BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg322444
Length=4422
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G48060.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 7640 0.0
> AT2G48060.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: shoot, sperm
cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function
DUF3595 (InterPro:IPR021999); Has 533 Blast hits to 341
proteins in 95 species: Archae - 2; Bacteria - 15; Metazoa
- 318; Fungi - 0; Plants - 93; Viruses - 0; Other Eukaryotes
- 105 (source: NCBI BLink). | chr2:19651196-19662617 REVERSE
LENGTH=7984
Length=7984
Score = 7640 bits (4137), Expect = 0.0
Identities = 4296/4375 (98%), Gaps = 2/4375 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTACCGATCGTGTGGAACATACATTGCTTTCATCACTATTCTCATAAGTGTATACCTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 ATGTACCGATCGTGTGGAACATACATTGCTTTCATCACTATTCTCATAAGTGTATACCTG 2196
Query 61 GTCAAACCCAATTATGTATCATTTGGATATATTTTCCTTCTCTTGCTCTGGATTACTGGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 GTCAAACCCAATTATGTATCATTTGGATATATTTTCCTTCTCTTGCTCTGGATTACTGGA 2256
Query 121 AGACAACTGTTTGAAGAAACTAAGAGACGCTTGTGGTTCCCTTTGAAAGCATATGCAGTT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 AGACAACTGTTTGAAGAAACTAAGAGACGCTTGTGGTTCCCTTTGAAAGCATATGCAGTT 2316
Query 181 TTGGTGTTTATGTTTATCTACTGCTTAAGTAGCTTTGTCAGCTTGCAGCTTTGGTTATCT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2317 TTGGTGTTTATGTTTATCTACTGCTTAAGTAGCTTTGTCAGCTTGCAGCTTTGGTTATCT 2376
Query 241 GGATTCATTGATCTCTACTTTTATTTGGGTTACAACTCTAAAGCCCCATTGCTGGATAAT 300
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377 GGATTTATTGATCTCTACTTTTATTTGGGTTACAACTCTAAAGCCCCATTGCTGGATAAT 2436
Query 301 GTCTGGGAATCTCTTGCTGTGTTGATCGTGATGCAACTTTACAGCTATGAAAGGAGGCAG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 GTCTGGGAATCTCTTGCTGTGTTGATCGTGATGCAACTTTACAGCTATGAAAGGAGGCAG 2496
Query 361 AGTGGACACTACGTTCCAGGTCAATCTAGTTTGCTTCATCCTGGAGtttttggttttttt 420
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2497 AGTGGACACTACATTCCAGGTCAATCTAGTTTGCTTCATCCTGGGGTTTTTGGATTTTTT 2556
Query 421 gagagatttttGGTATGGCATGGTCAGAAGATCTTGTTCGTGGCATTGTTTTATGCATCA 480
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2557 GAGAGATTTTTGGCATGGCATGGTCAGAAGATCTTGTTCGCGGCATTGTTTTATGCATCA 2616
Query 481 TTGTCTCCGATTAGTGTGTTTGGATTTGTATATCTCCTTGGCCTTGTCATCTGCACAACC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2617 TTGTCTCCGATTAGTGTGTTTGGATTTGTATATCTCCTTGGCCTTGTCATCTGCACAACC 2676
Query 541 TTCCCAAAGTCTTCTTCAATACCATCCAAATCATTCTTGATTTATACTGGATTTCTAGTG 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2677 TTCCCAAAGTCTTCTTCAATACCATCCAAATCATTCTTGATTTATACTGGATTTCTGGTG 2736
Query 601 TCTGCGGAGTATCTTTTCCAACTGTGGGGCATGCAAGCTCAGATGTTCCCTGGGCAAAAA 660
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2737 TCTGCGGAGTATCTTTTCCAATTGTGGGGGATGCAAGCTCAGATGTTCCCTGGGCAAAAA 2796
Query 661 TATGCTGAGTTGTCTTTCTACTTGGGGCTTCGAGTATATGAACCTGGATTTTGGGGTATA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2797 TATGCTGAGTTGTCTTTCTACTTGGGGCTTCGAGTATATGAACCTGGATTTTGGGGTATA 2856
