BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg328336 Length=3327 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT4G34100.1 | Symbols: | RING/U-box superfamily protein | chr4... 5529 0.0 AT4G34103.1 | Symbols: | pseudogene of protein binding / zinc ... 409 1e-112 > AT4G34100.1 | Symbols: | RING/U-box superfamily protein | chr4:16330467-16335074 FORWARD LENGTH=3660 Length=3660 Score = 5529 bits (2994), Expect = 0.0 Identities = 3218/3329 (97%), Gaps = 4/3329 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAGATTTCCTCGGCCGAATCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCCGCTTCTGAGGTCGTC 60 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 124 ATGGAGATTTCCCCGGCCGATTCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCTGCTTCTGAGGTCGTC 183 Query 61 TCTGAGCCTTCCGTATCTTCTTCTTCTTCCTCTTCGTCGCCGAATCAGGCCTCCCCCAAT 120 || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| Sbjct 184 TCCGAGCCTTCCGTATCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGCCGAATCAGGCATCACCCAAT 243 Query 121 CCTTTGTCAACCATGGATCCCGCAGTTGCGACGGCGACAGGGTCGAGGTACGTTGATGAT 180 ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 244 CCTTTCTCAAACATGGATCCTGCAGTTTCGACGGCGACAGGATCGAGGTACGTTGATGAT 303 Query 181 GACGAAGATGAGGAGGACGTGTGCAGGATCTGCAGAAATCCTGGCGATGCGGACAATCCG 240 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 304 GACGAAGATGAAGAGGACGTTTGCAGGATCTGCAGAAATCCTGGTGATGCAGACAATCCG 363 Query 241 CTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGGAGCATCAAGTTTGTTCACCAGGATTGTCTCCTT 300 |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 364 CTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGAAGTATCAAATTTGTTCACCAGGATTGTCTCCTT 423 Query 301 CAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCAAGCATCCTTTTTCATTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 424 CAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCAAGCATCCTTTTTCATTC 483 Query 361 TCCCCAGTGTATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCCAGGAGTTTGTAGTTGGC 420 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 484 TCCCCAGTATATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCCAGGAGTTTGTAGTTGGC 543 Query 421 ATTGCTATGAAAGCTTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGGTTAAGTTTTGTGCTTTCT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 544 ATTGCTATGAAAGCTTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGGTTGAGTTTTGTGCTTTCT 603 Query 481 GTCTGGCTTCTCACTATACCTTTCATTACATTTTGGATATGGCGATTGGCTTTCGTGCGA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 604 GTCTGGCTTCTCACTATACCTTTCATTACATTTTGGATATGGCGTTTGGCTTTCGTGCGA 663 Query 541 AGTTTTGGTGAAGCTCAGAGGTTGTTCTTAAGTCACATCTCCACCACAGTAATTCTCACC 600 | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 664 ACTTTTGGTGAAGCTCAAAGGTTGTTCTTAAGCCACATCTCCACCACAGTAATTCTCACT 723 Query 601 GATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCGGCAAGTATTGTCTTCATCTTCCTTGGAGCTACT 660 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 724 GATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCTGCAAGTATTGTCTTCATCTTCCTTGGAGCTACT 783 Query 661 TCCTTAAGGGACTACTTTAGGCATTTACGAGAGCTTGGGGGACAAGAAGAGAGAGAAGAT 720 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 784 TCATTAAGGGACTACTTTAGGCACTTACGAGAGCTTGGGGGACAAGAAGAGAGAGATGAT 843 Query 721 GATGGGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGCAAGAAGACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAAT 780 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 844 GATGTGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGCAAGAAGACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAAT 903 Query 781 CTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGGATCAGGGTGCTGCTGCTGGTCAGATT 840 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 904 CTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGGATCAGGGTGCTGCGGTTGGTCAGATT 963 Query 841 GTTAGAAGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGGTTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAG 900 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 964 GCTAGAAGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGGTTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAG 1023 Query 901 GCTCAGGTTGAACAGATGTTTGATGGGTTGGATGACGCTGATGGTGCAGAAGACGTTCCA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1024 GCTCAGGTTGAACAGATGTTTGATGGGTTGGATGACGCTGATGGTGCAGAAGACGTTCCA 1083 Query 961 TTTGATGAGCTGGTTGGAATGCAAGGTCCAGTGTTTCATTTGGTTGAGAATGCCTTTACT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1084 TTTGATGAGCTGGTTGGAATGCAAGGTCCAGTGTTTCATTTGGTTGAGAATGCCTTTACT 1143 Query 1021 GTTCTAGCAAGCAATATGATATTCCTTGGTGTTGTGATCTTCGTGCCCTTTACCTTAGGA 1080 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1144 GTTCTAGCAAGCAATATGATATTCCTTGGTGTTGTTATCTTCGTGCCCTTTACCTTGGGA 1203 Query 1081 CG-AGTTATATTGTATCACGTGTCATGGCTTTTTGCTGCTGCTAGAGGCCCTGCTGTGAC 1139 || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1204 CGGA-TTATATTGTATCACGTGTCATGGCTTTTTGCTGCTGCTAGAGGCCCTGCTGTGGC 1262 Query 1140 TGCATCATTGCATCTTATGGATACCGGACTCTCATTGGAAAATATTACTCTTCAGAGTGC 1199 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1263 