BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg317213
Length=6102
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G03300.1 | Symbols: DCL2, ATDCL2 | dicer-like 2 | chr3:76792... 5581 0.0
AT3G03305.1 | Symbols: | Calcineurin-like metallo-phosphoester... 3541 0.0
> AT3G03300.1 | Symbols: DCL2, ATDCL2 | dicer-like 2 | chr3:767926-776214
REVERSE LENGTH=4824
Length=4824
Score = 5581 bits (3022), Expect = 0.0
Identities = 3358/3523 (95%), Gaps = 12/3523 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2586 GGTCTATACCTGTGAGAATGAGTCTGTGCTGGCTGGGTTTGTCCCCTTTTCTACACCAAG 2645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 GGTCTATACCTGTGAGAATGAGTCTGTGCTGGCTGGGTTTGTCCCCTTTTCTACACCAAG 1273
Query 2646 GTTCAAGTATTACCAGCACATGGGGATACCAAGTTCCAAACGAGCAAGTTTGGTAGAGAA 2705
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1274 CTTCAAGTATTACCAGCACATAAAAATACCAAGTCCCAAACGAGCAAGCTTGGTAGAGAA 1333
Query 2706 GCTAGAAAAACTAATGATAAAGCATCGCTTATCCCTTGCAACCTTGGATCTCAAAC-CCT 2764
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1334 GCTAGAAAGACTAACGATAAAGCATCGCTTATCCCTTGGAACCTTGGATCTC-AACTCCT 1392
Query 2765 CTACTGTTGATTCTATAGAGAAGAGACTGTCGAGGATAAGTTCAACTCTAACATATTGTT 2824
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 CTACTGTTGATTCTGTAGAGAAGAGACTGTTGAGGATAAGTTCAACTCTAACATATTGTT 1452
Query 2825 TGGATGATCTCGGAATTTTGCTGGCGCAGAAGGCTGCTCAGTCATTGTCAGCCAGTCAGA 2884
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 TGGATGATCTCGGAATTTTGCTGGCCCAGAAGGCTGCTCAGTCATTGTCAGCCAGTCAGA 1512
Query 2885 ATGACTTTTTCTTGTGGGGGGAACTAAATATGTTTAGCGTGACCTTGGTAAAAAAGTTCT 2944
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 1513 ATGACTCTTTCTTGTGGGGCGAACTAAATATGTTTAGCGTGGCCTTGGTAAAAAAATTCT 1572
Query 2945 GTTCTGATGCTTCACAGGCGTTTTTGGCTGACATACCT-AATGGTCTTAGTTGGAGTATT 3003
| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||
Sbjct 1573 GCTCTGATGCTTCACAGGAGTTTTTGGCTGAGATACCTCAA-GGTCTTAATTGGAGTGTT 1631
Query 3004 GCTAACATAAATGGAAACGTGGAGGCAGGTCTCCTAACATCAAAAACAGTCTGCCTGGTT 3063
|| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||
Sbjct 1632 GCAAACATAAATGGAAATGCGGAGGCAGGTCTCCTAACTTTAAAAACTGTCTGCCTCATT 1691
Query 3064 GAGACTCTTCTTGGTTATAGCTCAC-TGGAGAACATACGGTGCATCATTTTTGTGGATAG 3122
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 GAGACTCTTCTTGGTTATAGCTC-CTTGGAGAACATACGGTGCATCATTTTTGTGGATAG 1750
Query 3123 GGTGATAACAGCCATTGTTCTGGAATCTCTGTTGGCTGAGATTCTTCCAAACTGTAATAA 3182
||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751 GGTGATAACAGCCATCGTTCTGGAATCCCTTTTGGCTGAGATTCTTCCAAACTGTAATAA 1810
Query 3183 CTGGAAAACCAAGTACGTTGCTGGGAATAACTCTGGTCTGCAAAATCAAACTCGGAAGAA 3242
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1811 CTGGAAAACCAAGTACGTTGCAGGAAATAACTCTGGTCTGCAAAATCAAACTCGGAAGAA 1870
Query 3243 GCAAAATGAAATTGTGGAAGACTTCCGGAGAGGCTTGGTAAACATCATTGTAGCAACATC 3302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 GCAAAATGAAATTGTGGAAGACTTCCGGAGAGGCTTGGTTAACATCATTGTAGCAACATC 1930
Query 3303 TATTCTAGAGGAGGGACTAGATGTTCAAAGTTGCAATCTGGTTATCAGATTTGATCCTGC 3362
