BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg321185

Length=5106
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G34680.1 | Symbols: AIR9 | Outer arm dynein light chain 1 pr...  8218    0.0  


> AT2G34680.1 | Symbols: AIR9 | Outer arm dynein light chain 1 
protein | chr2:14616622-14629129 REVERSE LENGTH=5739
Length=5739

 Score = 8218 bits (4450),  Expect = 0.0
 Identities = 4914/5136 (96%), Gaps = 39/5136 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTCGATGAAGAAACTGTGGAAACC-------A--C--TG  49
             ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||       |  |  ||
Sbjct  288   ATGGAGGAAGTAGCAGCTAAGGTTGAGGAAGAAACTGTGGAAACCAATGTAGATGCAGTG  347

Query  50    -TAGAGGACAATGTAACTACAGCTAATGAAAGTAGAAGTCCAGAAAATG-TT-T-C--TG  103
               ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || || | |  ||
Sbjct  348   AAAGAGGACAATGCAACTATAGCTAATGAAAGCAGAAGCCCAGAGAGTGTTTCTGCAGTG  407

Query  104   -C---GGTGTCAAGTCGAGCTGCTGCTACTAAGAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA  159
              |   |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408   TCTGTGGTGTCAAATCGAGCTGCTTCTACTAAAAAGAAACCAGTTATTAGTTCGAATTTA  467

Query  160   ATTAAGCCAACAGCGTCTTCTTCTTTACGGGTCTCAGGTACTACACCTGTGACAATCAGG  219
             || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct  468   ATAAAGCCAACTGCGTCTTCTTCATTACGGGTCTCGGGTACTACGCCTGTGACTATCAGG  527

Query  220   AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAAGTTAGTTGGTGCCTCTAAGGTTCTGCCTAAA  279
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| 
Sbjct  528   AGAAATAGTACTGGAGGAGTAACAGAGAATTTAGCTGGTACCTCTAAGGTTCTGCCTAAG  587

Query  280   CAAATGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGGCGATCACTTCCAGAATTGAGG  339
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  588   CAAGTGAGTACTACTGCCTCACGTACTGATCCGGTAAGACGATCACTTCCAGAATTGAGG  647

Query  340   AAGAGCTCAATGTCTTCTCTTTCTGCCAAGACTGTATCCAAACCAAGTCTTTCCGAGAGT  399
             ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  648   AAGAGCTCTGTGTCTTCTCTTTCTGCTAAGACTGTATCCAAACCAAGCCTTTCCGAGAGT  707

Query  400   AAAAAGTCTGTCCCTGTATCACCAGGGAGTCGGAGTTCGACAAAGTCACCTGGGTTTAGT  459
             |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct  708   AAAAAGTCTGTCCCCGTATCACCAGGTAGTCGGAGTTTGACAAAGTCAACTGGGTTTAGT  767

Query  460   TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACCAAG-CATGAGTGCCTCTGTGTCTTC-AACAA  517
             ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| || ||
Sbjct  768   TTAAGTAAGCCTGAGTCTTCTGCTAGACC-AGCCATGAGTGTTTCTGTGTCTTCGAA-AA  825

Query  518   GAGCTCCATCTTCATCGGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACCAGTAGTGGAAGACCACATT  577
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct  826   GAGCTCCATCTTCATCAGTTGACAGTAGTGGCAGCAGGACTAGTAGTGGAAGACTACACT  885

Query  578   CTACTCTCA-ATAGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCTGGATCATCA  636
             ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  886   CTACTCTCACA-AGTGGGAGGACAGTTTCTAAAGTTTCTTCTCCCTCTGCGGGATCATCA  944

Query  637   CCTTCTGTTTCTAGCGGTATAAGATCAAAGTCATTGTCGACACCTCTAGACCGGAGTTCC  696
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct  945   CCTTCTGTTTCTAGCAGTATAAGATCAAAGTCATTTTCGTCACCTCTAGACCGGACTTCC  1004

Query  697   AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACAGCTACCCCTGAAAGCCGCGATTCACGACTCATTATT  756
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1005  AACTTCTCTGGACGGAAGAAAACATCTACCCCTGAAAGCCGTGATTCACGACTCATTATT  1064

