BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg314757
Length=7917
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G55325.2 | Symbols: GCT | RNA polymerase II transcription me... 3513 0.0
AT1G55320.1 | Symbols: AAE18 | acyl-activating enzyme 18 | chr1... 3256 0.0
> AT1G55325.2 | Symbols: GCT | RNA polymerase II transcription
mediators | chr1:20637380-20648434 FORWARD LENGTH=6940
Length=6940
Score = 3513 bits (1902), Expect = 0.0
Identities = 2156/2275 (95%), Gaps = 32/2275 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3290 GGGCTGGTGATTTTGACTTCCTTGGAGCGTCTGAAAATAAGAGTGATGGGTTTTATGAAA 3349
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 GGGCTGGTGATTTTGACTGCCTTGGTGCGTCTGAAAATAAGAGTGATGGGTTTTATGAAA 1388
Query 3350 AGAATGATTACAATAGCAGTGGTAGTAGCCGTAATAGCAGCATTAGTTCAACAAGTAGCG 3409
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 AAAATGGTTACAATAGCAGTGGTAGTAGCCGTAATAGCAGCATTAGTTCAACAAGTAGCG 1448
Query 3410 CTTCCAGCGGGAGTGGCTGGAGGATGACGTCAAGAACTGGTGACCTTGACGCTGATGCAG 3469
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1449 CTTCCAGCGGGAGCGGCTGGAGGATGACGTCAAGAACTGGTGATCTTGACGCTGATGCAG 1508
Query 3470 ATTCTTTGACGTGTAGGCAATCTGGTCTTACTTCTAATGATGATCGCCCAAAAATGGGTT 3529
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1509 ATTCTTTGACGTGTAGGCAATCTGGTCTTACTTGTAATGATGATCGCCTAAAAATGGGTT 1568
Query 3530 CCAAGCGGCCGCGAACAGGGATGGCAGAGTCATTCGGTCAAGTAGGCATTGAAAATGATC 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569 CCAAGCGGCCGCGAACAGGGATGGCAGAGTCATTCGGTCAAGTAGGCATTGAAAATGATC 1628
Query 3590 AAATTGGTTGGGATTGGGATGCTGACGATGATGATGATGACAGAGAAGTTGGCATGGATA 3649
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAATTGGTTGGGATTGGGATGCTGATGATGATGATGATGACAGAGAAGTTGGCATGGATA 1688
Query 3650 TCAAGGCCCTTCTTTCAGAGTTTGGAGACTTTGGTGACTTCTTTGAGAACGATGCTTTGC 3709
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1689 TCAAGGCACTTCTTTCAGAGTTTGGAGACTTTGGTGACTTCTTTGAGAACGATGCTTTAC 1748
Query 3710 CTTTCGGGGAGCCACCGGGAACTGCAGAGTCGCATGCGCTCATTTTCCCTCCAGATTCTG 3769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1749 CTTTCGGGGAGCCACCGGGAACTGCAGAGTCGCATGTGCTCGTTTTTCCTCCAGATTCTG 1808
Query 3770 CTGATGTAGGTTCCAGTCCAGTGGATATGATGGATGTATCAGACCAAATCGTTTTGCCTG 3829
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1809 CTGATGTAGGTTCCAGTCCCGTGGATATGATGGATGTATCAGACCAAATCGTTTTGCCTG 1868
Query 3830 TCGGGTTTTCCTCTTTTGAGAGCTTTAATCCTGTTCCCCCTATCATTGATGAGTGCCTTA 3889
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1869 TTGGGTTTTCCTCTTTTGAGAGCTTTAATCCTGTTCCCCCAATCATTGATGAGTGCCTTA 1928
Query 3890 TTAAAAGTCAAGAAGTTCTCAACAGCAGTATCACTTCAGTTCCTTCATATCAAATGTCGA 3949
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1929 TTAAAAGTCAAGAAGTTCTCCACAGCAGTATCACTTCAGTTCCTTCAAATCAAATGTCGA 1988
Query 3950 TCTCTTCCACTAGTGAGTTCGATCATTTAATGAAAGCAGAGGCGATGATGACCTTCGCTC 4009
||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 1989 TCTCTTCGACTGGTGAGTTTGATCATTTACTAAAAGCAGAAGCAATGATGACCTTTGCTC 2048
Query 4010 CTGAGTATGGAGCTGTAGAAGCACCTATGAGCGAGATTTCCTCGACGTATTTCAAAAGCC 4069
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2049 CTGAGTATGGAGCTGTAGAAGCACCTATGAGCGAGATTTCCTCGACGTTTTTCAAAAGCC 2108
Query 4070 CATATCTTCCCAAATCTCATAAAGTGGAGAGTTCAAATTCAAGAACGAGTAATTATGTTT 4129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2109 CATATCTTCCCAAATCTCATAAAGTGGAGAGTTCAAATTCAAGAACGAGTAATTATGTCT 2168
Query 4130 ATGGAGCCACGCCACCTACCACTGATTCTGATGGAGCGGGCAATAAGATTTTGTTTGGAT 4189