TGCATCATTGCATCTTACAGATACCGGACTCTCATTGGAAAATATTACTCTGAAGAGTGC 1322 Query 1200 GCTGACTGCTGTCTCAAATTTGACTAACGAAGGCCAAGAAAATGGGCTACTTGGCCAGCT 1259 ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1323 GCTGACTGCTGTCTCGAATTTGACTAGCGAGGGCCAAGGAAATGGGCTGCTTGGTCAGCT 1382 Query 1260 CACTGAGATGATGAAAGTCAACGGAAGTGAATTGAATGGAGCAAACAATACGCTATCGGT 1319 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1383 CACTGAAATGATGAAAGTCAACGGAAGTGAATTGAATGGAGCAAACAATACGCTATCAGT 1442 Query 1320 TGCTACTGATCTCCTGAAAGGTTCTGCTGTTGGGGCCTCAAAGCTATCTGATATTACAAC 1379 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1443 TGCTACTGATCTCCTGAAAGGTTCTACTGTTGGGGCCTCAAAGCTTTCTGATATTACAAC 1502 Query 1380 TCTGGCTGTTGGGTACATGTTTATAGTATTTCTGGTGTTCCTTTACCTGGGGATCATTGC 1439 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1503 TCTGGCTGTTGGGTACATGTTTATCGTATTTCTGGTGTTCCTTTACCTTGGGATCATTGC 1562 Query 1440 ACTGATTCGATATGCCAAGGGTGAGCCACTGACCGTTGGAAGATTTTATGGTATTGCATC 1499 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1563 ACTGATTCGATATGCCAAGGGTGAGCCACTGACTGTTGGAAGATTTTATGGTATTGCATC 1622 Query 1500 TATAGTAGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGAT 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1623 TATAGTAGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGAT 1682 Query 1560 GACAATGATCAAAGTTGCCTTTCTTTTGGTCATCGAGCTTGGGGTCTTTCCTTTGATGTG 1619 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1683 GACCATGATCAAAGTTGCCTTTCTTTTGGTCATCGAGCTTGGGGTCTTTCCTCTGATGTG 1742 Query 1620 TGGGTGGTGGCTAGATGTTTGCACCGTTAGGATGTTTGGTAAAACAATGTCCCACAGAGT 1679 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 1743 TGGTTGGTGGCTAGATGTTTGCACTGTTAGGATGTTCGGTAAAACAATGTCCCACAGGGT 1802 Query 1680 ACAGTTTTTATCAATTTCTCCACTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGTATCAT 1739 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1803 ACAGTTTTTATCAATTTCTCCTCTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGAATCAT 1862 Query 1740 GTACATGTTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTACGAGGGGTTCTTCGCCCTGGAGT 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1863 GTACATGTTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTTCGAGGGGTTCTTCGTCCTGGAGT 1922 Query 1800 TCTGTATTTCCTTCGTGATCCAGCAGATCCTAATTACAATCCATTCCGAGATTTGATTGA 1859 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1923 TCTGTATTTCCTTCGTGATCCAGCAGATCCTAATTACAATCCATTCCGAGATTTGATTGA 1982 Query 1860 TGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGTAGAGTACTGTTATCTGTTGCAGTGTATGGAAGTTT 1919 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1983 TGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGGAGGGTACTGTTATCAGTTGCAGTGTATGGAAGTTT 2042 Query 1920 GATTGTCATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCAATCTT 1979 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2043 GATTGTGATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCAATCTT 2102 Query 1980 TCCACTCGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCGGCCGACATGCTTCTGTT 2039 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2103 TCCACTTGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCCGCCGACATGCTTCTGTT 2162 Query 2040 TCAAATATGCATTCCATTTATCATCGAGCATTTCAGACTTCGGACCACAATTAAGTCCCT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2163 TCAAATATGCATTCCATTTATCATCGAGCATTTCAGACTTCGGACCACAATTAAGTCCCT 2222 Query 2100 TCTACGCTGCTGGTTCACTGGTGTTGGCTGGGCACTTGGTTTGACAGACTTCCTCTTGCC 2159 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2223 TCTACGCTGCTGGTTCACTGGGGTTGGTTGGGCGCTTGGTTTAACAGACTTCCTCTTGCC 2282 Query 2160 AAGACCAGAGGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGCAGAACAG 2219 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2283 AAGACCAGAAGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGCAGAACAG 2342 Query 2220 AGCACAAGTATTGCAGGTGGGAGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTCCCAGTAGCTGA 2279 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2343 AGCACAAGTGTTGCAGGTCGGAGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTTCCAGTAGCTGA 2402 Query 2280 TGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAATATGAAGA 2339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2403 TGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAATATGAAGA 2462 Query 2340 TGATGAAGAACAATCTGATTCAGACAGGTACAACTTTGTCGTCAGGATAATCCTCCTTCT 2399 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| Sbjct 2463 TGATGACGAACAATCTGATTCTGACAGGTACAACTTTGTGGTCCGGATAATTCTCCTTCT 2522 Query 2400 ACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTACCAGTTTC 2459 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2523 ACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTGCCAGTTTC 2582 Query 2460 GCTTGGACGTGCTCTATTCAGTGCCAT-CCCAATTCTTCCAATAACTCATGGCATCAAAT 2518 ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2583 GCTGGGACGTGCTCTATTCAGTGCCATTCCCA-TTCTTCCAATAACTCATGGCATCAAGT 2641 Query 2519 GCAATGACCTGTATGCTTTCGTCATTGGTACATATGCCTTTTGGACTACCATATCTGGGG 2578 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2642 GCAATGATCTGTATGCTTTCGTCATTGGCACATATGCCTTTTGGACTACCATATCTGGGG 2701 Query 2579 CCAGGTATGCTATTGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAACCAAATAT 2638 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2702 CCAGGTATGCTATCGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAACCAAATAT 2761 Query 2639 GGAAATGGTGTGGGATTGTTTTCAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGGTTTTTATCA 2698 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2762 GGAAATGGTGTGGGATTGTATTCAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGGTTTTTATCA 2821 Query 2699 TTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTTATTGTCCCAATGAGAGTCCCAG 2758 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2822 TTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTGATTGTCCCAATGAGAGTCCCAG 2881 Query 2759 TTGATGAAAGCCCTGTCTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCATCTTTTTGA 2818 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2882 TTGATGAAAGCCCTGTGTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCATCTTTTTGA 2941 Query 2819 AGATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATGATAGCTGGA 2878 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2942 AAATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATGATAGCTGGA 3001 Query 2879 GAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGTTATGGGTAC 2938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3002 GAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGTTATGGGTAC 3061 Query 2939 TTAGAGAGATTGTGTTTCCGATCGTGATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATG 2998 |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3062 TTAGAGAGATTGTGTTCCCGATCGTCATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATG 3121 Query 2999 TGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCT 3058 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 3122 TGTTGGCAAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTTGTTGTGAACTCAGCGGTCT 3181 Query 3059 ACAGATACGCATGGATAGGTTGTCTCTCAGTTAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGAT 3118 |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3182 ACAGATTCGCGTGGATAGGTTGTCTTTCAGTGAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGAT 3241 Query 3119 GCCATGTCTGGTTCAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTC 3178 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3242 GCCATGTCTGGTTTAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTC 3301 Query 3179 GGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTGGCAAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTG 3238 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3302 GGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTAGCTAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTG 3361 Query 3239 AGGATGCAGGAGATGGTGTCCTGATAGGACGTGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAGGC 3298 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3362 AGGATGCAGGAGATGGTGTCTTGATAGGACGAGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAGGC 3421 Query 3299 TCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGCTTAG 3327 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3422 TCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGCTTAG 3450 > AT4G34103.1 | Symbols: | pseudogene of protein binding / zinc ion binding protein | chr4:16335338-16335669 FORWARD LENGTH=332 Length=332 Score = 409 bits (221), Expect = 1e-112 Identities = 322/364 (88%), Gaps = 33/364 (9%) Strand=Plus/Plus Query 2965 ATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATGTGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATG 3024 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGAAACTCCTAACGGCTTTATGTGTGCCTTATGTGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATG 60 Query 3025 CTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCTACAGATACGCATGGATAGGTTGTCTC 3084 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCTACAGATTCGCATGGATAGGTTGTCTC 120 Query 3085 TCAGTTAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGATGCCATGTCTGGTTCAGAAACCTTCAC 3144 ||||| ||||||||||||||||| | | | | |||||||||||| Sbjct 121 TCAGTGAGCCTCTTCTGCTTCTG-G--------T----T-T-------AGAAACCTTCAC 159 Query 3145 AACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTCGGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCT 3204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 160 AACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTCGGAGACTCCATAACTTTGGGGAAGCT 219 Query 3205 GCTTTGGCAAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTGAGGATGCAGGAGATGGTGTCCTGATA 3264 ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| Sbjct 220 GCTTTGGCAAA--A---CCAAA------GTAGTGAGGATGCGGGAGATGGTATCTTGATA 268 Query 3265 GGACGTGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTA-GGCTCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGC 3323 |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 269 GGACTTTAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAAGGCTCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGC 328 Query 3324 TTAG 3327 |||| Sbjct 329 TTAG 332 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 165550911900 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5