BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg327089
Length=888
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G08370.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 401 5e-111
AT1G26250.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 287 1e-76
AT4G08380.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 261 8e-69
AT2G24980.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 73.1 4e-12
AT5G35190.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family pro... 67.6 2e-10
AT3G54590.1 | Symbols: ATHRGP1, HRGP1 | hydroxyproline-rich gly... 65.8 7e-10
AT3G28550.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family pro... 56.5 4e-07
> AT4G08370.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr4:5301962-5303314 REVERSE LENGTH=1053
Length=1053
Score = 401 bits (217), Expect = 5e-111
Identities = 331/384 (86%), Gaps = 15/384 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 296 tctacagctctccaccaccacctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCAT 355
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Sbjct 515 TCTACAGCTCTCCACCACCA---CCTCCATATGTTTACAACTCTCCACCACCACCTCCAT 571
Query 356 ATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCCCCTCCA 414
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Sbjct 572 ATGTTTA-CGAGTCTGTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCA 630
Query 415 TATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCC 473
|||||||| | | ||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 631 TATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCC 689
Query 474 ATATGTTTACAAGTCTACCT-TTCATCG-TCCATTCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCT 531
|||||||||||| ||| || || | | |||||| |||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 690 ATATGTTTACAATTCT-GCTCCTCGT-GTTCCATTTATCTACAGCTCTCCACCACCACCT 747
Query 532 CCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCC 590
||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 CCATATGTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCC 806
Query 591 TCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCC 649
||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 807 TCCATATGTTTACAATTCTGCTCCT-CGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCTACCACCTC 865
Query 650 CTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673
|||||||||||||||| |||||||
Sbjct 866 CTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 889
Score = 396 bits (214), Expect = 2e-109
Identities = 378/453 (83%), Gaps = 27/453 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 230 TCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTCCATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctc 289
|||||| ||||||||||||| | | |||||| || |||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 515 TCTACAGCTCTCCACCACCA-C-C-TCCATATGTTTACAACTCTCCACCACCA---CCTC 568
Query 290 catacgtctac-agctctccaccaccacctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCACTA 348
|||| || ||| || ||| || | | ||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 569 CATATGTTTACGAG-TCT---GTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCC 624
Query 349 CCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATC 407
|||||||||||||| | |||| |||||| | || ||||| |||| |||||||||||| |
Sbjct 625 CCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCA-C 682
Query 408 C-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCA 465
| |||||||||||||| | | ||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 683 CTCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTGTTCCATTTATCTACAGCTCTCCACCA 741
Query 466 CCGCCTCCATATGTTTACAAGTC--TACCTTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCAC 523
|| |||||||||||||||||||| | || || | ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 742 CCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCC--TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCAC 799
Query 524 CACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCA 582
|||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||| |
Sbjct 800 CACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCTA 858
Query 583 CCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCG-TCCATTCATCTATAGCTCTC 640
||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | | |||||||||||| |||||||
Sbjct 859 CCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGT-GTTCCATTCATCTACAGCTCTC 916
Query 641 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673
||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 917 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 949
Score = 379 bits (205), Expect = 2e-104