Query 721 GAATCAGGTCTACGAGGAAAAGTGCTGGTTGTTGCTGCCTGTACTCTGCAGTACAATGTA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2857 GAATCAGGTCTACGAGGAAAAGTGCTGGTTGTTGCAGCCTGTACTCTGCAGTACAATGTA 2916
Query 781 TTTCGTTGGCTAGAAAGAACACCTGGTTTAACTGTTATCAAAGGAAAATATGAAGAGCCG 840
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2917 TTTCGTTGGCTAGAAAGAACATCTGGTTTAACTGTTATCAAAGGAAAATATGAAGAGCCG 2976
Query 841 TGTCCACTATTTGTCTCTGCAGAAGACACTACTGCAAGTGTTTCCAGTTCTAATGGTGAA 900
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2977 TGTCCACTTTTTGTCTCTGCAGAAGACACTACTGCAAGTGTTTCCAGTTCTAATGGTGAA 3036
Query 901 AATCCATCTTCGACTGATCATGCTTCTATATCAATGAAACAAGGCGAGGCAACGAGTAAC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3037 AATCCATCTTCGACTGATCATGCTTCTATATCAATGAAACAAGGCGAGGCAACGAGTAAC 3096
Query 961 TCATGGCCTTTCTTCTCTCCCCATGATAATCAGGGAGCTGGTTTTTTGCACCCCAAGACT 1020
|||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3097 TCATGGCCTTTCTTCTCTCCCCGTGGTAACCAGGGAGCTGGTTTTTTGCACCCCAAGACT 3156
Query 1021 GGAGGCTCTGAAAGTGGCAGTAGTAGGAAATTTTCATTTGGTCACTTCTGGGGAAGCATC 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3157 GGAGGCTCTGAAAGTGGCAGTAGTAGGAAATTTTCATTTGGTCACTTCTGGGGAAGTATC 3216
Query 1081 AAAGAGAGTCACAGGTGGAACAGGAGGAGAATTCTTGCATTGAAGAAGGAGAGGTTTGAA 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3217 AAAGAGAGTCACAGGTGGAACAGGAGGAGAATTCTTGCATTGAAGAAGGAGAGGTTCGAA 3276
Query 1141 ACACAGAAGAATCTGTTGAAAATTTACTTGAAGTTTTGGATAGAGAATATGTTTAATCTC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3277 ACACAGAAGAATCTGTTGAAAATTTACTTGAAGTTTTGGATAGAGAATATGTTTAATCTC 3336
Query 1201 TATGGCCTTGAGATAAACATGATTGCGCTGCTTCTTGCGAGTTTTGCTTTGCTGAATGCC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3337 TATGGCCTTGAGATAAACATGATTGCGCTGCTTCTTGCGAGTTTTGCTTTGCTGAATGCC 3396
Query 1261 ATCTCCATGGTATATATTGCACTGCTTGCTGCATGTGTCCTCTTGAGAAGACGCCTAATT 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3397 ATCTCCATGGTATATATTGCACTGCTTGCTGCATGTGTCCTCTTGAGAAGACGTGTAATT 3456
Query 1321 CAGAAACTATGGCCTGTCGTTGTTTTTCTGTTTGCATCAATTCTTGCAATTGAGTACGTT 1380
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3457 CAGAAACTATGGCCTGTTGTTGTTTTTCTGTTTGCATCAATTCTCGCAATTGAGTATGTT 3516
Query 1381 GCCACATGGAATAGCTTTTTGCCTTCAGATCAGGCTCCAAGTGAAACTAGTGTGCATTGC 1440
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3517 GCCACATGGAATAGTTTTTTGCCTTCAGATCAGGCTCCAAGTGAAACTAGTGTGCATTGC 3576
Query 1441 CATGACTGCTGGAGTATTGCAGCCCTCTACTTTAAATTTTGCCGGGAGTGTTGGCTTGGA 1500
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3577 CATGACTGCTGGAGTATCGCAGCTCTCTACTTTAAATTTTGCCGGGAGTGTTGGCTTGGA 3636
Query 1501 GTGAGAGTGGACGACCCCCGGACTCTTATTAGCTATTTTGTGGTATTCATGCTTGCCTGT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3637 GTGAGAGTGGACGACCCCCGGACTCTTATTAGCTATTTTGTGGTATTCATGCTTGCCTGT 3696
Query 1561 TTCAAACTTCGGGCTGATCACATATCCAGTTTCTCAGAGTCATCGACATATCATCAGATG 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3697 TTCAAACTTCGGGCTGATCACATATCCAGTTTCTCTGAGTCATCGACATATCATCAGATG 3756
Query 1621 AAGTCTCAAAGAAAGAACTCATTTGTCTGGAGAGATCTCTCCTTCGAGACAAAGAGCATG 1680
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3757 AAGTCTCAAAGAAAGAATTCATTTGTCTGGAGAGATCTCTCCTTCGAGACAAAAAGCATG 3816
