BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg322384
Length=2889
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G47390.1 | Symbols: | Prolyl oligopeptidase family protein ... 4857 0.0
> AT2G47390.1 | Symbols: | Prolyl oligopeptidase family protein
| chr2:19441992-19446365 REVERSE LENGTH=3284
Length=3284
Score = 4857 bits (2630), Expect = 0.0
Identities = 2800/2885 (97%), Gaps = 0/2885 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATGCGCTTTCACAAAGCTTGTCATCGTTTCTCTCTTTCACCTCTCTGCCATTTATCT 60
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 ATGATGCGCTTTCATAAAGCTTGTCATCGTTTCTCTCTTTCACCTCTCTGCCATTTATCT 172
Query 61 CCACCGTCTCCGTCGCCGGCTGCTTCTCTCCTTCTACTTCCCAAGCTTTCCGGATTCTCT 120
|| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 CCGCCGTCTCCGTCACCGGCTTCTTCTCTCCTTCTACTTCCCAAGCTTTCCGGATTCTCG 232
Query 121 ACGCTGTGTACACGCCGTTGCGCAAGAGTTCGCCGATTCTCCGATAACCCGTTGACCACT 180
|| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 233 ACTCTGAGTACACGACGTTGCGTAAGAGTTCGCCGATTCTCCGAAAACCCGTTGACCACT 292
Query 181 GTCATGTCTTCACGTGCTGCTGCTAGGCTTCGTTGTCTCGCATCTGTCTGTCCTGGAGGT 240
|||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 293 GTCATGGCTTCACGTTCTGCTTCTAGGCTTCGTTCTCTCGCATCTGCCTGTTCTGGAGGT 352
Query 241 GCTGAAGACGGTGGTGGCACCTCTAATGGCTCAGTATCAGCCTCTGCTACTACAACTGAA 300
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 353 GCTGAAGACGGTGGTGGAACCTCTAATGGCTCCCTATCAGCCTCTGCTACTGCAACTGAA 412
Query 301 GATGATGAATTGGCTTTAGGCACTGGATATCGTCTGCCTCCACCTGAGATCAGAGATATT 360
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 GATGATGAATTGGCTATAGGCACTGGATATCGTCTGCCTCCACCTGAGATCAGAGATATT 472
Query 361 GTAGATGCTCCACCAGTCCCGGCATTATCATTTTCACCACATAGGGATAAGATACTGTTT 420
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 473 GTAGATGCTCCACCAGTCCCGGCTTTATCATTTTCACCACATAGGGATAAGATATTGTTT 532
Query 421 CTCAAGCGGAGAGCATTGCCTCCCCTCGCTGATTTAGCTAGACCAGAGGAAAAGCTTGCT 480
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 533 CTCAAGCGGAGAGCATTGCCTCCGCTCGCAGATTTAGCTAGACCAGAGGAGAAGCTTGCT 592
Query 481 GGTGTTCGAATTGATGGACACTGCAATACCAGAAGCAGGATGTCTTTCTATACTGGTTTA 540
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 593 GGTGTTCGAATTGATGGATACTGCAATACCAGAAGCAGAATGTCATTCTATACTGGTTTA 652
Query 541 GGAATCCATCAGCTATTGCCTGATGGTACATTGAGTCCAGAGAAGGAGATCACTGGCATT 600
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 653 GGAATCCATCAGTTATTGCCTGATGGTACATTGAGTCCTGAGAAGGAGATCACTGGCATT 712
Query 601 CCAGATGGTGGTAAGATTAACTTTGTTACATGGTCTAATGACGGTAAGCATCTGGCTTTC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CCAGATGGTGGTAAGATTAACTTTGTTACATGGTCCAATGACGGTAAGCATCTGGCTTTC 772
Query 661 AGCATCCGGGTCGATGAGAACGGAAATAGTAGTAAGCCAGTAGTATGGGTAGCTGATGTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 773 AGCATCCGGGTCGATGAGAACGGAAATAGTAGTAAGCCAGTGGTATGGGTAGCTGATGTT 832
Query 721 GAGACTGGAGTAGCTAGACCATTGTTTAACTCGCAAGATATTTATCTGAATCCGATTTTT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 833 GAGACTGGAGTAGCTAGACCATTGTTTAACTCGCAAGATATTTTTCTGAATGCGATTTTT 892
Query 781 GAGAGTTTTGTTTGGATTGATAATTCCACTTTGTTGGTGAGCACAATCCCTTCATCTCGT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 GAGAGTTTTGTTTGGATTGATAATTCCACTTTGTTGGTGAGCACAATCCCTTCATCTCGT 952
Query 841 GGAGACCCACCAAAGAAACCTTTGGTGCCATCTGGTCCCAAAACTCTGTCAAACGAGACG 900
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 GGAGAACCACCAAAGAAACCTTTGGTGCCATCTGGTCCCAAAACTCTGTCAAACGAGACG 1012
