BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg327675
Length=3918
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G01030.1 | Symbols: | pentatricopeptide (PPR) repeat-contai... 3280 0.0
AT4G01037.1 | Symbols: WTF1, AtWTF1 | Ubiquitin carboxyl-termin... 2172 0.0
AT4G01026.1 | Symbols: PYL7, RCAR2 | PYR1-like 7 | chr4:447052-... 270 6e-71
> AT4G01030.1 | Symbols: | pentatricopeptide (PPR) repeat-containing
protein | chr4:447941-450642 REVERSE LENGTH=2702
Length=2702
Score = 3280 bits (1776), Expect = 0.0
Identities = 2134/2311 (92%), Gaps = 8/2311 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1612 ATGTATCGGTTTCTGGGTTTCACTATCCATGGTGGTTTGATCAAGAGAGGCCTCGATAAT 1671
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1 ATGTATCGGTTTCTGGGTTTAACTATCCATGGTGGTTTGATCAAGAGAGGGCTTGATAAT 60
Query 1672 TCAGACACACGAGTGGTTTCTGCGTTGATGGGTTTCTATGGAAGATGTGTGAGTTTGGAT 1731
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 61 TCAGACACACGAGTGGTTTCTGCGTCGATGGGTTTTTATGGAAGATGTGTGAGTTTGGGT 120
Query 1732 CTTGCTAACAAGATATTCGATGAAATGCCTAAAAGAGATGATCTTGCATGGAACGAGATC 1791
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TTTGCTAACAAGTTATTCGATGAAATGCCTAAAAGAGATGATCTTGCATGGAACGAGATC 180
Query 1792 GTGATGGTAAACTTGCGGAGTGGGAATTGGGAAAAGGCTGTGAAACTGTTCAGAGTGATG 1851
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||
Sbjct 181 GTAATGGTAAACTTGCGGAGTGGGAATTGGGAAAAGGCTGTGGAACTTTTCAGAGAGATG 240
Query 1852 CGGTTTTCTGGTGCAAAAGCTTATGATAGTACAATGGTTAAGCTTTTGCAAGTTTGTAGC 1911
| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CAGTTTTCTGGTGCTAAAGCTTATGATAGCACAATGGTTAAGCTTTTGCAAGTTTGTAGC 300
Query 1912 AACAAGGAAGGTTTTGCACAAGGGAGACAGATTCATGGGTATGTTCTGAGATTGGGGTTT 1971
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||
Sbjct 301 AATAAGGAAGGTTTTGCAGAAGGGAGACAGATTCATGGGTATGTTCTGAGACTCGGGCTT 360
Query 1972 GAATCAAATGTGTCCATGTGTAACTCCTTGATTGTCATGTACTCGAGGAATGGCAAGCTT 2031
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAATCAAATGTGTCTATGTGTAACTCTTTGATTGTCATGTATTCGAGGAATGGCAAGCTT 420
Query 2032 GAATCATCCAGGAAAGTTTTTAATTCGATGGTAGACCGGAATTTGTCTTCGTGGAACTCG 2091
|||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAATTATCCAGGAAAGTTTTTAACTCGATGAAAGACCGGAATTTGTCTTCGTGGAACTCG 480
Query 2092 ATTGTATCGAGTTATACGAAACTTGGTTATGTAGATGATGCTATGGGTCTCCTGGACGAG 2151
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 481 ATTTTATCGAGTTATACGAAACTTGGTTATGTAGATGATGCTATCGGTCTCCTGGACGAG 540
Query 2152 ATGGAGACATGTGGTCTGAAACCAGATATAGTGACATGGAACTCTCTTTTGTCAGGTTTT 2211
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 541 ATGGAGATATGTGGTCTGAAGCCAGATATAGTGACATGGAACTCTCTTTTGTCAGGTTAT 600
Query 2212 GCTTCTAAAGCCTTATCCAGAGATGCCATTGCGGTATTGAAGAGAATACAAATTGCTGGT 2271
|||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 601 GCTTCTAAAGGCTTATCCAAAGATGCCATTGCTGTATTGAAGAGAATGCAAATTGCTGGT 660