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1931 TATTCTAGAGGAGGGTCTAGATGTTCAAAGTTGCAACCTGGTTATCAGATTTGACCCTGC 1990
Query 3363 ATCCAACATTTGCAGTTTCATACAGTCTCGTGGGCGTGCCAGAATGCAAAATTCAGATTA 3422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 ATCCAACATTTGCAGTTTCATACAGTCTCGTGGGCGTGCTAGAATGCAAAATTCAGATTA 2050
Query 3423 TTTGATGATGGTGGAAAGCGGAGATCTGTTAACACAATCTCGGTTaaaaaaaTATCTTTC 3482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2051 TTTGATGATGGTGGAAAGCGGAGATCTGTTAACACAATCTCGATTAATGAAATATCTTTC 2110
Query 3483 TGGTGGGAAAAGAATGCGTGAAGAGTCTTTGCATCATTCTCTTGTTCCCTGTCCACCTCT 3542
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 TGGTGGGAAAAGAATGCGCGAAGAGTCTTTGGATCATTCTCTTGTTCCCTGTCCACCTCT 2170
Query 3543 TCCAGATGATTCAGACGAACTATTCTTCCGTGTCGAAAGTACTGGCGCAACTGTAACTCT 3602
||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2171 TCCAGATGATTCAGATGAACCACTCTTCCGTGTCGAAAGTACTGGAGCAACTGTAACTCT 2230
Query 3603 TAGCTCAAGCGTCAGCTTAATATATCATTACTGCTCAAGGCTTCCTTCAGATGAGTACTT 3662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 TAGCTCAAGCGTCAGCTTAATATATCATTACTGCTCAAGGCTTCCTTCAGATGAGTACTT 2290
Query 3663 CAAACCTGCTCCTAGATTTGATGTAAACAAGGATCAGGGGAGTTGTACCCTTTACCTTCC 3722
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2291 CAAACCAGCCCCTAGATTTGATGTAAACAAGGATCAGGGGAGTTGCACCCTTTACCTTCC 2350
Query 3723 TAAGAGCTGCCCAGTAAAAGAAGTTAAAGCTCAAGCAAATAATAAAGTGTTAAAACAAAC 3782
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2351 TAAGAGTTGCCCAGTAAAAGAAGTTAAAGCTGAAGCAAATAATAAAGTGTTAAAACAAGC 2410
Query 3783 TGTCTGTCTTGAAGCTTGCATTCAACTGCACAAAGTTGGAGCTCTAAGTGATCATCTTGT 3842
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411 TGTCTGTCTTAAAGCTTGCATTCAACTGCACAAAGTTGGAGCTCTAAGTGATCATCTTGT 2470
Query 3843 GCCTGACATGGTTCTGGCGGAAACTGTCGCACAAAAACTCGAGAAAATCCAATATAACCC 3902
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2471 GCCTGACATGGTTGTGGCGGAAACTGTCTCACAAAAACTCGAGAAAATCCAATATAACAC 2530
Query 3903 AGAGCAGCCATGTTACTTCCCCCCAGAGCTAGTCTCCCAGTTTTCAGTACAGCCGGAGAC 3962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2531 AGAGCAGCCATGTTACTTCCCCCCAGAGCTAGTCTCCCAGTTTTCAGCACAGCCGGAGAC 2590
Query 3963 AACATACCACTTCTACCTAATAAGAATGAAGCCAAACTCTCAAAGAAATTTTCATTTAAA 4022
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AACATACCACTTCTACTTAATAAGAATGAAGCCAAACTCTCCAAGAAATTTTCATTTAAA 2650
Query 4023 TGATGTTTTACTAGGCACCAGAGTTGTGCTTGAAGATGACATTGGGAACACAGGCTTCCG 4082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2651 CGATGTTTTACTAGGCACCAGAGTTGTGCTTGAAGATGACATTGGGAACACAAGCTTCCG 2710
Query 4083 GTTGGAAGATCATAAGGGTACAATAGCTGTGACATTGAGTTATGTGGGAGCTTTTCACCT 4142
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711 GTTGGAAGATCATAGGGGTACAATAGCTGTGACATTGAGTTATGTGGGAGCTTTTCACCT 2770
Query 4143 TACACAAGAGGAGGTCCTTTTGTGTAGAAGATTTCAGATAACTCTATTCCGAGTTCTTTT 4202
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2771 TACACAAGAAGAGGTCCTTTTCTGTAGAAGATTTCAGATAACTCTATTCCGAGTTCTTTT 2830
