BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg315894
Length=3099
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G68750.1 | Symbols: ATPPC4, PPC4 | phosphoenolpyruvate carbo... 5025 0.0
> AT1G68750.1 | Symbols: ATPPC4, PPC4 | phosphoenolpyruvate carboxylase
4 | chr1:25822942-25828107 REVERSE LENGTH=3102
Length=3102
Score = 5025 bits (2721), Expect = 0.0
Identities = 2973/3099 (96%), Gaps = 0/3099 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGGACACGACAGATGATATCGCGGAGGAAATCTCATTCCAAAGCTTCGAAGACGAC 60
||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4 ATGACGGACACAACAGACGATATCGCAGAGGAAATCTCATTCCAAAGCTTCGAAGATGAC 63
Query 61 TGCAAATTGCTCGGCAGTCTCTTCCATGACGTGTTACAAAGGGAAGTCGGCAACCCATTC 120
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 64 TGCAAATTGCTCGGTAGTCTCTTCCATGATGTGTTACAAAGGGAAGTTGGCAACCCATTC 123
Query 121 ATGGAAAAAGTTGAACGCATTCGGATTCTTGCTCAGAGTGCGTTAAATTTGCGAATGGCT 180
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 124 ATGGAAAAAGTCGAACGCATTCGGATTCTTGCTCAGAGTGCGTTAAATTTGCGTATGGCT 183
Query 181 GGTATTGAGGATACCGCAAACCTTTTGGAGAAGCAATTGACTAGTGAGATATCCAAAATG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 184 GGTATTGAGGATACCGCAAACCTTTTGGAGAAGCAATTGACTAGTGAAATATCCAAAATG 243
Query 241 CCACTAGAGGAAGCCTTAACCTTGGCTCGTACATTCACTCATTCTCTTAACTTAATGGGC 300
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 CCACTAGAAGAAGCCTTAACGTTGGCTCGTACATTCACTCATTCTCTTAACTTAATGGGC 303
Query 301 ATTGCAGACACTCATCACAGAATGCATAAAGTCCATAACGTTACACAACTTGCTAGATCT 360
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 304 ATTGCAGACACTCATCACAGAATGCACAAAGTCCATAACGTTACACAACTTGCAAGATCT 363
Query 361 TGTGATGATATATTCAGTCAGCTATTGCAAAGTGGAATTTCTCCAGAGGAACTTTACAAT 420
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 364 TGTGATGATATATTCAGCCAGCTATTGCAAAGTGGAATCTCTCCAGACGAACTTTATAAA 423
Query 421 ACTGTTTGCAAACAGGAGGTCGAAATTGTTCTTACTGCTCATCCTACTCAAATTAATCGA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 424 ACTGTTTGCAAACAGGAGGTCGAAATTGTTCTTACTGCTCATCCTACCCAAATAAATCGA 483
Query 481 AGAACCTTGCAGTACAAGCATCTTAGAATTGCTCATCTTCTAGAATATAACACCAGATCA 540
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 484 AGAACCTTGCAGTACAAGCATATTAGAATTGCTCATCTTCTAGAATATAACACTAGATCA 543
Query 541 GATCTCAGCCTTGAAGATCGCGAAACCCTCATTGAAGATTTGGTTAGAGAGATAACTTCA 600
||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 544 GATCTAAGCGTTGAAGATCGCGAAACGCTCATTGAAGATTTGGTTAGAGAGATTACTTCA 603
Query 601 CTATGGCAAACTGATGAGCTTAGACGTCAGAAACCTACTCCAGTTGATGAAGCTAGAGCT 660
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 CTGTGGCAAACTGATGAGCTTAGACGTCAGAAACCTACTCCAGTTGATGAAGCTAGAGCT 663
Query 661 GGTCTGAACATTGTGGAGCAATCCCTTTGGAAAGCTGTACCACATTACCTGCGTCGTGTC 720
