BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg315410
Length=3837
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G58230.1 | Symbols: | binding | chr1:21566148-21579123 FORW... 6421 0.0
> AT1G58230.1 | Symbols: | binding | chr1:21566148-21579123 FORWARD
LENGTH=8256
Length=8256
Score = 6421 bits (3477), Expect = 0.0
Identities = 3724/3845 (97%), Gaps = 10/3845 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACCAATGAAAGATGGTGGAATTTGTATGACAATCTGTGGAGGATAATATGTGATATA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4156 ATGACCAATGAAAGATGGTGGAATTTGTATGACAATCTGTGGAAGATAATATGTGATATT 4215
Query 61 AATGGAAGGGGTCTGGTAAAGATGTCTCCCAAATC-TTCAGCTACTGGTCCCTCTATTGG 119
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4216 AATGGAAGGGGTCCGGTAAAGATGTCTCCCAAATCGTT-AGCTACTGGTCCCTCTATTGG 4274
Query 120 CCAAAGAGCAAGAGGTTTAGTAGAATCATTGAATGTTCCCGCTGCTGAAATGGCTGCAGT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4275 CCAAAGAGCAAGAGGTTTAGTAGAATCATTGAATGTTCCAGCTGCTGAAATGGCCGCAGT 4334
Query 180 TGTTGTGTCAGGAGGAATTGGCAGTGCATTGAGTGGAAAAATGAACAAAAACGTTGATAA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4335 TGTTGTGTCAGGAGGAATTGGCAGTGCATTGAGTGGAAAAATGAACAAAAACGTTGATAA 4394
Query 240 AGCCATGCTCCTAAGGGGGGAGAAATGTCCACGGATCGTGTTTAGGCTTGTCACCCTTTA 299
||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4395 AGCAATGCTCCTAAGGGGGGAGAAATGCCCACGAATCGTGTTTAGGCTTGTCACCCTTTA 4454
Query 300 TCTGTGCATGTCTTCACTGGAAAAAGCCACTAGATGTGTACAGCAGGTGACCTCACTCTT 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4455 TCTGTGCATGTCTTCACTGGAAAAAGCCACTAGATGTGTACAGCAGGTGACCTCACTCTT 4514
Query 360 GCCTTCCTTTTTAGCTGCTGATGATGAACAAAGCAAGAGCAGATTGCATCTCTTTATTGG 419
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4515 GCCTTCCTTCTTAGCTGCTGATGATGAACAAAGCAAGAGCAGACTGCATCTCTTTATTGG 4574
Query 420 GTGTTTGCTTTATGTGAGATCCCAGTATGGAAAGTTAGATGACGGTGCTCGTTTCCATGT 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4575 GTGTTTGCTTTATGTGAGATCCCAGTATGGAAAGCTAGACGACGGTGCTCGTTTTCATGT 4634
Query 480 CATATCGCACCTGATACGTGAAACTGTAAGTTGTGGAAAGTCCATCCTTGCCACCAGTGG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4635 CATATCGCACCTGATACGTGAAACTGTAAGTTGCGGAAAATCCATCCTTGCCACCAGTGG 4694
Query 540 TATGAATAAGGATGACAGCTCTGATTCTGGTGGAATCTTCAAAGAAATGGGCTCTATCCA 599
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4695 TATGAATAAAGATGACAGCTCTGATTCTGGTGGAATCTTCAAAGAAATGGGCTCTATCCA 4754
Query 600 GAATCTTATACACAAAGACCGTGTGCTTGCTGCGGTCACTGATGAAACAACATACATGAA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4755 GAATCTTATACACAAAGACCGTGTGCTTGCTGCGGTCACTGATGAAACAACATACATGAA 4814
Query 660 AACATTGATATCTGATCGTA-----C-AGTGCAAGCCCTTGATGAAAGGAATAACGAAAC 713