Query 2272 CTGAAGCCAAACACGAGCTCAATTAGTAGTCTTCTTCAAGCTGTTTATGAACCAGGGCTT 2331
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
Sbjct 661 CTGAAGCCAAGCACGAGCTCAATTAGTAGTCTTCTTCAAGCTGTAGCTGAACCGGGGCAT 720
Query 2332 CTTAAACTTGGAAAAGCGATTCACGGATATGTAATAAGAAATCAGCTTTGGTACGATGTG 2391
||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CTTAAACTTGGGAAAGCGATCCACGGATACATATTAAGAAATCAGCTTTGGTACGATGTG 780
Query 2392 TATGTAGAAACCACATTGATTGACATGTATATTAAAACTGGCTACTTGCCTTACGCCCGG 2451
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TATGTAGAAACCACCTTGATCGACATGTATATTAAAACTGGCTACTTGCCTTACGCCCGG 840
Query 2452 ATGGTTTTTGATATGATGGATGAGAAGAACATTGTTGCTTGGAATTCACTCATCTCGGGA 2511
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 841 ATGGTTTTTGATATGATGGATGCGAAGAACATTGTTGCTTGGAATTCACTCGTCTCGGGA 900
Query 2512 CTTTCGTACACCGGTCTGCTAAAGGAAGCTGAAGCGTTAATAAGTAGAATGGAAAAGGAA 2571
||||||||| | |||| |||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||||||
Sbjct 901 CTTTCGTACGCTTGTCTTCTAAAGGATGCTGAAGCTTTGATGATTAGAATGGAGAAGGAA 960
Query 2572 GGGATCAAACCTGATGCTGTTACATGGAACAGTCTGGTTTCTGGGTATGCGAC-TTGGGG 2630
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 961 GGGATCAAACCTGATGCTATTACATGGAACAGTCTTGCTTCTGGGTATGCGACTTTGGGG 1020
Query 2631 AAAAACTGAGAAAGCTTTGGCTGTAG-TAGGGAAGATGAAAAAGAACGGGGTGGAGCCTA 2689
||| ||||||| || || | ||| | ||||||||||||| |||| || |||| ||||
Sbjct 1021 -AAACCTGAGAAGGCATTAGATGT-GATAGGGAAGATGAAGGAGAAAGGTGTGGCCCCTA 1078
Query 2690 ATGTGGTTTCATGGACTGCCATCTTGTCGGGGTGTTCCAAAAATGGAAACTTTGGGAATG 2749
| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1079 ACGTGGTTTCATGGACAGCCATTTTTTCAGGATGTTCCAAAAATGGAAACTTCAGGAATG 1138
Query 2750 GTCTCAAAGTTTTCATGAAAATGCAGGAAGAAGGTGTCT-CTCCAAACTCAGCTACCATA 2808
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || ||
Sbjct 1139 CTCTCAAAGTTTTCATTAAAATGCAGGAAGAAGGTGT-TGGTCCGAACGCAGCAACTATG 1197
Query 2809 TCCAGCTTGCTTAGGATATTAGGTTACTTGAGTCTATTATACAGTGGCAAAGAGGTTCAC 2868
|||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TCCACCTTGCTTAAGATATTAGGTTGCTTAAGTCTACTACACAGTGGCAAAGAGGTTCAC 1257
Query 2869 AGCTTCTGTCTAAAGAACAATTTGATCCACGATGCACATGTTGCAACTGCACTAGTAGAT 2928
| |||||| | | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GGTTTCTGTTTGAGGAAAAATTTGATCTGCGATGCATATGTTGCAACTGCACTAGTAGAT 1317
Query 2929 ATGTACGCAAAATCAGGGGATCTGCAAAGCGCGGCTGAGATTTTCTGGGGCATTAAGAAC 2988
||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATGTATGGAAAATCAGGGGATCTGCAAAGTGCGATTGAGATTTTCTGGGGCATTAAGAAC 1377
Query 2989 AAACCACTAGCTTCTTGGAATTGTATGATCATGGGTTATGCCATGTTTAGGCGAGGCGAA 3048
||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1378 AAATCGCTAGCTTCTTGGAACTGTATGCTCATGGGTTATGCCATGTTTGGGCGAGGCGAA 1437
Query 3049 GAAGGGATTGCGGTTTTTACTGCAATGCTTGAAGCGGGCATTGAACCTGATGTTATAACG 3108
|||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||