Query  757   CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGATATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG  816
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1065  CTTCCAAAGGTGGAGGTTAAAGCTGGCGATGACATGAGATTGGATCTTAGAGGCCACAGG  1124

Query  817   ATTCGCAGTCTAACCTCTGGGGGGC-TACACTTGTCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT  875
             |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1125  ATTCGCAGTCTAACCTCT-GGTGGCTTACACTTATCACCAAACTTAGAGTTTGTCTATCT  1183

Query  876   TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT  935
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1184  TAGAGACAATCTCCTATCTACGCTGGAAGGTATTGAGATATTGAATCGAGTCAAGGTTCT  1243

Query  936   GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT  995
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1244  GGATTTGAGTTTTAATGATTTCAAAGGGCCTGGATTTGAACCACTTGAGAATTGCAAAAT  1303

Query  996   GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT  1055
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1304  GCTGCAGCAACTTTATCTTGCTGGAAATCAGATAACTTCACTTGCTAGTCTGCCTCAACT  1363

Query  1056  TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTAGCTCAAAATAAATTAAAATCACTTGCAATGGCAAG  1115
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1364  TCCAAACTTAGAGTTTCTCTCGGTTGCTCAAAATAAATTAAAGTCACTTGCAATGGCAAG  1423

Query  1116  CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT  1175
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1424  CCAGCCCCGGCTTCAGGTACTAGCAGCAAGTAAGAACAAGATAACAACTCTGAAGGACTT  1483

Query  1176  TCCATATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAAATTTC  1235
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1484  TCCGTATCTACCAGTTCTTGAGCATCTGCGGGTTGAGGAAAATCCATTGCTGAAGATTTC  1543

Query  1236  TCATTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCATAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG  1295
             ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1544  TCACTTGGAAGCGGCATCCATACTACTCGTAGGTCCTACCTTGAAGAAATTCAATGACAG  1603

Query  1296  AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGACAATTGCAAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCCCTCTG  1355
             |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1604  AGATCTCTCTCGTGAGGAAGTGGCAATTGCCAAGCGTTATCCTCCACAAACAGCTCTCTG  1663

Query  1356  CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTCTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT  1415
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1664  CCTCAGAGAAGGTTGGGAGTTTTGCAAGTCTGATCTTGCAGCAGAATCGACATTCCGCTT  1723

Query  1416  CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT  1475
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1724  CTTAGTTGAGAGGTGGAAGGACACATTACCTTCTGGTTATCTTATTAAAGAAGCACATGT  1783

Query  1476  TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGTCACTTTGGTCTTGTTCAGGAACTTCC  1535
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||
Sbjct  1784  TGACCGACCTTCTGAAGAAGCTCCCTGTCAATGCCACTTTGGTCTTTTTCAGGAAAGTCC  1843

Query  1536  TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT  1595
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1844  TACTGCTACAGATCAAGAATTAGCCCTGAAATTTCAATGGTCTGTGGCGGACAGATCTCT  1903

Query  1596  TTCTAATTTTGTTCCTATTCTTGATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCAAAACGTGAAGA  1655
             ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1904  TTCTAATTTCGTTCCTATTCTTAATGCAACCAAGGAGGTCTATTGGCCCAAACGTGAAGA  1963

Query  1656  CATTGGTAAAATGCTAAAGATAGAATGTACTCCTGTTATGGGAGAGACTGAATATCCATC  1715
             |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||
Sbjct  1964  CATTGGTAAAATTCTAAAGATAGAATGTACACCTGTTATGGCTGAGACTGAATATCCATC  2023

Query  1716  CATATTTGCCATATCTTCACCAGTTCAGCGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT  1775
             |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2024  CATATTTGCCATATCTTCCCCAGTTCAACGAGGAAAGGGAATACCAAAAGTTGTGAGCCT  2083

Query  1776  TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGAAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG  1835
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2084  TGAATTAAATGGGGAACTAGTTGAGGGGAATATTATCAAGGGTCAAGCAGTGGTTGCATG  2143

Query  1836  GTGTGGTGGGACACCGGGAAAATGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAACGGGAG  1895
             ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2144  GTGTGGTGGGACACCAGGAAAGTGTATTACCAGTTGGTTGAGGAGAAAGTGGAATGGGAG  2203

Query  1896  CCCTGTGGTGATTGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG  1955
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2204  CCCTGTGGTGATCGATGGAGCTGAAGATGAGGAATATATGTTATCTTTAGATGATGTGGG  2263

Query  1956  ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA  2015
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2264  ATCAAGTATGGTTTTCATGTACACACCAGTCACAGAAGGAGGTGCAAGAGGAGAGCCTCA  2323

Query  2016  GTACAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCTCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC  2075
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2324  GTATAAGTACACAGAGTTCGTAAAAGCAGCGCCTCCATCTGTAAGTAATGTTCGAATTAC  2383

Query  2076  TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTTTAAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA  2135
             ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2384  TGGAGATGCTGTTGAAGGCTGCGTTCTCAAGGGGGTTGGAGATTATTTTGGAGGCAAGGA  2443

Query  2136  AGGTCCTAGCAAGTTCAAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCCTTGAT  2195
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2444  AGGTCCTAGCAAGTTCGAATGGTTACGGAAGAACAAGGAAACAGGAGAACTCTCGTTGAT  2503

Query  2196  ATCGGCTGGAACATCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTCACTTT  2255
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  2504  ATCGGCTGGAACCTCCGAGTATACATTGACCCAGGAAGATGTTGGCACACATGTAACTTT  2563

Query  2256  TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG  2315
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2564  TGTGTACATACCTGCAAATTTTGAGGGGCTAGAGGGGGAACCAGTGTCAACTTCATCCAG  2623

Query  2316  TGTAATCAACCCAGCACCTCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGATTTAAGGGA  2375
             |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  2624  TGTAGTCAAGCCAGCACCCCCGAAAGTAACAGATGCTAAGATAGTTGGTGACTTGAGGGA  2683

Query  2376  GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT  2435
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2684  GAATAGTAAGGTCACTGTAACAGGTACTGTTACTGGAGGAACTGAAGGTTCAAGCAGAGT  2743

Query  2436  GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATTCTAGAAGGAGGCAATTCTCTTGAAGAATTGAG  2495
             ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2744  GCAATGGTTCAAATCAAGTTGTTCTATCCTGGAAGGAGACAATTCTCTTGAAGAATTGAG  2803

Query  2496  CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCATTGGGGGCGGTGGGCTATTTCATAGT  2555
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct  2804  CACATCAAAAGTGGCAAAGTCATTCCGTATACCCTTGGGGGCAGTGGGCTATTACATAGT  2863

Query  2556  TGCGAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGTGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTATC  2615
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2864  TGCAAAGTATACTCCAATGACACCTGATGGGGAATGCGGTGAACCAGTATATGTACTCTC  2923

Query  2616  GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCCTGTCAATTACTGGAGACAA  2675
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct  2924  GGAAAGAGCAGTTGAGACCCTTCCCCCCAGCTTAAATTTCTTGTCAATTACGGGAGACAA  2983

Query  2676  TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTATGGATACATAGGGGGGCATGAAGGTAAAAG  2735
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2984  TATCGAGGGTGGAATATTGACAGCATCCTACGGATACATAGGAGGGCATGAAGGTAAAAG  3043

Query  2736  CATATACGAATGGCATTATCATAAGGCAGAAAATGATCTCCCTGGCACATTGATACCTGA  2795
             || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||
Sbjct  3044  CAAATACGAATGGCATTATCATAAGGCTGAAAATGATCTCCCTGGTGCATTGATACCTGA  3103

Query  2796  AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATTGGTAAATTCATTTCATT  2855
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3104  AGCCTCTGGGCTTCTTCAGTATACGATTACTAAAGAAGCTATAGGTAAATTCATTTCATT  3163

Query  2856  TCAATGTATTCCTATGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAATTGCATGTCCCA  2915
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3164  TCAATGTATTCCTGTGAGGGATGATGGGATTGTGGGTGAGCCAAGAAGTTGCATGTCCCA  3223

Query  2916  GGAACGTGCTCGTCCAGGAAACCCAAGCGCGGTATCTCTTCAAGTTGTTGGAGCTCCTGT  2975
             |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct  3224  GGAACGTGTTCGTCCAGGAAACCCAAGCACGGTATCTCTTCATGTTGTTGGAGCTCTTGT  3283