Query 4203 AGATCACAGTGTGAAAAATTTGATGGAGGCATTGAATGGATTGCTTCTCAGAGACGGGAT 4262
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
Sbjct 2831 AGATCACAGTGTGGAAAATTTGATGGAGGCATTGAATGGATTGCATCTCAGAGATGGGGT 2890
Query 4263 AGCACTTGATTATCTACTAGTTCCATCCACTCATTCACATGAAACATCTCCTATTGATTG 4322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2891 GGCACTTGATTATCTACTAGTTCCATCCACTCATTCACATGAAACATCTCTTATTGATTG 2950
Query 4323 GGAAGTGATCAGATCCGTGAATCTAACTTGTCATGA-ATCTTTGGAAAAACACGTAAATT 4381
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||
Sbjct 2951 GGAAGTGATCAGATCCGTGAATCTAACTTCTCATGAGGT-TTTGGAAAAACACGAAAATT 3009
Query 4382 GTTCTATCAACGGCGCTTCTCGTATTCTACACACAAAAGACGGCTTGTTTTGTACTTGTG 4441
|||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3010 GTTCTACCAACGGTGCTTCTCGCATTCTACACACAAAAGACGGCTTGTTTTGTACTTGTG 3069
Query 4442 TCGTACAAAATGCATTGGTTTACACACCACATAATGGATACTTCTACTGCACGAAAGGCG 4501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
Sbjct 3070 TCGTACAAAATGCATTGGTTTACACACCACATAATGGATACGTCTACTGCACAAAAGGTG 3129
Query 4502 TTCTCAACAATATAAATGCAAATTCATTCTTGACGAAGAGAAATTCTGGCGATCAGACTT 4561
||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3130 TTCTCAACAATCTAAACGGAAATTCATTATTGACCAAGAGAAATTCTGGCGATCAGACTT 3189
Query 4562 ACATAGAGTACTATGAGGAACGGCATGGGATTCAATTAAATTTTGTGGATGAACCTCTTC 4621
|||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3190 ACATTGAGTACTACGAGGAAAGGCATGGGATTCAATTAAATTTTGTGGATGAACCTCTTC 3249
Query 4622 TGAATGGAAGACACATTTTCACGTTGCATAATTATCTTCACATGACCAAGAAGAAAAAGG 4681
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 3250 TAAATGGAAGACACATTTTCACGTTGCATAGTTATCTTCACATGGCCAAGAAGAAGAAGG 3309
Query 4682 AGAAAGAGCATGACAAAGAGTTTGTTGAACTACCTCCTGAACTGTGTCATGTCATTTTGT 4741
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3310 AGAAAGAGCATGACAGGGAATTTGTTGAACTACCTCCTGAGCTTTGTCATGTCATTTTGT 3369
Query 4742 CCCCAATATCAGTTGATGTGATCTATTCGTATACTTTCATCCCATCTGTTATGCAACGCA 4801
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3370 CCCCAATATCAGTTGATATGATCTATTCATATACTTTTATCCCATCTGTTATGCAACGCA 3429
Query 4802 TTGAATCTTTGCTTATTGCATACAACCTGAAGAAGAGCATCCCAAAAGTCAATATTCCAA 4861
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3430 TTGAATCTTTGCTTATAGCATACAACCTGAAGAAAAGCATCCCAAAAGTCAATATTCCAA 3489
Query 4862 CCATCAAGGTTTTGGAAGCTATAACGACAAAGAAGTGCCAAGATCAGTTTCACTTGGAAT 4921
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 3490 CCATTAAGGTTTTGGAAGCTATTACGACAAAGAAGTGCGAAGATCAGTTCCACTTGGAAT 3549
Query 4922 CACTAGAAACTCTTGGTGACTCTTTTCTAAAATATGCTGTTTGTCAGCAACTATTCCAAC 4981
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3550 CACTAGAAACTCTTGGTGACTCTTTTCTGAAATATGCTGTTTGTCAGCAACTATTCCAAC 3609
Query 4982 ACTGCCATACTCACCATGAGGGTCTTCTTAGCGCGAAGAAAGATGGAATGATTTCAAATG 5041
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3610 ACTGTCATACTCACCATGAGGGTCTTCTTAGCACGAAGAAAGATGGAATGATTTCAAATG 3669
Query 5042 TCATGCTCTGCCAATTTGGATGTCAGCAGAAACTTCAGGGATTTATCCGCAATGAGTGTT 5101
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3670 TCATGCTCTGCCAATTTGGATGTCAGCAGAAACTTCAGGGATTTATCCGCGATGAGTGTT 3729
