BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg328440
Length=4275
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G32920.1 | Symbols: | glycine-rich protein | chr4:15887575-... 7005 0.0
> AT4G32920.1 | Symbols: | glycine-rich protein | chr4:15887575-15896006
REVERSE LENGTH=4877
Length=4877
Score = 7005 bits (3793), Expect = 0.0
Identities = 4132/4295 (96%), Gaps = 26/4295 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GATTTCGATTTCAATGGTGAGATTCTGTCTCTGTTTCGTC-TTCTTCATCTTCATATCTG 61
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||
Sbjct 9 GATTTCGATTCCAATGGTGAGATTCTGTCTCTGTTTCG-CGTTCGTCATCCTCGTATCTG 67
Query 62 CAAATCCGAAATTAATCAATTCGTGGGATGAGACTGCGATTAGATTCGAACCGCCGTCAC 121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 68 CAAATCCGAAATTAATCAATTCGTGGGATGAGACTGCGATTAGATTCGAACCACTGTCAC 127
Query 122 CTTCACCGGCGCCGGAG------CC------------TTCGTCGGTTTCATGTGTGGATG 163
|||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 128 CTTCTCCGGCGCCGGAGCCTTCCCCGGATGATGATGATTCGTCGGTTTCATGTGTAGATG 187
Query 164 ACCTAGGAGGTGTTGGCTCTTTAGATTCCACGTGTAAGCTCGTCGCTGATTTGAATCTCA 223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 ACCTAGGAGGTGTTGGCTCTTTAGATTCCACGTGTAAGCTCGTCGCTGATTTGAATCTCA 247
Query 224 CACGTGACCTAAACATCACCGGTAAAGGTAATCTCCACGTTTTGCCTGGTGTTCGATTGG 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 248 CACGTGACCTAAACATCACCGGTAAAGGTAATCTCCACGTTTTGCCTGGTGTTAGATTGG 307
Query 284 TTTGCCAGTTTCCGGGATGTTCGATTAGTGTCAATATCTCCGGGAATTTTTCATTGGCTG 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 308 TTTGCCAGTTTCCGGGATGTTCGATTAGTGTCAATATCTCCGGCAATTTCTCATTGGCTG 367
Query 344 AGAATTCTTCGGTTCTCGCCGGAACTTTCCGTCTCGCGGCGGATAACGCTGAATTTGGGG 403
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 368 AGAATTCTTCGGTTATCGCCGGGACTTTCCGTCTCGCGGCGGAAAACGCTGAATTTGGGC 427
Query 404 TAAATTCGGCCGTGGACACCACTGGATTGGCTGGGGAACCGCCGCCGGAGACTAGCGGTA 463
||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 428 TAAGCTCGGCCGTTGATACCACTGGATTGGCTGGAGAACCTCCGCCGGATACTAGCGGTA 487
Query 464 CGCCGGAGGGAGTGGAAGGTGCCGGTGGAGGATACGGTGGAAGAGGTGCGTGTTGTTTGT 523
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 488 CGCCGGAGGGAGTGGAAGGTGCCGGTGGTGGATACGGTGGAAGAGGTGCATGTTGTTTGT 547
Query 524 CGGATACTACCACGAAGATTCCGGAAGATGTGTTCGGTGGTGATGTTTACGGTTGGTCGT 583
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 548 CGGATACTACTACGAAGATTCCGGAAGATGTGTTCGGTGGTGATGTTTATGGTTGGTCGT 607
Query 584 CACTGGAGAAGCCGGAGATTTATGGTAGTAGAGGTGGTTCGACGAGTAATGAGGTTGATT 643
| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 CTTTGGAGAAGCCGGAGATTTATGGCAGTAGAGGTGGTTCGACGAGTAATGAGGTTGATT 667
Query 644 ACGGTGGAGGTGGCGGCGGAACGGTGGCGATAGAGATATTAGGGTATATAAGTTTAAACG 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 668 ACGGTGGAGGTGGCGGCGGAACGGTGGCGATAGAGATATTAGGGTATATTAGTTTAAACG 727
Query 704 GCAGCGTTTTAGCTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTAAAGGTGGTGGTGGGTCCGGCGGCA 763
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 GCAGCGTTTTAGCTGATGGGGCCAGTGGTGGTGTTAAAGGTGGTGGTGGGTCCGGCGGCA 787
