BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg318288
Length=5799
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G15120.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 6479 0.0
> AT3G15120.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr3:5088366-5095482
REVERSE LENGTH=5986
Length=5986
Score = 6479 bits (3508), Expect = 0.0
Identities = 3881/4062 (96%), Gaps = 22/4062 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1743 GCCTTGTGCACGAGCTAATGGTTGCATCTTTGATCACCGTAAATTTCTCATTGCTTGCAC 1802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 GCCTTGTGCACGAGCTAATGGTTGCATCTTTGATCACCGTAAATTTCTCATTGCTTGCAC 1880
Query 1803 AGACCATAGACATCATTTCCAACCCCATGGTCACCAGTGTCAAGTCAGACTGACGAAGAT 1862
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1881 AGACCATAGACATCATTTCCAACCCCATGGTCGCCAATGTCAAGTCAGAATGACGAAGAT 1940
Query 1863 GAAAACCAAGAGGATGCGACTGGAGATGAAGAAGCACTCAAATGATGCCTGGCGCAAGGA 1922
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 GAAAACCAAGAGGATGCGATTGGAGATGAAGAAGCACTCAAATGATGCCTGGCGCAAGGA 2000
Query 1923 TGTGGAAGCGGAAGAAAAGTGGTTTGAGAAATGTGGTGAAGATGAAGAATTTTTAAAACG 1982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2001 TGTGGAAGCGGAAGAAAAGTGGTTTGAGAAATGTGGTGAAGATGAAGAATTTTTAAAACG 2060
Query 1983 TGAAAGCAAGAGACTGCATCGAGATCTATTAAGAGTTGCTCCTGAGTATATTGGAGGTTC 2042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 TGAAAGCAAGAGACTGCATCGAGATCTATTAAGAGTTGCTCCTGAGTATATTGGAGGTTC 2120
Query 2043 TGATTCTGAGAGTGGAAAGGCATTTGAGGGATGGGACTCTGTTGCTGGGCTTGAAGGTGT 2102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121 TGATTCTGAGAGTGGAAAGGCATTTGAGGGATGGGACTCTGTTGCTGGGCTTGAAGGTGT 2180
Query 2103 TACTCAATGTATGAAAGAGGTTGTTCTTATACCCTTACTGTATCCAGAATTCTTTGATAA 2162
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2181 AACTCAATGTATGAAAGAGGTTGTTCTTATACCCTTACTATATCCAGAATTCTTTGATAA 2240
Query 2163 CCTTGGACTTACACCTCCAAGAGGTATCCTCTTACATGGACATCCTGGAACTGGAAAAAC 2222
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2241 CCTTGGACTTACACCTCCAAGAGGCATCCTCTTACATGGACATCCTGGAACTGGGAAAAC 2300
Query 2223 TCTTGTGGTTCGAGCGCTGATCGGTTCCCTTGCTCGTGGTAATAGACGAATTGCCTACTT 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2301 TCTTGTGGTTCGAGCGCTGATCGGTTCCCTTGCTCGTGGGAATAGACGGATTGCCTACTT 2360
Query 2283 TGCCCGCAAAGGGGCAGACTGTCTGGGAAAATACGTTGGTGATGCTGAGCGCCAGTTGAG 2342
||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2361 TGCTCGCAAAGGGGCAGACTGTTTGGGAAAATATGTTGGTGATGCTGAGCGCCAGTTGAG 2420
Query 2343 GCTCTTGTTTCAGGTCGCTGAAAAATGCCAACCATCCATCATATTTTTTGATGAAATAGA 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 GCTCTTGTTTCAGGTCGCTGAAAAATGCCAACCATCCATCATATTTTTTGATGAAATAGA 2480
