BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg318060
Length=2499
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G12915.1 | Symbols: | Ribosomal protein S5/Elongation facto... 3921 0.0
AT1G56070.1 | Symbols: LOS1 | Ribosomal protein S5/Elongation f... 1640 0.0
> AT3G12915.1 | Symbols: | Ribosomal protein S5/Elongation factor
G/III/V family protein | chr3:4112834-4115708 FORWARD LENGTH=2628
Length=2628
Score = 3921 bits (2123), Expect = 0.0
Identities = 2400/2529 (95%), Gaps = 37/2529 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GGTGAAGTTCACAGTTGAAGAGCAACGGAAAATTATGGATCGTAAACACAACATCCGTAA 62
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 GGTGAAGTTTACAGTTGAAGAGCAACGGAAAATTACGGATCGTAAACACAACATCCGTAA 164
Query 63 CATGTCTGTTATTGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACTCTTACGGATTCACTTGTTGC 122
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 165 CATGTCTGTCATCGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACACTTACGGATTCACTTGTTGC 224
Query 123 TGCTGCTGGTATTATTGCACAAGAATCTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATACGCGAGC 182
|||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 225 TGCTGCTGGTATCATTGCTCAAGAAACTGCGGGTGATGTGCGTATGACTGATACTCGTGC 284
Query 183 TGATGAAGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTACTATGAGAT 242
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 TGATGAGGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTACTATGAGAT 344
Query 243 GACTGATGAGTCTTTGAAGAGTTTCACTGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTACCTGATCAA 302
|||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 GACTGATGCGTCTCTGAAGAGTTTCACCGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTACCTGATCAA 404
Query 303 CCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCATCAGAAGTCACTGCTGCTCTCCGTAT 362
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 405 CCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCTTCAGAGGTCACAGCTGCTCTCCGTAT 464
Query 363 TACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGCGTTTGTGTGCAGACCGAGAC 422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 465 CACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGTGTTTGTGTGCAGACTGAGAC 524
Query 423 TGTGCTCAGGCAATCTCTTGGTGAAAGGATAAGGCCTGTTTTGACTGTCAACAAAATGGA 482
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 525 TGTGCTCAGGCAATCTCTTGGTGAAAGGATTAGGCCTGTTTTGACTGTCAACAAGATGGA 584
Query 483 CAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAAGAGGCTTATCAGAATTTCCAGAGGGT 542
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 585 CAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAGGAGGCGTATCAGAATTTCCAGAGGGT 644
Query 543 CATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCGACGTATGAGGATCCTCTCCTTGGTGATGTTCA 602
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 645 CATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCCACGCATGAGGATCCTCTCCTCGGTGATGTTCA 704
Query 603 GGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTGGCTTTCTCTGCTGGTCTCCACGGATGGGCTTTCAC 662
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 GGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTAGCTTTCTCTGCTGGTCTCCACGGATGGGCTTTCAC 764
Query 663 TCTTACCAATTTTGCTAAGATGCATGCTTCCAAGTTTGGTGTTTCTGAATCTAAAATGAT 722
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 765 TCTCACCAATTTTGCTAAGATGTATGCTTCCAAGTTTGGTGTCTCTGAATCTAAAATGAT 824
