BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg318738 Length=3357 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G19870.1 | Symbols: | unknown protein; Has 84 Blast hits to... 4772 0.0 > AT3G19870.1 | Symbols: | unknown protein; Has 84 Blast hits to 64 proteins in 35 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 31; Fungi - 0; Plants - 24; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 29 (source: NCBI BLink). | chr3:6907395-6911233 FORWARD LENGTH=3477 Length=3477 Score = 4772 bits (2584), Expect = 0.0 Identities = 2733/2807 (97%), Gaps = 2/2807 (0%) Strand=Plus/Plus Query 551 CGGAGAGAACTCACGCCGTGCAAGCTTATCTTCTCTTGTTCACTACAATTGTCTACAATG 610 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 556 CGGAGAGAACTCACGCCGTGCAAGCTTATCTTCTCTTGTTCACCACAATTGTCTACAATG 615 Query 611 TGGTTAATCAGAAGCTTAAGGTTTCACTTCTTAGTACCTCTGTACCTTTGGTGCCTTTTA 670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 616 TGGTTAATCAGAAGCTTAAGGTTTCACTTCTTAGTACCTCTGTACCTTTGGTGCCTTTTA 675 Query 671 ATGCTCCTAATTGGATGCGTGATCAGAGTTTGATTATGAGTCATGGTCAAGGGTTGGGGC 730 ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 676 ATGCTCCTAATTGGATGCGTGATGAGAGTTCGATTATGAGTCAAGGTCAAGGGTTGGGGC 735 Query 731 CAGATCAGAAGGAACTGAGACGAACATTGGCTTTTATGTTGGAATCTCCGTATTTGTTCA 790 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 736 CAGATCAGAAGGAACTGAGACGAACATTGGCTTTTATGTTGGAATCTCCGTATTTGTTTA 795 Query 791 CGTCTTGTGCTATGATGGAATTTATGGGTATGGTTGTGCCACTTGCATCGGCTTTGGAGT 850 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 796 CTTCTTGTGCTATGATGGAATTTATGGGTATGGTTGTGCCACTTGCATCGGCGTTGGAGT 855 Query 851 TACAGGCCTCTATGTTGAAAGTTCAGTTCTTGGGGATGATTTATTCGTTTGATCCAATGC 910 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 856 TACAGGCTTCTATGTTGAAAGTTCAGTTCTTGGGGATGATTTATTCGTTTGATCCAATGC 915 Query 911 TTTGTCATGTTGTCTTGCTTGTGTATTCTCAGTTCCCTGATGCGTTTGAGGGACAAGAGA 970 |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 916 TTTGTCATGTTGTCTTGCTTATGTATTCTCGGTTCCCTGATGCGTTTGAGGGACAAGAGA 975 Query 971 AAGAGATCATGAGACGTCTTATGCTCTTTTCCAAGGAGACTCAGATCTATCTTGTTTTCC 1030 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 976 AAGAGATCATGAGACGTCTTATGCTCTTTTCAAAGGAGACTCAGATCTATCTTGTTTTCC 1035 Query 1031 GCTTGCTTGCGCTACACTGGTTAATGGGTTTGTTGAATAAGCTTATGTTGAGTGGGGAGC 1090 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1036 GTTTGCTTGCGCTGCACTGGTTAATGGGTTTGTTGAATAAGCATATGTTGAGTGGGGAGC 1095 Query 1091 TTGAGAAGAGGAAATCTGTTCTTGAGATGGGTCAGAAGTTTCATCCTGTCGTTTTTGATC 1150 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1096 TTGAGAAGAGGACATCTGTTCTTGAGATGGGTCAGAAGTTTCATCCTGTCGTTTTTGATC 1155 Query 1151 CACTCGCTTTGAAAGCGTTGAAGCTTGATTTGCTGGTACAATGCTCTGTTAGTTCCAATG 1210 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 1156 CACTCGCTTTGAAAGCGTTGAAGCTTGATCTGCTGGTACAATGCTCTGTGAGTTCCAACG 1215 Query 1211 CTTTGAGTGGAGGTGATAACAGTAAGTCTGCTGGAGATCTGTTGCAGGACTGCTTGGTAT 1270 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1216 