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||
Sbjct 2169 ATGGAGCCACACCACCGACCACTGATTCTGATGGAGCAGGCGATATGATTTTGTTCGGAT 2228
Query 4190 CAAAATCATGCATTGGTAACAATGATGGCAGAACTTTGTTTCATTCGAGGGAGCATTACA 4249
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2229 CAAAATCATGCATTGGAAACAATGCTGGCAGAACTCTGTATCATTCGAGGGAGCATTACA 2288
Query 4250 CTCAAGTAGAGGGTAGAAATGACCAACATGATAAGCTACCTACTGTTGTCAGTGACAACA 4309
|||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2289 CTCAAGTAGAAGGTAGAAAGGGCCGACATGATAAGCTACCTACAGTTATCAGTGACAACA 2348
Query 4310 ATAGTACAAAGGAGGGTGTCTCTCATTCAAAACACTCAAAACATAGTGCTGCGAATGCTG 4369
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2349 GTAGTACAAAGGAGGGTGTCTCTCAATCAATACACTCAAAACATAGTGCTGCGAATGCTG 2408
Query 4370 TTAAGGTCGTGCAGGGGAAAAAGACTGATGGTATATCTGCTGTTGTTAGAACCTTATTAT 4429
|||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2409 TTAAGGTCGTACAGGGAAAAAAAACTGATGGTATATCTGCTGTTGTTAGTACCTTATTAT 2468
Query 4430 CTTCGAAGACCTTGCTGGCAACAGACGTGGGAAACGTTATGTTCCAAGCTTTCATGTGTA 4489
|||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469 CTTCAAAGACCCTGCTGGCAACAGACGTGGGAAGTGTTATGTTCCAAGCTTTCATGTGTA 2528
Query 4490 GGGTGCGG--C---A-CACTTCTTTAAAGCACAGTTCACCTGTTAGTCTGACTAGGCTTA 4543
|| ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2529 GGATGCGGCACATAATCACTTCTTCAAAGCACAGTTCACCTGTTAGTCTGACTAGGCTTA 2588
Query 4544 GCGGAAATTTTTTCCTGAACCAGCTGCCAAATGAGCCTAGTACTCTGACAGACAACATAT 4603
||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 GCGGAAACTTTTTCCTTAACCAGCTGTCAAATGAGCCTAGTACTCTGACAGACAACATAT 2648
Query 4604 CTGCAAGGAACGAGATATATAAGAAAGATATACCTACCAGAATTGCTGGAGATTTTGACG 4663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2649 CTGCAAGGAACGAGATATATAAGAAAGATATACCTACCAGAATAGCTGGAGATTTTGACG 2708
Query 4664 GAGGAATGTTGGATAGCCACATGAGTGCACCAGTTGGTGTATGGCGGACTGTTTCAGTCC 4723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 GAGGAATGTTGGATAGCCACATGAGTGCACCAGTTGGCGTATGGCGGACTGTTTCAGTCC 2768
Query 4724 CAAAAACAGCAAAACCTGCTAGTTCGCCAAATATTGAAGCAGGGTCATCCTTGCCCCATA 4783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 CAAAAACAGCAAAACCTGCTAGTTCGCCAAATATTGAAGCAGGGTCATCCTTGCCCCATA 2828
Query 4784 GTTCATTTAGCGAAGACAGCTTACTTTCTTATGGTCAAAGGCAACCTCTGCATGAGCTCC 4843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 2829 GTTCATTTAGCGAAGACAGCTTACTTTCTTATGGTCAAAGGCAACCACTGCAGGATCTCC 2888
Query 4844 TAGATGGAATATCGCTACTTGTACAGCAAGCTACCTCTTTTGTTGATTTAGCTCTGGATT 4903
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 TAGATGGAATAGCGCTACTTGTACAGCAAGCTACCTCTTTTGTTGATTTAGCTCTGGATT 2948
Query 4904 CAGATTGTGGAGATGGACCGTATGGCTGGCTTGCATTGGAAGAGTTATGGAGACGGGAAT 4963
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 CAGATTGTGGAGATGGACCTTATGGCTGGCTTGCATTGGAAGAGTTATGGAGACGGGAAT 3008
Query 4964 TGTCGTGTGGACCCTCTGCTGGCCATGCAGGTTGTGGGGGAACTTTGGCTTCCTGCCATT 5023
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 TGTCGTGTGGTCCCTCTGCTGGCCATGCAGGTTGTGGGGGAACTTTGGCTTCCTGCCATT 3068
Query 5024 CTCTGGACATTGCTGGTGTCAAGCTAGTTGATCCACTCTCTGCTGAGGTTTTCCCTTCGT 5083
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3069 CTCTGGACATTGCTGGTGTCAAGCTTGTTGATCCACTCTCTGCTGAGGTTTTTCCTTCGT 3128
Query 5084 CTGTCACTACTCTACTGCAATCTGACATCAAAACAGCTCTGAAATCTGCATTTGGTCAGT 5143
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3129 CTGTCATTACTCTTCTGCAATCTGACATCAAAACAGCTCTGAAATCTGCATTTGGTCAGT 3188
Query 5144 CAGATGGTCCATTATCTGTGACAGATTGGTGCAAGGGCCGAAATCAATCGGGCGATGGAG 5203