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 664 GGTCTAAACATAGTGGAGCAATCCCTTTGGAAAGCAGTACCACAATACCTGCGTCGTGTC 723
Query 721 AGCACTTCCTTGAAGAAGTTCACAGGGAAGCCACTTCCACTAACATGCACTCCTATAAAA 780
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 724 AGCAATTCCTTGAAGAAGTTTACAGGGAAGCCACTTCCACTAACATGCACTCCTATGAAA 783
Query 781 TTTGGTTCTTGGATGGGAGGTGATAGAGATGGAAACCCAAATGTCACGGCAAAGGTCACG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 TTTGGTTCTTGGATGGGAGGTGATAGAGATGGAAATCCAAATGTCACGGCAAAGGTCACG 843
Query 841 AAAGAAGTATCTCTCTTGTCTAGATGGATGGCTATCGATCTATACATAAGAGAGGTTGAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 844 AAAGAAGTATCTCTCTTGTCTAGATGGATGGCTATTGATTTGTACATAAGAGAGGTTGAT 903
Query 901 AGCTTAAGATTTGAACTATCTACGGATCGATGCAGTGATAGGTTTTCAAGATTGGCAGAT 960
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 904 AGCTTAAGATTTGAATTATCTACGGATCGATGCAGTGATAGGTTTTCAAGATTAGCTGAT 963
Query 961 GAAATTCTTGAAAAGGATTATGATAGAGGCCAATCAAATTTCCAAAAGCAACAAAGTTCA 1020
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 AAAATTCTTGAAAAGGATTATGATAGAGGAAAATCAAATTTCCAAAAGCAACAAAGTTCA 1023
Query 1021 TCATCCTTGCCAACACAACTTCCAGCTAGAGCTCACCTTCCTTCTTGCATTGACTTTGGT 1080
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1024 TCATGCTTGCCAACACAACTTCCAGCTAGAGCTCACCTTCCTGCTTGCATTGACTTTGGT 1083
Query 1081 GAATCACGACATACCAAATTCGAAATTGCGACGACAGATTATATGCCACCCAATCTTCAG 1140
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1084 GAATCACGACATACCAAATTTGAAATTGCGACGACAGATTATATGCCACCCAATCTCCAG 1143
Query 1141 AAGCAGAATGAACAAGACTTTCCGGAAAGCAACTGGGAGAAAACTGACAATGGTTCGCAG 1200
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1144 AAGCAGAATGAACAAGACTTTTCGGAAAGCGACTGGGAGAAAATTGACAATGGTTCGCGG 1203
Query 1201 TCCGGTCTTACTTCTCGAGGTTCTTTCTCATCTACTTCTCAACTTCTTTTACAGAGGAAA 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 1204 TCCGGTCTTACTTCTCGAGGTTCTTTCTCATCTACTTCTCAACTTCTTCTCCAGAGAAAA 1263
Query 1261 CTATTTGAGGAATCTCAGGTTGGGAAGACTAGTTTCCAAAAGCTACTAGAACCACCTCCA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 CTATTTGAGGAATCTCAGGTTGGGAAGACTAGTTTCCAAAAGCTACTAGAACCACCTCCA 1323
Query 1321 CTTAAACGAGCTGGAAGTGCTCCTTATCGTATTGTTCTTGGGGAAGTAAAAGAAAAGCTT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CTTAAACGAGCTGGAAGTGCTCCTTATCGTATTGTTCTTGGAGAAGTAAAAGAAAAGCTT 1383
Query 1381 GTGAAGACAAGAAGACTTCTTGAACTTCTAATTGAGGGTCTTCCTTGTGAGTATGACCCT 1440
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 GTGAAGACAAGAAGACTTCTTGAACTTCTTATTGAGGGTCTTCCTTGTGAGTATGACCCT 1443
Query 1441 TTAAACTCCTATGAAAAATCAGATCAACTTCTGGAACCATTGCTCCTCTGCTACGAATCT 1500
|||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1444 AAAAACTCCTATGAAACATCAGATCAGCTTCTTGAACCATTGCTCCTCTGTTACGAATCT 1503
Query 1501 CTACAATCATCGGGTGCTAGTGTACTAGCTGATGGACGACTTGCTGATCTCATCCGTAGA 1560