Query 2403 TGGTCTCGCTCCCAAGCGGTCAAGGCAGCAAGATCAAACTCATAGCTCCGTTGTATCCAC 2462
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2481 TGGTCTCGCTCCAAAGCGGTCAAGGCAGCAAGATCAAACTCATAGCTCCGTTGTATCCAC 2540
Query 2463 ATTGCTGGCTTTACTAGATGGCTTAAAGTCTCGTGGCTCAGTGGTGGTCATAGGTGCAAC 2522
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 ATTACTGGCTTTACTAGATGGCTTAAAGTCACGTGGCTCAGTGGTGGTCATAGGTGCAAC 2600
Query 2523 AAACTACCCTGATGCTATTGACCCAGCATTAAGGAGGCCTGGGAGGTTTGATAGGGAGAT 2582
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2601 CAACTACCCTGATGCTATTGACCCAGCATTAAGGAGGCCTGGGAGGTTTGATAGGGAGAT 2660
Query 2583 CTATTTTCCACTACCATCAGTCGACGATAGGGCTGCAATCATCTCGCTCCATACTAGGAA 2642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2661 CTATTTTCCACTACCATCAGTCGACGATAGGGCTGCAATCATCTCACTCCACACTAGGAA 2720
Query 2643 GTGGCCCAAGCCGGTGTCTGGATACTTGCTCAAGTGGATTGCTAAAGAAACTGCCGGTTT 2702
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2721 ATGGCCTAAGCCGGTGTCTGGATACTTGCTCAAGTGGATTGCTAAAGAAACTGCCGGTTT 2780
Query 2703 TGCTGGTGCAGATATACAAGCTCTCTGCACACAAGCTGCCATGATTGCCTTAAATAGGAG 2762
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781 TGCTGGTGCTGATATACAAGCTCTCTGCACACAAGCTGCCATGATTGCCTTAAATAGGAG 2840
Query 2763 TTTCCCTTTACAAGAATCTTTGGCCGCTGCAGAGTTGGGAGTGTCTAGTAGTAATCGTGC 2822
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2841 TTTCCCTTTACAAGAATCTTTGGCCGCTGCAGAGTTGGGAGTGTCTAGCAGTAATCGTGC 2900
Query 2823 TGCTCTTCCATCCTTCTCAGTTGAAGAAAGAGATTGGTTGGAAGCTTTATCCCGCTCCCC 2882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2901 TGCTCTTCCATCCTTCTCAGTTGAAGAAAGAGATTGGTTGGAAGCTTTATCCCGCTCTCC 2960
Query 2883 ACCCCCATGTTCACGTAGAGGAGCAGGAATAGCAGCTAGCGATATATTTTCTTCTCCCCT 2942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2961 ACCCCCATGTTCACGTAGAGGAGCAGGAATAGCAGCTAGTGATATATTTTCTTCTCCGCT 3020
Query 2943 TCCTACTTACTTGGTGCCTTCTTTATTGCCGCCATTGTGTTCTTTACTTGTTGCTCTTCA 3002
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3021 TCCTACTTACTTGGTACCTTCTTTATTGCCGCCATTATGTTCTTTACTTGTTGCTCTTCA 3080
Query 3003 TCTTGAAGAACGTATTTTGCTACCTCCTCTTCTTTCCAAAGCTGCGGTTGATGTCCAAAA 3062
|||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081 TCTTGATGAACGTATCTTCCTACCACCTCTTCTTTCCAAAGCTGCGGTTGATGTCCAAAA 3140
Query 3063 TGTGATCTGTTCTGCTTTGAGCAACAAGAAGATAACTGAGGGTTGTTGGTGGTCTCATGT 3122
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3141 TGTGATCCGTTCTGCTTTGAGCGACAAGAAGATAACTGAGGGTTGTTGGTGGTCTCATGT 3200
Query 3123 TGATACCCTTCTCCATGAAGTAGATGTTGTAAAGGATATAGTACAAAGACTTTCTTATAC 3182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3201 TGATACCCTTCTCCATGAAGTAGATGTTGTAAAGGATATAGTACAAAGACTTTCTTGTAC 3260