Identities = 362/434 (83%), Gaps = 25/434 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 254 TTCCATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctccatacgtctacagctctccaccac 313
|||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||| || |||| | | | | |
Sbjct 596 TTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCA-C-CC-CCTCCATATGTTTACA-AT-T-CTGCTC 649
Query 314 cacctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCA-CTACCTCCATATGTTTATC-TTTCTCC 371
| | | ||||| | |||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |||| |
Sbjct 650 CTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCT-CCTCCATATGTTTA-CAATTCTGC 707
Query 372 TCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCT 429
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Sbjct 708 TCCTCGTGTTCCATTTATCTACAGCTCTCCACCA-CCACCTCCATATGTTTA-CAAGTCT 765
Query 430 CCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCT 489
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Sbjct 766 GTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCT 825
Query 490 ACCT-TTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGC-ACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGT 547
|| || | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 826 -GCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCT-CTACCACCTCCTCCATATGTTTACAATT 883
Query 548 CTGC-CCTTCATCG-TCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAA 605
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Sbjct 884 CTGCTCC-TCGT-GTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAA 941
Query 606 GTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACA 664
||||| ||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 942 TTCTGCTCCT-CGTATTCCATTTATCTATAGTTCTCCACCACCCCA-CCATATGTTTACA 999
Query 665 AGTCTGCTCTTCAT 678
||| || || ||||
Sbjct 1000 AGTTTGTTCCTCAT 1013
Score = 339 bits (183), Expect = 4e-92
Identities = 461/584 (79%), Gaps = 64/584 (11%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCAATACTAGTAATTTGCCATCAT-TTCTTATGTTGGCCTTGGCCTTGTATGTCGT 59
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Sbjct 1 ATGGTCAATCCTAGTAATTGGCCATC-TCTTCTAATGTTGGTCTTAGCCTTCTATGTCGT 59
Query 60 TGCAGCACATACAAGTGCTCAGTGCAAATACTCTCCACCATCACCACTACCGTATGTCTA 119
|| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | | |
Sbjct 60 TGTAGTGCCTACAAGTGCTCAGTGCAAATACTCTCCACAATCA-C-C-A-C------C-- 107
Query 120 TAGTTCTCCACCACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTC 179
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 -A-----CCACAACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTC 161
Query 180 TCCCCCACCGGCTCCTTACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTC 239
||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 162 TCCACCACCATCTCCTTATCTCTATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGTATACAACTC 221
Query 240 TCCACCACCACCTCTTCCATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctccatacgtcta 299
|||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| || ||
Sbjct 222 TCCACCACCACCTCCTCCATACATCTACAACTCTCCACCACGACCTCC---ATATGTTTA 278
Query 300 ca-gctctccaccaccacctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCATATG 358
| | ||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 279 TAAG-TCTCC-CC-CT-CCTCCTCCATTCGTGTACAGCTCTCCACCACCCCCTACATATA 334
Query 359 TTTAT--CTTTCT-CCTCCTCCTC--T-T-T---CAT-TC-GT-C-T---A---CAG-C- 396
|||| || || || || |||| | | | || || || | | | || |
Sbjct 335 TTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCCTCGTATTACATTCA 394
Query 397 TCTCCA-C-C---ATC-CCC--TCCATATGTTTATCAGT-CTCCCCCTCCTTTTCCATTC 447
||| || | | | | ||| |||||||||||| || | || | |||| | ||||||||
Sbjct 395 TCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCCTCGTATTCCATTC 453
Query 448 ATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTAC-CTTTCATCGTCC-AT 505
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | | | || | ||
Sbjct 454 ATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCT-CGT-GTTCTAT 511
Query 506 TCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCT 549
| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 512 TTATCTACAGCTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAACTCT 555
Score = 329 bits (178), Expect = 2e-89
Identities = 366/453 (81%), Gaps = 27/453 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 230 TCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTCCATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctc 289
|||||| |||||||||||| || | |||||| || |||| | | | | || | | ||
Sbjct 395 TCTACAGCTCTCCACCACC-CC-C-TCCATATGTTTACA-AT-T-CTGCTCCTCGTATTC 448
Query 290 catacgtctacagctctccaccaccacctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCAC-TA 348
||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| | || | |
Sbjct 449 CATTCATCTATAGCTCT---CCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCTCGT- 504
Query 349 CCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCAT-TCGTCTACAGCTCTCCACCAT 406
|| || | | || | ||||| || || | | ||| | || |||| ||||||||||
Sbjct 505 GTTCTATTTATCTA-CAGCTCTCCACCACCACCTCCATAT-GTTTACAACTCTCCACCA- 561
Query 407 CC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACC 464
|| |||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 CCACCTCCATATGTTTA-CGAGTCTGTTCCTCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACC 620
Query 465 ACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTACCT-TTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCAC 523
||| ||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||||| |||||| |||
Sbjct 621 ACCCCCTCCATATGTTTACAATTCT-GCTCCTCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCAC 679
Query 524 CACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCG-TCCATTCATCTACAGCTCTCC 581
|||||||||||||||||||||| ||||| || || | | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 680 CACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGT-GTTCCATTTATCTACAGCTCTCC 737
Query 582 ACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTC 640
|||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||
Sbjct 738 ACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTC 796
Query 641 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673
||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 797 CACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 829
Score = 305 bits (165), Expect = 4e-82
Identities = 372/468 (79%), Gaps = 29/468 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 140 TCTACAGTC-CCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCCCCACCG-GCTCC-TT 196
||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| ||| | || || ||| ||
Sbjct 605 TCTACAG-CTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCC-TCGTATTCCATT 662
Query 197 ACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTC 256
| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | | | | || | | |||
Sbjct 663 -CATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAA-T-T-CTGCTCCTCGTGTTC 718
Query 257 CATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctccatacgtctac-agctctccaccacca 315
||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||| ||
Sbjct 719 CATTTATCTACAGCTCTCCACCACCA---CCTCCATATGTTTACAAG-TCT---GTTCCT 771
Query 316 cctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCC 374
| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||
Sbjct 772 CGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCTCC 830
Query 375 TCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCC 432
|| | || ||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||| | | ||| |
Sbjct 831 TCGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCTACCA-CCTCCTCCATATGTTTA-CAATTCTGCT 888
Query 433 CCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTAC- 491
|||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 889 CCTCGTGTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCT 948
Query 492 CTTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC 551
| | | | |||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||
Sbjct 949 CCT-CGTATTCCATTTATCTATAGTTCTCCACCACC-CCACCATATGTTTACAAGTTTGT 1006
Query 552 -CCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATG 598
||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 TCCT-CATATTCCAT-CATCTACAACTCTCCACCACCCCCTCCATATG 1052
Score = 228 bits (123), Expect = 8e-59
Identities = 322/414 (78%), Gaps = 30/414 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 275 caccaccacctcctccatacgtctacagctctccaccaccacc-tcctccaTACGTCTAC 333
|||||||||| | ||||| |||||||| || || |||| ||| | ||||||| || |||
Sbjct 101 CACCACCACCACAACCATATGTCTACAG-TC-CC-CCACTACCAT-CTCCATATGTTTAC 156
Query 334 -AGCTCTCCACCACTACCTCCATATGTTTATCTTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTA 392
|| |||||||||| | |||| ||| | ||| || || || || | | ||| ||| ||
Sbjct 157 AAG-TCTCCACCACCATCTCCTTATCTCTATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGTATA 215
Query 393 CAGCTCTCCACCA--TCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCAT-TC 447
|| |||||||||| || |||||||| | || | | ||||| || | ||||| |
Sbjct 216 CAACTCTCCACCACCACCTCCTCCATACATCTA-CAACTCTCCACCACGACCTCCATAT- 273
Query 448 ATCTA-CAGCTCTCCACCACCGCCTCCATAT-GTTTACAAG-TCTACCTTTCA--TCGTC 502
| || || ||||| || || ||||||| | || ||| || ||| || || | |
Sbjct 274 GTTTATAAG-TCTCCCCCTCCTCCTCCAT-TCGTGTAC-AGCTCT-CC-ACCACCCCCTA 328
