BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg329795
Length=5235
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G17330.1 | Symbols: ATG2484-1, G2484-1 | G2484-1 protein | c... 3923 0.0
> AT4G17330.1 | Symbols: ATG2484-1, G2484-1 | G2484-1 protein |
chr4:9688888-9697578 REVERSE LENGTH=6499
Length=6499
Score = 3923 bits (2124), Expect = 0.0
Identities = 2660/2909 (91%), Gaps = 75/2909 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2098 ACTCAGTTAGTTCTGGGCAAGGATAACAAAAATGAAAAGCCTAGTACTAGCTCCTTGGCT 2157
|||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2106 ACTCTGTCAGTTCTGGACAAGGATAACAAAAATGAAATGCCTATTACTAGCTCCTTGCCT 2165
Query 2158 AATCTTGGGAGTGAAGCTGGAAAAGATCACCGGGAAGAGGATAATTCTGCTGCGTCCGGA 2217
| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||
Sbjct 2166 ATTCTTGGGAGTGAAGCTGGAAAAGATGGCCAGGAAGAGGATAATACTGCTGCTTCTGGT 2225
Query 2218 GGGATTATGTCAGCTGGGACTCCTGTTTCAAACCCCAAAGGTGATGCAATCGTACTAGGA 2277
||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 GGGATTATGGCAGCTGGGACTCCTGTTACACACCCCAAAGGTGATGCAATCGTACTAGGA 2285
Query 2278 GACTCCTGTGCTTCTACAGT-TTCTGAGCCTTCTGGAAAGTCTCATGTAACTGCAACAAA 2336
|||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |
Sbjct 2286 GACTCCCGTGCTTCTACA-TGTTCTGAGTCTTCTGTAAAGTCTTATGTAACTGCAATAGA 2344
Query 2337 AGACGCTGCTACTAATTTGAAGACTCCTCTTAATTCTTTCCCCACTGTTAAGACTTCCGA 2396
||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2345 AGATGCTGCTACTAATTTAAAGACTCCTCTTGATTCTTTCCCCACTGTTAAGACTTCCGA 2404
Query 2397 ACTTCAACTTAATAAGACTGAGACAAACAGTGTCAAAAAGCCAGAAGATCAGAATATTTC 2456
||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 ACTTCAATTTAATAACACAGAGACAAACAGTGTCAAAAAGCCAGAAGATCAGAATATTTC 2464
Query 2457 GAGTTTTATGTCTGCTGGATCTTCGGTCTTGAAT---AATGAGACCTTCAGCAGTGAGAT 2513
| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2465 GGGTTTTATGTCTGCTGGATCTCCGGTCTTGAATAGAAATGAGACCTCCAGCAGTGAAAT 2524
Query 2514 GAACATAACTCCCGATCAGCTGAAAGCAGGGGAAATTTCCAAAGCTGTTAAT-TTTTCAC 2572
|||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2525 GAACTTAACTCCTGATCAGCTGAAAGCAGGGAAAATTTCCAAAGCTGTT-ATATTTTCAC 2583
Query 2573 AAGCTACACTGGTCTCTCCGATTGTGGTGGGATCTCCTTCAACATCTAGCTTAGAGAAAA 2632
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2584 AAGCTACCCTTGTCTCCCCGATTGTGGTGGGATCTCCTTCAACATCTAGCTTAGATAAAA 2643
Query 2633 CAGCTGCAAAGTCTTCCAAAACAAAATCTGAGCGGAAACCCAGGCGAACATCTAAATCTG 2692
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2644 CAGCTGCAAAGTCTTCCAAAGCAAAATCTGAGCGGAAACCCAGGCGAACATCTAAATCTG 2703
Query 2693 TAGGAAAAGAGACTTCTAGAAAAGGAACTAGTGTAAAAGGGGCTACACCTTTTCAACAGT 2752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2704 TAGGAAAAGAGACTTCTAGAAAAGGAACTAGTGTAAAAGGGGCTACACCTATTGAACAGT 2763