Query 723 GGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATCCTGCAACCAGAAAATGGACGACCAAAAA 782
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 825 GGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATTCTGCAACCAGAAAATGGACGACCAAAA- 883
Query 783 CACTGGCTCCGCGACCTGCAAGCGTGGGAT-G---A-T---G--ATCAACAC-TT--G-T 828
| ||||||| ||||||||||||||||| | | | | | || ||| | || | |
Sbjct 884 C--TGGCTCCCCGACCTGCAAGCGTGGGTTTGTTCAGTTCTGTTATGAACCCATTAAGAT 941
Query 829 A-TGAATGA-C-C----A-GAAGGAT-A-A-GC-T--G-TG-G-CCGATGTTGGAGAAGC 871
| ||| | | | | | ||| ||| | | | | | || | |||||||| |||||||
Sbjct 942 AATGA-TCAACACTTGTATGAATGATCAGAAGGATAAGCTGTGGCCGATGTTAGAGAAGC 1000
Query 872 TTGGTATTCAGATGAAGCCCGATGAGAAAGAGTTGATGGGTAAACCTTTGATGAAGCGTG 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 TTGGTATTCAGATGAAGCCCGATGAGAAAGAGTTGATGGGTAAACCTTTGATGAAGCGTG 1060
Query 932 TCATGCAGGCATGGCTCCCTGCGAGTACTGCTCTGCTTGAAATGATGATATTTCACTTAC 991
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1061 TCATGCAGGCATGGCTTCCTGCGAGTACCGCTCTTCTTGAAATGATGATCTTTCACTTAC 1120
Query 992 CATCACCCTACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAACTTGTATGAAGGTCCCCTTGATG 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121 CATCACCCTACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAACTTGTATGAAGGTCCCCTTGATG 1180
Query 1052 ATAAGTATGCTGCAGCTATCAGAAACTGTGATCCAGAAGGTCCTTTGATGCTCTACGTCT 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 ATAAGTATGCTGCAGCTATCAGAAACTGTGATCCAGACGGTCCTTTGATGCTCTACGTCT 1240
Query 1112 CTAAGATGATTCCTGCATCTGACAAGGGTAGGTTCTTTGCCTTGGGTCGTGTCTTTTCTG 1171
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1241 CTAAGATGATTCCCGCATCTGACAAGGGCAGGTTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTTTCTG 1300
Query 1172 GTACAGTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCCAACTATGTCCCTGGTGAAA 1231
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GTACGGTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCTAACTATGTCCCTGGTGAAA 1360
Query 1232 AGAAAGATCTGTATGTCAAGAGTGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAGCAAG 1291
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1361 AGAAAGATCTGTATGTCAAAAGTGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAACAAG 1420
Query 1292 AGACAGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTAGATCAGTTCA 1351
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1421 AGACAGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAATACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCA 1480
Query 1352 TCACCAAGAACGCTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGCTTCGTGCCA 1411
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCACCAAGAATGGTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGCTTCGTGCCA 1540
Query 1412 TGAAGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTAAAATGCAAGCTAGCGTCTGACC 1471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 TGAAGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTGAAATGCAAGCTAGCGTCTGACC 1600
Query 1472 TTCCCAAGCTTGTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTCTGACCCTATGGTTTTATGCA 1531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1601 TTCCCAAGCTTGTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTCTGACCCTATGGTTCTATGCA 1660