Query 5102 TTGAACCCAAAGGTTGGATGGTTCCTGGTCAA-CATTCTGCAGCTTATGCACTTGTAAAT 5160
||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3730 TTGAACCCAAAGGTTGGATGGTTCCAGGTCAATCA-TCTGCAGCTTATTCACTTGTAAAC 3788
Query 5161 GATACCCTACCCCAGTCTAGAAACATATACGTTGCTAGCAGGAGGAATTTGAAACGCAAG 5220
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 3789 GATACTCTACCCGAGTCTAGAAACATATACGTTGCTAGTAGGAGGAATCTGAAACGCAAG 3848
Query 5221 AGTGTGGCTGATGTTGTAGAATCACTAATTGGAGCATATCTCAGTGAGGGAGGTGAACTT 5280
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3849 AGTGTGGCCGATGTTGTAGAATCATTAATTGGAGCATATCTCAGCGAGGGAGGTGAACTT 3908
Query 5281 GGAGCTTTGATGTTCATGAATTGGGTTGGTATAAAGGTCGA-TTTCACTACTACGAAGAT 5339
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||
Sbjct 3909 GCAGCTTTGATGTTCATGAATTGGGTTGGAATAAAGGTCGACTTT-ACAACTACGAAGAT 3967
Query 5340 CCAGAGAGAGTCCCCAATACAAGCAGAGAAGCTTGTGAATGTAGGTTATATGGAGTCACT 5399
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3968 CCAGAGAGATTCCCCAATACAAGCAGAGAAGCTTGTGAATGTAGGTTATATGGAGTCGCT 4027
Query 5400 GTTGAATTACAGTTTTGAGGATAAGTCTCTTCTAGTTGAAGCATTGACTCATGGTTCATA 5459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4028 GTTGAATTACAGTTTTGAGGATAAGTCTCTTCTAGTTGAAGCATTGACTCATGGTTCATA 4087
Query 5460 CATGATGCCTGAAATTCCAAGATGCTATCAGCGGTTGGAGTTCCTCGGTGACTCGGTATT 5519
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4088 CATGATGCCTGAAATTCCAAGATGCTATCAGCGGTTGGAGTTCCTCGGTGACTCTGTATT 4147
Query 5520 GGATTATCTCATAACCAAGCATCTATACGACAAATATCCTTGTCTGTCTCCTGGACTATT 5579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4148 GGATTATCTCATAACCAAGCATCTATACGACAAATATCCTTGTCTGTCCCCTGGACTATT 4207
Query 5580 AACTGACATGCGATCAGCTTCTGTTAACAATGAATGTTATGCTCTAGTGGCGGTTAAAGA 5639
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4208 AACCGACATGCGATCAGCTTCTGTTAACAATGAATGTTATGCCCTAGTGGCGGTGAAAGC 4267
Query 5640 AAATCTGCACAAACACATCCTGCACGCCTCTCATGATCTCCACAAGCACATCTCTAGAAC 5699
||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4268 AAACCTGCACAAACACATCCTGTACGCCTCTCATCATCTCCATAAGCACATCTCTAGAAC 4327
Query 5700 AGTCAGTGAGTTCGAACAGTCTTCTTTGCAATCCACTTTCGGATGGGAATCCGATATATC 5759
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4328 TGTCAGTGAGTTTGAACAGTCTTCTTTGCAATCCACTTTCGGATGGGAATCCGATATATC 4387
Query 5760 TTTTCCTAAGGTTCTTGGAGATGTGATAGAATCTTTAGCAGGCGCGATATTTGTTGACTC 5819
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4388 TTTTCCAAAGGTTCTTGGAGATGTGATAGAATCTCTAGCAGGCGCGATATTTGTTGACTC 4447
Query 5820 AGGTTACAACAAGGAAGTAGTGTTTGCGAGTATTAAACCACTCTTGGGTTGTATGATAAC 5879
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4448 AGGTTACAACAAGGAAGTAGTGTTTGCAAGTATTAAACCACTTTTGGGTTGTATGATAAC 4507
Query 5880 TCCAGAGACTGTCAAGTTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAATTATGTCAGAAATCGCA 5939
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 4508 TCCAGAGACTGTCAAGTTGCATCCTGTGAGAGAGTTGACAGAATTATGTCAGAAGTGGCA 4567
Query 5940 GTTCGAGTTGAGTAAAGCTAGAGATTTCGATTATTTCACGGTTGAGGTGAAAGCTAAGGA 5999