Query 2753 TTCAAAGTGGAGGCAAAACAAATGCTGTTAATCAAAGTTCGGCTTGTCCTATTCAGATCA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 2764 TTCAAAGTGGAGGCAAAACAAATGCTGTTAATCAAAGTTTGGCTTCTCATATTCAGATCA 2823
Query 2813 CACAATCTACTGAGAAACAGCAAAGTCTTCAGAGCCCTGCTCTAAAAGCTTTTGGGACCC 2872
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2824 CACAATCTACTGAGAAACAGCGAAGTCTTCAGAGCCCTGCTCTAAAAGCTTTTGGGTCCC 2883
Query 2873 TTTCAACCCCCACGGCAAGTCTACCGGATTTGAACTCTGCTGCTCTCTCAAGTATTCTGC 2932
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2884 TTTCAACCCCTACGGCAAGTCTACCGGATTTGAACTCTTCTGCTCTCTCAAGTATTCTGC 2943
Query 2933 GTCGACCTTTCACAGACTTGCAACAAGTGCAACTACGTGCACAAATTTTCGTATATGGGG 2992
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 2944 GTCGACCTTTCACGGACTTGCAACAAGTGCAACTACGTGCACAGATTTTTGTATACGGGG 3003
Query 2993 CTCTGATCCAAGGAACAGCACCCGATGAAGCTTATATGATTTCTGCATTTGGTGGTCCAG 3052
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | | |
Sbjct 3004 CTCTGATCCAAGGAACAGCACCGGATGAAGCTTATATGATATCTGCA-TT--T-G----G 3055
Query 3053 TGTGTTCACTCTGCATTTCTTTAGATGGTGGGAAGGGCAGCTGGGAGAAAGCATGGCGTT 3112
|| | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3056 TG-G-------TG-----C---AGATGGTGGGAAGGGCAGCTGGGAGAAATCATGGCGTA 3099
Query 3113 CTTGTGTTGTAAGGGCTCAGAAATCGTTTGTTGCTACTCCTGAAACGCCATTGCAATCAC 3172
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3100 CTTGTGTTGTAAGGGCTCAGAAATCGCTTGTTGCTACTCCTGAAACGCCACTGCAATCAC 3159
Query 3173 GTGCAGGGAAGACAGAGACTCCATCAGCTGGTCACACCAATAGCAAAGAGACTTCAGCGA 3232
|| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3160 GTCCAGGGAAGACAGAGACCCCTTCAGCAGGTCACACCAATAGCAAAGAGAGTTCAGGGA 3219
Query 3233 CAAACCCCATGATTCCACTCTCATCACCTTTATGGAGTTTATCAACTTCCCTTGATACTT 3292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 3220 CAAACCCCATGATTCCACTCTCATCACCTTTATGGAGTTTATCAACTTCCGTAGATACTT 3279
Query 3293 TACAATCAAGTAGCATTCAGAGAGGTTCAACTGCTACTCACCAGCCATTACTTTCTTCAT 3352
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 3280 TACAATCAAGTAGCGTTCAGAGAGGTTCAGCTGCTACTCACCAGCCATTGCTTTCTGCAT 3339
Query 3353 CGCATGCTCACCAAACTCCACCAACTGC-GAATATTGTTGGACATAATACCCCTTGGATG 3411
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3340 CGCATGCTCACCAAACTCCACCAACT-CAGAATATTGTTGGACATAATACCCCTTGGATG 3398
Query 3412 TCGCCTCTCCCTTTCCGTAATTCTTGGCTTGCTTCTCAGCAAAGCAGTGGATATGATGTT 3471
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3399 TCGCCTCTCCCTTTCCGTAACGCTTGGCTTGCTTCTCAGCAAACCAGTGGATTTGATGTT 3458
Query 3472 GGTTCTCGTTTCCCCGTCTATCCGATGACCGAACCTGTAAAATTGACTCCCATGAAAGAA 3531