CTTTGAGTGGAGGTGATAACAGTAAATCTGCTGGGGATTTGTTGCAGGACTGCTTGGTAT 1275 Query 1271 CTGTTTCGGATTTCAAATGGTTGCCTCCATGGAGCTCAGAAACTGAACTAGCATTCCGCA 1330 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1276 CGGTTTCGGATTTCAAATGGTTGCCTCCATGGAGCTCAGAAACTGAACTAGCATTCCGCA 1335 Query 1331 CTTTACACAAGTTTCTGATATGTGCATCTACACATTCCGACTCTGACCCTTCCACCACTA 1390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1336 CTTTACACAAGTTTCTGATATGTGCATCTACACATTCCGACTCTGACCCTTCCACCACTA 1395 Query 1391 GAAGCCTTATGGAGTCTAGCCTCTTCCAAAACGTGCAGGGGTTGCTAGTAGACATGACTT 1450 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1396 GAATCCTTATGGAGTCTAGCCTCTTCCAAAACGTGCAGGGGTTGCTGGTAGACATGACTT 1455 Query 1451 TGGAGTTTCAAATCTTGGTCCCTGTTATTGTAGCTTTTATTGAGCGGTTGATACACTGTC 1510 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1456 TGGAGTTTCAAATCTTGGTCCCTGTTATTGTGGCTTTTATTGAGCGGTTGATTCACTGTC 1515 Query 1511 ACAAGCATCAGTGGTTAGGAGAGCGGTTTCTTCAGACAGTCGATGAGAATCTGCTTCCCA 1570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1516 ACAAGCATCAGTGGTTAGGAGAGCGGTTTCTTCAGATAGTCGATGAGAATCTGCTTCCCA 1575 Query 1571 AACTTAAGAAAAACAATTTATTAACAGCTTACTTCCCGCTTTTCCATCGGATAGCCGAGA 1630 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1576 AACTTAAGAAAAAAAACTTATTAACAGCTTACTTCCCGCTTTTCCATCGAATAGCCGAGA 1635 Query 1631 ATGATACAATACCTCCTTCTCGATTGATAGAGCTGCTTACGAAGTTTGTAATTTCACTTG 1690 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1636 ATGATACAATACCTCCTTCTCGATTGATAGAGCTGCTTACGAAGTTTGTAATTTCACTTG 1695 Query 1691 TTGAGAAGCGCGGGTTTGATGTGGGGTTGAAATTGTGGGATCAAGGAACTGAAGTTCTTG 1750 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1696 TTGAGAAGCGCGGACTTGATGTGGGGTTGAAATTGTGGGATCAAGGAACTGAAGTTCTTG 1755 Query 1751 GCATTTGTCGAACACTGATGAGTCACCATAAGAGCTCTAGATTATTTCTTGGACTCTCTC 1810 |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1756 GCATCTGTCGAACATTGATGAGTCACCATAAGAGCTCTAGATTATTTCTCGGACTCTCTC 1815 Query 1811 GCCTTCTTTCCCTCACATGTCTCTATTTCCCTGATCTGGAGGTCCGAGACAATGCTAGGA 1870 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1816 GCCTTCTTTCCCTCACATGTCTCTATTTCCCTGATCTGGAGGTCCGAGACAATGCTAGGA 1875 Query 1871 TATATCTGAGGATGCTGGTCTGTATACCAGGACAGAGAATTAAGAACATTTTGAAGCCCG 1930 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1876 TATATCTGAGGATGCTGGTCTGTATACCAGGACAGAGAATTAAGAACATTTTGAAGCCGG 1935 Query 1931 CAGATGCTGTCTCTCCATCAACCCATTCTTCTACATTCTTTAGTGTTCAAAGTCCTCGTT 1990 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1936 CAGATGCTGTCACTCCATCAACCCATTCTTCTACATTTTTTAGTGTTCAAAGTCCTCGTT 1995 Query 1991 TTCGTCATGATCCTAGTAAATCTCGGAACCTTTCATCCTATATTCATCTTGAACGGGTTA 2050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1996 TTCGTCATGATCCTAGTAAATCTCGGAACCTTTCATCCTATATTCATCTTGAACGGGTTA 2055 Query 2051 CGCCCCTACTCGTGAAACAGTCATGGTCATTGTCTCTACCATCTCTAAGTGTTGGAACTG 2110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2056 CGCCCCTACTCGTGAAACAGTCATGGTCATTGTCTCTACCATCTCTAAGTGTTGGAACTG 2115 Query 2111 ATGGATATAGCATTATAGAAAACAAAATCCAGGTAGATGAAGTTGAGCCGGATGGCAGTC 2170 