Query 1681 TGGACTGTGCTTGATTACCTGAGGCTTTATTGTTATGTCCATCTGCTGGATGTTGTGCTT 1740
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3817 TGGACTGTGCTTGATTACCTGAGGCTATATTGTTATGTCCATCTGCTGGATGTTGTGCTT 3876
Query 1741 ATTCTGATTTTAATCACAGGAACTCTTGAGTATGACATTCTACACCTGGGTTATCTTGCA 1800
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3877 ATTCTGATTCTAATCACAGGAACTCTTGAGTATGACATTCTACACCTGGGTTATCTTGCA 3936
Query 1801 TTCGCTCTTGTTTTTGCCCGAATGAGACTTGAAATACTGAAGAAGAAAAACAAAATATTC 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3937 TTCGCTCTTGTTTTTGCCCGAATGAGACTTGAAATACTGAAGAAGAAAAACAAAATATTC 3996
Query 1861 AGGTTCTTGCGGGTGTACAATTTTGTTCTCATCATCTTTTCTCTCGCATATCAGTCTCCA 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 AGGTTCTTGCGGGTGTACAATTTTGTTCTCATCATCTTTTCTCTCGCATATCAGTCTCCA 4056
Query 1921 TTTGTTGGAAACTTCAATGATGGAAAATGTGAAACCGTTGATTATATATACGAGGTGATT 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4057 TTTGTTGGAAACTTCAATGATGGAAAATGTGAAACGGTTGATTATATATACGAGGTGATT 4116
Query 1981 GGATTTTACAAGTATGACTATGGATTTCGAATCACTGCAAGATCTGCTCTCGTTGAGATC 2040
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4117 GGATTTTACAAGTATGACTATGGGTTTCGAATCACTGCAAGATCTGCTCTCGTTGAGATC 4176
Query 2041 ATCATATTTATGCTAGTATCTCTTCAGTCCTACATGTTTTCCTCCCAGGAGTTTGATTAT 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4177 ATCATATTTATGCTAGTATCTCTTCAGTCCTACATGTTTTCCTCCCAGGAGTTTGATTAT 4236
Query 2101 GTGTCGCGGTATCTTGAAGCAGAGCAAATCGGTGCTATTGTGCGGGAGCAAGAGAAGAAA 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4237 GTGTCGCGGTATCTTGAAGCAGAGCAAATCGGTGCTATTGTGCGGGAGCAAGAGAAGAAA 4296
Query 2161 GCAGCACGGAAGACCGAGCAACTGCAACAAATTCGTGAGGCTGAGGaaaaaaaaCGGCAG 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4297 GCAGCACGGAAGACCGAGCAACTGCAACAAATTCGTGAGGCTGAGGAAAAAAAAAGGCAG 4356
Query 2221 CGGAATTTGCAGGTGGAAAAGATGAAATCTGAAATGCTGAACCTGCGGGTACAGCTTCAC 2280
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4357 CGAAATTTGCAGGTGGAAAAGATGAAATCTGAAATGCTGAACCTACGTGTACAGCTTCAC 4416
Query 2281 AGAATGAATTCTGATTCTAATTTTGGAGTCGCTTCTCCGCGCACTGAAGGTCTAAGAAGG 2340
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4417 AGAATGAATTCTGATTCTAATTTTGGAGTTGCTTCTCCGCGCACTGAAGGTCTAAGAAGG 4476
Query 2341 AGGAAGAGTCCGTATCTAATTCCAGATAGTGGTGCAGCCAGTCCTGAGATTGACGGAGTG 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4477 AGGAAGAGTCCGTATCTAATTCCAGATAGTGGTGCAGCCAGTCCTGAGATTGACGGAGTG 4536
Query 2401 GTCCACAGGAAAGAAGAGCAGCCTATTGACGAGGAGTCACAGTATCCTTTTGAAGCGCAT 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4537 GTCCACAGGAAAGAAGAGCAGCCTATTGACGAGGATTCACAGTATCCTTTTGAAGCGCAT 4596
Query 2461 GAGTTTCCAGTGAGTACCACTCCAGAAGCACTAGATTCTCCAGAGTATAT-ATTTGGAGC 2519
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 4597 GAGTTTCCAGTGAGTACCACTCCAGAAGCACTAGATTCTCCAGAGTAT-TCATTTGGAGC 4655
Query 2520 ATCTCCTTGTGAGATAACTGAAGTTCAACAGGATCTTGATGTGATGTCTATGGGACGTGA 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4656 ATCTCCTTGTGAGATAACTGAAGTTCAACAGGATCTTGATGTGATGTCTATGGAACGTGA 4715
Query 2580 AAGAAAGGAAAAGTCCGAGGGAAAGGAGAATCCGTTGATTTCTGCGGTGCAACTCATCGG 2639
