BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg330174
Length=2073
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
ATCG01280.1 | Symbols: YCF2.2 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA ty... 1982 0.0
ATCG00860.1 | Symbols: YCF2.1 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA ty... 1982 0.0
> ATCG01280.1 | Symbols: YCF2.2 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA
type, core | chrC:145291-152175 REVERSE LENGTH=6885
Length=6885
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Strand=Plus/Plus
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Query 1109 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGaaaaaaaTAGGATCACTTCTTATGGAT 1168
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Query 1169 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 1228
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Query 1229 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 1288
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Query 1289 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query 1349 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6161 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 6220
Query 1409 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6221 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 6280
Query 1469 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query 1529 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6341 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 6400
Query 1589 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGCGGAACCATGCAGTACCAGAGACGAGATAGGT 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6401 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGCGGAACCATGCAGTACCAGAGACGAGATAGGT 6460
Query 1649 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6461 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 6520
Query 1709 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6521 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 6580
Query 1769 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6581 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 6640
Query 1829 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATTGTTGATTCAGCGCC 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6641 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATTGTTGATTCAGCGCC 6700
Query 1889 AGAGATGGCTTAGAACCAATAGTTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGAT 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6701 AGAGATGGCTTAGAACCAATAGTTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGAT 6760
Query 1949 CCGAGAGTTATCAGTATTTATCAAATCTGTTCCTATCTAATGGAACGCTATTGGATCGAA 2008
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6761 CCGAGAGTTATCAGTATTTATCAAATCTGTTCATATCTAACGGAACGCTATTGGATCGAA 6820
Query 2009 TGACAAAGACATTGTTGaaaaaaaGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCA 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6821 TGACAAAGACATTGTTGAAAAAAAGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCA 6880
Query 2069 TGTAA 2073
|||||
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Identities = 988/990 (99%), Gaps = 0/990 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4702 ATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTAT 4761
Query 61 CTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4762 CTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCAT 4821
Query 121 TATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4822 TATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTCT 4881
Query 181 CATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGATA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4882 CATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGATA 4941
Query 241 GGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4942 GGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGTT 5001
Query 301 CCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGtttttttATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5002 CCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGTTTTTTTATT 5061
Query 361 GATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5062 GATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGAA 5121
Query 421 CTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTCG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5122 CTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTTG 5181
Query 481 GAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTGC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5182 GAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTGC 5241
Query 541 ATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5242 ATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCTC 5301
Query 601 GGTCTATTGGTGAACTCTCTCTCCAGGGATTATGAAAGATGTTCCACTAGAAATATTCTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5302 GGTCTATTGGTGAACTCTCTCTCCAGGGATTGTGAAAGATGTTCCACTAGAAATATTCTT 5361
Query 661 GTTATTGCTTCGACTCATATTCCCCAAAAAGTGGATCCCGCTCTAATAGCCCCGAATAAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5362 GTTATTGCTTCGACTCATATTCCCCAAAAAGTGGATCCCGCTCTAATAGCCCCGAATAAA 5421
Query 721 TTAAATACATGCATTAAAATACGAAGGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5422 TTAAATACATGCATTAAAATACGAAGGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTC 5481
Query 781 ACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTCACTTGGAAAAGAAAATGTTCCATACTAATGGATTC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5482 ACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTCACTTGGAAAAGAAAATGTTCCATACTAATGGATTC 5541
Query 841 GAGTCTATAACCATGGGTTCCAGTGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5542 GAGTCTATAACCATGGGTTCCAGTGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTA 5601
Query 901 TCAATTAGTATTACACAGAAGAAATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5602 TCAATTAGTATTACACAGAAGAAATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTT 5661
Query 961 CATAGACAAACTTGGGATTTGCGATCCCAG 990
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5662 CATAGACAAACTTGGGATTTGCGATCCCAG 5691
> ATCG00860.1 | Symbols: YCF2.1 | Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA
type, core | chrC:86474-93358 FORWARD LENGTH=6885
Length=6885
Score = 1982 bits (1073), Expect = 0.0
Identities = 1081/1085 (99%), Gaps = 0/1085 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 989 AGAAGAAATCATGTAACGAAGGGGATTCTTATTTGTACAAATGGTACTTCGAGCTTGGAA 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5801 AGAAGAAATCATGTAACGAAGGGGATTCTTATTTGTACAAATGGTACTTCGAGCTTGGAA 5860
