BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg329195
Length=4416
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G24680.1 | Symbols: MOS1 | modifier of snc1 | chr4:12732678-... 3530 0.0
> AT4G24680.1 | Symbols: MOS1 | modifier of snc1 | chr4:12732678-12740051
FORWARD LENGTH=4763
Length=4763
Score = 3530 bits (1911), Expect = 0.0
Identities = 2216/2360 (94%), Gaps = 34/2360 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2065 ACAAACACAGAAAGCTTT-GACGAGGTTAATGTGGATGACTCTTTGGATACCGATTCCAT 2123
|||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2116 ACAAACACAGAAAGCTTTCG-CGAGGTTAATGTCGATGACTCTTTGGATACCGAGTCCAT 2174
Query 2124 CAGGAGGCCTGGGTCTGGAATATCAGCAGACCCAAACGACAATCAGCGTTCTACGATGAG 2183
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 2175 CAGGAGGCCTGGGTCGGGAATATCAGCAGACCCAAAGGATAACCAGCGTTCTACGATGAG 2234
Query 2184 AGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGGCAAAAAGAGGAGGAAGAAAGAGCAAGAGA 2243
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2235 AGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGGCAGAAAGAGGAGGAAGAAAGAGCGAGAGA 2294
Query 2244 TCAGCGGGCTAAGGCTCTCGCAAAACTAGAAGAGTTGAATAGACGTTCCCAAGTATCTGA 2303
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2295 TCAGCGGGCTAAGGCTCTTGCAAAACTAGAAGAGTTAAATAGACGTTCCCAAATATATGA 2354
Query 2304 GGAGGGTTCAGTTAAGAATAAT-GCTTCTCCCCCTGACATGCCAGAAGATCCTGGGTCTC 2362
|||||||||||||||||| || | || | || | ||| | ||| || | |
Sbjct 2355 GGAGGGTTCAGTTAAGAA-CATGGAAGCTGCATCT-A-ATG-C---TTCTCC-GGCTGAC 2406
Query 2363 AT-TCATCCGCTCTTGAGATGAAGA-ACA-CTGTTGCAGTTGCAAATTCCGTAGAACCTA 2419
|| || | | || || ||| | || || ||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2407 ATGCCAACAGATCCTG-GAT-CTCATTCATCTAATGC---TACAAATTCCGTAGAACCTA 2461
Query 2420 CTGGAGGATCAGGAAAAAACACGATGCAAAACACGAAGACTTCAACAGAATATGCAAATA 2479
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462 CTGGAGGATCAGGAAAAAACACAACGCAAAACACGAGGACTTCAACAGAATATGCAAATA 2521
Query 2480 ATGTAGGCCCTACCCAACAGGATAATCTTCCACGTGATCATGATGGCGGTGGCTCAAAAC 2539
|||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2522 ATGTGGGCCCTTCCCAACAGGATAATCTTCCAC--G----TGATGGCGGTGCCTCAAAAC 2575
Query 2540 AGAAGCGCTTGGGTTATAAGCAGAAGCAGCAAAATATAATATTTGAGaaaaaaaCGACAG 2599
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2576 AGAAGCGCTTGGGTTATAAGCAG-A--AGCAAAATATTATATTTGAGAAAAAACCGACAG 2632
Query 2600 GGAGCTCTGTTGCTACTACAGATGTGTTTGATATTGTTCCATCTCTTGTGGTTGTTAATG 2659
||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||| || |||||||||||
Sbjct 2633 GGAGCTCTGTTGCTACTGCAGAGGTGTTTGATGTTGTCCCGTCTCCTGAGGTTGTTAATG 2692
Query 2660 AAGGTGTCTCAAGCCATAACTCAGAAATGCCAGCAATGTCAAGCGTTTCAGCTGAGTCAA 2719
|||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2693 AAGGTGTCTCAAGCAATAACTCAGACATGCCAGCGACGTCAACCGTTTCAGCTGAGTCAA 2752
Query 2720 CTTTCCCGAAAAGAAAAAATAACAGGAATGGTAAGAAAAAGCACAAGGCTGAGGAGACAG 2779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2753 CTTTCCCGAAAAGAAAAAATAACAGGAATGGTAAGAAAAAACACAAGGCTGAGGAGACAG 2812
Query 2780 CAACGATGAATACGACAAGAGTTGCCGTTGGAAAAGAAACAAAATCGGGAGATGAGTCAA 2839