||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4716 AAGAAAGCAAAAGTCTGAGGGAAAGGAGAATCCATTAATTTCTGCGGTGCAACTCATCGG 4775
Query 2640 TGATGGTGTTTCCCAGGTACAATTTATTGGAAATCAGGCAGTAAATAACCTTGTGAATTT 2699
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4776 TGATGGTGTTTCCCAGGTACAGTTTATTGGAAATCAGGCAGTAAATAACCTTGTGAATTT 4835
Query 2700 CTTAAACATATCGCCGGAAAATTCAGATACAAATGAGCAGTCTTCTGTTGATGATGATGT 2759
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4836 CTTAAACATCTCGCCGGAAAATTCAGATACAAATGAGCAGTCTTCTGTTGATGATGAGGT 4895
Query 2760 GTATGATGAAATGGAAAGTCAGAAAAGAAAACACACGCCTTTCGAACGGTCAACATCTCT 2819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4896 GTATGATGAAATGGAAAGTCAGAAAAGAAAACACACACCTTTCGAACGGTCAACATCTCT 4955
Query 2820 ACAATCTGACAGGAGTAGTGATGGCACTAGCTTTCAGATAGGAAGGATCTTTCGTCATAT 2879
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4956 ACAATCTGACAGGAGTAGTGATGGCACTAGTTTTCAGATAGGAAGGATCTTTCGTCATAT 5015
Query 2880 ATGGTCTAGGATGCAGTCCAATAACGATATTGTTTGCTATTGCTGCTTCATTATTGCGTT 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5016 ATGGTCTAGGATGCAGTCCAATAACGATATTGTTTGCTATTGCTGCTTCATTATTGCGTT 5075
Query 2940 TCTCTGGAATTTCAGTCTTCTTTCCATGGTCTATCTAGCAGCACTGTTCCTATATGCCCT 2999
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5076 TCTCTGGAATTTCAGTCTTCTTTCCATGGTCTATCTAGCAGCACTGTTCCTATACGCCCT 5135
Query 3000 CTGCGTTCACACTGGCCCTACTCACATCTTCTGGGTCATCATGCTAATGTACACAGAAAT 3059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5136 CTGCGTTCACACTGGCCCTACTCACATCTTCTGGGTCATCATGCTAATGTACACAGAAAT 5195
Query 3060 TTATATCCTGCTCCAGTATTTATACCAGATTATAATCCAGCACTGTGGGTTAAGCATTGA 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5196 TTATATCCTGCTCCAGTATTTATACCAGATTATAATCCAGCACTGTGGGTTAAGCATTGA 5255
Query 3120 TGCACCTCTTCTTCATGAATTGGGATTTCCAACGCAAAGAATCAAATCATCATTTGTTGT 3179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5256 TGCACCTCTTCTTCATGAATTGGGATTTCCAACGCAAAGAATCAAATCATCATTTGTTGT 5315
Query 3180 CAGCTCGTTGCCTCTATTCCTTATTTACATATTTACTCTCATACAGACTGCTATAACAGT 3239
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 5316 CAGCTCGTTGCCTCTGTTCCTTATTTACATATTTACTCTCATACAGAGTTCTATAACAGT 5375
Query 3240 GAAAGATGGTGATTGGGTTCCTTCTGCTGATTTTACTTCGCGCCGGAATGCCCGTGGTAG 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5376 GAAAGATGGTGATTGGGTTCCTTCTGCTGATTTTACTTCGCGCCGGAATGCCCGTGGTAG 5435
Query 3300 CCAGAAGGATCTTACAAGAATTAGCTTGAGCCAGAGAATCTTGGATGTGTTCAAGAAGCT 3359
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5436 CCAGAAGGATCTTACAAGAATTAGATTGAGCCAGAGAATCTTGGATGTGTTTAAGAAGCT 5495
Query 3360 AAGAGATAGTGGGAAGCTGGTGATCAGGAGCATCTGCCGATACTGGATATCTCTGACACG 3419
||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5496 AAGAGATAGTGCGAAATTGGTGATCAGAAGCATCTACCGATACTGGATATCTCTGACACG 5555
Query 3420 TGGAGCAGAATCCCCTCCTTACTTTGTTCAGGTGACAATGGATGTTCACATGTGGCCTGA 3479
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5556 TGGAGCAGAATCCCCTCCGTACTTTGTTCAGGTGACAATGGATGTTCACATGTGGCCTGA 5615
Query 3480 AGATGGAATTCAGCCTGAAAGAGTTGAATGTAGAATGAATCAGTTGCTTAGGCTTGTCCA 3539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5616 AGATGGAATTCAGCCTGAAAGAGTTGAATGTAGAATGAATCAGTTGCTTAGGCTTGTCCA 5675
