BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg321185
Length=5106
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G34680.1 | Symbols: AIR9 | Outer arm dynein light chain 1 pr... 8218 0.0
> AT2G34680.1 | Symbols: AIR9 | Outer arm dynein light chain 1
protein | chr2:14616622-14629129 REVERSE LENGTH=5739
Length=5739
Score = 8218 bits (4450), Expect = 0.0
Identities = 4914/5136 (96%), Gaps = 39/5136 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTCGATGAAGAAACTGTGGAAACC-------A--C--TG 49
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||
Sbjct 288 ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTTGAGGAAGAAACTGTGGAAACCAATGTAGATGCAGTG 347
Query 50 -TAGAGGACAATGTAACTACAGCTAATGAAAGTAGAAGTCCAGAAAATG-TT-T-C--TG 103
||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || || | | ||
Sbjct 348 AAAGAGGACAATGCAACTATAGCTAATGAAAGCAGAAGCCCAGAGAGTGTTTCTGCAGTG 407
Query 104 -C---GGTGTCAAGTCGAGCTGCTGCTACTAAGAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA 159
| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 TCTGTGGTGTCAAATCGAGCTGCTTCTACTAAAAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA 467
Query 160 ATTAAGCCAACAGCGTCTTCTTCTTTACGGGTCTCAGGTACTACACCTGTGACAATCAGG 219
|| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 468 ATAAAGCCAACTGCGTCTTCTTCATTACGGGTCTCGGGTACTACGCCTGTGACTATCAGG 527
Query 220 AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAAGTTAGTTGGTGCCTCTAAGGTTCTGCCTAAA 279
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 528 AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAATTTAGCTGGTACCTCTAAGGTTCTGCCTAAG 587
Query 280 CAAATGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGGCGATCACTTCCAGAATTGAGG 339
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 588 CAAGTGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGACGATCACTTCCAGAATTGAGG 647
Query 340 AAGAGCTCAATGTCTTCTCTTTCTGCCAAGACTGTATCCAAACCAAGTCTTTCCGAGAGT 399
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 648 AAGAGCTCTGTGTCTTCTCTTTCTGCTAAGACTGTATCCAAACCAAGCCTTTCCGAGAGT 707
Query 400 AAAAAGTCTGTCCCTGTATCACCAGGGAGTCGGAGTTCGACAAAGTCACCTGGGTTTAGT 459
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 708 AAAAAGTCTGTCCCCGTATCACCAGGTAGTCGGAGTTTGACAAAGTCAACTGGGTTTAGT 767
Query 460 TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACCAAG-CATGAGTGCCTCTGTGTCTTC-AACAA 517
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 768 TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACC-AGCCATGAGTGTTTCTGTGTCTTCGAA-AA 825
Query 518 GAGCTCCATCTTCATCGGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACCAGTAGTGGAAGACCACATT 577
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 826 GAGCTCCATCTTCATCAGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACTAGTAGTGGAAGACTACACT 885
Query 578 CTACTCTCA-ATAGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCTGGATCATCA 636
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 886 CTACTCTCACA-AGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCGGGATCATCA 944
Query 637 CCTTCTGTTTCTAGCGGTATAAGATCAAAGTCATTGTCGACACCTCTAGACCGGAGTTCC 696
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 945 CCTTCTGTTTCTAGCAGTATAAGATCAAAGTCATTTTCGTCACCTCTAGACCGGACTTCC 1004
Query 697 AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACAGCTACCCCTGAAAGCCGCGATTCACGACTCATTATT 756
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1005 AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACATCTACCCCTGAAAGCCGTGATTCACGACTCATTATT 1064
Query 757 CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGATATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG 816
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGACATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG 1124
Query 817 ATTCGCAGTCTAACCTCTGGGGGGC-TACACTTGTCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT 875
|||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 ATTCGCAGTCTAACCTCT-GGTGGCTTACACTTATCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT 1183
Query 876 TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT 1243
Query 936 GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT 1303
Query 996 GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT 1363
Query 1056 TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTAGCTCAAAATAAATTAAAATCACTTGCAATGGCAAG 1115
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1364 TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTTGCTCAAAATAAATTAAAGTCACTTGCAATGGCAAG 1423
Query 1116 CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT 1483
Query 1176 TCCATATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAAATTTC 1235
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1484 TCCGTATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAGATTTC 1543
Query 1236 TCATTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCATAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG 1295
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 TCACTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCGTAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG 1603
Query 1296 AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGACAATTGCAAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCCCTCTG 1355
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1604 AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGGCAATTGCCAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCTCTCTG 1663
Query 1356 CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTCTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT 1415
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTTTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT 1723
Query 1416 CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724 CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT 1783
Query 1476 TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGTCACTTTGGTCTTGTTCAGGAACTTCC 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1784 TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGCCACTTTGGTCTTTTTCAGGAAAGTCC 1843
Query 1536 TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT 1595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844 TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT 1903
Query 1596 TTCTAATTTTGTTCCTATTCTTGATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCAAAACGTGAAGA 1655
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1904 TTCTAATTTCGTTCCTATTCTTAATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCCAAACGTGAAGA 1963
Query 1656 CATTGGTAAAATGCTAAAGATAGAATGTACTCCTGTTATGGGAGAGACTGAATATCCATC 1715
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1964 CATTGGTAAAATTCTAAAGATAGAATGTACACCTGTTATGGCTGAGACTGAATATCCATC 2023