Query 3183 TGGGATACTGGATGGAGGATCTGACTTGGTTAGATCTGTTGCAAGCATTCCTGGTACTGG 3242
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3261 TGGGATACTGGATGGAGGATGTGACTTGGTTGGATCTGTTGCAAGCATTCCTGGTACTGG 3320
Query 3243 CGACTGTAGTTTGGGTTCTCCACAATTCATGGTACATAGAGTCTGCCGACGTCCTGGGCT 3302
||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |
Sbjct 3321 CGACTGTAGTTTGGGTTCTGCAAAATTCATGGTACCTAGAGTCTGCAGACATCCTGGGGT 3380
Query 3303 TTTGGGGAATGCTTCTGTAGAATCAACGAGCAAATCAGGGTTCCAACTGCTTATTGCTGG 3362
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3381 TTTGGGGAATGCCTCTGTAGAATCAACGAGCAAGTCAGGGTTCCAACTACTTATTGCTGG 3440
Query 3363 AGGTCCTAAATCTGGTCAACGACATCTTGCTTCTTGTATCTTGCATTGTTTTATTGGTAA 3422
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3441 AGGACCTAAATCTGGTCAACGACATCTTGCTTCTTGTGTCTTGCATTGTTTTATTGGTAA 3500
Query 3423 TGCAGAGATGC-AGAAGATAGACACAGCAACAATTTCACAAGAAGGAAATGGGGATCTGG 3481
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3501 TGCAGAGATGCTA-AAGATAGACACAGCAACAATTTCACAAGAAGGAAATGGGGATCTGG 3559
Query 3482 TGCTAGGCGTAACTCACTTATTAATTAAATGTGCAAGCAGGAAATCATGTGTGGTATTCA 3541
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3560 TGCTAGGTGTAACTCACTTATTAATTAAATGTGCTAGCAAGAAATCATGTGTGGTATTCA 3619
Query 3542 TGCCAAGAATTGACTTGTGGGCAGTAGAGACAGAAACTCCACTGAAT-AAG-GGAATTGA 3599
||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| || | ||
Sbjct 3620 TGCCAAGGGTTGACTTGTGGGCTGTAAAGACAGAAACTCCTCTGAATGAAGAGG--TCGA 3677
Query 3600 GTGTGATGATGCTTCTTTAAAGGAGAATTGTTATTCCCTTTTTCGAGAAATGGGAGAGGA 3659
||||||||||| |||| || |||| || | || ||| |||||||||||||||
Sbjct 3678 GTGTGATGATGATTCTGTACAGGA-AA-----A-----TTGTTC-AGAAATGGGAGAGGA 3725
Query 3660 AAAGGCATTACAGAATGCTGTTCGAGTTTCACATGCTTGGAATACATTTTTTGAGCAAGT 3719
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3726 AAAGGCATTGCAGAATGGTGTTCGAGTTTCACATGCTTGGAACACATTTTTTGAGCAAGT 3785
Query 3720 AGAATCATTGCGAGTTTCCACAAAGATGATGATTCTGGCTACTTCTGGCATGCCCTACAA 3779
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3786 AGAAACGCTGCGAGTTTCCACAAAGATGATGATTCTGGCTACTTCTGGCATGCCCTACAA 3845
Query 3780 ACTCCTGCCTCCTAAGATACAACAGTTCTTTAAGACCGACCTATCAAAGGAGTATCAGCC 3839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3846 ACTCCTGCCTCCTAAGATACAACAGTTCTTTAAGACTGACCTATCAAAGGAGTGTCAGCC 3905
Query 3840 AACTATGTCTGAGGCTGTTCCACAATTCAATGTACAAGTTGTTGAAAGTTCTGACCAGGA 3899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3906 AACTATGTCTGAGGCTGTTCCACAATTCAATGTACAAGTTGTTGAAAGTTCTGACCAGGA 3965
Query 3900 TATGGCCATTGACCTGTCTGCTACTGAGTTGTCAAGGCGGGCAATCCAGGTGTTTCTTCA 3959
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 3966 TATAGCCATTGACCTGTCTGCTACTGAGTTGTTAAGGCGGGCAATCCAAGTATTTCTTCA 4025