|||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 4815 AACATTGATATCTGATCGTACTCGTCAAGTACAAGCCCTTGGTGAAAGGAATAATGAAAC 4874
Query 714 ATTAACTATAGAACGCAACAGCAAGAAAGCTTTTGATGACGAGCTGCAAAACGTTTTAAA 773
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4875 ATTATCTATAGAATGCAACAGCAAGAAAGCTTTTGATGGTGAGCTGCAAAACGTTTTAAA 4934
Query 774 AACTGTTCTTACATGGGATGAAAATAGACGAGTTGCAGTGCAATTAAGCCATGAAGAGAA 833
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4935 AACTGTTGTTACATGGGATGAAAATAGACGAGTTTCAGTGCAATTAAGCCATGAAGAGCA 4994
Query 834 ACAGCAAAATGTTACTGAGAAATGGATTCACATGCTGCGATCTTTGATGGATGAGAGGGG 893
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4995 ACAACAAAATGTTACTGAGAAATGGATTCACATGCTGCGATCTTTGATGGATGAGAGGGG 5054
Query 894 TCCTTGGTCTGCAACTCCTTTTCCTAATAACATTTTAAACCGCTGGAAACTCGACAGGAC 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5055 TCCTTGGTCTGCAACTCCTTTTCCTAATAACATTTTAAACCGCTGGAAACTTGACAGGAC 5114
Query 954 AGAAGATTCTTGGAGGCGTAGACCAAAGTTGAGACGAAATTATCATTTTGACGAAAGGCT 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5115 AGAAGATTCTTGGAGGCGTAGACCAAAGTTGAGACGAAATTATCATTTTGACGAAAGGCT 5174
Query 1014 GTGTCATCCACCTTCTACTTCCACTGCCACTGAAAATGAGACTTCAAACGTTATTAATGA 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5175 GTGTCATCCACCTTCTACTTCCACTGCCACTGAAAATGAGACTTCAAACGTTATTAATGA 5234
Query 1074 AAGCAAGTCTGGTGTGATACATATACCTGAACAGATGAAGAAATTTTTACTAAAAGGCAT 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5235 AAGCAAGTCTGGTGTGATACATATACCTGAACAGATGAAGAAATTTTTACTTAAAGGCAT 5294
Query 1134 TCGCAGGATAACTGATGAGGGTGGCGCAGAATCCTGTGAGAATGACAGTAGTCAAAGT-G 1192
|||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 5295 TCGCAGGATAACCGATGAGGGTGGCTCAGATTCCTGTGAGAATGACAGTAGTCAA-GCCG 5353
Query 1193 AGGAAAGTTTCATGGATACTTCTGCAGATATCCAGTTCTCTGAGCTTGTGAGAACCAGCA 1252
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5354 AGCAAAGTTTCATGGATACTTCTGCAGATATCCAGTTCTCTGAGCTTGTGAGAACCAGCA 5413
Query 1253 GTGGTCTCAAGGATGTCGTACAGGATAAAGTAGATGCATCTTCTCTTGAAGTTGATACCA 1312
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 5414 GTGGTCTCAAGGATGTCGTACAGGATAAAGTAGATGCATCTTCTCTAGAAGTTGGTACCA 5473
Query 1313 GCGAGGTTTTGACATCAGTTCCTTGTGTTCTTATAACTCCGAAGAGGAAACTGGCTGGTT 1372
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5474 GCGAGGTTTTGACATCAGTTCCTTGTGTTCTCGTAACTCCGAAGAGGAAACTGGCTGGTT 5533
Query 1373 GGTTGGCAGTTATGAAAAACGTTTTGCATTTCTCTGGGGAGTTTTTGGTGGAAGGAACTG 1432
||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5534 GGTTGGCAGTTATGAAAAATGTTTTACATTTTTCTGGGGAGTTTTTGGTGGAAGGAACTG 5593
Query 1433 GTGGATCAGCTGTCTTCAAGAACTTTAGCACTTCAAAGGGTAGTGATGTAACAAAGGCTG 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5594 GTGGATCAGCTGTCTTCAAGAACTTTAGCACTTCAAAGGGTAGTGATGTAACAAAGGCTG 5653
