BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg328471
Length=4653
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G32620.2 | Symbols: | Enhancer of polycomb-like transcripti... 7070 0.0
> AT4G32620.2 | Symbols: | Enhancer of polycomb-like transcription
factor protein | chr4:15731508-15737272 FORWARD LENGTH=4928
Length=4928
Score = 7070 bits (3828), Expect = 0.0
Identities = 4400/4670 (94%), Gaps = 64/4670 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAAAATAGACTAGTTAACTCTAATGGAGTGGGAATTTCGAAGAAATCAAGGTCTTTA 60
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 256 ATGGAAAATAGACTAGGTAACTCTAATGGAGTGGGAATTTCGAAGAAATCCAGGTCTTTA 315
Query 61 GATCTTAAGACGCTCTATAAGTCTAGCATTTCCAAGGATTCAGTGAATAAGAGCTTTAAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 GATCTTAAGACGCTCTATAAGTCTAGCATTTCCAAGGATTCAGTGAATAAGAGCTTTAAA 375
Query 121 AGAAAA-ATTAGGTCTGGGGA-TGATGGTGATCAGTTGAAGCAGGACAAGAAGGGCAGGA 178
|||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 376 AGAAAACA-TAGGTCT-GGGATTGATGGTGATCAGTTGAAGCAGGACAAGAAGAGCAGGA 433
Query 179 AAGTTGTTTCTTTAAGTAGCTTTAAGAAACTCGGTAGCGAGAACGAGAAAATTCTGGATA 238
||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 434 AAGTTGTTTCTCTAAGTAGTTTTAAGAAAGTAGGTAGCCAGAACGAGAGTATTCTGGATA 493
Query 239 AGGCATGCAATGGCACCACCGGATTGCACAATTTGGAGGACTCCAAGGAGGTGGGTTTGG 298
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 AGGCATGCAATGGCACCACTATATTGCACAATTTGGAGGACTCCAAGGAGGTGGGTTTGG 553
Query 299 ATGAGAAATTGTGTGACAGTAATGGGCTTCAAGGGATTTCAGTTGGCTTGGCAGGTAGTA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 554 ATGAGAAATTGTGTGACAGTAATGGGCTTCAAGTGATTTCTGTTGGTTTGGCAAGTAGTA 613
Query 359 CGATTTATGTTCCTAGACGCAGGAGAGATTTTGTTGGGAGGAGTAGGTTTGAGAATGGCC 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 CGATTTATGTTCCTAGACGCAGGAGAGATTTTGTTGGGAGGAGTAGGTTTGAGAATGGCC 673
Query 419 TAGTACAGAAGTCTGCAGGGGAATCTGATAGTCAGGAGGAGGCGCTGGTTGATAATATCC 478
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 674 TAGCACAGAAGTCTGCAGGGGAGTCTGATAGTCAGGAGGA---GCTGGTTGTTAATATCC 730
Query 479 CTAAGGTAACTGCTGAAGAATCTAGTGCTCAGGATCAACTCTCTAAAGTTGAAGAGAAGG 538
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 731 CTAAGGTTACTGCTGAAGAATCTAGTGTTCAGGATCAACCCTCTAAAGTTGAAGAGAAGG 790
Query 539 AATCTGACAAAGAAATCAAAGAATCGAATTCAGCAGCTCAGTTGCAGTTGGAAAATGGGC 598
| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 791 ACTCTGACAAAGATATCAAAGAATCTAATTCCGCAGCTCCGTTGCAGTTGGAAAATGGGC 850
Query 599 ATTCTAATCAGTCTCCAGTGAAAGATGATCAGCTGGTTGCTGTTAAACAAAGAAATAGTA 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 851 ATTCTAATCAGTCTCCAGTGAAAGATGATCAGCTGGTTGTTGTTAAACAAAGAAATAGTA 910
Query 659 ATAGCAGAAAAAGGAAGTCCTCAGCATCAAACAAG-CGCTTGGGAAAAGAGGCCAAGTCT 717
| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 911 ACAGCAGAAAAAGGAAGTCCTCAGCATCAAAC-AGACGCGTGGGAAAAGAGGCCAAGTCT 969
Query 718 TCAGGTGATACTTCTGGTAAAATATCCAAGGTATCACGAGAAGATGATGAGGAGAATCTT 777
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TCAGGTGATGCTTCTGGTAGAATATCCAAGGTATCACGGGAAGATGATGAGGAGAATCTT 1029
Query 778 GAAGCTAATGCAGCAAGAATGCTGTCTTCACGGTTTGATCCAAAATGCACCCAGTTTCCT 837
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1030 GAAGCTAATGCTGCAATAATGCTGTCTTCACGGTTTGATCCAAACTGTACCCAGTTTCCT 1089
Query 838 TCAAATTCTGTTACTCCTGGTTCACCATCTGCCAGCAGATTGCATCCATTATCTTCTGTT 897
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |
Sbjct 1090 TCAAATTCTGTTACTCCTGGTTCACCATCTGCGAGTAGATTGCATCCATTGCCTTCTGGT 1149
Query 898 AAGAATTTAG-TGAATCCTCCGTCCGAGTTGCATAGTTCGAAATGCGTCTCAGATGACAC 956
||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1150 AAGAATTCAGTTG-ATCCTCGGTCCGAGTTGCTTAGTTCTAAATGTGTCTCAGATGACAC 1208
Query 957 TGATGATAGAATGTTGCGACCAAGGAGACAGAATGATGATGGGAAGGGTAAAGTTCGGAA 1016
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1209 TGATGATAGAATGTTGCGACCAAGGAGACATAATGATGATGGGAAGGGTAAAGTTCGGAA 1268
Query 1017 AAGACGCCACTTTTATGAAATTTTGTTTTCAGATGTGGATTCACACTGGTTGTTAAACAA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269 AAGACGCCACTTTTATGAAATTTTGTTTTCAGATGTGGATTCACACTGGTTGTTAAACAA 1328
Query 1077 AAAGATTAAAGTTTTCTGGCCTTTGGATGAGAGTTGGTATCATGGGTTTGTGGATGGTTT 1136
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 AAAGATTAAAGTTTTCTGGCCATTGGATGAGAGATGGTATCATGGGTTTGTGGATGGTTT 1388
Query 1137 CGATGGAGACAAGAACCTGCATCATGTAAAATATGATGATCGTGATGAGGAGTGGATCAA 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389 CGATGGAGACAAGAACCTGCATCATGTAAAATATGATGATCGTGATGAGGAGTGGATCAA 1448
Query 1197 CTTACAGGGTGAAAGATTCAAAATTCTGTTGTTCCCTACTGAAGTTCCTGGAAAAAACCA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1449 CTTACAGGGTGAAAGATTCAAAATTCTGTTGTTTCCTTCTGAAGTTCCTGGAAAAAATCA 1508
Query 1257 ACGGAAAAGGCGCTGTTCAGTGTCCAAGTCTACTCAGAAAATAAAAGGGAATGATACATC 1316
||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 1509 GCGGAAAAGGCGTTGTTCAGAGTCAAAGTCTACTCAGAAAGTAAAAGGGAATGATACTTC 1568
Query 1317 CAGCAAAGACGAGGAGAAGCAGAAGGAAAAGCTAGAAGATGATAGCTGCATGGAATCAGA 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569 CAGCAAAGACGAGGAGAAGCAGAAGGAAAAGCTAGAAGATGATAGCTGCATGGAATCAGA 1628
Query 1377 GCCAATCATCACATGGTTGGCTCGGTCTAGGCATCGGGACAAATCTTCCACTGTTAAGGC 1436
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1629 GCCAATCATCACATGGTTGGCTCGGTCTAGACATCGGGACAAATCCTCCACTCTTAAGGC 1688
Query 1437 TGTACAAAAACGGAAAAAATCTGAAGTAATGACATCCAATGAAACTGTGAAAATGAATGG 1496
||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |
Sbjct 1689 TGTACAAAAGCGGAAAAAAACTGACGTAATGACATCTAATGAATCTGTTAAAATG-A--- 1744