Query 503 CAT-TCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCG 560
||| | || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |
Sbjct 329 CATAT-ATTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTAT 386
Query 561 TCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATC 619
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |
Sbjct 387 TACATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTCCT-CGTA 445
Query 620 GTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 446 TTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 499
Score = 219 bits (118), Expect = 5e-56
Identities = 419/558 (75%), Gaps = 46/558 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 136 TATGTCTACAGTC-CCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCT-C-CC-CCACCGGC 191
||| |||| || | |||||| |||| ||||||| || ||||| ||| | || ||||| |
Sbjct 178 TATCTCTATAG-CTCCCCACCACCACCTCCATACGTATACAACTCTCCACCACCACCTCC 236
Query 192 TCCTTACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC 251
||| ||| |||| | ||| ||||||| || ||||| || || || ||| | || || ||
Sbjct 237 TCCATACATCTACAACTCTCCACCACGACCTCCATATGTTTATAAGTCT-C-CC-CCTCC 293
Query 252 TCTTCCATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctccatacgtctacagctctccacc 311
|| ||||| ||| ||||||||||||||| | || ||| |||| | |||| |||||||||
Sbjct 294 TCCTCCATTCGTGTACAGCTCTCCACCA-C-CC-CCTACATATATTTACAACTCTCCACC 350
Query 312 accacctcctccaTACGTCTAC-AGCTCTCCACCAC-TACCTCCA-T-ATGTTTATCTTT 367
|||| |||||||| || ||| || ||| || | || | || | || | | | |
Sbjct 351 ACCA---CCTCCATATGTTTACAAG-TCTGTTCCTCGTA-TTACATTCATCTACAGC--T 403
Query 368 CTCCTCCTCCTCTTTCAT-TCGTCTACAGCTCTCCACCATC-CCCTCCATAT-GTTTATC 424
|||| || || | | ||| | || |||| ||| | || || ||||| | | |||
Sbjct 404 CTCCACCACCCCCTCCATAT-GTTTACAATTCTGCTCC-TCGTATTCCAT-TCATCTAT- 459
Query 425 AG-TCTCCCCCTCCTTTTCCAT-TCATCTACAGCTCTCCACCACCG-CCTCCATATGTTT 481
|| ||||| || ||| ||||| | | |||| ||| | || || || || | | |
Sbjct 460 AGCTCTCCACCACCTCCTCCATAT-GTTTACAATTCTGCTCC-TCGTGTTCTATTTATCT 517
Query 482 ACAAG-TCT--ACCTTTCATCGTCCAT-TCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATAT 537
|| || ||| ||| || | ||||| | | |||| |||| ||||||| |||||||||
Sbjct 518 AC-AGCTCTCCACC-ACCA-CCTCCATAT-GTTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATAT 573
Query 538 GTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 596
|||||| |||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 574 GTTTACGAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 632
Query 597 TGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCAT 655
||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 633 TGTTTACAATTCTGCTCCT-CGTATTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCAT 691
Query 656 ATGTTTACAAGTCTGCTC 673
|||||||||| |||||||
Sbjct 692 ATGTTTACAATTCTGCTC 709
Score = 135 bits (73), Expect = 5e-31
Identities = 284/377 (75%), Gaps = 49/377 (13%)
Strand=Plus/Plus
Query 308 caccaccacctcctccaTACGTCTACAGCT-CTCCACCACTACCTCCATATGTTTATC-T 365
|||||||||| | ||||| |||||||| | | |||| || | ||||||||||||| |
Sbjct 101 CACCACCACCACAACCATATGTCTACAG-TCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTA-CAA 158
Query 366 TTCTCCTCCTCC-TCTTTCAT-TCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTA 422
||||| || || || | | | || |||| ||||| |||||| || |||||||| || ||
Sbjct 159 GTCTCCACCACCATC-TCCTTATC-TCTATAGCTCCCCACCA-CCACCTCCATACGTATA 215
Query 423 TC-AGTCT-C-CC-CCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCG-CCTCCATAT 477
| | ||| | || || ||| ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||
Sbjct 216 -CAACTCTCCACCACCACCTCCTCCATACATCTACAACTCTCCACCA-CGACCTCCATAT 273
Query 478 GTTTACAAGTCTACCTTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATAT 537
||||| |||||| || | || ||| | ||| | | | || | || || ||||
Sbjct 274 GTTTATAAGTCT-CC--CCCTCCTCC-TCCAT-T-C-G---TGTA-CAGCT-CTCC---- 317
Query 538 GTTTACAAGTCTGCCCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATAT 597
|| | | ||| | | | | | | || |||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 318 ----ACCA--C--CCCCT-A-CAT--A-T-ATTTACAACTCTCCACCACCACCTCCATAT 363
Query 598 GTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCATCTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 656
||||||||||||| || || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GTTTACAAGTCTGTTCC-TCGTATTACATTCATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATA 422
Query 657 TGTTTACAAGTCTGCTC 673
||||||||| |||||||
Sbjct 423 TGTTTACAATTCTGCTC 439
Score = 130 bits (70), Expect = 2e-29
Identities = 93/104 (89%), Gaps = 2/104 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 571 TACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTG-CCCTTCATCGTCCATTCAT 629