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4568 GTTCGAGTTGAGTAAAGCTAAAGATTTCGATTCTTTCACGGTTGAGGTGAAAGCTAAGGA 4627
Query 6000 AATGAGTTTTGCTCACACAGCAAAGGCCTCTGATAAGAAAATGGCCAAGAAATTGGCTTA 6059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4628 GATGAGTTTTGCTCACACAGCAAAGGCCTCTGATAAGAAAATGGCCAAGAAATTGGCTTA 4687
Query 6060 CAAAGAAGTCTTGAACTTACTTAAGAAGGGCCTTGCCTCCTAA 6102
||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||
Sbjct 4688 CAAAGAAGTCTTGAACTTACTTAAGAACAGCCTGGACTACTAA 4730
Score = 839 bits (454), Expect = 0.0
Identities = 494/514 (96%), Gaps = 0/514 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1660 ATCACACTTGTACTGTGGATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGT 1719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 ATCACACTTGTACTGTGGATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGT 61
Query 1720 TACATGGCATACTTGTTGTATCTGATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTATACT 1779
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 62 TACATGGCATACTTGTTCTATCTCATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTTTGCT 121
Query 1780 GATTCCGGAAACAGAACATACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCA 1839
||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 122 GATTCTGGAGACAGAGCATACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCA 181
Query 1840 GATAGGAAACATGAATACATTGGACAACCTGATGTAATGGTTCTGGTGATCCCACATGTG 1899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 182 GATAGGAAACATGAATACATTGGACAACCTGATGTAATGGTTGTGGTGATCCCACATGTG 241
Query 1900 GTCTTTGTTGTTATCCCCAGTGTCTTGGTTGTGTGTTGTTTGGTTGCTGAGAGAGAAATC 1959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 242 GTCTTTGTTGTTATCCCCAGTGTCTTGGTTGTGTGTTGTCTGGTTGCTGAGAGAGAAATC 301
Query 1960 TACAAAGATCACATTCGAACCGTCTCTGGAAAGAAAGAGGATGATCATGACCGGGGAAGG 2019
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 302 TACAAAGATCACATTCGAACTGTCTCTGGTAAGAAAGAGGATGACCATGACCGGGGAAGG 361
Query 2020 AAGAAGAGATCACAACGCCGCTCGCTGTTATTCTCTAACAGAAGACTGTTTCGTAAATCA 2079
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 362 AAGAAGAGATCACAACGCCGCTCACTGTTATTCTCGAACAGAAGACTGTTTCGGAAATCG 421
Query 2080 CTCTTGGTGGCTTCATTAGCTCTATATTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGGCATTAGCT 2139
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 422 GTCTTGCTGGCTTCATTAGCTCTATATTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGGCATTAGGT 481
Query 2140 AGAGCTTATGAGATGAATATGGTTCATTTTCCAG 2173
|||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 482 AGAGCTTATGAGATGAATGTGGTTCATTTTCCAG 515
Score = 431 bits (233), Expect = 4e-119
Identities = 255/265 (96%), Gaps = 3/265 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2185 ACCACTGATCAAGTCTCTGCATCTCCTCTACATTTTGCTAGAAGTTATCAGGTAGAGGCA 2244
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 597 ACCACTGATCAAGTCTCTGCTTCTCCTCTACATTTTGCCAGAAGTTATCAGGTAGAGGCA 656
Query 2245 CTTGAGAAAGCTATCAAGCACAACACTATTGTCTTCTTTGAGACTGGTTCTGGCAAGACC 2304