Query 1049 CGAGCATGAAGACATTCACGATACTTCTTTATCTTTTGAGTTGTTCTTCCGGATCGGTCG 1108
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5861 CGAGCATGAAGAAATTCACGATACTTCTTTATCTTTTGAGTTGTTCTGCCGGATCGGTCG 5920
Query 1109 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGaaaaaaaTAGGATCACTTCTTATGGAT 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5921 CTCAAGACCTTTGGTCTCTACCCGTACCCGATGAAAAAAATAGGATCACTTCTTATGGAT 5980
Query 1169 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5981 TCGTTGAGAATGATTCGGATCTAGTTCATGGCCTATTAGAAGTGCAAGGCGCTTTGGTGG 6040
Query 1229 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6041 GATCCTCACGGACAGAAAAAGATTGCAGTCAGTTTGATAATGATCGAGTGACATTGCTTT 6100
Query 1289 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6101 TTCGCTCCGAACCAAGGGATCCCTTATATATGATGCAAGATGGATCTTGTTCTATCGTTG 6160
Query 1349 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6161 ATCAGAGATTTCTCTATGAAAAATACGAATCGGAGTTTGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGAG 6220
Query 1409 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6221 TCCTCGACCCGCAACAGATAGAGGAGGATTTATTCAATCACATAGTTTGGGCTCCTAGAA 6280
Query 1469 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6281 TATGGCGCCCTCGGGGCTTTCTATTTGATTGTATCGAAAGGCCTAATGAATTGGGATTTC 6340
Query 1529 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6341 CCTATTCGGCCGGGTCATTTCGGGGCAAGCGGATCATTTATGATGAAAAGTATGAGCTTC 6400
Query 1589 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGCGGAACCATGCAGTACCAGAGACGAGATAGGT 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6401 AAGAGAATGATTCGGAGTTCTTGCAGAGCGGAACCATGCAGTACCAGAGACGAGATAGGT 6460
Query 1649 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6461 CTTCCAAAGAACAAGGCTTTTTTAGAATAAGCCAATTCATTTGGGACCCCGCAGATCCAC 6520
Query 1709 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 1768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6521 TCTTTTTCCTATTCAAAGATCAACCCTTTGTCTCTGTGTTTTCACATCGAGAATTCTTTG 6580
Query 1769 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 1828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6581 CAGATGAAGAGATGTCAAAGGGGCTTCTTACTTCCCAAACGGATCCTCCTACATCTATAT 6640
Query 1829 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATTGTTGATTCAGCGCC 1888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6641 ATAAACGCTGGTTTATCAAGAATACGCAAGAAAAGCACTTCGAATTGTTGATTCAGCGCC 6700
Query 1889 AGAGATGGCTTAGAACCAATAGTTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGAT 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6701 AGAGATGGCTTAGAACCAATAGTTCATTATCTAATGGATTTTTCCGTTCTAATACTCGAT 6760
Query 1949 CCGAGAGTTATCAGTATTTATCAAATCTGTTCCTATCTAATGGAACGCTATTGGATCGAA 2008
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6761 CCGAGAGTTATCAGTATTTATCAAATCTGTTCATATCTAACGGAACGCTATTGGATCGAA 6820
Query 2009 TGACAAAGACATTGTTGaaaaaaaGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCA 2068
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Sbjct 6821 TGACAAAGACATTGTTGAAAAAAAGATGGCTTTTCTCGGATGAAATGAAAATAGGATTCA 6880
Query 2069 TGTAA 2073
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Sbjct 6881 TGTAA 6885
Score = 1818 bits (984), Expect = 0.0
Identities = 988/990 (99%), Gaps = 0/990 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTAT 60
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Sbjct 4702 ATGATTGAACAACCGGGAACAATTTACTTACGATACTTAGTTGACATTCATAAAAAGTAT 4761
Query 61 CTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4762 CTAATGAATTATGAGTTCAATACATCCTGTTTAGCAGAAAGACGGATATTCCTTGCTCAT 4821
Query 121 TATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTCT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4822 TATCAGACAATCACTTATTCACAAACTTCGTGTGGGGCTAATAGTTTTCATTTCCCGTCT 4881
Query 181 CATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGATA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4882 CATGGAAAACCCTTTTCGCTCCGCTTAGCCCTATCCCCCTCTAGGAGTATTTTAGTGATA 4941
Query 241 GGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4942 GGTTCTATAGGAACTGGACGATCCTATTTGGTCAAATACCTAGCGACAAACTCCTATGTT 5001
Query 301 CCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGtttttttATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5002 CCTTTCATTACAGTATTTCTGAACAAGTTCCTGGATAACAAGCCGAAAGGTTTTTTTATT 5061
Query 361 GATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5062 GATGATATCGATATTGATGATAGTGACGATATTGATGCTAGTAACGATATTGATCGTGAA 5121
Query 421 CTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTCG 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5122 CTTGATACGGAGCTGGAGCTTCTAACTATGATGAATGCGCTAACTATGGATATGATGTTG 5181
Query 481 GAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTGC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5182 GAAATAGACCGATTTTATATCACCCTTCAATTCGAATTAGCAAAAGCAATGTCTCCTTGC 5241
Query 541 ATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5242 ATAATATGGATTCCAAACATTCATGATCTTGATGTGAATGAGTCGAGTTACTTAGCCCTC 5301
Query 601 GGTCTATTGGTGAACTCTCTCTCCAGGGATTATGAAAGATGTTCCACTAGAAATATTCTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5302 GGTCTATTGGTGAACTCTCTCTCCAGGGATTGTGAAAGATGTTCCACTAGAAATATTCTT 5361
Query 661 GTTATTGCTTCGACTCATATTCCCCAAAAAGTGGATCCCGCTCTAATAGCCCCGAATAAA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5362 GTTATTGCTTCGACTCATATTCCCCAAAAAGTGGATCCCGCTCTAATAGCCCCGAATAAA 5421
Query 721 TTAAATACATGCATTAAAATACGAAGGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTC 780
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Sbjct 5422 TTAAATACATGCATTAAAATACGAAGGCTTCTTATTCCACAACAACGAAAGCACTTTTTC 5481
Query 781 ACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTCACTTGGAAAAGAAAATGTTCCATACTAATGGATTC 840
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Sbjct 5482 ACTCTTTCCTATACTAGGGGATTTCACTTGGAAAAGAAAATGTTCCATACTAATGGATTC 5541
Query 841 GAGTCTATAACCATGGGTTCCAGTGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5542 GAGTCTATAACCATGGGTTCCAGTGCACGAGATCTTGTAGCACTTACCAATGAGGCCCTA 5601
Query 901 TCAATTAGTATTACACAGAAGAAATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5602 TCAATTAGTATTACACAGAAGAAATCAATTATAGACACTAATACAATTAGATCTGCTCTT 5661
Query 961 CATAGACAAACTTGGGATTTGCGATCCCAG 990
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Sbjct 5662 CATAGACAAACTTGGGATTTGCGATCCCAG 5691
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 102760515615
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5