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3189 CAGATGGTCCATTATCTGTTACAGATTGGTGCAAGGGCCGAAATCAATCGGGGGATGGAG 3248
Query 5204 GATCTATTTCTGAGGGATCTACTTCTGAGTCAGCCCTGAGTGAAGTGAATGGTGTCAAAA 5263
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3249 GATCTATTTCTGAGGGATTTACTGCTGAGTCAGCCCTGAGTGAAGT---------C---- 3295
Query 5264 TCTCTGATGTGTCAAATGCAATAGATGGTGGGAAAGGAGAGGAGACGGCTCAGAGCCTAG 5323
|| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 3296 TC----A------AA-TGCAATAGATGGTGGGAAAGGAGATGAGACGGCTCAGAGCCAAG 3344
Query 5324 ACATATACAGTTCAGAATTACTCCGACCGACA-TTGTTTGTTCTTCCATCACCTGCTATA 5382
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 ACATATACAGTTCAGAATTACTCCGACCGACACTT-TTTGTTCTTCCATCACCTGCTATA 3403
Query 5383 CTTGTCGGGTACCAAGATGACTGGCTTAAGATATCTACAAACTCCTTGCCACATTGGGAA 5442
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3404 CTTGTCGGGTACCAAGATGACTGGCTTAAGATATCAACAAACTCCTTGACACATTGGGAA 3463
Query 5443 AAGGCCCCGTTTGAGCCATATGCTCTGCCAAAAAGTATTAACTATACTGTTGTATGCCCA 5502
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 3464 AAGGCCCCCTTTGAGCCATATGCTCTGCCAAAAAGTATTAATTATGCTGTTGTATGCCCG 3523
Query 5503 GATATTGATCCTTTAACTTGTGCTGCTGCTGATTTCTTCCAGCAACTTGGAACTG 5557
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3524 GATATTGATCCTTTAACTTGTGCTGCTACTGATTTCTTCCAGCAGCTTGGAACTG 3578
Score = 1945 bits (1053), Expect = 0.0
Identities = 1129/1167 (97%), Gaps = 0/1167 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5615 GGCTGGGAACCCATTTGCCACAGAGCCTGGGAAATCAAATGGATACGGACGCTGGAAGAT 5674
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||
Sbjct 3594 GGCTGGGAACACATTTGCCACAGAGCCTGGGAAATCAAATGGAAAAGGACGTTGGGAGAT 3653
Query 5675 TATCCTCATCTGGATTTGTTCTGCTTGATTGCCCTCAATCAATGAAGATTGAAAGCAATA 5734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3654 TATCCTCATCTGGATTTGTTCTGCTTGATTGCCCTCAATCAATGAAGATTGAAAGCAATA 3713
Query 5735 ACACATCGCTTCTGGGATCTCTCAGCGATTATTTTCTATCTTTGTCAAATGGGTGGAATG 5794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3714 ACACATCGCTTCTGGGATCTCTCAGCGATTATTTTCTATCTTTATCAAATGGGTGGAATG 3773
Query 5795 TGAGTAGCTATCTGAAGTCTTTATCAAAAGCGCTGAAAGGTCTAAAGCTTGGATCTTCCC 5854
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3774 TGAATAGCTATCTGAAGTCTTTATCAAAAGCGCTGAAAGGTCTAAAGCTTGGATCAGGCC 3833
Query 5855 TTTACACAAACCAGAAAGAAGGATCAGGAAGTCCTTGTATGGTAGTGTACATAGTGTGTC 5914
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3834 TTTACACAAACCAAAAAGAAGGATCAGGAAGTCCTTGTGTGGTAGTGTACATAGTGTGTC 3893
Query 5915 CATTTCCTGATCCTTCAGCAGTTTTAAGGACGATCGTCGAATCGTCTATAGCACTTGGAT 5974
|||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 CATTTCCTGACCCTTCGGCAGTTTTAAGAACGATCGTCGAATCGTCTATAGCACTTGGAT 3953
Query 5975 CAGTAATACAGTCAGATAGAGAGAGGAGATCAATACTCAACAGTCAGGTTGCAAGGGCGT 6034
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3954 CAGTAATACAGTCAGATAGAGACAGGAGATCAATACTCAACAGTCAAGTTGCAAGGGCGT 4013
Query 6035 TTGGTAGTTCTACTGCTGTTGACGAAGCATCAATATCTCACATTCCAGTGCTTTCAGGGT 6094
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4014 TTAGTAGTTCTACTGCTGTTGACGAAGCATCAATATCTCACATTCCAGTGCTCTCAGGGT 4073
Query 6095 TTAGTGTCCCCAAATTAGTTCTACAAGTGGTGTCGGTTGATTCTATTTTCCGGATAACAA 6154
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4074 TTAGTGTCCCCAAATTAGTTCTACAAGTGGTGTCTGTTGATTCAATTTTCCGGATAACAA 4133
Query 6155 GTCCAAGCTTTAATGAGCTTGTCATTCTCAAGGATACTGCTTTTTCTGTATACAATAAAG 6214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4134 GTCCAAGCTTTAATGAGCTTGTCATTCTCAAGGATACTGCTTTTTCTGTATACAATAAAG 4193