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CTTGAGAAAGCTATCAAGCAGAACACTATTGTCTTCTTGGAGACTGGTTCTGGCAAGACC 716
Query 2305 CTTATTGCCATTATGCTTCTTCGTAGCTACT-CCTACCTTTTCCGCAAGCCTTCACCCTG 2363
|||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 717 CTTATTGCTATTATGCTTCTTCGTAGCTA-TGCCTACCTTTTCCGCAAGCCTTCACCATG 775
Query 2364 CTTCTGTGTCTTCTTGGTTCCTCAAGTGGTTCTTGTCACTCAGCAAGCAGAAGCCCTGAA 2423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 CTTCTGTGTCTTCTTGGTTCCTCAAGTGGTTCTTGTCACTCAGCAAGCAGAAGCCCTGAA 835
Query 2424 GATGCATACTGATCTACAAGT-GGT 2447
|||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 836 GATGCATACTGATCTAAAAGTTGGT 860
Score = 228 bits (123), Expect = 6e-58
Identities = 133/138 (96%), Gaps = 0/138 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2450 AGGTTCTGGTGATGACCCCTGCCATTTTGCTCGATGCATTGAGGCATAGTTTTCTGAACT 2509
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 931 AGGTTCTGGTGATGACCCCTGCCATTTTGCTCGACGCGTTGAGGCATAGTTTTCTGAGCT 990
Query 2510 TGAGCATGATCAAGGTTCTAATAGTTGATGAGTGTCATCATGCTGGGGGAAAGCACCCCT 2569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 991 TGAGCATGATCAAGGTTCTAATAGTTGATGAGTGTCATCATGCAGGGGGAAAGCACCCTT 1050
Query 2570 ATGCTTGTATCATGAGGG 2587
||||||||||||||||||
Sbjct 1051 ATGCTTGTATCATGAGGG 1068
> AT3G03305.1 | Symbols: | Calcineurin-like metallo-phosphoesterase
superfamily protein | chr3:775368-778396 REVERSE LENGTH=2493
Length=2493
Score = 3541 bits (1917), Expect = 0.0
Identities = 2099/2187 (96%), Gaps = 12/2187 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAATCGATCGGCGACGACGATGAGCTCAGTAGCAAAACAGTTTCTCTTCGGAGAAGA 60
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 126 ATGGAATCGATCGGCGACGACGATGAGCTCCGAAGCAAAACAGTTTCTCTTCCGAGAAGA 185
Query 61 ATCTCGTTTACGAttcttcttcttcttcttcttctcttAATCTCCTTGAGTACGAGGGTC 120
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 186 ATCTCGTTTACGA------TTCTTCTTCTTCTTCTGTTAATCTCCTTGAGTACAAGGGTC 239
Query 121 TCTGGTTCGATT-GACGAGTCTGGAAGAAGAGTGATTGAAGCGAGAACTGGGCAAGACTT 179
||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TCTGGTTCG-TTAGACAAATCTGGAAGAAGAGTGATTGAAGCGAGAACTGGGCAAGACTT 298
Query 180 GATTTGGGTTGTTCAGCTATCTGATCTCCATTTCAGTGTTCATCATCCCGAGAGAGCCAC 239
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 299 GATTTGGGTTGTTCAGCTATCCGATCTCCATTTCAGTGTCCATCATCCTGAAAGAGCCAT 358
Query 240 TGATTTCAAAAACAGTGTGGGCCCTGCTCTGTCTCTTATCAACCCTTCTCTCGTCCTCAT 299
|||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 359 TGATTTCAAAAACATTGTGGGTCCTGCTCTGGCTCTTATCAACCCTTCTCTCGTCTTAAT 418
Query 300 CACTGGAGATCTCACAGATGGGAAAAGCAAAGACATGTTAACAATGAAGCTAAATGAAGA 359
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 419 CACCGGTGATCTCACAGATGGGAAAAGCAAAGACATGTTAACAATGAAGTTAAATGAAGA 478
Query 360 TGAGTGGTTAGAATACGAGAGTGTGATGCAAGATGTTGTGGAA-AGAAGTGGGCTTAATA 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 479 TGAGTGGTTAGAATACGAGAGTGTGATGCAAGATGTTGT-GAAGAGAAGTGGGCTTAATA 537
Query 419 AGAGCATATTTTATGATCTCAGGGGTAACCATGACAACTTTGGTGTTCCGGCTGTTGGTT 478