Query 1493 AAAATAAACAGAACCTTGTAAAATGGTCTTCGCCTTATGATAGTGAGACGTTCCTAGATT 1552
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5654 AAAATAAACAGAACCTTGTAAAATGGTCTTCGCCTTATGATAGTGAGACGTTTCTAGATT 5713
Query 1553 TGGAATCAGGAAACAAAAATAAGAAACCCTTAAAAAAGGTTAAGCGCCACAGAAGATGGA 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5714 TGGAATCAGGAAACAAAAATAAGAAACCCTTAAAAAAGGTTAAGCGCCACAGAAGATGGA 5773
Query 1613 AAATAGGGAAGGTGAAAAGTGTTCATTGGACGCGGTATTTGCTTCAGTACACAGCTCTGG 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 5774 AAATAGGGAAGGTGAAAAGTGTTCATTGGACGCGGTATTTGCTTCAGTATACAGCTCTTG 5833
Query 1673 AGATTTTCTTCCAGGAATCTGTACCCCCAGTCTTTCTAAATTTTGCATCTCAAAAGAATG 1732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5834 AGATTTTCTTCCAGGAATCTGTACCCCCAGTCTTTCTCAATTTTGCATCTCAAAAGAATG 5893
Query 1733 CAAAGGAGGTCGGCATGTTAATAGTTTCTACCAGGAATGAATTCCTGTTTCCAAAGAATG 1792
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5894 CAAAGGAGGTCGGGATGTTAATAGTTTCTACCAGGAATGAATTCCTGTTTCCAAAGAATG 5953
Query 1793 TTGCTAGGGACAGGACTGCAATGATTTCGTTTGTTGACAGAAAAATAGCCATGGAGATGG 1852
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 5954 TTCCTAGGGACAGGACTGCAATGATTTCGTTTGTTGACAGAAGAATAGCTATGGAGATGG 6013
Query 1853 CAGAAACAGCCAGAGACAGATGGAGAAGTAGAGAGATTACAAATTTTGAATACTTGATGA 1912
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6014 CAGAAACAGCCAGAGACAGATGGAGAAGGAGAGAGATTACAAATTTTGAATACTTGATGA 6073
Query 1913 TTCTCAACACCCTTGCAGGCAGATCTTATAATGATTTGACTCAGTATCCTGTTTTTCCTT 1972
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6074 TTCTCAACACCCTTGCAGGCAGATCTTACAATGATTTGACTCAGTATCCTGTTTTCCCTT 6133
Query 1973 GGGTGGTGGCTGACTACTCATCAGAGACTCTTGATTTTAGCAAAGCATCTACCTTTCGTG 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6134 GGGTGGTGGCTGACTACTCATCAGAGACTCTTGATTTTAGCAAAGCATCTACCTTTCGTG 6193
Query 2033 ATCTTTCTAAACCGGTTGGAGCTTTAGATACAAGAAGGTTTGAGATTTTTGAGGACAGAT 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6194 ATCTTTCTAAACCGGTTGGAGCTTTAGATACAAGAAGGTTTGAGATTTTTGAGGACAGAT 6253
Query 2093 ATCACAGCTTCTCTGATCCTGATATACCTAGTTTCTATTACGGATCCCACTATTCAAGTA 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6254 ATCACAGCTTCTCTGATCCTGATATACCTAGTTTCTATTACGGGTCCCACTATTCAAGTA 6313
Query 2153 TGGGAAGTGTGTTGTATTACCTTTTAAGGTTAGAGCCGTTTACATCCCTTCATCGTAGTC 2212
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6314 TGGGAAGTGTGTTGTATTACCTTTTGAGGTTAGAGCCGTTTACATCCCTTCATCGTAGTC 6373
Query 2213 TGCAGGGTGGTAAATTTGATCACGCAGATCGTCTTTTCCAAAGTGTTGAGGGGTCCTTTC 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6374 TGCAGGGTGGTAAATTTGATCACGCAGATCGTCTTTTCCAAAGTGTTGAGGGGTCCTTTC 6433
