BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg323324
Length=4110
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G46960.1 | Symbols: | RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB... 6460 0.0
> AT3G46960.1 | Symbols: | RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1
protein | chr3:17290873-17298067 REVERSE LENGTH=4175
Length=4175
Score = 6460 bits (3498), Expect = 0.0
Identities = 3919/4112 (95%), Gaps = 70/4112 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAACAGAGTCCAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGTGTCGGATTCTCCGGTCATGGT 60
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACAAAGTCGAAGCAGGCAATGAGCTCGGCTTCCGGGTCGGATTCTCCGGTCATGGT 60
Query 61 GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTCTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGC-CGTGAACTCACT 119
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 61 GGTCACCTCCGCGTCGAGCCTTTTTACACGGCCGAGAGAGACGACGCAC-TGAACTCACT 119
Query 120 TCCCGATTTCGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA 179
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TCCCGATTTTGTATCCCCTCCTGCATTTGCCAAGGAAACAAAAGAATCAATAAAGAAACA 179
Query 180 TATTGAGGAGAAATATCTCCTACCAAGACTGGAACCGGATCAATTTTCTGCTGAAAAAGC 239
|||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 180 TATTGAGGAGAAGTATCTCATCCCGAGACTGGAACCGGATCAGTTTTCTGCTGAAAAAGC 239
Query 240 TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGGTGCCCCTTCAACCCTCTTT 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 240 TGAGAATCAGTGGGATTTTGATTGGTTTTCCAGGGTGAAGATGCCCCTTCAACCCTCTTT 299
Query 300 GCCAAGGCCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGTGGATAC 359
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 300 GCCAAGGTCCGTTGTGGTTCCGACTTGGGAGTTGCCATTCAGGCGTCAAAAAGAGGATAC 359
Query 360 TGAGAATGGAGCGTGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGACCAAATGTATGG 419
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 TGAGAACGGAGCATGGGAGCCAAAATCAGTGGAGGTGGATTTGTCAGAACAAATGTATGG 419
Query 420 AGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GGATCAAGATTCTGGATTTTTTCCACGAATGGTAGGACCTCCGAAGGATTTTCTGAGAGG 479
Query 480 AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 AAGTGTCAACAATCGCCCTTTCCGTCCAGGTGGCTTGGAGGATTCACAGTCTTCAGAGAG 539
Query 540 AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGCGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTAAATGGGGGTCC 599
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 540 AGTCCTTCCAGAGGGTGTCTCTAGTGGCCAATGGGTACAGGAATTGCTCAATGGGGGTCC 599
Query 600 TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGCTCAAACTGTTCCTCCTAGTTTTAAGCAGAGTTTAGATCTTGGAGATCTGATGCCATA 659
Query 660 TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCAGAGTTCACATGGCAATGCTTCTGATGAAAA 719
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 660 TCCCCAAACATGGAGCGTTTATGAGGATCATAGTTCACATGGCAATGCTTCAGATGAAAA 719
Query 720 TTCGGTCTGTAGATCAATGTCACTGGTCAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGCTCAA 779
| || | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 720 ---------T---TC---G--A---G-CAAGTTGTCTATTCAGTTTGACGATCTGTTCAA 758
Query 780 GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCCGAACTTGAGAGAGATGGTGTGTTTAATCATTC 839
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | |
Sbjct 759 GAAGGCATGGGAAGAAGATACTTTCTCTGAACTTGAG-G-GA------G-------A-T- 801
Query 840 ATATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCAGAAGCTGAACCCGAAGCTAAAGCGAG 899
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 802 -GATCATACAGCTGGATCTGAGTCTCCAAAGGCGGAAGCTGAACCCGATGCTAAAGCGAG 860
Query 900 CATAAGCAATGAAGTCAGCAAGGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT 959