Query  2976  TGAAGGAACCATGCTATATGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT  3035
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3284  TGAAGGAACCATGCTATCTGCAGAGAAAGAATATTGGGGTGGTGAAGAAGGAGCATCAGT  3343

Query  3036  TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC  3095
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3344  TTTCCGGTGGTTCCGGACTAATTCAGATGGTACTCCATGCGAAATAAAGGGTGCAACTAC  3403

Query  3096  TTCGTCATATCTGCTGTCAGTCGATGATATCGGTTTCTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC  3155
             |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3404  TTCGTCATATCTACTGTCAGTCGGTGATATCGGTTACTTCATTTCGGTTTCTTATGAACC  3463

Query  3156  CATGAGAAATGACATG-GCTCGTGGACCCACGGTTATTTCTGAACTATCTGGACCAATTG  3214
               |||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||
Sbjct  3464  TGTGAGAAATGACA-GAGCCCGTGGACCCACAGCCATTTCTGAAATAGCTGGACCAATTG  3522

Query  3215  TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC  3274
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3523  TAGCTGGCCATCCAAATTGTCAGTCACTGGAGTTTCTTGGATCAATGATTGAAGGGCAAC  3582

Query  3275  GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATAAAAGGAAATTGCTACCTTGAATGGG  3334
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3583  GCTTGAGCTTTGTTGCTTCATATACTGGAGGGATGAAGGGAAATTGCTATCTTGAATGGG  3642

Query  3335  TTAGGGTGAAAAGTAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAATGATGAGTTTTTGGATTTAT  3394
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3643  TTAGGGTGAAAAATAATGGTGTTAAGGAAATATTGAGTAGTGATGAGTTTTTGGATTTAT  3702

Query  3395  CACTGGACGATGTTGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA  3454
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3703  CACTGGACGATGTCGGGGAAAGCATTGAACTTATTTACACTCCTGTTCGTGAAGATGGAA  3762

Query  3455  TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGTCTGATGGCATTGCTCCAGCAAATCCGATGGGGT  3514
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3763  TAGAAGGGAGTCCAAGGAGTATCAGGACTGATGGTATTGCTCCAGCAAATCCTATGGGGT  3822

Query  3515  TGGAGCTTAAAATTCCTGACTGCCGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT  3574
             ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3823  TGGAGCTTTTAATTCCTGACTGCTGTGAGAAACAAGAGGTTGTGCCTCATAAAACTTATT  3882

Query  3575  TTGGAGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATAGAACTAAGGTCAAGTTGCATG  3634
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3883  TTGGGGGCCATGAAGGTGTTGGAGAGTACATCTGGTATCGAACTAAGGTCAAGTTGCATG  3942

Query  3635  GATCTGCACTCACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGCTTGTAGTAGAACAT  3694
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct  3943  GATCTGCACTTACGGAAATATCCTATGCCGGTGAAGAGGTTGTTGTTTGTTGTAGAACAT  4002

Query  3695  TAAAATATACTCCATCACTTGAAGATGTGGGCGCTTATCTAGTCTTGTACTGGATTCCTA  3754
             |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  4003  TAAAATATACTCCATCGCTTGAAGATGTGGGGGCTTATCTAGTCTTGTATTGGATTCCTA  4062

Query  3755  CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTT-TCGATAACAAACTCTCTTGTTGCC  3813
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct  4063  CTCGCGTAGATGGGAGAAGTGGGAAGCCAGTTGTTGT-GATAACAAACTCTCCTGTTGCC  4121

Query  3814  CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT  3873
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4122  CCAGCTGATCCAGAAGTATCTAATGTTCGTGTGAAGAAACTTTTTTCGGATGCTTATTCT  4181

Query  3874  GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGCCATGAAGGTGCTAGTATCTTCAGTTGGTACAGAGAT  3933
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| 
Sbjct  4182  GGAGAAGGAGAGTACTTTGGTGGACATGAAGGTCCAAGTCTCTTCAGTTGGTACAGAGAG  4241

Query  3934  AATGATGGAAACATTGATCTTATTGCTGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG  3993
             |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4242  AATGATGGAACCATTGATCTTATTGATGGGGCTAACTCCAAAACGTATGAGGTGACTGAG  4301