|||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||
Sbjct 547 TACAACTCTCCACCACCACCTCCATATGTTTACGAGTCTGTTCC-TCGTATTCCATTCAT 605
Query 630 CTATAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGCTC 673
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 606 CTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAATTCTGCTC 649
Score = 71.3 bits (38), Expect = 1e-11
Identities = 98/125 (78%), Gaps = 11/125 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 757 CCACCACCATACGCCTACAGT---CCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCT 813
|||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 CCACAACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC- 167
Query 814 TACT-TCTCCACCACCATACTCATA-CAGTCCACCGCCATCTCCATATGTTTACAAGTCT 871
|| ||||| | | | || ||| | ||||| ||| ||||||| || ||||| |||
Sbjct 168 -ACCATCTCCTT-ATC-T-CT-ATAGCTCCCCACCACCACCTCCATACGTATACAACTCT 222
Query 872 CCACC 876
|||||
Sbjct 223 CCACC 227
Score = 56.5 bits (30), Expect = 4e-07
Identities = 51/60 (85%), Gaps = 5/60 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 821 CCACCACCATA-CTCATACAGT---CCACCGCCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC 876
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Sbjct 109 CCACAACCATATGTC-TACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC 167
> AT1G26250.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr1:9083838-9085464 FORWARD LENGTH=1627
Length=1627
Score = 287 bits (155), Expect = 1e-76
Identities = 389/497 (78%), Gaps = 36/497 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 125 CTCCACCACCATATGTCTACAGTCCCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCCC 184
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Sbjct 667 CTCCACCACCTTACGTCTACTCTTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTACAAATCTCCTC 726
Query 185 CACCGGCTCCTTACCTCTATAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCAC 244
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Sbjct 727 CACCTCCTCCTTATGTCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTCCGC 786
Query 245 CACCACCTCTTCCATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctccatacgtctacagct 304
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Sbjct 787 CACCA-C-C-TCCTTACGTCTACAGTTCTCCACCACCA---CCTCCATATGTCTACAAAT 840
Query 305 ctccaccaccacctcctccaTACGTCTACAGCTCTCCACCACTACCTCCATATGTTTATC 364
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Sbjct 841 CTCCACCACCGCCTCCT---TATGTGTACAGCTCACCACCACCACCTCCTTATGTTTA-C 896
Query 365 -TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATTCGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTA 422
|||||||| || | | | | |||||| ||||| || ||| || ||||| || || ||
Sbjct 897 AAATCTCCTCCACCACCTCCCTACGTCTATAGCTCGCCTCCA-CCACCTCCCTACGTATA 955
Query 423 TCAGTCTC-CC-CCTCCTTTTCCAT-TCATCTACAGCTCTCCACCACCGCCTCCATATGT 479
| || ||| || || || ||||| | | |||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 956 T-AG-CTCGCCACCACCACCTCCATAT-GTTTACAGCTCGCCACCGCCTCCTCCATATGT 1012
Query 480 TTACAAGTCTACCTTTCA--TCGTCCATTCA--TCTACAGC-TCTGCACCACCTCCTCCA 534
|| |||||| || | || | ||| || | |||| | | || ||||||||||||||
Sbjct 1013 ATATAAGTCT-CC-TCCACCACCTCC-TT-ATGTCTATA-CTTCACCACCACCTCCTCCA 1067
Query 535 TATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTACAGCT-CTCCACCACC-CC-- 589
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Sbjct 1068 TATGTTTACAAGTCTCCTCCACCACC-TCCATACGTCGATAGCTACTC-ACCACCACCGG 1125
Query 590 CTCCATATGTTTACAAG 606
||||||||||||| |||
Sbjct 1126 CTCCATATGTTTATAAG 1142
Score = 272 bits (147), Expect = 4e-72
Identities = 468/613 (76%), Gaps = 62/613 (10%)
Strand=Plus/Plus
Query 89 ACTCTCCACCATCACCA-CTACCGTATGTCTATAG-T--TCTCCA---CCACCATATGTC 141
||||||| || ||||| || || || |||||||| | ||||| || ||||||||
Sbjct 328 ACTCTCC-CC--CACCACCT-CCCTACGTCTATAGCTCCCCTCCACCTCCTCCATATGTT 383
Query 142 TAC-AGTC-CCCCACTACCATCTCCATATGTTTACAAGTCT-CCC-CCACCGGCTCCTTA 197
||| |||| |||| | |||| |||| ||||| ||| || || ||| ||||| |||| ||
Sbjct 384 TACAAGTCTCCCC-C-ACCACCTCCCTATGTCTAC-AG-CTCCCCACCACCTCCTCCATA 439
Query 198 CCTCTA-TAGCTCCCCACCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCTCTTC 256
| || || ||||| ||||| || || || ||||| | |||| |||||||||| ||
Sbjct 440 TGTTTACAAG-TCCCCGCCACCACCTCCTTATGTCTATAGCTCT---CCACCACCTCCTC 495
Query 257 CATACGTCTACAGctctccaccaccacctcctccatacgtcta-cagctctccaccacca 315
| || ||||| || | ||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||
Sbjct 496 CTTATGTCTATAG-T-TCC-CCACCACCACCACCATATGTTTATAAG-TCTCCTCCACCA 551
Query 316 cctcctccaTACGTCTACAGCT-CTCCACCACTACCTCCATATGTTTATCTTTCTCCTCC 374