Query 3960 TTTGGTGCATCAGGGAACCCATACTCACTGTGGCTTACAGAAGAAATACAAAAGAGAGAA 4019
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4026 TTTGGTGCATCAGGGATCCCATACTCACTGTGGCTTAAAGAAGAAATACAAAGGAGAGGA 4085
Query 4020 TCCTGACCAGGGTTGCAGAGATGCAGCTTATCAGAATAATACTGATCATGGCGCAGGGGA 4079
|| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 4086 TCTTGACCAGGGTTGCAGAGATGCAGCTCCTCAGAATAATACTGATCACAGAGCAGGGGA 4145
Query 4080 AGAAGCAGGTGTTAAATCAAAACCTGTTGATGATGGTTCTTTAAAAGTTCCACCATTACC 4139
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4146 AGAAGCAGTTGTTAAATCAAAACGTCTTGATGATGGTTCTTTAAAAGTTCCACCATTACC 4205
Query 4140 TATCAACATAAATGTGAAAGCAAAATCAAGCCTGCAGTTAGCTGTCTCCACATTTGGTTA 4199
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4206 TATCAACATCAATGTGAAACCAAAATCAAGCCTGCAGTTAGCTGTCTCCACATTTGGTTA 4265
Query 4200 TCAAATACTACAGTATCCTCAATTTGCTGAACTTTGTTGGGTGACATCAAAGCTTAAGGA 4259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4266 TCAAATACTACAGTATCCTCAATTTGCTGAACTTTGCTGGGTGACATCAAAGCTTAAGGA 4325
Query 4260 AGGGCCAAGTGCAGATGTTTCTGGTCCTTGGAGGGGATGGCCATTTAATTCGTGTATCAG 4319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4326 AGGGCCAAGTGCAGATGTTTCTGGTCCTTGGAGGGGATGGCCATTTAATTCGTGTATCAC 4385
Query 4320 TCGCCCTTGTAATTCCTCAGAGCAGACTATTACTTCTTCTGATTCCAACAATGTTAAAGG 4379
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4386 TCGCCCTTGTAATTCCTCGGAGCAGACTATTACTTCTTCCGATTCCAACAATGTTAAAGG 4445
Query 4380 CAAAGATTCAACTGGCATTGTCAGAGGTCTTACTGCAGTTGGATTATCAGCATATAGAGG 4439
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4446 AAAAGATTCCACTGGAATTGTCAGAGGTCTTACTGCTGTTGGATTATCAGCGTATAGAGG 4505
Query 4440 AACCTATATATCACTGAGGGAAGTCTCCTTTGAGGTACGGAAAGTTCTGGAGCTCTTAGT 4499
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4506 AACCTATATATCGCTGAGGGAAGTCTCATTTGAGGTACGGAAAGTTCTGGAGCTCTTAGT 4565
Query 4500 TGGACGGATCAATGTTAAAATCAACGCTGGAAAGGACAGATGTCGATATATTCGAATTTT 4559
||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4566 TGGACGGATCAGTGTTAAAATTAATGCTGGAAAGGACAGATGTCGATATATTCGAATTTT 4625
Query 4560 GTCTCAAGTTGCTTATCTGGAGGATCTGGTTAATAGTTGGGTATATGCGATGCGAAGTTT 4619
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4626 GTCTCAAGTTGCTTATCTGGAAGATCTGGTTAATAGTTGGGTATACGCGATGCGAAGTTT 4685
Query 4620 TGAATCAACCACTCAAACAGAGTCGGCGAATCCATTGTCTTGTTCTGTAGTCAATCAATC 4679
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 4686 CGAATCAACCACTCAAACAGAGTCAACGAATCCATTACCTTGTTCTGTAGTCAATCCATC 4745
Query 4680 AGTGAGGAATGAGCCAACTGAGCAAGAAACATCTGATCAATCAAAAGGGTCAGAAGAAGA 4739
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4746 AGTGAGGAATGAGCCAACTGAGCAAGGAACATCTGATCAATTAAAAGGGTCAGAAGAAGA 4805