Query 1532 CAATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGGTGCAGGTGCTGGAGAACTCCACATTGAAATTT 1591
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 CAATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGTTGCAGGTGCTGGAGAACTCCACATTGAAATTT 1720
Query 1592 GTGTCAAGGATCTTCAAGATTTTATGGGTGGTGCGGAGATCATAGTGTCAGATCCTGTTG 1651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1721 GTGTCAAGGATCTTCAAGATTTTATGGGTGGTGCGGATATCATAGTGTCAGATCCTGTTG 1780
Query 1652 TTTCGTTGCGAGAGACAGTCTTTGAGAGGTCTTGCCGCACTGTGATGAGTAAGTCCCCAA 1711
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 TTTCGTTACGAGAGACAGTCTTTGAGAGGTCTTGCCGGACTGTGATGAGTAAGTCCCCAA 1840
Query 1712 ACAAGCACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGACCAATGGAGGATGGTCTAGCAGAGGCTA 1771
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1841 ACAAACACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGACCAATGGAGGATGGTCTAGCAGAGGCCA 1900
Query 1772 TTAATGAAGGTCGCATCGGTCCATCTGATGATCCCAAGATCCGATCCAAGATCCTTGCAG 1831
|| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1901 TTGATGAAGGCCGCATCGGTCCATCTGATGACCCCAAGATCCGATCCAAGATTCTTGCAG 1960
Query 1832 AAGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAAATATGGGCATTTGGACCTGACACCA 1891
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1961 AAGAGTTTGGGTGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAAATCTGGGCGTTTGGACCTGACACCA 2020
Query 1892 CAGGGCCCAACATGGTGGTTGATATGTGTAAGGGAGTGCAGTACTTGAATGAAATCAAGG 1951
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2021 CAGGGCCCAACATGGTGGTTGACATGTGTAAGGGAGTGCAGTACTTGAATGAAATCAAGG 2080
Query 1952 ACTCAGTGGTTGCTGGTTTCCAATGGGCTTCAAAGGAAGGCCCTTTAGCAGAAGAAAACA 2011
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2081 ACTCAGTGGTTGCTGGGTTCCAATGGGCTTCAAAGGAAGGTCCTTTAGCAGAGGAAAACA 2140
Query 2012 TGAGAGGGGTCTGTTATGAGGTGTGTGATGTTGTGCTCCATGTTGATGCAATCCACAGAG 2071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2141 TGAGAGGGGTCTGTTATGAGGTGTGTGATGTTGTGCTCCATGCTGATGCAATCCACAGAG 2200
Query 2072 GAGGTGGTCAGATGATTTCAACAGCAAGAAGAGCCATCTATGCATCACAGCTCACGGCCA 2131
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2201 GATGTGGTCAGATGATCTCAACAGCAAGAAGAGCCATCTATGCATCACAACTCACGGCCA 2260
Query 2132 AGCCAAGACTTCTTGAGCCGGTTTACATGGTCGAGATACAAGCACCTGAGGGAGCTTTGG 2191
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2261 AGCCTAGACTTCTTGAGCCGGTTTACATGGTCGAGATACAAGCACCTGAGGGAGCTTTAG 2320
Query 2192 GAGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAGAAATGCAAAGGC 2251
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321 GAGGAATCTACAGTGTGTTGAATCAGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAGAAATGCAAAGGC 2380
Query 2252 CAGGAACACCTCTCTACAACATCAAAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAGTCGTTTAATTTCT 2311
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 2381 CAGGAACGCCTCTCTACAACATCAAAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAGTCATTTGGTTTCT 2440
Query 2312 CAGGTCAGCTAAGGGCTGCAACCTCAGGACAAGCCTTTCCTCAGTGTGTGTTTGACCATT 2371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 CAGGTCAGCTAAGGGCTGCAACCTCAGGACAAGCCTTTCCTCAGTGTGTGTTTGACCATT 2500
Query 2372 GGGACATGATGTCTTCTGATCCGCTGGAGGCTGGCTCACAGGCTGCTACATTGGTAGCTG 2431
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2501 GGGACATGATGTCTTCTGATCCGCTTGAGACTGGCTCACAGGCTGCGACATTGGTAGCTG 2560