||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3459 GGTTCCCGTTTCCCCGTCTATCCAATCACTGACCCTGTAAAATTGACTCCCATGAAAGAA 3518
Query 3532 TCGTCCTTGAGT-TTCCCTGGCGCAAAGCATGTTCAGAGTGGAACTTCTGGCAATGTTTT 3590
|| ||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3519 TCATCCATGACTCTT-TCTGGCGCAAAACATGTTCAGAGTGGAACTTCTAGCAATGTTTC 3577
Query 3591 CAAAATGACATCATCACTTGAGCCAACGAGTACAGTTGTAGCACCTGCTCAACATTCCAC 3650
|||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3578 CAAAGTGACACCAACACTTGAGCCTACTAGTACAGTTGTAGCACCTGCTCAACATTCTAC 3637
Query 3651 -CGGGACAAAATCAAGGAAACGGAAGAAGATGCCAGTCTCTGTGGAGTCTGGTCCAAACA 3709
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3638 AAGGG-TAAAATCAAGGAAACGGAAGAAGATGCCAGTCTCTGTGGAGTCTGGTCCAAACA 3696
Query 3710 TTTTGAATTCGTTAAAGCAGACAGAGTTAGCTGCCTCACCTCTTGTTTCTATATCGACGG 3769
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 3697 TTTTGAATTCGTTAAAGCAGACAGAATTAGCTGCCTCACCTCTTG--------T-G-C-- 3744
Query 3770 CAGTGCCTATTACACCTACTCCGGCTAATCTGGGTTCTAATGCTGGCACCCTGCCTAATG 3829
| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||
Sbjct 3745 C--T---T-TTACACCTACTCCGGCTAATCTGGGTTATAATGCTGGCACCCTGCCCAGTG 3798
Query 3830 TTGTTTCTATCACTGCAGTCCCTATGGACCTGGTATCTACGTTCCCCGGGAAGAAAATCA 3889
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3799 TTGTTTCTATGACTGCAGTCCCTATGGACCTGGTATCTACGTTCCCCGGGAAGAAAATAA 3858
Query 3890 AATCATCGTTGCCATCTCCAATTTTTGGTGGTAACCTTGTACCTGAAGTAAAGCAGAGAT 3949
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3859 AATCATCTTTCCCATCTCCAATTTTTGGTGGTAACCTTGTACGTGAAGTAAAGCAGAGAT 3918
Query 3950 CTGTCTTGTCAGAGGATACTAACGATAAACTTAAGGAGGCTAAGATGCATGCAGAGGATG 4009
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3919 CTGTCTTGTCAGAGGATACTATTGAAAAACTTAAGGAGGCTAAGATGCATGCAGAGGATG 3978
Query 4010 CATCTGCTCTTGCTACTGCAGCTGTTAGTCACAGCGAATATGTATGGAAGCGGATAGAGC 4069
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3979 CATCTGCTCTTGCTACTGCAGCTGTTAGTCATAGCGAATATGTATGGAAGCAGATAGAGC 4038
Query 4070 AACAAAGTCATGCTGGCCTCCAGCCAGAAACTCAAGACAGATTAGCTTCGgctgctgttg 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4039 AACAAAGTCATGCTGGCCTCCAGCCAGAAACTCAAGACAGATTAGCTTCGGCTGCTGTTG 4098
Query 4130 ctatagctgctgctgctgcggtggcaaaagctgcagctgctgccgccaatattgcagcta 4189
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4099 CCATAGCTGCTGCAGCTGCGGTGGCAAAAGCTGCAGCTGCTGCCGCCAATGTTGCAGCTA 4158
Query 4190 atgctgcaTTGCAGGCCAAATTAATGGCTGAAGAAGCATCCCTTCTAAATACTTTTGATC 4249
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||
Sbjct 4159 ATGCTGCATTGCAGGCCAAGTTAATGGCTGAAGAAGCATCCCTTCCAAATGCTTCTGATC 4218
Query 4250 AGGGACTCCCAAAGTCAAATGATAATATATTATTACCAGGCCACGGTACCCCTGCTTCTA 4309