Query 4740 CGTGAAAGAAGATACCCAAAACATTAATTGTCCAGACCCTATAGCATCTAGTAATCTTAC 4799
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4806 CCTGAAAGAAGATACCCAAAACATGAATTGTCCAGACCCTATAGCATCTAGTAATCTTAC 4865
Query 4800 CGACAATCATCAGCCAGTTGTAGAGATTGCAAATGGTCATAGTGGAACAAATCATGAACC 4859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 4866 CGACAATCATCAGCCAGTTGTAGAGATTGCAAATGGTCATAATGGAACAAATCATGAATC 4925
Query 4860 TTTTCTTGAAGATACTGGACATCTTACAACCCACAGTACGGATGGCTTAACTTTGGTCAA 4919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4926 TTTTCTTGAAGATACTGGACATCTTACAACCCACAGTACGGATGGCTTAACTTTGGTCAA 4985
Query 4920 AGAGAATGTTGATGTTATTTC-GAATACTGAAATGGTGATTGAGGATTCAGGAGTGAGTT 4978
||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4986 AGAGAATGTTGATGTTATTTCAGA-TACTGAAATGATGATTGAGGATTCAGGAGTGAATC 5044
Query 4979 CCTTTCGGCAGGCTGTTCTCCTTGATCTTAACTCTCCTGCAGCTGACCATGAACAGAATG 5038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5045 CCTTTCGGCAGGCTGTTCTCCTTGATCTTAACTCTCCTGCAGCTGACCATGAACAGAATG 5104
Query 5039 AAACTCCCCATGGATCATGCGAGGTAGAAACTACAGGAACAGTAATTTCTTTGCAAGGAA 5098
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5105 AAACTCCACATGGATCATGCGAGGTAGAAACTACAGGAACAGTAATTTCTTTGCAAGAAA 5164
Query 5099 AAGCTGATTCCCTAGACCATCGTAATGGATCTGAGGATCCCAATTCTATCTCCCTGAAAG 5158
||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||
Sbjct 5165 AAGCTGATTCCCTAGACAATCCTAATGGATCTGGGGATTCCAATTCTATATCCCTGGAAG 5224
Query 5159 ATCCCCACAAATCAGCTGACTCAAATAACGGTAATGCCTGGGATGGAGTTCATGGCTTAG 5218
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5225 ATCCCCACAAATCAGCTGACTCAAATAACGGTAAAGCCTGGGATGGAGTTCATGGATTAG 5284
Query 5219 AATCTGCAAACAACATGCCTGAACCAGTTGAGCAAGTTGAAACAACTGCAAGAACCAATC 5278
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 5285 AATCCGCAAACAACATGCCTGAACCAGTTGAACAAGTTGAAACGACTGGAAGAACCAATC 5344
Query 5279 CTCTGGATGACCCTAGTTTGGTGTGTTTGTACCGTTGCTGCTCCCAGTGTGTCTCCATCC 5338
||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5345 CTCAGGATGACCCTAGCTTGGTGTGCTTGTACCGTTGCTGCTCCCAGTGCGTCTCCATCC 5404
Query 5339 TGCAAGATTTAATGCATAAATTAGTTACTCGCGAATTGAGACTTGGTATGAGTTCCATCA 5398
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5405 TCCAAGATTCAATGCATAAATTAGTTACTCGCGAATTGAGACTTGGTAGGAGTTCCATCA 5464
Query 5399 CAACAGACGGTATACATGATGCAGTTTCTTCATTATCAGTGGAGCTTATTGCTGCTGTTA 5458
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5465 CAACAGAGGGTATACATGATGCGGTTTCTTCATTATCAGTGGAGCTTATTTCTGCTGTTA 5524
Query 5459 GAAAGTTCATCTCTGCGAAAAACAATGGTACTAAGCAGGAAGCGAAGGTCGAAGATCATG 5518
||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5525 GAAAGTTCATCTCTGTGAAAAACAATGGTACCATGCAGGAAGCGAAGGTCAAAGATCATG 5584