|||||| |||||||| || | ||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||
Sbjct 552 CCTCCT---TACGTCTATAG-TCCTCCACCACCACCGCCATATGTCTACCAATCTCCTCC 607
Query 375 TCCTCTTTCATT-CGTCTACAGCTCTCCACCATCC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCC 431
|| | || || ||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||| || | |||| ||
Sbjct 608 ACCAC-CTCCTTACGTATATAGCTCTCCACC-TCCTCCTCCTTATGTCTA-CAAGTCGCC 664
Query 432 CCCTCCTTTTCCATT-CATCTACAGC-TCTCCACCACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCT 489
||||| || || | ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 665 TCCTCCACCACC-TTACGTCTAC-TCTTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTACAAATCT 722
Query 490 ACCTTTCA--TCGTCCATTCA--TCTACAGCTCTGCACCACCTCCTCCATATGTTTACAA 545
|| | || || ||| || | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 723 -CC-TCCACCTCCTCC-TT-ATGTCTATAGCTCTCCACCACCTCCTCCATATGTTTACAA 778
Query 546 GTCTGC-CCTTCATCGTCCATT-CATCTACAGCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTTTAC 603
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Sbjct 779 GTCTCCGCCACCACC-TCC-TTACGTCTACAGTTCTCCACCACCACCTCCATATGTCTAC 836
Query 604 AAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCATCTATA--GCTCTCCACCACCCCCTCCATATGTT 660
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Sbjct 837 AAATCTCCACCACCGCC-TCC-TT-ATGTGTACAGCTCACCACCACCACCTCCTTATGTT 893
Query 661 TACAAGTCTGCTC 673
||||| ||| |||
Sbjct 894 TACAAATCTCCTC 906
Score = 148 bits (80), Expect = 7e-35
Identities = 203/260 (78%), Gaps = 18/260 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 349 CCTCCATATGTTTATC-TTTCTCCTCCTCCTCTTTCATT-CGTCTACAGCTCTCCACCAT 406
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Sbjct 252 CCTCCATATATCTA-CAGTTCTCCCCCACCAC-CTCCTTACGTCTATAGCTCCCCACCA- 308
Query 407 CC-CCTCCATATGTTTATC-AGTCTCCCCCTCCTTTTCCATTCATCTACAGCTCTCCACC 464
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Sbjct 309 CCTCCTCCATATGTTTA-CAACTCTCCCCCACCACCTCCCTACGTCTATAGCTCCCCTCC 367
Query 465 ACCGCCTCCATATGTTTACAAGTCTACCTTTC-ATCGTCCAT-TCATCTACAGCTCTGCA 522
||| ||||||||||||||||||||| || | | | ||| | | |||||||||| ||
Sbjct 368 ACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTCCCCCACCACC-TCCCTATG-TCTACAGCTCCCCA 425
Query 523 CCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-CCTTCATCGTCCATTCAT--CTACAGCTCT 579
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Sbjct 426 CCACCTCCTCCATATGTTTACAAGTCCCCGCCACCACC-TCC-TT-ATGTCTATAGCTCT 482
Query 580 CCACCACCCCCTCCATATGT 599
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Sbjct 483 CCACCACCTCCTCCTTATGT 502
> AT4G08380.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr4:5311093-5312406 REVERSE LENGTH=1314
Length=1314
Score = 261 bits (141), Expect = 8e-69
Identities = 192/215 (89%), Gaps = 10/215 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 683 GTCCACCCCCATCTCCATATGCTTACAAGTCTCCCCCTTACGTCTATAGTTCTCCAACGA 742
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Sbjct 551 GTCCACCTCCATCCCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAGTTCTCCACCGC 610
Query 743 CATATGCCTACAGTCCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACA 802
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Sbjct 611 CATATGCCTACAGTCCGCCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACA 670
Query 803 AGTCTCCACC-T-T--AC-T--T-CTCCACCACCATACT-CATACAGTCCACCGCCATCT 853
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Sbjct 671 AGTCTCCACCATATGTATATAGTTCTCCACCTCCATA-TGCCTACAGTCCACCACCATCT 729
Query 854 CCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 888
||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 CCATACGTCTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 764
Score = 224 bits (121), Expect = 1e-57
Identities = 158/174 (91%), Gaps = 10/174 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 724 GTCTATAGTTCTCCAACGACATATGCCTACAGTCCACCACCATACGCCTACAGTCCACCA 783
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Sbjct 427 GTCTATAGTTCTCCACCGCCATATGCCTACAGTCCACCACCATACGCCTACAGTCCACCA 486
Query 784 CCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACC-T-T--AC-T--T-CTCCACCACCATACT-C 834
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Sbjct 487 CCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCATATGTATATAGTTCTCCACCACCATA-TGC 545
Query 835 ATACAGTCCACCGCCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 888
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Sbjct 546 CTACAGTCCACCTCCATCCCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 599
Score = 148 bits (80), Expect = 7e-35
Identities = 212/271 (78%), Gaps = 28/271 (10%)
Strand=Plus/Plus
