BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg318409
Length=4263
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G16340.1 | Symbols: ATPDR1, PDR1 | pleiotropic drug resistan... 6831 0.0
> AT3G16340.1 | Symbols: ATPDR1, PDR1 | pleiotropic drug resistance
1 | chr3:5539897-5546417 FORWARD LENGTH=4405
Length=4405
Score = 6831 bits (3699), Expect = 0.0
Identities = 4083/4269 (96%), Gaps = 24/4269 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGACGTTATCGAGAAGCCTAAGTAGGAGCTTAGGAGAGTTGTTAGCGAGTAATAGT 60
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGACGTTATCGAGAAGCCTAAGTAAGAGCTTAGGAGAGTTGTTAGCGAGTAATAGT 60
Query 61 AATAACCATTTCTCAAGGAGAAGCGGTTCAACGATCGATGATCACGACGAGGAAGCTCTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 AATAACCATTTCTCAAGGAGAAGCGGTTCAACGATAGATGATCACGATGAGGAAGCTCTT 120
Query 121 AAATGGGCTGCTCTCGAGAAACTTCCAACCTTCGCTCGTCTTCGTACCACTATCATTCAC 180
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AAATGGGCTGCTCTCGAGAAACTTCCAACCTTTGCTCGTCTTCGTACCACTATCATTCAT 180
Query 181 CCTAATGATGATCTCGTCGATGTTACCAAGCTCGGTGTCGATGATCGACAGAAGTTCATC 240
||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 CCTCACGAAGATCTCGTCGACGTTACCAAGCTCGGTGTTGATGATCGCCAGAAGTTCATC 240
Query 241 GATTCTATCTTTAAAGTCACGGAGGAAGATAATGAGAAATTCTTGAAAAAGTTTAGGAAT 300
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GATTCTATCTTCAAAGTCACCGAGGAAGATAACGAGAAGTTCTTGAAAAAGTTTAGGAAT 300
Query 301 CGAATCGACAGGGTGCGGATAAAGTTACCGACAGTGGAAGTGAGATTCGAGAAAGTAACG 360
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CGAATCGACAGGGTGCGGATAAAGCTACCGACAGTGGAAGTGAGATTCGAGAAAGTAACG 360
Query 361 GTAGAGGCGAATTGTCACATAGGAAAAAGAGCTCTTCCCACATTACCTAACGCTGCTTTA 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 ATAGAGGCGAATTGTCACATAGGAAAAAGAGCTCTTCCCACATTACCCAACGCTGCTTTA 420
Query 421 AACATTGCAGAGAGAGGTCTTCGTTTGCTTGGTTTTAACTTTACAGAAACCACTAAAGTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 421 AACATTGCAGAGAGAGGTCTTCGTTTGCTTGGTTTTAACTTTACAAAAACCACTAAAGTC 480
Query 481 ACTATCCTTAGAGACGTCT-CGGGTATTATCAAACCTTCACGAATGACACTTTTATTAGG 539
||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 481 ACTATTCTTAGAGACGTCTCCGGG-ATTATCAAACCTTCAAGAATGACACTTTTATTAGG 539
Query 540 TCCACCATCATCAGGGAAAACAACTCTTTTATTAGCGTTAGCTGGAAAACTAGACCCAAG 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 540 TCCACCATCATCAGGGAAAACAACTCTTTTATTAGCGTTAGCTGGAAAACTAGACCAAAG 599
Query 600 TTTAAAGGTGACAGGGAGAGTAACATACAATGGGCATGGATTAGAAGAGTTTGTGCCACA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 CTTAAAGGTGACAGGGAGAGTAACATACAATGGGCATGGATTGGAAGAGTTTGTGCCACA 659
Query 660 GAAAACATCAGCATACATAAGCCAAAACGATGTTCATGTTGGAGTCATGACTGTTCAAGA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 660 GAAAACATCAGCATACATAAGCCAAAACGATGTTCATGTTGGAGTCATGACTGTCCAAGA 719
Query 720 AACTCTTGATTTTTCTGCTAGATGTCAAGGAGTTGGCACTAGATACGATTTGTTAAGTGA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 720 AACTCTTGATTTTTCTGCTAGATGTCAAGGAGTTGGCACTAGATATGATTTGTTAAGTGA 779