Query 1716 CATATTTGCCATATCTTCACCAGTTCAGCGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT 1775
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2024 CATATTTGCCATATCTTCCCCAGTTCAACGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT 2083
Query 1776 TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGAAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG 1835
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGGAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG 2143
Query 1836 GTGTGGTGGGACACCGGGAAAATGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAACGGGAG 1895
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2144 GTGTGGTGGGACACCAGGAAAGTGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAATGGGAG 2203
Query 1896 CCCTGTGGTGATTGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG 1955
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204 CCCTGTGGTGATCGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG 2263
Query 1956 ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA 2015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA 2323
Query 2016 GTACAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCTCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC 2075
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 GTATAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCGCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC 2383
Query 2076 TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTTTAAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA 2135
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTCTCAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA 2443
Query 2136 AGGTCCTAGCAAGTTCAAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCCTTGAT 2195
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2444 AGGTCCTAGCAAGTTCGAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCGTTGAT 2503
Query 2196 ATCGGCTGGAACATCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTCACTTT 2255
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2504 ATCGGCTGGAACCTCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTAACTTT 2563
Query 2256 TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG 2315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG 2623
Query 2316 TGTAATCAACCCAGCACCTCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGATTTAAGGGA 2375
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2624 TGTAGTCAAGCCAGCACCCCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGACTTGAGGGA 2683
Query 2376 GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT 2435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT 2743
Query 2436 GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATTCTAGAAGGAGGCAATTCTCTTGAAGAATTGAG 2495
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2744 GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATCCTGGAAGGAGACAATTCTCTTGAAGAATTGAG 2803
Query 2496 CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCATTGGGGGCGGTGGGCTATTTCATAGT 2555
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2804 CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCCTTGGGGGCAGTGGGCTATTACATAGT 2863
Query 2556 TGCGAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGTGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTATC 2615
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2864 TGCAAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGGGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTCTC 2923
Query 2616 GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCCTGTCAATTACTGGAGACAA 2675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 2924 GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCTTGTCAATTACGGGAGACAA 2983
Query 2676 TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTATGGATACATAGGGGGGCATGAAGGTAAAAG 2735
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2984 TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTACGGATACATAGGAGGGCATGAAGGTAAAAG 3043
Query 2736 CATATACGAATGGCATTATCATAAGGCAGAAAATGATCTCCCTGGCACATTGATACCTGA 2795
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3044 CAAATACGAATGGCATTATCATAAGGCTGAAAATGATCTCCCTGGTGCATTGATACCTGA 3103
Query 2796 AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATTGGTAAATTCATTTCATT 2855
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3104 AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATAGGTAAATTCATTTCATT 3163
Query 2856 TCAATGTATTCCTATGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAATTGCATGTCCCA 2915
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3164 TCAATGTATTCCTGTGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAGTTGCATGTCCCA 3223
Query 2916 GGAACGTGCTCGTCCAGGAAACCCAAGCGCGGTATCTCTTCAAGTTGTTGGAGCTCCTGT 2975
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 3224 GGAACGTGTTCGTCCAGGAAACCCAAGCACGGTATCTCTTCATGTTGTTGGAGCTCTTGT 3283
Query 2976 TGAAGGAACCATGCTATATGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT 3035
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 TGAAGGAACCATGCTATCTGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT 3343
Query 3036 TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC 3095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3344 TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC 3403
Query 3096 TTCGTCATATCTGCTGTCAGTCGATGATATCGGTTTCTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC 3155
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3404 TTCGTCATATCTACTGTCAGTCGGTGATATCGGTTACTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC 3463
Query 3156 CATGAGAAATGACATG-GCTCGTGGACCCACGGTTATTTCTGAACTATCTGGACCAATTG 3214
|||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3464 TGTGAGAAATGACA-GAGCCCGTGGACCCACAGCCATTTCTGAAATAGCTGGACCAATTG 3522
Query 3215 TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC 3274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC 3582
Query 3275 GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATAAAAGGAAATTGCTACCTTGAATGGG 3334
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3583 GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATGAAGGGAAATTGCTATCTTGAATGGG 3642
Query 3335 TTAGGGTGAAAAGTAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAATGATGAGTTTTTGGATTTAT 3394
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3643 TTAGGGTGAAAAATAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAGTGATGAGTTTTTGGATTTAT 3702
Query 3395 CACTGGACGATGTTGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA 3454
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3703 CACTGGACGATGTCGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA 3762
Query 3455 TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGTCTGATGGCATTGCTCCAGCAAATCCGATGGGGT 3514