Query 6215 CTCGGAGAATTTCACGAGGAATGCCTAATGATGCAATTTTCTCATCATCTTTATCAAGCA 6274
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4194 CTAGGAGAATTTCACGAGGAATGCCTAATGATGCATTTTTCTCATCATCTTTACCAAGCA 4253
Query 6275 GATCCTCTTCAGCGTTGACATCAATGAGCTCTATTTCAGGAATCTGGAAAGACTGCGGTG 6334
|||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 GATCGTCTTCAGCGTTGACACCAATGAACTCTATTTCAGGAATCTGGAAAGACTGCGGTG 4313
Query 6335 GTTCTCGAATGACAGGTTCTACACATCCAAGAGATGGTGACATTGATGTTAGCTTGAGAA 6394
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 4314 GTTCTCGAATGACAGGTTCTACACATCCAAGAGATGGTGAAATTGATGTTAGTTTGAGAA 4373
Query 6395 CGAGTGGTTGGGATACCTCTACTTCCTGGCAAATACCAAGATCTGGAGGACTAAGTTGCG 6454
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 4374 CGAGTGGTTGGGATACCTCTACTTCCTGGCAGATACCAAGATCTGGAGGATTAAGCTGCG 4433
Query 6455 ACCCAAGCAGAAATGGAGATTTTTACCTTAATGATGAAATTTTCTATTTATTTGAACCAC 6514
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4434 ACCCAAACAGAAATGGAGATTTTTACCTTAATGATGAAATTTTCTATTTATTTGAACCAC 4493
Query 6515 TTTTCATTCTTTCCGAGCCTGGTTCTGTGGAGCGTGGAGTTTCACCTACTTTCGGCAGCT 6574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4494 TTTTCATTCTTTCCGAGCCTGGTTCTGTGGAGCGTGGAGTTTCACCTACTTTCACCAGCT 4553
Query 6575 TGGGTTCTGAGTCTTCCAAGCCAATTCCCGAGGATGGTGGCAGAGGTTCTGGACCTGGCA 6634
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4554 TGGGTTCTGAGTCTTCCAAGCCAATACCCGAGGATGGTGGCAGAGGTTCTGGACCTGGCA 4613
Query 6635 TGAATTCAATGGAAGGTATAACATCGGGATCAAGCTCCCAGGGGGATGCATCCCAGCTTG 6694
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4614 TGAATTCAATGGAAGGTATAACATCGGGATCAAGCTCCCAGGGGGATGTATCCCAGCTTG 4673
Query 6695 AAGGAAAGGCTATTCCAAGTTTACATTGCTGCTACGGTTGGACTGAGGACTGGAGATGGC 6754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4674 AAGGAAAGGCTATTCCAAGTTTACATTGCTGCTACGGTTGGACAGAGGACTGGAGATGGC 4733
Query 6755 TTGTAAGCATCTGGACGGATGCCAGGG 6781
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4734 TTGTAAGCATCTGGACGGATGCCAGGG 4760
Score = 987 bits (534), Expect = 0.0
Identities = 558/570 (98%), Gaps = 0/570 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 7303 GGTGGCCAGAGCAGTACTGGTATGAGTTCTGTTAATTACATTGAAGGTTTCACTCCTGTC 7362
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5333 GGTGGCCAGAGCAGTACTGGTATGAGTTCCGTTAATTACATTGAAGGTTTCACTCCTGTC 5392
Query 7363 AAGTCTCTTGGGTCGACCGCTTTCTCTTACATGATGATACCATCACCCAACATGCGCTTT 7422
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5393 AAGTCTCTTGGTTCTACCGCTTTCTCTTACATGATGATACCATCACCCAACATGCGCTTT 5452
Query 7423 CTTCACCCAAGTCCTCTTCAGCTTCCTACATGTTTAACTGCCGAGTCACCTCCACTTGCT 7482
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5453 CTTCACCCAAGTCCTCTTCAGCTTCCGACATGTTTAACTGCCGAGTCACCTCCACTTGCT 5512
Query 7483 CACCTCCTTCACAGCAAAGGCTGTGCAATCCCCTTGTCTACTGGATTTGTTGTTTCAAAA 7542
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5513 CACCTCCTTCACAGCAAAGGCTATGCAATCCCCTTGTCTACTGGATTTGTTGTTTCAAAA 5572
Query 7543 GCTGTGCCTTCCATGAGAAAAGACTCAAGAATAAACATGAAAGAAGAATGGCCATCAGTT 7602
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5573 GCTGTGCCTTCCATGAGAAAAGACTCAAGGATAAACGTGAAAGAAGAATGGCCATCAGTT 5632
Query 7603 CTTTCTGTAAGTCTCATAGACTATTATGGTGGTTATGACAATGCTCATGACAGAATTCTT 7662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 5633 CTTTCTGTAAGTCTCATAGACTATTATGGTGGTTATGACAACGCTCATGACAAAATTCTT 5692
Query 7663 CAGGGAATCATGAAGCAGGGAGGAGGGACCAAAGAAACTAGAGATTTTGAGGTTGAAAGC 7722
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5693 CAGGGAATCGTGAAGCAGGGAGGAGGGACCAAAGAAACTAGAGATTTTGAGGTTGAAAGC 5752