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 CATAAGCAATGAAGTCAGCAAAGGACTAGAGACTGACGTCACTGTGCTGGATGAGATTTT 920
Query 960 GTCATCAGCAAAAACAGCAATATTGACGGACGAGGCAGTTACTGGGAACAGCGATAAACA 1019
|||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 921 GTCATCAGCAAAAACAGCAATAATGTCTGAAGAGGCAGTTACTGGGAGCAGCGATAAACA 980
Query 1020 ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACGAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA 1079
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 ACTACGGAAAGAGGGATGGGCCACTAAAGGAGATAGCCAAGACATTGCAGACCGGTTTTA 1040
Query 1080 TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTAGACAACTTTCAGAAGGA 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1041 TGAGCTTGTTCCTGACATGGCGATTGAATTCCCTTTCGAATTGGACAACTTTCAGAAGGA 1100
Query 1140 GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGGGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCAGCGGG 1199
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1101 GGCTATCTGTTGTTTAGAAAAGGGAGAGTCTGTTTTTGTAGCAGCACATACATCGGCGGG 1160
Query 1200 GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCTGT 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1161 GAAGACAGTTGTTGCAGAATATGCATTCGCTTTGGCCACCAAGCACTGTACACGAGCGGT 1220
Query 1260 TTACACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAATT 1319
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1221 TTATACTGCTCCAATTAAAACCATCAGCAACCAAAAATACAGAGATTTTTGTGGGAAGTT 1280
Query 1320 TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 TGATGTAGGACTTCTCACAGGTGATGTTAGCATAAGGCCAGAGGCATCTTGTCTGATCAT 1340
Query 1380 GACTACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA 1439
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 GACAACTGAAATATTAAGGTCAATGCTTTATCGTGGTGCTGATATCATACGTGATATAGA 1400
Query 1440 ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 ATGGGTTATATTTGATGAAGTTCACTATGTCAATGACGTAGAGAGAGGGGTTGTTTGGGA 1460
Query 1500 AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 AGAAGTCATCATCATGTTGCCAAGGCATATAAATTTTGTCCTCCTTTCTGCAACGGTGCC 1520
Query 1560 AAACACATTTGAATTTGTTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAAGAGATACGTGTTAC 1619
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1521 AAACACATTTGAATTTGCTGATTGGATTGGCCGAACAAAACAAAAGGAGATACGTGTTAC 1580
Query 1620 TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTATTTTATTCTGGAGAACTCTA 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1581 TGGCACGACAAAAAGACCAGTTCCCCTAGAGCATTGTCTTTTTTACTCTGGAGAACTCTA 1640
Query 1680 CAAAGTTTGTGAGGATGAAGTTTTTATTCCTAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA 1739
||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1641 CAAAGTTTGTGAGAACGAAGTTTTTCTTTCAAAAGGGATAAAGGATGCTAAAGATTCACA 1700
Query 1740 AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTCGCTCCTAAACAGTATACGGGATCTTCAGC 1799
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||
Sbjct 1701 AAAGAAGAAGAATTCAAATGCAGTTAGTGTTGCACCTAAACAACAAATGGGATCTTCAGC 1760
Query 1800 TCATCAAGATGGGAACAAATCTCAGAAACATGTAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA 1859
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 TCATCAAGATGGGAGCAAATCTCAGAAACATGAAGCTCATTCTCGTGGCAAGCAGAATAA 1820
Query 1860 ACACTCAAGTGCAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG 1919
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 ACACTCAAGTGTAAAAGATGTGGGAAAATCCTCTTACAGTGGTAACAGTCAGAACAATGG 1880
Query 1920 GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTCTCAAAAAA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1881 GGCATTTAGACGATCAGCAGCTTCAAATTGGTTACTGCTTATCAACAAGCTTTCAAAAAT 1940
Query 1980 GTCCCTGTTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA 2039
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 GTCCCTATTACCTGTGGTTGTCTTCTGTTTCTCGAAGAATTATTGTGATAGGTGTGCCGA 2000