||||||||||||||||| |||||| |||||| || || || ||||||||||||||||
Sbjct 4219 AGGGACTCCCAAAGTCATATGATAGCATATTAC--CC-GGTCAGGGTACCCCTGCTTCTA 4275
Query 4310 TCTTGAAGGGTGAAGGTGCAGTGGGGAGCTCCAGTTCGGTTCTTATTGCTGCGAGAGAGG 4369
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4276 TCTTGAAGGGTGAAGGTGCAGTGGTGAACTCCAGTTCGGTTCTTATTGCTGCGAGAGAGG 4335
Query 4370 CATCTAAGAAGAGGGTTGAAGCTGCCACAGCGGCCACCAAGCGTGCTGAAAATATGGACT 4429
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4336 CATCTAAGAAGAGGGTTGAAGCTGCTACAGCGGCCACCAAGCGTGCTGAAAATATGGACT 4395
Query 4430 CCATTGTAAAAGCAGCTGAATTGGCATCCGACGCGGTTTCACAAGCTGGAATACTTGTGT 4489
|||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 4396 CCATTGTAAAAGCAGCAGAATTGGCATCAGAGGCTGTTTCTCAAGCTGGAATACTTGTTT 4455
Query 4490 CAATGGGTCATCCTCCGTCT-CTCAATAAGCTGGTGGAGGCGGGTCCAAGTAAGTATTGG 4548
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 4456 CAATGGGTCATCCTCCGT-TGCTCAATAAGCTGGTGGAGGCGGGTCCAAGTAATTACTGG 4514
Query 4549 AGACAGGCTCAAGGATCTCATGAAGTGCAGCCTTGTA---CGGTTGTTTTAGAAAAAGAA 4605
|| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 4515 AGGCAGGCTCAAGAATCTCAGGAAGTACAGCCCTGTAAAACGGTTGTCTTAGAAAAAGAA 4574
Query 4606 CCTGTGGCTACTAGTGAGGGAACTATTGCTAGTCCCAGAACTGTGCAGACTGAGTTGGGT 4665
||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||
Sbjct 4575 ACTGTGTCTACTAGTGAGGGAACTTTTGCTGGTCCCAAAATTGTGCAGACTGAGTTTGGT 4634
Query 4666 GGCTCTCTGAAAAAGGCAGATGGTGTGTCTGGTCCAGTTTCTGCCACTGGAAAGAAAAAG 4725
|||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 4635 GGCTCTGTGAATACGGCAGATGGTGTGTCCGGTCCAGTTCCTGCCACTGGAAAGTTAAAG 4694
Query 4726 GGACAAAAGGGTGATACAGGTGCAGACTTGGCTGTTAACAATGATGTGGTTTTGGAACCA 4785
||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4695 GGACAGGAGGGTGATAAATATGCAGACTTGGCTAAAAACAATGATGTGGTTTTTGAACCA 4754
Query 4786 GAAGTTGGGTCAAAAATTTCGATTGACACACAAACTGAAAGTCAACAGAGTATGAAAGCA 4845
||||||||||||||| |||| |||||| | ||| | | | | | ||| ||||||
Sbjct 4755 GAAGTTGGGTCAAAATTTTCAATTGACGCCCAA-C--A--G--A-C----TATCAAAGCA 4802
Query 4846 ACGAATAATGCGGACATCAAGGAGGGTTCTAATGTAGAGGTTTTCAAGGAAGAACCTGGA 4905
|| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4803 ACAAAGAATGAGGACATCAAGGAGGGTTCTAATGTAGAGGTTTTCAAAGAAGAACCTGGA 4862
Query 4906 TTAAGAACCGCATGGTACTCTGCCAATGTATTGAGCTTAGAGGATGATAAAGCTTACGTG 4965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4863 TTAAGAACCGCATGGTACTCTGCCAATGTATTGAGCTTAGAGGATGATAAAGCTTACGTG 4922
Query 4966 TTGTTCAATGACCTTTCTGTAGAACAAGG 4994
||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 4923 TTGTTCAGTGACCTATCTGTAGAACAAGG 4951
Score = 2758 bits (1493), Expect = 0.0