Query 780 GTTGGTGAGGAGAGAGAAGGACGCAGGGATCTTGCCGGAACCGGAAGTGGATCTCTTCAT 839
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTGGTGAGAAGAGAGAAGGACGCAGGGATCTTGCCGGAACCGGAAGTGGATCTCTTCAT 839
Query 840 GAAGTCCATCGCAGCTGGAAATGTCAAGAGCAGTCTCATCACAGACTACACTCTCAGAAT 899
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 840 GAAGTCCATTGCAGCTGGAAATGTCAAGAGCAGTCTCATCACAGACTATACTCTCAGAAT 899
Query 900 ATTAGGGCTTGACATATGCAAAGATACTGTGGTCGGAGATGAGATGATTAGAGGAATCTC 959
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 900 ATTAGGGCTTGACATATGCAAAGATACGGTGGTCGGAGATGAGATGATTCGAGGAATCTC 959
Query 960 GGGTGGTCAAAAGAAAAGAGTAACAACAGGAGAGATGATAGTGGGACCAACAAAGACATT 1019
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 960 GGGAGGTCAAAAGAAAAGAGTCACAACAGGAGAGATGATAGTAGGACCAACAAAGACATT 1019
Query 1020 GTTCATGGACGAGATATCGACAGGTCTAGACAGTTCAACAACGTTCCAAATAGTGAAATG 1079
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1020 GTTCATGGATGAGATATCGACAGGTCTAGACAGTTCAACAACGTACCAAATAGTGAAATG 1079
Query 1080 CCTTCAAGAGATTGTCCGGTTCACGGACGCAACGGTTCTCATGTCCTTATTACAACCAGC 1139
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CCTTCAAGAGATTGTTCGGTTCACGGACGCAACGGTTCTCATGTCCTTATTACAACCAGC 1139
Query 1140 TCCTGAAACGTTCGAACTTTTTGATGACATCATTCTATTGTCTGAAGGTCAAATCGTGTA 1199
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1140 TCCTGAAACGTTCGAACTTTTCGATGACATCATTCTATTGTCTGAAGGACAGATCGTGTA 1199
Query 1200 CCAAGGTCCACGGGATCTTGTTCTTACCTTCTTTGAAACTTGCGGTTTCAAGTGTCCCGA 1259
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CCAAGGTCCACGTGATCATGTTCTTACCTTCTTTGAAACTTGCGGTTTCAAGTGTCCCGA 1259
Query 1260 CCGCAAAGGCACCGCAGATTTCTTGCAAGAGGTAACTTCAAGGAAAGACCAAGAACAGTA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CCGCAAAGGCACCGCAGATTTCTTGCAAGAGGTAACTTCAAGGAAAGACCAAGAACAGTA 1319
Query 1320 TTGGGCAGAGACAACAAAACCATACAATTACATTTCTGTCTCCGAATTCTCCAAACGATT 1379
||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1320 TTGGGCAGACTCAAAAAAACCATACAGTTACATTTCTGTCTCTGAATTCTCCAAACGATT 1379
Query 1380 CAGGACCTTCCATGTCGGAGCCAATCTTGAAAAAGATCTATCAGTCCCTTACGACAGATT 1439
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CAGAACCTTCCATGTCGGAGCCAATCTTGAAAAAGATCTATCAGTCCCTTACGACAGATT 1439
Query 1440 CAAATCACACCCTGCTTCTCTAGTCTTCAACAAACACTCTGTTCCAAAATCTCAACTCTT 1499
|||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1440 CAAATCACACCCAGCTTCTCTCGTCTTCAAGAAACACTCTGTTCCGAAATCTCAACTCTT 1499
Query 1500 CAAGGTCTGTTGGGACAGAGAGTTGCTTCTCATGAAACGTAACGCTTTCTTCTACGTTAC 1559
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1500 CAAGGTCTGTTGGGACAGAGAATTGCTTCTCATGAAACGTAACGCTTTCTTCTACATTAC 1559
Query 1560 CAAGACTGTTCAAATTATCATTATGGCTTTGATTGCGTCGACCGTGTACCTGAGAACGGA 1619
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CAAAACAGTTCAAATTATCATTATGGCTTTGATTGCGTCGACCGTGTACCTGAGAACGGA 1619
Query 1620 GATGGGTACAAAGGACGAGAGTGATGGAGCCGTCTACATTGGTGCGTTGATGTTCTCCAT 1679
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GATGGGAACAAAGAACGAGAGTGATGGAGCCGTCTACATCGGTGCGTTGATGTTCTCCAT 1679