Query 7723 CATCTTATCCTTGAGTCAATTGCGGCAGAACTCCATGCTCTATCATGGATGACTGTTAGT 7782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5753 CATCTTATCCTTGAGTCAATTGCGGCAGAACTCCATGCTCTATCATGGATGACTGTTAGT 5812
Query 7783 CCAGCATATCTGGACAGGCGGACGGCATTGCCGTTTCACTGTGATATGGTTTTGAGATTG 7842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5813 CCAGCATATCTGGACAGGCGGACGGCATTGCCGTTTCACTGTGATATGGTTCTGAGATTG 5872
Query 7843 AGACGTCTGCTTCACTTTGCGGACAAAGAA 7872
|||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5873 AGACGTCTTCTTCACTTTGCGGACAAAGAA 5902
Score = 933 bits (505), Expect = 0.0
Identities = 611/656 (93%), Gaps = 32/656 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2122 GGTGGTCTACATAATGTTTCTTGGTTTCAGTTACTTCCGAGTGAAACTGAGCTGAATCCT 2181
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 239 GGTGGTCTACATAATGTTTCTTGGTTTCAGTTTCTTCCAAGTGAAACTGAGCTGAATCCT 298
Query 2182 GG-TTCTGATAGAAGTTCAAGAGCTGAGCAGAATGATGTTGCAACATATCTTGTGCTTTC 2240
|| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 299 GGCTT-TGATAGAAGTTCAAGAGCTGAGCAGAATGAAGTTGCAACATATCTTGTACTTTC 357
Query 2241 CTCTCATCTACGGTTGCAGAAGGAAGGGTTTCTTACCACTTGGACCAATTCTTTTGTTGG 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CTCTCATCTACGGTTGCAGAAGGAAGGGTTTCTTACCACTTGGACCAATTCTTTTGTTGG 417
Query 2301 ACCTTGGGATCCATCTCAAGGTTTATATAACCCTGATGAAAAGATTAAGCTTTGGCTTTT 2360
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 ACCTTGGGATCCATCTCAAGGTTTATACAACCCTGATGAAAAGATTAAGCTTTGGCTTTT 477
Query 2361 TCTACCTGGGCGTCATTCATCAATCACTGATAAAGCTCAGGCTGCTGTGTCAAAGCTTAG 2420
||||||||||||||| | || || | || | | | ||| | ||||| |
Sbjct 478 TCTACCTGGGCGTCA-T--TC-AT--C-----AA--T-A---T-CTG-AT-AAAGC-T-C 515
Query 2421 AGTGAACATGCCTGTTGTCTATGCTTATCTTGTTGTTGCGTCAGGAATTTGGGTAGCACC 2480
|| | | || ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 AG-G--C-TG-CTG-TGTCAAAGCTTA--GAGTTGTTGCGTCAGGAATTTGGGTAGCACC 567
Query 2481 TGGGGACTCTGAAGAGATATCAGTTGCCTTTTCACAGTCTTTACGTAATTGCATTGAAAG 2540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 568 TGGGGACTCTGAAGAGATATCAGTTGCCTTTTCACAGTCTTTACGTAATTGCATCGAAAG 627
Query 2541 AGCATTATCTGGACTTTCCTACATGAGATTTGGAGATGTGTTTTCAAAATTCAGCCCTCA 2600
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 AGCATTATCTGGAATTTCCTACATGAGATTTGGAGATGTGTTTTCAAAATTCAGCCCTCA 687
Query 2601 AAGCGAAGAATATTTGAGGAGGGGACAGCCTACTGTTGAATTCATCTTTGCTGCTACCGA 2660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688 AAGCGAAGAATATTTGAGGAGGGGACAGCCTACTGTTGAATTCATCTTTGCTGCTACCGA 747
Query 2661 AGAGGCAGTTTTTGTCCATGTCATTATATCTGCCAAGAATGTCCGCACACTTTCAAGTGG 2720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 AGAGGCAGTTTTTGTCCATGTCATTATATCTGCCAAGAATGTCCGCACACTTTCAAGTGG 807
Query 2721 CGATGCTGAAAGAATGTTAAGGAGTTCTTTGAAAAACTCCAGTTATAGGCTTCCAG 2776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CGATGCTGAAAGAATGTTAAGGAGTTCTTTGAAAAACTCCAGTTATAGGCTTCCAG 863
Score = 800 bits (433), Expect = 0.0
Identities = 467/484 (96%), Gaps = 0/484 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6781 GTTCTGCAGCAGGGATGTCAAATACTACAGGCGTGTTCCTCCCCTGACAATGGATCTTTC 6840
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4847 GTTCTGCAGCAGGGATGTCAAATACTACAGGCGTGCTCCTCCCCTGACAATGGATCTTTC 4906
Query 6841 AAACCCAGGGATTTTGTCATTACACGCATTGGGAATTTCTTCGAGCTTGAATACCAAGAG 6900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4907 AAACCCAGGGATTTTGTCATTACACGCATTGGGAATTTCTTCGAGCTTGAATACCAAGAG 4966