Query  3994  TCGGATTACAATTGCCGAATATTGTTTGGGTACACACCTGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG  4053
             || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  4302  TCAGATTACAATTGCCGGATATTGTTCGGGTACACACCAGTTCGTTCAGATTCTGTTGTG  4361

Query  4054  GGAGAGTTAAAGATGTCCGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC  4113
             |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4362  GGAGAGCTAAAGATGTCTGAGCCAACTGAAATTATCCTCCCAGAGGTTCCAAAAGTAGAC  4421

Query  4114  ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCGGTACAGGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC  4173
             ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4422  ATGCTTGCTTTCACCGGAAAGGCTGTACAAGGTGATGTTCTCACAGCCGTCCAAGTGATC  4481

Query  4174  CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGAAATTCAATACCAA  4233
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  4482  CCAAAGACTGAAATTCAACAACTTGTTTGGAGCAAGTACAAAGGAGATATTCAATACCAA  4541

Query  4234  TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATTTCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAACT  4293
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4542  TGGTTCCGCTCACCGGAATCAGGGGATAAGATATCGTATGAGGCTCTCTCTTCAGAAATT  4601

Query  4294  TCGTGTTCATACAGGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA  4353
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4602  TCGTGTTCATACAAGGTGCGGTTTGAGGATATTGGCAGATGTCTCAAATGTGAATGTGTA  4661

Query  4354  GTACATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATTA  4413
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4662  GTGCATGATGTGTTTGGAAGGTCTAGTGAACTAGCATACGCCGAGACTGATCCAATATCA  4721

Query  4414  CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTTCATACTAACTTA  4473
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  4722  CCAGGTTTTCCTAGGATAGAGAAGCTAGAGATTGAAGGACAAGGTTTCCATACTAACTTA  4781

Query  4474  TATAG-TGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT  4532
             ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4782  TAT-GCTGTGCGGGGAAATTATTTTGGTGGTAAAGAGGGAAAGAGTAAAATCCAATGGCT  4840

Query  4533  TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA  4592
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4841  TAGATCAATGGTTGGAAGCCCTGATCTCATCTCAATTCCAGGTGAGACAGGAAGGATGTA  4900

Query  4593  TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATCCGTGA  4652
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4901  TGAAGCTAATGTGGATGATGTCGGATACAGACTGGTCGTTGTATATACACCCATACGTGA  4960

Query  4653  GGATGGTGTTCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACAGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA  4712
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4961  GGATGGTGTCCAAGGCCACCCAGTTTCTGCATCAACTGAGCCTGTTGCTGTTGAACCTGA  5020

Query  4713  CCTT-TATAAGGAAGTGA-AGCAGAAACTAGAAACCGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG  4770
               || | ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5021  TATTCT-TAAGGAAGTGAGA-CAGAAATTAGAAACTGGGTTAGTGAAGTTTGAGGTGTTG  5078

Query  4771  TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG  4830
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5079  TGTGACAAGGACCCTTATCCCAAAAAGATTGTGGGAGAGGGAAATCTCGAGAGACGAATG  5138

Query  4831  CTGGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTAAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA  4890
             || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5139  CTAGAAATGAACAGGAAGAGAATAAAGGTTGTGAAACCAGGTTCAAAGACGTCTTTCGCA  5198

Query  4891  ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAATGAC  4950
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  5199  ACTACTGAAGTCCGTGGAAGCTATGGTCCTCCTTTCCACGTGGAGACATTTCGTAACGAC  5258

Query  4951  CAGAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCATTCG  5010
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  5259  CAAAGAAGGCTAAGGATAGTTGTGGATAGTGAGAATGAAGTAGACATAGTGGTGCAGTCG  5318

Query  5011  CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTGCTTGTCATTCGCGGGTTTGCTCAGCGATTCAACAGC  5070
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  5319  CGCCATCTCCGCGATGTTATAGTACTTGTCATTCGCGGCTTTGCTCAGCGGTTCAACAGC  5378

Query  5071  ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA  5106
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5379  ACTTCACTCAATTCTCTACTTAAGATCGATACATGA  5414



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 254797903497


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5