Query 2273 GAAATTGCCTGTCCAATACAAGCGATGTAAAAGAACTGATCCCTGAGTTCTTCTACATGC 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6434 GAAATTGCCTGTCCAATACAAGCGATGTAAAAGAATTGATCCCTGAGTTCTTCTACATGC 6493
Query 2333 CTGAATTTCTGGTGAATTCTAACTCTTACCATCTTGGAGTGAAACAAGACGGTGAACCTC 2392
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 6494 CTGAATTTCTGGTTAATTCTAACTCGTACCATCTTGGAGTAAAACAAGATGGTGAACCTC 6553
Query 2393 TTAAAGATGTTTGTCTACCTCCATGGGCTAAGGGTTCTCCAGAGATGTTCATTGCTCGTA 2452
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6554 TTGGTGAAGTTTGTCTACCTCCATGGGCTAAGGGTTCTCCAGAGATGTTCATTGCTCGTA 6613
Query 2453 ATAGAGAAGCACTAGAGAGCGAGTATGTTAGCTCACATCTCCATGATTGGATTGATTTGA 2512
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6614 ATAGAGAAGCCCTAGAGAGCGAGTATGTTAGTTCACATCTCCATGATTGGATTGACTTGA 6673
Query 2513 TATTTGGACACAAACAGCGTGGAAAACCAGCTGTGGAGGCTGCAAATATCTTTTATTACC 2572
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6674 TATTTGGACACAAACAGCGTGGCAAACCAGCTGTGGAGGCTGCAAATATCTTTTATTACC 6733
Query 2573 TTACATATGAAGGTGCTGTCGATGTTGAAAATATGGAAGATGAACTGCAAATATCAGCCA 2632
|||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 6734 TTACATATGAAGGTGCTGTCGACGTAGAAAACATGGAAGATCAACTGCAAATATCAGCAA 6793
Query 2633 TTGAAGATCAGATCGCTAATTTTGGTCAAACTCCAATCCAAATATTCCGGAAGAAACATC 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6794 TTGAAGATCAGATCGCTAATTTTGGTCAAACTCCAATCCAAATATTCCGGAAGAAACATC 6853
Query 2693 CGAGAAGAGGGCCACCTATTCCAATTGCACATCCGTTGTACTTTGCACCTGCTTCCATTA 2752
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6854 CGAGAAGGGGGCCACCTATTCCAATTGCACATCCGTTGTACTTTGCGCCTGCTTCCATTA 6913
Query 2753 ATTTGACTTCTATTCTTCCCGCTACAACTCATTCCCCATCAGCAGTTCTATATGTTGGTG 2812
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6914 ATTTGTCTTCTATTCTTCCCGCTACAACTCATTCCCCATCAGCAGTTCTATATGTTGGTG 6973
Query 2813 TAGTGGATTCAAATATAGTTCTCGTTAACCAGGGTCTAACTTTGTCAGTCAAGATTTGGT 2872
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6974 TAGTGGATTCAAATATAGTACTCGTAAACCAGGGTCTAACTTTGTCAGTCAAAATTTGGT 7033
Query 2873 TGACAACTCAACTACATTCTGGTGGAAATTTTACTTTTTCTAGCGCTCAGGATCCATTCT 2932
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7034 TGACAACTCAACTACATTCTGGCGGAAATTTTACATTTTCTAGCGCTCAGGATCCATTCT 7093
Query 2933 TTGGAGTTGGCTCTGATGTTCTCTCTCCCCGTAACATTGGAAGTCCCCTAGCAGACAATG 2992
|||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 7094 TTGGAGTTGGTTCGGATGTTCTTTCTCCCCGTAACATTGGAAGTCCCCTAGCAGACAACG 7153
Query 2993 TTGAACTTGGATCACAGTGCTTTGCCGCAACGCAAACGCCACTGGAAAACTTTCTGGTTT 3052
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 7154 TTGAACTTGGATCACAGTGCTTTGCTGCAATGCAAATGCCACTGGAAAACTTTCTGGTTT 7213
Query 3053 CATGTGGGAACTGGGAGAACAGTTTTCATGTCATATCGTTGACTGATGGCCGGGTAGTCC 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 7214 CATGTGGGAACTGGGAGAACAGTTTTCATGTCATATCCTTGACTGATGGTCGGGTAGTCC 7273