Query 1680 GATCGTTAACATGTTTAATGGATTCGCGGAGCTTGCTTTGATGATTCAGAGACTTCCCGT 1739
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GATCGTTAACATGTTTAATGGATTTGCAGAGCTTGCTTTGATGATTCAGAGACTTCCCGT 1739
Query 1740 GTTCTACAAGCAACGAGACCTTTTGTTTCATCCTCCTTGGACCTTCACTCTCCCAACATT 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1740 GTTCTACAAGCAACGAGACCTTTTGTTTCATCCTCCTTGGACCTTCAGTCTTCCAACATT 1799
Query 1800 TCTTCT-GGGAATTCCTATCTCCATCTTCGAATCCGTTGTTTGGGTCAGCATTACTTATT 1858
||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1800 TCT-CTTGGGTATTCCTATCTCCATCTTCGAATCTGTTGTTTGGGTCACCATTACTTATT 1858
Query 1859 ACATGATCGGATTTGCTCCAGAACTCAGCAGGTTCTTGAAGCATTTGTTGGTGATATTTC 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 ACATGATCGGATTTGCTCCAGAACTCAGCAGGTTCTTGAAGCATTTGTTGGTGATATTTC 1918
Query 1919 TGACACAGCAAATGGCTGGTGGTATATTTCGATTCATTGCGGCAACTTGCAGATCGATGA 1978
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TGACACAGCAAATGGCTGGTGGTATATTTAGGTTCATCGCGGCAACTTGCAGATCGATGA 1978
Query 1979 TTCTTGCTAATACGGGAGGATCTCTAGTTATCCTCCTCCTCTTCTTGCTTGGAGGGTTCA 2038
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TTCTTGCTAATACGGGAGGAGCTCTAGTTATCCTCCTCCTCTTCTTGCTTGGAGGGTTCA 2038
Query 2039 TTGTTCCTAGAGGTGAGATTCCTAAATGGTGGAAATGGGCTTACTGGGTTTCACCAATGG 2098
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TTGTTCCTAGAGGTGAGATACCTAAATGGTGGAAATGGGCTTACTGGGTTTCACCAATGG 2098
Query 2099 CTTACACTTACGATGCTTTAACTGTCAATGAAATGCTTGCTCCTAGATGGATGAATCAAC 2158
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2099 CTTACACTTACGATGCTTTAACTGTCAATGAAATGCTTGCTCCTAGATGGATTAATCAAC 2158
Query 2159 GGTCTTCTGATAACTCGACGAGGCT-AGGGTTGGCTGTTCTTGAGATTTTCGATATTTTC 2217
||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 CGTCTTCTGATAACTCCACGAG-CTTAGGGTTGGCTGTTCTTGAGATTTTCGATATTTTC 2217
Query 2218 ACAGATCCAAACTGGTATTGGATCGGGATAGGAGGCATTCTCGGGTTTACCATTCTCTTC 2277
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2218 ACGGATCCAAACTGGTATTGGATCGGGGTAGGAGGCATTCTCGGGTTTACGGTTCTCTTT 2277
Query 2278 AACATCCTCGTTACCCTCGCTCTGACATTCCTAAACCCACTTGAGAAACAGCAAGCCGTT 2337
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 AACATCCTCGTTACCCTCGCTCTTACATTCCTAAACCCACTTGAGAAACAGCAAGCCGTT 2337
Query 2338 GTTTCAAAAGAAAATGCAGAGGAAAACAGAGCAAAAAACAGAGCAGAGAATGGCTTAAAG 2397
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | || | | ||||
Sbjct 2338 GTTTCAAAAGAAAATACAGAGGAAAACAGAGCAGAGAAC-G-GC------T--C--AAAG 2385
Query 2398 AGTAAGAGTATT-AGCGCGAAAAGAGGAATGGTTCTACCTTTTACACCTCTCACAATGTC 2456
|||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2386 AGTAAGAGCATTGA-CGTGAAAAGAGGAATGGTTCTACCTTTTACTCCTCTCACAATGTC 2444
Query 2457 TTTTGACAATGTAAACTACTACGTCGACATGCCTAAGGAAATGAAGGAACAAGGAGTTTC 2516
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 CTTCGACAACGTAAACTACTACGTCGACATGCCTAAGGAAATGAAGGAACAAGGAGTTTC 2504
Query 2517 CAAGGATAAGCTTCAGCTGCTAAGGGAAGTGACAGGGGTCTTTAGGCCAGGTGTACTAAC 2576