Query 639 TCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-TCTTCATCAATGTCCACCCCCATCTC 697
||||||||| |||||||||||||||||||| | | | || || | | ||| |||
Sbjct 645 TCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCAT-ATGTATATAGTTCTCCACCTC 703
Query 698 CATATGCTTACAAGT-CTCC-CC--CT---TACGTCTA-TAGTTCTCCAACGACATATGC 749
||||||| ||| ||| | || || || |||||||| || ||||| || | || |
Sbjct 704 CATATGCCTAC-AGTCCACCACCATCTCCATACGTCTACAAG-TCTCC-AC--CTTACGT 758
Query 750 CTACAG---TCCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTC 806
||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 759 CTATAGTTCTCCACCACCATATGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTCTACAAGTC 818
Query 807 TCCACCTTA---CT-TC-T-C-C-ACCACCATACT-CATACAGTCCACCGCCATCTCCAT 857
||| ||||| || | | | | ||||||||| | | || |||||||| || |||||||
Sbjct 819 TCCGCCTTATGTCTATAGTTCACCACCACCATA-TGCCTATAGTCCACCACCGTCTCCAT 877
Query 858 ATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 888
| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 ACGTCTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 908
Score = 148 bits (80), Expect = 7e-35
Identities = 216/275 (79%), Gaps = 36/275 (13%)
Strand=Plus/Plus
Query 639 TCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCT--GCTCTTCA--TCAAT-GTCCACCCCCA 693
||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| | || || || |||| |||
Sbjct 789 TCCACCACCATCTCCATATGTCTACAAGTCTCCGC-CTT-ATGTCTATAGTTCACCACCA 846
Query 694 TCTCCATATGCTTACAAGT-CTCC-CC--CT---TACGTCTA-TAGTTCTCCAACGACAT 745
|||||||| || ||| | || || || |||||||| || ||||| || | |
Sbjct 847 ---CCATATGCCTA-TAGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAG-TCTCC-AC--CTT 898
Query 746 ATGCCTACAG-T--CCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACA 802
| | ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 899 ACGTCTATAGTTCACCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACA 958
Query 803 AGTCTCCACCTTACTTCT------C-C-ACCACCATACT-CATACAGTCCACCGCCATCT 853
|||||||||||||| ||| | | ||||||||| | | ||||||||||| || |||
Sbjct 959 AGTCTCCACCTTACGTCTATAGTTCACCACCACCATA-TGCCTACAGTCCACCACCGTCT 1017
Query 854 CCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 888
||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 CCATACGTCTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 1052
Score = 147 bits (79), Expect = 2e-34
Identities = 122/141 (87%), Gaps = 10/141 (7%)
Strand=Plus/Plus
Query 757 CCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTAC 816
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 199 CCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAGTCTCCACCTTAC 258
Query 817 TTCT------C-C-ACCACCATACT-CATACAGTCCACCGCCATCTCCATATGTTTACAA 867
||| | | ||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| || |||||
Sbjct 259 GTCTATAGTTCACCACCACCATA-TGCCTACAGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAA 317
Query 868 GTCTCCACCTTACGTCTATAG 888
|||||||||||||||||||||
Sbjct 318 GTCTCCACCTTACGTCTATAG 338
Score = 134 bits (72), Expect = 2e-30
Identities = 173/219 (79%), Gaps = 18/219 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 683 GTCCACCCCCATCTCCATATGCTTACAAGTCTCCCCCTTACGTCTATAGTTCTCCAACGA 742
||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||| || |
Sbjct 479 GTCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCATATGTATATAGTTCTCC-ACCA 537
Query 743 -CATATGCCTACAGTCCA---CCA---CCATACGCCTAC-AGTCCACCACCAT-C-TCCA 792
||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||| | ||||| | | || |
Sbjct 538 CCATATGCCTACAGTCCACCTCCATCCCCATATGTTTACAAGT-CTCCACCTTACGTCTA 596
Query 793 TATGTT-TACAAGTCTCCACCTTACTTC--TCCACCACCATACTCATACAGTCCACCGCC 849
|| ||| | | | | ||| | || | ||| ||||||||| | ||||||||||| ||
Sbjct 597 TA-GTTCT-CCA-CCGCCATATGCCTACAGTCCGCCACCATACGCCTACAGTCCACCACC 653
Query 850 ATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAG 888
||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 654 ATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCATATGTATATAG 692
Score = 110 bits (59), Expect = 3e-23
Identities = 154/196 (79%), Gaps = 22/196 (11%)
Strand=Plus/Plus
Query 639 TCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-TCTT-CATCAAT-GTCCACCCCCATC 695
||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||| | || || || |||| |||
Sbjct 219 TCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAGTTCACCACCA-- 276
Query 696 TCCATATGCTTACAAGT-CTCC-CC--CT---TACGTCTA-TAGTTCTCCAACGACATAT 747
|||||||| ||| ||| | || || || |||||||| || ||||| || | ||
Sbjct 277 -CCATATGCCTAC-AGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAG-TCTCC-AC--CTTAC 330
Query 748 GCCTACAG-T--CCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAG 804
| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 331 GTCTATAGTTCACCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCGTCTCCATATGTGTACAAG 390
Query 805 TCTCCACCTTACTTCT 820
|||||||||||| |||
Sbjct 391 TCTCCACCTTACGTCT 406
Score = 108 bits (58), Expect = 1e-22
Identities = 181/235 (77%), Gaps = 30/235 (13%)
Strand=Plus/Plus
Query 639 TCCACCACCCCCTCCATATGTTTACAAGTCTGC-TCTT-CATCAAT-GTCCACCCCCATC 695
||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||| | || || || |||| |||
Sbjct 933 TCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAGTCTCCACCTTACGTCTATAGTTCACCACCA-- 990
Query 696 TCCATATGCTTACAAGT-CTCC-CC--CT---TACGTCTA-TAGTTCTCCAACGACATAT 747
|||||||| ||| ||| | || || || |||||||| || ||||| || | ||
Sbjct 991 -CCATATGCCTAC-AGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAG-TCTCC-AC--CTTAC 1044
Query 748 GCCTACAG-T--CCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAG 804
| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 1045 GTCTATAGTTCACCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCGTCTCCATACGTCTACAAG 1104
Query 805 TCTCCACCTTAC-T-T------CTCCACCACCATACTCATACAGTCCACCGCCAT 851
|||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||
Sbjct 1105 TCTCCACCTTACGTCTATAGTTCTCCACCACCATACACCTACAGCCCACCACCAT 1159
Score = 95.3 bits (51), Expect = 9e-19
Identities = 63/69 (91%), Gaps = 0/69 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 820 TCCACCACCATACTCATACAGTCCACCGCCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCTTA 879
||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 459 TCCACCACCATACGCCTACAGTCCACCACCATCTCCATATGTTTACAAGTCTCCACCATA 518
Query 880 CGTCTATAG 888
|| |||||
Sbjct 519 TGTATATAG 527
> AT2G24980.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr2:10622453-10624132 FORWARD LENGTH=1680
Length=1680
Score = 73.1 bits (39), Expect = 4e-12
Identities = 91/114 (80%), Gaps = 11/114 (10%)
Strand=Plus/Plus
Query 214 CCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC-T-CTTC-CATACGTCTAC-A- 268
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | | | ||| | |
Sbjct 1192 CCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCATACTACTC-TCCTTCTCCTAA 1250
Query 269 Gctctcc-acca--cc--acctcctccatacgtctacagctctccaccaccacc 317
| | | | || | || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1251 GGTTTACTACAAGTCCCCACCTCCACCATACGTCTACAGCTCCCCACCTCCACC 1304
> AT5G35190.1 | Symbols: | proline-rich extensin-like family protein
| chr5:13434181-13435167 FORWARD LENGTH=987
Length=987
Score = 67.6 bits (36), Expect = 2e-10
Identities = 38/39 (97%), Gaps = 0/39 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 214 CCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT 252
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 CCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT 555
Score = 67.6 bits (36), Expect = 2e-10
Identities = 38/39 (97%), Gaps = 0/39 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 214 CCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT 252
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT 705
Score = 62.1 bits (33), Expect = 9e-09
Identities = 33/33 (100%), Gaps = 0/33 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 220 CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT 252
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACCT 405
> AT3G54590.1 | Symbols: ATHRGP1, HRGP1 | hydroxyproline-rich glycoprotein
| chr3:20206160-20208472 FORWARD LENGTH=2163
Length=2163
Score = 65.8 bits (35), Expect = 7e-10
Identities = 37/38 (97%), Gaps = 0/38 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 214 CCACCTCCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC 251
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642 CCACCACCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC 1679
Score = 60.2 bits (32), Expect = 3e-08
Identities = 32/32 (100%), Gaps = 0/32 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 220 CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC 251
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 CCACCATACGTCTACAACTCTCCACCACCACC 479
> AT3G28550.1 | Symbols: | Proline-rich extensin-like family protein
| chr3:10700707-10703929 REVERSE LENGTH=3223
Length=3223
Score = 56.5 bits (30), Expect = 4e-07
Identities = 32/33 (97%), Gaps = 0/33 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 103 CCACTACCGTATGTCTATAGTTCTCCACCACCA 135
|||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116 CCACCACCGTATGTCTATAGTTCTCCACCACCA 2148
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 43352068861
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5