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 538 AGAGCATATTTTATGATCTTAGGGGTAACCATGACAACTTTGGTGTTCCGTCTGTTGGTT 597
Query 479 CATCTGTTGATTTCTTCTCAAAGTATAGCATCAATGCACAGATGGGAAGGAAAGGAAATG 538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CATCTGTTGATTTCTTCTCAAAGTATAGCATCAATGGACAGATGGGAAGGAAAGGAAATG 657
Query 539 TTAACACCATAACTGTTGAGACTAGCGAACGTAAACATCTGTTTGTCGGTATTGACACCA 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TTAACACCATAACTGTTGAGACTAGCGAACGTAAACATCTGTTTGTCGGTATTGACACCA 717
Query 599 CAATGCATATTGGATTACGCGGCCCAACAAATCTCTTTGGGCATCCAACTGATGAACTTT 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CAATGCATATTGGATTACGCGGCCCAACAAATCTCTTTGGGCATCCAACTGATGAACTTT 777
Query 659 TGAGCTCACTCGACTCACACCTGTCGCAATGGGATAACCAATCAGCAAAACCTGTTGCAA 718
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 TGAGCTCACTCGACTCACACCTCTCGCAATGGGATAACCAATCAGCAAAACCTGTTGCAA 837
Query 719 AAATATCATTTGGGCATTTCCCATTGTCATTCACAGCGCTGTCACATTCTCAAAAGAGCC 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 AAATATCATTTGGGCATTTCCCATTGTCATTCACAGCGCTGTCACATTCTCAAAAGAGCC 897
Query 779 TTAAAGATGTTTTTCTGAAGCACTCCATCTCAGCTTATTTGTGTGGCCATCTACACTCAA 838
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 TTAAAGATGTTTTTCTGAAGCACTCTATCTCAGCTTATTTGTGTGGCCATCTACACTCAA 957
Query 839 AGTTTGGCAAGAATCTTAAAAGACATCACCACTCTGGTGGTATCAGTTTATCAGATAATG 898
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 GGTTCGGCAAGAATCTTAAAAGACATCATCACTCTGGTGGTATCAGTTTATCAGATAATG 1017
Query 899 ACTTGTTTCAGCTGAATATGAGGCAGAGTGGTGCTGAAAGTACTTCGAACTGCTCATTTG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1018 ACTTGTTTCAGCTGAATATGAGGCAGAGTGGTGCTGAAAGTACTTCGAACTGCTCTTTTG 1077
Query 959 GAGCCTTACCAGCTGCAGAATTCTGGGAATGGGAGATGGGTGACTGGAGAAAAAACAGAG 1018
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1078 GAGCCTTACCAGCTGCAGAGTTCTGGGAATGGGAGATGGGTGACTGGAGAAAAAACAGGG 1137
Query 1019 CAATGCGGATCATGGCCATTGATAGGGGTCATGTTTCATATGTTGATCTTGACTTCAAGT 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 CAATGCGGATCATGGCCATTGATAGGGGTCATGTTTCATATGTTGATCTTGACTTCAAGT 1197
Query 1079 CAAAATCCCT-AAGGACTATCATATTACCGACCTTTCCATTAGATTCACGTTTTATGTCA 1137
||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 CAAAACCCCAGAAG-ACTATCATATTACCGACCTTTCCATTAGATTCACGTTTTATGTCA 1256
Query 1138 ACATCCTTTGCACGTCACAAATACGAATGCCAACATATGATCTCATCATCCTATGACACA 1197
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1257 ACATCCTTTGCACGTCACAAATACGAGTGCCAACATATGATCTCATCATCGTATGACGCA 1316
Query 1198 ATAAGAGCCATTGTCTTTTCTCATTCCCTGATTGTGGAAGTTGTAGCTAGAGTTTATGAC 1257
|||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 ATAAGAGCCATTGTTTTTTCTCATTCTCTGGTTGTGGAAGTTGTAGCTAGAGTTTATGAC 1376
Query 1258 TCAAGCCCTGGATTTGACAACCTGGTCATGGAAGCTCCAATGAGAAAACTTGGAGGCGAT 1317
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1377 TCAAGCCCTGGATTTGATAATCTGGTCATGGAAGCTCCAATGAGAAAACATGGAGGCGAT 1436
Query 1318 TCTTCTTCTTCCGGGGCAACATTATTTTCACTTCCATGGAATTATAGGGCCTTTGAAGAT 1377
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 TCTTCTTCTTCCGGGGCAACATTCTTTTCACTTCCATGGAATTATAGGGCCTTTGAAGAT 1496