Query 764 GCATCTTCGTTATGGCTCATAAAATGGCAGGAAATGGTCGTTTAAGTGCATCTGGAGGTG 823
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 GCATCTTCGTAATGGCTCATAAAATGGCAGGAAATGGTCGTTTAAGTGCATCTGGAGGTG 847
Query 824 ATGGGTATGCTGGTGGAGGTGGTGGACGGGTATCGGTCGATATATACAGCCGCCATTCTG 883
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 848 ATGGGTATGCTGGTGGAGGTGGTGGACGGGTATCCGTCGATATATACAGCCGCCATTCTG 907
Query 884 ACCCAAAAATCTTTTTCCATGGAGGTAGTAGTTTTGGTTGTCCAGAAAATGCTGGGGCTG 943
| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 908 ATCCAAAAATCTTTTTCAATGGAGGTCGTAGTTTTGGTTGTCCAGAAAATGCTGGAGCTG 967
Query 944 CTGGGACTATGTATGATGTTATTTCAGAGAGCTTAACCATCGACAACCACAATAAGACAA 1003
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 968 CTGGGACTCTGTATGATGTTATTTCAGAGAGCTTAACCATTGACAACCACAATAAGACAA 1027
Query 1004 CAGT-TACGGACACTCTTCTCCTGGAGTTCCCTAACCATCGCCTTTTCACTAATTTGTAT 1062
|| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 CA-TATACAGACACTCTTCTCCTGGAGTTCCCTAACCACCGCCTTTTCACTAATTTGTAT 1086
Query 1063 ATCCGAAATATGGCAAAGGTTGCTGTTCCCCTGCGTTGGAGCCGTGTCCAGGTTCAAGGA 1122
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1087 ATCCGGAATATGGCAAAGGTTGCTGTTCCCTTGCGTTGGAGCCGTGTTCAGGTTCAAGGA 1146
Query 1123 TTGATAAGTTTGTCGAATGGTGGAGAGTTGAACTTTGGTCTTCCACGTTATGCTTCCTCA 1182
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 TTGATAAGTTTGTCAAATGGTGGAGAGTTGAACTTTGGTCTTCCACGTTATGCTTCCTCT 1206
Query 1183 GAATTTGAATTATTTGCTGAGGAACTCTTGATGAGTAATTCTGCTATCAAGGTTTACGGG 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1207 GAATTTGAATTATTTGCTGAGGAACTCTTGATGAGTAATTCTGCAATCAAGGTTTACGGG 1266
Query 1243 GCTTTACGTATGACAGTCAAAGTGTTCTTGATGTTGAAGTCAAGAATGTTTATAGATGGA 1302
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 GCTTTACGTATGACAGTCAAGGTGTTCTTGATGTTGAAGTCAAGAATGTTTATAGATGGC 1326
Query 1303 GGTGGTGTGGCAATATTAGGAACTTCAATGCTCGAAATTAGTAATCTGTTGGTGCTCAAG 1362
||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 GGTGGTGTGACAATATTGGGAACTTCAATGCTTGAAATTAGTAATCTGTTGGTGCTCAAG 1386
Query 1363 GAGTCATCTGTGATACAATCCAATGGGAATCTCGGAGTACATGGGCAGGGTCTGTTGAAT 1422
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1387 GAGTCATCTGTGATACAATCCAATGGAAACCTCGGAGTACATGGGCAGGGCCTGTTGAAT 1446
Query 1423 CTAACAGGCACAGGAGATACAATTGAAGCACAGCGTCTGATTTTGTCTCTGTTTTATAGC 1482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1447 CTAACAGGCACAGGAGATACAATTGAAGCACAGCGTCTGATTTTGTCTCTATTTTATAGC 1506
Query 1483 ATCCAGGTTGGAGCCGGAGCGGTTCTGCGTGGTCCTTTGCAGAATGCATCAACTGGTGGC 1542
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 ATCCAGGTTGGAGCCGGAGCGGTTTTGCGTGGTCCTTTGCAGAATGCATCAACTGGTGGC 1566
Query 1543 CTTACTCCAAAGCTTTACTGTCAACGCCAAGATTGCCCTGTTGAACTACTCCACCCGCCG 1602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1567 CTTACTCCAAAGCTTTACTGTCAACGCCAAGATTGCCCTGTTGAACTACTCCACCCACCG 1626
Query 1603 GAGGATTGCAATGTCAATTCATCCCTTCCATTCACTCTTCAGATCTGCCGAGTTGAGGAT 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 GAGGATTGCAATGTCAATTCATCCCTTCCATTCACTCTTCAGATCTGCCGAGTTGAGGAT 1686