Query 1497 GGATGTTGTTAGAGACACTGTAGGACAGTTCACAGATAGATCTGCTAGTTCTCTTGCATT 1556
||| | | | | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1745 --ATG--G---G-G--A---T------G-TCACAGATAGATCGGCTAGTTCTCTTGCATC 1784
Query 1557 ATGTGGATTACCTGGACCAAGTGGAAATGAGTTGGAAAGCTCTGGTTTTCGTAATGGTAG 1616
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1785 ATGTGGATTACCTGGACCAAGTAAAAACGAGTTGGAAAGCTCTGGTTTTCGGAATGGTAG 1844
Query 1617 CATATTTCCTATTGTCTATTGTAGGAGACGACTTCATACAGCAAAAAAGGAAATCTACAA 1676
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1845 CATATTTCCTATTGTCTATTGTAGGAGAAGACTTCATACAGCAAAGAAGGATATCTACAA 1904
Query 1677 GGGGTCATGTGACAATAATGTTGAGGTTTTGAAGCAGTTTCATGTATCAAAAAGTCCGGA 1736
| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1905 AGAGTCAGGTTACAATAGTGTTGAGTTTTTGAAGCAGTTTCTTGTATCAAAAAGTCCGGA 1964
Query 1737 TCCTGATGTAGAGTTTTTGCCTATTGAAGATTCTGGGGATCTGGAGATTTGTTGTCCGTG 1796
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 1965 TCCTGGTGTAGAGTTTTTGCCTATTGAAGATTCTGGGGATCTGGAGCTTTGTTGCCCGTG 2024
Query 1797 GAATGACA-CAGAGCAATTTGAGTTGTCCTTCAGCTTACAGGGTGTTTCCTTGATGAGCT 1855
|||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 GAATGA-ATCAGAGCAATTTGAGTTGTCCCTCAGCCTACAGGGTGTTTCCTTGATGAGCT 2083
Query 1856 ACTTTCTTATGGCGGATGTTGACTGGCTTTCACGTGTTGCTCTTTTGCTTCGTCATGGTA 1915
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 ACTTTCTTATGGCCGATGTTGACTGGCTTTCACGTGCTGCTCTTTTGCTTCGTCATGGTA 2143
Query 1916 CACTTGTGACTTTGTGGCCAAGGGTTTGTTTGGAAATGATTTTCCTGAATAACCAAGATG 1975
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 CACTTGTGACTTTGTGGCCAAGAGTTCGTTTGGAAATGATTTTCCTGAATAACCAAGATG 2203
Query 1976 GGTTAAGGTATCTAATTTTTGAAGGCTGCTTAATGGAAGTTGTTCAATTGATTTTCCGTA 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204 GGTTAAGGTATCTAATTTTTGAAGGCTGCTTAATGGAAGTTGTTCAATTGATTTTCCGTA 2263
Query 2036 TCTTGATGGTAGTAGATCATTCTAATAAGCAAGGAGCACAAGGAGCGGATGCTGACTTGC 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 TCTTGATGGTAGTAGATCATTCTAATAAGCAAGGAGCACAAGGAGCGGATGCTGACTTGC 2323
Query 2096 AGTTGCCAGTTTTCGCAATTGGTCTCCAAGTTTCTTGCATCCCAGGTTTCCAAAGGCAGC 2155
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 AGTTGCCAGTTTTCTCAATTGGTCTCCAAGTTTCTTGCATCCCAGGTTTCCAAAGGCAGC 2383
Query 2156 TTGCATTTCAATTCTACAGTTTCCATGAAGTTAAACATTCAAAGTGGTCATACTTGGAAC 2215
||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 TTGGATTTCAAATCTACAGTTTCCATGAGGTGAAACATTCAAAGTGGTCATACTTGGAAC 2443
Query 2216 AGAATGTCAGGAGGCATTCTTTGCTAGTTAAGCAAGTATCAATTGCAGAGTGTACACACG 2275
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2444 AGAATGTCAGGAGACATTCTTTGCTGGTTAAGCAAGTATCAATTGCAGAGTGTACTCACA 2503