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3763 TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGACTGATGGTATTGCTCCAGCAAATCCTATGGGGT 3822
Query 3515 TGGAGCTTAAAATTCCTGACTGCCGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT 3574
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3823 TGGAGCTTTTAATTCCTGACTGCTGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT 3882
Query 3575 TTGGAGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATAGAACTAAGGTCAAGTTGCATG 3634
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3883 TTGGGGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATCGAACTAAGGTCAAGTTGCATG 3942
Query 3635 GATCTGCACTCACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGCTTGTAGTAGAACAT 3694
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 3943 GATCTGCACTTACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGTTTGTTGTAGAACAT 4002
Query 3695 TAAAATATACTCCATCACTTGAAGATGTGGGCGCTTATCTAGTCTTGTACTGGATTCCTA 3754
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4003 TAAAATATACTCCATCGCTTGAAGATGTGGGGGCTTATCTAGTCTTGTATTGGATTCCTA 4062
Query 3755 CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTT-TCGATAACAAACTCTCTTGTTGCC 3813
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4063 CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTTGT-GATAACAAACTCTCCTGTTGCC 4121
Query 3814 CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT 3873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4122 CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT 4181
Query 3874 GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGCCATGAAGGTGCTAGTATCTTCAGTTGGTACAGAGAT 3933
||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4182 GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGACATGAAGGTCCAAGTCTCTTCAGTTGGTACAGAGAG 4241
Query 3934 AATGATGGAAACATTGATCTTATTGCTGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG 3993
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4242 AATGATGGAACCATTGATCTTATTGATGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG 4301
Query 3994 TCGGATTACAATTGCCGAATATTGTTTGGGTACACACCTGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG 4053
|| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4302 TCAGATTACAATTGCCGGATATTGTTCGGGTACACACCAGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG 4361
Query 4054 GGAGAGTTAAAGATGTCCGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC 4113
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4362 GGAGAGCTAAAGATGTCTGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC 4421
Query 4114 ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCGGTACAGGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC 4173
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4422 ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCTGTACAAGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC 4481
Query 4174 CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGAAATTCAATACCAA 4233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4482 CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGATATTCAATACCAA 4541
Query 4234 TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATTTCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAACT 4293
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4542 TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATATCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAATT 4601
Query 4294 TCGTGTTCATACAGGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA 4353
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4602 TCGTGTTCATACAAGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA 4661
Query 4354 GTACATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATTA 4413
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4662 GTGCATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATCA 4721
Query 4414 CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTTCATACTAACTTA 4473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4722 CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTCCATACTAACTTA 4781
Query 4474 TATAG-TGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT 4532
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4782 TAT-GCTGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT 4840
Query 4533 TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA 4592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4841 TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA 4900
Query 4593 TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATCCGTGA 4652
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4901 TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGA 4960
Query 4653 GGATGGTGTTCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACAGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA 4712
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4961 GGATGGTGTCCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACTGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA 5020
Query 4713 CCTT-TATAAGGAAGTGA-AGCAGAAACTAGAAACCGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG 4770
|| | ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5021 TATTCT-TAAGGAAGTGAGA-CAGAAATTAGAAACTGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG 5078
Query 4771 TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG 4830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5079 TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG 5138
Query 4831 CTGGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTAAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA 4890
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5139 CTAGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA 5198
Query 4891 ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAATGAC 4950
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5199 ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAACGAC 5258
Query 4951 CAGAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCATTCG 5010
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5259 CAAAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCAGTCG 5318
Query 5011 CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTGCTTGTCATTCGCGGGTTTGCTCAGCGATTCAACAGC 5070
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 5319 CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTACTTGTCATTCGCGGCTTTGCTCAGCGGTTCAACAGC 5378
Query 5071 ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA 5106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5379 ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA 5414
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 254797903497
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5