Query 901 AAGACTGTTGTCCAAGTTAGAACATTCCAAGATTTGCTTAAGGATGAGTATGATGCTGAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 AAGACTGTTGTCCAAGTTAGAACATTCCAAGATTTGCTTAAGGATGAGTATGATGCTGAT 1072
Query 961 TTATTCGACTACTACGCCACATCACAATTAGTATTGGCTTCTTTGGATGGCACAGTGAAG 1020
||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1073 TTATTTGACTACTACGCTTCATCACAACTAGTATTGGCTTCTTTGGATGGTACTGTGAAG 1132
Query 1021 GAAGTAGGGGTTCCTGCAGTGTATACATCGTTAGACCCTTCGACAGACCATAAATACTTG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1133 GAAGTAGGGGTTCCTGCAGTGTATACATCGTTAGACCCTTCGACAGACCATAAGTACTTG 1192
Query 1081 TTAGTGTCATCACTTCACAGGCCATATTCCTTCATTGTACCCTGTGGTAGATTTCCAAAG 1140
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1193 TTGGTGTCATCACTTCACAGGCCATATTCCTTCATTGTACCTTGTGGTAGATTTCCAAAG 1252
Query 1141 AAGGTGGAAGTCTGGACAACTGATGGTAGATTTGTAAGACAGCTATGTGACTTGCCCTTA 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 AAGGTGGAAGTCTGGACAACTGATGGTAGATTTGTAAGACAGCTATGTGACTTGCCCTTG 1312
Query 1201 GCTGAAGATATCCCCATTGCCTCCAATAGTGTGCGGAAAGGAATGCGTTCAATAAACTGG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GCTGAAGATATCCCCATTGCCTCCAATAGTGTGCGGAAAGGAATGCGTTCAATAAACTGG 1372
Query 1261 CGAGCAGACAAGCCTTCAACCCTCTACTGGGCAGAAACACAAGATGGAGGTGATGCCAAA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 CGAGCAGACAAGCCTTCAACCCTCTACTGGGCAGAAACACAAGATGGAGGTGATGCCAAA 1432
Query 1321 ATGGAAGTTTCACCGCGTGATATAGTTTATATGCAGTCTGCGGAACCATTGGCAGGAGAA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1433 ATGGAAGTTTCACCGCGTGATATAGTTTATATGCAGTCTGCTGAACCATTGGCAGGAGAA 1492
Query 1381 GAACCAGAAGTGTTACACAAGCTCGATCTTCGTTATGGAGGGATTTCTTGGTGTGATAAT 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1493 GAACCAGAAGTGTTACACAAGCTCGATCTTCGTTATGGAGGGATTTCTTGGTGTGATGAT 1552
Query 1441 ACGTTAGCTCTAGTTTATGAATCATGGTATAAAACACGACGAACAAGGACATGGGTTATC 1500
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1553 ACATTAGCTCTGGTTTATGAATCATGGTATAAAACACGACGAACAAGGACGTGGGTTATC 1612
Query 1501 TCTCCTGGATCTAACGATGTCAGTCCACGCATCTTGTTTGATAGATCATCGGAAGATGTG 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 TCTCCTGGATCTAACGATGTCAGTCCACGCATCTTGTTTGATAGATCATCGGAAGATGTG 1672
Query 1561 TACTCAGACCCTGGCTCAACCATGCTGAGGAGAACCGCTGCTGGAACGTATGTAATAGCA 1620
||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 TACTCAGACCCTGGCTCAACCATGCTGAGAAGGACCGATGCTGGAACGTATGTAATAGCA 1732
Query 1621 AAGATAAAGAAGGAAAATGATGAAGGCACTTATGTATTACTGAACGGAAGTGGGGCTACA 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 AAGATAAAGAAGGAAAATGATGAAGGCACTTATGTATTACTGAACGGAAGTGGGGCTACA 1792
Query 1681 CCACAAGGGAATGTGCCCTTCCTTGACTTGTTTGACATAAATACAGGCAACAAAGAACGA 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 CCACAAGGGAATGTGCCCTTCCTTGACTTGTTTGACATAAATACAGGCAACAAAGAACGA 1852
Query 1741 ATCTGGGAGAGCGACAAGGAAAAGTATTTCGAGACAGTTGTTGCTTTGATGTCTGACCAG 1800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1853 ATCTGGGAGAGCGACAAGGAAAAGTATTTCGAGACAGTTGTTGCCTTGATGTCTGACCAA 1912
Query 1801 AAAGAAGGGGATTTAAAAATGGAGGAGCTGAAAATTCTGACATCAAAGGAGTCTAAAACA 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 AAAGAAGGGGATTTAAAAATGGAGGAGCTGAAAATTCTGACATCAAAGGAGTCTAAAACA 1972
Query 1861 GAAAACACCCAATATTCTCTCCAACTTTGGCCTGATAGGAAAGTGCAACAGATTACAAAC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 GAAAACACCCAATATTCTCTCCAACTTTGGCCTGATAGGAAAGTGCAACAGATTACAAAC 2032