Query 6901 TGGCAAAAGGCTATTTACTCAGCTGGAGGTCCTGAGGTTAAAAAGTGGCCTATTCAACTG 6960
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4967 TGGCAAAAGGCAATTTACTCAGCTGGAGGTCCTGAGATTAAAAAGTGGCCTATTCAACTG 5026
Query 6961 CGACGTTCTGCGCCTTCTGGCATAGCCACCAACAGCAACGGATCTTCCTTGCAACAGCAG 7020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5027 CGACGTTCTGCGCCTTCTGGCATAGCCACCAACAGCAACGGATCTTCCTTGCAACAGCAG 5086
Query 7021 GATCTTAGTCTGATTCAAGAGAGAGCCTCATCAACTAGCACACTTTACAGCTCTCATTCA 7080
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5087 GATCTGAGTCTGATTCAAGAGAGAGCCTCATCAACTAGCACACTCTACAGCTCTCATTCA 5146
Query 7081 AAACCATCCACCTTTGTGAAAGGCAGTATTGGGCAATCTGCTGGAAGAAAGCAGATAATG 7140
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5147 AAACAATCCACCTTTGTGAAAGGCAGTATGGGGCAATCCGCTGGAAGAAAGCAGATAATG 5206
Query 7141 GGTGGGCAAACCATATCTGGTACTCCAAGGGGATTGTTTCAGTGGGTTCATAGCATCAGT 7200
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5207 GGTGGGCAGACCATTTCTGGTACTCCAAGGGGATTGTTTCAGTGGGTTCACAGCATCAGT 5266
Query 7201 TTTGCTTCTGTTTCACTTGATCACTCCCTACATTTTGTTCTTCCAGCTGAGTTGGTGTCT 7260
||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5267 TTTGCTTCTATTTCACTTGACCATTCCCTGCATTTTGTTCTTCCAGCTGAGTTGGTATCC 5326
Query 7261 GCTG 7264
||||
Sbjct 5327 GCTG 5330
Score = 508 bits (275), Expect = 2e-142
Identities = 378/422 (90%), Gaps = 30/422 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 2887 CCAGTGATTGTTTCTCCTCATGGAATGCGGGGCAGCCTCACTGGATTCTGTCCCAATGAC 2946
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 860 CCAGTTATTGTTTCTCCTCATGGAATGCGGGGCAGCCTTACTGGATTCTGTCCCAATGAC 919
Query 2947 CTTGTCAAGCAAGTCTACTTCAGTTCTGGAAACTTAAGGACTTCGAGTGGATA---T-G- 3001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |
Sbjct 920 CTTGTCAAGCAAGTCTACTTCAGTTCTGGAAACTTAAAAACTTCGACTGGATATGTTGGT 979
Query 3002 -------------TTGGTCGTGGGTCCCGTCTGATAAACGGCAATCATTGCTACGTGGAA 3048
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 980 CTCCCTTCTCATATTGGTCGTGGGTCCCGTCTGATAAATGGCAATCATTGCTACGTGGAA 1039
Query 3049 GTTAGACTTGGTTGCTGCCAAAATAAAAATGACAATAAAAATGACAACACAAGTCAAGCT 3108
|||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 GTTACACTTGGTTGCTGCCAAAAT----A-G-------AAATGACAACACAAGTCAAGCT 1087
Query 3109 AATTCGAACTTTGCAGTTAACTTGCCCCATAATCAGTGTCCTGAACCTTCAGTTGGGAGT 3168
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 AATTCGACCTTTGCAGTTAACTTGCCCCATAACCAGTGTCCTGAACCTTCAGTTGGGAGT 1147
Query 3169 AAAGATCACCGTAAAGGACAACCAGATCTTTTATCAGTTTGTGaaaaaaaGTTCATTTAT 3228
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1148 AAAGATCACCGTAAAGGACAATCAGATCTTTCATCAGTTTGTGAAAAAAAGTTCATCTAT 1207
Query 3229 CCAGCTGAGGCAGTGCTTGTGCCAATCTTACAGTCGGCATTTGCTAAATTTTCTTTGAAA 3288
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1208 CCAGCTGAGGCAGTGCTTGTACCAATCTTACAGTCGGCATTTGCGAAATTTTCTTTGAAA 1267
Query 3289 AG 3290
||
Sbjct 1268 AG 1269
> AT1G55320.1 | Symbols: AAE18 | acyl-activating enzyme 18 | chr1:20633360-20636892
FORWARD LENGTH=2428
Length=2428
Score = 3256 bits (1763), Expect = 0.0
Identities = 2016/2137 (94%), Gaps = 21/2137 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTGGAAGAGCATAGGAGAATTGAGTTGCGATGACTATGTCAAAGCTGGATTGACTTTG 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 12 ATGTGGAAGAGCATAGGCGAATTGAGTTGCGATGATTATGTCAAAGCTGGGTTGACTTTG 71
Query 61 GAAGACGCCAAGGGATTTGACAAATTGGTGAGGGATGTGATTTCAACGGCTATAGAGACT 120
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 72 GAAGACGCCAAGGAATTTGACAAATTGGTGAGCGATGTGATTACAAAGGCTATAGAGACT 131