Query 1663 ATTACTGTTGAAGGTCTCATCAAAGGATCTGTCATCCAGTTCCATCTGGCAAGAACGGTA 1722
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 ATTACTGTTGAAGGTCTCATTAAAGGATCTGTAATCCAATTCCATCTGGCAAGAACGGTA 1746
Query 1723 GTTGTCCGCTCTTCTGGAACAATATCCGCAGACGGGATGGGCTGCAAAGGTGGAGTTGGG 1782
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747 CTTGTCCGCTCTTCTGGAACAATATCCGCGGACGGGATGGGCTGCAAAGGTGGAGTTGGG 1806
Query 1783 ACTGGTAGATTTCTGAGAAGCGGTATTGGGAGTGGTGGTGGACATGGTGGTAAAGGCGGA 1842
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807 ACAGGTAGGTTTCTGAGAAGCGGTATTGGGAGTGGTGGTGGACATGGTGGTAAAGGCGGA 1866
Query 1843 AGCGGGTGTTACAATCATACTTGCATCGAGGGTGGCGAGTCTTATGGAAATGCAGACCTA 1902
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 AGCGGATGTTACAATCATACTTGCATTGAGGGTGGCGAGTCTTATGGAAATGCAGACCTA 1926
Query 1903 CCATGTGAACTTGGCAGCGGAAGTGGAAATGAAGAGTCAACAGATTCAGTTGCTGGTGGA 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1927 CCATGTGAACTTGGCAGCGGAAGTGGAAATGAAGAGTCAACGGATTCAGTTGCTGGGGGA 1986
Query 1963 GGAATCATTGTGCTTGGTTCACTTGAGCACCCACTTTCAAGCTTGTCACTGGAAGGCTCA 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 GGAATCATTGTGCTTGGTTCACTTGAGCACCCACTTTCAAGCTTGTCACTGGAAGGCTCA 2046
Query 2023 ATAACAACTGATGGTGAAAGTCCCAGGAAGACGCTGAAAGGCCTAAGTAATTCAAGTCTA 2082
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2047 ATAACAACTGATGGCGAAAGTCCCAGGAAGACGCTGAAAGGCCTAAGTAATTCAAGTCTA 2106
Query 2083 GGACCTGGTGGTGGTTCAGGTGGAACCGTACTTTTATTCTTGCGCACACTTGAGATAGGG 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2107 GGACCTGGTGGTGGTTCAGGTGGAACCGTACTTTTATTCTTGCGCACACTTGAGATAGGG 2166
Query 2143 AGGTCTGCGATCCTCTCTAGTATTGGAGGAAATGGTAGCCTAAAGGGAGGTGGTGGAGGG 2202
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2167 AGGTCTGCGATTCTCTCTAGTATTGGAGGAAATGGTAGCCTGAAGGGAGGTGGAGGAGGA 2226
Query 2203 AGTGGTGGAAGGATTCATTTTCATTGGTCAGACATTCCCACTGGTGATGTCTATCATCCT 2262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2227 AGTGGTGGAAGGATTCATTTTCATTGGTCAGACATTCCCACTGGTGATGTCTATCATCCC 2286
Query 2263 GTTGCCATAGTAAAGGGAAGAGTTTATGTAAGAGGAGGGATGGGTATTATTGAAGATAAC 2322
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2287 GTTGCCATAGTTAAGGGAAGAGTTTATGTAAGAGGAGGGATGGGTATCATTGAAGATAAT 2346
Query 2323 GTTGGAGGGAATGGAACTTTGACTGGCAAAGCTTGTCCAGAAGGGCTCTATGGTTTATTT 2382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347 ATTGGAGGGAATGGAACTTTGACTGGCAAAGCTTGTCCAGAAGGGCTCTATGGTTTATTT 2406
Query 2383 TGCGAGGAATGTCCATCTGGCACTTATAAGAACGTCACTGGATCAGATAAAGCTCTTTGT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2407 TGCGAGGAATGTCCATCTGGCACTTATAAGAACGTTACTGGATCTGATAAAGCTCTTTGT 2466
Query 2443 CATCTTTGTCCGGCTAATGATCTTCCTCATCGTGCTGTATATGTCACTGTTCGAGGCGGT 2502
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2467 CATCTTTGTCCGGCTAATGATATTCCCCATCGTGCTGTATATGTCACTGTTCGAGGTGGT 2526
Query 2503 GTTGCAGAAACGCCTTGTCCATATAAATGCATTTCGGATAGATACCACATGCCACACTGT 2562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2527 GTTGCAGAAACGCCTTGTCCATATAAATGCATTTCGGATAGATACCACATGCCACACTGT 2586