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 2505 CAAGGATAAGCTTCAGCTACTAAAGGAAGTGACAGGGGTCTTTAGGCCAGGGGTATTAAC 2564
Query 2577 AGCTTTGATGGGAGTTAGTGGAGCTGGTAAGACCACTTTAATGGATGTTTTAGCGGGCAG 2636
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2565 AGCTTTGATGGGAGTTAGTGGAGCTGGTAAGACCACTTTAATGGATGTTTTAGCTGGTAG 2624
Query 2637 AAAAACCGGTGGATACATCGAAGGAGACATCAGAATCTCCGGTTTCCCTAAAAGACAAGA 2696
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2625 AAAAACCGGTGGTTACATCGAAGGAGACATCAGAATCTCTGGTTTCCCTAAAAGACAAGA 2684
Query 2697 AACCTTTGCAAGAATCTCTGGTTATTGTGAACAGAATGATATCCACTCACCGCAAGTCAC 2756
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2685 AACCTTTGCAAGAATCTCTGGTTATTGTGAACAGAACGATATCCACTCACCGCAAGTTAC 2744
Query 2757 TATCAAAGAGTCTCTCATCTACTCTGCTTTCCTACGTCTCCCAAAAGAAGTCACTAAAGT 2816
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2745 TGTCAAAGAGTCTCTCATCTACTCTGCTTTCCTTCGTCTCCCAAAAGAAGTCACTAAA-T 2803
Query 2817 -TGAGAAAATGAGATTTGTGGATGAAGTGATGGAGCTAGTAGAGCTAGAGAGTCTAAAAG 2875
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 ATGAGAAAATGAGATTTGTGGATGAAGTGATGGAGCTAGTAGAGCTAGAGAGTCTAAAAG 2863
Query 2876 ATGCGGTGGTGGGGCTTCCAGGGATCACAGGGTTATCAACAGAACAGAGGAAGAGACTTA 2935
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2864 ACGCGGTGGTGGGGCTTCCAGGTATCACAGGGTTATCAACAGAGCAGAGGAAGAGACTTA 2923
Query 2936 CAATTGCAGTGGAATTAGTGGCGAATCCATCTATAATCTTCATGGATGAGCCAACCTCTG 2995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2924 CAATTGCAGTGGAATTAGTGGCGAATCCATCTATAATCTTCATGGATGAGCCAACCTCTG 2983
Query 2996 GTCTTGACGCGAGGGCTGCAGCGATTGTGATGAGGACGGTGAGGAACACTGTTGACACAG 3055
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 2984 GTCTTGACGCTAGGGCTGCAGCGATTGTGATGAGGACAGTGAGGAATACAGTTGACACAG 3043
Query 3056 GAAGAACTGTTGTCTGCACAATCCACCAACCTAGCATTGATATCTTTGAAACTTTTGATG 3115
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3044 GAAGAACTGTGGTCTGCACAATCCACCAACCTAGCATTGATATCTTTGAAGCTTTTGATG 3103
Query 3116 AACTTCTTCTTATGAAGAGAGGAGGACAAGTTATTTACGCTGGTCCTTTAGGTCGAAACT 3175
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 3104 AACTTCTTCTTTTGAAGAGAGGAGGACAAGTGATTTATGCTGGTCCTTTAGGTCAAAACT 3163
Query 3176 CTCACAAGATTATCGAATATTTCCAGGCGATTCATGGAGTTCCAAAAATTAAAGAGAAGT 3235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 3164 CTCACAAGATTATCGAATATTTCCAGGCGATTCATGGAGTTCCGAAGATTAAAGAGAAGT 3223
Query 3236 ATAATCCGGCGACATGGATGTTAGAAGTGAGCTCAATGGCTGCAGAAGCCAAGCTTGAGA 3295
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3224 ATAATCCGGCGACATGGATGCTAGAAGTGAGCTCAATGGCTGCAGAAGCTAAGCTTGAGA 3283
Query 3296 TAGATTTTGCTGATCATTACAAAACATCATCCTTATATCAACAAAACAAGAATCTTGTTA 3355
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3284 TAGATTTTGCTGAGCATTATAAAACATCATCCTTATATCAACAAAACAAGAATCTTGTAA 3343
Query 3356 AGGAACTAAGCACACCACCACAAGGAGCAAGCGATCTCTACTTCTCAACGCGGTTCTCAC 3415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3344 AGGAACTAAGCACACCACCACAAGGAGCAAGCGATCTCTACTTCTCAACGCGGTTCTCAC 3403
Query 3416 AATCATTGTTAGGACAATTCAAATCTTGTTTATGGAAGCAGTGGATAACTTACTGGAGAA 3475