Query 2040 CGCCTTAACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTAAAATCCGTGTCTTTTG 2099
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2001 CGCCTTGACTGGGACCGACCTCACCAGTAGCTCTGAGAAAAGTGAAATCCGTGTCTTTTG 2060
Query 2100 CGATAAAGCATTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT 2159
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 CGATAAAGCGTTTTCAAGATTGAAAGGGTCTGATCGGAATTTACCTCAGGTTCTCAGACT 2120
Query 2160 TCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATCGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA 2219
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121 CCAAAGCTTACTTCATAGAGGAATTGGTGTTCATCATGCTGGGCTGCTTCCAATTGTAAA 2180
Query 2220 GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2181 GGAAGTTGTTGAAATGCTTTTTTGCCGTGGTGTTATTAAGGTGCTATTTTCAACGGAGAC 2240
Query 2280 ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2241 ATTTGCCATGGGGGTTAATGCTCCAGCTAGAACGGTCGTTTTTGATGCTTTGAGGAAGTT 2300
Query 2340 TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 TGATGGCAAGGAATTTAGACAATTGCTTCCTGGAGAGTACACTCAAATGGCAGGACGTGC 2360
Query 2400 TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2361 TGGCAGAAGAGGACTTGACAAAACGGGCACAGTTGTTGTCATGTGTCGCGATGAAGTTCC 2420
Query 2460 AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 AGATGAGAGTGATCTGAGGCGTGTAATTGTTGGAAGCGCAACAAGACTAGAATCTCAGTT 2480
Query 2520 TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTGAAGGTGGAGGA 2579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2481 TCGACTAACCTACATAATGATCCTCCATCTTTTACGTGTTGAAGAATTAAAGGTGGAGGA 2540
Query 2580 CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTCCATGCTCAGAAGAAACTGCCCGAGAAACAACA 2639
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2541 CATGCTGAAAAGAAGTTTTGCTGAATTTCATGCCCAGAAGAAACTACCCGAGAAACAACA 2600
Query 2640 GCTTCTCATGAGAAAACGTTCTCTACCAATCAAAAATATCGAAGCTGATCTATTGATTTA 2699
||||||||||| ||||||||||||||||| | || || | || ||||| |
Sbjct 2601 GCTTCTCATGATAAAACGTTCTCTACCAA-C-----TA---AA-C--AT--ATTGA---A 2643
Query 2700 TTCATCCAGATGTATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTATATGGA 2759
| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2644 T-------G-T--ATTAAAGGTGAACCGGCAATTGAAGATTACTATGACATGTACATGGA 2693
Query 2760 AGCAAATGAATATAACAGCAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG 2819
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 AGCAAATGAATATAACAACAAGATGTCGGAAGCGGTCATGCAGTCTCCTTATGCCCAGAG 2753
Query 2820 TTTTCTTGTACCAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAACGGGCATAGACAATTTACT 2879
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2754 TTTTCTTGTACAAGGAAGAGTAGTGGTCATGAAATCTGGAATGGGCATAGACAATTTACT 2813
Query 2880 CGGAGTCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGAAAAA 2939
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2814 CGGAATCGTTCTGAAGGGACCTTCCAACACTAACAGACAATATGTTGTTTTGGTGATAAA 2873
Query 2940 ATCTGAAATACCGCCACCAGAGAGAAATATGGTGAGCATTGGCAAGAAAAGCTCAGAGCC 2999
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2874 ATCTGAAATACCGCCACCGGAGAAAAATATGGTCAGCATTGGCAAGAAAAGTTCAGATCC 2933
Query 3000 TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCCAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC 3059
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2934 TTCTCAAGGTTATTTTATTGCGCCTAAATCAAAACGTGGTTTTGAAGAAGAATTTTATAC 2993
Query 3060 GAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTTCCGCTGTGATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGAGT 3119
||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2994 AAAGCCGAGCTCTCGTAAAGGTCCCGTTGTAATAAAGATAGAGCTCCCGTACCATGGGGT 3053
Query 3120 CGCTGCTGGCGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG 3179