Query 121 GATCCAAGAGATCAATGGAAGGCTTTGGTGGATGAGAGTTTGCTTAAGCCATGGCATCCT 180
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 132 GATCCAAGAGATCAATGGAAAGCTTTGGTAGATGAGAGTGTGCTTAAGCCATGGCATCCA 191
Query 181 CATCCCCTGCATCAGCTTCTCTACTACTCTGTCTACTCAAACTGGGACTCCTCTGCTCTT 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
Sbjct 192 CATCCTCTGCATCAGCTTCTCTACTACTCTGTCTATTCAAACTGGGACTCCTCTGTTCAT 251
Query 241 GGCCCTCCTCTCTATTGGTTTCCTTCTCCATCTCAGTCAAAATCAACAAATTTGGGGAAG 300
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||||
Sbjct 252 GGCCCTCCTCTCTATTGGTTTCCTTCTCTATCTCAGTCAAAGTCCACCAATCTGGGGAAG 311
Query 301 CTGATGGAA-ACTCACGGGTCAAGACTTCTTGGTCCTACATACAAGAACCCTCTTGAAAG 359
||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 CTGATGGAATA-TCACGGACCAAGACTTCTTGGTCCTTCATACAAGAACCCTCTTGAAAG 370
Query 360 TTTTGAACTTTTCCGGAGATTCTCAGTTGAACACCCTGAAGTTTATTGGTCAATTGTTAT 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 371 TTTTGAACTTTTCCGGAGATTCTCAGTTGAACACCCTGAAGTTTATTGGTCATTTGTTAT 430
Query 420 CGATGAGCTTTCACTTGTGTTTCATACTCCTCCGAGGTGTATCCTTGACAAATCAAAACC 479
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 431 CGATGAGCTTTCACTTGTGTTTCACACTCCTCCGAGGTGTATCCTTAACAAATCAAAACC 490
Query 480 TGGAGGGACTTGGCTCCTTGATGCTGTTCTTAATATCGCTGAGTGTTGTCTGATGCCTTC 539
|| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TGAAGGGACTTGGCTCCCTGATGCAGTTCTTAATATCGCTGAGTGTTGTCTGATGCCTTC 550
Query 540 AAGTCATCCCAAAAAGGAGGATGATAGTGTGGCTGTTGTATGGCGTAATGAAGGCTTTGA 599
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 551 AAGCCATCCCAAAAAGGAGGATGATAGTGTGGCTGTTGTATGGCGTAATGAAGGGTTTGA 610
Query 600 TGATTCTCCAGTCAATCA-AATGA-CATTaaaaaaaCTCCGCGAACAAGTAATGTTGGTG 657
||| |||||||||||| | ||||| |||| ||| | || || || |||||||||||||||
Sbjct 611 TGACTCTCCAGTCAAT-AGAATGACCATT-AAAGAGCTTCGGGAGCAAGTAATGTTGGTG 668
Query 658 GCAAATGCGATAGGTGGAAGTTTTGAAAAGGGTGACACAATTGCAATCGATATGCCAATG 717
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 GCAAATGCGATAAGTGGAAGTTTTGAAAAGGGTGACACAATTGCAATCGATATGCCAATG 728
Query 718 ACAGTCGATGCAGTGATTATATATCTCGCAATCATATTAGCTGGTTGCATTGTTGTTTCC 777
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 729 ACAGTTGATGCAGTGATTATATATCTCGCAATCATATTAGCTGGTTGCATTGTTGTCTCC 788
Query 778 ATCGCAGACAGCTTTGCAGCTAAAGAAATTGCAACACGGTTGAAAATTTCTAAAGCAAAA 837
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 789 ATCGCAGACAGCTTTGCAGCTAAAGAAATAGCAACAAGGTTGAAAATTTCGAAGGCAAAA 848
Query 838 GGCATATTCACTCAGGATTACATACTCAGAGGAGGTCGAAGATTTCCTTTATACAGTCGG 897
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 849 GGCATATTCACTCAGGATTATATACTCAGAGGAGGTCGAAGGTTTCCTTTATACAGTCGA 908
Query 898 GTGGTTGAAGCTGCTCCATCTAAGGTCATTGTCCTCCCAGCTTCAGGTA---AATTGCGC 954
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 909 GTGGTTGAAGCTGCTCCATCTAAGGTCATTGTCCTCCCGGCTTCAGGTACTGAATTGCAT 968
Query 955 GTTCAGTTAAGAGAACAGGATATATCATGGATGGACTTTCTTTCCAATGCGAAAACCCA- 1013
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||
Sbjct 969 GTTCAGTTAAGAGAACAGGATGTATCATGGATGGATTTTCTTTCCAACGCCAAACCCCAT 1028
Query 1014 TCTTAGTGGAGAGAACTACTATCGTCCGATTAATCTACCTGTAGACTCTGTGATTAACAT 1073
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1029 TC-TAGTGGAGAGAACTACTATCGTCCGATTTATCTACCTGTAGAGTCTGTGATTAACAT 1087
Query 1074 TCTCTTCTCATCTGGAACTACAGGTGAACCGAAAGCTATACCGTGGACACAGCTCTCGCC 1133
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 1088 TCTCTTCTCATCTGGAACTACAGGTGAGCCGAAAGCTATACCGTGGACACAACTATCACC 1147
Query 1134 AATTCGTAGTGCATGTGATGGATGGGCACATCTTGATGTCCAAGTGGGTAACACATATTG 1193