Query 5519 AGGAATGTCCAGAAAAGGAAGCATGTTCTTGCAAAAGCTTATCCGGTAATTTTCTTGCCT 5578
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5585 AGGAATGTCCAGAAAACGAAGCATGTTTTTGCAAACGCTTATCCGGTAATTTTCTTGCCT 5644
Query 5579 CGGT-GAAATGTTGCAGTCATTCTGCTGAATTGCAAGGGAGCTTAGATGAAGGAAATACA 5637
| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5645 CTGTCGAA-TGTTGCAGTCATTCTGCTGAAATGCAAGGGAGCTTAGATGAGGGAAATACA 5703
Query 5638 TATCCAAGCCCTAAGACTTGGCTTGAACCATTATTCGTTTTCAAAGATGGAATATTGGTT 5697
|||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5704 TATCGAAGACCTAAGACTTGGCTTGAACCAGTATTCGTTTTCAAAGATGGAATATTGGTT 5763
Query 5698 CCGGTAAGTACTGAAGATGACCGCTCTTTGCATTGTAAATATGATAGATTCTGCCTTGGT 5757
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5764 CCGGTGAGTACTGAAGATGACCGCTCTTTGCATTGTAAATATGATAGTTTCTGCCTTGGT 5823
Query 5758 TCTCTCATAGAGTTGATTGCAACTGAGATGAAGCCTTTTTGA 5799
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5824 TCTCTCATAGAGTTAATTGCAACTGAGATGAAGCCTTTTTGA 5865
Score = 1225 bits (663), Expect = 0.0
Identities = 750/793 (95%), Gaps = 2/793 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 922 GAAGATGAGAATAAGGAGATGGGTGCAATGGTTTCGGAAAGTGGAAATGGCACTGGTATA 981
|||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GAAGATGAGAATAAGGAGATGGATGTAATTGTTTCGGAAAGTGGAAATGGCACTGGTATA 1089
Query 982 CTAGAAGATGAGAATAAGGATATGGGTGTAGGGGTTTCCGGAAGTGGAAATGGCACTGGT 1041
||||||| |||||||||| | |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1090 CTAGAAGGTGAGAATAAGAAGATGGAAGTAATGGTTTCGGGGAGTGGAAATGGCACTGGT 1149
Query 1042 ATACTAGAAGATGATAGCAATTTTGCTGCTGAAGTTAAGAACAGAGAAGGAGATACTTTA 1101
|||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 ATACGAGAAGATGATAGTGATTTTGCTGCTAAAGTTAAGAACAGAGAAGGAGATACTTTA 1209
Query 1102 CATCCTGAACTACTTCGTGAAGCTAGCAACGAGGTTAATGAGAGTTTGGAGCAGAATGAT 1161
||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1210 CATCCTGAACTACTTGGCGAAGCTAGCACCGAGATTAATGAGAGTTTGAAGCAGAATGAT 1269
Query 1162 GACATCGGAGAGCAAGGTGTTTCTAGAACACCATCCAATAATAAGACCTTGGAACATAGT 1221
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1270 GATATCGGAGAGCAAGGTGTTTCTAGAACACCATCTAATAATAAGACCAAGGAACATAAT 1329
Query 1222 GAGTTTCTTGATAGAGGGAGTGAAAGTGTGGAAATGCTTGACGAGTTACCTAATCAGAAT 1281
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1330 GAGTTTCTTGATAGAGGGGGTGAAAGTGTGGAAATGCCTGACGAGTTACCTATTCAGAAT 1389
Query 1282 GAAACGTGCAAGAAGGCAGTTGTCTCAGTTTCCACTTCATCAGATAGACTAGGTAAACCT 1341
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 GAAACGTGCAAGAAGGCAGTTGACTCAGTTTCCACTTCATCAGATAGACTAGGTAAACCT 1449
Query 1342 CTCTTCAAACAAACCAGACGCTGTGGTTTATGTGGAGTTGGTACTGATGGCAAACGCCCA 1401