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 TGCTGCTGGTGTAGGTTACGAGGTTAAAGGGTTTGATAACAAAGAATTTTTGTGCATATG 3113
Query 3180 CGATAGCAAGATAACGATTGATCAGGTGCGTCTACTCGAGGATGGGAACAGGGCAGCTTT 3239
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3114 CGATAGCAAGATAAAGATTGATCAGGTGCGCCTACTCGAGGATGGGAACAAGGCAGCTTT 3173
Query 3240 TTCGCAGACGGTTCAACAGCTTTTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAGTATCCTCCTGC 3299
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 3174 TTCTCAGACGGTTCAACAGCTTCTGGATCTGAAATCAGACGGAAACAAATTTCCTCCTGC 3233
Query 3300 TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGTTGAGCGTGTGGAGACGTACTATAA 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 3234 TCTAGACCCAGTAAAAGATTTGAAGCTGAAAGATGCTGAGCTTGTGGAGACATACTATAA 3293
Query 3360 ATGGAC-AAGCTTATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCAAGGTTGTGTCAAATTGG 3418
|||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3294 ATGGACCAACCT-ATTGCAAAAGATGTCCATGAATAAGTGCCACGGTTGTGTCAAATTGG 3352
Query 3419 AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGAATGATCTCAAAGATCTTG 3478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3353 AAGAGCACATGAAGTTAGCTAGGGAGATTAAGAAGCATAAGACGGATCTCAAAGATCTTG 3412
Query 3479 AATTTCAAATGTCAGATGAAGCCCTATTACAGATGCCTGCGTTTCAGGGCCGGATCGATG 3538
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3413 AATTTCAAATGTCTGATGAAGCCCTATTACAAATGCCTGCCTTTCAGGGCCGGATCGATG 3472
Query 3539 TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGCCGTGTCG 3598
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3473 TTCTGAAGAACATTGGGTGTATAGATGATGACCTCGTCGTCCAAATCAAAGGTCGTGTCG 3532
Query 3599 CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAGTTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT 3658
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 CTTGCGAGATGAATTCTGGGGAAGAATTGATTTGCACAGTGTGTCTGTTCGAGAATCAAT 3592
Query 3659 TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA 3718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3593 TCGAAGAATTAGAACCAGAAGAAGCAGTGGCTATAATGTCTGCCTTTGTCTTCCAACAGA 3652
Query 3719 AAAACACTTCAGCGCCTTCACTTACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG 3778
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653 AAAACACTTCAGCGCCTACACTAACTCCTAAGCTGGCTAAGGCTAAACAAAGACTCTATG 3712
Query 3779 ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG 3838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3713 ATACAGCAATCAGACTTGGTGAACTTCAAGCTCAGTACAATTTACAAATAGACCCTGAAG 3772
Query 3839 AATATGCCCAGGAGAATCTCAAATTCGGTCTGGTTGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG 3898
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3773 AATATGCTCAGGAGAATCTCAAATTTGGTCTGGTCGAAGTCGTCTATGAGTGGGCAAAGG 3832
Query 3899 GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACGGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA 3958
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3833 GGACTCCATTTGCAGAGATATGTGAACTGACAGATGTCCCGGAAGGTCTGATAGTTCGAA 3892
Query 3959 CCATTGTGAGATTGGATGAGACGTGCCGTGAGTTCAAGAACGCAGCCGCCATTATGGGGA 4018
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3893 CCATTGTGAGATTGGATGAGACATGCCGTGAATTCAAGAACGCAGCTGCCATTATGGGGA 3952
Query 4019 ACTCAGCGTTACATAAGAAAATGGATGCGGCTTCAAATGCTATAAAACGTGACATCGTCT 4078
|||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3953 ACTCGGCGTTACACAAGAAAATGGATGCAGCTTCAAATGCCATAAAACGTGACATCGTCT 4012
Query 4079 TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTATAA 4110
|||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4013 TTGCGGCTAGTCTGTATGTGACCGGAGTGTAA 4044
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 204831628269
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5