Query 2432 ATATCAGGAAGAGAAAAGGTTTGAAGCTACAGATGACTCCACTCTCTGATT-TCGAAGAC 2490
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 2561 ATATCAGGAAGAGAAAAGGTTTGAAGCTACAAATGACTCCACTCTCTGATTAT-GAAGAC 2619
Query 2491 AAATTGTAA 2499
|||||||||
Sbjct 2620 AAATTGTAA 2628
> AT1G56070.1 | Symbols: LOS1 | Ribosomal protein S5/Elongation
factor G/III/V family protein | chr1:20967930-20971742 REVERSE
LENGTH=2958
Length=2958
Score = 1640 bits (888), Expect = 0.0
Identities = 1438/1699 (85%), Gaps = 55/1699 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 823 ACTTGTATGAATGACCAGAAGGATAAGCTGTGGCCGATGTTGGAGAAGCTTGGTAT-TCA 881
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||
Sbjct 964 ACTTGCATGAATGACCAGAAGGATAAGTTGTGGCCTATGTTGGCGAAGCTTGGTGTCTCA 1023
Query 882 GATGAAGCCCGATGAGAAAGAG-TTGATGGGTAAACCTTTGATGAAGCGTGTCATGCAGG 940
|||||| |||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 1024 -ATGAAGAATGATGAGAAGGAGCTT-ATGGGTAAACCTCTAATGAAGCGTGTTATGCAGA 1081
Query 941 CATGGCTCCCTGCGAGTACTGCTCTGCTTGAAATGATGATATTTCACTTACCATCACCCT 1000
| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||
Sbjct 1082 CTTGGCTCCCTGCAAGTACTGCACTACTTGAGATGATGATCTTTCATTTGCCATCTCCCC 1141
Query 1001 ACACTGCGCAGAGGTACCGTGTTGAGAACT-TGTATGAAGGTCCCCTTGATGATAAGTAT 1059
||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1142 ACACTGCCCAGAGGTACCGTGTTGAGAA-TCTGTATGAAGGTCCTCTTGATGATCAGTAT 1200
Query 1060 GCTGCA-GCTATCAGAAACTGTGATCCAGAA-GGTCCTTTGATGCTCTACGTCTCTAAGA 1117
|| | || ||||| |||||||| || || || ||| | ||||||||||| || ||||
Sbjct 1201 GC-AAATGCCATCAGGAACTGTGA-CCCCAATGGACCTCTCATGCTCTACGTATCCAAGA 1258
Query 1118 TGATTCCTGCATCTGACAAGGGTAGGTTCTTTGCCTTGGGTCGTGTCTTTTCTGGTACA- 1176
||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
Sbjct 1259 TGATTCCAGCCTCTGACAAGGGTAGATTCTTTGCCTTCGGTCGTGTCTTTGCTGGTA-AG 1317
Query 1177 GTTTCTACTGGTATGAAAGTCAGGATCATGGGTCCCAACTATGTCCCTGGTGAAAAGAAA 1236
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 1318 GTTTCTACTGGTATGAAGGTCAGAATCATGGGTCCCAACTATATCCCTGGTGAGAAGAAG 1377
Query 1237 GATCTGTATGTC-AAGAGTGTGCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAAGCAAGAGAC 1295
|||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1378 GATCTGTA-CACTAAGAGTGTTCAGAGGACTGTCATTTGGATGGGTAAGAGGCAAGAGAC 1436
Query 1296 AGTGGAGGATGTTCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTAGATCAGTTCATCAC 1355
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1437 AGTGGAGGATGTCCCTTGTGGTAACACTGTTGCTATGGTTGGGCTGGATCAGTTCATCAC 1496
Query 1356 CAAGAACGCTACCTTGACGAATGAGAAGGAAGTGGACGCACACCCGC-TTCGTGCCATGA 1414
|||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||||||| ||||
Sbjct 1497 CAAGAATGCTACATTGACTAATGAGAAGGAAGTTGATGCTCACCC-CATTCGTGCTATGA 1555
Query 1415 AGTTTTCTGTCTCTCCCGTTGTTCGTGTTGCTGTAAAATGCAAGCTAGCGTCTGACCTTC 1474
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||
Sbjct 1556 AGTTTTCTGTGTCTCCTGTTGTTCGTGTTGCTGTTCAGTGTAAGGTTGCGTCTGACCTTC 1615
Query 1475 CCAAGCTT-GTAGAAGGTCTTAAGAGGCTGGCCAAGTCTGACCCTATGGTTTTATGCACA 1533
||||| || || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||
Sbjct 1616 CCAAG-TTGGTTGAGGGTCTCAAGAGGTTGGCCAAGTCTGATCCTATGGTTGTGTGTACA 1674
Query 1534 ATGGAAGAGTCTGGTGAGCACATTGGTGCAGGTGCTGGAGAACTCCA-CATTGAAATTTG 1592
||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||
Sbjct 1675 ATGGAGGAATCAGGTGAGCACATTGTTGCTGGTGCAGGAGAACTCCATC-TTGAGATTTG 1733