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1148 AATTCGTAGTGCTTGTGATGGATGGGCTCATCTTGATGTCCAAGTGGGTCACACATATTG 1207
Query 1194 TTGGCCTACAAATCTTGGATGGGTAATGGGACCAACTCTTATATTCTCCTGCTTTCTAAC 1253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1208 TTGGCCTACAAATCTTGGATGGGTAATGGGACCAACTCTTATGTTCTCCTGCTTTCTAAC 1267
Query 1254 CGGTGCAACACTTGCTCTCTATCA-AGGGTCTCCTCTTGGACGCGGTTTTGGAAAG--T- 1309
|||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1268 TGGTGCAACTCTCGCTCTCTA-CAGCGGGTCTCCCCTTGGCCGCGGTTTTGGAAAGTTTG 1326
Query 1310 TT---GATGCTGGAGTTATGGTTCTTGGTACTGTTCCGAGCTTGGTGAAAACTTGGAAGA 1366
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 TTCAGGATGCTGGAGTTACAGTTCTTGGTACTGTTCCAAGCTTGGTGAAAACTTGGAAGA 1386
Query 1367 GGACAAACTGTATGGAAGGGCTTAATTGGACAAAGATTAAGTATTTCGCCACTACAGGAG 1426
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1387 GAACAAACTGTATGGAAGGGCTTAATTGGACAAAGATTAAGTTTTTCGCCACTACAGGAG 1446
Query 1427 AAGCTTCCAATGTTGATGATGTTCTCTGGCTTTCTTCTAAAGCTTATTACAAACCTGTGA 1486
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1447 AAGCTTCCAATGTTGACGATGTTCTCTGGCTTTCTTCTAAAGCTGATTACAAACCTGTGA 1506
Query 1487 TCGAATGCTGTGGAGGCACGGAACTCGCTTCTTCATACATCATAGGAAGCCCGCTTCAAC 1546
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1507 TCGAATGCTGTGGAGGCACGGAACTTGCTTCGTCATACATCATAGGAAGCCCTCTTCAAC 1566
Query 1547 CGCAGGCTTTTGGAGCGTTTAGCACACCATCCATGACAACTAGAATCATCATCTTCGATG 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 CGCAGGCTTTTGGAGCGTTTAGCACACCATCCATGACAACTAGAATCATCATCTTCGATG 1626
Query 1607 AAAATGGCGTCCCATATCCGGATGATCAACCATGTACTGGAGAAGTCGGTTTGCTCCCCC 1666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1627 AAAATGGCGTCCCATATCCGGATGATCAACCATGTACTGGAGAAGTCGGTTTGTTCCCCC 1686
Query 1667 AGCACCTTGGGGCCACGGATAGACTTCTGAACGCAAACCACGACGAGGTTTACTTCAAGG 1726
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 AGCACCTTGGGGCCACGGATAGACTTCTGAATGCAAATCACGACGAGGTTTACTTCAAGG 1746
Query 1727 GAATGCCAATGTACAAGGAAACAAGACTTAGAAGACACGGTGACATCGTGAAGCGAACCA 1786
||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1747 GAATGCCCATGTATAAGGAAACACGACTTAGAAGACACGGTGACATTGTGAAGCGAACTG 1806
Query 1787 TAGGAGGATATTACAATGTTCAAGGCAGAGCTGATGATACCATGAACCTTGGAGGCATTA 1846
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807 TTGGAGGATATTACAATGTTCAAGGTAGAGCTGATGATACCATGAACCTTGGAGGCATTA 1866
Query 1847 AGACGAGTTCTATTGAGATTGAACGGGTGTGTGATCAAGCTGATGAGTGCATCTCTGAGA 1906
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 AGACGAGTTCTATTGAGATCGAACGTGTGTGTGATCAAGCTGATGAGTGCATCTCTGAGA 1926
Query 1907 CAGCTGCAGTCAGCTTAACACCACCTAACGGTGGTCCAGAGTTGCTGGTCATATTCGCCG 1966
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1927 CAGCTGCAGTCACCTTAACACCACCTAACGGTGGTCCAGAGTTGCTGGTCATATTCGCAG 1986
Query 1967 TCTTGAAAGAAGGGTTCAAGAAACAGAGTG-AGGAAGAGCTAAAGATGAAATTTTCAAGA 2025
|||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 TCTTGAAAGAAGGGTTCAAGCAACAGAGTGGAG-AAGAGCTAAAGATGAAATTTTCAAGA 2045
Query 2026 ACCATTCAAAAAGATCTTAATCCTCTCTTCAAGGTGAGTTTTGTGAAGATTGTGCCAGAG 2085
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2046 ACCATTCAAAAAGATCTTAATCCTCTCTTCAAGGTGAGTTTTGTGAAGATTGTGCCGGAG 2105
Query 2086 TTTCCAAGAACAGCTTCTAACAAGTTACTGAGAAGAG 2122
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 2106 TTTCCAAGAACAGCTTCTAGCAAGCTACTGAGAAGAG 2142
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 395501927149
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5