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 1450 CTCTTCAAACAAACCAGACGCTGTGGTTTATGTGGAGTGGGTACTGATGGCAAACTTCCG 1509
Query 1402 AAGAAGTTGATGCAAGATAATGGTGACAGTGACGTAGAGGCACATAGCGGGTCTTCATCT 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1510 AAGAAGTTGATGCAAGATAATGGTGACAGTGACGTAGAGGCACCTAGCGGGTCTTCATCT 1569
Query 1462 TCAGAGGAGCAAAACTATGACATATTGGATGGTTTTGGCGATGATCCTGGATGGCTTGGC 1521
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 TCAGAGGAGCAAAAGTATGACATATTGGATGGTTTTGGGGATGATCCTGGATGGCTTGGC 1629
Query 1522 CGTCTATTGGGCCCTATAAACGATCGTTATGGAATTTCTGGAACTTGGGTTCATCAGAAC 1581
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 CGTCTCTTGGGCCCTATAAACGATCGTTATGGAATTTCTGGAACTTGGGTTCATCAGAAC 1689
Query 1582 TGTGCCGTATGGAGTCCCGAGGTTTATTTTGCTGGTGTAGGATGCTTAAAGAATATAAGG 1641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 TGTGCCGTATGGAGTCCCGAGGTTTATTTTGCTGGTGTAGGATGCTTAAAGAATATAAGG 1749
Query 1642 GCGGCACTTTTCAGAGGGAGGTCATTAAAATGCACTCGCTGTGCA-AGACCTGGGGCAAC 1700
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1750 GCAGCACTTTTCAGAGGGAGGTCATTAAAATGCACTCGCTGTG-ATAGACCTGGGGCAAC 1808
Query 1701 CATTGGTTGTCGG 1713
|| ||| ||||||
Sbjct 1809 CACTGGCTGTCGG 1821
Score = 782 bits (423), Expect = 0.0
Identities = 498/534 (93%), Gaps = 6/534 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 525 TTCGGAAGATGGGGAAAAAGAGTCTGATACCAGTAATTCGGAAGATGAGAGTGCTAGCGA 584
||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 TTCGGAAGATGTGCAAAAGGAGTCTGATACCAGTAATTCGGAAGATGAGAGTGCTAGCGA 629
Query 585 GTCCGAGGAATCAATGCAGGCTGACAGTGAAGATAGAGAGGAAGT-TGAGGAAAAGAAGG 643
||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||| |||||||
Sbjct 630 GTCAGAGGAATCAATGCAGGCTGACAGTGCAGCTAGAGA-GAAATACCAGGAGAAGAAGG 688
Query 644 CTACCAAAAGATCCGTTGTTTTAGAGAGTGAGAATGAAGCTGAAGTTGATGGAACAGAGA 703
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 689 CTACCAAAAGATCCGTTTTTTTAGAGAGTGAGAATGAAGCTGAAGTTGATAGAACGGAGA 748
Query 704 CTGAGAGCGAGGATGGAACAGACAGTACTGACAATGAGATTGATGATAGTGATGAAGAGG 763
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 CTGAGAGCGAGGATGGAACAGACAGCACTGACAATGAGATTGATGATAGTGATGAAGAGG 808
Query 764 GGGAAAGTGAGGCACAAAGTAGTGCAGATAAGACAGGAAGTGAGACTGAAGCTAATGTGG 823
||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 GGGAAAGTGAGACACAATGTAGTGCAGAGAAGACAGGAAGTGAGACTGAAGCTAATGTGG 868
Query 824 ATGAAATGAGAGCTGATACTAATGTTAGC-ATGGAAGCAGTACAAAATGAAAGTCGGAAT 882
| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 AGGAAATGAGAGCTGATACTAATGTTA-CAATGGAAGCAGTACAAAATGAAAGTCGGAAT 927
Query 883 CAAATGGAAGAATTGGAAAATGAGATTGAGATGGGAGTTGAAGATGAGAATAAGGAGATG 942
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 928 CAAATGGAAGAATTGGAAAATGAGATTGAGATGGGAGTTGAAGATGAGAAGAAGGAGATG 987