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAACTATGAATACTACAAGAGTTGCCGTTGGAAAAGAAACAAAATCGGGAGATGAGTCAA 2872
Query 2840 TTGAGACTGGTAGGGCAAGGGCAGCTGAAATGGAGTCGGGGTCTGTTTCAGTTCCAAGCC 2899
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 TTGAGACTGCTAGGGCAAGGGCAGCTGAAATTGAGTTGGGGTCTGTTTCAGTTCCAAGCC 2932
Query 2900 TGGATATCAAAGTGTCTGGTGATTCGTCTGAACAAATCAGTTCCTTCACTAATGAAGAGT 2959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 TGGATATCAAAGTGTCTGGTGATTCGTCTGAACAAATCAGTTCCTTCACTAATGAAGAGT 2992
Query 2960 CTCAAAACAGGGGAAAAAACAACTGGAAATCTCAACATTTGCGTAGGACTCAAAGAAACT 3019
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 CTCAAAACAGAGCTAAAAACAACTGGAAATCTCAACATGTGCGTAGGACTCAAAGAAACT 3052
Query 3020 CACTGGTAAATAAGCCTGGC-GAGAAATTTTCTGGCAACAATGCTGTTATATGGGCTCCA 3078
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3053 CACTGGTAAATAAGCCT-GCAGAGAAATTTTCTGGCAACAATGCTGTTATTTGGGCTCCA 3111
Query 3079 GTACATCCACAGCAAAAAGCTGATGTTTCCACAGGTGGAGGGAGTCAGACTACTGTCCCT 3138
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3112 GTACATCCACAGCAAAAAGCTGATGTTTCCACTGGTGGAGGGAGTCAGACTACTGTCCCT 3171
Query 3139 GAGTTTGGCACCTCTTCAAAGAGTCAGCATCATGGACAGACTAGTTCTAAAAGCAAAAGA 3198
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3172 GAGTTTGGCACCTCTTCAAAAAGTCAGCATCAAGGACAGACTAGTTCTAAAAGCAAAAGA 3231
Query 3199 GTGGAGATTGAAAGATATGTACCGAAGCCCATAGTAAAAGAAATGGCTGAGCAAATCGTC 3258
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 GTGGAAATTGAAAGATATGTACCGAAGCCTATAGTAAAGGAAATGGCTGAGCAAATCGTC 3291
Query 3259 AGTAAAAATCTAGTAAACTCTGCTCCAGATATGTCGGAGAATGTAAACCAGAAAGAAAAT 3318
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3292 AGTAAAAATCTAGTAACCTCTGCTCCAGATATGTCGGAGAATGTAAACCAGAAAGAAAAT 3351
Query 3319 CGTGGAGGTGAGGGTACAGGAATTCTCGAACCTTCTGGTTCAACTGCA-GGAAATTCTGG 3377
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3352 CGTGGAGGTGAGGGTACAGGAATTCTCCAACCTTCTGGTTCAACTGCAGGGAAA-TCTGG 3410
Query 3378 GTCTCCTTCAAGGTCAAGACACGGGAATGGTAGGCAGGGAAAGCATGGTAGAGAACATGG 3437
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 GTCTCCTTCAAAGTCAAGACATGGGAATGGTAGGCAGGGAAAGCATGGTAGAGAACATGC 3470
Query 3438 ATCATGGCACCAGAGGGGTTCTGGAGCACATACTAAACCTTTGGAGGATGGACAATATGT 3497
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 3471 ATCATGGCACCAGAGAGGTTCTGGAGCACCTACTAAAGCTTTGGAGGATGGACAATTTGT 3530
Query 3498 AACCTCAAATCAGCCCATTCGAGGAACAGTTAACTATCACTCTAGTAACCAAACCGAACA 3557
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3531 AACCTCAAATCAGCCCATCCGAGGAACAGTGAACTATCACTCTAGTAAGCAAACCGAACA 3590
Query 3558 AATTGCTGCCAAGGATCAAACCACATGTAATAAGGATGGATGGAACGATGGCTGGTATAT 3617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3591 AATTGCTGCCAAGGATCAAACCACATGTAATAAGGATGGATGGAACGATGGCTGGTATAT 3650
Query 3618 GACTCCTGAAACGCATTACTCTGCTGCTGAAGAAATGGAATCCAGTGCTGTTGGAAAAGA 3677
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 GACTCCTGAAACGCATTACTCTGCTGCCGAAGAAATGGAATCCAGTGCTGTTGGAAAAGA 3710
Query 3678 TCAAGGAATGAGCATGCACGGCAAGCAGCATGCTTCCAGAAGCAACAAGGATGGAGGAAG 3737