Query 2563 TATACTACACTTGAAGAGTTAATATACACATTTGGTGGACCCTGGTTGTTTGGTGTTCTT 2622
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2587 TATACTACGCTTGAAGAGTTAATATACACATTTGGTGGACCCTGGCTGTTTGGTGTTCTT 2646
Query 2623 TTAGTAGTTGTGCTCCTCCTATTAGCACTTGTTTTCAGCGTCGCCAGAATGAAATTTGTT 2682
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2647 TTAGTAGTTGTGCTCCTCCTACTAGCACTTGTTTTCAGCGTCGCCAGAATGAAATTTGTG 2706
Query 2683 AGCGGTGACGAATTACATGGGTCTGCCCCGACCCAGCATGGCTCTCAGATTGATCACTCA 2742
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2707 AGCGGTGACGAATTGCATGGGTCTGCCCCGACCCAGCATGGCTCTCAGATTGATCACTCA 2766
Query 2743 TTTCCTTTCCTCGAGTCGTTGAATGAGGTGATGGAGACGAACAGAGTGGAGGAGTCACAG 2802
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2767 TTTCCATTCCTCGAGTCGTTGAATGAGGTGATGGAGACGAGCAGAGTGGAGGAGTCACAG 2826
Query 2803 GGCCACATGCATAGGATCTATTTCTTAGGTCCTAATACTTTCAGTGAACCTTGGCATCTT 2862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2827 GGCCACATGCATAGGATCTATTTCTTAGGTCCTAATACTTTCAGTGAACCTTGGCATCTT 2886
Query 2863 TCTCATACACCCCCAGAGGAAATAAAAGAGATTGTGTACGAGGCTGCGTTTAATGGGTTT 2922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCTCATACACCCCCAGAGGAAATAAAAGAGATTGTGTACGAGGCTGCGTTTAATGGGTTT 2946
Query 2923 GTTGATGAGGTCAATGTTATAGCTGCATACCAGTGGTGGGAGGGTGCGATTTACATTGTG 2982
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2947 GTTGATGAAGTCAATGTTATAGCTGCATATCAGTGGTGGGAGGGTGCGATTTACATTATG 3006
Query 2983 CTTTCAGTTCTAGTCTATCCTCTTGCATGGTCATGGCAGCAATCCCGCCGGAGGCTGAAA 3042
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3007 CTTTCAGTTCTAGTCTATCCTCTTGCATGGTCATGGCAGCAATCACGCCGGAGGCTGAAA 3066
Query 3043 TTTCAGAAACTCCGTGACTTTGTTAGATCAGAATATGACCATTCTTGTCTACGCTCGTGT 3102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3067 TTTCAGAAACTCCGTGACTTTGTTAGATCAGAATATGACCATTCTTGTCTACGCTCGTGT 3126
Query 3103 CGTTCAAGGGCATTATATGAAGGTCTAAAGGTAGCTGCTACTCCTGATTTAATGTTAGCT 3162
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3127 CGTTCAAGGGCATTATATGAAGGGCTAAAGGTAGCTGCTACTCCTGATTTGATGTTAGCT 3186
Query 3163 CATCTAGATTTCTTCCTTGGTGGCGATGAAAAGAGAAGTGACCTTCCTCCTCCGGTTCAT 3222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||
Sbjct 3187 CATCTAGATTTCTTCCTTGGTGGCGATGAAAAGAGAAGCGATCTTCCTCCTCAGGTTCAT 3246
Query 3223 CAAAGACTTCCAATGCCTTTAATATTTGGAGGCGACGGAAGTTACATGGCCTATTACTCA 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3247 CAAAGACTTCCAATGCCTTTAATATTTGGAGGCGACGGAAGTTACATGGCCTATTACTCA 3306
Query 3283 CTCCAAAGTGACGATATTCTGACCAGTCTTCTGAGCCAGTTGGTCCCACCAACCACTTGG 3342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3307 CTCCAAAGTGACGATATTCTGACCAGTCTTCTGAGCCAGTTGGTCCCACCAACCACTTGG 3366
Query 3343 TACCGCTTTGTGGCTGGTCTGAACGCTCAGCTGCGTCTGGTTCAGCAAGGGAAACTGAGG 3402
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3367 TACCGCTTTGTCGCTGGTCTGAACGCTCAGCTACGTCTGGTTCAGCAAGGGAAACTGAGG 3426
Query 3403 TCCACGTTTCGCTCTGTTATGAGATGGATTGAAACTCATGGAAACCCAGCTTTGAAAAGA 3462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3427 TCCACGTTTCGCTCTGTTATGAGATGGATTGAAACTCATGGAAACCCTGCTTTGAAAAGA 3486
