BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg328336
Length=3327
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G34100.1 | Symbols: | RING/U-box superfamily protein | chr4... 5529 0.0
AT4G34103.1 | Symbols: | pseudogene of protein binding / zinc ... 409 1e-112
> AT4G34100.1 | Symbols: | RING/U-box superfamily protein | chr4:16330467-16335074
FORWARD LENGTH=3660
Length=3660
Score = 5529 bits (2994), Expect = 0.0
Identities = 3218/3329 (97%), Gaps = 4/3329 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGATTTCCTCGGCCGAATCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCCGCTTCTGAGGTCGTC 60
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 124 ATGGAGATTTCCCCGGCCGATTCGTTGTCCATCTCTGGCGCGGCTGCTTCTGAGGTCGTC 183
Query 61 TCTGAGCCTTCCGTATCTTCTTCTTCTTCCTCTTCGTCGCCGAATCAGGCCTCCCCCAAT 120
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 184 TCCGAGCCTTCCGTATCTTCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGCCGAATCAGGCATCACCCAAT 243
Query 121 CCTTTGTCAACCATGGATCCCGCAGTTGCGACGGCGACAGGGTCGAGGTACGTTGATGAT 180
||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 244 CCTTTCTCAAACATGGATCCTGCAGTTTCGACGGCGACAGGATCGAGGTACGTTGATGAT 303
Query 181 GACGAAGATGAGGAGGACGTGTGCAGGATCTGCAGAAATCCTGGCGATGCGGACAATCCG 240
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 304 GACGAAGATGAAGAGGACGTTTGCAGGATCTGCAGAAATCCTGGTGATGCAGACAATCCG 363
Query 241 CTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGGAGCATCAAGTTTGTTCACCAGGATTGTCTCCTT 300
|||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 CTTCGGTATCCGTGTGCCTGTAGCGGAAGTATCAAATTTGTTCACCAGGATTGTCTCCTT 423
Query 301 CAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCAAGCATCCTTTTTCATTC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 CAGTGGCTTAATCACAGCAACGCTCGTCAATGCGAGGTTTGCAAGCATCCTTTTTCATTC 483
Query 361 TCCCCAGTGTATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCCAGGAGTTTGTAGTTGGC 420
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TCCCCAGTATATGCTGACAATGCTCCGTCAAGGCTCCCTTTCCAGGAGTTTGTAGTTGGC 543
Query 421 ATTGCTATGAAAGCTTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGGTTAAGTTTTGTGCTTTCT 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 544 ATTGCTATGAAAGCTTGCCATGTTTTACAGTTCTTTCTGCGGTTGAGTTTTGTGCTTTCT 603
Query 481 GTCTGGCTTCTCACTATACCTTTCATTACATTTTGGATATGGCGATTGGCTTTCGTGCGA 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 604 GTCTGGCTTCTCACTATACCTTTCATTACATTTTGGATATGGCGTTTGGCTTTCGTGCGA 663
Query 541 AGTTTTGGTGAAGCTCAGAGGTTGTTCTTAAGTCACATCTCCACCACAGTAATTCTCACC 600
| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 ACTTTTGGTGAAGCTCAAAGGTTGTTCTTAAGCCACATCTCCACCACAGTAATTCTCACT 723
Query 601 GATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCGGCAAGTATTGTCTTCATCTTCCTTGGAGCTACT 660
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 GATTGCTTGCATGGGTTCTTACTATCTGCAAGTATTGTCTTCATCTTCCTTGGAGCTACT 783
Query 661 TCCTTAAGGGACTACTTTAGGCATTTACGAGAGCTTGGGGGACAAGAAGAGAGAGAAGAT 720
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 784 TCATTAAGGGACTACTTTAGGCACTTACGAGAGCTTGGGGGACAAGAAGAGAGAGATGAT 843
Query 721 GATGGGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGCAAGAAGACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAAT 780
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 GATGTGGACAGAAATGGTGCTCGTGCTGCAAGAAGACCTGCTGGACAGGCTAATAGGAAT 903
Query 781 CTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGGATCAGGGTGCTGCTGCTGGTCAGATT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 904 CTTGCTGGAGAGGGGAATGGTGAAGATGCTGGGGATCAGGGTGCTGCGGTTGGTCAGATT 963