Sbjct 1438 GAAGGGATCGCGGCTTTCAGTGTGATGCTTGAAGCGGGCATGGAACCAGATGCTATAACG 1497
Query 3109 TTTACCTCTGTCTTGTCTGTTTGTAAGAACTCAGGTCTTGTCCGAGAAGGATGGAAATAC 3168
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1498 TTTACCTCTGTCTTGTCTGTCTGTAAGAACTCAGGTCTTGTCCAAGAAGGGTGGAAATAC 1557
Query 3169 TTTGATCTTATGAGGTCTCATTATGGTGTTATCCCGACTATCGAACACTGCTCTTGCATG 3228
||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 TTTGATCTTATGAGGTCTCGTTATGGTATAATCCCGACCATCGAACACTGCTCTTGCATG 1617
Query 3229 GTAGAAT-TGCTCGGGAGATCGGGTTATCTTGATGAAGCCTGGGACTTTATCCGAACAAT 3287
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||
Sbjct 1618 GTAG-ATCTGCTCGGGAGATCGGGTTATCTTGATGAAGCCTGGGACTTCATTCAAACAAT 1676
Query 3288 GCCATTAAAACCCGATGCAACTATTTGGGGTGCATTTCTTTCATCTTGTAAGATCCATAG 3347
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1677 GTCATTAAAACCCGATGCAACTATTTGGGGTGCTTTTCTTTCATCTTGTAAGATTCATAG 1736
Query 3348 AGACCTAGAACTCGCTGAAATCTCTTGGAAGAGGCTTCAAGTACTAGAACCACACAATTC 3407
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AGACCTAGAACTCGCGGAAATCGCTTGGAAGAGGCTTCAAGTACTAGAACCACACAATTC 1796
Query 3408 AGCTAACTACATGATGATGATAAACTTGTACAGTAATTTGAACAGATGGGGAGATGTTGA 3467
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1797 AGCTAACTACATGATGATGATAAACTTGTACAGTAATTTGAACAGATGGGAAGATGTTGA 1856
Query 3468 ACACATACGGAACTCAATGAGCAATAATAGGGTGAGAGTCCAGGATCTGTGGAGCTGGAT 3527
|| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 ACGTATACGGAACTTAATGAGGAATAACAGGGTGAGAGTCCAGGATCTGTGGAGCTGGAT 1916
Query 3528 TCAGATCGATCAAACGGTTCACATCTTCTATGCAGAGGGAAAAGCACATCCGGATGAAGG 3587
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 1917 TCAGATAGATCAAACGGTTCACATCTTCTATGCGGAGGGAAAAACACATCCTGATGAAGG 1976
Query 3588 AGAGATATACTTTGAGCTATACAAATTAGTCTCTGAGATGAAGAAATCAGGTTATATGCC 3647
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1977 AGATATATACTTTGAGCTGTACAAATTAGTCTCTGAGATGAAGAAATCAGGTTATGTGCC 2036
Query 3648 AGACACAAGATGTGTACATCAAAACATAAGTGAATCAGAGAAAGAGAAGCTGCTTATGGG 3707
||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 AGACACAAGCTGTATACACCAAGACATAAGTGATTCAGAGAAAGAGAAGCTGCTTATGGG 2096
Query 3708 ACATACAGAGAAGTTAGCAATGACTTATGGCCTTATCAAGAAGAAAGGCATAGCTCCTAT 3767
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2097 ACATACAGAGAAGTTAGCAATGACGTATGGCCTTATCAAGAAGAAAGGCTTAGCTCCTAT 2156
Query 3768 AAGAGTGGTCAAAAACACAAATCTATGTTCTGATTGCCACACTGTAGCCAAATACATATC 3827
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2157 AAGAGTGGTCAAAAACACGAATATATGTTCTGATAGCCACACCGTAGCCAAATACATGTC 2216
Query 3828 GGTTTTAAGAAACCGTGAAATTGTTTTACAAGAGGGGGCAAGAGTTCATCATTTCAGAGA 3887
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2217 GGTTTTGAGAAACCGTGAGATTGTTTTACAAGAAGGGGCAAGGGTTCATCATTTCAGAGA 2276
Query 3888 CGGAAAATGTTCCTGCAACGACTCTTGGTGA 3918
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 CGGAAAATGTTCCTGCAACGACTCTTGGTGA 2307