Query 3463 CATGGTGTACGTGTCGACCTAGCTAGATTTCAGGCATTGTCTTCGTCGTCTTGCCAGTAT 3522
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3487 CATGGTGTACGTGTTGACCTAGCTAGGTTTCAGGCATTGTCTTCGTCGTCTTGCCAGTAT 3546
Query 3523 GGAATCCTTGTTCACACCATTGTAGATGAAGAT-GCGTCAACAAGAACTGATGATGAAAC 3581
|||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3547 GGAATCCTTGTTCACACCATTGCAGATGAAG-TCGCATCAACAAGAAGTGATGATGAAAC 3605
Query 3582 AGAACAGCAGCACCCATGGGGGACACAAATTGAAAACTC-CTCTGGTGATTTCAGGGAGA 3640
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3606 AGAACAGCAGCATCCATGGGGGACACAAATTGAAAA-TCACTCTGGTGATTTCAGGGAGA 3664
Query 3641 ATTTTCAACCTCTAAGAAGCGAAATCAACCACGTAAGGCATCGAGAGTGTGGAGAAATCA 3700
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3665 ATTTTCAACCTCTAAGAAGCGAAATCAACCACGTGAGGCATCAAGAGTGTGGAGAAATCA 3724
Query 3701 TAGACATTGGAAGCTTACAATATCTCAAAGAAGATAAAGATGTTCTTTCCCTCATCTCCT 3760
||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3725 TAGACATTGGAAGCTTACAATTTCTTAAAGAAGAAAAAGATGTCCTTTCCCTCATCTCCT 3784
Query 3761 TCTTGATTCATAATACAAAACCTGTTGGCCACCAGGATCTGGTCGGTTTGGTTATCTCGG 3820
||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3785 TCTTGATTCATAACACAAAACCTGTTGGTCATCAGGATCTGGTCGGTTTGGTTATCTCGG 3844
Query 3821 TGCTACTCCTAGGAGATCTAACTTTAATGTTACTCACGCTGCTCCAACTCTACTCGATAT 3880
||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 3845 TGCTACTCCTAGGAGATTTAACTCTAACGTTACTCACACTACTCCAACTCTACTCGATAT 3904
Query 3881 CTTTGCTGGAAGTTTTTCTCGCTATGTTTATTTTACCTCTCAGCATCATTTTCCCATTTC 3940
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 3905 CATTGCTGGAAGTCTTTCTCGCTATGTTTATTTTACCTCTCAGCATCATTTTTCCATTCC 3964
Query 3941 CTGCCGGGGTCAGCGCTTTGTTTAGCCACGGACCAAGGCGCTCTGCTGGTCGCACACGCG 4000
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3965 CTGCTGGGGTCAGCGCTTTGTTTAGCCACGGACCAAGGCGCTCTGCTAGTCGCACACGCG 4024
Query 4001 TTTATGCATTGTGGAACGTCACATCCTTGGTCAATGTCGTTGTTGCGTTTGTGTGTGGAT 4060
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 4025 TTTATGCATTGTGGAATGTCACATCCTTGGTCAATGTCGTTGTGGCATTTGTGTGTGGAT 4084
Query 4061 ATGTTCACTATCATGGCTCATCATCTGGGAAAAAGATCCCGTATCTCCAGCCATGGAACA 4120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4085 ATGTTCACTATCATGGCTCATCATCTGGGAAAAAGATCCCGTATCTCCAGCCATGGAACA 4144
Query 4121 TAAGCATGGACGAGAACGAATGGTGGATATTCCCAGTCGCTTTGTTTCTATGCAAAGTCT 4180
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4145 TTAGCATGGACGAGAACGAATGGTGGATATTCCCAGTCGCTTTGTTTCTATGCAAAGTCT 4204
Query 4181 TGCAATCCCAACTCGTAAACTGGCACGTTGCAAACCTCGAGATACAAGATTACTCCTTGT 4240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4205 TGCAATCCCAACTCGTAAACTGGCACGTTGCAAACCTCGAGATACAAGATTACTCCTTGT 4264
Query 4241 ACAGTGATGACTCAGAGGTGTTCTGGCAGTCGTGA 4275
|||| ||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct 4265 ACAGCGATGATTCCGAGCTGTTCTGGCAGTCGTGA 4299
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 213109173864
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5