Query 841 GTTAGAAGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGGTTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAG 900
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 GCTAGAAGGAATCCTGAAAATGTTCTGGCAAGGTTGGACATACAAGCAGCTCGTCTTGAG 1023
Query 901 GCTCAGGTTGAACAGATGTTTGATGGGTTGGATGACGCTGATGGTGCAGAAGACGTTCCA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 GCTCAGGTTGAACAGATGTTTGATGGGTTGGATGACGCTGATGGTGCAGAAGACGTTCCA 1083
Query 961 TTTGATGAGCTGGTTGGAATGCAAGGTCCAGTGTTTCATTTGGTTGAGAATGCCTTTACT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 TTTGATGAGCTGGTTGGAATGCAAGGTCCAGTGTTTCATTTGGTTGAGAATGCCTTTACT 1143
Query 1021 GTTCTAGCAAGCAATATGATATTCCTTGGTGTTGTGATCTTCGTGCCCTTTACCTTAGGA 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1144 GTTCTAGCAAGCAATATGATATTCCTTGGTGTTGTTATCTTCGTGCCCTTTACCTTGGGA 1203
Query 1081 CG-AGTTATATTGTATCACGTGTCATGGCTTTTTGCTGCTGCTAGAGGCCCTGCTGTGAC 1139
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1204 CGGA-TTATATTGTATCACGTGTCATGGCTTTTTGCTGCTGCTAGAGGCCCTGCTGTGGC 1262
Query 1140 TGCATCATTGCATCTTATGGATACCGGACTCTCATTGGAAAATATTACTCTTCAGAGTGC 1199
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1263 TGCATCATTGCATCTTACAGATACCGGACTCTCATTGGAAAATATTACTCTGAAGAGTGC 1322
Query 1200 GCTGACTGCTGTCTCAAATTTGACTAACGAAGGCCAAGAAAATGGGCTACTTGGCCAGCT 1259
||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1323 GCTGACTGCTGTCTCGAATTTGACTAGCGAGGGCCAAGGAAATGGGCTGCTTGGTCAGCT 1382
Query 1260 CACTGAGATGATGAAAGTCAACGGAAGTGAATTGAATGGAGCAAACAATACGCTATCGGT 1319
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1383 CACTGAAATGATGAAAGTCAACGGAAGTGAATTGAATGGAGCAAACAATACGCTATCAGT 1442
Query 1320 TGCTACTGATCTCCTGAAAGGTTCTGCTGTTGGGGCCTCAAAGCTATCTGATATTACAAC 1379
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1443 TGCTACTGATCTCCTGAAAGGTTCTACTGTTGGGGCCTCAAAGCTTTCTGATATTACAAC 1502
Query 1380 TCTGGCTGTTGGGTACATGTTTATAGTATTTCTGGTGTTCCTTTACCTGGGGATCATTGC 1439
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1503 TCTGGCTGTTGGGTACATGTTTATCGTATTTCTGGTGTTCCTTTACCTTGGGATCATTGC 1562
Query 1440 ACTGATTCGATATGCCAAGGGTGAGCCACTGACCGTTGGAAGATTTTATGGTATTGCATC 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 ACTGATTCGATATGCCAAGGGTGAGCCACTGACTGTTGGAAGATTTTATGGTATTGCATC 1622
Query 1500 TATAGTAGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGAT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 TATAGTAGAAGCTGTACCATCCCTCCTTAGACAGTTCTTGGCAGCAATGAGGCATCTGAT 1682
Query 1560 GACAATGATCAAAGTTGCCTTTCTTTTGGTCATCGAGCTTGGGGTCTTTCCTTTGATGTG 1619
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1683 GACCATGATCAAAGTTGCCTTTCTTTTGGTCATCGAGCTTGGGGTCTTTCCTCTGATGTG 1742
Query 1620 TGGGTGGTGGCTAGATGTTTGCACCGTTAGGATGTTTGGTAAAACAATGTCCCACAGAGT 1679
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1743 TGGTTGGTGGCTAGATGTTTGCACTGTTAGGATGTTCGGTAAAACAATGTCCCACAGGGT 1802
Query 1680 ACAGTTTTTATCAATTTCTCCACTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGTATCAT 1739
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1803 ACAGTTTTTATCAATTTCTCCTCTGGCAAGCTCACTTGTTCATTGGGTTGTTGGAATCAT 1862
Query 1740 GTACATGTTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTACGAGGGGTTCTTCGCCCTGGAGT 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1863 GTACATGTTGCAAATAAGCATCTTCGTCAGCCTTCTTCGAGGGGTTCTTCGTCCTGGAGT 1922
Query 1800 TCTGTATTTCCTTCGTGATCCAGCAGATCCTAATTACAATCCATTCCGAGATTTGATTGA 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 TCTGTATTTCCTTCGTGATCCAGCAGATCCTAATTACAATCCATTCCGAGATTTGATTGA 1982
Query 1860 TGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGTAGAGTACTGTTATCTGTTGCAGTGTATGGAAGTTT 1919