Identities = 1856/2028 (92%), Gaps = 37/2028 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATTATGATGACAATGACTTTCAAAACCAGAATCTCCATTTAGCTGGTGAAGCCAAC 60
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 ATGGATTATGATGACAGTGACTTTCAAAACCAGAATCTCCATTTAGCTGGTGAAGCCAAC 161
Query 61 AATAAATTTCCACCAGTTTTACAGCCTTATGCTCTACCAAAGTTTGATTTTGATGATACA 120
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 AACAAATTTCCACCAGTTTTACAGCCTTATGCTCTTCCAAAGTTTGATTTTGATGATACA 221
Query 121 CTCAACACGCATCTAAGGTTTGACAGTTTAGGTGAAAGTGAGGCTTTTCTTGGTATTGAG 180
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 222 CTCAACACGCATCTGAGGTTTGATAGTTTAGGTGAATCTGAAGCTTTTCTTGGTATTGAG 281
Query 181 GGTAACGAAGATAATAACTGGATTGAGGATTTTTCTCGTGGAAGTAGTGGTATAGTGTTT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 GGTAACGAAGATAATAACTGGATTGAGGATTTCTCTCGTGGAAGTAGTGGTATAGTGTTT 341
Query 241 AGTTCAGGTGCAACGGAGTCTTGTGCCATTCCAAGGCACAATAATGTTTGGTCTGAGGCT 300
|||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 AGTTCAGGTGCAACGGAGTCCTGTGCCATTTCTAGGCACAATAATGTTTGGTCTGAGGCT 401
Query 301 ACTTCGTCGGAATCTGTTGAAATGCTTTTGAATTCAGTTGGACAGGACGAAGTTATTGTA 360
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 ACTTCGTCGGAATCTGTTGCAATGCTTTTGAATTCAGTTGGACAGGACGAAGTTATTGTA 461
Query 361 AGAGAGGATACTATCAAGAAATCTGACACTTCTGATGAACTAGGTTGCACAATGGAACCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 462 AGAGAGGATACTATCAAGAAATCTGACACTTCTCATGAACTAGGCTGCACAATGGAAACA 521
Query 421 ATGGAGCCTGGTCAGACATCCCATGAAAAAAGTCCTTCCAAAGAGGAAACGGTGAACTTA 480
| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 GTAGAGCCTGGTCAGACATCCCATGAAAGAAGTCTTTCCAAAGAGGAAACGGTGAACTTA 581
Query 481 CAACCCAACCCATCTGTGGATGATACTTCAGGAGAGTTCTCTGTAGTCAAGACAGATGAT 540
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||
Sbjct 582 CAACCCAACCCCTCTGTGGATGATACTCCAGGAGAGTCCTCTGTGGTAAAGACAGATGAT 641
Query 541 GGACAGGAGCAGGTTCTGGTAAAAGATGACTCACCAACCGCTGTAGAAGAAGCATCTGTG 600
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 642 GGACAGGAGCAGGTTCTGGTTAAAGATGACTCACCAACGGCTGTAGAAGAGGCATCTGTG 701
Query 601 GAGGAAAAGAATGCCATCTTGACTTCAAATACCGCGACGGTAGAGGCTGTCGATACTGCT 660
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||
Sbjct 702 GAGGAAAAGAATTCCATCTTGACTTCTAATACCGCGACGGTAGAGGCTATAGATACTACT 761
Query 661 GGTCTTGATAAAATAGGACCTGAGTCGACTGATGATCTTCTTCACCAAACGGAAGAGAAA 720
| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 762 GATCTTGGTAAAATAGGAACTGAGACGACGGATAATCTTCTTGACCAAACAGAAGAGAAA 821
Query 721 GCCAATATAGAATCAAGGATGGAAGATGATTGTAGCGATAG-AACTGTACCGACTGTGAT 779
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| | ||
Sbjct 822 GCCAATGTAGAATCAAGGATGGAAGATGATTGTAGCGATGGGAA-TGTACAGACTATTAT 880