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3404 AATCATTGTTAGGACAATTCAAATCTTGTTTGTGGAAGCAGTGGATAACTTACTGGAGAA 3463
Query 3476 CTCCTGACTACAATCTAGCCAGATTTTTCTTTACGTTAGCTGCAGCTGTCATGCTCGGAT 3535
||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 CTCCTGACTACAATCTAGCAAGATTTTTCTTTACATTGGCTGCAGCTGTCATGCTCGGAT 3523
Query 3536 CAATTTTCTGGAAAGTTGGCACAAAAAGGGAAAGTGCTAATGATCTTACAAAGGTTATTG 3595
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 CAATTTTCTGGAAAGTTGGCACAAAAAGGGAAAACGCTAATGATCTTACAAAGGTTATTG 3583
Query 3596 GAGCAATGTACGCTGCAGTTTTATTCGTGGGCATAAATAATTCCTCATCTGTCCAACCGC 3655
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 3584 GAGCAATGTATGCTGCTGTTTTATTCGTGGGCGTAAACAACTCTTCATCTGTCCAACCGC 3643
Query 3656 TAATAGCCGTGGAACGAACTGTATTCTATAGAGAAAGAGCTGCTGAAATGTACTCTGCTT 3715
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3644 TAATAGCCGTGGAAAGATCTGTATTCTATAGAGAAAGAGCTGCTGAAATGTACTCTGCTT 3703
Query 3716 TACCTTATGCCCTAGCACAGGTGGTATGTGAAATACCGTATGTACTGATCCAGACGACAT 3775
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 3704 TACCTTATGCCCTAGCACAGGTGGTATGCGAAATACCGTATGTGCTGATCCAAACTACAT 3763
Query 3776 ATTATACACTAATAATATACGCAATGCTCTGTTTCGAATGGACAGTGGCCAAATTCTTTT 3835
||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3764 ATTATACACTAATTATATACGCCATGATGTGTTTCGAATGGACATTGGCCAAATTCTTTT 3823
Query 3836 GGTTTTACTTCGTATCATTCGTCTCCTTCCTCTACTTCACATACTATGGGATGATGACAG 3895
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3824 GGTTTTACTTCGTATCATTTATGTCCTTCCTCTACTTCACATACTATGGGATGATGACAG 3883
Query 3896 TTGCCCTCACCCCGAACCAGCAAGTCGCAGCCGTTTTTGCAGGAGCTTTCTACGGACTCT 3955
||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3884 TTGCCCTCACCCCAAATCAGCAAGTTGCAGCTGTTTTTGCCGGAGCTTTCTACGGACTTT 3943
Query 3956 TCAACCTCTTTTCTGGTTTTGTCATCCCTAGACCGAGAATTCCGAAATGGTGGATATGGT 4015
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3944 TCAACCTCTTTTCTGGTTTTGTCATTCCTAGACCGAGAATTCCGAAATGGTGGATATGGT 4003
Query 4016 ATTACTGGATCTGTCCGGTGGCTTGGACTGTGTACGGATTGATTGTTTCGCAGTACGGTG 4075
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4004 ATTACTGGATCTGTCCAGTGGCTTGGACTGTGTATGGATTGATTGTTTCGCAGTACGGTG 4063
Query 4076 ACGTGGAGGATACGATTAAAGTTCCGGGTATGGCAAGTGATCCGACGATAAAGTGGTACA 4135
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4064 ACGTGGAGGATACGATTAAAGTTCCGGGTATGGCAAATGATCCGACGATAAAGTGGTACA 4123
Query 4136 TTGAAAACCACTATGGATACGACGCAGATTTCATCG-TCCCGATTGCTACCGTGTTAGTG 4194
||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||
Sbjct 4124 TTGAAAACCACTATGGATACGACGCAGATTTTAT-GATACCGATTGCTACTGTGTTAGTG 4182
Query 4195 GGCTTTACTCTCTTTTTTGCTTTTATGTTTGCTTTCGGCATAAGAACGCTCAACTTCCAA 4254
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4183 GGCTTTACTCTCTTTTTTGCGTTTATGTTTGCTTTTGGCATAAGAACGCTCAACTTCCAA 4242
Query 4255 CAACGATAG 4263
|||||||||
Sbjct 4243 CAACGATAG 4251
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 212507170548
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5