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 TGATCCAGTGCACAAGCATGCTCGGAGGGTACTGTTATCAGTTGCAGTGTATGGAAGTTT 2042
Query 1920 GATTGTCATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCAATCTT 1979
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043 GATTGTGATGCTGGTATTTTTACCAGTCAAACTTGCGATCCGGATGGCTCCTTCAATCTT 2102
Query 1980 TCCACTCGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCGGCCGACATGCTTCTGTT 2039
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2103 TCCACTTGACATATCTGTATCCGACCCATTCACTGAGATTCCCGCCGACATGCTTCTGTT 2162
Query 2040 TCAAATATGCATTCCATTTATCATCGAGCATTTCAGACTTCGGACCACAATTAAGTCCCT 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 TCAAATATGCATTCCATTTATCATCGAGCATTTCAGACTTCGGACCACAATTAAGTCCCT 2222
Query 2100 TCTACGCTGCTGGTTCACTGGTGTTGGCTGGGCACTTGGTTTGACAGACTTCCTCTTGCC 2159
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2223 TCTACGCTGCTGGTTCACTGGGGTTGGTTGGGCGCTTGGTTTAACAGACTTCCTCTTGCC 2282
Query 2160 AAGACCAGAGGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGCAGAACAG 2219
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 AAGACCAGAAGACAACATTGGTCAGGACAATGGAAATGGTGAACCAGGAAGGCAGAACAG 2342
Query 2220 AGCACAAGTATTGCAGGTGGGAGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTCCCAGTAGCTGA 2279
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2343 AGCACAAGTGTTGCAGGTCGGAGGACCTGACAGGGCCATGGCTGCGCTTCCAGTAGCTGA 2402
Query 2280 TGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAATATGAAGA 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2403 TGACCCTAACAGAAGTCGCCTCCGTGCTGGGAATGTCAACACGGGTGAGGAATATGAAGA 2462
Query 2340 TGATGAAGAACAATCTGATTCAGACAGGTACAACTTTGTCGTCAGGATAATCCTCCTTCT 2399
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2463 TGATGACGAACAATCTGATTCTGACAGGTACAACTTTGTGGTCCGGATAATTCTCCTTCT 2522
Query 2400 ACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTACCAGTTTC 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2523 ACTTGTTGCATGGGTGACTCTTCTTCTCTTCAATTCAGCATTGATAGTTGTGCCAGTTTC 2582
Query 2460 GCTTGGACGTGCTCTATTCAGTGCCAT-CCCAATTCTTCCAATAACTCATGGCATCAAAT 2518
||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2583 GCTGGGACGTGCTCTATTCAGTGCCATTCCCA-TTCTTCCAATAACTCATGGCATCAAGT 2641
Query 2519 GCAATGACCTGTATGCTTTCGTCATTGGTACATATGCCTTTTGGACTACCATATCTGGGG 2578
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 GCAATGATCTGTATGCTTTCGTCATTGGCACATATGCCTTTTGGACTACCATATCTGGGG 2701
Query 2579 CCAGGTATGCTATTGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAACCAAATAT 2638
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2702 CCAGGTATGCTATCGAGCATGTCAAGTCAAAGAGGACTTCAGTCTTGCTTAACCAAATAT 2761
Query 2639 GGAAATGGTGTGGGATTGTTTTCAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGGTTTTTATCA 2698
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 GGAAATGGTGTGGGATTGTATTCAAGAGCTCGGTGCTGTTAGCCATATGGGTTTTTATCA 2821
Query 2699 TTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTTATTGTCCCAATGAGAGTCCCAG 2758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2822 TTCCGGTGCTAATTGGACTTCTGTTTGAGCTTTTGGTGATTGTCCCAATGAGAGTCCCAG 2881
Query 2759 TTGATGAAAGCCCTGTCTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCATCTTTTTGA 2818
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2882 TTGATGAAAGCCCTGTGTTCCTCCTGTATCAAGACTGGGCTCTTGGGCTCATCTTTTTGA 2941
Query 2819 AGATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATGATAGCTGGA 2878
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2942 AAATCTGGACTAGACTGGTAATGCTGGATCATATGCTTCCAATAGTGGATGATAGCTGGA 3001
Query 2879 GAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGTTATGGGTAC 2938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3002 GAGCAAAGTTTGAGCGGGTAAGAGAAGATGGCTTCTCGAGGCTTCAAGGGTTATGGGTAC 3061