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 TCAAGGAATGAGCATGCACGGCAGGCAGCATGCTTCAAGAAGCAACAAGGATGGAGGAAG 3770
Query 3738 CAACTATGGTGACCCTAAAAAAGCCAATAAGAGGGATTTCAATAAAGCTCATATGCAGCA 3797
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3771 CAACTATGGTGACCCTAAAAAAGGCAATAAGAGGGATTTCAATAAAGCTCATACGCAGCA 3830
Query 3798 CTCTGGCCATGGGTTTAACCAACCAGATTTGCCTGCTGCTTCAAAAGAAAGTCGTGTCCC 3857
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3831 CTCTGGCCATGGGTTTAGCCAACCAGATTTGCCTGCTGCTTCAAAAGAAGGTCGTGTCCC 3890
Query 3858 TGGAGATCATGTGTGGCATACAGCTAATAGGACAGGTAAGTATGGTGGTCGTGAAAGTAC 3917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 TGGAGATCATGTGTGGCATACAGCTAATAGGACAGGTAAGTATGGTGGTCGTGAAAGTAC 3950
Query 3918 GAGGGACAAACCTTATGGATCTCA-GAAAAAAGATGTTGCTGGATACGAGCATCAAGGGT 3976
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3951 AAGGGACAAACCTTATGGATCTCAGGAAAAAA-ATGTTGTTGGATACGAGCATCAAGGGT 4009
Query 3977 TTACTACAGAACAGAAAACGACGTCTGCTGATACACAAGCCCAGTCGCAAAACCGATCTA 4036
||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4010 TTACTACAGAACAAAAAACGACATCAGCTGATACACAAGCCCAGTTGCAAAACCGATCTA 4069
Query 4037 CCAATAATGAGGTCCAGGTTGAGCAAAATCCGAATAGTATGTTCCAAAAGAACACAGGGC 4096
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4070 CCAATAAGGAGGTCCAGGTTGAGCAAAATCCGAATAGTATGTTCCAAAAGAACACAGGGC 4129
Query 4097 AGGGTCGACGGTTTGGAAGAGGGCAGGAGTCACAAGGAGGTTGGGGTTTACCGGCGCAAG 4156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4130 AGGGTCGACGGTTTGGAAGAGGGCAGGAGTCACAAGGAGGTTGGGGTTTACCGGCGCAAG 4189
Query 4157 AAAATCTGCACCATCACCATCAGAGGCCACCTTCAAACAGAGATAGACAGAAGCAAAATA 4216
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4190 AGAATATGCACCATCACCATCAGAGGCCACCTTCAAACAGAGATAGACAGAAGCAAAATC 4249
Query 4217 TGCATTATGAATACAAACCTGTTGGGTCTCATAATTATGATGGAGAACGTAGTGGAGAAC 4276
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4250 TGCATTATGAATACAAACCTGTTGGGTCTCATACTTATGATGGAGAACGTAGTCGAGAAC 4309
Query 4277 AATCGAAAGAGAGTTCTCAGACAGAAGGTCCAAGATACAGAGAGAAGGGACAGGGGCAGC 4336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 AATCGAAAGAGAGTTCTCAGACAGAAGGTCCAAGATACAGAGAGAAGGGACAGGGGCAGC 4369
Query 4337 AAAGGCAGGGTGGATACCAACAGCAAAGGGGTAATAGTGGGAGAAACACTGGTCATGGAT 4396
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4370 AAAGGCAGGGTGGATACCAACAGCAAAGGGGTACTAGTGGGAGAAACGGTGGTCATGGAT 4429
Query 4397 TCACAGGTGAGAGAAACTAA 4416
|||| ||||| |||||||||
Sbjct 4430 TCACTGGTGATAGAAACTAA 4449
Score = 1906 bits (1032), Expect = 0.0
Identities = 1126/1171 (96%), Gaps = 7/1171 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 903 AGAAGCTAATGAACGGATTGGAGAGGCCAATTCCTGGAGAAGAGATAATCAACCATACAG 962
|||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 912 AGAAGCTAATGACCGGATTGGGGATGCCAATTCCTGGAGAAGAGAGAATCAACCATACAG 971
Query 963 TGAAGATGCACCTAGACATTGTAGAGAAGAAGGGCAATTGGACTCACGTGGTTCACAGTC 1022
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 972 TGAAGATGCACCTAGACATTGTAGAGAGGAAGGGCAATTGGACTCACGTGGTTCACAATC 1031
Query 1023 TTATCCTAATGCTAATTTTCCTCCTCAGTATGATGCTTGGCGTGGTCCTCCAGTAAATAA 1082
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 TTATCCTAATGCTAATTTTCCTCCTCGGTATGATGCTTGGCGTGGTCCTCCAGTAAATAA 1091