Query 1593 TGTCAAGGATCTTCA--A-GATTTTATGGGTGGTGCGGAGATCAT-AGTGTCAGATCCTG 1648
| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||||
Sbjct 1734 TCTTAAGGATCTTCAGGATGATTTCATGGGTGGTGCTGAAATTATCA-AGTCAGACCCTG 1792
Query 1649 TTGTTTCGTTGCGAGAGACAGTCTT-TGAGAGGTCTTGC-CGCACTGTGATGAGTAAGTC 1706
| || || || || |||||||| || ||| || || | | ||||| || |||||||||||
Sbjct 1793 TGGTCTCCTTCCGTGAGACAGT-TTGTGATAGATC-TACTCGCACAGTTATGAGTAAGTC 1850
Query 1707 CCCAAACAAGCACAACCGTCTTTACATGGAAGCCAGACCAATGGAGGATGGTCTAGCAGA 1766
|| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 1851 TCCTAACAAGCATAACCGTCTGTACATGGAAGCAAGACCCATGGAGGAAGGTCTAGCTGA 1910
Query 1767 GGCTATTAATGAAGGTCGCATCGGTCCATCTGATGATCCC-AAGATCCGATCCAAGATCC 1825
||||||| |||| || || || || ||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |
Sbjct 1911 GGCTATTGATGATGGACGTATTGGCCCAAGGGATGA-CCCTAAGATCAGATCCAAGAT-C 1968
Query 1826 TT-GCAGAAGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCCAAGAAAATATGGGCATTTGGACCT 1884
|| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 1969 TTGGCTGAGGAGTTTGGATGGGACAAGGATCTTGCAAAGAAGATCTGGGCTTTTGGACCT 2028
Query 1885 GACACCACAGGGCCCAACATGGTGGTTGATATGTGTAAGGGAGTGCAGTA-CTTGAATGA 1943
|| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||
Sbjct 2029 GAAACCACAGGGCCTAACATGGTTGTCGATATGTGTAAGGGAGTTCAGTACCTT-AACGA 2087
Query 1944 AATCAAGGACTCAGTGGTTGCTGGTTTCCAATGGGCTTCAAAGGAAGGCCCT-TTAGCAG 2002
||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| || || |
Sbjct 2088 AATCAAGGATTCAGTTGTTGCTGGTTTCCAGTGGGCGTCCAAGGAAGGTCCTCTT-GCTG 2146
Query 2003 AAGAAAACATGAGAGGGGTCTGTTATGAGGTGTGTGATGTTGTGCTCCATGT-TGATGCA 2061
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || | ||||||
Sbjct 2147 AAGAGAACATGAGAGGTATCTGTTTTGAGGTATGTGATGTGGTGCTTCA-CTCTGATGCC 2205
Query 2062 ATCCACAGAGGAGGTGGTCAGATGATTTCAACAGCAAGAAGAGCCATCTATGCATCACAG 2121
||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||| | ||| || || || |||
Sbjct 2206 ATCCACAGAGGAGGTGGTCAGGTTATCCCCACAGCCAGAAGGGTCATATACGCTTCCCAG 2265
Query 2122 CTCACGGCCAAGCCAAGACTTCTT-GAGCCGGTTTACATGGTCGAGATACAAGCACCTGA 2180
|||| || ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct 2266 ATCACAGCTAAGCCCAGACTT-TTGGAGCCGGTTTACATGGTTGAGATCCAGGCACCAGA 2324
Query 2181 GGGAGCT-TTGGGAGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACATGTGTTTGAAG 2239
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 2325 GGGAGCTCTT-GGAGGAATCTACAGTGTGCTGAATCAGAAGCGTGGACACGTGTTCGAGG 2383
Query 2240 AAATGCAAAGGCCAGGAACACCTCTC-TACAACATCAAAGCCTACCTTCCTGTGGTCGAG 2298
| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||
Sbjct 2384 AGATGCAGAGGCCAGGAACTCC-CTTGTACAACATCAAGGCATACCTGCCTGTTGTGGAG 2442
Query 2299 TCGTTTA--ATTTCTCAGGTCAGCTAAGGGCTGCAACCTCAGGACAAGCCTTTCCTCAGT 2356
|| ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||
Sbjct 2443 TC-TTTCGGATT-CTCAAGTCAGCTTAGGGCAGCAACCTCAGGACAGGCATTCCCACAGT 2500
Query 2357 GTGTGTTTGACCATTGGGACATGATGTCTTCTGATCCGCTGGAGGCTGGCT-CACAGGCT 2415
|||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||| | || | | ||||||
Sbjct 2501 GTGTGTTTGATCATTGGGAAATGATGTCTTCTGACCCTCTTGAGCCAGG-TACTCAGGCT 2559
Query 2416 GCTACATT-GGTAGCTGATATCAGGAAGAGAAAAGGTTTGAAGCTA-CAGATGACTCCAC 2473
| | || ||| ||||||||||||||||| || || |||||| | | |||||||||||
Sbjct 2560 TC-AGTTTTGGTGGCTGATATCAGGAAGAGGAAGGGATTGAAGGAAGC-GATGACTCCAC 2617