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1504 CTGCAATCATCGGGTGCTAGGGTACTAGCTGATGGACGACTTGCTGATCTGATTCGTAGA 1563
Query 1561 GTTTCTACCTTTGGAATGGTTTTGGTGAAACTTGATTTACGCCAGGAATCTGCAAGACAT 1620
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1564 GTTTCTACCTTTGGAATGGTTTTGGTGAAACTCGACTTACGCCAGGAAGCTGCAAGACAT 1623
Query 1621 TCTGAAGCATTGGATGCAATTACAACATACTTGGATATGGGTACTTATAGTGAATGGGAT 1680
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624 TCTGAAGCTTTGGATGCAATTACAACATACTTGGATATGGGTACTTATAGTGAATGGGAT 1683
Query 1681 GAAGAGAAAAAATTAGAATTTTTGACCAGAGAACTAAAAGGGAAACGACCTCTTGTTCCT 1740
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684 GAAGAGAAGAAATTAGAATTTTTGACAAGAGAACTAAAAGGGAAACGACCTCTTGTTCCT 1743
Query 1741 CCATGTATTAAGGTTGGTCCTGACGTCAAAGAAGTATTGGACACATTCCGAGTCGCTGCG 1800
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744 CAATGTATTAAGGTTGGTCCTGACGTCAAAGAAGTATTGGACACATTCCGAGTCGCTGCT 1803
Query 1801 GAGCTTGGAAGTGAATCACTTGGAGCTTATGTTATTTCTATGGCTTCTAATGCAAGTGAT 1860
|| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1804 GAACTTGGAAGTGAATCACTTGGCGCTTACGTTATTTCTATGGCTTCAAATGCAAGTGAT 1863
Query 1861 GTCCTTGCTGTGGAGCTTCTTCAAAAGGATGCTCGACTTGCTATAACTAGCGAACATGGA 1920
||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1864 GTCCTCGCTGTGGAACTTCTTCAAAAAGATGCTCGACTTGCTTTAACTAGCGAACATGGA 1923
Query 1921 AAACCATGTCCCGGTGGAACGCTACGAGTGGTACCTCTTTTTGAAACGGTGAATGATTTA 1980
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 AAACCATGTCCTGGTGGAACGCTACGAGTGGTACCTCTTTTTGAAACGGTGAATGATTTA 1983
Query 1981 AGAGCCGCTGGTCCTTCGATAAGGAAATTGCTCTCAATCGATTGGTATAGGGAACACGTC 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1984 AGAGCCGCTGGTCCTTCGATAAGGAAATTGCTCTCAATCGATTGGTATAGGGAACACATC 2043
Query 2041 CAAAAGAACCACAACGGTCACCAAGAGGTAATGGTTGGATACTCTGATTCTGGAAAAGAT 2100
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044 CAAAAGAACCACAACGGTCACCAAGAGGTGATGGTTGGATACTCTGATTCTGGAAAAGAT 2103
Query 2101 GCTGGACGTTTTACAGCAGCATGGGAACTCTACAAAGCACAAGAAAATGTTGTGGCTGCT 2160
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2104 GCTGGACGTTTTACTGCAGCATGGGAACTCTACAAAGCTCAAGAAAATGTTGTTGCTGCT 2163
Query 2161 TGTAATGAATTTGGAATCAAAATCACATTATTTCATGGACGAGGAGGAAGCATTGGTCGT 2220
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2164 TGTAATGAATTTGGAATCAAAATAACATTATTTCATGGACGAGGAGGAAGCATTGGTCGT 2223
Query 2221 GGTGGTGGTCCGACTTATCTCGCTATACAGTCCCAACCACCAGGCTCTGTAATGGGCTCT 2280
||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2224 GGTGGTGGTCCAACCTATCTCGCTATTCAGTCCCAACCACCAGGCTCTGTAATGGGCTCT 2283
Query 2281 TTGCGTTCAACTGAGCAAGGTGAGATGGTTCAAGCTAAGTTTGGGATACCACAAACGGCT 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2284 TTGCGTTCAACTGAGCAAGGTGAGATGGTTCAAGCTAAGTTTGGGATACCACAAACGGCT 2343