> AT4G01037.1 | Symbols: WTF1, AtWTF1 | Ubiquitin carboxyl-terminal
hydrolase family protein | chr4:451251-453243 REVERSE LENGTH=1923
Length=1923
Score = 2172 bits (1176), Expect = 0.0
Identities = 1274/1323 (96%), Gaps = 0/1323 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGCCCAAGCTTCTTCTTTCTGCACATAAACCCTTGTTTGTATCTTGTAACTCTCCG 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 144 ATGGAGCCCAAGCTTCTGCTTTCTGCACATAAACCTTTGTTTGTCTCTTGTAACTCTCCA 203
Query 61 TTCAATGAAAAAACCAATCTTTCTGTCAAATCCGGTTTGCCCATGTCCACAATTCGAGCT 120
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 TTCAATGAAAAAACCAAGCTTTCGGTCAAATCCGGTTTGCCCATGTCCACAATTCGAGCT 263
Query 121 GCGAGGTCTCAGTTTATGGGGGAAGGTTTGATTTTGGGGAACAAATATGGGTTTTGGAGT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 264 GCGAGGTCTCAGTTTATGGGGGAAGGTTTGATTTTGGGGAACAAGTATGGGTTTTGGAGT 323
Query 181 GCTTCTAGGAAAACTCGTCTTGTTGTTGAGCCTGTGAGAGCTGCTGTGAAGAGAAGGAAA 240
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 ACTTCTAGGAAAACTCGTGTTGTTGTTGAGCCTGTGAGAGCTGCTGTGAAGAGAAGGAAA 383
Query 241 GAGCTTACTTTCGATAGCGTTGTTCAAAGGGATAAGAAACTTAAGTTAGTGTTGAACATT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 GAGCTTACTTTCGATAGCGTTGTTCAAAGGGATAAGAAACTTAAGTTAGTGTTGAACATT 443
Query 301 AGGAAGATTCTTGTGAGTCAACCTGATAGGATGATGTCTCTTAGGGGTTTGGGTAAGTAC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 AGGAAGATTCTTGTGAGTCAACCTGATAGGATGATGTCTCTTAGGGGTTTGGGTAAGTAC 503
Query 361 AGGAGAGATTTGGGTTTGAAGAAACGTCGTCGGTTTATAGCTCTGCTTAGGAAATATCCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 AGGAGAGATTTGGGTTTGAAGAAACGTCGTCGGTTTATAGCTCTGCTTAGGAAATATCCT 563
Query 421 GGTGTGTTTGAGATTGTTGAAGAAGGAGCATATTCTTTGAGATTTAAGATGACTTCAGAG 480
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 564 GGTGTGTTTGAGATAGTTGAAGAAGGAGCTTATTCTTTGAGATTTAAGATGACATCAGAG 623
Query 481 GCTGAAAGGCTGTACCTTGAGGAAATGAGGATTAGAAATGAGCTTGAAGATGTACTAGTT 540
||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 624 GCTGAAAGGTTGTACCTTGACGAAATGAGGATTAGGAATGAGCTTGAAGATGTACTGGTT 683
Query 541 GTTAAGTTGAGGAAATTGGTGATGATGTCTATCGATAAGCGGATATTATTGGAGAAAATT 600
|||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 684 GTTAAGCTGAGGAAACTGGTGATGATGTCTATTGATAAGCGGATATTGTTGGAGAAGATT 743
Query 601 TCCCATTTGAGGACCGATTTAGGACTTCCTTTAGAGTTCCGCGACACGATCTGTCAGCGT 660
|||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 744 TCCCATTTGAAGACTGATTTAGGGCTTCCGTTAGAGTTCCGCGACACGATTTGTCAGCGT 803
Query 661 TACCCGCAATATTTCCGTGTGGTTCCTACGCCTAGAGGTCCGGCTTTAGAGTTAACGCAC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 804 TACCCGCAATATTTCCGTGTGGTTCCTACGCCTAGAGGTCCGGCTTTAGAGTTGACTCAC 863
Query 721 TGGGATCCTGAGCTTGCAGTGTCAGCTGCTGAGTTATCTGAGGATGATAATAGGACTAGA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 TGGGATCCTGAGCTTGCAGTGTCAGCTGCTGAGTTATCTGAGGATGATAATAGGACTAGA 923