Query 2474 TCTCTGATTTCGAAGACAA 2492
| ||||| |||||||||||
Sbjct 2618 TATCTGAGTTCGAAGACAA 2636
Score = 887 bits (480), Expect = 0.0
Identities = 712/822 (87%), Gaps = 24/822 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTGAAGTTCACAGTTGAAGAGCAACGGAA-AATTATGGATCGT--AAACACAACATC 57
||||||||||| |||| ||| |||| | ||| |||||||| | | ||||||||||||
Sbjct 112 ATGGTGAAGTTTACAGCTGATGAGCTTC-GAAGGATTATGGA-C-TACAAACACAACATC 168
Query 58 CGTAACATGTCTGTTATTGCCCATGTCGATCATGGGAAATCTACTCTTACGGATTCACTT 117
||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 169 CGTAATATGTCTGTTATTGCTCATGTCGACCACGGGAAATCCACTCTTACTGATTC-TTT 227
Query 118 -GTTGCTGCTGCTGGTATTATTGCACAAGA-ATCTGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATA 175
||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228 GGTTGCTGCTGCTGGTATCATTGCCCAAGAGGT-TGCTGGTGATGTTCGTATGACTGATA 286
Query 176 CGC-GAGCTGATGAAGCAGAACGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGGTATCTCTCTCTAC 234
| | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 287 C-CAGAGCTGATGAGGCTGAACGTGGTATCACTATCAAGTCCACTGGTATTTCTCTCTAC 345
Query 235 TATGAGATGACTGATGAGTCTTTGAAGAGTTTCACTGGAGCTAGAGATGGCAATGAGTAC 294
|| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||
Sbjct 346 TACGAGATGACTGATGAATCCTTGAAGAGTTTCACTGGAGCCAGAGACGGAAACGAGTAC 405
Query 295 CTGATCAACCTCATTGACTCTCCTGGACACGTTGACTTTTCATCAGAAGTCACTGCTGCT 354
|| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||
Sbjct 406 CTCATCAATCTTATTGATTCACCTGGGCACGTTGACTTTTCTTCTGAGGTTACTGCTGCT 465
Query 355 CTCCGTATTACTGATGGTGCTCTTGTGGTTGTTGACTGCATTGAAGGCGTTTGTGTGCAG 414
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||
Sbjct 466 CTCCGTATTACTGATGGTGCTCTTGTGGTGGTCGACTGCATTGAGGGTGTGTGTGTTCAG 525
Query 415 ACCGAGACTGTGCTCAGG-CAATCTCTTGGTGAAAGGATAAGGCCTGTTTTGACTGTCAA 473
|| |||||||| || | | || |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||
Sbjct 526 ACTGAGACTGTTCT-ACGTCAGGCTCTTGGTGAGAGGATTCGACCTGTCTTGACTGTCAA 584
Query 474 CAAAATGGACAGGTGTTTCCTTGAGCTTAAGGTTGATGGTGAAGAGGCTTATCAGAATTT 533
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||
Sbjct 585 CAAGATGGACAGGTGTTTCCTTGAGCTTCAGGTTGATGGTGAGGAGGCTTACCAGACTTT 644
Query 534 C-CAGAGGGTCATTGAGAATGCTAATGTCATCATGGCGACGTATGAGGATCCTCTCCTTG 592
| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 645 CTC-GAGGGTTATTGAGAACGCTAATGTCATCATGGCTACATACGAGGATCCTCTCCTTG 703
Query 593 GTGATGTTCAGGTTTACCCTGAAAAGGGGACAGTGGC-TTTCTCTGCTGGTCTCCACGGA 651
||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||
Sbjct 704 GTGATGTTCAGGTTTACCCAGAGAAGGGAACTGTGGCGTTT-TCTGCTGGTCTCCATGGA 762
Query 652 TGGGC-TTTCACTCTTACCAATTTTGCTAAGATGCATGCTTCCAAGTTTGGTGTT-TCTG 709
||||| ||| || || ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||| | ||
Sbjct 763 TGGGCGTTT-ACACTGACCAACTTCGCCAAGATGTATGCTTCCAAGTTCGGTGTTGT-TG 820
Query 710 AATCTAAAATGATGGAGAGGCTGTGGGGTGAGAACTTCTTTGATCCTGCAACCAGAAAAT 769
||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |
Sbjct 821 AATCTAAGATGATGGAGAGGCTCTGGGGTGAGAATTTCTTTGACCCTGCCACCAGGAAGT 880
Query 770 GGAC-GACCAAAAACACTGGCTCCGCGACCTGCAAGCGTGGG 810
||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 881 GGAGTGGC-AAAAACACTGGTTCCCCGACCTGCAAGCGTGGG 921
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 124012683096
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5