Query 3113 AAAGCATCCGACATCATAAAGATGTTGTAAGCTGTGTTGCAGTGACTGCTGATTCGACTA 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7274 AAAGCATCCGACATCATAAAGATGTTGTAAGCTGTGTTGCAGTGACTGCTGATTCGACTA 7333
Query 3173 TACTTGCAACTGGTAGCTATGATACGACTGTGATGGTGTGGGACATTCTCCGCATGAGAA 3232
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7334 TCCTGGCAACTGGTAGCTATGATACGACTGTGATGGTGTGGGACATTCTCCGCATGAGAA 7393
Query 3233 CACCTGAAAAGAGGGTTAGAAATACCCACACAGAAGTACTGCGGAAAGATATCGTCATAG 3292
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 7394 CACCTGAAAAGAGGGTTAGAAATACCCACGCAGAAGTTCTGCGGAAAGATATCGTCATAG 7453
Query 3293 CCGATGCTCCTTCTCATATCCTTTGTGGTCATGATGATATAATAACCTGTTTATATGTCA 3352
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 7454 CCGATGCTCCTTCTCATATTCTTTGTGGCCATGATGATATAATAACCTGTCTATATGTCA 7513
Query 3353 GCACCGATCTTGATATAGTCATCAGTGGGTCAAAAGATGGAACCTGTGTATTCCACACAT 3412
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7514 GCACTGATCTTGATATAGTCATCAGTGGGTCAAAAGATGGAACCTGTGTATTCCACACAT 7573
Query 3413 TGCGGGAAGGAAGATACATAAGATCTTTAAAACATCCTTCGGGCAGTGCAGTTTCAAAGC 3472
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 7574 TGCGGGAAGGGAGATACATAAGATCTTTAAAACATCCTTCGGGCAGTGCAGTCTCAAAGC 7633
Query 3473 TTGCTGCATCGCACCATGGACGGATTGTTCTGTATGGTGATGATGATCTTAGTCTACACC 3532
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 7634 TTGCTGCATCGCACCATGGACGGATTGTTCTATACGGTGATGATGATCTTAGTCTGCACC 7693
Query 3533 TCTACTCCATAAACGGAAAACATCTGGCCAGCTCAGAATCAAATGGACGCATCAACTGTC 3592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 7694 TCTACTCCATAAACGGAAAACATCTGGCCAGCTCAGAGTCAAATGGACGAATCAACTGTC 7753
Query 3593 TCGAACTTAGTAAGTGTGGAGAGTTCTTGGTCAGTGCCGGTGACCAAGGACAAATAATTG 3652
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7754 TTGAACTTAGTAAGTGTGGAGAGTTCTTGGTCAGTGCCGGTGACCAAGGACAAATAATTG 7813
Query 3653 TACGGTCTATGAACACCCTTGAAGTAGTAAGACGATATAACGGCGCAGGGAAAATAATCA 3712
| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7814 TGCGGTCTATGAACACCCTTGAAGTAGTAAAACGGTATAACGGCGCAGGGAAAATAATCA 7873
Query 3713 CCTCTCTTACAGTAACTCAGGAAGAGTGTTTCTTAGCAGGTACAAAAGATGGAGCCCTTC 3772
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 7874 CCTCTCTGACAGTAACTCAGGAAGAGTGTTTCTTAGCAGGGACAAAAGATGGAGCCCTTC 7933
Query 3773 TTGTTTATTCGATCGAGAATCCTCAACATCGGAAAACGAGCCCAATCTGGAGCATAAAAT 3832
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7934 TTGTTTATTCGATCGAGAATCCTCAACATCGGAAACCGAGCCCAATCTGGAGCATAAAAT 7993
Query 3833 CCTGA 3837
|||||
Sbjct 7994 CCTGA 7998
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 191136052830
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5