Query 781 GAATCAGAAGAGAGGAATTTGATTATTGATAGACCACCTAAGTTCAATAGGGTTAAGCTT 840
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 924 GAGTCAGAAGAAAGGAATTTGATTATTGATAGACCACCTAAGTTCAACAGGGTTAAGCTT 983
Query 841 CCAAGGGGTCTCAATCTTTCAAAAAGTGAGACGAGGAAGATATCTCAGTTCCGTGACATG 900
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 CCAAGGGGTCTCAATCTTTCAAAGAGTGAGACGAGGAAGATATCTCAGTTCCGTGACATG 1043
Query 901 CGGTATATATCTCCTTACAAGGATTTCTCCCACTTGAGGTCGGGAACACTCGAGAAAGAA 960
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 CAGTATATATCTCCTTACAAGGATTTCTCCCACTTGAGGTCGGGAACACTCGAGAAAGAA 1103
Query 961 AAGCATGCTTGTGGGGTTATTCATGAGCTTTTGAGCTTGACGACTGAGAAAAGAACGCTG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 AAGCATGCTTGTGGGGTTATTCATGAGCTTTTGAGCTTAACGACTGAGAAAAGAACGCTG 1163
Query 1021 GTGGATCACTTGACTCATTTCCGCGAGGAATTCAGATTCTCACAACAACTGAGAGGAATG 1080
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1164 GTGGATCACTTGACTCATTTCCGTGAGGAATTCAGATTCTCACAACAACTGAGGGGAATG 1223
Query 1081 CTTATAAGGCACCCTGATCTCTTCTACGTGTCTTTGAAAGGGGAAAGGGATTCGGTTTTC 1140
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||
Sbjct 1224 CTTATTAGGCACCCTGATCTCTTCTACGTGTCTTTGAAAGGTGAAAGAGACTCGGTGTTC 1283
Query 1141 TTAAGAGAAGCTTACAGGAACTCTGAATTGATAGATAAAGATCCTCTAACTCTTGTGAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1284 TTAAGAGAAGCTTACAGGAACTCTGAATTGATAGATAAAGATCCTTTAACTCTTGTGAAA 1343
Query 1201 GAGAAGATGCGCGCACTTGTTTCTGTACCGAGGTTCCCaaggagaggaggacccaggaaa 1260
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 GAGAAGATGCGTGCACTTGTTTCTGTACCAAGGTTCCCAAGGAGAGGAGGACCCAGGAAA 1403
Query 1261 gaagaagaaggaagagacgaagagatggatggaagcgatgcagagggtgaggaggaagaa 1320
|| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1404 GACGAAGAAGGAAGAGAGGTAGAGATCGATGGAAGCGATGCAGATGGTGAGGAGGAAGAA 1463
Query 1321 gaa 1323
|||
Sbjct 1464 GAA 1466
> AT4G01026.1 | Symbols: PYL7, RCAR2 | PYR1-like 7 | chr4:447052-448511
FORWARD LENGTH=1166
Length=1166
Score = 270 bits (146), Expect = 6e-71
Identities = 166/176 (94%), Gaps = 0/176 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 3743 TCAAGAAGAAAGGCATAGCTCCTATAAGAGTGGTCAAAAACACAAATCTATGTTCTGATT 3802
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1166 TCAAGAAGAAAGGCTTAGCTCCTATAAGAGTGGTCAAAAACACGAATATATGTTCTGATA 1107
Query 3803 GCCACACTGTAGCCAAATACATATCGGTTTTAAGAAACCGTGAAATTGTTTTACAAGAGG 3862
||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1106 GCCACACCGTAGCCAAATACATGTCGGTTTTGAGAAACCGTGAGATTGTTTTACAAGAAG 1047
Query 3863 GGGCAAGAGTTCATCATTTCAGAGACGGAAAATGTTCCTGCAACGACTCTTGGTGA 3918
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 GGGCAAGGGTTCATCATTTCAGAGACGGAAAATGTTCCTGCAACGACTCTTGGTGA 991
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 195199575213
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5