTTGAGTCTGAAAGATATTGGAGGGCTATTGATGTGACT 2151
Query 2152 GCCTTACAACACGATCTTGATTTGCTTCCAGGTCGTGATCTTACTGAGATTGGAGAACGT 2211
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2152 GCCTTACAACACGATCTTGATTTGTTTCCAGGCCGTGATCGTACTGAGATTGGAGAACGT 2211
Query 2212 GGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCA 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 GGGGTGAATATTAGTGGAGGGCAGAAGCAGAGAGTTTCAATGGCTAGGGCAGTCTACTCA 2271
Query 2272 AATTCAGATGTTTACATATTCGATGATCCTTTGAGTTCATTAGATGCTCATGTTGCTCAC 2331
||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 AATTCAGATATTTACATATTTGATGATCCTTTCAGTGCTTTAGATGCTCATGTTGCTCAC 2331
Query 2332 CAGGTCTTTGATAGCTGCATGAAGGATGAGCT-AAGGGGGAAAACAAGAGTTCTTGTCAC 2390
|||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||
Sbjct 2332 CAGGTCTTTGATAGCTGCGTGAAGCATGAGCTGAAGGGG-AAAACCAGGGTTCTTGTAAC 2390
Query 2391 AAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATTTTAGTCTCCGAAGGAATGAT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 AAATCAGCTACATTTTCTTCCTTTGATGGATAGAATAATTTTAGTCTCCGAAGGAATGAT 2450
Query 2451 TAAAGAGGAGGGAACCTTTACAGAGCTGTCAAAAAGTGGGAGTTTGTTCAAGAAACTAAT 2510
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 2451 CAAAGAGGAGGGAAACTTCGCAGAGCTGTCAAAAAGTGGGACTTTGTTCAAAAAACTAAT 2510
Query 2511 GGAGAATGCTGGAAAAATGGACGCAACCCAAGAGGTCAATACAAATGACGAGGACATTTT 2570
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2511 GGAGAATGCTGGAAAAATGGATGCAACCCAAGAAGTCAATACAAATGACGAGAACATTTC 2570
Query 2571 GAAACTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGAAATCTTGGCAGTA-CCAAGC 2629
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||
Sbjct 2571 GAAGCTGGGTCCTACTGTCACGATTGATGTGAGTGAAAGAAGTCTTGGCAGTATCCA-GC 2629
Query 2630 AAGGGAAACGGAGAAGATCTGTGCTTGTAAAGCAAGAAGAACGGGAAACTGGCATCATTA 2689
|||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2630 AAGGGAAATGGGGAAGATCCATGCTTGTAAAGCAAGAAGAGCGGGAAACTGGCATCATTA 2689
Query 2690 GTTGGAATGTTCTGATGAGGTATAA-AGAAGCAGTAGGCGGCTTATGGGTAGTTATGATT 2748
| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 GCTGGGATGTTGTGATGAGGTATAATA-AAGCAGTAGGCGGCTTATGGGTAGTTATGATT 2748
Query 2749 CTATTAGCATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTACGAGTTTCAAGTAGCACATGGTTAAGT 2808
|| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2749 CTCTTAGTATGCTATTTAACAACTGAAGTTCTCCGAGTTTTAAGTAGCACATGGTTAAGT 2808
Query 2809 ATTTGGACTGATCAAAGCACGTCAAAGAGTTATAGCCCCGGTTTTTACATTGTTGTATAT 2868
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2809 ATTTGGACTGATCAAAGCACGCCAAAGAGTTATAGTCCCGGTTTCTACATTGTCGTATAT 2868
Query 2869 GCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTCACCAACTCCTTTTGGCTGATCACA 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |
Sbjct 2869 GCTCTTCTCGGATTTGGTCAGGTGGCTGTCACGTTTACCAACTCTTTTTGGTTGATCTCG 2928
Query 2929 TCAAGTTTACATGCCGCCAAAAGACTCCATGACGGGATGCTGAGTTCTATTCTTCGAGCT 2988
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||
Sbjct 2929 TCAAGTTTACATGCCGCTAAAAGACTCCATGACGCAATGCTGAATTCTATCCTACGTGCT 2988
Query 2989 CCTATGCTCTTCTTCCACACAAACCCAACTGGACGTGTAATAAACAGATTTTCTAAGGAT 3048
||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2989 CCTATGCTCTTCTTCGAAACAAACCCAACCGGACGTGTAATAAACAGGTTTTCTAAGGAT 3048
Query 3049 ATTGGTGATATAGATAGAAACGTTGCCAACCTAATGAATATGTTCATGAACCAGCTATGG 3108
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3049 ATTGGTGATATAGATAGAAACGTGGCCAACCTAATGAACATGTTCATGAACCAGCTATGG 3108
Query 3109 CAACTCCTCTCGACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATA 3168
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CAACTCCTCTCGACATTTGCACTTATAGGTATTGTCAGTACAATTTCATTGTGGGCAATA 3168
Query 3169 ATGCCACTCCTAATACTGTTTTATTCAGCATATCTCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAA 3228
|||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 ATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAACATATATCTACTATCAGAGCACATCCCGTGAA 3228
Query 3229 GTTAGACGTTTGGATTCCGTTACAAGATCACCTATTTATGCTC-AGTTTGGAGAAGCTTT 3287
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3229 GTTAGACGTTTGGATTCCGTTACTAGATCACCTATCTATGCTCTA-TTTGGAGAAGCTTT 3287
Query 3288 GAATGGTTTGTCAAGTATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGGATGGCCAAGATTAATGG 3347
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3288 GAATGGTTTGTCAAGCATCCGAGCCTATAAAGCCTATGACCGGATGGCAAAGATAAATGG 3347