Query 1083 TCATCAAGGTGGTGGCTGGTACGGAGGGAACCACCCGTATGGTGCCCCAATGGGTCCTGG 1142
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 TCATCAAGGAGGTGGCTGGTACGGAGGGAACCACCCGTATGGTGCCCCAATGGGTCCTGG 1151
Query 1143 GGGTTTTCACATGGATCCTTTTCCATTTTATCCTACGCAAGTTCCACCTTCTCCTGGACA 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1152 GGGTTTTCACATGGATCCTTTTCCATTTTATCCTACGCAAGTTCCACCTGCTCCTGGACA 1211
Query 1203 TGGGGCTGGTCCTAGGGGCAATCACGCCAATAATGAAAGAATGTTCAGACCTCCAATGCT 1262
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 TGGGGCTGGTCCTAGGGGTAATCACGCTAATAATGAAAGAATGTTCAGACCTCCAATGCT 1271
Query 1263 TGACTCTTATGTCCACCCAAGGATGCAGACTAGGCCTGGGTTTTATGTTGGTCCAGCGCC 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272 TGACTCTTATGTCCACCCAAGGATGCAGACTAGGCCTGGGTTTTATGTTGGTCCAGCGCC 1331
Query 1323 ACACGAAGGCTACTATGGTCCTCCCATGGGGTATGGCAGTCCCAGCAACAGAGACCTGCC 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1332 ACACGAAGGCTACTATGGTCCTCCCATGGGGTATGGCAGTCCCAGCAACAGAGACCTACC 1391
Query 1383 CTTTGCAGGTAGGCCTACTGGTCCGCATGCTTATAACAATCATTCTGGTCAAGGTGTATA 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1392 TTTTGCAGGTAGGCCTACTGGTCCGCATGCTTATAACAATCATTCTGGTCAAGGTGGATA 1451
Query 1443 TGATACGCCTGGAAGTTCAGTGTCTTTGGAACGGAACGAGTCATCACATTCTCAAGAAAC 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452 TGATACGCCTGGAAGTTCAGTGTCTTTGGAACGGAACGAGTCATCACATTCTCAAGAAAC 1511
Query 1503 ACAAAGGCCATACAAGGTTATCCTAAAGCACCAAGATGGGAGGTTTGGGGAAGATAGA-G 1561
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1512 ACAAAGGCCATACAAGGTTCTCCTAAAGCACCAAGATGGGAGGTTTGGGGAAGATA-ATG 1570
Query 1562 CAAAGCGGGAAGAATTTCTAGGAAATAGGCTCCCGAATGCAGAGAAGATAGCTCAACAGA 1621
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 CAAAGCGGGAAGAATTTCTTGGAAATAGGCTCCCGAATGCAGAGAAGATAGCTCAACAGA 1630
Query 1622 TGCAAACTTCAAGAAATGAGAGGAGAGAAATCCGAAATGAGGCAAGTGGTGAAGTACAAC 1681
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1631 TGCAAACTTCAAGAAACGAGAGGAGAGAAATCAGAAATGACGCAAGTGGTGAAGTACAAC 1690
Query 1682 CAATCAAAGCAGAACTTGCTGCCCCTGGAGATCCTAGTTTGATTCAGAAAATTGAGGGCT 1741
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1691 CAGTCAAAGCAGAACTTGCTGCCCCTGGAGATCCTAGTTTGATTCAGAAAATCGAGGGCT 1750
Query 1742 TAAATGCAAAAACTAGAACTAATGATGGTTGGCAAAATGCTTCATCTGTCGTCAATAGAG 1801
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||
Sbjct 1751 TAAATGCAAAAACTAGAACTAATGATGGTTGGCAAAATTCGTCATCTGTTGTTAATAGAG 1810
Query 1802 ATGAGCAGGAAAGCAAACCACGTACAGTCAATTCTGGGAACTCTGTAAATAAAGTTTCAG 1861
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1811 ATGAGCAGGAAAGCCAACCACGTACACTCAATTCTGGGAACTCTGCAAATAAAGTTTCAG 1870
Query 1862 CAAAAAATCCTCGAACTGGTCACGCAAGTGATAGTAAGAACT--T-ACACTATAATCAAG 1918
| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1871 CCAGAAATCATCGAACTGGTCATGCAAGTGACAGTAAGAACTCATCACACTATAATCAAG 1930
Query 1919 GTGATTCTGCCACAAACAAAAATGCTGAACTGGCAGCTATGGGTGGAACT-GCCATATTC 1977
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1931 GTGATTCTGCCACAAACAAGAATGCTGAACCCGCAGCTATGGGTGGAACTAGC-ATATTC 1989