Query 2276 ATAACATGAAGGTCCTGCAGAAGGTTATGCAGAAGAGATCTAGGCATGGAATCAGGTCAG 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2504 ATAACATGAAGGTCCTGCAGAAGGTTATGCAGAAGAGATCTAGGCATGGAATCAGCTCAG 2563
Query 2336 CCCTTGTATCTAGAGGATCGTCATCTGCTAAAGCCTGGCCCACATCTGTTTGCTACAAGA 2395
|||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 GCCTTGTTTCTAGAGGATCATCATCTGCTGAAGCGTGGCCCACATCTGTTTGCTACAAGA 2623
Query 2396 AGCAAAATACGTCTCCATTTGCACTTCCTTTTACTGCTCGGCCACCTACACTGTTACTCA 2455
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 AGCAAAATACGTCTCCATTTGCACTTCTTTTTACTGCTCGGCCACCTACACTGTTACTCA 2683
Query 2456 GTTTACACCTGAACATGATAAGGGAGCTGGGTCATGATTCAGCAGACTTCCTAGGAACAG 2515
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2684 GTTTACACTTGAACATGATAAGGGAGCTGGGTCATGATTCAGCAGACTTCCTAGGAATAG 2743
Query 2516 AACGCGATTTGGTAACAGATAGAGGTTTTGATATGGCAGATTGCACAAATGAACATTCTG 2575
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2744 AACGCGATTTGGTAACACATAGAGGTTGTGATATGGCAGATTTTACAAATGAGCATTCTG 2803
Query 2576 AATC-CTCTCTCAAGAGTAAGGGCCATAGTGATGAACCAATTATCACTTCTTCCAGAGCG 2634
|| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2804 AA-CTGTCTCTCAAGAGTAAGAGCCAAACTGATGAACCAATTATCACTTCTTCCAGA--G 2860
Query 2635 CAAGAAGCGGAAGAGTCAAAAGATCTTCATACTTCGTCTCAAAGGCAGCAGCTGGGGTCT 2694
| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2861 C-----GC--AAGAGTCAAAAGACCTTCATACTCCGTCTCAAAGTCAGCAGCTGGGGTCT 2913
Query 2695 GATTCTGAAAACTGGGTGTCAGT-CAGTTCTTCTGTTGTCAGACATAAGCATGAAACCAG 2753
||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2914 GATTCTGAAAACTGGATGTCA-TACAGTTCTTCTGTTGTCAGACATAAGCATGAAACCAG 2972
Query 2754 GTCTAAAGTTCCAGTGAATGGGATTAGTATTCAAGTTCCAGTATCTGATCATTGTGAGGA 2813
|||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2973 GTCTAATGTTTCGGTGAATGGGATTAGTATTCAAGTTCCAATATCTGATGATTGTGAGGA 3032
Query 2814 TGGTACTCCGCAGTCTAGTAATCTGGCCTTGAATATTCAAGGTA--A-CATCTCAAGTCC 2870
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||
Sbjct 3033 TGGTACTCCGCAGTCAAGTAATCTGGCCTTGAATATTCAAGGTAGTAGCAACTCAAGTCC 3092
Query 2871 AAAGGCCACTGCCCCAAGAAGTATGTGGAGTCGAAGTAAAAGTTCTTTAAATGGCCATCT 2930
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093 AAAGGCCACTGCCCCAAGAAGTATGTGGAACCGAAGTAAAAGTTCTTTAAATGGCCATCT 3152
Query 2931 CTCACATGGTTGGTCGGATTCGAAGGGAGACTTTCTGCACACTAATTTGGCAAATGGACC 2990
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 CTCGCATGGTTGGTCGGATTCAAAGGGAGACTTTTTGAACACTAATTTGGCAAATGGACC 3212
Query 2991 TAAGAAGCGACGTACCCAAGTGTCTTATTCATTGCCTTCTGGAGGTTCTGATTCTAGAAA 3050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3213 TAAGAAGCGACGTACCCAAGTGTCTTATTCATTGCCTTCTGGGGGTTCTGATTCTAGAAA 3272
Query 3051 CAAAGGTTCCCTGCACAAGGGGCTTCCGAACAAAAGAATTAGGAGGTCTACTACTGATGT 3110
|||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3273 CAAAGGTTCCCTGCTCAAGGGGATGCCGAACAAAAGAATTAGAAGGTCTACCGCTGATGT 3332