Query 3348 AAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTCACTCTTGCAAATACTAGCTCAAATCGTTGGCT 3407
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3348 AAAATCCATGGACAACAACATAAGGTTTACTCTCGCTAGTACTAGCTCAAATCGTTGGCT 3407
Query 3408 CACTATAAGAT-TGGAGACTCTTGGGGGTGTGATGATTTGGTTAACTGCAACTTTTGCGG 3466
||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 CACTATAAGATCTG-AGAGTCTTGGGGGTGTCATGATTTGGTTAACTGCAACTTTTGCGG 3466
Query 3467 TTCTGCAAAATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGCTTTTGCATCAACGATGGGTCTCCTTC 3526
|||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3467 TTCTGCGATATGGGAATGCAGAGAACCAAGCTGTTTTTGCATCTACGATGGGTCTCCTTC 3526
Query 3527 TTAGTTACACTCTGAATATCACTAGTCTATTAAGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAGAG 3586
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3527 TTAGTTACACTCTGAATATCACTACTCTGTTAAGTGGTGTTCTAAGGCAAGCTAGCAAAG 3586
Query 3587 CGGAGAACAGCTTGAATTCTGTTGAGCGTGTTGGTAACTACATTGATCTTCCTTCTGAGG 3646
| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3587 CAGAGAACAGCTTAAACTCTGTTGAGCGTGTTGGCAACTATATTGATCTTCCTTCTGAGG 3646
Query 3647 CTACAGATATAATTGAGAACAATCGTCCAGTAGCTGGCTGGCCTTCAAGAGGATCAATT- 3705
|||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 CTACAGCTATAATCGAGAACAATCGTCCAGTATCTGGCTGGCCTTCAAGAGGATCAATTC 3706
Query 3706 AAGTTCGAAGACGTCCACCTGCGTTATCGACCCGGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGGCTG 3765
|| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3707 AATTT-GAAGACGTTCACCTGCGTTATAGACCCGGGCTTCCTCCAGTATTGCATGGACTG 3765
Query 3766 ACCTTTTTTGTTTCTCCCAGTGAGAAAGTAGGAGTTGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAA 3825
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3766 TCCTTTTTTGTTTATCCGAGTGAGAAAGTAGGAGTGGTGGGAAGAACTGGGGCAGGAAAG 3825
Query 3826 TCTTCCATGCTGAATGCATTATTTCGGATCGTGGAAGTGGAAAAGGGAAGAATTATGATT 3885
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3826 TCTTCCATGCTGAATGCATTATACCGGATTGTGGAATTGGAAAAAGGAAGAATCCTGATT 3885
Query 3886 GATGATTGTGATGTGGCTAAGTTCGGACTAACAGATTTACGCAGGGTTCTAAGTATCATA 3945
||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct 3886 GATGATTATGATGTGGCTAAGTTTGGACTGACAGATTTGCGTAGGGTCCTAAGTATCATA 3945
Query 3946 CCACAATCTCCTGTTCTTTTCTCAGGGACGGTGAGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAA 4005
|| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3946 CCCCAGTCACCAGTTCTTTTTTCAGGGACGGTGAGATTCAATATCGATCCATTTAGTGAA 4005
Query 4006 CATAATGATGCTGACCTCTGGGAAGCTCTACAAAGGGCGCATATAAAAGATGTCATC-AG 4064
|| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4006 CACAATGATGCTGACCTCTGGGAGGCTCTAGAAAGGGCGCATATAAAAGATGTCATCGAT 4065
Query 4065 CAGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGAGAATTTCAGCGTGGG 4124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4066 -AGGAATCCTTTTGGCCTAGATGCAGAGGTCTCTGAGGGAGGTGAGAACTTCAGTGTGGG 4124
Query 4125 GCAAAGGCAACTGCTGAGTCTTGCGCGTGCGTTGCTAAGAAGATCTAAGATCCTTGTTCT 4184
|||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4125 GCAAAGACAACTGCTGAGTCTAGCGCGTGCATTGCTAAGAAGATCTAAGATCCTTTTTCT 4184
Query 4185 CGATGAAGCAACAGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGATACAGAGGACCATTCG 4244
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4185 TGATGAAGCAACTGCATCTGTTGATGTCAGAACAGATTCTCTGATACAGAGGACCATACG 4244
Query 4245 GGAGGAATTCAAGTCTTGCACAATGCTTGTTATTGCTCACAGGTTGAATACCATCATCGA 4304
||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4245 TGAGGAATTCAAGTCTTGTACAATGCTTATTATCGCTCACAGATTGAATACCATCATCGA 4304
Query 4305 CTGTGACAAGATTCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTATGATAGTCCTCAAGA 4364
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4305 CTGCGACAAGATCCTTGTGCTTAGTTCTGGTCAGGTTTTGGAGTATGATAGTCCACAAGA 4364
Query 4365 ATTGCTATCAAGAGACACAAGCGCCTTCTTTA-GTATGGTTCATAGCACCGGACCAGCAA 4423
||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 4365 ATTGCTATCAAGAGATACAAGTGCTTTCTTTAAG-ATGGTTCATAGCACTGGACCAGAAA 4423
Query 4424 ATGCTCAGTACCTTTCCAATTTGGTCTTTGAAAGGCGAGAGAATGGTATGAGTTTGGGTG 4483
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||
Sbjct 4424 ATGGTCAGTACCTTTCCAACTTGGTCTTTGAAAGGAGAGGGAATGGAATGAGTCAAGGTG 4483
Query 4484 GATA 4487
||||
Sbjct 4484 GATA 4487
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 223794732723
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5