Query 1978 AGGAGATCTACTCAACAGACTCAAGGCAGAGCAGATCCTCAGACCAAACGAATAGTGAAC 2037
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 AGGAGACCTACTCAACAGACTCAAGGCAGAGCAGATCCGCAGACCAAACGAATAGTGAAC 2049
Query 2038 AGTGAAGGCAATGATGCTTGGCAGAAGACAA 2068
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2050 AGTGAAGGCAATGATGCTTGGCAGAAGACAA 2080
Score = 1094 bits (592), Expect = 0.0
Identities = 700/749 (93%), Gaps = 20/749 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACCTCTAGCACGGCAGGAGATCG-A--AGATGGGGTACTACAAGAAGAAGTGGCATG 57
||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 ATGACCTCTAGCACGACAGGAGATCGAAGCAGATGGGGTACTACAAGAAGAAGTGGCATG 225
Query 58 ACTATATTGGGAAAGGTTGCTGTTCCAAAACCGATTAACTTACCAAGCCAAA-GAT-G-G 114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |
Sbjct 226 ACTATATTGGGAAAGGTTGCTGTTCCAAAACCGATTAACTTACCAAGCCAAAGGTTAGAG 285
Query 115 --TTTA---CTT--TTC--TTCTGGACATCTATT-TTAGGGGGACCCTTAGTTGGGGCAG 164
| ||| | | | || || | || | ||| || ||||||||||||||
Sbjct 286 AACCAAGGCCTTGACCCAAATGTAGAAAT-TGTTCCAAAGGGAACACTTAGTTGGGGCAG 344
Query 165 TAAATCATCACTGAATGCTTGGGGG--A-CATCCTTGTCACCACGAACTGAAAGTGGCCC 221
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 TAAATCATCACTGAATGCTTGGGGGACATCATCCTTGTCACCACGAACTGAAAGTGGCCC 404
Query 222 TGGTTCACCAAGCCACCTCAGTAATCGACCTTCTTCTGGTGGAAGTGTCACTCGACCTTC 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 TGGTTCACCAAGCCACCTCAGTAATCGACCTTCTTCTGGTGGAAGTGTCACTCGACCTTC 464
Query 282 AACTGCTGATAGTAACAAAGCACATGACTCTTCTTCTTCTGCTGCATGGGATTCAAACTC 341
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 465 AACTGCCGATAGTAACAAAGCACATGACTCTTCTTCTTCTGTTGCATGGGATTCGAACTC 524
Query 342 TCGGCCTTCATCAGCATCTGGGGTGTTTCCATCTAATCAGGCATCAGTTGCACTACAGCG 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 525 GCGGCCTTCATCAGCATCTGGGGTGTTTCCATCTAATCAGCCATCAGTTGCACTACAGCG 584
Query 402 TCCACATAGTGCAGACACAAGACCAGGAAGTTCCCAGTTATCCCGATTTGCTGAACCCGT 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 TCCACATAGTGCAGACACAAGACCAGGAAGTTCCCAGTTATCCCGATTTGCTGAACCCGT 644
Query 462 GTCAGAGACTTCTGCAACATGGGGTCAACATGTGGCGGCAGAGAAGTTGGGAGTTGCTCC 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 GTCAGAGACTTCTGCAACATGGGGTCAACATGTGGCGCCAGAGAAGTTGGGAGTTGCTCC 704
Query 522 ATCAAAGAATGATGGGTTTTCTTTGACTTCTGGAGATTTTCCTTCCCTTGGCGCTGAAAA 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 705 ATCAAAGAATGATGGGTTTTCTTTGACTTCTGGAGATTTTCCTTCCCTTGGTGCTGAAAA 764
Query 582 GGAAACTTCTGAAAAGAGTACAAGGCCACATGTAAATACGTTAGACATGGCTCTTAGAAA 641
||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 GGACACTTCTGAAAAGAGTACAAGGCCACAAGGAGATACGTTAGACATGGCTCTTAGAAA 824
Query 642 CTGCAAATTTGCAGATGCTGGACCTCACGCTCGTCCTCCATCTTCGTCTGGAAGATCTGT 701
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 825 CTACAAATTTGCAGATGCTGGACCTCACGCTCGTCCTCCATCTTCGTCTGGAAGATCTGT 884
Query 702 GGAAGGGCAAGGTGTAGATTGCACAGAAG 730
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 GGAAGGGCAAGGTGTAGATTGCACAGAAG 913
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 220182712827
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5