Query 3111 TTCCAGAGGTATTCAGAAAGATTTGGAGTCTAGTTTATGTGATGCCAATATATTAGTCAC 3170
| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3333 TACCAAAGGTATTCAGAAAGATCTCGAGTCTAGTTTATGTGATGCCAATGTATTAGTCAC 3392
Query 3171 TCTTGGTGACAGAGGCTGGAGAGAATATGGAGCTCAGATTTTCTTGGAACCTTTTGATAA 3230
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3393 TCTTGGTGATAGAGGCTGGCGAGAATATGGAGCTCAGATTTTCCTGGAACCTTTTGATAA 3452
Query 3231 TAATGAATGGAGACTTGCAGTGAAAATCTCAGGGACGACAAAATACTCACACAGGGCACA 3290
|||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3453 TAATGAATGGAGACTTGCGGTAAAAATCTCAGGGACAACAAAATACTCACACAGGGCACA 3512
Query 3291 TCAGTTTCTGCAACCTGGGTCAGTGAATAGGTTTACACATGCTATGATGTGGAAAGGTGG 3350
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3513 TCAATTTCTGCAACCTGGGTCAGTGAATAGGTTTACACATGCTATGATGTGGAAAGGTGG 3572
Query 3351 AAAAGATTGGACCCTGGAGTTCCCTGATAGGGGCCAGTGGTCCCTTTTTAAAGAGATGCA 3410
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3573 AAAAGATTGGACCTTGGAGTTCCCTGATAGGGGCCAGTGGTTCCTTTTTAAAGAGATGCA 3632
Query 3411 TGAAGAGTGCTACAATAGAAATAGTCGGGCTGCTTTAGTTAGAAATATTCCTATTCCTGG 3470
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3633 TGAAGAGTGCTACAATAGAAATACTCGGGCTGCTTTAGTTAGAAATATTCCTATTCCTGG 3692
Query 3471 CATCCGCATGATAGAAAGGGAAAATTCTGATGGAACAGAAACTGAATTTATTCGCAGTTC 3530
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3693 CATCCGCATGATAGAAAGGGATAATTTTGATGGAACAGAAACTGAATTTATTCGCAGTTC 3752
Query 3531 TTCTAAATATTTTCGGCAGACTGAAACTGATGTTGAGATGGCATTAGATCCTTCACGTGT 3590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3753 TTCTAAATATTTTCGGCAGACTGAAACTGATGTTGAGATGGCATTAGATCCTTCACGTGT 3812
Query 3591 TTTGTATGACATGGACAGTGATGATGAGCAGTGCCTTTTGAGAATTCGTGAGTGTTCG-G 3649
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3813 TATGTATGACATGGACAGCGATGATGAGCAGTGCCTTTTGAGAATTCGTGAGTGTTCGAG 3872
Query 3650 ATGCTGAGAATAGTGGCTCTTGTGAGATTACTGAGGACATGTTTGAGAAGGCAATGGACT 3709
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3873 -TGCTGAGAATAGTGGCTCTTGTGAGATCACTGAGGACATGTTTGAGAAGGCAATGGACA 3931
Query 3710 TGTTTGAGAAGGCTTCGTATGTAAAGCAGCGTGATCACTTTACCTTAATCGAAATTCAAG 3769
|||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3932 TGTTTGAGAAGGCTTCATTTGTAAAGCAGCGTGATAACTTTACCTTAATCGAAATTCAAG 3991
Query 3770 AATTGACGGCTGGAGTGGGATCCTTGGAAGCAATGGAAACAATATATGAGCTTTGGAGAA 3829
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3992 AATTGACGGCTGGAGTTGGATCCTTGGAAGCAATGGAAACAATATATGAGCTTTGGAGAA 4051
Query 3830 TAAAGAGGCAGAGGAAGGGAATGCCGTTAATCAGGCATCTTCAGCCACCTCTGTGGGAAA 3889
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4052 CAAAGAGGCAGAGGAAGGGAATGCCATTGATCAGGCATCTTCAGCCACCTCTATGGGAAA 4111
Query 3890 AATATCTAAAAG-AGCTCAAAGACTGGGAGTTGGTTATGAGCAAAGCAAACACTCCAAAT 3948