Query 1921 TTTCCTCATCCATATCCGCAGTTGGCTTCGTTACAGAAAGAGATGATCAGGTATCAACGG 1980
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 TTTCCTCATCCGTATCCGCAATTGGCTTCGTTACAGAAAGAGATGATCAGGTATCAACGG 2092
Query 1981 AAAGACGGGGTTCAACTTACTGCAACACTATACCTACCACCAGGCTATGATCCATCAAAA 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 AAAGACGGGGTTCAACTTACTGCAACACTATACCTACCACCAGGCTATGATCCATCAAAA 2152
Query 2041 GACGGTCCTCTTCCTTGTCTGTTTTGGTCTTATCCTGGTGAATTCAAGAGCAAAGATGCT 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2153 GACGGTCCTCTTCCTTGTCTGTTTTGGTCTTATCCTGGTGAATTCAAGAGTAAAGATGCT 2212
Query 2101 GCTGGTCAAGTCCGTGGTTCTCCAAATGAATTTGCAGGCATTGGTTCAACTTCTGCCCTT 2160
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2213 GCTGGTCAAGTCCGTGGCTCGCCAAATGAATTTGCAGGCATTGGATCAACTTCTGCCCTT 2272
Query 2161 CTTTGGCTTGCTAGAAGGTTTGCTATATTATCTGGACCTACTATACCTATAATTGGTGAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 CTTTGGCTTGCTAGAAGGTTTGCTATATTATCTGGACCTACTATACCTATAATTGGTGAA 2332
Query 2221 GGTGATGAAGAGGCTAATGATAGGTATGTCGAGCAACTGGTTGCAAGTGCTGAGGCTGCT 2280
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 2333 GGTGATGAAGAGGCTAATGATAGGTATGTAGAGCAACTGGTGGCAAGTGCCGAAGCTGCT 2392
Query 2281 GTAGAGGAAGTCGTCAGGCGTGGAGTGGCTCATCCAAGCAAAATTGCAGTTGGGGGACAC 2340
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 GTAGAGGAAGTCGTCAGGCGTGGAGTGGCTGATCGAAGCAAAATTGCAGTTGGGGGACAC 2452
Query 2341 TCCTATGGAGCTTTTATGACTGCAAATCTTCTTGCTCACGCTCCTCATCTTTTCTCCTGC 2400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 2453 TCCTATGGAGCTTTTATGACTGCAAATCTTCTTGCTCATGCTCCTCATCTTTTCGCCTGC 2512
Query 2401 GGAATCGCCCGATCTGGCGCTTACAACAGAACACTCACGCCCTTTGGTTTCCAGAACGAG 2460
|| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 GGGATTGCCAGATCTGGGGCTTACAACAGAACACTCACGCCCTTTGGTTTCCAGAACGAG 2572
Query 2461 GACCGAACTCTGTGGGAAGCCACTAACGTCTATGTAGAGATGAGCCCATTCATGTCTGCT 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 GACCGAACTCTGTGGGAAGCCACTAACGTCTATGTAGAGATGAGCCCATTCATGTCTGCT 2632
Query 2521 AATAAAATCAAGAAGCCAATCTTGCTTATTCATGGTGAAGAAGACAATAACCCAGGAACT 2580
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 AATAAAATCAAGAAGCCAATCTTACTTATTCATGGTGAAGAAGACAATAACCCAGGAACT 2692
Query 2581 CTAACAATGCAGTCAGACCGATTCTTCAATGCACTAAAAGGCCACGGCGCTCTTTGCCGT 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 CTAACAATGCAGTCAGACCGATTCTTCAATGCACTAAAAGGCCACGGCGCTCTTTGCCGT 2752
Query 2641 CTTGTTGTTCTTCCACACGAGAGCCACGGGTACTCAGCACGGGAAAGCATTATGCACGTT 2700
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 CTTGTTGTTCTTCCTCACGAGAGCCACGGGTACTCAGCACGGGAAAGCATTATGCACGTT 2812
Query 2701 CTCTGGGAAACTGACCGCTGGCTTCAAAAATACTGCGTTCCAAACACACCAGATGCAGAT 2760
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2813 CTCTGGGAAACTGACCGTTGGCTTCAAAAATACTGTGTTCCAAACACATCAGATGCAGAT 2872
Query 2761 ACAAATCCTGACCAGTCCAAAGAAGGCTCAGATTCTGCAGACAAAGTAGCCACTGGCACA 2820
|||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 2873 ACAAGTCCCGACCAGTCCAAAGAAGGGTCAGATTCTGCAGACAAAGTATCCACAGGCACA 2932
Query 2821 GGTGGTGGTAATCCGGAGTGTGGTGAGCATGAAGTTCACTCCAAGCTCAGGAGATCACTT 2880
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 GGTGGTGGTAATCCGGAGTTTGGTGAGCATGAAGTTCACTCCAAGCTCAGGAGATCACTT 2992
Query 2881 CTCTG 2885
|||||
Sbjct 2993 CTCTG 2997
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 143577790866
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5