Query 2939 TTAGAGAGATTGTGTTTCCGATCGTGATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATG 2998
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3062 TTAGAGAGATTGTGTTCCCGATCGTCATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATG 3121
Query 2999 TGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCT 3058
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3122 TGTTGGCAAGAGGAGTGTTCCCAATGCTCGGATATCCGCTTGTTGTGAACTCAGCGGTCT 3181
Query 3059 ACAGATACGCATGGATAGGTTGTCTCTCAGTTAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGAT 3118
|||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 ACAGATTCGCGTGGATAGGTTGTCTTTCAGTGAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGAT 3241
Query 3119 GCCATGTCTGGTTCAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTC 3178
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3242 GCCATGTCTGGTTTAGAAACCTTCACAACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTC 3301
Query 3179 GGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTGGCAAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTG 3238
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302 GGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCTGCTTTAGCTAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTG 3361
Query 3239 AGGATGCAGGAGATGGTGTCCTGATAGGACGTGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAGGC 3298
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3362 AGGATGCAGGAGATGGTGTCTTGATAGGACGAGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAGGC 3421
Query 3299 TCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGCTTAG 3327
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3422 TCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGCTTAG 3450
> AT4G34103.1 | Symbols: | pseudogene of protein binding / zinc
ion binding protein | chr4:16335338-16335669 FORWARD LENGTH=332
Length=332
Score = 409 bits (221), Expect = 1e-112
Identities = 322/364 (88%), Gaps = 33/364 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 2965 ATGAAACTCCTAACGGCTTTATGCGTGCCTTATGTGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATG 3024
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACTCCTAACGGCTTTATGTGTGCCTTATGTGTTGGCGAGAGGAGTGTTCCCAATG 60
Query 3025 CTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCTACAGATACGCATGGATAGGTTGTCTC 3084
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTCGGATATCCGCTAGTAGTGAACTCAGCGGTCTACAGATTCGCATGGATAGGTTGTCTC 120
Query 3085 TCAGTTAGCCTCTTCTGCTTCTGTGCAAAAAGATGCCATGTCTGGTTCAGAAACCTTCAC 3144
||||| ||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||
Sbjct 121 TCAGTGAGCCTCTTCTGCTTCTG-G--------T----T-T-------AGAAACCTTCAC 159
Query 3145 AACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTCGGAGACTGCATAACTTTGGGGAAGCT 3204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 160 AACTCTATCCGTGATGACCGTTATCTCATTGGTCGGAGACTCCATAACTTTGGGGAAGCT 219
Query 3205 GCTTTGGCAAATCAAAACCAAAACCAAAGTAGTGAGGATGCAGGAGATGGTGTCCTGATA 3264
||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||
Sbjct 220 GCTTTGGCAAA--A---CCAAA------GTAGTGAGGATGCGGGAGATGGTATCTTGATA 268
Query 3265 GGACGTGAGGGAGATGTTGATAATGGACTTA-GGCTCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGC 3323
|||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 GGACTTTAGGGAGATGTTGATAATGGACTTAAGGCTCAGACGTGCAATCCAACAAGAAGC 328
Query 3324 TTAG 3327
||||
Sbjct 329 TTAG 332
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 165550911900
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5