Query 3540 TAATGAGAGATGCGAGAAAGGAAACCCTGATCTCTGCCCTTACTCTAGCAGGGTTCACGT 3599
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5676 TAATGAGAGATGCGAGAAGGGAAACCCTGATCTCTGCCCTTACTCTAGCAGGGTTCACGT 5735
Query 3600 ACAAAGTATAGAGAGGAGTACAGAAACCCCAAACGAGGCCTTAGTTGTTTTCGAGGTTGA 3659
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5736 ACAAAGTATAGAGAGAAGTACAGAAACCCCAAACGAGGCCTTAGTTGTTCTCGAGGTTGA 5795
Query 3660 GTATGCTTCTCCCACGAATGGGTGTTCTTCAGCAGAATGGTACAAATCACTTACCCCAGC 3719
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5796 GTATGCTTCTCCCACAAATGGCTGTTCTTCAGCAGAATGGTACAAATCACTTACTCCAGC 5855
Query 3720 CTCGGATGTGGCGAAAGAAATTCGTAAAGCTCAACATAGTGGACTTGTTGAAGGAACTGG 3779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5856 CTCGGATGTGGCGAAAGAAATTCGTAAAGCTCAACATAGTGGACTTGGTGAAGGAACTGG 5915
Query 3780 ATTTCCATACCCCATTCTCTCTGTGATTGGCGGAGGAAAGAGAGATACTGACCTCTATGC 3839
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 5916 ATTTCCTTACCCCATTCTCTCTGTAATTGGCGGAGGAAAGAGAGATACAGACCTCTACGC 5975
Query 3840 CTACATATTTGGTGCTGACTTGATAGTCTTCTTTCTGGTTGCCATTTTCTACCAATCAGT 3899
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5976 CTACATTTTTGGTGCTGACTTGATAGTCTTCTTTCTGGTTGCCATTTTCTACCAATCAGT 6035
Query 3900 CATTAAAAATAAAAGCGAGTTTATTGATGTATATCAGCTAGAAGACCAGTTTCCATTTGA 3959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6036 CATTAAAAATAAAAGCGAGTTTATTGATGTATATCAGCTAGAAGACCAGTTTCCATTCGA 6095
Query 3960 CTTTGTCATTATTCTTATGGTTATCTTCTTCCTAATTGTTGTTGATCGCGTCATCTATCT 4019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6096 CTTTGTCATTATTCTTATGGTTATCTTCTTCCTAATTGTTGTTGATCGCGTCATCTATCT 6155
Query 4020 TTGCTCATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTATCTCTTCAGCCTTATTCTCTTCACATA 4079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6156 TTGCTCATTTGCGACTGGAAAAGTGGTATACTATCTCTTCAGTCTTATTCTCTTCACATA 6215
Query 4080 TGCAGTGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACCCAGCAACACGCTGCTGGCTTGGC 4139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6216 TGCAGTGACAGAGTATGCTTGGAGCATATATCCTACCCAGCAACACGCTGCTGGCTTGGC 6275
Query 4140 TCTCAGAATCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTCTCCAAGCCATACAAATCCG 4199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 6276 TCTCAGAATCATATTTCTTGCCAAAGCAATGTCACTAGCTCTCCAGGCCATACAAATCCG 6335
Query 4200 CTATGGACTACCTCATAAAAGCACCTTGTATCGGCAGTTTTTGACAAGTGAAGTTTCACG 4259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6336 CTATGGACTACCTCATAAAAGCACCTTGTATCGGCAGTTTTTGACAAGTGAAGTATCACG 6395
Query 4260 GATCAATTACTATGGTTACAGACTTTACCGTGCTCTTCCCTTCCTGTATGAACTGAGATG 4319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6396 GATCAATTACTATGGTTACAGACTTTACCGTGCTCTTCCTTTCCTGTATGAACTGAGATG 6455
Query 4320 TGTGCTTGACTGGTCTTGCACAGCTACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAG 4374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6456 TGTGCTTGACTGGTCTTGCACAGCTACATCACTGACAATGTATGACTGGCTCAAG 6510
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 220483714485
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5