|||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4112 AATATC-AAAGGGAGCTCAAAGACTGGGAGTTGGTTATGAGCAAAGCAAACACTCCAAAT 4170
Query 3949 TCCTGTGGGTCACAGAAGAAACAGTCACCTATTGAGAAGCCAGCGATGTTTGCTTTCTGT 4008
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4171 TCCTGTGGGTCGCAGAAGAAACAGTCACCTACTGAGAAGCCAGCGATGTTTGCTTTCTGT 4230
Query 4009 TTTAAGCCTCGAGGTTTGGAAGTCAAACACAGGGGAACAAAACACAGGTCACAGAAGAAA 4068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4231 TTTAAGCCTCGAGGTTTGGAAGTCAAACACAGGGGAACAAAACACAGGTCACAGAAGAAA 4290
Query 4069 ATCTCGGTTTATGCTCAACATAGTTCTACTTTGGGAGATTATGATGTCTATAATTCATCA 4128
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 4291 CTCTCAGTTTATGCTCAACATAGTTCTGCTTTGGGAGATTATGATGGCTGTAATTCATCA 4350
Query 4129 GCAGGAAGAAGACCTGTTGGTTTTGCCTCTGGAGATGAAAGGTTTTTATATTCAAATCAA 4188
||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4351 GCAGGAAGAAGACCTGTTGGTTTTGTCTCTGGCGACGAGAGGTTTTTATATTCAAATCAA 4410
Query 4189 AGCTATGAGAACGT-GAATGAATATCCTATGCATCCGGGAACATATTCCCCCCGTGACCT 4247
||||||||| || | |||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4411 AGCTATGAGCAC-TCGAATGAATTTTCTGTACATCCAGGAACATATTCCCCTCGTGACCT 4469
Query 4248 AGGCATGGGATATTTCTCGAGCGGTGGAAATGGATATCATAGGAATCACCAAAACAAGTT 4307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4470 AGGCATGGGATATTTCTCGAGCGGTGGAAATGGATATCATAGGAATCACCAAAACAAGTC 4529
Query 4308 GCAAAGAGTCAATGGGAAGAGGAATACGAGTGAACGATGGGATGGAGGCTATTCTGAATG 4367
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4530 GCAAAGAATCAATGGGAAGAGGAATACGAGTGAACGATGGGATGCAGGCTATTCTGAATG 4589
Query 4368 CCCCAGTTCCAATCTTGTCTGTTACTCTAACGGATCTCAGCGTCCTGATCTGGAAG-AAT 4426
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 4590 CCCCAGTTCCAATCTTGTCTGTTACTCCAACGGATCTCAGCGTCCTGATGTGGAAGGAAT 4649
Query 4427 TACAGAATAGTACAGATATTGATGAGTACAAATTGCGAGATGCAGCTGGTGCTGCAAGGC 4486
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4650 -ACGGAATAGTACAGACATTGATGAGTACAAATTGCGAGATGCAGCTGGTGCTGCAAGGC 4708
Query 4487 GAGCATGCGCATTGGCGAAGCTCAAGCGAGAAAGAGCAGAGAGTTTGAGGTACAAAGCAG 4546
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4709 GAGCATGCGCTTTGGCGAAGCTCAAGCGGGAAAGAGCAGAGAGTTTGAGGTACAAAGCAG 4768
Query 4547 ATCTAGCGATCCAGAAAGCTGCAGCTGCTCTCATGTGTGCAGAGGCAGTTAAAGCTTCTT 4606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4769 ATCTAGCGATCCAGAAAGCTGCAGCTGCTCTCATGTGTGCAGAGGCAGTTAAAGCTTCTT 4828
Query 4607 CTGTGGACCTAAGCAACAA---TGGGTTAGAAAGCTCAAGCGAAGGATGA 4653
| | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4829 CCGAGGACCTAGGCAACAACAATGGGGTAGAAAGCTCAAGCGAAGGATGA 4878
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 232072278318
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5