Query 943 GGTGCAATGGTTTCGGAAAGTGGAAATGGCACTGGTATACTAGAAGATGAGAATAAGGAT 1002
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 988 AGTGTGATTGTTTCGGAAAGTGGAAATGGCACTGGTATACGAGAAGATGAGAATAAGGAG 1047
Query 1003 ATGGGTGTAGGGGTTTCCGGAA-GTGGAAATGGCACTGGTATACTAGAAGATGA 1055
|||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1048 ATGGATGTAATTGTTTC-GGAAAGTGGAAATGGCACTGGTATACTAGAAGGTGA 1100
Score = 749 bits (405), Expect = 0.0
Identities = 521/573 (91%), Gaps = 23/573 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 AAAGAATCATTCGGGTTCTCCTTCTGGGAAGAAGAGTAAGAAGCTTGCTGCAATATGTGA 65
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 AAAGAATCATTCGGGTTCTCCTTCTGGGAAGAAAAGTAAGAAGCTTGCTGCAATATGTGA 83
Query 66 GGAGGAATACaaaaaaaaCCATGGAGAGTCGCAGGGCAGAGATGGTGGGTCTGGGTTAGC 125
|||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GGAGGAATACAAGAAAAATCATGGAGAGTCCCAGGACAGAGATGGTGGGTCTGGGTTAGC 143
Query 126 TTGTGCTGACTCTGAACTTCGGCGGAGCTCTAGGGTCAGGAAGATACCGTCCATCCTGGA 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 144 TTGTGCTGACTCTGAACTTCGGCGGAGCTCTAGGGTCAGGAAGATTCCGTCCATCCTGGA 203
Query 186 CGCTTCTCCTCCGCCTCCAAAGAAAAGGCAGCGTTTTAATAAACACGTAGATAGGAGTTC 245
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | | | | ||||||
Sbjct 204 TGCTTCTCCTCCGCCACCAAAGAAAAGGCAGCG-TTT--T--A-A--T--A-A-GAGTTC 251
Query 246 TAGTAGTATAGAGAAAGGGAA-ACGAAATGAGGAT-GAGGATGAGGATACCCTGGATGGT 303
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||
Sbjct 252 CAGTAGTATAGAGAAAGGGAAGA-GAAATGAGGATGGA-GATTCGGATGCCCCGGATGGT 309
Query 304 TGGAAATCCAGGTTGAGGTCAA--A-GAGGAAGAACGTTGGTTCCCAAGCGAGTGGGAGA 360
|||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 310 TGGAAATCCAGGTTGAGGTCAAGGAGGAAGAAGAACGTTGGTTTCCAAGCGAGTGGGAGA 369
Query 361 CAGAGACGTGTGGTCAAGGGAAAAAGAAAGCTTGTTTTCAGAAACCGTGCCTGTGAGTTG 420
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAGAGACGTGTGGTAAAGGGGAAAAGGAAGCTCGTTTTCAGAAACCGTGCCTGTGAGTTG 429
Query 421 AGTGACAAAGCAGTGGAAAGTGACAGGGAAGAGGAAAGAAG-AGCTCCT-AAAGGTGGGG 478
||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||
Sbjct 430 AGTGAAAAAGCAGAGGCAAGTGACAGGGAAGAGGAAA-AAGGAGC-CCTTAAAGGTGGGA 487
Query 479 GGCTGATTAAAACAAAAAAGCCAGTAGATGTTAAGGAATCGGAAAGTTCGGAAGATGGGG 538
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 488 AGCTGAATAAAGCAAAAAAGCCAGTGGATGTTAAGGAATCAGAAAGTTCGGAAGATGGGG 547
Query 539 AAAAAGAGTCTGATACCAGTAATTCGGAAGATG 571
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 GAAAAGAGTCTGATACCAGTAATTCGGAAGATG 580
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 289319510911
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5