Query 780 TACTTGTAGTGGTGAGTTGACTAATCAGAGCACTTTGCTTCCAGAGACTTCCAATGATGA 839
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TACTTGTAGCGGTGAGTTGAATAATCAGAGCACTTTACTTCCAGAGACTTCCAATGATGA 940
Query 840 AAATGTTATCAGTGACCACATTCAAAGTAGTTATAACCGCAGTGATATAACTATAGGTGC 899
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||
Sbjct 941 AAATGTTATCAGCGACCACATTCAAAGTAGTTATAACCGCAATGATCTAACTGCAGATGC 1000
Query 900 ACAGTCAGTTTTGGTTGA-GGCTCATTCTGATAGCCGTATAGAATCAGCTTCCAAAGCTG 958
|| |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||
Sbjct 1001 ACGGTCAATTTTGGTTGAAGG-TCATTCTGATAGCCATATAGACTCAGCTTCCGAAGTTG 1059
Query 959 AAAATGTGGAAGCTGAAAATATTTGCGAAACTGCAGAGCCTGATTTGAAGGAGATAGAGC 1018
|||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 AAAAAGTGGAAGCTGAAAATATTGGCAAAACTGCAAAGCCTGATTTGAAGGAGATAGAGC 1119
Query 1019 TATCTGATGTCACAGTACTAGAAAGAGGGGACCAAGCTCTCC-CTACTCTTGAGGTAGGT 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1120 TATCTGATGTCACAGTACTAGAAAGAGGGGACCAAGCTC-CCTCTACTCTTGAGGTAGGT 1178
Query 1078 GGACAAGATGTTTCTGGGACTC-AATGCCAAGATCTCCTTGTCAGCACTGTTCATACTAG 1136
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 GGACAAGATGTTTCTGGGAC-CGAATGCCAAGATCTCCTTGTCAGCACTGTTCATACTAG 1237
Query 1137 GGGAGCTGTTGAAGCATCTTTGGAACTTGTTGGGGAATTGACAACTATAACAAACAGTGT 1196
| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 CGTAGCTGTTGAAGCGTCTTTGGAACTTGCTGGGGAATTGACAACTATAACAAACAGTGT 1297
Query 1197 TTCCATTGAGAAGCCTGAGTCGCTTAGTCATCAACATATGGAAGTTATTACAAGTGTACA 1256
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1298 TTCCATTGAGAAGCCCGAGTTGCTTAGTCATCAACATATGGAAGTTATTACAAGTGAACA 1357
Query 1257 TGAGTCTACTTTTCAGATGGAGACTGAGACACATACGCAGATACATGTAGTTGAAACTTC 1316
|||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1358 TGAGTCTACTTTTCAGATAGAGACTGAGACATATCCGCAGATACACGTATTTGAAACTTC 1417
Query 1317 AGAAAGTGTTTATATTTCACCTATGGACTCGATGGTTGAAGCTACAAAAGGTGGTGTGTC 1376
||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1418 AGAGAGTGTTTATATTTCAACGATGGACTCAATGGTTGAAGCTAGAGAAGGTGGTGTGTC 1477
Query 1377 TAAGAAGAGTGACAGTGAAGGTAGTGATCCCACTTCTAATCTCGAGGAAAGAATGGAACT 1436
|||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 1478 TAAGAAGAGTGACAATGAAGGTAGTGCTCGCACTTCTAATCTCGAGCAAAGCATGGAACT 1537
Query 1437 GCCTGTCAATGCCAACGATAGAGATCAGGATGTCAAGAACTCTCCA-ATTTTGTCTGAAA 1495
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||
Sbjct 1538 GCCTGTCAATGCCAATGATAGAGATCAAGATGTCAAGAACTCTC-AGATCCTATCTGAAA 1596
Query 1496 GTGTTGTGTCCGAGT-CTGTTGACTATGTTTCAGGAGGCCCTGCTTCCA-AGCTGGCGGA 1553
| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||| || |||| | || |||||||