Query 2341 GTTAGGCAACTAGAGGTATACACAACCGCTGTTCTACTTGCTACCTTAAAACCTCCTCAG 2400
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2344 GTTAGGCAACTAGAGGTATACACAACCGCGGTTCTACTCGCTACCTTAAAGCCTCCTCAG 2403
Query 2401 CCACCTCGAGAGGAAAAATGGCGAAACCTAATGGAAGAAATCTCTACAATCAGTTGCCAA 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2404 CCACCTCGAGAGGAAAAATGGCGAAACCTAATGGAAGAAATCTCTGGAATCAGTTGCCAA 2463
Query 2461 CACTATAGAAGCACAGTGTATGAGAACCCAGAGTTCCTATCTTATTTTCATGAGTCAACA 2520
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2464 CACTATAGAAGCACAGTGTATGAAAACCCAGAGTTTCTATCTTATTTTCATGAGGCAACA 2523
Query 2521 CCTCAAGCAGAACTCGGTTTCCTCAATATAGGAAGCCGACCAACGCGAAGAAAGAGCTCT 2580
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2524 CCGCAAGCAGAACTTGGTTTCCTCAATATAGGAAGCCGACCAACACGAAGAAAGAGCTCT 2583
Query 2581 AGCGGCATAGGTCATCTCCGAGCTATCCCTTGGGTCTTTGCTTGGACTCAAACAAGATTT 2640
|| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2584 AGTGGAATAGGACATCTCCGAGCTATCCCTTGGGTCTTTGCTTGGACTCAAACAAGGTTT 2643
Query 2641 GTTCTTCCAGCTTGGCTTGGTGTAGGGGCTGGCTTAAAGGGAGTCTCTGAGAAGGGTCAT 2700
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2644 GTTCTTCCAGCTTGGCTTGGTGTAGGGGCTGGTTTAAAGGGAGTTTCTGAGAAGGGTCAT 2703
Query 2701 GCGGATGATCTTCAAGAGATGTATAAAGAATGGCCATTTTTTCAGTCCACCCTTGAACTT 2760
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2704 GCGGATGATCTTAAAGAGATGTACAAAGAATGGCCATTTTTTCAGTCCACCCTTGAACTT 2763
Query 2761 ATAGAGATGGTGTTAGCTAAAGCTGACATCCCCATGACCAAACACTACGACGAACAACTT 2820
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2764 ATAGAGATGGTGTTAGCTAAAGCAGACATTCCAATGACCAAACACTACGACGAACAACTT 2823
Query 2821 GTGTCTGAGAAAAGAAGAGGACTTGGCAATGAACTAAGAAAGGAACTAATGACTACTGAG 2880
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2824 GTGTCTGAGAAAAGAAGAGGACTTGGCACTGAGCTAAGAAAAGAACTAATGACTACTGAG 2883
Query 2881 AAGTACGTTCTTGTGATAAGTGGCCACGAGAAACTCTTGCAGAACAATAAGAGCTTGAAG 2940
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2884 AAGTACGTTCTTGTGATAAGTGGTCACGAGAAACTCTTGCAGGACAATAAGAGCTTGAAG 2943
Query 2941 AAACTCATTGAGAGTAGACTTCCGTATCTCAACGCAATGAACATGTTACAAGTTGAAATT 3000
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2944 AAACTCATTGATAGTAGACTTCCGTATCTCAACGCAATGAACATGTTACAAGTTGAAATT 3003
Query 3001 CTTAAGAGGCTAAGACGTGATGAAGATAATAATAAGCTTAGAGATGCTTTGCTTATCACA 3060
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3004 CTTAAGAGGCTAAGACGTGATGAAGATAACAATAAGCTAAGAGATGCTTTGCTTATCACA 3063
Query 3061 ATTAATGGTATCGCTGCAGGAATGAGAAATACCGGTTAA 3099
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3064 ATCAATGGTATTGCTGCAGGAATGAGAAATACCGGTTAA 3102
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 154112848896
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5