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2116 ATGGATATAGCATTATAGAAAACAAAATCCAGGTAGATGAAGTTGAGCCGGATGGCAGTC 2175 Query 2171 AAGAACTTCAGATTTTGCCAGAAGCTCGAAGAATTGAATCAGGAAAACCTACGTTAAGGG 2230 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2176 AAGAACTTCAGATTTTGCCAGAAGCTCGAAGAATTGAATCAGGAAAACCTACGTTAAGGG 2235 Query 2231 TAATGGACTCAAAGATTGCAGAGATTCTAGAAAGATTAAGAAGATATTTCTCTGTGATTC 2290 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2236 TAATGGACTCAAAGATTGCAGAGATTCTAGAAAGATTAAGAAGATATTTCTCTGTGATTC 2295 Query 2291 CTGATTTCAAACACATGCCTGGAATTAAGGTTAGAATAACGTGTACTTTGAGATTGGATG 2350 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2296 CTGATTTCAAACACATGCCAGGAATTAAGGTTAGAATAACGTGTACTTTGAGATTGGATG 2355 Query 2351 CTGAACCATATAGCAGTATATGGGGAAGTGAAAGTCAGAAAATCGATTTAGAGAAAGTTG 2410 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2356 CTGAACCATATAGCAGTATATGGGGAAGTGAAACTCAGAAAATCGATTTAGAGAAAGTCG 2415 Query 2411 ATTCACCTCCTGCGATTTTCGCGACCGTACTCAAATTCTCATCTTCAGCCCCGTATGGCT 2470 | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2416 ACTCACCTCCTGCGATTTTCGCGACGGTGCTCAAATTCTCATCTTCAGCCCCTTATGGCT 2475 Query 2471 CTATTCACTCATGCCGCATACCTTTCCTTCTTGGTGAGCCTCATTGGAACAGCAATGTAC 2530 |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2476 CTATTCCCTCATGTCGCATACCTTTCCTTCTCGGTGAGCCTCATTGGAACAGCAATGTAC 2535 Query 2531 CCAATGAAGAAGTTTCTTTAGACATCGTCCTGGTAGAAAACACACTGAAAGAGGAGGAAA 2590 ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2536 CCAATGAAGAAGTTTCTTTAGACATTGTCGTGGTAGAAAACACACTGAAAGAGGAGGAAA 2595 Query 2591 AAGATGGCTTGAGAGGAGCACCTGTAACAGTGGAACTGGAACCTAGAGAACCTACACCAG 2650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2596 AAGATGGCTTGAGAGGAGCACCTGTAACAGTGGAACTGGAACCTAGAGAACCTACACCAG 2655 Query 2651 GTTTGGTCGAGGTTTCAATGGAAGCAAATGCAGAGAATGGTCAGGTGATTCAGGGAAAAC 2710 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2656 GTTTGGTCGAGGTTTCAATGGAAGCAAATGCAGAGAATGGTCAGATGATTCAGGGAAAAC 2715 Query 2711 TCGAGAGTGTCCCTGTGGGGATCGAAGACATGTTCCTAAAAGCTCTTGCTCCACTGGACG 2770 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2716 TCGAGAGTGTCCCTGTGGGGATTGAAGACATGTTCCTAAAAGCTCTTGCTCCACCGGACG 2775 Query 2771 AACCTGAAGATACAATACCGAGCTACTACTCAGATCTATTCAATGCTTTGTGGGAAGTGT 2830 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2776 AACCTGAAGATACAATACCGAGCTACTACTCAGATCTATTCAATGCTTTGTGGGAAGTGT 2835 Query 2831 GTGGTTCTTCATCCAGCACCGCACACGAAACATTTGCACTAAAAGGTGGCAAAACGGCTG 2890 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2836 GTGGTTCTTCGTCCAGCACTGCACACGAAACATTTGCACTAAAAGGTGGCAAAATGGCTG 2895 Query 2891 CAGCAGTCAGCGGGACTCGGTCAGTAAAACTGCTTGAAGTCCCTGCGGAAACTGTAATAC 2950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2896 CAGCAGTCAGCGGGACTCGGTCAGTAAAACTGCTTGAAGTCCCTGCGGAAACTGTAATAC 2955 Query 2951 AGGCCACTGAGCTTCGCTTAGCGCCCTTTGTTGTGGCTATCAGCGGAGAACAGCTTGTAA 3010 |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2956 AGGCCACTGAGCTTCGTTTAGCGCCCTTTGTGGTGGCTATCAGTGGAGAACAGCTTGTAA 3015 Query 3011 