Sbjct 1597 GCGTTGTGTCTG-GTTCTGTTGGCTATGTTTCAGGAGGCTCTACTTC-AGAGTTGGCGGA 1654
Query 1554 GCCAAAATCTCAATCTGACAACATCCCAACAGACAAGTCAGGGACTATGATTGACTA-TT 1612
| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||
Sbjct 1655 GTCAGAATCTCAATCTGACAGCATTCCAACAGACAAGTCAGAGACTATGATTGAC-AGTT 1713
Query 1613 CTCTTAACCGT-GAAGAATTACAACCTTTAAATCCATATGGAGCACCTGCTGTCAGTCTT 1671
|||| || | | ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 CTCTCAATC-TCGAAGAATTACAACCTCTAAGTCAAGATGGAGCACCTGCTGTCAGTCTC 1772
Query 1672 ACATCTTCAATAGATTTACATATGGTAAAGACATCCTCTGAT-ACAAGTGACCAAGGCAG 1730
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1773 ACATCTTCAATAGATTTACATATGGTAAAGACATCCTCTGATGACA-GTGACCAAGGCAG 1831
Query 1731 TTTCTATAAAACCGAGAAGATATCATCTGGTGAACCTGAAAATGGTCAAACCGTTCCACC 1790
|| || | ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 TTACTCTGAAACCAAGAAGGTTT-AT--GGTGAACCTGAAAATGGTCAAACCGTTCCACC 1888
Query 1791 TGTGGATGCAAGTAGTTCGGGGAGTCAGATGGACAAACAAGCTAGGAAGATTGCTGAAGA 1850
||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1889 TGTGGATGCAAGTTGTTCAGGGAGTCAGATGGACCAAGAAGCTAGGAAGCGTGCTGAAGG 1948
Query 1851 TACTCAGCAAAGTACACACTTTGTTGAAGGCTGTCCTGGCTCTGAAGGGTCAAAGGATGC 1910
|||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 TACTAAGCAAAGTACATACTCTGTTGAAGGCTGTCCTCGCTCTGAAGGGTCAAAGGATGC 2008
Query 1911 AGTAGATGCTGATGCTGATGCTGGTGCTACTGGACAAGTTTTGCTGCAGCAGTCTGAGGA 1970
|||||||||||||| | || | || | ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2009 AGTAGATGCTGATG--G-TG-T--TG-----G-ACAAGTTTTGCAGCAGCAGTCTGAGGA 2056
Query 1971 AACAATTTTAGAAGA-AACTCTAGTAACAGAAGTTGTAAATGCTCCTG 2017
| |||||| ||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 2057 ATTAATTTTTGAAGAGAA-TGTAGTAACAGAAGCTGTAAAAGCTCCTG 2103
Score = 315 bits (170), Expect = 4e-84
Identities = 180/185 (97%), Gaps = 0/185 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4998 TTGGTTGGAGGGTGTTATCACAGAGAAGAACAAGAAAGATGAAAATACAGTGACTGTGCA 5057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5132 TTGGTTGGAGGGTGTTATCACAGAGAAGAACAAGAAAGATGAAAACACAGTGACTGTGCA 5191
Query 5058 TTTTCCTGCGCAAGGAGACACTTTGACGATCAAAGCTTGGAATCTTCGTCCTTCTCTTGT 5117
|||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5192 TTTTCCTGCGGAAGAAGAAACTTTGACGATCAAAGCTTGGAATCTTCGTCCTTCTCTTGT 5251
Query 5118 GTGGAAAGATGGAAAGTGGATTGAATGTTCTAGTTCAGGAGAAAATATCAGCTCGTCACA 5177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5252 GTGGAAAGATGGAAAGTGGATTGAATGTTCTAGTTCAGGAGAAACTATCAGCTCGTCACA 5311
Query 5178 TGAGG 5182
|||||
Sbjct 5312 TGAGG 5316
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 261269439144
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5