BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg323324 Length=4110 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G46960.1 | Symbols: | RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB... 6460 0.0 > AT3G46960.1 | Symbols: | RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein | chr3:17290873-17298067 REVERSE LENGTH=4175 Length=4175 Score = 6460 bits (3498), Expect = 0.0 Identities = 3919/4112 (95%), Gaps = 70/4112 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAACAGAGTCCAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGTGTCGGATTCTCCGGTCATGGT 60 ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGAACAAAGTCGAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGGGTCGGATTCTCCGGTCATGGT 60 Query 61 GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTCTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGC-CGTGAACTCACT 119 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 61 GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTTTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGCAC-TGAACTCACT 119 Query 120 TCCCGATTTCGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA 179 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TCCCGATTTTGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA 179 Query 180 TATTGAGGAGAAATATCTCCTACCAAGACTGGAACCGGATCAATTTTCTGCTGAAAAAGC 239 |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 180 TATTGAGGAGAAGTATCTCATCCCGAGACTGGAACCGGATCAGTTTTCTGCTGAAAAAGC 239 Query 240 TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGGTGCCCCTTCAACCCTCTTT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 240 TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGATGCCCCTTCAACCCTCTTT 299 Query 300 GCCAAGGCCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGTGGATAC 359 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 300 GCCAAGGTCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGAGGATAC 359 Query 360 TGAGAATGGAGCGTGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGACCAAATGTATGG 419 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 360 TGAGAACGGAGCATGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGAACAAATGTATGG 419 Query 420 AGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG 479 Query 480 AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG 539 Query 540 AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGCGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTAAATGGGGGTCC 599 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 540 AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGTGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTCAATGGGGGTCC 599 Query 600 TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA 659 Query 660 TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCAGAGTTCACATGGCAATGCTTCTGATGAAAA 719 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 660 TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCATAGTTCACATGGCAATGCTTCAGATGAAAA 719 Query 720 TTCGGTCTGTAGATCAATGTCACTGGTCAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGCTCAA 779 | || | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 720 ---------T---TC---G--A---G-CAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGTTCAA 758 Query 780 GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCCGAACTTGAGAGAGATGGTGTGTTTAATCATTC 839 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | | Sbjct 759 GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCTGAACTTGAG-G-GA------G-------A-T- 801 Query 840 ATATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCAGAAGCTGAACCCGAAGCTAAAGCGAG 899 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 802 -GATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCGGAAGCTGAACCCGATGCTAAAGCGAG 860 Query 900 CATAAGCAATGAAGTCAGCAAGGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT 959 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 861 CATAAGCAATGAAGTCAGCAAAGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT 920 Query 960 GTCATCAGCAAAAACAGCAATATTGACGGACGAGGCAGTTACTGGGAACAGCGATAAACA 1019 |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 921 GTCATCAGCAAAAACAGCAATAATGTCTGAAGAGGCAGTTACTGGGAGCAGCGATAAACA 980 Query 1020 ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACGAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA 1079 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 981 ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACTAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA 1040 Query 1080 TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTAGACAACTTTCAGAAGGA 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1041 TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTGGACAACTTTCAGAAGGA 1100 Query 1140 GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGGGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCAGCGGG 1199 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1101 GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGAGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCGGCGGG 1160 Query 1200 GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCTGT 1259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1161 GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCGGT 1220 Query 1260 TTACACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAATT 1319 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1221 TTATACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAGTT 1280 Query 1320 TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1281 TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT 1340 Query 1380 GACTACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA 1439 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1341 GACAACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA 1400 Query 1440 ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1401 ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA 1460 Query 1500 AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1461 AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC 1520 Query 1560 AAACACATTTGAATTTGTTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAAGAGATACGTGTTAC 1619 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1521 AAACACATTTGAATTTGCTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAGGAGATACGTGTTAC 1580 Query 1620 TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTATTTTATTCTGGAGAACTCTA 1679 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1581 TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTTTTTTACTCTGGAGAACTCTA 1640 Query 1680 CAAAGTTTGTGAGGATGAAGTTTTTATTCCTAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA 1739 ||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1641 CAAAGTTTGTGAGAACGAAGTTTTTCTTTCAAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA 1700 Query 1740 AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTCGCTCCTAAACAGTATACGGGATCTTCAGC 1799 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||| Sbjct 1701 AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTTGCACCTAAACAACAAATGGGATCTTCAGC 1760 Query 1800 TCATCAAGATGGGAACAAATCTCAGAAACATGTAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA 1859 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1761 TCATCAAGATGGGAGCAAATCTCAGAAACATGAAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA 1820 Query 1860 ACACTCAAGTGCAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG 1919 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1821 ACACTCAAGTGTAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG 1880 Query 1920 GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTCTCAAAAAA 1979 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1881 GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTTTCAAAAAT 1940 Query 1980 GTCCCTGTTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA 2039 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1941 GTCCCTATTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA 2000 Query 2040 CGCCTTAACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTAAAATCCGTGTCTTTTG 2099 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2001 CGCCTTGACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTGAAATCCGTGTCTTTTG 2060 Query 2100 CGATAAAGCATTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT 2159 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2061 CGATAAAGCGTTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT 2120 Query 2160 TCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATCGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA 2219 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2121 CCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATTGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA 2180 Query 2220 GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC 2279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2181 GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC 2240 Query 2280 ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT 2339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2241 ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT 2300 Query 2340 TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC 2399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2301 TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC 2360 Query 2400 TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC 2459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2361 TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC 2420 Query 2460 AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT 2519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2421 AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT 2480 Query 2520 TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTGAAGGTGGAGGA 2579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2481 TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTAAAGGTGGAGGA 2540 Query 2580 CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTCCATGCTCAGAAGAAACTGCCCGAGAAACAACA 2639 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2541 CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTTCATGCCCAGAAGAAACTACCCGAGAAACAACA 2600 Query 2640 GCTTCTCATGAGAAAACGTTCTCTACCAATCAAAAATATCGAAGCTGATCTATTGATTTA 2699 ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || | || ||||| | Sbjct 2601 GCTTCTCATGATAAAACGTTCTCTACCAA-C-----TA---AA-C--AT--ATTGA---A 2643 Query 2700 TTCATCCAGATGTATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTATATGGA 2759 | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2644 T-------G-T--ATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTACATGGA 2693 Query 2760 AGCAAATGAATATAACAGCAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG 2819 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2694 AGCAAATGAATATAACAACAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG 2753 Query 2820 TTTTCTTGTACCAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAACGGGCATAGACAATTTACT 2879 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2754 TTTTCTTGTACAAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAATGGGCATAGACAATTTACT 2813 Query 2880 CGGAGTCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGAAAAA 2939 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2814 CGGAATCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGATAAA 2873 Query 2940 ATCTGAAATACCGCCACCAGAGAGAAATATGGTGAGCATTGGCAAGAAAAGCTCAGAGCC 2999 |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 2874 ATCTGAAATACCGCCACCGGAGAAAAATATGGTCAGCATTGGCAAGAAAAGTTCAGATCC 2933 Query 3000 TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCCAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC 3059 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2934 TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCTAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC 2993 Query 3060 GAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTTCCGCTGTGATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGAGT 3119 ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2994 AAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTCCCGTTGTAATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGGGT 3053 Query 3120 CGCTGCTGGCGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG 3179 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3054 TGCTGCTGGTGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG 3113 Query 3180 CGATAGCAAGATAACGATTGATCAGGTGCGTCTACTCGAGGATGGGAACAGGGCAGCTTT 3239 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3114 CGATAGCAAGATAAAGATTGATCAGGTGCGCCTACTCGAGGATGGGAACAAGGCAGCTTT 3173 Query 3240 TTCGCAGACGGTTCAACAGCTTTTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAGTATCCTCCTGC 3299 ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 3174 TTCTCAGACGGTTCAACAGCTTCTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAATTTCCTCCTGC 3233 Query 3300 TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGTTGAGCGTGTGGAGACGTACTATAA 3359 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 3234 TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGCTGAGCTTGTGGAGACATACTATAA 3293 Query 3360 ATGGAC-AAGCTTATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCAAGGTTGTGTCAAATTGG 3418 |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3294 ATGGACCAACCT-ATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCACGGTTGTGTCAAATTGG 3352 Query 3419 AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGAATGATCTCAAAGATCTTG 3478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3353 AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGACGGATCTCAAAGATCTTG 3412 Query 3479 AATTTCAAATGTCAGATGAAGCCCTATTACAGATGCCTGCGTTTCAGGGCCGGATCGATG 3538 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3413 AATTTCAAATGTCTGATGAAGCCCTATTACAAATGCCTGCCTTTCAGGGCCGGATCGATG 3472 Query 3539 TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGCCGTGTCG 3598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3473 TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGTCGTGTCG 3532 Query 3599 CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAGTTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT 3658 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3533 CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAATTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT 3592 Query 3659 TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA 3718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3593 TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA 3652 Query 3719 AAAACACTTCAGCGCCTTCACTTACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG 3778 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3653 AAAACACTTCAGCGCCTACACTAACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG 3712 Query 3779 ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG 3838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3713 ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG 3772 Query 3839 AATATGCCCAGGAGAATCTCAAATTCGGTCTGGTTGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG 3898 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3773 AATATGCTCAGGAGAATCTCAAATTTGGTCTGGTCGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG 3832 Query 3899 GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACGGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA 3958 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3833 GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACAGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA 3892 Query 3959 CCATTGTGAGATTGGATGAGACGTGCCGTGAGTTCAAGAACGCAGCCGCCATTATGGGGA 4018 |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3893 CCATTGTGAGATTGGATGAGACATGCCGTGAATTCAAGAACGCAGCTGCCATTATGGGGA 3952 Query 4019 ACTCAGCGTTACATAAGAAAATGGATGCGGCTTCAAATGCTATAAAACGTGACATCGTCT 4078 |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3953 ACTCGGCGTTACACAAGAAAATGGATGCAGCTTCAAATGCCATAAAACGTGACATCGTCT 4012 Query 4079 TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTATAA 4110 |||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4013 TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTGTAA 4044 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 204831628269 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5