Query 1378 CCCTTACCTGATAGATTTTGGCTGCAAATAGAAGTCACTGACATCAAAGGCAGATTAACT 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1497 CCCTTACCTGATAGATTTTGGCTGCAAATAGAAGTCACTGATATCAAAGGCAGATTAACC 1556
Query 1438 TTATCAGAAATGCGACCATTTTCCATCAATGGTCTAAGCTCTAAAGTCTCATGGACATGG 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1557 TTATCAGAAATGCGACCATTTTCCATCAATGGTCTAAGCTCTAAAGTTTCATGGACATGG 1616
Query 1498 AATGAGTTCCGTGTCATGGGTTGCCAATGGGCAGCATTATATTACCCGATTCTTTGGGCT 1557
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1617 AATGAGTTCCGTGTCATGGGCTGCCAGTGGGCGGCATTATATTACCCGATTCTTTGGCCT 1676
Query 1558 GCTATGTATAGTTTGTTTCTCGTTTTTCTTATCCCCAAATGCATCATCATCGTTTTCAAG 1617
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 GCTCTATATAGTTTGTTTCTCGTTTTTCTTATCCCCAAATGCATCATCATCGTTTTCAAG 1736
Query 1618 AAGCAGTACACTCTCAAGAAGTTCATTGCCAAGAGAGGACCAATCACACTTGTACTGTGG 1677
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AAGCAGTACACTCTCAAGAAGTTCATTGCCAAGAAAGGACCTATCACACTTGTACTGTGG 1796
Query 1678 ATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGTTACATGGCATACTTGTTG 1737
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 ATTCTCCAAGACCTCTGCAGAATGCCTGTGGTTTGGTTCGGTTACATGGCATACTTGTTC 1856
Query 1738 TATCTGATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTATACTGATTCCGGAAACAGAACA 1797
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||
Sbjct 1857 TATCTCATATTCTTTCCTTGGTTCTCCGGTGAAGTGTTTGCTGATTCTGGAGACAGAGCA 1916
Query 1798 TACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCAGATAGGAAACATGAATAC 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TACATGACTATTATGGGATGGGTGGTGACGAGCTCAGGCGCAGATAGGAAACATGAATAC 1976
Query 1858 ATTGGACAACCTGATGTAATGGTTCTGGTGATCCCACATGTGGTCTTTGTTGTTATCCCC 1917
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 ATTGGACAACCTGATGTAATGGTTGTGGTGATCCCACATGTGGTCTTTGTTGTTATCCCC 2036
Query 1918 AGTGTCTTGGTTGTGTGTTGTTTGGTTGCTGAGAGAGAAATCTACAAAGATCACATTCGA 1977
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 AGTGTCTTGGTTGTGTGTTGTCTGGTTGCTGAGAGAGAAATCTACAAAGATCACATTCGA 2096
Query 1978 ACCGTCTCTGGAAAGAAAGAGGATGATCATGACCGGGGAAGGAAGAAGAGATCACAACGC 2037
|| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 ACTGTCTCTGGTAAGAAAGAGGATGACCATGACCGGGGAAGGAAGAAGAGATCACAACGC 2156
Query 2038 CGCTCGCTGTTATTCTCTAACAGAAGACTGTTTCGTAAATCACTCTTGGTGGCTTCATTA 2097
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 2157 CGCTCACTGTTATTCTCGAACAGAAGACTGTTTCGGAAATCGGTCTTGCTGGCTTCATTA 2216
Query 2098 GCTCTATATTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGGCATTAGCTAGAGCTTATGAGATGAAT 2157
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2217 GCTCTATATTGGAAGCATTTCAAGAATTGCTGGGCATTAGGTAGAGCTTATGAGATGAAT 2276
Query 2158 ATGGTTCATTTTCCAGGGTACAGTCTT 2184
|||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2277 GTGGTTCATTTTCCAGGTTACAGCCTT 2303
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 304509913234
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5