ACATTGTAAGAGACGGAGGAATCATCGAGAACATTGTGTGGAAGGAAGAGGAAGAAGAAC 3070 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3016 ACATTGTAAGAGACGGAGGAATTATTGAGAACATTGTGTGGAAGGAAGAGGAAGAAGAAC 3075 Query 3071 AAGGGGATCACGCAAATGCGGACCAGTCTTCTTCATCCTCGGTGGGATTAAACCGAGGCC 3130 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3076 AAGGGGATCACACAAATGCGGACCAGCCTTCTTCATCCTCGGTGGGATTAAACCGAGGCC 3135 Query 3131 CTCTTCGTCTGACATACATTGGATATGGAGATGACCAAGAGGTTCCGATGACGAGGAGCA 3190 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 3136 CTCTTCGTCTGACATACATTGGATATGGAGATGACCAAGAGGTTCCGATGACGAGAAGTA 3195 Query 3191 GAGGGAAAATGGGAAAGATAAAGATGCTGATGTTTCTTCCTCCGAGATATCATCTGATGT 3250 | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| Sbjct 3196 GGGGGAAAATGGGAACGATAAAGATGCTGATGTTTCTGCCGCCAAGATATCATCTAATGT 3255 Query 3251 TTGAAATGGAAGTTGGTG-AAGGATCGACATTGGTGCATATAAGAACAGATTATTGGCCT 3309 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3256 TTGAAATGGAAGTTGG-GCAAGGATCGACATTGGTGCATATAAGAACAGATTATTGGCCT 3314 Query 3310 TGCTTAGCTTATGTTGATGATTACTTAGAAGCTTTGTTTTTGCAATA 3356 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3315 TGCTTAGCTTATGTTGATGATTACTTAGAAGCTTTGTTTTTGTAATA 3361 Score = 739 bits (400), Expect = 0.0 Identities = 447/470 (95%), Gaps = 2/470 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGACCACGACGACGCCGGAGAAGACTCCGGCGAGACCTCTCTCTATCCATGATTGGGAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 87 ATGACCACGACGACGCCGGAGAAGACTCCGGCGAGACCTCTCTCTATCCAAGATTGGGAC 146 Query 61 GTTCTCATCGACGACTTCCGAGACGCCGGCGCTCCTCGCGACTGGTTCACTTCCGTTTTC 120 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 147 GTTCTCATCGACGACTTCCGCGACGCCGGCGCTCCTCGCGACTGGTTCACTTCCGTTTTC 206 Query 121 CAGATTGATTCTCTGGTAGACTTCGCTCTCTCGTCTCTCCTCAAGAAAGACTTTCCTACG 180 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 207 CAGATTGATTCTCTGGTGGACTTCGCTCTCTCGTCTCTCCTCAAAAAAGACTTCCCTACA 266 Query 181 CCGGTGAAGCTCTCAATCCTTGTCTTTCTCGACGAATTTTCCCCGATTTTGTTTGATAAA 240 || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 267 CCAGTGAAGCTCTCAATCCTAGTCTTTCTCGATGAATTTTCCCCGATTTTGTTTGATAAT 326 Query 241 TGTGGTAACGACACCTTTGATCGCTTCATCGATGTTCTCCGTG-CGATTGTACAATCTCC 299 ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| Sbjct 327 TGTGGTAGCGATACCTTTGATCGCTTCATCGATGTTCTCCG-GACGATCGTGCAATCTCC 385 Query 300 GACTGATGGATCTTCCGGATTTAAAGAGCAAGCTATGGTTTCTTTCACGTCTGTGCTTGT 359 ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 386 AACTGATGGATCGTCAGGATTGAAAGAGCAAGCTATGGTCTCTTTCACGTCTGTGCTTGT 445 Query 360 ATCGATTGATTCTTTCTCTGTAGGTCACGTTGAAGCAGTTGTTGATTTACTTCTTGCGCT 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 446 ATCGATTGATTCTTTCTCTGTAGGTCACGTTGAAGCAGTTGTTGATTTGCTTCTTGCGCT 505 Query 420 CGTTAATCGTCCTAACCACGGCTTTGATCGACAAGCTCGTGCTATCGCCT 469 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 506 CGTTAATCGTCCTAACCACGGATTTGATCGACAAGCTCGTGCTATCGCCT 555 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 167055920190 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5